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《遗传》 CSCD 北大核心

作品数6074被引量38781H指数61
《遗传》杂志是中国科学院遗传与发育生物学研究所和中国遗传学会主办、科学出版社出版的国家级学术期刊,中文核心期刊,中国精品科技期刊。刊登内容主要涉及遗传学、基因组学、细胞生物学、发育生物学、生物进化、遗...查看详情>>
  • 主办单位中国遗传学会;中国科学院遗传与发育生物学研究所
  • 国际标准连续出版物号0253-9772
  • 国内统一连续出版物号11-1913/R
  • 出版周期月刊
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基于转录组学挖掘与分析NJ9108水稻种子寿命的关键基因
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作者 韩超飞 陈灵 +4 位作者 王源秀 程前 左胜 刘华彬 王程亮 《遗传》 北大核心 2025年第3期351-365,共15页
种子寿命是种子在贮藏期间维持生活力的一段时间,是衡量种子质量的重要指标,其寿命的改变直接影响种子在田间的出苗率、幼苗形态建成以及储藏时间。因此,挖掘种子寿命基因对培育耐储藏和长寿命种子具有重要的价值。本研究通过对不同水... 种子寿命是种子在贮藏期间维持生活力的一段时间,是衡量种子质量的重要指标,其寿命的改变直接影响种子在田间的出苗率、幼苗形态建成以及储藏时间。因此,挖掘种子寿命基因对培育耐储藏和长寿命种子具有重要的价值。本研究通过对不同水稻品系的种子进行人工加速老化处理,发现NJ9108种子是一种耐老化的水稻品系。利用转录组技术,对其未老化和老化后所注释的基因进行mfuzz模糊聚类,可分为6个亚类,共有8,384个基因被老化诱导上调/下调表达;对这些差异表达基因进行GO和KEGG富集分析显示,在生物学过程(biologicalprocesses,BP)、细胞组分(cellularcomponents,CC)和分子功能(molecularfunctions,MF)中的差异显著基因有42个被富集到苯丙烷类生物合成、31个被富集到糖信号以及42个被富集到植物激素信号转导等通路中,它们作为最主要的通路参与NJ9108的耐老化过程。qRT-PCR结果显示,与ZH11相比,NJ9108种子经老化处理后,苯丙烷类生物合成通路中的4-香豆酸辅酶A连接酶5(4CL5)、肉桂醇脱氢酶5(CAD5)以及过氧化物酶体3和86(PRX3和PRX86)等基因显著上调表达;糖信号通路中的β-葡萄糖苷酶18和22(BGLU18和BGLU22)及海藻糖-6-磷酸磷酸酶3(TPP3)基因同样显著上调表达;植物激素信号转导通路中的细胞分裂素响应12(RR12)和响应脱落酸(ABA)诱导的蛋白激酶5(SAPK5)基因老化后显著上调表达,而生长素响应基因12和20(IAA12和IAA20)显著下调表达,以上基因的表达趋势均与转录组数据结果一致,暗示它们可能是调控水稻种子寿命的关键基因,其中BGLU18、BGLU22、OsRR12和TPP3作为最新鉴定的种子寿命基因后续可重点进行研究。本研究结果为解析水稻种子寿命调控网络和培育耐老化的水稻品系提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 种子寿命 转录组 植物激素 糖信号 苯丙烷合成
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靶向RNA的CRISPR/Cas系统及衍生技术 被引量:1
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作者 周迅 周世杰 +1 位作者 刘捷 王宇祥 《遗传》 北大核心 2025年第8期842-860,共19页
RNA编辑是表观遗传学领域重要的研究方向之一。随着研究的深入,科学家们发现CRISPR/Cas系统不仅可以靶向DNA,也可以靶向RNA,从而实现转录水平的基因精准编辑;同时,使用CRISPR/Cas系统进行RNA编辑也可以避免对基因组的破坏。目前,基于靶... RNA编辑是表观遗传学领域重要的研究方向之一。随着研究的深入,科学家们发现CRISPR/Cas系统不仅可以靶向DNA,也可以靶向RNA,从而实现转录水平的基因精准编辑;同时,使用CRISPR/Cas系统进行RNA编辑也可以避免对基因组的破坏。目前,基于靶向RNA的CRISPR系统已开发出多种衍生技术,如RNA敲低和编辑、核酸检测和成像、RNA示踪等。这些衍生技术的出现,为生物遗传机制解析和疾病治疗提供了有利工具。本文归纳总结了靶向RNA的CRISPR/Cas系统的结构、功能、机制以及开发的衍生技术,以期丰富人们对CRISPR/Cas系统编辑RNA的认知。 展开更多
关键词 基因编辑 CRISPR/Cas系统 RNA 功能及应用
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CD209同源基因在斑马鱼中的鉴定及功能表征
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作者 杨晓君 黄振瀚 +2 位作者 刘伟 张文清 黄志斌 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期947-957,共11页
先天免疫反应在维持机体稳态中扮演关键角色,其启动与先天免疫细胞表面的模式识别受体或损伤相关分子密切相关。CD209作为巨噬细胞或树突状细胞表面的模式识别受体,在免疫功能中具有重要作用。然而,目前尚不清楚CD209在体内对先天免疫... 先天免疫反应在维持机体稳态中扮演关键角色,其启动与先天免疫细胞表面的模式识别受体或损伤相关分子密切相关。CD209作为巨噬细胞或树突状细胞表面的模式识别受体,在免疫功能中具有重要作用。然而,目前尚不清楚CD209在体内对先天免疫细胞如巨噬细胞、中性粒细胞的影响。本研究通过多序列比对和系统进化树构建,发现斑马鱼(Danio rerio)中存在3个与人CD209同源的基因,分别是cd209(Ensembl ID:ENSDARG00000029461)、zgc:174904(Ensembl ID:ENSDARG00000059049)和si:dkey-187i8.2(Ensembl ID:ENSDARG00000096624)。与Ensembl数据库中的cd209和si:dkey-187i8.2基因相比,zgc:174904在序列上与人CD209更为相似。通过整体原位杂交和荧光共定位实验,本研究发现zgc:174904主要在巨噬细胞表达。进一步通过morpholino敲低实验,结果显示,敲低zgc:174904会导致M1型巨噬细胞相关基因的上调以及成熟中性粒细胞数量的减少,表明zgc:174904在功能上与CD209更为相似。本研究结果不仅揭示了CD209在调控巨噬细胞功能和中性粒细胞发育中的潜在作用,还为先天免疫机制的研究提供了重要的线索。 展开更多
关键词 先天性免疫 CD209 巨噬细胞极化 粒细胞 斑马鱼
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新冠肺炎遗传易感基因的研究进展 被引量:2
4
作者 李元丰 吴天准 +4 位作者 陈顺琦 王玉婷 曾涛 李若凡 周钢桥 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期963-975,共13页
新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染人体后,个体间存在显著不同的新冠肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)临床症状。机体遗传因素在新冠病毒感染后的临床转归过程中发挥重要的作用... 新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染人体后,个体间存在显著不同的新冠肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)临床症状。机体遗传因素在新冠病毒感染后的临床转归过程中发挥重要的作用。以全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)为代表的遗传关联研究方法,已成功鉴定了多个与新冠肺炎相关的易感基因,为新冠肺炎防诊治措施的研发提供了理论基础。本文综述了新冠肺炎遗传易感基因的研究进展,包括多种表型、多个人群、多种遗传变异类型的新冠肺炎全基因组关联研究以及易感基因区域的精细定位研究等,旨在为新冠肺炎遗传易感基因的后续研究提供参考。 展开更多
关键词 新冠病毒 新冠肺炎 遗传易感基因 全基因组关联研究
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长雄野生稻有利基因的发掘与利用 被引量:4
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作者 廉小平 黄光福 +3 位作者 张玉娇 张静 胡凤益 张石来 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期765-780,共16页
人类将普通野生稻驯化为亚洲栽培稻,其农艺性状如株高、落粒性、穗型等发生了重要变化,产量也大幅提高,但许多优良性状如抗逆性等却丢失。长雄野生稻与亚洲栽培稻同属AA基因组,蕴藏了许多生物胁迫和非生物胁迫的抗性基因,被认为是亚洲... 人类将普通野生稻驯化为亚洲栽培稻,其农艺性状如株高、落粒性、穗型等发生了重要变化,产量也大幅提高,但许多优良性状如抗逆性等却丢失。长雄野生稻与亚洲栽培稻同属AA基因组,蕴藏了许多生物胁迫和非生物胁迫的抗性基因,被认为是亚洲栽培稻遗传改良的潜在基因库。本文总结了长雄野生稻生物及非生物胁迫抗性、地下茎性状以及其他潜在应用价值性状,包括白叶枯抗性、抗旱性、耐热性、自交不亲和性、氮高效利用以及高产等有利性状。基于长雄野生稻地下茎性状开展多年生稻育种实践的应用研究,对长雄野生稻进行从头驯化的策略进行了探讨,以期为长雄野生稻基础研究及栽培稻遗传改良提供理论参考。 展开更多
关键词 长雄野生稻 有利基因 多年生稻 基因组编辑 从头驯化
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一例SOX10基因缺失所致的Waardenburg综合征2型合并低促性腺激素性性腺功能减退症的诊断和基因检测分析 被引量:3
6
作者 王思琪 陈阳 +5 位作者 罗宽宏 史宁杰 肖康丽 崔振海 曾天舒 黎慧清 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1158-1166,共9页
低促性腺激素性性腺功能减退症(hypogonadotropic hypogonadism,HH)是以下丘脑–垂体–性腺激素轴功能障碍为主要特征的一类疾病,可致性激素水平低和生育能力受损。伴随嗅觉丧失/减退的HH被称为Kallmann综合征(Kallmann syndrome,KS)。W... 低促性腺激素性性腺功能减退症(hypogonadotropic hypogonadism,HH)是以下丘脑–垂体–性腺激素轴功能障碍为主要特征的一类疾病,可致性激素水平低和生育能力受损。伴随嗅觉丧失/减退的HH被称为Kallmann综合征(Kallmann syndrome,KS)。Waardenburg综合征(Waardenburg syndrome,WS)是一种罕见的常染色体显性遗传病,以感音神经性听力损失以及色素沉着异常为主要特征。本研究收集1例不明原因的低促性腺激素性性腺功能减退和先天性耳聋患者的临床资料,该患者进入青春期后无明显第二性征发育,在22q13.1区域(Chr.22:38106433-38525560)存在杂合缺失,至少419 kb,此区域覆盖了SOX10基因。患者父母、妹妹基因测序分析未见异常。通过总结分析该病例特点,分析探讨低促性腺激素性性腺功能减退症与Waardenburg综合征2型在分子生物学上的病因关联,丰富后续遗传学研究的临床资料,同时为此类疾病的诊疗措施提供参考。 展开更多
关键词 WAARDENBURG综合征 低促性腺激素性性腺功能减退症 KALLMANN综合征 SOX10基因 突变
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小鼠雄性生殖干细胞转录组分析揭示成熟精原干细胞特征
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作者 郭彦 杨乐乐 戚华宇 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期591-608,I0001,共19页
精原干细胞(spermatogonial stem cells,SSCs)是成年动物睾丸中的成体干细胞,具有自我更新与分化的能力。小鼠(Mus musculus)精原干细胞来源于胚胎期的原始生殖细胞(primodial germ cells,PGCs),小鼠出生前原始生殖细胞处于有丝分裂静... 精原干细胞(spermatogonial stem cells,SSCs)是成年动物睾丸中的成体干细胞,具有自我更新与分化的能力。小鼠(Mus musculus)精原干细胞来源于胚胎期的原始生殖细胞(primodial germ cells,PGCs),小鼠出生前原始生殖细胞处于有丝分裂静止状态,出生后恢复增殖并由曲细精管中央迁移至管壁基质,建立稳定的精原干细胞克隆。成熟小鼠的精原干细胞周期性地启动精子发生以维持雄性动物长期稳定的生殖能力。精原干细胞在其建立和成熟后是否具有特征上的差异目前尚不清楚。本研究在前期建立的不同年龄小鼠精原干细胞(表达多能性基因Pou5f1编码的OCT4)转录组数据基础上,对小鼠新生期(出生后3天)、幼年期(出生后7天)和成熟期(2~3月龄)精原干细胞的基因表达差异进行了生物信息学分析,包括差异表达基因(differentially expression genes,DEGs)的筛选、DEGs编码的蛋白相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)的建立、功能聚类富集(Gene Ontology,GO)和通路分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG),以及使用基于GO、KEGG和HALLMARK的基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)。结果显示,OCT4阳性精原干细胞在小鼠新生期、幼年期和成熟期存在大量差异表达基因,所编码的蛋白主要生物学功能集中在生物合成和能量代谢、免疫反应、细胞连接和迁移以及细胞分化等方面。精原干细胞细胞膜成分的显著变化可能影响精原干细胞的超敏反应、细胞间相互作用以及对细胞外环境因子的应答反应。在能量代谢方式上,随着年龄的增加,OCT4阳性精原干细胞逐渐从线粒体氧化磷酸化作用转变为糖酵解作用,同时也显著减少了细胞内核糖体形成相关基因的转录。这些结果为进一步研究雄性生殖干细胞形成和成熟的调控机制提供了新的思路。 展开更多
关键词 精原干细胞 OCT4 转录组 差异表达基因
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MCM2通过抑制p53信号通路促进胆管癌细胞的增殖、迁移和侵袭 被引量:1
8
作者 王翠玲 刘信燚 +3 位作者 王亚会 张争 王治东 周钢桥 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期230-244,共15页
微小染色体维持蛋白2(minichromosome maintenance protein 2,MCM2)的异常表达与多种恶性肿瘤的发生发展密切相关。为探索MCM2基因对胆管癌细胞肿瘤生物学行为的影响及其潜在的作用机制,本研究首先采用cell counting kit-8(CCK-8)、平... 微小染色体维持蛋白2(minichromosome maintenance protein 2,MCM2)的异常表达与多种恶性肿瘤的发生发展密切相关。为探索MCM2基因对胆管癌细胞肿瘤生物学行为的影响及其潜在的作用机制,本研究首先采用cell counting kit-8(CCK-8)、平板细胞克隆形成、Transwell和Invasion实验证实,MCM2可促进胆管癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力;流式细胞术检测结果显示,MCM2可加快细胞周期进程,抑制细胞凋亡。进一步通过对胆管癌组织RNA测序数据集的分析发现,MCM2基因与p53信号通路的激活显著负相关。采用实时定量PCR(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)和蛋白质免疫印迹(Western blotting,WB)实验发现,在胆管癌细胞中MCM2可显著下调p53和BAX的mRNA和蛋白表达水平,显著上调BCL2和CCND1的mRNA和蛋白表达水平。采用流式细胞术、qRT-PCR和WB实验进一步证实MCM2基因依赖于p53通路发挥影响胆管癌细胞周期和凋亡的功能。最后,通过分析MCM2的表达水平与胆管癌患者临床预后的相关性发现,MCM2在胆管癌组织中的表达显著高于癌旁组织,且其高表达与患者的不良预后显著相关。综上所述,本研究初步揭示MCM2可能通过抑制p53信号通路促进胆管癌的发生发展,并提示MCM2的高表达与胆管癌的不良预后显著相关,为未来胆管癌新的临床诊治措施的研发提供了理论依据。 展开更多
关键词 胆管癌 MCM2 细胞增殖 细胞迁移 细胞侵袭 细胞周期 细胞凋亡 P53
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二甲双胍对斑马鱼骨骼发育及损伤修复的机制研究 被引量:1
9
作者 贾婷婷 雷蕾 +3 位作者 吴歆媛 蔡顺有 陈艺璇 薛钰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期68-79,共12页
二甲双胍(metformin,MET)是治疗糖尿病的一线药物,对骨骼疾病也有一定的治疗效果,但具体作用机制尚不明确。本研究利用斑马鱼(Danio rerio)构建骨质疏松模型,通过荧光观察、骨骼染色、半定量PCR、原位杂交及ELISA等技术方法,探究MET对... 二甲双胍(metformin,MET)是治疗糖尿病的一线药物,对骨骼疾病也有一定的治疗效果,但具体作用机制尚不明确。本研究利用斑马鱼(Danio rerio)构建骨质疏松模型,通过荧光观察、骨骼染色、半定量PCR、原位杂交及ELISA等技术方法,探究MET对斑马鱼骨骼发育及损伤修复的作用机制。首先通过胚胎致死率、骨骼矿化及钙化程度确定了MET的工作浓度是0.1%,该浓度MET对斑马鱼胚胎和幼鱼的骨骼发育均有显著的促进作用,可通过增强骨骼调控基因的m RNA水平和蛋白质水平实现。进一步利用枸橼酸铁铵(ferric ammonium citrate,FAC)和硝基还原酶/甲硝唑(nitroreductase/metronidazole,NTR/MTZ)系统构建斑马鱼体外和体内骨质疏松模型,并利用MET进行恢复实验,结果表明MET能显著修复FAC或MTZ诱导引起的骨骼矿化面积减小、脊椎钙化减少、成骨分化减弱等骨质疏松表型,通过促进成骨细胞再生、增强成骨细胞标记物(sp7、ALP)表达和抑制破骨细胞标记物(ctsk、mmp9、TRAP)的活性发挥修复作用。最后,通过检测Bmp信号成员的表达水平变化,初步证明MET不仅可以增强Bmp的mRNA和蛋白表达,还可通过激活Bmp下游信号通路促进斑马鱼骨骼发育和损伤修复。综合本研究的实验结果表明,MET作为治疗糖尿病专用药的同时,对斑马鱼骨骼发育也有促进作用,且对骨质疏松症具有显著的修复功效,为老药新用提供了新的研究方向和实验支撑。 展开更多
关键词 二甲双胍 斑马鱼 骨质疏松 损伤修复 BMP
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神经嵴细胞和神经嵴病及其致病机制的研究进展 被引量:4
10
作者 蒋卓远 查艳 +1 位作者 石小峰 张永彪 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期117-133,I0001,共18页
神经嵴细胞(neural crest cells,NCCs)是一类脊椎动物特有的可迁移的多能干细胞,其可分化为软骨细胞、神经元和黑色素细胞等多种类型细胞。NCCs的形成、迁移和分化受到严格调控,任何扰乱NCCs发育的因素都可导致胚胎发育畸形。由神经嵴... 神经嵴细胞(neural crest cells,NCCs)是一类脊椎动物特有的可迁移的多能干细胞,其可分化为软骨细胞、神经元和黑色素细胞等多种类型细胞。NCCs的形成、迁移和分化受到严格调控,任何扰乱NCCs发育的因素都可导致胚胎发育畸形。由神经嵴细胞发育异常所导致的一系列疾病统称为神经嵴病(neurocristopathies,NCPs)。NCPs种类繁多且表型复杂,可累及人体多个部位(颅面部、心脏、肠胃和皮肤等),严重危害患者的身体机能和心理健康。NCPs占所有出生缺陷患儿的1/3,遗传因素是导致NCPs的主要风险因素,但环境风险因子以及基因–环境交互作用异常也可导致NCPs。本文对神经嵴细胞和神经嵴病及其致病机制进行综述,为系统认知神经嵴细胞发育以及神经嵴病提供参考,为了解神经嵴病的病因以及开展有效防控提供科学支撑。 展开更多
关键词 神经嵴细胞 神经嵴病 基因调控网络 风险因素 发病机制
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《遗传》作者须知
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《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期422-422,共1页
《遗传》为中国精品科技期刊,是反映中国遗传学原创性研究成果及国际遗传学进展的中文核心期刊。读者对象为生命科学领域研究与教学人员。技术研发人员。研究生及本科生等。
关键词 中文核心期刊 原创性研究 读者对象 研究与教学 研究生 作者须知 中国精品科技期刊 本科生
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猪乳头性状生理学和遗传学研究进展 被引量:5
12
作者 周李生 赵为民 +3 位作者 涂枫 吴云鹤 任守文 方晓敏 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期384-390,共7页
猪乳头性状属于繁殖性状,直接影响母猪哺乳率和仔猪成活率,是种猪遗传改良的重要指标,揭示其遗传机理对提高种猪繁殖性能具有重要意义。猪乳头性状复杂多样,包括乳头数、乳头类型、乳头位置分布和波动不对称性现象等,但其遗传机制尚不... 猪乳头性状属于繁殖性状,直接影响母猪哺乳率和仔猪成活率,是种猪遗传改良的重要指标,揭示其遗传机理对提高种猪繁殖性能具有重要意义。猪乳头性状复杂多样,包括乳头数、乳头类型、乳头位置分布和波动不对称性现象等,但其遗传机制尚不清晰。本文对猪乳头及乳腺的形成与发育过程、猪乳头性状调控基因数量性状位点(quantitative trait locus, QTL)定位和候选基因等生理学和遗传学方面的研究进展进行了综述,旨在为今后鉴别影响猪乳头性状的因果突变和主效基因,揭示猪乳头在胚胎发育过程中产生数目、类型和位置差异的复杂遗传机制提供新的视角。 展开更多
关键词 乳头性状 遗传研究
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Krüppel样因子在肌肉组织中的功能研究进展 被引量:9
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作者 庄兆辉 仲永 +1 位作者 陈月婵 张志威 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期733-748,共16页
Krüppel样因子(Krüppel-like factors,KLFs)是一类C-末端含有3个C2H2锌指结构的转录因子,N-末端为转录调控结构域,能够结合多种特异蛋白质,介导转录调控。目前在人体基因组中共发现18种KLFs,它们在多种类型人类细胞的分化、... Krüppel样因子(Krüppel-like factors,KLFs)是一类C-末端含有3个C2H2锌指结构的转录因子,N-末端为转录调控结构域,能够结合多种特异蛋白质,介导转录调控。目前在人体基因组中共发现18种KLFs,它们在多种类型人类细胞的分化、表型维持和生理功能调控中发挥重要作用。多个KLFs参与了对人和动物的心肌、平滑肌和骨骼肌的发育和功能的调控。在心肌中,KLF4、KLF10、KLF11和KLF15参与心肌肥大的负调控,KLF6参与调控心脏纤维化,KLF13调控胚胎时期的心肌发育。在血管平滑肌中,KLF4受促增殖或促分化因子调控,介导调控血管平滑肌表型转换;KLF5促进血管平滑肌增殖,KLF8和KLF15抑制血管平滑肌增殖。在骨骼肌中,KLF2、KLF3、KLF4、KLF10和KLF15调控骨骼肌发育,此外,KLF15是肌肉组织能量代谢的调节因子。本文综述了KLFs在心肌、平滑肌和骨骼肌中的功能研究进展,为进一步揭示KLFs在肌肉组织中的作用和肌肉相关疾病的分子机制提供参考。 展开更多
关键词 Krüppel样因子 心肌 平滑肌 骨骼肌
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KLF1和KLF9对K562细胞红系分化的协同调控作用 被引量:5
14
作者 任岚 肖茹丹 +3 位作者 张倩 娄晓敏 张昭军 方向东 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期998-1006,共9页
Krüppel样因子(Krüppel-like factors,KLFs)是锌指蛋白超家族的一个亚家族,参与细胞内的多种生理、病理过程,该家族成员在红细胞分化发育过程中发挥非常重要的作用,但是家族成员间对红系分化的协同调控作用还鲜有报道。本课... Krüppel样因子(Krüppel-like factors,KLFs)是锌指蛋白超家族的一个亚家族,参与细胞内的多种生理、病理过程,该家族成员在红细胞分化发育过程中发挥非常重要的作用,但是家族成员间对红系分化的协同调控作用还鲜有报道。本课题组前期研究发现,KIF家族成员KLF1和KLF9在已分化的红系细胞中的表达水平显著高于造血干细胞。为进一步探讨二者在红系分化中是否存在协同作用,本研究在K562细胞中分别过表达/敲低表达KLF1和KLF9,检测二者表达的相关性,发现KLF1和KLF9的基因表达呈现正相关,且二者共表达可以显著促进K562细胞红系分化,特异地增强β-珠蛋白的表达。通过对KLF1、KLF9单独和共同过表达、敲低表达的K562细胞转录组数据的分析发现二者可能通过PI3K-Akt和FoxO通路协同调控红系分化,FOS、TF、IL8是协同调控的候选靶基因。本研究结果为后续深入研究KLF1和KLF9协同调控红系分化的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 红系分化 KLF 转录组测序 转录因子
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国家级生物大数据中心展望 被引量:9
15
作者 马英克 鲍一明 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期938-943,共6页
大数据时代下,科学大数据已经成为科技创新和社会经济发展的新动力。我国是生物数据生产大国,生命大数据是人口健康和国家安全的重要战略资源。面对我国生物数据因存储零散、缺乏系统监管而大量丢失和流失,以及严重依赖国际生物组学大... 大数据时代下,科学大数据已经成为科技创新和社会经济发展的新动力。我国是生物数据生产大国,生命大数据是人口健康和国家安全的重要战略资源。面对我国生物数据因存储零散、缺乏系统监管而大量丢失和流失,以及严重依赖国际生物组学大数据中心的局面,亟需从国家层面建设我国自己的生命大数据保存和管理体系。本文以美国NCBI为例介绍了国际生物大数据中心的发展历程及现状,阐明我国建立国家级生物大数据中心的重要性、迫切性、当前历史机遇和发展前景。中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心为此做了大量努力,并在数据存储、汇交和转化应用上取得了阶段性成果,以期推进我国生物大数据中心的建设,提高生命科学研究的国际竞争力和影响力。 展开更多
关键词 生命与健康 大数据 国家级 大数据中心
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面向国家重大需求打造国际一流研究所——庆祝中国科学院北京基因组研究所成立15周年 被引量:1
16
作者 薛勇彪 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期925-928,共4页
DNA是细胞核中携带生物生长指令的遗传物质。1953年,沃森和克里克提出DNA双螺旋结构模型,推动了遗传密码的复制、转录、转译等一系列生命功能的研究,也由此揭开了分子生物学的序幕。DNA上的核苷酸序列最终决定了生命的遗传信息,而解析DN... DNA是细胞核中携带生物生长指令的遗传物质。1953年,沃森和克里克提出DNA双螺旋结构模型,推动了遗传密码的复制、转录、转译等一系列生命功能的研究,也由此揭开了分子生物学的序幕。DNA上的核苷酸序列最终决定了生命的遗传信息,而解析DNA序列则是研究生物生长发育、环境适应和疾病发生机理的核心基础。自20世纪80年代第一台DNA测序仪诞生以来,基因组科学迎来了发展的新时期。伴随着基因组学技术的快速发展和生物信息数据的爆炸性增长,基因组科学沿着基因组、表观组和RNA组等研究轨迹迅速发展起来,一系列里程碑式的研究成果引领了生命科学领域的发展。 展开更多
关键词 基因组学技术 中国科学院 研究所 DNA序列 双螺旋结构模型 北京 国际 生物生长
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Wnt信号通路在毛细胞分化和再生过程中的作用 被引量:5
17
作者 范晴晴 孟飞龙 +2 位作者 房冉 李高鹏 赵小立 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期897-907,共11页
Wnt信号通路在生物发育和维持内环境稳态过程中起着重要作用。Wnt配体通过与Frizzle受体结合参与体轴的形成、细胞分化和细胞命运决定等生命活动。在小鼠内耳发育过程中,Wnt信号通路扮演了重要角色:在内耳发育早期阶段,参与听基板的特... Wnt信号通路在生物发育和维持内环境稳态过程中起着重要作用。Wnt配体通过与Frizzle受体结合参与体轴的形成、细胞分化和细胞命运决定等生命活动。在小鼠内耳发育过程中,Wnt信号通路扮演了重要角色:在内耳发育早期阶段,参与听基板的特化和听泡的形成;在内耳发育后期阶段,调控毛细胞分化及毛细胞纤毛束的定向。本文综述了Wnt信号通路在内耳毛细胞发育分化及再生过程中的研究进展,以期为从事相关领域的科研人员提供参考。 展开更多
关键词 WNT信号通路 听基板 听泡 毛细胞再生
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酿酒酵母染色体设计与合成研究进展 被引量:7
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作者 徐赫鸣 谢泽雄 +3 位作者 刘夺 吴毅 李炳志 元英进 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期865-876,共12页
随着合成生物学的蓬勃发展,基因组学的研究正在由读取基因组信息拓展到以编写基因组信息为主的合成基因组学时代。2009年,由Jef D.Boeke教授提出的人工合成酵母基因组计划(Sc2.0)旨在合成世界上首个真核生物基因组。在美、中、英、法、... 随着合成生物学的蓬勃发展,基因组学的研究正在由读取基因组信息拓展到以编写基因组信息为主的合成基因组学时代。2009年,由Jef D.Boeke教授提出的人工合成酵母基因组计划(Sc2.0)旨在合成世界上首个真核生物基因组。在美、中、英、法、澳大利亚、新加坡等多国科学家的努力下,目前已经完成1/3的酵母染色体的人工合成。本文从合成基因组学领域的发展历程出发,介绍了Sc2.0计划中酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)染色体设计与合成的最新进展,包括酿酒酵母9号染色体右臂、3号染色体、2号染色体、5号染色体、6号染色体、10号染色体和12号染色体的设计与合成过程,阐述了其各自的合成策略以及生物学意义,以期为合成基因组学的深入开展提供借鉴与参考。 展开更多
关键词 合成基因组学 合成酵母基因组计划(Sc2.0) 合成型酵母染色体
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KRAB型锌指蛋白的进化及在物种演化中的功能 被引量:3
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作者 王进龙 王建 田春艳 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期971-978,共8页
C2H2型锌指蛋白家族是目前发现的哺乳动物中最大的转录/转录调控因子家族,由一小群古老的含有真核锌指结构的转录因子经过多次基因复制和功能分化演化而来。KRAB型锌指蛋白(KRAB.containing zinc finger proteins,KRAB-ZFPs)作为C2H2型... C2H2型锌指蛋白家族是目前发现的哺乳动物中最大的转录/转录调控因子家族,由一小群古老的含有真核锌指结构的转录因子经过多次基因复制和功能分化演化而来。KRAB型锌指蛋白(KRAB.containing zinc finger proteins,KRAB-ZFPs)作为C2H2型锌指蛋白家族中最大的亚家族,最早出现在四足脊椎动物,并随物种的进化数量快速增长,在人类中占据C2H2型锌指蛋白的60%左右。在物种演化中,进化压力主要改变KRAB-ZFPs的DNA结合能力,而KRAB-ZFPs介导的转录抑制能力则稳定存在。同时,多种KRAB-ZFPs能够与KRAB相关蛋白1(KRAB-associated protein 1,KAP1)协同作用沉默哺乳动物中反转录元件的活性,并与之协同进化,严格限制反转录原件的跳跃能力。本文综述了KRAB-ZFPs的数量倍增、锌指结构的灵活多变、KRAB-ZFPs/KAP1的转录抑制能力和反转录元件的跳跃性在促进哺乳动物调控网络的差异、基因组稳定性的变化和物种进化中的作用,旨在进一步揭示KRAB-ZFPs在推动物种稳定演化中的特点和功能。 展开更多
关键词 KRAB 锌指 KRAB-ZFPs 进化 KAP1 转座子
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快速构建多重sgRNA载体利用CRISPR/Cas9技术敲除拟南芥IAA2基因 被引量:12
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作者 刘丁源 邱婷 +3 位作者 丁晓辉 李苗苗 朱睦元 王君晖 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期756-764,共9页
IAA2(Indole Acetic Acid 2)是拟南芥Aux/IAA生长素响应基因大家族中的一员,目前还没有它的突变体的报道,阻碍了对其功能和作用机制的深入研究。在CRISPR/Cas9基因组编辑技术中,1个sgRNA只能靶向基因的1个位点,有时基因敲除的效率并不... IAA2(Indole Acetic Acid 2)是拟南芥Aux/IAA生长素响应基因大家族中的一员,目前还没有它的突变体的报道,阻碍了对其功能和作用机制的深入研究。在CRISPR/Cas9基因组编辑技术中,1个sgRNA只能靶向基因的1个位点,有时基因敲除的效率并不高。为了提高敲除效率,本文在Golden-Gate克隆技术的基础上,通过两轮PCR扩增,将每3个sgRNA串联到同1个入门载体中,再将入门载体与含Cas9表达框的目标载体LR反应,获得最终的表达载体。结果表明,设计的6个sgRNA有4个发挥了作用,产生了碱基插入突变和大片段缺失突变等多种可遗传的突变。与单个sgRNA相比,多重sgRNA的基因敲除效率高、种系突变多;与其他构建多重sgRNA载体的方法相比,本方法具有快速、高效等优点。本文所得到的5个突变体为后续的IAA2功能研究提供了良好的材料。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 多重sgRNA串联 基因组编辑 IAA2基因
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