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Developing a one-step triplet-repeat primed PCR assay for diagnosingmyotonic dystrophy 被引量:1
1
作者 Xiaoping Lan Na Li +5 位作者 Hongling Wan Lintong Luo Yiming Wu Sanxiang Li Yu An Bai-Lin Wu 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2018年第10期549-552,共4页
Myotonic dystrophy type 1 (DM1),or Steiner’s disease,is an autosomal dominant disorder caused by the expansion of unstable trinucleotide repeats (CTG) in the 3’ untranslated region of the myotonic dystrophy protein ... Myotonic dystrophy type 1 (DM1),or Steiner’s disease,is an autosomal dominant disorder caused by the expansion of unstable trinucleotide repeats (CTG) in the 3’ untranslated region of the myotonic dystrophy protein kinase gene (DMPK) (Brook et al.,1992;Mahadevan et al.,1992).The number of CTG repeats observed in normal individuals is in a range of 5-34,while the individuals with 35-49 CTG repeats are usually asymptomatic but at risk of 展开更多
关键词 PCR TP CTG Developing a one-step triplet-repeat primed PCR assay for diagnosing myotonic dystrophy
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遗传性脊髓小脑型共济失调7型遗传学诊断及临床特征 被引量:2
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作者 李清华 唐北沙 +1 位作者 江泓 沈璐 《临床神经病学杂志》 CAS 北大核心 2005年第3期164-166,共3页
目的研究中国人遗传性脊髓小脑型共济失调(SCA)7型(SCA7)的基因突变和临床特征。方法应用聚合酶链反应(PCR)、聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)等技术对临床表现为SCA的92个家系112例患者和16例散发SCA患者的SCA7基因内CAG三核苷酸重复序列进... 目的研究中国人遗传性脊髓小脑型共济失调(SCA)7型(SCA7)的基因突变和临床特征。方法应用聚合酶链反应(PCR)、聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)等技术对临床表现为SCA的92个家系112例患者和16例散发SCA患者的SCA7基因内CAG三核苷酸重复序列进行检测,对异常等位基因片段进行DNA测序,分析基因型和表型之间的关系,并与表型正常的家系成员和健康人对照。结果在1个SCA7家系的6位成员中检测出2例患者的SCA7等位基因内CAG重复数目为71;临床表现主要为共济失调、视力下降、黄蓝色盲及视网膜色素变性。该家系内表型正常的4位成员SCA7等位基因CAG重复数目为7~9,另126例临床表现为SCA的患者、71名表型正常的家系成员及60名健康对照者SCA7等位基因内CAG三核苷酸重复数为6~21。结论CAG过度扩增为SCA7的致病原因,分子遗传学分析有助于SCA7的诊断;视网膜色素变性为SCA7的重要特征。 展开更多
关键词 脊髓小脑型共济失调 等位基因 三核苷酸重复 视网膜色素变性
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三核苷酸重复及相关序列宏观弯曲的预测 被引量:2
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作者 蔡禄 罗辽复 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期595-601,共7页
给出描述36个四联体内碱基对平面间相互方位和碱基对间沿长轴方向位移的参数集。考虑到碱基对梯阶间的非紧邻相互作用 ,提出DNA宏观弯曲的经验预测规则。给出DNA宏观弯曲的定义 ,使用联系碱基对梯阶间的变换矩阵计算宏观弯曲。对18个与... 给出描述36个四联体内碱基对平面间相互方位和碱基对间沿长轴方向位移的参数集。考虑到碱基对梯阶间的非紧邻相互作用 ,提出DNA宏观弯曲的经验预测规则。给出DNA宏观弯曲的定义 ,使用联系碱基对梯阶间的变换矩阵计算宏观弯曲。对18个与人类遗传病有关的三核苷酸重复及相关序列预测了宏观弯曲。理论结果和相应的实验数据作了比较 ,对结果的理论含义作了讨论。 展开更多
关键词 三和苷酸重复序列 宏观弯曲 经验预测 TRS
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强直性肌营养不良症DMPK基因CTG重复序列与Alu±1kb单倍型研究 被引量:1
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作者 肖翠英 武辉 +1 位作者 潘阿根 张思仲 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期81-84,共4页
强直性肌营养不良(myotonicdystrophy,DM)是由于DMPK基因3′非翻译区CTG重复序列异常扩展所致的、主要累及神经肌肉系统的常染色体显性遗传病。在该基因的第8内含子中还存在一个Alu重复序列的1kb插入/缺失多态性,即Alu±1kb多态性... 强直性肌营养不良(myotonicdystrophy,DM)是由于DMPK基因3′非翻译区CTG重复序列异常扩展所致的、主要累及神经肌肉系统的常染色体显性遗传病。在该基因的第8内含子中还存在一个Alu重复序列的1kb插入/缺失多态性,即Alu±1kb多态性。为了帮助阐明汉族人群中DM突变的起源,并为解释DM在不同群体中发病率的差异提供更多依据 ,本文从300例已知CTG拷贝数的正常汉族群体中随机挑选60例,首先通过PCR扩增确定其Alu±1kb多态性 ,然后对Alu±1kb和CTG双杂合的标本,采用长PCR方法先行扩增含Alu±1kb和CTG重复序列的DNA片段,再分别对含Alu( +)和Alu( -)的DNA片段中的CTG拷贝数进行常规PCR分析,以确定二位点的单倍型。结果表明60例正常人中二位点间呈连锁不平衡。其单倍型为:(CTG) 5 均与Alu( +)连锁 ;多数(CTG)11~14与Alu( -)连锁 ;在两个(CTG)≥19的等位基因中一个与Alu( +)连锁 ,另一个与Alu( -)连锁。各民族相关资料的比较提示 ,汉族人群中(CTG)11~14与非洲黑人的起源可能不同;(CTG)19~30/Alu-1kb在汉族人群中的频率远比欧洲人群的高 ;(CTG)19~30/Alu-1kb与(CTG)19~30/Alu +1kb在汉族人群中是以一定比例共存的 ;(CTG)19~30在不同民族间的起源不尽相同 ;如果从(CTG)5 到(CTG)19~30的假设成立的话 ,则很可能? 展开更多
关键词 DM DMPK基因 CTG重复序列 Alu±1kb单倍型
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MEF2A第11号外显子CAG三联核苷酸重复序列的改变与其转录激活活性的相关性 被引量:1
5
作者 戴大鹏 郑君德 +2 位作者 周晓阳 张铁梅 蔡剑平 《医学研究杂志》 2009年第4期22-25,共4页
目的探讨MEF2A第11号外显子CAG三联核苷酸重复序列的改变与其转录激活活性的相关性。方法PCR法扩增富含组氨酸钙结合蛋白(histidine—rich calcium—binding protein,HRC)基因启动子/增强子序列,插入报告载体pGL3-Basic中,生成pGL... 目的探讨MEF2A第11号外显子CAG三联核苷酸重复序列的改变与其转录激活活性的相关性。方法PCR法扩增富含组氨酸钙结合蛋白(histidine—rich calcium—binding protein,HRC)基因启动子/增强子序列,插入报告载体pGL3-Basic中,生成pGL3-HRC enhancer质粒,该质粒与全长野生型MEF2A cDNA表达质粒pCDNA—MEFcDNA,或含4~15个CAG的变异型MEF2AcDNA表达质粒pCDNA—MEFcDNA—CAGr,以及内参质粒pRL—TK,用脂质体转染法共转染于293T细胞,Western blot检测MEF2A蛋白的表达,双荧光素酶检测系统测定报告分子的表达。结果成功构建了MEF2A蛋白体外转录激活活性检测系统;所构建的含4~15个CAG序列的MEF2A变异蛋白,与含11个CAG序列的野生型MEF2A蛋白之间其转录激活活性没有显著性差异。结论目前已发现的MEF2A第11号外显子CAG重复数目的改变不会影响MEF2A蛋白的转录激活活性。 展开更多
关键词 MEF2A 三联核苷酸重复序列 HRC增强子 转录激活作用
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一个复合短串联重复序列的分离
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作者 刘勇 姚俊杰 +4 位作者 刘山鸣 吴东颖 刘国仰 黄尚志 杨焕明 《基础医学与临床》 CSCD 2000年第1期82-85,共4页
ShortTandemRepeats(STR)即短串联重复序列,已广泛应用于连锁分析和致病基因的定位克隆等方面。近年来发现可表达的三核苷酸重复单位拷贝数的扩增在导致人类某些遗传病的可能作用,使重复序列的研究更受重视。... ShortTandemRepeats(STR)即短串联重复序列,已广泛应用于连锁分析和致病基因的定位克隆等方面。近年来发现可表达的三核苷酸重复单位拷贝数的扩增在导致人类某些遗传病的可能作用,使重复序列的研究更受重视。本文采用自行设计的可筛选基因组中所有可能三核苷酸STR的“三联体”兼并寡核着酸探针来筛查5号染色体短臂区域部分Cosmid克隆中可能存在的三核苷酸STR。经过多次Southern杂交、酶切、亚克隆的方法,得到一复合STR。 展开更多
关键词 STR 三联体 杂交 短串联重复序列
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中国四个人群中MICA基因多态性研究(英文) 被引量:9
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作者 肖翠英 张思仲 +5 位作者 程璐 敬慧娥 侯一平 褚嘉佑 张戈 吴谨 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期424-428,共5页
目的 了解中国 4个人群中 MICA基因第 5外显子 (GCT) n位点的遗传多态性并从遗传学的角度提供白马藏族起源的初步证据。方法  411个无血缘关系个体的血标本或唾液标本分别采自四川平武县白马藏族、西藏拉萨和云南中甸县藏族、成都地... 目的 了解中国 4个人群中 MICA基因第 5外显子 (GCT) n位点的遗传多态性并从遗传学的角度提供白马藏族起源的初步证据。方法  411个无血缘关系个体的血标本或唾液标本分别采自四川平武县白马藏族、西藏拉萨和云南中甸县藏族、成都地区汉族以及四川茂县羌族。以 1对跨越 MICA基因第 5外显子 GCT重复序列区的引物扩增基因组 DNA,产物用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离 ,银染显色分析。结果 在 4个群体中均检测出 5种已报道的等位片段 ,并均以 A5最常见 ,在白马藏族、藏族、成都汉族和羌族中的频率分别为 0 .32 5、0 .345、0 .390和 0 .319。 A5 .1在成都汉族和羌族中占第 2位 ,频率分别为0 .2 30和 0 .2 93,A4和 A9在白马藏族和藏族中分别占第 2位 ,频率分别为 0 .2 5 4和 0 .2 72。上述各等位基因分布在 4个群体中存在差异 ,尤其是白马藏族与其它 3个群体之间存在显著差异。结论 MICA基因在迄今已研究的不同群体中都有 5种等位基因 ,提示 MICA基因在各群体间是在相似选择压力下产生 ,对维持群体的生理功能有着必不可少的作用。各民族 展开更多
关键词 MHCⅠ类链 相关基因A 三核苷酸 多态性 藏族
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三引物PCR技术在强直性肌营养不良1型患者基因检测及产前诊断中的应用
8
作者 陈晨 赵学潮 +1 位作者 孟静静 孔祥东 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2024年第10期1182-1186,共5页
目的探讨三引物PCR(TP-PCR)技术在强直性肌营养不良症1型(DM1)患者分子检测和产前诊断中的应用价值。方法选取2018年5月至2022年10月在郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心接受基因检测的48个DM1家系共60人作为研究对象。应用TP-PC... 目的探讨三引物PCR(TP-PCR)技术在强直性肌营养不良症1型(DM1)患者分子检测和产前诊断中的应用价值。方法选取2018年5月至2022年10月在郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心接受基因检测的48个DM1家系共60人作为研究对象。应用TP-PCR结合毛细管电泳的方法对受试者进行DMPK基因CTG重复数的检测,并对4个确诊家系进行产前诊断。本研究通过郑州大学第一附属医院医学伦理委员会的审查(伦理号:KS-2018-KY-36)。结果共检出52例DM1患者,多以肌无力、肌萎缩和肌强直为首发症状,并伴有肌强直样放电;部分患者合并有其他系统的异常。患者的DMPK基因CTG异常扩增数>50次,正常等位基因CTG重复数范围为5~18次,检出率最高的等位基因重复次数为6次(30.77%,16/52)。接受产前诊断的4个DM1家系中,1例胎儿未见异常,3例胎儿检测到CTG异常扩增(>50次),并被诊断为DM1患者。结论TP-PCR可快速准确诊断DM1患者,但当CTG异常扩增数高于50次时,该方法无法准确检出重复次数。 展开更多
关键词 强直性肌营养不良1型 三引物PCR CTG三核苷酸重复
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MEF2A基因第11外显子CAG三联核苷酸重复序列多态性与动脉粥样硬化性脑梗死的相关性研究 被引量:1
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作者 王凤 应忠明 +9 位作者 朱敏 郑周 胡晓飞 王恩 伍嫦珠 何欣威 李卫玲 李彩 朱峰 金笑平 《中华神经医学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第12期1259-1264,共6页
目的探讨肌细胞增强因子2A(MEF2A)基因第11外显子CAG三联核苷酸重复序列[(CAG)n]多态性与动脉粥样硬化性脑梗死的相关性。方法对温州医科大学附属台州医院神经内科自2010年6月至2014年12月收治的205例首发急性大动脉粥样硬化性脑梗... 目的探讨肌细胞增强因子2A(MEF2A)基因第11外显子CAG三联核苷酸重复序列[(CAG)n]多态性与动脉粥样硬化性脑梗死的相关性。方法对温州医科大学附属台州医院神经内科自2010年6月至2014年12月收治的205例首发急性大动脉粥样硬化性脑梗死患者(脑梗死组)及同期体检正常的192例健康志愿者r对照组),采用聚合酶链反应产物直接测序技术(PCR-SBT)检测MEF2A基因第11外显子区域的基因多态性,分析其中(CnG)n多态性与动脉粥样硬化性脑梗死的相关性。结果在脑梗死组与对照组朋E尼A基因第11外显子区域均可检测到多种(CAG)n,重复序列数目主要集中在9~11个,且脑梗死组与对照组之间(CAG)n多态性分布差异有统计学意义(X^2=8.547,P=-0.036);(CAG)9在脑梗死组中比例明显高于对照组,差异有统计学意义萨6.650,P=-0.010)。排除相关混杂因素后,Logistic回归分析显示收缩压及(CAG)9(OR=1.401,辟0.017。95%CI:1.063-1.847)是动脉粥样硬化性脑梗死发生的独立危险因素。结论MEF2A基因第11外显子(CAG)n多态性与动脉粥样硬化性脑梗死相关,(CAG)9可能是其易患基因之一。 展开更多
关键词 肌细胞增强因子2A CAG三联核苷酸重复序列 基因多态性 脑梗死
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