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应用比较基因组分析检测乙型肝炎病毒中可能的重组事件 被引量：2

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摘要 应用生物信息学软件RDP3和Simplot及5种重组检测算法(RDP,GENECONV,MaxChi,Chimaera和SiScan),对791个人类乙型肝炎病毒(HBV)全基因组和38个非人灵长类乙型肝炎病毒全基因组序列进行了比较分析,以检测可能的重组事件及重组子.用RDP3检测出9个重组事件及61个重组子,并用Simplot分析确定了具有两条亲代序列的6个事件中重组发生的位置.61个重组子中53个为首次发现.研究还表明PreC/C基因区域和基因边缘附近发生重组频率较高.
作者 叶琳 张原 梅旖 南蓬 钟扬
机构地区 复旦大学生命科学学院进化生物学中心 中国医学科学院病原生物学研究所 上海生物信息技术研究中心 西藏大学生物多样性与地生物学研究所
出处 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第14期1322-1328,共7页 Chinese Science Bulletin
基金 上海市重点学科项目(B111) 上海市科委项目(07XD14025)资助
关键词 乙型肝炎病毒 重组 RDP3 Simplot
分类号 R450 [医药卫生—治疗学]
  • 相关文献

参考文献53

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同被引文献78

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引证文献2

二级引证文献9

科学通报
2010年 第14期

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