摘要
对来源于兰州和上海两市的两株腮腺炎病毒野毒的小疏水蛋白(SH)基因及其旁侧区cDNA的PCR扩增产物,分别进行直接测序和克隆测序。用直接测序法测定2株腮腺炎野毒378个核苷酸序列,在此范围内存在16个核苷酸(4.2%)差异,其中11个(2.9%)位于编码区序列中,所推导的SH蛋白序列有6个氨基酸(10.5%)差异。克隆测序法测定的这两株腮腺炎野毒的核苷酸序列相当于直接法的78-378位核苷酸。两种方法在所测301个核苷酸(nt)的共同区域内序列完全一致。证明PCR产物直接测序用于腮腺炎病毒分子流行病学研究不仅特异性强,敏感度高,而且比克隆测序法更为快速简便。
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
1998年第1期33-37,共5页
Chinese Journal of Virology
关键词
腮腺炎病毒
小疏水蛋白
基因
PCR
克隆
测序
Mumps virus(MuV), Small hydrophobic (SH) protein gene, PCR direct sequencing( PCR-DS), Cloning sequencing, Molecular epidemiology