期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息

DNA序列分析中的信息熵应用现状 被引量：1

Application of information entropy in DNA sequence analysis
在线阅读 下载PDF
导出
摘要 信息熵理论是生物信息学研究的一个重要工具,它在DNA序列分析中有着广泛的应用。本文详细介绍了近年来诸多DNA序列分析问题中信息熵应用的研究进展,并分析了未来该问题的研究方向。 Information entropy theory is an important tool in bioinformatics.It is widely used in DNA sequence analysis.In this paper,we introduce the development of information entropy application in DNA sequence analysis in recent years.At last some vital aspects that may be conducted in the future investigations are discussed.
作者 詹青
机构地区 哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院
出处 《生物信息学》 2012年第1期44-49,共6页 Chinese Journal of Bioinformatics
关键词 DNA 序列分析 信息熵 DNA sequence analysis information entropy
分类号 TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术] Q523.8 [生物学—生物化学]
  • 相关文献

参考文献30

  • 1SHANNON C E. A mathematical theory of communication [ J]. Mobile Computing and communications Review,2001,5 ( 1 ) : 3 - 55.
  • 2LIO P, POLITI A, BUIATrI M, RUFFO S. High statistics block entropy measures of DNA sequences [ J]. J Theor Biol, 1996, 180(2) : 151 -60.
  • 3ILIC I, OSGOOD R M, LAUC G, HEFFER - LAUE M, ILIC G. The use of entropy to characterize coding genes for translation of proteins from DNA [ A]. Proceedings of the 15th Annual Interna- tional Conference of the IEEE [ C ]. Engineering in Medicine and Biology Society, 1993. 1496 - 1496.
  • 4SCHMITT A O, HERZEL H, EBELING W. A New Method to Calculate Higher- Order Entropies from Finite Samples [ J]. Eu- rophys Lett, 1993, 23(5) : 303 -9.
  • 5HERZEL H, EBELING W, SCHMITF A O. Entropies of biose- quences : The role of repeats [ J ]. Physical review E, Statistical physics, plasmas, fluids, and related interdisciplinary topics, 1994, 50(6) : 506l -71.
  • 6SCHMITT A O, HERZEL H. Estimating the entropy of DNA se- quences [J]. J Theor Biol, 1997, 188(3) : 369 -77.
  • 7LIU Z, VENKATESH S S, MALEY C C. Sequence space cover- age, entropy of genomes and the potential to detect non - human DNA in human samples [J]. BMC Genomics, 2008, 9: 509.
  • 8GROSSE I, BULDYREV S V, STANLEY H E, HOLSTE D, HERZEL H. Average mutual information of coding and noncoding DNA [J]. Pac Syrnp Biocomput, 2000, 614-23.
  • 9GROSSE I, HERZEL H, BULDYREV S V, STANLEY H E. Species independence of mutual information in coding and non- coding DNA [ J ]. Physical review E, Statistical physics, plas- mas, fluids, and related interdisciplinary topics, 2000, 61 (5 Pt B) : 5624 -9.
  • 10Renyi A. On Measures of Entropy and Information [ A ]. Pro- ceedings of the Proc 4th Berkeley Syrup Math Statist and Prob [C]. Univ. Calif, Press, 1961. 547-61.

同被引文献3

引证文献1

生物信息学
2012年 第1期

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部