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风信子ISSR-PCR体系的优化及引物筛选 被引量:19

Optimization of ISSR-PCR Reaction System and Primer Selection for Hyacinth
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摘要 以风信子基因组DNA为ISSR-PCR扩增模板,采用单因素试验方法,对影响PCR扩增体系中Mg2+浓度、dNTPs、模板DNA及引物浓度、Taq酶的用量5个因素进行研究,建立了风信子ISSR-PCR扩增最佳反应体系,即:20μL反应体系中分别加入2μL10×Buffer、1.4μL Mg2+(25mmol/L)、1.5μL dNTPs(2.5mmol/L)、1.5μL引物(10pmol/μL),0.2μLTaq酶(5U/μL),1.2μL模板(30ng/μL),ddH2O补足体积。并以此体系对110条引物进行筛选,最终获得了多态性高,重复性好的引物12条。 Genomic DNA extracted from Hyacinth was used as template for ISSR-PCR, the impact factors in PCR system, Mg2+ concentration, dNTPs, template DNA, primer concentration and Taq polymerase, were studied using a single factor experiment method by setting up different volume gradient to establish the hyacinth ISSR-PCR reaction system. The experiment results showed that the best reaction system was adding in turn with 2 μL 10×Buffer, 1.4 μL Mg2+ (25 mmol/L), 1.5 μL dNTPs (2.5 mmol/L), 1.5 μL primer (10 pmol/μL), 0.2 μL Taq polymerase (5 U/μL, 1.2 μL template (30 ng/μL), and ddH2O to 20 μL at last. According to this PCR system, 110 primers were selected, eventually thirteen primers showed high polymorphism and repeatability.
出处 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期139-144,共6页 Molecular Plant Breeding
基金 中国博士后科学基金面上项目(20100470217) 江苏省高校优势学科建设工程项目共同资助
关键词 风信子 ISSR-PCR 引物筛选 Hyacinth ISSR-PCR Primer selection
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参考文献22

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引证文献19

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