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我国2006年野鸟H5N1 HPAIV表面基因进化特征 被引量:1

Surface gene phylogeny of H5N1 HPAIV isolated from migratory waterfowl in China
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摘要 国家禽流感参考实验室在2006年,从来自青、藏两省(区)3种野鸟及辽宁省的2种死亡的野鸟体内共分离到14株H5N1亚型高致病力禽流感病毒(High pathogenic avian influenza virus,HPAIV),比较发现其HA、NA基因核苷酸的同源率在97.9%~99.9%之间。所有病毒的HA基因的裂解位点均具有HPAIV特有的连续碱性氨基酸-RRRKKR-,并具有近年来H5N1亚型流行株所特有的NA基因颈部49~68位20个氨基酸缺失及NS基因80~84位5个氨基酸的缺失;遗传进化分析表明2006年野鸟病毒由2005年野鸟病毒进化而来,并形成独立的进化分支;辽宁省近2年的4株野鸟病毒亲缘关系较近,说明引起2005年该省锦州地区H5N1 HPAI疫情的病毒在该地区的野鸟体内继续存在。 Twelve highly pathogenic avian influenza viruses (HPAIV) of H5N1 subtype were isolated from 3 species of migratory birds in Qinghai and Tibet and 2 viruses from dead magpie and wild duck in Liaoning province in 2006. Sequence analysis showed that the HA and NA genes of these viruses shared 97.9 % to 99.9 % sequence identity with other viruses. All 14 viruses harbored a series of basic amino acids (-RRRKKR-) at the hemagglutin (HA) cleavage site similar to the majority isolates circulating during recent years, and had a 20-amino acid deletion in the neuraminidase (NA) stalk (residues 49-68), Phylogenic analysis suggested that viruses isolated from wild bird in 2006 were originated from those in 2005, and likely have evolved to a separate clade of which 4 viruses from Liaoning formed a closer clade. These results indicated that the highly pathogenic avian influenza viruses remain exist in nature.
出处 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期760-763,共4页 Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine
基金 国家"十五"科技攻关禽流感病原学平台研究(2004BA519A20)
关键词 野鸟 H5N1 HPAIV 表面基因 遗传进化分析 wild birds H5N1 HPAIV surface gene phylogenic analysis
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