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Application of Abnormal Touchdown PCR with High Degeneracy Primer in Amplification of Large-Family Genes 被引量:2
1
作者 华慧颖 王芳 +1 位作者 常重杰 杜启艳 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2011年第2期188-190,共3页
[Objective] The aim was to explore the special methods for amplification of large-family genes by using primers with high degeneracy.[Method] By using the primers with high degeneracy,conventional PCR,conventional tou... [Objective] The aim was to explore the special methods for amplification of large-family genes by using primers with high degeneracy.[Method] By using the primers with high degeneracy,conventional PCR,conventional touchdown PCR and the optimized abnormal touchdown PCR were respectively carried out to amplify the genomic DNA of Cyprinus carpio.[Result] Only one evident electrophoretic band and a few Sox genes were obtained by using normal PCR;no obvious electrophoretic band but dispersive product was obtained by normal touchdown PCR;ideal result was obtained by the abnormal touchdown PCR that three evident electrophoretic bands and much more Sox genes were amplified.[Conclusion] The research provided theoretical basis for the optimization and selection of PCR amplification conditions of the large-family genes. 展开更多
关键词 Primers with high degeneracy Abnormal touchdown pcr Large-family genes AMPLIFICATION
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Touchdown PCR检测野生中缅树鼩伯氏疏螺旋体感染 被引量:5
2
作者 柳爱华 程玲 +8 位作者 张才军 陈芳 施明 陈亮 沈培清 刘汝文 角建林 李玛琳 宝福凯 《中国热带医学》 CAS 2009年第4期621-622,734,共3页
目的用Touchdown PCR检测野生中缅树鼩的伯氏疏螺旋体感染。方法从昆明及其周边地区捕获30只野生中缅树鼩,乙醚深度麻醉后处死,取内脏-30℃保存备用。用总DNA提取试剂盒提取组织总DNA,用紫外可见光分光光度计测定样品的DNA含量,用热启动... 目的用Touchdown PCR检测野生中缅树鼩的伯氏疏螺旋体感染。方法从昆明及其周边地区捕获30只野生中缅树鼩,乙醚深度麻醉后处死,取内脏-30℃保存备用。用总DNA提取试剂盒提取组织总DNA,用紫外可见光分光光度计测定样品的DNA含量,用热启动Touchdown PCR技术检测野生中缅树鼩的伯氏疏螺旋体flaB基因。对PCR产物做凝胶电泳,凝胶成像仪观察并照相。结果Touchdown PCR有良好的特异性和敏感性。实验重复3次,结果一致,野生树鼩的伯氏疏螺旋体DNA阳性率为63.33%(19/30)。结论野生树鼩存在伯氏疏螺旋体感染,并且感染率较高。 展开更多
关键词 树鼩 伯氏疏螺旋体 touchdown pcr 莱姆病
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降落PCR技术检测环状RNA表达量的方法评价
3
作者 刘洋 李亚奇 +4 位作者 刘越 李雪莹 龙奕妃 郑志坚 孟春燕 《中国煤炭工业医学杂志》 2024年第2期220-224,共5页
目的 通过扩增低丰度表达的环状RNA,与常规PCR反应程序比较,评价降落PCR扩增环状RNA的定性定量结果。方法 人肝癌细胞系HepG2细胞中运用Trizol法提取RNA,普通PCR和降落PCR程序扩增circHDAC2片段,琼脂糖凝胶电泳比较两种PCR产物的电泳结... 目的 通过扩增低丰度表达的环状RNA,与常规PCR反应程序比较,评价降落PCR扩增环状RNA的定性定量结果。方法 人肝癌细胞系HepG2细胞中运用Trizol法提取RNA,普通PCR和降落PCR程序扩增circHDAC2片段,琼脂糖凝胶电泳比较两种PCR产物的电泳结果。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对连续5倍稀释的cDNA进行降落PCR程序扩增,比较定量准确度并计算扩增效率。结果 相较于普通PCR,降落PCR程序法能够在不同丰度样本中扩增出circHDAC2,且熔解曲线结果显示单一熔解峰。Sanger测序结果证明扩增产物正确。5倍梯度浓度稀释样本进行降落PCR程序结果显示条带单一,说明降落PCR程序具有良好的敏感性,能够对低丰度circHDAC2进行有效扩增,增效率可达93.27%。结论 降落PCR程序法较普通PCR法扩增circHDAC2基因特异性更高,降落PCR方法在灵敏度、特异度上均优于普通PCR。 展开更多
关键词 降落RT-pcr 环状RNA 实时荧光定量pcr
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改良的降落PCR与普通PCR结果比较 被引量:11
4
作者 张贵星 袁保梅 +1 位作者 许培荣 薛乐勋 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2003年第3期352-354,共3页
目的 :设计并验证一改良的降落PCR(MTD PCR)程序。方法 :自盐藻bardawil中提取基因组DNA作为PCR模板 ,使用TaqDNA聚合酶及pfuDNA聚合酶 ,运用普通PCR和MTD PCR程序 ,扩增胡萝卜素生物合成... 目的 :设计并验证一改良的降落PCR(MTD PCR)程序。方法 :自盐藻bardawil中提取基因组DNA作为PCR模板 ,使用TaqDNA聚合酶及pfuDNA聚合酶 ,运用普通PCR和MTD PCR程序 ,扩增胡萝卜素生物合成相关基因 (cbr)上游启动子序列 ,并电泳比较PCR扩增产物的特异性。结果 :使用普通Taq酶进行PCR ,普通PCR程序产生2 0 0bp , 50 0bp和 1 2 72bp的 3条带 ,而MTD PCR程序仅克隆出 1 2 72bp的特异带 ;利用高保真的pfuDNA聚合酶作PCR ,在MTD PCR泳道中也仅有 1 2 72bp 1条带 ,而普通PCR除了产生 1 2 72bp的特异带外 ,还出现 1条 50 0bp的非特异带。结论 :无论使用普通Taq酶或高保真酶pfu,改良的MT PCR程序均明显提高PCR的特异性 ,提示它可用于克隆普通PCR难以克隆的基因片段 。 展开更多
关键词 改良降落pcr pcr pcr特异性 PFU DNA聚合酶
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应用降落PCR和正交设计优化甘蔗“割手密”SSR-PCR反应体系 被引量:8
5
作者 杨绍林 王先宏 +4 位作者 李苏洁 胡德分 娄红波 肖关丽 杨清辉 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期431-436,共6页
甘蔗野生种割手密抗逆性强,在甘蔗抗逆育种中具有较好的应用前景;割手密SSR分子标记技术体系的建立及优化可为割手密指纹图谱绘制、种质鉴定、遗传多样性及亲缘关系分析提供技术支持。本研究以21份割手密材料用改良CTAB法提取DNA,采用降... 甘蔗野生种割手密抗逆性强,在甘蔗抗逆育种中具有较好的应用前景;割手密SSR分子标记技术体系的建立及优化可为割手密指纹图谱绘制、种质鉴定、遗传多样性及亲缘关系分析提供技术支持。本研究以21份割手密材料用改良CTAB法提取DNA,采用降落PCR和正交试验设计对扩增反应体系主要成分的浓度(DNA模板,引物,Mg2+,d NTPs,Taq聚合酶)进行了优化。结果表明建立的割手密Touchdown SSR-PCR分子标记技术体系操作简便,扩增条带清晰且多态性丰富,有较强的稳定性和可重复性,可为割手密资源的相关研究提供技术支持。 展开更多
关键词 甘蔗 割手密 降落pcr SSR 正交设计
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J亚群禽白血病病毒TD-PCR检测方法的建立及初步应用 被引量:7
6
作者 杭柏林 秦爱建 +4 位作者 钱琨 金文杰 沈海玉 吴晓平 仇钰 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期40-44,共5页
采用J亚群禽白血病病毒(ALV-J)感染DF1细胞提取的总DNA作为模板,以H5和H7为特异性引物,建立检测ALV-J的降落PCR(TD-PCR)方法,并对反应体系进行优化。结果表明:建立TD-PCR方法灵敏度高、特异性强,可检测0.105 ng的DNA,该方法与网状内皮... 采用J亚群禽白血病病毒(ALV-J)感染DF1细胞提取的总DNA作为模板,以H5和H7为特异性引物,建立检测ALV-J的降落PCR(TD-PCR)方法,并对反应体系进行优化。结果表明:建立TD-PCR方法灵敏度高、特异性强,可检测0.105 ng的DNA,该方法与网状内皮组织增生症病毒、马立克病病毒、鸡贫血病毒及I群禽腺病毒没有交叉反应。运用TD-PCR、ELISA以及病毒分离对临床病料进行检测,TD-PCR方法与ELISA检测结果一致(100%),均比病毒分离检出率(75%)高。证明TD-PCR检测ALV-J的方法具有快速、灵敏、特异等优点,可满足临床、生产实际检测的需要。 展开更多
关键词 J亚群禽白血病病毒 降落pcr 病毒检测
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降落-重叠PCR法四重融合构建平菇同源重组片段 被引量:10
7
作者 柴冉 孙强 邱立友 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期375-379,共5页
对多个长片段的基因融合目前仍缺少有效的方法.本文提出一种新的融合PCR策略,即在常规的重叠PCR的第1步和第2步均增加1个降落PCR程序,减少不适当的退火温度和PCR产物3'端额外碱基A对片段融合、扩增的影响,提高正确融合与扩增的效率... 对多个长片段的基因融合目前仍缺少有效的方法.本文提出一种新的融合PCR策略,即在常规的重叠PCR的第1步和第2步均增加1个降落PCR程序,减少不适当的退火温度和PCR产物3'端额外碱基A对片段融合、扩增的影响,提高正确融合与扩增的效率.结果表明,为构建平菇葡聚糖合成酶启动子的同源重组序列,在4个长度分别是1 015 bp、2 822 bp、2 206 bp和1 008 bp的片段进行融合时,在重叠PCR的第1步加上退火温度61.5℃~57.5℃、每降落0.5℃进行1个循环的降落PCR程序,在重叠PCR的第2步加上退火温度60℃~56℃、每降落0.5℃进行1个循环的降落PCR程序,经过1次PCR即获得顺序正确的全长融合片段.测序结果与4个片段序列的一致性达到98.5%,降落-重叠PCR法对多个长片段的基因融合具有较高的应用价值. 展开更多
关键词 基因融合 重叠pcr 降落pcr 同源重组
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多重降落PCR检测血流感染产ESBLs肠杆菌科细菌与MRSA方法的建立和应用 被引量:4
8
作者 毕艳妮 隋振耿 +4 位作者 宋宇 曲业敏 马淑青 孙梅 刘海珠 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2015年第10期663-667,共5页
目的探索一种可同时检测产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的肠杆菌科细菌与耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的多重降落PCR方法。方法收集某院20l3年3月—2014年9月102份住院患者血培养阳性标本,针对产ESBLs肠杆菌科细菌的SHV、TEM、OXA基因和... 目的探索一种可同时检测产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的肠杆菌科细菌与耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的多重降落PCR方法。方法收集某院20l3年3月—2014年9月102份住院患者血培养阳性标本,针对产ESBLs肠杆菌科细菌的SHV、TEM、OXA基因和MRSA的MecA基因设计4对特异性引物,分别采用单一降落PCR和多重降落PCR对各耐药基因进行扩增,并将结果与药敏纸片法进行比较。结果各单一PCR均可扩增出特异性条带,并用多重降落PCR同时检测了4种耐药基因;建立的多重降落PCR对4种耐药基因(MecA、SHV、TEM、OXA)DNA的检测下限分别为4.37、2.19、4.53和3.59 ng。与药敏纸片法相比,多重降落PCR总灵敏度与特异性分别为100.00%、88.24%,检测ESBLs的灵敏度达100.00%,特异性为87.23%,检测MRSA的灵敏度和特异度均为100.00%。结论该实验建立的多重降落PCR具有高灵敏度与特异性,可用于产ESBLs肠杆菌科细菌和MRSA所致血流感染的快速诊断与流行病学调查,有利于指导临床使用抗菌药物。 展开更多
关键词 超广谱β-内酰胺酶 ESBLS 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 MRSA SHV TEM OXA MECA 多重降落pcr
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一种高特异性的改良降落PCR(英文) 被引量:4
9
作者 张贵星 袁保梅 +2 位作者 许培荣 王建民 薛乐勋 《生命科学研究》 CAS CSCD 2002年第4期314-317,共4页
为提高基因组DNA中的基因PCR检出的特异性,设计了一种改良的降落PCR程序,并分别用TaqDNA聚合酶及高保真PfuDNA聚合酶进行实验.自盐藻Dunaliellabardawil中提取基因组DNA作为PCR模板,使用TaqDNA聚合酶及PfuDNA聚合酶,运用普通PCR和降落PC... 为提高基因组DNA中的基因PCR检出的特异性,设计了一种改良的降落PCR程序,并分别用TaqDNA聚合酶及高保真PfuDNA聚合酶进行实验.自盐藻Dunaliellabardawil中提取基因组DNA作为PCR模板,使用TaqDNA聚合酶及PfuDNA聚合酶,运用普通PCR和降落PCR程序,扩增胡萝卜素生物合成相关基因(cbr)上游启动子序列,并电泳比较PCR扩增产物的特异性.结果显示,使用普通Taq酶PCR,普通PCR程序产生200bp,500bp和1272bp长的三条带,而TD PCR程序仅克隆出1272bp的特异带;利用高保真的PfuDNA聚合酶作PCR,在TD PCR泳道中仅有1272bp一条带,而普通PCR除了1272bp的特异带外,还出现一条500bp的非特异带.无论使用普通Taq酶或高保真酶Pfu,改良的降落PCR程序均明显提高PCR的特异性,类似的降落PCR程序可望用于克隆用普通PCR难以克隆的基因片段,或在假阳性难以去除的情况下提高PCR的特异性. 展开更多
关键词 高特异性 改良降落pcr PfuDNA聚合酶
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基于兼并引物的PCR扩增特定基因的效果比较 被引量:6
10
作者 李志强 何德 李翠新 《湖北民族学院学报(自然科学版)》 CAS 2015年第2期170-173,共4页
根据NCBI上的DNA拓扑异构酶Ⅱ基因序列设计兼并引物,采用常规PCR、降落PCR、巢式PCR三种方法扩增糙皮侧耳和阿魏侧耳的拓扑异构酶Ⅱ部分基因序列,比较三种方法扩增效果的特异性、灵敏度.结果表明,巢式PCR的灵敏度和特异性都优于常规PCR... 根据NCBI上的DNA拓扑异构酶Ⅱ基因序列设计兼并引物,采用常规PCR、降落PCR、巢式PCR三种方法扩增糙皮侧耳和阿魏侧耳的拓扑异构酶Ⅱ部分基因序列,比较三种方法扩增效果的特异性、灵敏度.结果表明,巢式PCR的灵敏度和特异性都优于常规PCR和降落PCR,并且巢式PCR的灵敏度是常规PCR灵敏度的100倍以上,更加适合兼并引物扩增.这对利用兼并引物获取特异基因具有指导意义. 展开更多
关键词 兼并引物 常规pcr 降落pcr 巢式pcr
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运用降落PCR同时快速检测NV、EV71和CoxA16病毒 被引量:2
11
作者 罗灿 冀新凤 +8 位作者 李建栋 刘犇 朱红英 潘秋妹 陈伟岚 廖如燕 陈胤瑜 陈清 俞守义 《热带医学杂志》 CAS 2011年第2期126-130,共5页
目的运用降落聚合酶链反应(touchdown PCR,TD-PCR)技术快速从腹泻、手足口病人粪便标本中同时检测诺如病毒(Norovius,NV)、肠道病毒71型(Enterovirus 71 EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsachie virus,CoxA16),并评价该技术用于检测这3种... 目的运用降落聚合酶链反应(touchdown PCR,TD-PCR)技术快速从腹泻、手足口病人粪便标本中同时检测诺如病毒(Norovius,NV)、肠道病毒71型(Enterovirus 71 EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsachie virus,CoxA16),并评价该技术用于检测这3种病毒的效能和敏感性。结论根据touchdown PCR原理设计TD-PCR程序,试验选择最佳反应条件,与普通PCR扩增效果进行评价。用10倍稀释检验TD-PCR方法的灵敏度,并用轮状病毒、札幌病毒、星状病毒、伤寒杆菌、小肠结肠炎耶尔森菌、香港海鸥形菌检测该方法的特异性。结果 TD-PCR能在一个反应条件下同时检测NV、EV71和CoxA16,扩增片段条带清晰,检测效果明显优于普通PCR,测序证实了3组片段的特异性,3种病毒cDNA的最低检测浓度分别为4.775μg/ml、2.360μg/ml、43.273μg/ml。检测该方法特异性时,其他病原体未见特异性条带扩增。结论成功建立的TD-PCR方法可同时检测腹泻和手足口病人粪便中NV、EV71和CoxA163种病毒,为快速检测相关病原体、科学防治腹泻和手足口病疫情暴发提供了可靠手段。 展开更多
关键词 降落聚合酶链反应 诺如病毒 肠道病毒71型 柯萨奇病毒A组16型 快速检测
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长片段基因FMNL2 PCR实验的体会 被引量:3
12
作者 曾元凤 肖移生 +1 位作者 梁莉 丁彦青 《南昌大学学报(医学版)》 CAS 2013年第4期19-21,共3页
目的尝试扩增长片段FMNL2基因。方法采用巢式PCR或和降落PCR相结合的方法进行了FMNL2基因编码区全长及FMNL2-NT、-CT的扩增。结果高效、特异地扩增出FMNL2基因编码区全长及FMNL2-NT、-CT片段。结论巢式PCR或和降落PCR相结合,提高了目的... 目的尝试扩增长片段FMNL2基因。方法采用巢式PCR或和降落PCR相结合的方法进行了FMNL2基因编码区全长及FMNL2-NT、-CT的扩增。结果高效、特异地扩增出FMNL2基因编码区全长及FMNL2-NT、-CT片段。结论巢式PCR或和降落PCR相结合,提高了目的基因的扩增效率和扩增产物的特异性。 展开更多
关键词 巢式pcr 降落pcr 长片段基因 FMNL2
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猕猴结核分枝杆菌PCR检测方法的建立与初步应用 被引量:4
13
作者 罕园园 高家红 +3 位作者 罗志武 匡德宣 陆彩霞 代解杰 《中国比较医学杂志》 CAS 2008年第9期78-82,I0003,共6页
目的建立猕猴结核分枝杆菌PCR快速检测方法。方法根据GenBank中报道的人型结核分枝杆菌标准株H37RV全基因序列,针对其中致病性结核分枝杆菌所特有的保守区域ESAT-6设计一对引物进行Touchdown PCR反应,利用此方法对100份野生来源猕猴全... 目的建立猕猴结核分枝杆菌PCR快速检测方法。方法根据GenBank中报道的人型结核分枝杆菌标准株H37RV全基因序列,针对其中致病性结核分枝杆菌所特有的保守区域ESAT-6设计一对引物进行Touchdown PCR反应,利用此方法对100份野生来源猕猴全血标本进行检测,并与传统的PPD实验和咽拭子抗酸染色实验结果作比对。结果抽取33份野生来源猕猴的外周血,提取DNA进行扩增,扩增片段经纯化、回收克隆测序后用BLAST软件进行同源性对比,与GenBank中报道的序列基本相同,检测标本中有4份(4/33)为阳性,其中3份(3/33)标本与结核菌素试验和咽拭子抗酸染色试验结果相符合。结论建立了从猴全血中直接检测猴结核分枝杆菌DNA的Touchdown PCR方法,具有敏感性和特异性高,且简便的优点。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 降落pcr 猕猴
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改良的降落PCR扩增中国地鼠目的基因 被引量:2
14
作者 宋国华 庞文彪 +2 位作者 张锐虎 刘田福 岳文斌 《山西医科大学学报》 CAS 2008年第10期876-878,共3页
目的优化PCR程序,尝试用降落PCR扩增中国地鼠目的基因。方法设计了4对引物,用普通PCR和改良的降落PCR扩增中国地鼠COX1、COX2、NADH5、NADH6部分基因。结果普通PCR只有1对引物扩增出特异性条带,而降落PCR4对引物都扩增出特异性条带,并... 目的优化PCR程序,尝试用降落PCR扩增中国地鼠目的基因。方法设计了4对引物,用普通PCR和改良的降落PCR扩增中国地鼠COX1、COX2、NADH5、NADH6部分基因。结果普通PCR只有1对引物扩增出特异性条带,而降落PCR4对引物都扩增出特异性条带,并与中国地鼠目的基因大小一致。结论降落PCR省略了常规PCR中摸索最适退火温度的过程,对中国地鼠一些Tm值相近的基因可以使用降落PCR温度程序扩增,是一种行之有效的PCR方法。 展开更多
关键词 中国地鼠 降落pcr 退火温度 pcr特异性
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降落和重叠延伸PCR构建靶向肿瘤干细胞腺病毒载体及感染实验 被引量:1
15
作者 张超 刘国炳 +2 位作者 田平阁 周春平 李学农 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1513-1517,共5页
目的应用降落和重叠延伸PCR法构建对肿瘤干细胞有特异靶向性的高效载体-复制缺陷型腺病毒载体,观察其对CD133+人大肠癌细胞株SW480的感染效率。方法利用重叠延伸PCR技术扩增5型腺病毒纤毛球端HI环两端的基因序列,定向插入真核表达质粒pE... 目的应用降落和重叠延伸PCR法构建对肿瘤干细胞有特异靶向性的高效载体-复制缺陷型腺病毒载体,观察其对CD133+人大肠癌细胞株SW480的感染效率。方法利用重叠延伸PCR技术扩增5型腺病毒纤毛球端HI环两端的基因序列,定向插入真核表达质粒pEGFP-N1中,构建重组质粒pEGFP-N1.KNOB△HI,同时在缺失HI环部位引入EcoRV限制性酶切位点。在此基础上,用降落PCR克隆纤毛基因全长编码区序列,构建出腺病毒穿梭质粒pNEB-F5。利用凝胶图像分析和基因测序验证所构建质粒的正确性。再与pAdEasy-1,pShuttle-GFP在E.coli BJ5183中同源重组,得腺病毒载体Ad5FHI-GFP和Ad5-GFP。用Ad5FHI-GFP和Ad5-GFP分别感染CD133+人大肠癌细胞株SW480,通过荧光显微镜观察感染效率。结果降落PCR和重叠延伸PCR都扩增出特异性条带,测序结果与预期相符。与Ad5-GFP相比,Ad5FHI-GFP对CD133+人大肠癌细胞株SW480有显著提高。结论利用降落和重叠延伸PCR成功构建新型靶向肿瘤干细胞的腺病毒载体,利用降落和重叠延伸PCR成功构建新型靶向肿瘤干细胞的腺病毒载体,其对CD133+人大肠癌细胞株SW480实验显示Ad5FHI-GFP组感染效率明显强于Ad5-GFP组。 展开更多
关键词 降落pcr 重叠延伸pcr 肿瘤干细胞 复制缺陷型腺病毒 穿梭质粒
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TD-PCR技术用于肠道病毒71的检测 被引量:1
16
作者 高璐璐 陈清 +2 位作者 郭江 陈志永 俞守义 《热带医学杂志》 CAS 2009年第12期1377-1379,1384,共4页
目的评价降落聚合酶链反应(touchdown PCR,TD-PCR)检测肠道病毒71型(Enterovirus71,EV71)的效能和敏感性。方法根据touchdown原理设计TD-PCR程序,试验选择PCR最佳反应条件,分别与普通PCR及TD-PCR、普通Taq酶与热启动酶扩增效果进行比较... 目的评价降落聚合酶链反应(touchdown PCR,TD-PCR)检测肠道病毒71型(Enterovirus71,EV71)的效能和敏感性。方法根据touchdown原理设计TD-PCR程序,试验选择PCR最佳反应条件,分别与普通PCR及TD-PCR、普通Taq酶与热启动酶扩增效果进行比较,并利用10倍稀释法检验TD-PCR方法的灵敏度。琼脂糖凝胶电泳验证扩增产物,纯化后DNA产物测序验证该方法的特异性。结果 TD-PCR的扩增片段条带清晰,检测效果明显优于普通PCR,使用普通Taq酶的TD-PCR比使用热启动酶有更优的性价比,测序证实了此组片段的特异性,cDNA的最低检测浓度为1.031μg/mL。结论成功建立TD-PCR检测EV71的方法,使用普通Taq酶获得理想的检测结果,为快速检测手足口病的病原体提供了可靠的手段。 展开更多
关键词 降落聚合酶链反应 肠道病毒71型 检测
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多元PCR在黑鲍(Haliotis rubra)微卫星遗传研究中的应用 被引量:8
17
作者 黎中宝 Appleyard Sharon A Elliott Nicholas G 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期319-325,共7页
根据D03等11个微卫星引物单位点PCR扩增时优化的扩增条件(退火温度、MgCl2等)和11个微卫星引物所带有的荧光颜色、等位基因大小变异范围及反应的灵敏度,可将11个微卫星引物分成A组(D03、G04、B04和H08)、B组(A09、H11、A08和G01)和C组(C... 根据D03等11个微卫星引物单位点PCR扩增时优化的扩增条件(退火温度、MgCl2等)和11个微卫星引物所带有的荧光颜色、等位基因大小变异范围及反应的灵敏度,可将11个微卫星引物分成A组(D03、G04、B04和H08)、B组(A09、H11、A08和G01)和C组(CmrHr1.24、CmrHr2.30和CmrHr2.23)进行多元PCR扩增,结果显示各组内位点之间的分离清晰,这表明多元PCR可以大大提高微卫星检测仪器的使用效率和提高实验效果,在微卫星研究中是一种快速便捷的方法。 展开更多
关键词 微卫星 黑鲍 多元pcr rrouchDown pcr
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应用降落PCR及克隆测序检测2型糖尿病外周血白细胞胰岛素样生长因子受体IGF1R基因甲基化 被引量:3
18
作者 陈玲 严世荣 +2 位作者 胡培 陈永梅 程龙海 《湖北医药学院学报》 CAS 2011年第6期557-560,共4页
目的:比较应用降落PCR(TD-PCR)及克隆测序检测2型糖尿病患者外周血白细胞中胰岛素样生长因子受体(IGF1R)基因启动子区DNA甲基化位点的方法。方法:提取2型糖尿病患者外周血白细胞DNA进行亚硫酸氢盐处理,设计引物扩增IGF1R基因启动子区富... 目的:比较应用降落PCR(TD-PCR)及克隆测序检测2型糖尿病患者外周血白细胞中胰岛素样生长因子受体(IGF1R)基因启动子区DNA甲基化位点的方法。方法:提取2型糖尿病患者外周血白细胞DNA进行亚硫酸氢盐处理,设计引物扩增IGF1R基因启动子区富含CG位点序列,分别行普通PCR和TD-PCR扩增,对含目的条带产物进行直接测序和克隆后测序。结果:与普通PCR扩增结果相比,TD-PCR扩增条带清晰、产物量多、二聚体少;且TD-PCR减少了对退火温度不断摸索的过程。克隆后测序峰图清晰,碱基丢失错判频率减少。结论:推荐应用TD-PCR检测亚硫酸氢盐处理的DNA甲基化位点,并进行克隆后测序。 展开更多
关键词 甲基化 降落pcr 胰岛素样生长因子1受体 2型糖尿病 测序
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转Bt基因稻米的降落PCR-毛细管电泳快速检测研究 被引量:1
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作者 刘亚攀 欧阳华学 +2 位作者 孙成均 阮佳 李永新 《中国卫生检验杂志》 CAS 北大核心 2012年第11期2531-2533,共3页
目的:建立转Bt基因稻米的降落PCR-毛细管电泳快速定性检测方法。方法:转Bt基因稻米经磨碎后提取基因组DNA,对其内源蔗糖磷酸合酶SPS基因和抗虫毒蛋白Bt基因同时进行聚合酶链反应(PCR)扩增,产物用无胶筛分毛细管电泳分离、激光诱导荧光... 目的:建立转Bt基因稻米的降落PCR-毛细管电泳快速定性检测方法。方法:转Bt基因稻米经磨碎后提取基因组DNA,对其内源蔗糖磷酸合酶SPS基因和抗虫毒蛋白Bt基因同时进行聚合酶链反应(PCR)扩增,产物用无胶筛分毛细管电泳分离、激光诱导荧光检测器检测。结果:在优化条件下,25 min内即可完成SPS和Bt基因的检测,日内精密度在2.37%~3.19%之间,特异性实验结果表明本法特异性较高。结论:所建立的方法快速、分离效能高、样品用量少且成本低廉,适用于转Bt基因稻米的快速鉴定。 展开更多
关键词 转Bt基因稻米 降落pcr 毛细管电泳 激光诱导荧光检测
原文传递
应用TD-PCR技术和限制性内切酶技术鉴定猴B病毒
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作者 刘忠华 黄韧 钟翎 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第A19期235-237,共3页
从DNA水平上鉴定猴B病毒,并区别人单纯疱疹病毒(HSV-1);用PCR技术对猴B病毒和HSV-1进行扩增,并用限制性内切酶技术对扩增产物进行酶切,对PCR扩增产物和酶切产物进行电泳;电泳结果显示猴B病毒和HSV-1的PCR扩增产物为128bp,酶切后,B病毒... 从DNA水平上鉴定猴B病毒,并区别人单纯疱疹病毒(HSV-1);用PCR技术对猴B病毒和HSV-1进行扩增,并用限制性内切酶技术对扩增产物进行酶切,对PCR扩增产物和酶切产物进行电泳;电泳结果显示猴B病毒和HSV-1的PCR扩增产物为128bp,酶切后,B病毒能产生72bp和56bp片段,而HSV-1不能产生酶切产物;该方法能较好地鉴定猴B病毒,同时也将有密切抗原关系的HSV-1区分开来。 展开更多
关键词 B病毒 单纯疱疹病毒 聚合酶链反应(pcr) 限制性内切酶技术 降落pcr
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