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桃基因组ACC合成酶基因的分离及其生物信息学分析

Isolation and bioinformatics analysis of ACC synthase gene from peach ( Prunus persica) genome
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摘要 根据桃(PrunuspersicaL.Batch)品种Hakuho中与成熟相关的ACC合成酶基因cDNA序列,设计了两对特异引物,从新白花水蜜桃基因组DNA中,利用PCR方法扩增得到两个片段,经过拼接获得了ACC合成酶基因的完整序列(GenBankaccession:AY994054),并对其进行了生物信息学分析。该序列全长2496bp,包括4个外显子和3个内含子,4个外显子共长1479bp。桃ACC合成酶基因编码区与蔷薇科梅(Prunusmume)和梨(Pyrus communis)的同源性分别为98%和84%,除终止密码子外,编码492个氨基酸,其中有SLSKDMGLPGLR共12个氨基酸残基的保守区,被认为是ACC合成酶的活性中心,位于274至285氨基酸残基处。推测其酶蛋白分子量为55kDa,pI为8.26。
作者 邹爱兰 陈崇顺
机构地区 南京师范大学生命科学学院
出处 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2005年第3期82-85,共4页 Jiangsu Agricultural Sciences
基金 江苏省自然科学基金(编号:BK2001206)。
关键词 桃 基因组 ACC合成酶基因 分离 生物信息学
分类号 S662.136 [农业科学—果树学]
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共引文献146

江苏农业科学
2005年 第3期

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