摘要
为了筛选青花菜不同激素处理条件下稳定表达的内参基因,为青花菜lncRNAs相关分子研究提供参考,通过qRT-PCR技术检测不同激素处理的青花菜中16个候选内参基因的表达量,利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件分析内参基因的稳定性和最适内参基因的数目,再通过RefFinder网站综合评估内参基因,最终确定理想的内参基因。结果表明,XLOC_007087、XLOC_015579和XLOC_008536基因的CT值变化范围最小。GeNorm算法认为XLOC_008536在6-BA、ABA、IAA、NAA处理中表达稳定性较好;XLOC_037050在MEJA、SA处理中表现的稳定性较好。NormFinder计算出NAA、ABA处理下XLOC_037050最稳定;6-BA处理下,基因XLOC_021473最稳定;MEJA处理下,最稳定的基因为XLOC_010342;SA处理下,XLOC_034687最稳定;IAA处理下,XLOC_029328最稳定。BestKeeper显示,在6-BA、MEJA处理下,表达最稳定的基因是XLOC_007087;NAA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_015579;ABA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_012179;SA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_010342;IAA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_007980。3个软件的分析结果不尽相同,RefFinder综合分析结果显示,在NAA和ABA处理下适宜的内参基因为XLOC_037050;MEJA处理下适宜的内参基因为XLOC_010342;6-BA处理下适宜的内参基因为XLOC_021473;SA处理下适宜的内参基因为XLOC_034687;IAA处理下适宜的内参基因为XLOC_007980。4个软件综合分析认为,在不同激素胁迫中适宜的内参基因组合为XLOC_008536和XLOC_007087。
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2025年第10期36-42,共7页
Jiangsu Agricultural Sciences
基金
云南省科技计划重大科技专项(编号:202202AE090015)
云南省地方本科高校(部分)基础研究联合专项(编号:2018FH001-044)
云南省基础研究专项青年项目(编号:2019-1-C-25318000002236)
浙江省自然科学基金(编号:LY18C150006)
浙江省农业(蔬菜新品种选育)新品种选育重大科技专项(编号:2021C02065-4-2)
温州市科技项目(编号:2019ZX007-2、N2016001)
昆明市产业技术领军人才项目。
