稀疏矩阵向量乘(SpMV)是稀疏线性系统的计算核心和瓶颈,其运算效率会影响迭代求解器的整体性能,其优化研究一直是科学计算和工程应用领域中的研究热点之一。偏微分方程的离散化会产生稀疏对角矩阵,由于其多样的非零元分布,导致没有一种...稀疏矩阵向量乘(SpMV)是稀疏线性系统的计算核心和瓶颈,其运算效率会影响迭代求解器的整体性能,其优化研究一直是科学计算和工程应用领域中的研究热点之一。偏微分方程的离散化会产生稀疏对角矩阵,由于其多样的非零元分布,导致没有一种方法能够在所有矩阵中取得最优时间性能。针对上述问题,提出一种面向图形处理单元(GPU)的稀疏对角矩阵自适应SpMV优化方法AST(Adaptive SpMV Tuning)。该方法通过设计特征空间,构建特征提取器,提取矩阵结构精细特征,通过深入分析特征和SpMV方法的相关性,建立可扩展的候选方法集合,形成特征和最优方法的映射关系,构建性能预测工具,实现矩阵最优方法的高效预测。实验结果表明,AST能够取得85.8%的预测准确率,平均时间性能损失为0.09,相比于DIA(Diagonal)、HDIA(Hacked DIA)、HDC(Hybrid of DIA and Compressed Sparse Row)、DIA-Adaptive和DRM(Divide-Rearrange and Merge),能够获得平均20.19、1.86、3.06、3.72和1.53倍的内核运行时间加速和1.05、1.28、12.45、1.94和0.97倍的浮点运算性能加速。展开更多
矩阵主特征向量(principal eigenvectors computing,PEC)的求解是科学与工程计算中的一个重要问题。随着图形处理单元通用计算(general-purpose computing on graphics pro cessing unit,GPGPU)的兴起,利用GPU来优化大规模稀疏矩阵的图...矩阵主特征向量(principal eigenvectors computing,PEC)的求解是科学与工程计算中的一个重要问题。随着图形处理单元通用计算(general-purpose computing on graphics pro cessing unit,GPGPU)的兴起,利用GPU来优化大规模稀疏矩阵的图形处理单元求解得到了广泛关注。分别从应用特征和GPU体系结构特征两方面分析了PEC运算的性能瓶颈,提出了一种面向GPU的稀疏矩阵存储格式——GPU-ELL和一个针对GPU的线程优化映射策略,并设计了相应的PEC优化执行算法。在ATI HD Radeon5850上的实验结果表明,相对于传统CPU,该方案获得了最多200倍左右的加速,相对于已有GPU上的实现,也获得了2倍的加速。展开更多
文摘稀疏矩阵向量乘(SpMV)是稀疏线性系统的计算核心和瓶颈,其运算效率会影响迭代求解器的整体性能,其优化研究一直是科学计算和工程应用领域中的研究热点之一。偏微分方程的离散化会产生稀疏对角矩阵,由于其多样的非零元分布,导致没有一种方法能够在所有矩阵中取得最优时间性能。针对上述问题,提出一种面向图形处理单元(GPU)的稀疏对角矩阵自适应SpMV优化方法AST(Adaptive SpMV Tuning)。该方法通过设计特征空间,构建特征提取器,提取矩阵结构精细特征,通过深入分析特征和SpMV方法的相关性,建立可扩展的候选方法集合,形成特征和最优方法的映射关系,构建性能预测工具,实现矩阵最优方法的高效预测。实验结果表明,AST能够取得85.8%的预测准确率,平均时间性能损失为0.09,相比于DIA(Diagonal)、HDIA(Hacked DIA)、HDC(Hybrid of DIA and Compressed Sparse Row)、DIA-Adaptive和DRM(Divide-Rearrange and Merge),能够获得平均20.19、1.86、3.06、3.72和1.53倍的内核运行时间加速和1.05、1.28、12.45、1.94和0.97倍的浮点运算性能加速。
文摘矩阵主特征向量(principal eigenvectors computing,PEC)的求解是科学与工程计算中的一个重要问题。随着图形处理单元通用计算(general-purpose computing on graphics pro cessing unit,GPGPU)的兴起,利用GPU来优化大规模稀疏矩阵的图形处理单元求解得到了广泛关注。分别从应用特征和GPU体系结构特征两方面分析了PEC运算的性能瓶颈,提出了一种面向GPU的稀疏矩阵存储格式——GPU-ELL和一个针对GPU的线程优化映射策略,并设计了相应的PEC优化执行算法。在ATI HD Radeon5850上的实验结果表明,相对于传统CPU,该方案获得了最多200倍左右的加速,相对于已有GPU上的实现,也获得了2倍的加速。
