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Allexivirus属的一个新成员——大蒜病毒E的基因组全序列测定和系统树分析 被引量:1

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摘要 测定了一个从浙江余杭大蒜中分离到的Allexivirus属成员的基因组全序列. 单链正性病毒基因组含8451个核苷酸, 6个ORF. 与其他Allexivirus属成员的基因组全序列的核苷酸同源性仅为62.8%~64.8%; ORF1~ORF6编码蛋白的氨基酸同源性分别为67.6%~78.5%, 55.4%~66.2%, 56.7%~66.4%, 40.3%~55.6%, 66.3%~79.7%和52.2%~68.8%. 进一步分析显示, 此病毒与其他病毒的差异和该属中远缘病毒间的差异相似, 外壳蛋白核心区域氨基酸序列同源性仅为63.9%~79.8%, 远低于该属不同病毒的国际分类标准, 应归类为Allexivirus属的新成员, 命名为大蒜病毒E. 病毒不同编码蛋白序列的进化树分析也进一步证明了该病毒与其他病毒的亲缘关系.
作者 陈炯 陈剑平
出处 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第17期1463-1468,共6页 Chinese Science Bulletin
基金 浙江省青年科技人才专项基金(批准号:RC9604) 浙江省重点实验室专项基金(批准号:4001107557)资助项目
  • 相关文献

参考文献1

二级参考文献2

  • 1Diao A,J Gen Virol,1999年,80卷,1141页
  • 2Diao A,Virology,1999年,261卷,331页

共引文献7

同被引文献8

  • 1Chen J, Chen J P, Adams M J. Molecular characterisation of a complex mixture of viruses in garlic with mosaic symptoms in China. Arch Virol, 2001, 146:1841-1853.
  • 2Tsuneyoshi T, Matsumi T, Natsuaka K T, et al. Nucleotide sequence analysis of virus isolates indicates the presence of three potyvirus species in Allium plants. Arch Virol, 1998, 143: 97-113.
  • 3Tsuneyoshi T, Matsumi T, Deng T C, et al. Differentiation of Allium carlaviruses isolated from different parts of the world based on the viral coat protein sequence. Arch Virol, 1998, 143: 1093-1107.
  • 4Kanyuka K V, Vishnichenko V K, Levay K E, et al. Nucleotide sequence of shallot virus X RNA reveals a 5′-proximal cistron closely related to those of potexviruses and a unique arrangement of the 3′-proximal cistrons. J Gen Virol, 1992, 73: 2553-2560.
  • 5Song S L, Song J T, Kim C H, et al. Molecular characterization of the garlic virus X genome. J Gen Virol, 1998, 79: 155-159.
  • 6Sumi S, Matsumi T, Tsuneyoshi T. Complete nucleotide sequences of garlic viruses A and C, members of the newly ratified genus Allexivirus. Arch Virol, 1999, 144: 1819-1826.
  • 7van Dijk P, van der Vlugt R A. New mite-borne virus isolates from Rakkyo, shallot and wild leek species. Eur J Plant Path, 1994, 100: 269-277.
  • 8Chen J, Zheng H Y, Antoniw J F, et al. Detection and classification of allexiviruses from garlic in China. Arch Virol,2004, 149: 435-445.

引证文献1

二级引证文献19

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