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阈性状QTL定位的系谱传递不平衡检验 被引量：1

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摘要 阈性状是具有一定生物学意义和经济价值的性状,其表型分布不连续,遗传基础与数量性状相同.由于阈性状的特殊性,传统的数量性状QTL定位方法不能有效地对其进行QTL定位.在人类疾病定位方面广泛采用的是传递不平衡检验(TDT),它以简便和高效得到了应用和扩展.但TDT只能利用独立的核心家系,对综合了父母、同胞及其他亲属信息的扩展系谱,TDT在使用时会损失大量信息,故难以推广,尤其在动物群体中难以应用.针对此,Martin提出了PDT方法,它能有效地对人类扩展系谱进行分析.在此基础上,将PDT方法移植到畜禽阈性状QTL定位中,并针对畜禽的特点,对PDT方法进行了适当修正,提出了系谱传递不平衡检验(PTDT).利用MonteCarlo方法,模拟了多种参数组合下,PTDT的检验功效和Ⅰ型错误.结果表明,PTDT是一个稳健、有效的阈性状QTL定位方法,其Ⅰ型错误接近于显著性水平(P<0.05),大多数情况下,PTDT的检验功效接近于1.0.在父母信息部分缺失的情况下,PTDT的Ⅰ型错误和检验功效与未缺失时基本相同.在资料信息有限的情况下,PTDT的检验功效高于PDT,且Ⅰ型错误低于PDT.模拟结果同时表明在粗糙定位的基础上,PTDT可作为QTL精细定位的新策略.
作者 丁向东 张勤 徐如海 王雅春
机构地区 农业部畜禽遗传育种重点开放实验室农业生物技术国家重点实验室
出处 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1166-1171,共6页 Chinese Science Bulletin
关键词 阈性状 QTL定位 系谱传递不平衡检验 扩展系谱 PTDT 遗传机理 数量性状座位 基因定位
分类号 Q3-0 [生物学—遗传学]
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引证文献1

二级引证文献2

科学通报
2004年 第12期

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