摘要
研究遗传密码与氨基酸生物配比（ＢＦＡＡ）之关联表明，具有相同同义密码子数（ｘ）的氨基酸ＢＦＡＡ之均数（Ｐｘ）与其氨基酸平均分子量（ｍｘ）和密码子抽样概率均数（Ｒｘ）之关系模型为Ｐｘ＝Ｋｍｘｅｘｐ（２／Ｒｘ）＋ａ，其中ｋ和ａ均为常数。依据概率事件的运算法则，可用４种核苷酸（Ｕ、Ｃ、Ａ和Ｇ）的抽样概率来估计Ｒｘ值，当用ｘ代替Ｒｘ时，模型的估计精度不变。同义密码子的非随机应用产生同义密码子对相应氨基酸的贡献方差（σ２ｉ）：σ２ｉ＝∑ｊｄ２ｉｊｘｉ－１ｘ２ｉ，其中ｄｉｊ＝第ｉ种氨基酸的第ｊ个同义密码子的应用频率。第ｋ个核苷酸抽样方差为（∑ｉＮｋｉＰｉσｉ）２，其中Ｎｋｉ＝第ｉ种氨基酸的第ｋ个碱基的数量，Ｐｉ＝第ｉ种氨基酸的ＢＦＡＡ值。另外，本文测定了２０个物种３６６个样品的生物体ＢＦＡＡ，结果显示所有物种的观察值和模型值之相关系数均超过０９５，Ａｓｐ和Ｇｌｕ对模型是个特例。
Astudyoftherelationshipbetweengeneticcodeandbiologicalformulaeofaminoacids(BFAA)inlivingbodyindicatedthatamongthemeanBFAA(Px)ofaminoacidsofidenticalsynonymouscodonnumber(X),theaveragemolecularweight(mx)oftheaminoacidsandthemeansamplingprobability(Rx)ofthecodon,therewasarelationshipmodel:Px= kmxexp(2/Rx) +ainwhichkandawereconstants.Accordingtothecalculationruleofprobailityevent,Rxwasestimatedbythesamplingprobabilityof4nucleotides,U,C,AandG.Whenusingthenumber(X)ofsynonymouscodoninsteadofRx,theestimatingaccuracyofthemodelwassimilartothatwithRx.Thenonrandomusageofsynonymouscodoncausedvariance(2i)ofcontributionamongsynonymouscodonstocorrespondingaminoacid,2i= jd2ij Xi -1 X2i inwhichdij=theusageprobabililtyofjthsynonymouscodonofithaminoacid.Thesamplingvarianceofkthnucleotide(k=U,C,AorG)wasD(Xi (NkiPii)]2inwhichNki=thenumberofkthbaseofithaminoacidandPi=theBFAAvaluceofithaminoacid.Inaddition,theBFAAofsomelivingbodies(366simplesof20species)havebeenestimated.TheresultshowedthatthecorrelationcoefficientsbetweenobservedvalueandmodelsPxinallthespecieswereover095.However,themodelwasnotsuitedtoAspandGlu.
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
1999年第3期225-231,共7页
ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA
基金
安徽省教委自然科学基金
关键词
氨基酸
生物配比
遗传密码
Aminoacid,Geneticcodon,Molecularpopulationgenetics
