摘要
为深入探讨中华绒螯蟹的生长发育机制,基于三龄性成熟蟹和二龄性成熟蟹的肝胰腺样本,获得高质量的转录组数据。通过数据分析,对单核苷酸多态性(SNP)位点进行鉴定和分析,以筛选出与中华绒螯蟹生长发育相关的功能基因。结果显示,中华绒螯蟹的转录组中存在441 138个SNP位点,分布在22 640条SNP-Unigene上,其中发生转换的SNP数量显著多于颠换,二者的比值远>2,表明在进化过程中,转换突变可能对中华绒螯蟹的适应性和生长发育起到重要作用。SNP位点中以C-T、T-A、G-A、A-T等4种突变类型的数量较为丰富,进一步揭示该物种基因组的突变特征。功能注释结果表明,22 640条SNP-Unigene被注释,其中有8 671条被注释到代谢过程、细胞解剖实体和胞内区等29个GO注释,7 544条被注释到信号转导、免疫系统、内分泌系统等34条KEGG通路中,指示它们在生长发育及免疫反应中的潜在功能。通过转录组差异表达基因分析和KEGG通路注释,筛选出大量与中华绒螯蟹生长发育相关的候选基因。研究结果不仅可丰富中华绒螯蟹的分子标记类型,还可为其遗传育种、生长发育及免疫研究提供重要的数据参考。
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2025年第9期162-172,共11页
Jiangsu Agricultural Sciences
基金
贵州省教育厅科技拔尖人才项目(编号:黔教技[2022]096)
毕节市揭榜挂帅项目(编号:毕科合重大专项字[2021]1)
毕节市科学技术项目(编号:毕科联合字[2023]48)。
