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Wolbachia pipientis wMel基因组水平上的密码子使用分析
被引量:
18
1
作者
孙铮
马亮
+2 位作者
MURPHY Robert
张宪省
黄大卫
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2009年第10期948-953,共6页
本实验检测了黑腹果蝇的专性寄生菌Wolbachia pipientis wMel基因组的密码子使用模式,并推测影响其密码子组成的因素.选择了478条蛋白编码基因作为研究对象,它们的GC含量比较低,约0.282~0.432.本研究结果显示,关联突变(contex...
本实验检测了黑腹果蝇的专性寄生菌Wolbachia pipientis wMel基因组的密码子使用模式,并推测影响其密码子组成的因素.选择了478条蛋白编码基因作为研究对象,它们的GC含量比较低,约0.282~0.432.本研究结果显示,关联突变(context-dependent mutation)是影响W.pipientis wMel基因组密码子组成的主要因素.同时,Nc—Plot曲线显示,基因组的密码子组成还受到了核苷酸组成偏好性(nucleotide composition bias)的影响.对应分析的结果显示,基因长度(R=0.123,P〈0.01)和基因表达水平(R=-0.312,P〈0.01)也对基因组的密码子使用偏好性起到了一定的作用.因此,关联突变、核苷酸组成、基因长度和基因表达水平都会影响到基因组的密码子使用偏好性.Wolbachia基因组的几个特征和动物线粒体基因组具有较高的相似性,而且现在已有报道说明它们有共同的起源,但仍需进一步验证.
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关键词
Wolbaehia
PIPIENTIS
wmel
密码子使用
对应分析
关联突变
原文传递
共生菌Wolbachia在蚊媒传染病防控方面的研究
被引量:
14
2
作者
刘同凯
张忠
张瑞玲
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第11期1122-1125,共4页
沃尔巴克氏体(Wolbachia)是一类广泛分布于节肢动物体内的革兰阴性共生菌。Wolbachia不仅可以通过多种方式调控宿主的生殖,还可以抑制或阻断宿主对登革热病毒、黄热病病毒、寨卡病毒等多种虫媒病毒的感染,因此被广泛用于蚊媒传染病的防...
沃尔巴克氏体(Wolbachia)是一类广泛分布于节肢动物体内的革兰阴性共生菌。Wolbachia不仅可以通过多种方式调控宿主的生殖,还可以抑制或阻断宿主对登革热病毒、黄热病病毒、寨卡病毒等多种虫媒病毒的感染,因此被广泛用于蚊媒传染病的防控。但Wolbachia对不同虫媒病毒的作用又受到蚊虫种类和所选用Wobachia类型等因素的影响。总起来说,wMel对各种虫媒病毒的抑制效果较好。本文对现有的相关研究进行了综述,以期为后续研究提供基础资料。
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关键词
Mel
蚊媒病
种群替代
种群抑制
综述
原文传递
题名
Wolbachia pipientis wMel基因组水平上的密码子使用分析
被引量:
18
1
作者
孙铮
马亮
MURPHY Robert
张宪省
黄大卫
机构
山东农业大学植物保护学院
黄岛出入境检验检疫局
中国科学院动物研究所
Department of Natural History
中国科学院昆明动物研究所遗传与进化国家重点实验室
山东农业大学生命科学学院
出处
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2009年第10期948-953,共6页
基金
国家自然科学基金(批准号:30570970和30770302)
科学技术部科技基础性工作专项重点项目(批准号:2006FY110500)
国家基础科学人才培养基金(批准号:NSFC-J0630964/J0109)资助
文摘
本实验检测了黑腹果蝇的专性寄生菌Wolbachia pipientis wMel基因组的密码子使用模式,并推测影响其密码子组成的因素.选择了478条蛋白编码基因作为研究对象,它们的GC含量比较低,约0.282~0.432.本研究结果显示,关联突变(context-dependent mutation)是影响W.pipientis wMel基因组密码子组成的主要因素.同时,Nc—Plot曲线显示,基因组的密码子组成还受到了核苷酸组成偏好性(nucleotide composition bias)的影响.对应分析的结果显示,基因长度(R=0.123,P〈0.01)和基因表达水平(R=-0.312,P〈0.01)也对基因组的密码子使用偏好性起到了一定的作用.因此,关联突变、核苷酸组成、基因长度和基因表达水平都会影响到基因组的密码子使用偏好性.Wolbachia基因组的几个特征和动物线粒体基因组具有较高的相似性,而且现在已有报道说明它们有共同的起源,但仍需进一步验证.
关键词
Wolbaehia
PIPIENTIS
wmel
密码子使用
对应分析
关联突变
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
共生菌Wolbachia在蚊媒传染病防控方面的研究
被引量:
14
2
作者
刘同凯
张忠
张瑞玲
机构
泰山医学院新发传染病溯源及防控协同创新中心
泰山医学院基础医学院
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第11期1122-1125,共4页
基金
国家自然科学基金项目(No.81401693
81572028)
文摘
沃尔巴克氏体(Wolbachia)是一类广泛分布于节肢动物体内的革兰阴性共生菌。Wolbachia不仅可以通过多种方式调控宿主的生殖,还可以抑制或阻断宿主对登革热病毒、黄热病病毒、寨卡病毒等多种虫媒病毒的感染,因此被广泛用于蚊媒传染病的防控。但Wolbachia对不同虫媒病毒的作用又受到蚊虫种类和所选用Wobachia类型等因素的影响。总起来说,wMel对各种虫媒病毒的抑制效果较好。本文对现有的相关研究进行了综述,以期为后续研究提供基础资料。
关键词
Mel
蚊媒病
种群替代
种群抑制
综述
Keywords
wmel
mosquito-borne diseases
population replacement
population suppression
review
分类号
R183.5 [医药卫生—流行病学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Wolbachia pipientis wMel基因组水平上的密码子使用分析
孙铮
马亮
MURPHY Robert
张宪省
黄大卫
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2009
18
原文传递
2
共生菌Wolbachia在蚊媒传染病防控方面的研究
刘同凯
张忠
张瑞玲
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017
14
原文传递
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