期刊文献+

基于面上DNA计算求解最小集合覆盖问题 被引量:7

DNA computing approach on surface to solve minimal set covering problem
在线阅读 下载PDF
导出
摘要 利用DNA分子结构推得DNA计算机理及实现方式,提出用面上DNA计算模型求解最小集合覆盖问题,给出了具体应用和算法评价;在计算模板表面穷举了所有可能的结果,同一时间验证结果是否满足条件,实现DNA计算的强大并行性;同时在互补的寡聚核苷酸片段发生退火反应时,通过催化剂来决定是否杂交,减少人工参与、提高计算效率。最后,通过计算机仿真模拟验证了本模型的可行性。 Using the gotten DNA computing mechanism and realization through DNA molecular structure,this paper proposed a DNA solution on surface for minimal set covering problem,and presented specific applications and algorithm evaluation.It listed all possible results in the surface of the calculation template,which at the same time,verified whether the results met the conditions for the realization of the strong parallelism of DNA computing.Meanwhile,when complementary oligonucleotide gather nucleotide clips occured,it should be decided whether to hybridize through the catalyst,reducing human intervention and improving efficiency.Finally,computer simulations demonstrate the feasibility of the model.
出处 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2012年第4期1220-1222,共3页 Application Research of Computers
基金 国家自然科学基金资助项目(61170038 60873058) 山东省自然科学基金资助项目(ZR2011FM001)
关键词 DNA计算 表面方式 最小集合覆盖问题 DNA computing surface-based fashion minimal set covering problem
  • 相关文献

参考文献10

二级参考文献116

  • 1肖绚,胡鸿豪.DNA计算模型发展分析[J].计算机应用,2004,24(9):123-126. 被引量:2
  • 2崔光照,刘玉琳,张勋才.数据存储新方向:DNA分子存储技术[J].计算机工程与应用,2006,42(26):29-32. 被引量:13
  • 3Adleman L M. Molecular computation of solutions to combinatorial problems [J]. Science, 1994, 5 187 (266):1 021-1 024.
  • 4Sakamoto K, Gouzu H, Komiya K, et al. Molecular computation by DNA hairpin formation[J]. Science, 2000, 5 469(288): 1 223-1 226.
  • 5Lee J Y, Shin S Y, Park T H, et al. Solving traveling salesman problems with DNA molecules encoding numerical values[J]. BioSystems, 2004, 78(1-3):39-47.
  • 6Q Liu, et al. DNA computing on surfaces[ J ]. Nature, 2000,403:175 -179.
  • 7H Wu. An improved surface-based method for DNA computation [J].Boisystem, 2001,59:1 - 5.
  • 8J A Bondy, USR Murty. Graph Theory with Application [ M ]. the Macmillan Press LTD. London: Basingtoke and New York, 1976.
  • 9L Adleman. Molecular computation of solution to combinatorial problems [J]. Science, 1994,266 ( 11 ) : 1021 - 1024.
  • 10R J Lipton. DNA solution of hard computational problems [J]. Science,1995,268(4) :542 - 545.

共引文献51

同被引文献63

引证文献7

二级引证文献7

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部