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携带增强绿色荧光蛋白的重组甲型流感病毒构建及体外应用
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作者 李佳 王东红 +8 位作者 蒋宇婕 韩瑞雯 楚巧鸿 王瑭琪 刘冠雅 张雪洁 黄保英 邓瑶 谭文杰 《微生物学报》 北大核心 2025年第10期4607-4620,共14页
【目的】构建表达增强绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)报告基因的重组甲型流感病毒,并研究其体外生物学特性、抗病毒药物筛选及中和抗体检测的应用。【方法】运用流感病毒反向遗传学技术在H1N1-PR8病毒神经氨酸... 【目的】构建表达增强绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)报告基因的重组甲型流感病毒,并研究其体外生物学特性、抗病毒药物筛选及中和抗体检测的应用。【方法】运用流感病毒反向遗传学技术在H1N1-PR8病毒神经氨酸酶(NA)基因的C端插入EGFP基因,成功构建并拯救出重组甲型流感病毒,命名为PR8NAEGFP/WSN。采用逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)与测序分析验证EGFP插入位置的准确性及遗传稳定性;通过EGFP报告基因表达、复制动力学分析和空斑形态观察,对重组病毒(PR8NAEGFP/WSN)和对照病毒(PR8NA/WSN,无EGFP插入)进行鉴定;采用病灶形成试验(focus-forming assay,FFA)、定量聚合酶链式反应(quantitative polymerase chain reaction,q PCR)和EGFP荧光检测,评估流感病毒阳性药物法匹拉韦的体外抗病毒药效;同时采用病灶减少中和试验(focus reduction neutralization test,FRNT)和报告基因活性检测,开展甲型流感病毒(influenza A virus,IAV)中和抗体检测。【结果】重组病毒(PR8NAEGFP/WSN)在鸡胚中经过5代盲传后仍能保持遗传稳定。与PR8NA/WSN相比,该重组病毒在48 h测得的病毒滴度略低,结晶紫噬斑形态与对照病毒相似。采用重组病毒测得的法匹拉韦半数有效浓度(half maximal effective concentration,EC50)与对照病毒一致,且通过FFA、q PCR和EGFP荧光等多种检测方法所得的EC50值之间具有良好的相关性。FRNT和EGFP荧光测定的中和抗体滴度相关系数r为0.9304,结果具有良好的一致性。【结论】携带报告基因的重组流感病毒为IAV的基础研究、抗病毒药物和疫苗评价提供了实时可视化的工具。 展开更多
关键词 甲型流感病毒 反向遗传学 报告基因 体外应用 抗病毒药物 中和抗体
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基于多种机器学习算法鉴定四个靶基因作为儿童急性轮状病毒感染的分子生物标志物的研究 被引量:2
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作者 王雪琪 黄龙 +6 位作者 张锦华 郑港 王怡鹏 何文俊 刁美 庞立丽 黄涛 《病毒学报》 北大核心 2025年第2期446-461,共16页
轮状病毒引起的儿童腹泻通常表现为严重的腹泻、呕吐和脱水,尤其对免疫系统尚未完全成熟的儿童构成较大健康威胁。尽管现有的诊断方法如PCR和ELISA在临床实践中被广泛应用,但仍面临准确性、时效性和成本等方面的挑战。因此,本研究提出... 轮状病毒引起的儿童腹泻通常表现为严重的腹泻、呕吐和脱水,尤其对免疫系统尚未完全成熟的儿童构成较大健康威胁。尽管现有的诊断方法如PCR和ELISA在临床实践中被广泛应用,但仍面临准确性、时效性和成本等方面的挑战。因此,本研究提出了一种结合生物信息学和机器学习技术的创新分析框架。通过整合来自多个队列的基因表达数据,识别出了与急性轮状病毒感染高度相关的分子生物标志物,并验证了其在不同临床组中的特异性。研究发现,四个基因(CD1C、IFI27、IFI44和IFI44L)的组合在急性轮状病毒感染组与健康组之间表现出显著的差异表达,与其他常见病原引起的腹泻相比,这一组合具有更高的特异性。这些发现为儿童轮状病毒腹泻的早期诊断提供了重要的见解,并为开发快速、灵敏且经济高效的临床诊断工具奠定了基础。此外,通过功能富集分析和免疫细胞浸润分析,揭示了这些基因在免疫反应中的潜在作用,特别是在免疫调节和细胞修复中的关键角色。本研究的结果为急性轮状病毒感染的早期诊断和个性化治疗提供了重要的依据和参考。 展开更多
关键词 腹泻 轮状病毒 分子生物标志物 机器学习 免疫细胞浸润
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缺失F1L对重组复制缺陷痘苗病毒天坛株在小鼠中免疫原性与免疫保护效果的影响 被引量:1
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作者 刘士元 任皎 +7 位作者 赵莉 吴依依 刘冠雅 韩一泽 黄保英 王文玲 田厚文 谭文杰 《病毒学报》 北大核心 2025年第2期334-343,共10页
痘苗病毒(Vaccinia virus,VACV)广泛用于疫苗与重组病毒载体。国内拥有自主知识产权的复制缺陷型痘苗病毒天坛株(Non-replicating Tiantan strain Vaccinia virus,NTV)作为新型猴痘疫苗近期已获得临床试验批准。前期研究中,本课题组通... 痘苗病毒(Vaccinia virus,VACV)广泛用于疫苗与重组病毒载体。国内拥有自主知识产权的复制缺陷型痘苗病毒天坛株(Non-replicating Tiantan strain Vaccinia virus,NTV)作为新型猴痘疫苗近期已获得临床试验批准。前期研究中,本课题组通过回插基因C7L获得了重组病毒NTV-C7L(J),然而该重组病毒的免疫原性未得到明显改善,迫切需要进一步改进。本研究利用同源重组技术对NTV-C7L(J)进行了二次基因改造,构建了缺失F1L基因的重组病毒NTV-ΔF1L-C7L(J)。BALB/c小鼠免疫结果表明,105 PFU免疫剂量二次肌肉注射,NTV-ΔF1L-C7L(J)可诱导出较强体液免疫反应和CD8^(+)T细胞反应,其水平明显高于NTV与NTV-C7L(J)免疫组。与2×10^(5) PFU剂量复制型痘苗病毒天坛株(Vaccinia virus Tiantan strain,VTT)组尾部划痕单剂免疫组相比,NTV-ΔF1L-C7L(J)抗体应答低但细胞免疫反应强。初次免疫后第42d采用致死剂量(107 PFU)VACV WR株进行小鼠滴鼻攻毒,NTV-ΔF1L-C7L(J)加强免疫组与VTT单剂免疫组均可提供完全保护,且攻毒后前者小鼠体重保护明显优于后者;但NTV与NTV-C7L(J)免疫组仅呈现部分保护(分别为60%和90%)。研究结果表明∶F1L基因的缺失明显提高了NTV及NTV-C7L(J)的免疫原性与免疫保护效果,且安全性优于VTT。本研究为开发新型痘苗病毒载体及更加安全高效阻断猴痘的疫苗提供了新思路和实验依据。 展开更多
关键词 痘苗病毒 天坛株 复制缺陷 F1L 免疫原性 保护
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埃可病毒11型不同基因型间交叉中和效应及抗原性变异的初步研究 被引量:1
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作者 刘莹 李冀琛 +6 位作者 王蕊 李慧洁 梁钰材 段伟 肖金波 孙强 张勇 《病毒学报》 北大核心 2025年第2期291-300,共10页
埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)是一种常被检出的肠道病毒,近年来在亚洲与欧洲地区多次报道由E11引发新生儿重症病例甚至导致死亡。自1994年E11在我国被首次检出后,其基因型历经多次更替。为探究基因型更替与型间交叉中和能力是否存在... 埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)是一种常被检出的肠道病毒,近年来在亚洲与欧洲地区多次报道由E11引发新生儿重症病例甚至导致死亡。自1994年E11在我国被首次检出后,其基因型历经多次更替。为探究基因型更替与型间交叉中和能力是否存在相关性,本研究选取了曾经在中国流行的A1、A2、C1、C3、D5以及E基因型的代表性毒株,依次进行噬斑试验、浓缩、纯化和灭活,随后与铝佐剂混合,于第0周、第2周、第4周,分三次对6周龄雌性BALB/c小鼠进行免疫。在末次免疫1周后,采集小鼠抗血清进行交叉中和效果评估。中和实验结果表明,不同基因型间的交叉中和能力存在显著差异。部分毒株能够突破前代毒株所形成的免疫保护屏障,这一现象与E11流行基因型转换的规律相契合。其中,D5基因型毒株展现出较高的免疫原性以及较为广谱的交叉保护特性,具备作为理想疫苗候选株的特征。同时,当前流行的D5基因型毒株抗血清对C1和C3基因型毒株提供的交叉保护作用有限,提示未来有可能出现新的基因型更替。此外,通过序列分析发现,VP1-BC loop和VP2-EF loop区域的差异可能对E11毒株的抗原性产生影响,进一步揭示了E11免疫逃逸的潜在机制。本研究系统地探讨了E11的交叉免疫效应及其对基因型更替的影响,为制订E11感染的防控策略和开展疫苗研发提供了重要的参考依据。 展开更多
关键词 肠道病毒 埃可病毒11型 基因分型 交叉中和 血清保护
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2023年中国5岁以下儿童肠道腺病毒分子特征分析
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作者 董梦洁 车如意 +8 位作者 熊光萍 王宏 李金松 孙晓曼 李利利 范佳欣 唐晓苹 张无敌 李丹地 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第9期887-892,共6页
目的深入探究我国5岁以下急性胃肠炎患儿中肠道人腺病毒(Human Adenovirus,HAdV)的分子特征与遗传进化规律,为疾病防控提供基础数据。方法收集2023年中国5岁以下因急性胃肠炎住院和门诊患儿的8074份粪便样本,采用实时荧光检测技术筛查HA... 目的深入探究我国5岁以下急性胃肠炎患儿中肠道人腺病毒(Human Adenovirus,HAdV)的分子特征与遗传进化规律,为疾病防控提供基础数据。方法收集2023年中国5岁以下因急性胃肠炎住院和门诊患儿的8074份粪便样本,采用实时荧光检测技术筛查HAdV,对阳性样本进行测序,并运用GenBank、BioAider和MEGA11.0等生物信息学软件进行基因分型、同源性及系统发育分析。结果8074份样本中HAdV阳性370例(4.58%),包括2种肠道HAdV基因型,HAdV-F41占比高达98.09%,其次为HAdV-F40(1.90%)。结论我国5岁以下急性胃肠炎患儿中HAdV-F41是最优势基因型,生物信息学分析显示我国HAdV主要流行谱系为谱系1和2,暂未受到欧洲地区的谱系3影响。对HAdV开展系统长期监测,有助于揭示HAdV在中国的多样性及其进化规律,为制定更有效的防控策略提供科学依据。 展开更多
关键词 人肠道腺病毒 基因型 急性胃肠炎 分子特征
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C3L敲除改变痘苗病毒天坛株生物学特性并降低小鼠体内致病性
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作者 韩一泽 翟玉倩 +7 位作者 吴长城 刘士元 任皎 赵莉 陈思研 田厚文 王文玲 谭文杰 《病毒学报》 北大核心 2025年第2期344-353,共10页
痘苗病毒C3L编码的补体控制蛋白(Vaccinia virus complement control protein,VCP)具有抑制补体系统激活等生物学功能,但其对病毒复制扩散及致病性的影响及具体机制尚不明确。本研究利用CRISPR/Cas9技术将痘苗病毒天坛株(Vaccinia virus... 痘苗病毒C3L编码的补体控制蛋白(Vaccinia virus complement control protein,VCP)具有抑制补体系统激活等生物学功能,但其对病毒复制扩散及致病性的影响及具体机制尚不明确。本研究利用CRISPR/Cas9技术将痘苗病毒天坛株(Vaccinia virus Tiantan strain,VTT)C3L缺失构建了重组病毒rVTT-mCherryΔC3L,并通过细胞和小鼠模型系统评估其生物学特性。结果显示:在HeLa、Vero和BHK-21细胞中,rVTT-mCherryΔC3L(MOI=0.01)的复制效率与VTT无显著差异,但感染48h后形成的免疫噬斑面积显著增大(分别为VTT的1.3倍、2.1倍和1.6倍,P<0.01);滴鼻感染BALB/c小鼠后,5×10^(4) PFU rVTT-mCherryΔC3L感染的小鼠,体重下降幅度减轻且恢复时间提前,5×10^(5) PFU感染时存活率显著高于VTT组(100%vs 16.7%)。研究结果表明,C3L缺失虽未显著影响病毒复制能力,但细胞间扩散能力增强,而小鼠体内毒力降低。该研究为痘苗病毒减毒疫苗设计及抗正痘病毒策略提供了重要理论依据。 展开更多
关键词 痘苗病毒天坛株 C3L 重组痘苗病毒 细胞间扩散 致病性
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2021-2022年中国12省5岁以下人星状病毒分子流行病学特征研究
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作者 董梦洁 熊光萍 +9 位作者 范佳欣 车如意 唐晓苹 张无敌 庞立丽 章青 孔翔羽 李希希 王宏 李丹地 《病毒学报》 北大核心 2025年第1期107-116,共10页
为了解2021-2022年我国5岁以下儿童中病毒性急性胃肠炎患者HAstV的分子特征及遗传进化规律。对1236份5岁以下急性胃肠炎住院或门诊患儿粪便样本采用实时荧光法筛查HAstV,在HAstV阳性样本中随机选择30例用RT-PCR法扩增并送公司测序,测序... 为了解2021-2022年我国5岁以下儿童中病毒性急性胃肠炎患者HAstV的分子特征及遗传进化规律。对1236份5岁以下急性胃肠炎住院或门诊患儿粪便样本采用实时荧光法筛查HAstV,在HAstV阳性样本中随机选择30例用RT-PCR法扩增并送公司测序,测序成功的HAstV序列利用生物信息学分析软件GenBank、BioAider、MEGA11.0、DNASTAR和BEAST软件对其进行基因分型、遗传进化及贝叶斯分析。2021-2022年我国HAstV阳性率为4.05%(50/1236),测序获得24条基因序列,鉴定结果显示,HAstV-1为主要基因型(66.67%),其次为HAstV-4(20.83%),HAstV-5(8.33%)和HAstV-2(4.16%)。HAstV-1平均进化率约为6.3×10^(-4)(HPD95%2.2×10^(-4)~1.1×10^(-3))替换/位点/年;HAstV-4平均进化率约为7.5×10^(-4)(HPD95%4.9×10^(-4)~1.0×10^(-3))替换/位点/年。本研究显示,2021-2022年我国HAstV基因型别多样,HAstV-1和HAstV-4占比较高且进化速率低。本研究了解我国HAstV的遗传变异情况,为今后病毒防控和疫苗的研发提供一定的基础数据。 展开更多
关键词 星状病毒 分子特征 基因型 平均进化率
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西尼罗病毒和基孔肯雅病毒双价重组DNA疫苗的构建及在小鼠中诱导的免疫应答研究
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作者 舒畅 李梦哲 +7 位作者 翟程程 赵志敏 单徐畅 邴佳洛 祁振勇 邓瑶 翟德胜 谭文杰 《病毒学报》 北大核心 2025年第3期713-724,共12页
构建西尼罗病毒(West nile virus,WNV)与基孔肯雅病毒(Chikungunya virus, CHIKV)的新型双价重组DNA疫苗并在小鼠中评价其免疫原性。本研究以WNV的prM-E蛋白和CHIKV的C-E3-E2-6K-E1或E3-E2-6K-E1蛋白为靶抗原,构建了WNV和CHIKV双价重组... 构建西尼罗病毒(West nile virus,WNV)与基孔肯雅病毒(Chikungunya virus, CHIKV)的新型双价重组DNA疫苗并在小鼠中评价其免疫原性。本研究以WNV的prM-E蛋白和CHIKV的C-E3-E2-6K-E1或E3-E2-6K-E1蛋白为靶抗原,构建了WNV和CHIKV双价重组DNA疫苗VRC-PrME-2A-CE和VRC-PrME-2A-E。转染HEK293T细胞后通过Western blot验证目的蛋白的表达。两剂次同源免疫小鼠,通过ELISA和Elispot进行体液与细胞免疫检测,并与表达WNV-XJ11129-3株的prM-E蛋白的WNV单价DNA疫苗VRC-prME和表达CHIKV 181/clone25的C-E3-E2-6K-E1蛋白的CHIKV单价DNA疫苗VRC-CE进行比较。结果显示,双价DNA疫苗构建成功。重组双价DNA疫苗单剂或加强免疫小鼠后均能诱导较高水平抗原特异性IgG,且与单价疫苗滴度相当。细胞免疫检测结果显示:加强免疫后VRC-PrME-2A-CE表现出针对CHIKV E1和CHIKV E2最高的分泌IFN-γ的T细胞水平,但与单价疫苗VRC-CE无统计学差异。本研究成功构建两款针对WNV和CHIKV的双价DNA疫苗,免疫小鼠后可以诱导产生良好的体液和细胞免疫应答,本研究为新型WNV和CHIKV双价基因工程疫苗的研发应用提供了实验参考。 展开更多
关键词 西尼罗病毒 基孔肯雅病毒 DNA疫苗 小鼠 免疫原性
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重组蛋白疫苗呼吸道黏膜佐剂的种类和研究进展
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作者 胡宏俏 江洁 +2 位作者 曹蕾 李海 张燕 《病毒学报》 北大核心 2025年第4期1269-1279,共11页
呼吸道黏膜佐剂能够增强重组蛋白疫苗在呼吸道黏膜的免疫应答,是近年来疫苗研究中的重要领域之一。黏膜佐剂主要包括聚合物类、细菌毒素类、模式识别受体激动剂类、细胞因子类和小分子多肽类等,它们通过不同作用机制提高重组蛋白疫苗的... 呼吸道黏膜佐剂能够增强重组蛋白疫苗在呼吸道黏膜的免疫应答,是近年来疫苗研究中的重要领域之一。黏膜佐剂主要包括聚合物类、细菌毒素类、模式识别受体激动剂类、细胞因子类和小分子多肽类等,它们通过不同作用机制提高重组蛋白疫苗的免疫原性。黏膜佐剂的作用机制主要包括促进抗原的摄取与呈递、激活先天免疫应答、诱导黏膜免疫部位的特异性免疫应答及调节免疫微环境等。不同作用机制的黏膜佐剂联合使用可以显著提升免疫效果。本研究对常见的呼吸道黏膜佐剂及其研究进展进行综述,为开发安全有效的呼吸道黏膜疫苗提供系统的理论基础和实践指导,以期促进呼吸道黏膜佐剂技术的进一步创新和应用。 展开更多
关键词 呼吸道病毒 黏膜佐剂 重组蛋白疫苗
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融合表达新型冠状病毒RBD与N蛋白的重组腺病毒构建及免疫原性研究
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作者 张鹏 毛彤瑶 +2 位作者 姜苏芮 李丹地 段招军 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第8期845-851,共7页
目的研究融合表达新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)Omicron变异株受体结合域蛋白(RBD)与衣壳蛋白(N)的非复制型5型重组腺病毒的免疫原性,旨在为开发针对SARS-CoV-2 Omicron变异株的高效疫苗... 目的研究融合表达新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)Omicron变异株受体结合域蛋白(RBD)与衣壳蛋白(N)的非复制型5型重组腺病毒的免疫原性,旨在为开发针对SARS-CoV-2 Omicron变异株的高效疫苗提供理论依据和实验基础。方法利用重叠PCR方法获得RBDgs3N片段,同源重组得到质粒pKAd5ESRBDgs3N,重组质粒转染HEK293细胞后收获和扩增重组病毒,氯化铯密度梯度离心法纯化病毒,有限稀释分析法测定病毒滴度,Western blot方法鉴定融合蛋白表达情况。将重组腺病毒肌注免疫BALB/c小鼠,利用间接ELISA方法和酶联免疫斑点技术检测小鼠特异性免疫应答。结果体外纯化获得滴度为1.168×10^(10)IU/mL的重组腺病毒AdV5-RBDgs3N。重组腺病毒体外感染HEK293细胞可成功表达RBDgs3N融合蛋白。单剂肌注免疫能显著诱导小鼠产生针对新冠野毒株(WT)和变异株(Delta,Omicron)RBD的IgG抗体,抗体滴度分别为10^(3.6778)、10^(3.8785)、10^(4.4549),针对保守的N蛋白产生的特异性抗体滴度为10^(4.9422)。RBD特异性细胞免疫的IFN-γ水平为1452 SFC/10^(6)个细胞。结论本研究构建的RBD和N基因融合的非复制型5型重组腺病毒能在BALB/c小鼠体内分别诱导高水平的针对RBD和N蛋白的特异性抗体及RBD特异的细胞免疫,为进一步评价该重组腺病毒作为潜在新冠疫苗提供了研究基础。 展开更多
关键词 SARS-CoV-2疫苗 腺病毒载体 细胞免疫 体液免疫
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2023年福建省急性出血性结膜炎病原体鉴定及基因进化分析
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作者 周蕾 朱颖 +13 位作者 冀天娇 杨倩 刘娜 祝双利 肖金波 于力恒 郭琴 刘莹 李冀琛 栗凡 肖梦怡 张勇 何文祥 严冬梅 《病毒学报》 北大核心 2025年第2期301-309,共9页
本研究利用国家疾病监测信息管理系统,对2023年福建省急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)的暴发进行了描述性流行病学分析,并采集40份AHC患者眼结膜拭子进行病原学鉴定和基因进化分析。结果显示,福建省2023年AHC... 本研究利用国家疾病监测信息管理系统,对2023年福建省急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)的暴发进行了描述性流行病学分析,并采集40份AHC患者眼结膜拭子进行病原学鉴定和基因进化分析。结果显示,福建省2023年AHC报告病例数6024例,发病率14.38/10万。5-14岁的发病儿童占发病总数的59.8%,学生、农民和幼托儿童为主要发病人群占比84.7%。40份拭子分离到26株柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CVA24v)。基于3C和VP1区域的基因进化树表明福建26株CVA24v属于GⅣ基因型。3株福建CVA24v的全基因组序列结果显示其在5’UTR区和3C区与EV-C96存在重组。 展开更多
关键词 急性出血性结膜炎 柯萨奇病毒A组24型变异株 基因进化分析 重组
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人类星状病毒分子流行病学及检测方法研究进展
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作者 董梦洁 李丹地 《病毒学报》 北大核心 2025年第4期1252-1260,共9页
人类星状病毒(Human astrovirus,HAstV)自1975年被发现,一直被视作引发儿童病毒性急性肠胃炎的重要病原体之一。目前已知的HAstV分为三个类别:经典HAstV(HAstV 1~8)、HAstV-MLB(MLB1~3)和HAstVVA(VA1~5),HAstV感染症状通常为自限性,但... 人类星状病毒(Human astrovirus,HAstV)自1975年被发现,一直被视作引发儿童病毒性急性肠胃炎的重要病原体之一。目前已知的HAstV分为三个类别:经典HAstV(HAstV 1~8)、HAstV-MLB(MLB1~3)和HAstVVA(VA1~5),HAstV感染症状通常为自限性,但在部分免疫功能低下患者中,可能引发严重感染。本文聚焦于HAstV的分子流行病学及检测方法的研究进展。 展开更多
关键词 星状病毒 监测方法 分子流行病学
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Transcriptomics:from Technological Breakthrough to Disease Control Empowerment
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作者 Yong Zhang 《Biomedical and Environmental Sciences》 2025年第9期1029-1031,共3页
With the reduction of sequencing costs,optimization of algorithms,and improvement of multi-omics integration capabilities,transcriptomics,as a core technology for analyzing gene expression dynamics and discovering key... With the reduction of sequencing costs,optimization of algorithms,and improvement of multi-omics integration capabilities,transcriptomics,as a core technology for analyzing gene expression dynamics and discovering key functional molecules,has shown great potential in the field of disease prevention and control[1,2].The multi-continental transcriptomics study of tick-borne poxvirus not only provides a new perspective for understanding the evolution and transmission of vector-mediated viruses,but also reflects the trend of transcriptomics research and highlights its key role in disease prevention and control[3]. 展开更多
关键词 analyzing gene expression dynamics disease prevention control sequencing costs technological breakthrough algorithm optimization discovering key functional moleculeshas reduction sequencing costsoptimization algorithmsand gene expression dynamics
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Pathogenicity and Transcriptomic Profiling Revealed Activation of Apoptosis and Pyroptosis in Brain of Mice Infected with the Beta Variant of SARS-CoV-2
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作者 Han Li Baoying Huang +9 位作者 Gaoqian Zhang Fei Ye Li Zhao Weibang Huo Zhongxian Zhang Wen Wang Wenling Wang Xiaoling Shen Changcheng Wu Wenjie Tan 《Biomedical and Environmental Sciences》 2025年第9期1082-1094,共13页
Objective Patients with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)infection frequently develop central nervous system damage,yet the mechanisms driving this pathology remain unclear.This study investi... Objective Patients with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)infection frequently develop central nervous system damage,yet the mechanisms driving this pathology remain unclear.This study investigated the primary pathways and key factors underlying brain tissue damage induced by the SARS-CoV-2 beta variant(lineage B.1.351).Methods K18-hACE2 and C57BL/6 mice were intranasally infected with the SARS-CoV-2 beta variant.Viral replication,pathological phenotypes,and brain transcriptomes were analyzed.Gene Ontology(GO)analysis was performed to identify altered pathways.Expression changes of host genes were verified using reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction and Western blot.Results Pathological alterations were observed in the lungs of both mouse strains.However,only K18-hACE2 mice exhibited elevated viral RNA loads and infectious titers in the brain at 3 days post-infection,accompanied by neuropathological injury and weight loss.GO analysis of infected K18-hACE2 brain tissue revealed significant dysregulation of genes associated with innate immunity and antiviral defense responses,including type I interferons,pro-inflammatory cytokines,Toll-like receptor signaling components,and interferon-stimulated genes.Neuroinflammation was evident,alongside activation of apoptotic and pyroptotic pathways.Furthermore,altered neural cell marker expression suggested viral-induced neuroglial activation,resulting in caspase 4 and lipocalin 2 release and disruption of neuronal molecular networks.Conclusion These findings elucidate mechanisms of neuropathogenicity associated with the SARS-CoV-2 beta variant and highlight therapeutic targets to mitigate COVID-19-related neurological dysfunction. 展开更多
关键词 Beta variant of SARS-CoV-2 ENCEPHALITIS Neuronal injury Transcriptomics Cell death
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Associations of White Blood Cell,Platelet Count,Platelet-to-White Blood Cell Ratio with Muscle Mass among Community-Dwelling Older Adults in China
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作者 Zhenwei Zhang Yuming Zhao +6 位作者 Hongzhou Chen Li Qi Chen Chen Jun Wang Wenhui Shi Yuebin Lyu Xiaoming Shi 《Biomedical and Environmental Sciences》 2025年第6期693-705,共13页
Objective This study aimed to evaluate the relationships of white blood cell(WBC)count,platelet(PLT)count,and PLT-to-WBC ratio(PWR)with muscle mass in Chinese older adults.Methods This cross-sectional analysis involve... Objective This study aimed to evaluate the relationships of white blood cell(WBC)count,platelet(PLT)count,and PLT-to-WBC ratio(PWR)with muscle mass in Chinese older adults.Methods This cross-sectional analysis involved 4,033 Chinese older adults aged≥65 years from the Healthy Ageing and Biomarkers Cohort Study.Muscle mass and total skeletal muscle mass index(TSMI)were measured by bioelectric impedance analysis.WBC,PLT,and PWR were measured using standard methods.Multivariate linear regression was used to examine the associations of WBC count,PLT count,and PWR with TSMI.Results High WBC count,PLT count,and PWR were associated with low TSMI,with coefficients of-0.0091(95%confidence interval[CI]:-0.0142 to-0.0041),-0.0119(95%CI:-0.0170 to-0.0068),and-0.0051(95%CI:-0.0102 to-0.0001).The associations between the three inflammatory indices and TSMI were linear.Stratified analyses indicated that the relationship between inflammatory markers and TSMI was more evident in male participants and in individuals aged<80 years than in their counterparts.Conclusion Elevated WBC count,PLT count,and PWR correlated with muscle mass loss.This study highlights the importance of regular monitoring of inflammatory markers as a potential strategy for the screening and management of sarcopenia in older adults. 展开更多
关键词 White blood cell count PLATELET Platelet to white blood cell ratio Older adults Muscle mass
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人偏肺病毒感染研究进展 被引量:13
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作者 麻粉莲 郑丽舒 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期133-139,共7页
人偏肺病毒(Human metapneumovirus,HMPV)是急性呼吸道感染的主要病原之一,可感染所有人群的上呼吸道和下呼吸道,感染后多引起咳嗽、发烧、鼻塞和呼吸短促等症状,在婴幼儿、老年人和免疫功能低下者等易感人群中可致支气管炎和肺炎等严... 人偏肺病毒(Human metapneumovirus,HMPV)是急性呼吸道感染的主要病原之一,可感染所有人群的上呼吸道和下呼吸道,感染后多引起咳嗽、发烧、鼻塞和呼吸短促等症状,在婴幼儿、老年人和免疫功能低下者等易感人群中可致支气管炎和肺炎等严重疾病。目前HMPV尚无疫苗和特效药物,治疗措施多为对症支持治疗。2023年1月至4月HMPV在美国检出率出现高峰,短时间内出现大量病例,引起了社会各界的广泛关注。本文将就HMPV病原学特点、流行特点、HMPV感染的临床特征及发病机制等方面的的研究现状进行简单综述,为HMPV感染的科学预防和控制提供参考。 展开更多
关键词 人偏肺病毒 感染 流行特点
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2018-2023年新疆维吾尔自治区风疹流行病学特征及病毒基因特征分析 被引量:2
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作者 玛合木提江·库尔班 钱程 +3 位作者 凯赛尔·吾斯曼 孙璐 阿依波塔·孜那西 朱贞 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期374-382,共9页
为了解2018-2023年新疆维吾尔自治区(以下简称新疆)风疹流行病学特征以及风疹病毒(Rubella virus,RuV)基因特征,本研究整理和汇总2018-2023年新疆风疹发病数据,采集2022年临床标本开展核酸检测和病毒分离,并对分离株进行测序,获得其靶... 为了解2018-2023年新疆维吾尔自治区(以下简称新疆)风疹流行病学特征以及风疹病毒(Rubella virus,RuV)基因特征,本研究整理和汇总2018-2023年新疆风疹发病数据,采集2022年临床标本开展核酸检测和病毒分离,并对分离株进行测序,获得其靶基因序列(位于E1基因的739个靶核酸片段,E1-739)。基于E1-739,将本研究RuV株与WHO基因分型代表株以及已报道的1E和2B基因亚型代表株构建系统发育树,鉴定其基因型/亚型。同时,与同时期我国其他省份流行RuV代表株进行比对,了解新疆流行RuV的分子差异。结果显示,2018-2023年,新疆共计报告风疹病例599例,除外2019年风疹发病有小幅回升(414例,1.66/10万),其余年份发病率均维持在较低水平(年均发病率为0.17/10万),并在2023年降低到了历史最低水平(8例,0.03/10万);2018-2023年间,病例主要集中在北疆的阿勒泰和塔城等地区;病例年龄分布显示,2018年和2021-2023年间,<10岁儿童病例占比均较高(52.8%~62.5%),而2019年和2020年则以10-19岁年龄组人群为主(72.4%和51.9%)。病毒学监测数据显示,2022年从新疆4个地(州、市)共获得7株RuV病毒株的靶基因,分属于1E-L2(6株)和2B-L2c(1株),与同期我国其他省份流行的RuV病毒株具有较高的亲缘性。本研究为新疆地区优化风疹防控策略提供了基础科学数据。 展开更多
关键词 风疹 流行病学 基因特征 新疆维吾尔自治区
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鼠疫耶尔森菌低钙应答V抗原人源单克隆抗体筛选与鉴定
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作者 张黎 郑滨洋 +5 位作者 张琪 吴海莲 潘红星 朱凤才 吴海生 周剑芳 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期15-20,共6页
目的筛选抗低钙应答V抗原(LcrV)的人源单克隆抗体,分析抗体基因特点,检测抗体与抗原结合的特异性、亲和力及功能。方法使用PCR方法从鼠疫疫苗临床试验志愿者外周血细胞cDNA扩增抗体轻、重链可变区基因片段,构建ScFv噬菌体抗体文库。用L... 目的筛选抗低钙应答V抗原(LcrV)的人源单克隆抗体,分析抗体基因特点,检测抗体与抗原结合的特异性、亲和力及功能。方法使用PCR方法从鼠疫疫苗临床试验志愿者外周血细胞cDNA扩增抗体轻、重链可变区基因片段,构建ScFv噬菌体抗体文库。用LcrV对文库进行富集筛选,将获得的抗体基因表达成人IgG1后,测定抗体与LcrV抗原结合的特异性、亲和力、免疫调节功能以及保护能力。结果成功构建了鼠疫耶尔森菌人源ScFv抗体文库,库容量为7.54×10^(8)。抗体文库经LcrV筛选后获得了3株抗LcrV抗体,命名为RV-B4、RV-D1和RV-E8。3株抗体重链为VH1-46和VH3-30,轻链分别为VL1-51、VK3-20和VK1-39。3株抗体经ELISA及Western blot验证均与LcrV特异性结合,其与V抗原结合的解离常数(KD)分别为2.1 nmol/L、1.24 nmol/L和42 nmol/L。RV-D1体外降低人THP-1分泌TNF-α,动物攻毒试验中未发现抗LcrV抗体的保护效果。结论从鼠疫疫苗免疫人群获得了靶向低钙应答V抗原的人源抗体,以结合抗体为主,不能有效阻断病菌感染。所获得的单抗为鼠疫免疫基础研究、鼠疫诊断应用提供了候选材料。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 低钙应答V抗原 噬菌体展示 重组抗体 保护效果
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选择不同对照疫苗对疑似预防接种异常反应信号检测的影响
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作者 夏兰芳 李克莉 +2 位作者 王磊 李燕 王华庆 《中国药物警戒》 2024年第7期798-804,810,共8页
目的探索不同类型疫苗做对照时的信号检出情况,为疑似预防接种异常反应(AEFI)信号检测中选择适宜对照疫苗提供参考。方法分别选择所有其他疫苗和同技术路线其他疫苗做对照,对所有疫苗和特定疫苗进行信号检测,汇总所有其他疫苗和同技术... 目的探索不同类型疫苗做对照时的信号检出情况,为疑似预防接种异常反应(AEFI)信号检测中选择适宜对照疫苗提供参考。方法分别选择所有其他疫苗和同技术路线其他疫苗做对照,对所有疫苗和特定疫苗进行信号检测,汇总所有其他疫苗和同技术路线其他疫苗做对照时信号检出数量,相同信号、新出现信号和消失信号个数及其反应分类分布,检测灵敏度和特异度。结果与所有其他疫苗做对照时相比,同技术路线其他疫苗做对照时,各种类疫苗信号检出个数均明显减少,全部信号检出数从501个减少至254个;新出现信号35个,新出现信号比例最大的是多糖疫苗,为24.39%(10/41),反应分类为一般反应(10个)、异常反应(3个)、偶合症(2个);消失信号282个,消失信号比例最大的是重组蛋白疫苗,为94.92%(56/59),消失信号的反应分类为偶合症(53个)、异常反应(23个)、一般反应(13个)。同技术路线其他疫苗做对照时,检测一般反应和异常反应的灵敏度降低,特异度增加,但减毒活疫苗和多糖疫苗中检测一般反应的灵敏度增加。结论不同类型疫苗做对照时,检出信号数差异较大;同技术路线其他疫苗做对照时,可以增加一般反应中信号的检出数量,但可能会造成较多异常反应信号消失。建议对于较严重的异常反应进行检测时,使用所有其他疫苗做对照。 展开更多
关键词 疑似预防接种异常反应 疫苗安全 信号检测 对照 灵敏度 特异 技术路线
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人呼吸道合胞病毒SH蛋白混合多肽免疫原性初步研究 被引量:2
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作者 郭宏 宋洋 +7 位作者 李海 时雨晴 胡宏俏 江洁 郭晋源 毛乃颖 曹蕾 张燕 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期293-301,共9页
本研究旨在探讨人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)小疏水蛋白(Small hydrophobic protein,SH)T细胞表位肽的免疫原性和保护效果。通过设计并合成覆盖SH蛋白序列全长的10条多肽,利用HRSV感染小鼠的脾淋巴细胞进... 本研究旨在探讨人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)小疏水蛋白(Small hydrophobic protein,SH)T细胞表位肽的免疫原性和保护效果。通过设计并合成覆盖SH蛋白序列全长的10条多肽,利用HRSV感染小鼠的脾淋巴细胞进行IFN-γ-酶联免疫斑点(Enzyme-linked immunospot assay, ELISpot)的检测,筛选出5条能显著刺激IFN-γ产生的SH蛋白T细胞表位多肽。将其与CpG和磷酸铝(AL)佐剂配制成混合多肽疫苗,两次皮下给药的方式免疫C57BL/6J小鼠,评价其免疫原性和保护效果。结果显示,与佐剂对照组相比,SH蛋白混合多肽疫苗可以诱导免疫后的小鼠产生抗原特异性IgG抗体和Th1偏向的T细胞免疫应答,降低HRSV感染后肺病毒载量,并减轻肺脏病理损伤。研究结果表明,SH蛋白混合多肽通过免疫小鼠可以引起良好的免疫原性,并保护小鼠抵抗HRSV的感染。为进一步研究基于SH蛋白的HRSV多肽疫苗提供了科学依据。 展开更多
关键词 人呼吸道合胞病毒 小疏水蛋白 多肽 细胞免疫
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