期刊文献+
共找到12,779篇文章
< 1 2 250 >
每页显示 20 50 100
A portable and versatile fluorescent platform for high-throughput screening of toxic phosgene,diethyl chlorophosphate and volatile acyl chlorides
1
作者 Beitong Zhu Xiaorui Yang +3 位作者 Lirong Jiang Tianhong Chen Shuangfei Wang Lintao Zeng 《Chinese Chemical Letters》 2025年第1期453-458,共6页
Highly toxic phosgene,diethyl chlorophosphate(DCP)and volatile acyl chlorides endanger our life and public security.To achieve facile sensing and discrimination of multiple target analytes,herein,we presented a single... Highly toxic phosgene,diethyl chlorophosphate(DCP)and volatile acyl chlorides endanger our life and public security.To achieve facile sensing and discrimination of multiple target analytes,herein,we presented a single fluorescent probe(BDP-CHD)for high-throughput screening of phosgene,DCP and volatile acyl chlorides.The probe underwent a covalent cascade reaction with phosgene to form boron dipyrromethene(BODIPY)with bright green fluorescence.By contrast,DCP,diphosgene and acyl chlorides can covalently assembled with the probe,giving rise to strong blue fluorescence.The probe has demonstrated high-throughput detection capability,high sensitivity,fast response(within 3 s)and parts per trillion(ppt)level detection limit.Furthermore,a portable platform based on BDP-CHD was constructed,which has achieved high-throughput discrimination of 16 analytes through linear discriminant analysis(LDA).Moreover,a smartphone adaptable RGB recognition pattern was established for the quantitative detection of multi-analytes.Therefore,this portable fluorescence sensing platform can serve as a versatile tool for rapid and high-throughput detection of toxic phosgene,DCP and volatile acyl chlorides.The proposed“one for more”strategy simplifies multi-target discrimination procedures and holds great promise for various sensing applications. 展开更多
关键词 Fluorescent platform High throughput BODIPY Linear discriminant analysis PHOSGENE Acyl chloride Diethyl chlorophosphate
原文传递
High-throughput miniaturized purge-and-trap device integrating semiconductor refrigeration storage for on-site extraction and long-term preservation of VOCs in water
2
作者 Yuan Yang Yue Wang +4 位作者 Xi Wang Hanshuang Li Xiaoli Wu Yurong Deng Chengbin Zheng 《Chinese Chemical Letters》 2025年第10期558-562,共5页
To accomplish on-site separation, preconcentration and cold storage of highly volatile organic compounds(VOCs) from water samples as well as their rapid transportation to laboratory, a high-throughput miniaturized pur... To accomplish on-site separation, preconcentration and cold storage of highly volatile organic compounds(VOCs) from water samples as well as their rapid transportation to laboratory, a high-throughput miniaturized purge-and-trap(μP&T) device integrating semiconductor refrigeration storage was developed in this work. Water samples were poured into the purge vessels and purged with purified air generated by an air pump. The VOCs in water samples were then separated and preconcentrated with sorbent tubes. After their complete separation and preconcentration, the tubes were subsequently preserved in the semiconductor refrigeration unit of the μP&T device. Notably, the high integration, small size, light weight, and low power consumption of the device makes it easy to be hand-carried to the field and transport by drone from remote locations, significantly enhancing the flexibility of field sampling. The performances of the device were evaluated by comparing analytical figures of merit for the detection of four cyclic volatile methylsiloxanes(cVMSs) in water. Compared to conventional collection and preservation methods, our proposed device preserved the VOCs more consistently in the sorbent tubes, with less than 5% loss of all analytes, and maintained stability for at least 20 days at 4℃. As a proof-of-concept,10 municipal wastewater samples were pretreated using this device with recoveries ranging from 82.5% to 99.9% for the target VOCs. 展开更多
关键词 PURGE-AND-TRAP High throughput Semiconductor refrigeration storage On-site extraction Volatile organic compounds Water analysis
原文传递
Optimal amino acid system for early embryo development in sows based on response surface methodology and high-throughput screening cell models
3
作者 Xinyu Wang Jun Huang +12 位作者 Yanlong Li Zhekun Zhu Bangxin Xue Yueyang Meng Jiale Bao Ran Ning Siyu Li Fang Chen Shihai Zhang Xiangzhou Zeng Shuang Cai Chuanjiang Cai Xiangfang Zeng 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 2025年第3期1324-1340,共17页
Background Early embryo development plays a pivotal role in determining pregnancy outcomes,postnatal development,and lifelong health.Therefore,the strategic selection of functional nutrients to enhance embryo developm... Background Early embryo development plays a pivotal role in determining pregnancy outcomes,postnatal development,and lifelong health.Therefore,the strategic selection of functional nutrients to enhance embryo development is of paramount importance.In this study,we established a stable porcine trophectoderm cell line expressing dual fluorescent reporter genes driven by the CDX2 and TEAD4 gene promoter segments using lentiviral transfection.Results Three amino acid metabolites—kynurenic acid,taurine,and tryptamine—met the minimum z-score criteria of 2.0 for both luciferase and Renilla luciferase activities and were initially identified as potential metabolites for embryo development,with their beneficial effects validated by qPCR.Given that the identified metabolites are closely related to methionine,arginine,and tryptophan,we selected these three amino acids,using lysine as a standard,and employed response surface methodology combined with our high-throughput screening cell model to efficiently screen and optimize amino acid combination conducive to early embryo development.The optimized candidate amino acid system included lysine(1.87 mmol/L),methionine(0.82 mmol/L),tryptophan(0.23 mmol/L),and arginine(3 mmol/L),with the ratio of 1:0.43:0.12:1.60.In vitro experiments confirmed that this amino acid system enhances the expression of key genes involved in early embryonic development and improves in vitro embryo adhesion.Transcriptomic analysis of blastocysts suggested that candidate amino acid system enhances early embryo development by regulating early embryonic cell cycle and differentiation,as well as improving nutrient absorption.Furthermore,based on response surface methodology,400 sows were used to verify this amino acid system,substituting arginine with the more cost-effective N-carbamoyl glutamate(NCG),a precursor of arginine.The optimal dietary amino acid requirement was predicted to be 0.71%lysine,0.32%methionine,0.22%tryptophan,and 0.10%NCG for sows during early gestation.The optimized amino acid system ratio of the feed,derived from the peripheral release of essential amino acids,was found to be 1:0.45:0.13,which is largely consistent with the results obtained from the cell model optimization.Subsequently,we furtherly verified that this optimal dietary amino acid system significantly increased total litter size,live litter size and litter weight in sows.Conclusions In summary,we successfully established a dual-fluorescent high-throughput screening cell model for the efficient identification of potential nutrients that would promote embryo development and implantation.This innovative approach overcomes the limitations of traditional amino acid nutrition studies in sows,providing a more effective model for enhancing reproductive outcomes. 展开更多
关键词 Amino acid Embryonic development High throughput screening NUTRIENT Response Surface Methodology
在线阅读 下载PDF
Machine learning enhanced metal 3D printing:high throughput optimization and material transfer extensibility
4
作者 Yuanjie Zhang Cheng Lin +10 位作者 Yuan Tian Jianbao Gao Bo Song Hao Zhang Min Wang Kechen Song Binghui Deng Dezhen Xue Yonggang Yao Yusheng Shi Kun Kelvin Fu 《International Journal of Extreme Manufacturing》 2025年第4期297-310,共14页
Metal 3D printing holds great promise for future digitalized manufacturing.However,the intricate interplay between laser and metal powders poses a significant challenge for conventional trial-and-error optimization.Me... Metal 3D printing holds great promise for future digitalized manufacturing.However,the intricate interplay between laser and metal powders poses a significant challenge for conventional trial-and-error optimization.Meanwhile,the“optimized”yet fixed parameters largely limit possible extensions to new designs and materials.Herein,we report a high throughput design coupled with machine learning(ML)guidance to eliminate the notorious cracks and porosities in metal 3D printing for improved corrosion resistance and overall performance.The high throughput methodologies are mostly on obtaining the printed samples and their structural and physical properties,while ML is used for data analysis by model building for prediction(optimization),and understanding.For 316L stainless steel,we concurrently printed 54 samples with different parameters and subjected them to parallel tests to generate an extensive dataset for ML analysis.An ensemble learning model outperformed the other five single learners while Bayesian active learning recommended optimal parameters that could reduce porosity from 0.57%to below 0.1%.Accordingly,the ML-recommended samples showed higher tensile strength(609.28 MPa)and elongation(50.67%),superior anti-corrosion(I_(corr)=4.17×10^(-8) A·cm^(-2)),and stable alkaline oxygen evolution for>100 hours(at 500 mA·cm^(-2)).Remarkably,through the correlation analysis of printing parameters and targeted properties,we find that the influence of hardness on corrosion resistance is second only to porosity.We then expedited optimization in AlSi7Mg using the learned knowledge and feed hardness and relative density,thus demonstrating the method’s general extensibility and efficiency.Our strategy can significantly accelerate the optimization of metal 3D printing and facilitate adaptable design to accommodate diverse materials and requirements. 展开更多
关键词 high throughput 3D printing machine learning 316L stainless steel rapid optimization corrosion resistance
暂未订购
A high-throughput measurement of critical micelle concentrations based on absolute aggregation-caused quenching probes
5
作者 Xin Ji Aun Raza +3 位作者 Jianping Qi Yi Lu Haisheng He Wei Wu 《Journal of Pharmaceutical Analysis》 2025年第3期651-653,共3页
Amphiphiles,including surfactants,have emerged as indispensable elements in materials science and pharmaceutical science,and their functions are highly relying on the critical micelle concentration(CMC)[1,2].Numerous ... Amphiphiles,including surfactants,have emerged as indispensable elements in materials science and pharmaceutical science,and their functions are highly relying on the critical micelle concentration(CMC)[1,2].Numerous fluorimetry-based probes have been developed to measure CMCs[3](Fig.S1).However,CMC measurements using these probes suffer from a time-consuming and laborious procedure and large uncertainties,primarily due to their poor photo-stabilities and highly fluctuating fluorescence backgrounds. 展开更多
关键词 high throughput measurement photo stabilities fluorescence backgrounds critical micelle concentration cmc numerous materials science critical micelle concentration fluorimetry based probes absolute aggregation caused quenching
在线阅读 下载PDF
Channel assignment and power allocation for throughput improvement with PPO in B5G heterogeneous edge networks
6
作者 Xiaoming He Yingchi Mao +3 位作者 Yinqiu Liu Ping Ping Yan Hong Han Hu 《Digital Communications and Networks》 SCIE CSCD 2024年第1期109-116,共8页
In Beyond the Fifth Generation(B5G)heterogeneous edge networks,numerous users are multiplexed on a channel or served on the same frequency resource block,in which case the transmitter applies coding and the receiver u... In Beyond the Fifth Generation(B5G)heterogeneous edge networks,numerous users are multiplexed on a channel or served on the same frequency resource block,in which case the transmitter applies coding and the receiver uses interference cancellation.Unfortunately,uncoordinated radio resource allocation can reduce system throughput and lead to user inequity,for this reason,in this paper,channel allocation and power allocation problems are formulated to maximize the system sum rate and minimum user achievable rate.Since the construction model is non-convex and the response variables are high-dimensional,a distributed Deep Reinforcement Learning(DRL)framework called distributed Proximal Policy Optimization(PPO)is proposed to allocate or assign resources.Specifically,several simulated agents are trained in a heterogeneous environment to find robust behaviors that perform well in channel assignment and power allocation.Moreover,agents in the collection stage slow down,which hinders the learning of other agents.Therefore,a preemption strategy is further proposed in this paper to optimize the distributed PPO,form DP-PPO and successfully mitigate the straggler problem.The experimental results show that our mechanism named DP-PPO improves the performance over other DRL methods. 展开更多
关键词 B5G Heterogeneous edge networks PPO Channel assignment Power allocation throughput
在线阅读 下载PDF
Improving throughput in SWIPT-based wireless multirelay networks with relay selection and rateless codes
7
作者 Gaofei Huang Qihong Zhong +2 位作者 Hui Zheng Sai Zhao Dong Tang 《Digital Communications and Networks》 SCIE CSCD 2024年第4期1131-1144,共14页
This paper studies a dual-hop Simultaneous Wireless Information and Power Transfer(SWIPT)-based multi-relay network with a direct link.To achieve high throughput in the network,a novel protocol is first developed,in w... This paper studies a dual-hop Simultaneous Wireless Information and Power Transfer(SWIPT)-based multi-relay network with a direct link.To achieve high throughput in the network,a novel protocol is first developed,in which the network can switch between a direct transmission mode and a Single-Relay-Selection-based Cooperative Transmission(SRS-CT)mode that employs dynamic decode-and-forward relaying accomplished with Rateless Codes(RCs).Then,under this protocol,an optimization problem is formulated to jointly optimize the network operation mode and the resource allocation in the SRS-CT mode.The formulated problem is difficult to solve because not only does the noncausal Channel State Information(CSI)cause the problem to be stochastic,but also the energy state evolution at each relay is complicated by network operation mode decision and resource allocation.Assuming that noncausal CSI is available,the stochastic optimization issue is first to be addressed by solving an involved deterministic optimization problem via dynamic programming,where the complicated energy state evolution issue is addressed by a layered optimization method.Then,based on a finite-state Markov channel model and assuming that CSI statistical properties are known,the stochastic optimization problem is solved by extending the result derived for the noncausal CSI case to the causal CSI case.Finally,a myopic strategy is proposed to achieve a tradeoff between complexity and performance without the knowledge of CSI statistical properties.The simulation results verify that our proposed SRS-and-RC-based design can achieve a maximum of approximately 40%throughput gain over a simple SRS-and-RC-based baseline scheme in SWIPT-based multi-relay networks. 展开更多
关键词 Simultaneous wireless information and power TRANSFER Energy harvesting Relay networks throughput maximization
在线阅读 下载PDF
痛安汤对膝骨关节炎大鼠滑膜巨噬细胞极化的作用机制 被引量:4
8
作者 陈一鑫 陆延 +7 位作者 张璇 陈小莉 谭良源 徐张杰 陈望龙 苏少亭 梁基耀 周红海 《中国组织工程研究》 北大核心 2025年第26期5621-5631,共11页
背景:国医大师韦贵康所创痛安汤治疗膝骨关节炎的疗效显著,但作用机制尚不明确。目的:探讨痛安汤通过调控大鼠滑膜巨噬细胞极化治疗膝骨关节炎的作用机制。方法:①通过miRNA高通量测序与PCR分析正常大鼠与膝骨关节炎大鼠膝关节滑膜组织... 背景:国医大师韦贵康所创痛安汤治疗膝骨关节炎的疗效显著,但作用机制尚不明确。目的:探讨痛安汤通过调控大鼠滑膜巨噬细胞极化治疗膝骨关节炎的作用机制。方法:①通过miRNA高通量测序与PCR分析正常大鼠与膝骨关节炎大鼠膝关节滑膜组织中差异miRNA表达,通过数据库预测miR-27a靶基因,采用荧光素酶实验检测miR-27a与靶基因结合情况。②采用随机数字表法将68只SD大鼠随机分为正常对照组(n=16)、模型组(n=16)、miR-27a过表达组(n=12)、痛安汤组(n=12)、痛安汤+miR-27a抑制组(n=12)。除正常对照组外,其他4组通过膝关节腔注射碘乙酸钠的方法建立右侧膝骨关节炎模型,造模后第2天,miR-27a过表达组、痛安汤+miR-27a抑制组右侧膝关节腔内分别注射miR-27a模拟物、miR-27a抑制物,1次/d,连续注射5 d;造模后第15天,痛安汤组、痛安汤+miR-27a抑制组给予痛安汤灌胃,其他3组给予生理盐水灌胃,1次/d,连续14 d。灌胃干预结束后,分别进行行为学检测、X射线片检查、膝关节滑膜组织与软骨组织苏木精-伊红染色以及膝关节滑膜组织的免疫荧光染色、RT-PCR、Westernblot检测。结果与结论:①miRNA高通量测序显示膝骨关节炎大鼠滑膜组织中miR-27a低表达,miR-27a的靶基因为核因子κB,荧光素酶实验显示二者能够相互结合。②行为学检测显示,miR-27a过表达或痛安汤可缓解膝骨关节炎大鼠的关节功能障碍,miR-27a抑制可拮抗痛安汤的作用。X射线片与苏木精-伊红染色结果显示,miR-27a过表达或痛安汤可减轻膝骨关节炎程度,miR-27a抑制削弱了痛安汤的治疗作用。RT-PCR与Western blot检测结果显示,与正常对照组比较,模型组白细胞介素10表达均降低(P<0.05),基质金属蛋白酶13、白细胞介素1β、核因子κB表达均升高(P<0.05);miR-27a过表达或痛安汤可不同程度地逆转膝骨关节炎造模导致的上述指标变化,而miR-27a抑制会削弱痛安汤的作用。免疫荧光染色结果显示,模型组CD86蛋白表达高于正常对照组(P<0.05),CD206蛋白表达低于正常对照组(P<0.05);miR-27a过表达组、痛安汤组CD86蛋白表达低于模型组(P<0.05),CD206蛋白表达高于模型组(P<0.05);痛安汤+miR-27a抑制组CD86高于痛安汤组(P<0.05),CD206蛋白表达低于痛安汤组(P<0.05)。③结果表明,痛安汤通过促进miR-27a表达、抑制核因子κB表达来调控巨噬细胞极化,改善膝关节功能,进一步治疗膝骨关节炎。 展开更多
关键词 膝骨关节炎 巨噬细胞极化 滑膜炎 微小RNA 痛安汤 碘乙酸钠 核因子ΚB 高通量测序 工程化组织构建
暂未订购
基于转录组学分析昆布多糖对C57BL/6小鼠非增生性糖尿病视网膜病变的影响 被引量:3
9
作者 张蕾 张素梅 +7 位作者 杨振 胡韦康 白红枚 周文静 王子涵 李名聪 张胜权 廖荣丰 《安徽医科大学学报》 北大核心 2025年第3期392-398,共7页
目的采用高通量测序技术(RNA-seq)探讨昆布多糖(LAM)对非增生性糖尿病视网膜病变(NPDR)的影响。方法采用链脲佐菌素(STZ)腹腔注射建立糖尿病模型,观察LAM对糖尿病小鼠的影响。将C57BL/6小鼠随机分为对照(Control)、模型(Model)、昆布多... 目的采用高通量测序技术(RNA-seq)探讨昆布多糖(LAM)对非增生性糖尿病视网膜病变(NPDR)的影响。方法采用链脲佐菌素(STZ)腹腔注射建立糖尿病模型,观察LAM对糖尿病小鼠的影响。将C57BL/6小鼠随机分为对照(Control)、模型(Model)、昆布多糖治疗(LAM)组,每组8只小鼠。在建模8周后,LAM组接受为期4周的LAM腹腔注射治疗。记录3组小鼠血糖体质量变化,HE染色检查视网膜病变情况,采用RNA-seq挖掘STZ及LAM作用下糖尿病视网膜病变(DR)的关键差异基因(DEGs)。结果使用STZ可以成功建立DR模型,而LAM可以在一定程度上降低糖尿病小鼠血糖并改善糖尿病小鼠视网膜结构疏松的病理形态。经过RNA-seq对DEG挖掘发现与Control组相比,Model组小鼠视网膜共有214个DEGs,通过富集分析发现DR可通过PI3K-Akt信号通路加重病变程度。Model组与LAM组小鼠视网膜共有DEGs 42个,富集后显示LAM通过中性粒细胞胞外陷阱通路改善其病变程度。早期生长反应因子1(Egr1),FBJ骨肉瘤致癌基因(Fos),核受体亚家族4A成员1(Nr4a1),盐诱导激酶1(Sik1)受STZ调节,而LAM能显著回调其表达,可能与LAM对糖尿病视网膜病变的治疗密切相关。结论DEG可通过PI3K-Akt信号通路加重糖尿病视网膜病变程度。LAM可以通过中性粒细胞胞外陷阱通路减轻糖尿病视网膜病变,Egr1、Fos、Nr4a1、Sik1是LAM治疗STZ诱导DR的关键基因。 展开更多
关键词 高通量测序 昆布多糖 糖尿病视网膜病变 C57BL/6
暂未订购
密度对罗氏沼虾种虾存活率、抱卵率、水质、水体和肠道微生物群落的影响 被引量:2
10
作者 李倩 孙丽慧 +6 位作者 张海琪 姜建湖 陈建明 彭俊 杨必成 高令梅 郭建林 《水生生物学报》 北大核心 2025年第4期9-20,共12页
为探讨保种期罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)种虾合理的放养密度,实验以温室保种期的种虾为研究对象,雌雄比例2﹕1,雌虾初始体重为(17.95±1.11)g,雄虾初始体重为(21.39±1.63)g,设置3个放养密度:LD(1.0 kg/m^(3))、MD(1.... 为探讨保种期罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)种虾合理的放养密度,实验以温室保种期的种虾为研究对象,雌雄比例2﹕1,雌虾初始体重为(17.95±1.11)g,雄虾初始体重为(21.39±1.63)g,设置3个放养密度:LD(1.0 kg/m^(3))、MD(1.5 kg/m^(3))、HD(2.0 kg/m^(3)),研究了密度对罗氏沼虾种虾抱卵率、存活率、水质、水体和肠道微生物群落的影响。结果表明:水质未稳定前,水体中氨氮和亚硝态氮的含量随着放养密度的增加而升高,HD组显著高于LD组(P<0.05)。水质稳定后各密度组之间无显著差异(P>0.05)。LD组和MD组雌虾的抱卵率显著大于HD组(P<0.05),LD组和MD组无显著差异(P>0.05)。存活率随着放养密度的增加显著降低(P<0.05)。放养密度显著影响罗氏沼虾的规格,小规格虾的比例随着放养密度的升高显著增加(P<0.05)。水体微生物群落结果表明,水体中氨氮含量最高时,硝化螺旋菌属(Nitrospira)为HD组的指示物种。肠道微生物结果表明,在相同的采样时间,放养密度对罗氏沼虾肠道微生物菌群组成无显著影响。但当水体中氨氮含量最高时,潜在病原菌柠檬酸杆菌(Citrobacter)的占比在MD组和HD组有所升高,说明密度引起的水质变化显著影响中高密度组的肠道微生物群落组成。综上,建议保种期罗氏沼虾的放养密度以1.0 kg/m^(3)为宜。 展开更多
关键词 养殖密度 水质 高通量测序 水体细菌群落 肠道微生物 种虾 罗氏沼虾
在线阅读 下载PDF
基于转录组分析玉米幼苗对盐胁迫的响应 被引量:2
11
作者 李涛 屈小玉 +5 位作者 马小英 刘威帆 万猛虎 马风兰 吴娜 刘吉利 《中国农业大学学报》 北大核心 2025年第1期38-54,共17页
为分析玉米耐盐基因及相关代谢途径,选用玉米品种‘禾育157’(HY157)和‘先玉335’(XY335),设置0(CK)、120(S1)、240 mmol/L NaCl(S_(2))3种处理的盆栽试验,测定不同浓度NaCl处理下玉米幼苗的生长指标和转录组表达情况。结果表明:与CK相... 为分析玉米耐盐基因及相关代谢途径,选用玉米品种‘禾育157’(HY157)和‘先玉335’(XY335),设置0(CK)、120(S1)、240 mmol/L NaCl(S_(2))3种处理的盆栽试验,测定不同浓度NaCl处理下玉米幼苗的生长指标和转录组表达情况。结果表明:与CK相比,‘HY 157’在S1和S2处理下分别产生3305和4314个差异表达基因(DEGs),分别鉴定出1900和2457个上调、1405和1857个下调DEGs;‘XY 335’在S1和S2处理下分别产生729和5037个DEGs。其中,293和2500个上调、436和2537个下调DEGs。通过对DEGs进行GO富集分析,2个玉米品种共同的上调DEGs显著富集在过氧化氢、盐胁迫的应答及碳水化合物代谢过程等GO条目。KEGG富集分析表明,差异基因主要参与淀粉和蔗糖代谢、苯丙烷类生物合成、磷酸戊糖途径、苯并恶唑类生物合成、MAPK通路(植物)以及植物激素信号传导等代谢途径。苯丙烷类生物合成途径中,有3个基因在‘XY 335’中特异性地上调表达,‘HY 157’则有5个基因特异性地下调表达。此外,上调的转录因子主要集中在MYB、C2H2、AP2、NAC、bHLH、bZIP、WRKY等基因家族。综上,120和240 mmol/L NaCl胁迫下,‘HY 157’的DEGs以及显著上调表达的转录因子,主要参与调控渗透调节、离子平衡、抗氧化防御等多种适应性反应,从而增强玉米幼苗对盐胁迫的耐受性。 展开更多
关键词 玉米 盐胁迫 高通量测序 转录组 转录因子
原文传递
基于微流控技术的工程细胞高通量表型测试技术与装备研究进展 被引量:1
12
作者 李爽 郭肖杰 +7 位作者 陈海博 陈思思 笪鑫 李峥辉 刘芹秀 王怡 邢新会 张翀 《中国科学院院刊》 北大核心 2025年第1期91-106,共16页
工程细胞是绿色生物制造的重要基础,如何高效测试并获得目标表型的工程细胞是影响生物制造应用的关键因素之一。近年来,基于微流控技术开发了非培养类型单细胞表型高通量测试装备,以及通过微液滴和微腔室等微型生物反应器实现单细胞生... 工程细胞是绿色生物制造的重要基础,如何高效测试并获得目标表型的工程细胞是影响生物制造应用的关键因素之一。近年来,基于微流控技术开发了非培养类型单细胞表型高通量测试装备,以及通过微液滴和微腔室等微型生物反应器实现单细胞生长代谢的培养类型高通量表型测试装备,实现了工程细胞表型的高通量、自动化、微型化和集成化测试,为工程细胞选育提供了强有力的工具。文章系统综述基于荧光信号、拉曼信号、图像信号、磁信号的非培养类型单细胞表型测试技术与装备,基于皮纳升、微升多尺度微型生物反应器的液滴、微腔室单细胞培养类型测试技术与装备研究进展,并探讨工程细胞高通量测试仪器创制发展趋势,为绿色生物制造工程细胞测试技术研究提供借鉴。 展开更多
关键词 微流控 单细胞 高通量测试 合成生物学 生物制造
原文传递
太白贝母鳞茎腐烂病对其根际土壤特性及细菌群落结构的影响 被引量:1
13
作者 韩凤 章文伟 +3 位作者 罗川 王黎 谭秋生 林茂祥 《西北农业学报》 北大核心 2025年第7期1324-1333,共10页
为探明太白贝母鳞茎腐烂病对土壤理化性质及细菌群落结构和多样性的影响,以太白贝母健康鳞茎植株、鳞茎腐烂病植株根际土壤和未种植太白贝母土壤壤为材料,测定土壤理化性质,并采用Illumina MiSeq测序技术分析3组样品中细菌群落结构多样... 为探明太白贝母鳞茎腐烂病对土壤理化性质及细菌群落结构和多样性的影响,以太白贝母健康鳞茎植株、鳞茎腐烂病植株根际土壤和未种植太白贝母土壤壤为材料,测定土壤理化性质,并采用Illumina MiSeq测序技术分析3组样品中细菌群落结构多样性、群落结构组成和相对丰度。结果表明,根际土壤中pH、有机质、全氮、全磷、全钾、碱解氮、速效磷、速效钾在健康与感病土中差异显著。3组土壤样品共检测出6544个细菌OTUs,获得42个门类、111个纲、155个目、289个科、479个属的细菌,其中变形菌门、酸杆菌门、拟杆菌门和放线菌门等4门细菌相对丰度均大于10%,为优势菌门;而布氏杆菌属、Candidatus_Solibacter、黄杆菌属、根瘤菌属4属细菌为太白贝母根际土壤中相对丰度均大于3%,为优势菌属。土壤性质与根际微生物之间的相关性表明,土壤pH、有机质、全氮、全磷、全钾、有效磷、速效钾与布氏杆菌属、芽单孢菌属、Candidatus_Solibacter、根瘤菌属、酸热菌属、酸杆菌属及Mucilaginibacter呈显著正相关;与硝化螺菌属、变杆菌属、H16、RB41、鞘氨醇单胞菌属、土生单胞菌属、假单胞杆菌属、费氏杆菌属和黄杆菌属呈显著负相关。 展开更多
关键词 太白贝母 鳞茎腐烂病 根际土壤 细菌多样性 高通量测序
在线阅读 下载PDF
鸭绿江口海域浮游植物粒级结构的环境差异响应 被引量:1
14
作者 宋广军 宋伦 +3 位作者 吴金浩 王召会 胡超魁 刘桂英 《环境科学研究》 北大核心 2025年第1期78-89,共12页
海洋浮游植物面临着与气候及环境变化相关的新挑战,种种迹象表明,海水营养盐浓度下降和失衡,以及海水升温、酸化会导致海洋浮游植物粒级结构趋向小型化,但在自然海域这一趋势缺乏直接的验证与深入研究。本文在黄海北部的鸭绿江口设置了1... 海洋浮游植物面临着与气候及环境变化相关的新挑战,种种迹象表明,海水营养盐浓度下降和失衡,以及海水升温、酸化会导致海洋浮游植物粒级结构趋向小型化,但在自然海域这一趋势缺乏直接的验证与深入研究。本文在黄海北部的鸭绿江口设置了16个采样点,2020年3−12月期间,每月采集一次样品(包括浮游植物环境DNA样品和海水样品),对鸭绿江口海域浮游植物粒级结构和环境指标〔包括氮、磷、硅营养盐,水温、溶解氧(DO)、pH以及化学需氧量(COD)等〕进行了系统分析,利用非度量多维尺度分析(NMDS),筛选出各环境因子不同浓度梯度站位,结合高通量测序和实验室镜检手段对浮游植物粒级分级和定量,以验证鸭绿江口海域浮游植物粒级结构的环境差异响应。结果表明:鸭绿江口海域含氮营养盐平均浓度呈现出东西两侧河口区域较高、中部海域相对较低的分布特征,磷、硅营养盐的分布趋势与氮营养盐基本一致。同时,pH和DO浓度在西侧河口区域相对较低,而COD浓度在该区域相对较高。水温在3−12月期间呈倒U型变化趋势,7月达到最高值。验证结果表明,海水中氮、磷、硅营养盐浓度与小粒级浮游植物生物量均呈负相关,即营养盐浓度越低,小粒级浮游植物生物量占比越高。同时,水温的上升也促进了小粒级浮游植物的生长,使其生物量占比增加。此外,发现小粒级浮游植物对有机物的利用效率高于大粒级浮游植物,且对低氧环境具有一定的耐受性。这表现为小粒级浮游植物生物量占比随着COD浓度的升高而升高,随DO浓度的升高而下降。研究显示,近岸海域氮、磷、硅营养盐浓度下降以及水温上升、缺氧加剧,均可导致浮游植物粒级结构趋于小型化,这可能会对生态系统的稳定和海水贝类养殖业的可持续发展构成潜在威胁。因此在全球气候变化的背景下,建议对河口区域陆源氮、磷等营养盐的调控政策进行实时调整,以利于海洋生态系统的健康和海洋经济可持续发展。 展开更多
关键词 浮游植物 高通量测序 粒级结构 环境差异 鸭绿江口海域
在线阅读 下载PDF
消毒剂对猪粪短期湿式厌氧消化系统性能及微生物群落的变化响应 被引量:1
15
作者 吴永明 李坊飞 +8 位作者 吴留兴 张磊 刘亚军 黄学平 刘翔敏 李荣富 池泽涌 张杰 邓觅 《农业工程学报》 北大核心 2025年第9期207-215,共9页
为研究消毒剂对猪粪厌氧发酵系统的影响,选取不同浓度(质量分数0.02%、0.1%、0.5%)卫可(Virkon^(TM))消毒剂进行试验。结果表明:在高浓度Virkon^(TM)胁迫下,厌氧发酵系统出水中总氮(total nitrogen,TN)、氨氮(ammonia nitrogen,NH_(4)^(... 为研究消毒剂对猪粪厌氧发酵系统的影响,选取不同浓度(质量分数0.02%、0.1%、0.5%)卫可(Virkon^(TM))消毒剂进行试验。结果表明:在高浓度Virkon^(TM)胁迫下,厌氧发酵系统出水中总氮(total nitrogen,TN)、氨氮(ammonia nitrogen,NH_(4)^(+)-N)、总磷(total phosphorus,TP)和化学需氧量(chemical oxygen demand,COD)等含量异常剧增,伴随TS和VS的降解率下降。对照组(CK组)和0.02%、0.1%和0.5%Virkon^(TM)试验组(分别记为L组、M组和H组)的最大产CH_(4)速率分别为63.20、71.63、73.10和38.17mL/g且CH_4总产量分别降低4.48%、16.58%(P<0.001)和86.33%(P<0.001)。随着暴露时间的延长,试验组的关键酶活呈先升后降趋势,其中,H组的S-α-GC、S-β-GC、S-ACP、S-NP及S-CAT等土壤酶活被显著性抑制(P<0.05)。进一步结合高通量测序发现,在整个厌氧发酵阶段,H组Ace指数、Chao指数和Shannon指数均显著性低于CK组(P<0.01)。在门水平上,第一优势菌群为厚壁菌门,其次为变形菌门,其中厚壁菌门相对丰度随Virkon^(TM)浓度的上升而降低,而变形菌门则相反;在属水平上,随着厌氧发酵时间的延长,束毛球菌属(Trichococcus)相对丰度均出现不同程度上升,由0.19%~0.39%提升至2.80%~4.20%,而H组中史密斯氏菌属(Smithella)的相对丰度受到极显著性(P<0.001)的抑制,较CK组下降91%。同时通过PICRUSt2功能预测分析发现,各试验组微生物群落COG(clusters of orthologous groups of proteins)功能组成结构差异并不明显,未知功能及氨基酸运输和代谢为主要优势功能;结合KO(KEGG orthology)结果与KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)数据库相关基因分析发现,高浓度Virkon^(TM)显著抑制微生物群落的生长代谢活性并削弱厌氧发酵系统的甲烷合成效能,另一方面,却诱导关键功能基因K00531(anfG)的表达活性发生超量级响应,较对照组(CK)激增约272倍。其表达水平的显著上调可能通过强化关键酶活性,使系统对Virkon^(TM)消毒副产物中典型氯代污染物(氯代烷烃及氯代烯烃类化合物)的降解效率获得提升,结果可为猪粪厌氧消化处理提供参考。 展开更多
关键词 消毒剂 厌氧发酵 猪粪 酶活 高通量测序 PICRUSt2
在线阅读 下载PDF
基于高通量测序技术对口腔扁平苔藓患者相关癌变差异LncRNAs的筛选与分析 被引量:2
16
作者 董文亮 黄一丹 +2 位作者 郭文卓 杨慧霞 张敬 《实用口腔医学杂志》 北大核心 2025年第1期80-87,共8页
目的:筛选并分析口腔扁平苔藓(OLP)黏膜组织的长链非编码RNAs(LncRNAs)的癌变相关差异性表达谱,并对其功能进行初步分析,探索其在OLP发生发展过程中可能的作用。方法:收集OLP(糜烂型)病损黏膜组织和正常黏膜组织各5例,应用高通量测序技... 目的:筛选并分析口腔扁平苔藓(OLP)黏膜组织的长链非编码RNAs(LncRNAs)的癌变相关差异性表达谱,并对其功能进行初步分析,探索其在OLP发生发展过程中可能的作用。方法:收集OLP(糜烂型)病损黏膜组织和正常黏膜组织各5例,应用高通量测序技术构建OLP中基因差异表达谱,生物信息学分析得到与口腔扁平苔藓癌变关系密切的LncRNAs。结果:筛选获得400个与OLP相关的LncRNAs,其中250个表达上调,150个表达下调,得到5个与口腔扁平苔藓癌变相关的差异表达LncRNAs:54055、100128560、399717、378825、100130231。结论:筛选得到的OLP病损黏膜中差异表达LncRNAs400个,发现其中5个LncRNAs可能与OLP发病、癌变倾向相关。 展开更多
关键词 长链非编码RNAs 口腔扁平苔藓 高通量测序 生物信息学分析 癌变
暂未订购
基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用 被引量:1
17
作者 张振超 陶美奇 +4 位作者 潘永飞 孙国胜 王传友 安林海 戴忠良 《核农学报》 北大核心 2025年第3期513-521,I0003-I0005,共12页
为提高青花菜分子标记辅助育种水平,本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记,并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型,根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记,用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表... 为提高青花菜分子标记辅助育种水平,本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记,并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型,根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记,用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表明,70组KASP标记中,未分型成功有3个,未分型材料>5份有13个,多态性差的有6个,分型成功48个(成功率68.6%)。48个标记中,多态性信息含量(PIC)值≥0.30的标记有37个(占比77.08%),其中PIC值为0.37的标记数量最多,为11个,0.38的标记有3个。将48个标记的分型结果转化为二元编码数据,获得了43份青花菜育种材料的SNP-DNA指纹图谱。聚类分析结果发现,Br05与其他材料的遗传关系较远;Br12和Br19、Br33和Br34之间遗传系数均为100,Br14和Br32的遗传系数为99,表明两两间为同一株系的可能性大,这与在田间的表型观察结果基本一致。10组标记对30株Br19的一致性进行鉴定,发现纯度值区间为83.3%~96.7%,说明Br19株系间存在差异;采用10组标记对亲本Br19、Br35和杂交种F1(Br19×Br35)进行基因分型,结果有5个标记(SNP07、SNP09、SNP10、SNP11和SNP19)在三者间的分型结果不同,可用于杂交制种田F1(Br19×Br35)种子纯度鉴定。本研究结果对青花菜种质资源鉴定、分子标记辅助育种与新品种保护具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 高通量测序 竞争性等位基因特异性PCR 指纹图谱 纯度鉴定 分子标记
在线阅读 下载PDF
鸭绿江入海口湿地土壤细菌群落结构和组装机制 被引量:1
18
作者 宋宇 高明 +3 位作者 曲贵伟 张春鹏 李晓玲 李富祥 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第2期214-222,共9页
为了探究鸭绿江入海口湿地中土壤细菌的群落多样性、结构及其组装机制,利用高通量测序技术对滩涂盐土、碱蓬草盐土、沼泽土、水稻土、草甸土和棕壤等6种典型土壤的细菌群落进行16S rRNA基因扩增子测序,并基于系统发育二进制的零模型分析... 为了探究鸭绿江入海口湿地中土壤细菌的群落多样性、结构及其组装机制,利用高通量测序技术对滩涂盐土、碱蓬草盐土、沼泽土、水稻土、草甸土和棕壤等6种典型土壤的细菌群落进行16S rRNA基因扩增子测序,并基于系统发育二进制的零模型分析(model analysis)解析细菌群落组装机制。结果表明,变形菌门(Proteobacteria)平均相对丰度最高(38.5%),其次为酸杆菌门(Acidobacteria,18.2%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,9.7%)。6种土壤类型细菌群落的α多样性和β多样性整体差异显著(P<0.05)。主要菌门和菌属与环境因子的冗余分析(RDA)结果表明,土壤有机碳(SOC)、全氮(TN)、电导率(EC)、全硫(TS)和pH是主要影响因子。基于零模型的群落组装分析表明,鸭绿江口湿地土壤细菌群落组装以随机性为主导,其中扩散限制贡献最大,在群落组装中占40.52%。研究结果可为鸭绿江口湿地生态管理提供参考。 展开更多
关键词 湿地 细菌多样性 群落结构 组装机制 鸭绿江口
在线阅读 下载PDF
不同成曲方式制备高温大曲的细菌菌群解析及其功能与表型预测 被引量:1
19
作者 赵慧君 王玉荣 +4 位作者 侯强川 张海波 田龙新 叶明波 郭壮 《食品工业科技》 北大核心 2025年第8期156-163,共8页
为比较分析人工踩曲和机械压曲制备高温大曲细菌菌群结构的异同,本研究采用Illumina MiSeq高通量测序技术解析了2种成曲方式制备高温大曲样品的细菌菌群组成,并预测了细菌的基因功能及表型。通过α多样性发现,人工踩曲和机械压曲制备的... 为比较分析人工踩曲和机械压曲制备高温大曲细菌菌群结构的异同,本研究采用Illumina MiSeq高通量测序技术解析了2种成曲方式制备高温大曲样品的细菌菌群组成,并预测了细菌的基因功能及表型。通过α多样性发现,人工踩曲和机械压曲制备的高温大曲样品中细菌的多样性和丰富度均无显著差异(P>0.05);通过β多样性发现,2种成曲方式制备高温大曲样品的细菌菌群之间存在非常显著的结构差异(P<0.01),且机械压曲制备的高温大曲组间差异较小;通过细菌菌群结构解析发现,较之人工踩曲,机械压曲制备高温大曲样品中Lentibacillus的含量显著偏多(P<0.001),而Weissella、Brevibacterium和Pediococcus的含量相对偏少(P>0.05);通过线性判别分析效应量(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)发现,放热线菌科(Thermoactinomycetaceae)是人工踩曲制备高温大曲的生物标志物,芽孢杆菌科(Bacillaceae)是机械压曲制备高温大曲的生物标志物;通过基因功能预测发现,相较于人工踩曲,机械压曲制备的高温大曲中细菌类群在信号传导机制上显著偏高,在细胞内运输、分泌和囊泡运输上显著偏低(P<0.05);通过表型预测发现,人工踩曲制备的高温大曲中细菌的氧化胁迫耐受的能力更强(P<0.05),而机械压曲制备的高温大曲中革兰氏阳性菌的含量更丰富(P<0.05)。由此可见,人工踩曲和机械压曲制备高温大曲的细菌菌群结构具有显著差异,并进一步影响其细菌的功能和表型,该研究可为推进酱香型白酒制曲工艺的发展提供基础理论和学科依据。 展开更多
关键词 人工踩曲 机械压曲 Illumina MiSeq高通量测序 细菌菌群 基因功能 表型
在线阅读 下载PDF
基于区块链的车联网数据共享综述 被引量:1
20
作者 范艳芳 张哲 +2 位作者 秦天琦 陈若愚 孙英伦 《计算机应用研究》 北大核心 2025年第6期1611-1623,共13页
车联网数据共享,即不同车辆之间或车辆与基础设施之间交换和共享交通数据,可以有效提升驾驶体验、提高驾驶安全性。区块链凭借去中心化、防窜改、可追溯等特性,被广泛应用于车联网环境下的数据共享,为构造一个可信的数据共享环境提供了... 车联网数据共享,即不同车辆之间或车辆与基础设施之间交换和共享交通数据,可以有效提升驾驶体验、提高驾驶安全性。区块链凭借去中心化、防窜改、可追溯等特性,被广泛应用于车联网环境下的数据共享,为构造一个可信的数据共享环境提供了前所未有的机遇。然而将传统区块链应用于车联网数据共享存在不容忽视的挑战,对此已有大量研究工作提出针对性解决方案。结合现有研究对基于区块链的车联网数据共享展开综述,首先介绍了区块链及车联网数据共享的相关背景知识;其次分析基于区块链的车联网数据共享方案的研究现状,总结方案中存在的主要挑战,其中,首次针对其中吞吐率低下及存储开销过大两种主要挑战的现有解决方案进行分析与对比;最后根据车联网及区块链的发展趋势,提出未来可能的研究方向。 展开更多
关键词 车联网 区块链 数据共享 吞吐率 存储开销
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 250 下一页 到第
使用帮助 返回顶部