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tRNA来源的小RNA在神经精神疾病中的作用研究进展
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作者 初帅 吴婷婷 +4 位作者 洪青晓 陈为升 周文华 刘惠芬 禹海航 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第2期219-225,共7页
转运核糖核酸(tRNA)衍生的小分子RNA(transfer-RNA derived small RNA,tsRNA)是近年来新发现的一类由成熟tRNA或其前体通过特殊的内切酶介导产生的非编码RNA。已有的研究揭示,tsRNA能够在转录及转录后水平上调控基因表达,能以表观遗传... 转运核糖核酸(tRNA)衍生的小分子RNA(transfer-RNA derived small RNA,tsRNA)是近年来新发现的一类由成熟tRNA或其前体通过特殊的内切酶介导产生的非编码RNA。已有的研究揭示,tsRNA能够在转录及转录后水平上调控基因表达,能以表观遗传调控因子方式,在多种生物体的生理和病理过程中发挥重要作用,因此,其逐渐成为生物医学的研究热点而引起广泛关注。而且越来越多的证据显示,tsRNA通过对应激反应、细胞增殖与凋亡、神经发育、突触可塑性、神经炎症与免疫调节、表观遗传、RNA加工和蛋白质翻译调控等参与许多神经精神疾病的发生和发展过程。该文主要就tsRNA的生成和分类及其生物学功能,阐述tsRNA在神经发育和神经精神疾病中的作用和可能作用机制,从而进一步揭示tsRNA作为神经精神疾病可靠生物标志物和治疗靶点的潜力。 展开更多
关键词 trna来源的小RNA trna衍生的应激诱导的RNA trna衍生片段 神经精神疾病 基因调控 生物标志物
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基于mature-tRNA-Asp-GTC/ATF3-LPCAT3介导的铁死亡途径探讨绞股蓝皂苷L抗卵巢癌的分子机制 被引量:1
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作者 朱敬轩 赵佼 +4 位作者 王群 孙小扉 王嘉鑫 张宏达 宋囡 《中国实验方剂学杂志》 北大核心 2025年第11期107-117,共11页
目的:探讨mature-t RNA-Asp-GTC与pre-t RNA-Arg-TCT在卵巢癌(OC)细胞铁死亡表型中作用及绞股蓝皂苷L(Gyp-L)对OC细胞mature-t RNA-Asp-GTC与pre-t RNA-Arg-TCT的调控机制。方法:采用细胞增殖与活性检测法(CCK-8)检测人卵巢腺癌细胞(OVC... 目的:探讨mature-t RNA-Asp-GTC与pre-t RNA-Arg-TCT在卵巢癌(OC)细胞铁死亡表型中作用及绞股蓝皂苷L(Gyp-L)对OC细胞mature-t RNA-Asp-GTC与pre-t RNA-Arg-TCT的调控机制。方法:采用细胞增殖与活性检测法(CCK-8)检测人卵巢腺癌细胞(OVCAR3)增殖情况,计算顺铂(5、10、15、20、25、30μmol·L^(-1))、Gyp-L(25、50、75、100、125μmol·L^(-1))及在Gyp-L作用下顺铂的半数抑制浓度(IC50)以确定后续实验的干预浓度。细胞克隆实验与划痕实验反映OVCAR3细胞的增殖与迁移能力。PANDORA-seq小RNA测序检测Gyp-L干预后细胞差异表达的转运RNA衍生的小RNA(ts RNA),通过RNAhybrid软件查找ts RNA相应的靶基因。比色法或酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测丙二醛(MDA)、谷胱甘肽(GSH)、脂质过氧化物(LPO)水平;Ferro Orange荧光探针检测Fe2+含量;DCFH-DA荧光探针检测活性氧(ROS)含量来共同反映OVCAR3细胞铁死亡的发生。将OVCAR3细胞分为空白组、50μmol·L^(-1)Gyp-L组、100μmol·L^(-1)Gyp-L组。实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-timePCR)检测mature-t RNA-Asp-GTC、mature-t RNA-Leu-CAA、mature-mt_t RNA-Tyr-GTA_5_end、mature-t RNAVal-CAC、mature-mt_t RNA-Glu-TTC、pre-t RNA-Arg-TCT、mature-t RNA-Asn-GTT、羟甲基双烷合酶(HMBS)、Wnt、β-连环蛋白(β-catenin)、谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)、Kelch样ECH关联蛋白1(KEAP1)、核转录因子红系2相关因子2(Nrf2)、活化转录因子3(ATF3)、胱氨酸/谷氨酸逆向转运蛋白(x CT)、溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶(LPCAT3)、花生四烯酸15-脂氧合酶(ALOX15)基因表达;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测HMBS、Wnt、β-catenin、GPX4、KEAP1、Nrf2、ATF3、x CT、LPCAT3、ALOX15蛋白表达。结果:50μmol·L^(-1)Gyp-L组、100μmol·L^(-1)Gyp-L组、顺铂组、50μmol·L^(-1)Gyp-L+顺铂组及100μmol·L^(-1)Gyp-L+顺铂组显著抑制OVCAR3细胞增殖与迁移(P<0.05)并加剧细胞铁死亡,发生体现为ROS、MDA、LPO、Fe2+含量增多及GSH含量明显降低(P<0.05)。与空白组比较,Gyp-L有效干扰OVCAR3细胞25种ts RNA的表达(P<0.05,|log2Fc|>1);Gyp-L干预后,pre-t RNA-Arg-TCT/HMBS/Wnt/β-catenin/GPX4、pre-t RNA-Arg-TCT/KEAP1/Nrf2/x CT、mature-t RNA-Asp-GTC/ATF3/KEAP1/Nrf2/x CT、mature-t RNA-Asp-GTC/LPCAT3/ALOX15轴表达均发生明显异常(P<0.05)。结论:pre-t RNA-Arg-TCT/HMBS/Wnt/β-catenin/GPX4、pre-t RNA-Arg-TCT/KEAP1/Nrf2/x CT、mature-t RNA-Asp-GTC/ATF3/KEAP1/Nrf2/x CT、maturet RNA-Asp-GTC/LPCAT3/ALOX15信号通路参与OC发生发展。Gyp-L主要通过mature-t RNA-Asp-GTC/ATF3/KEAP1/Nrf2/x CT、mature-t RNA-Asp-GTC/LPCAT3/ALOX15信号轴激活OVCAR3细胞铁死亡发生,从而抑制OC发生发展。 展开更多
关键词 卵巢癌 绞股蓝皂苷L mature-trna-Asp-GTC pre-trna-Arg-TCT 铁死亡
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tRNA结构的研究历程综述
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作者 冯国庆 徐宏伟 +1 位作者 吕涛 贾丰华 《生物学通报》 2025年第9期85-91,共7页
自20世纪50年代发现tRNA分子之后,人们便对其结构进行了积极的研究。本文从纯化方法,一、二、三级结构,以及第2套遗传密码等方面综述tRNA分子结构相关研究的历程,以呈现tRNA结构研究的简要科学史。
关键词 trna结构 第2套遗传密码 工程化trna 科学史
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氨基酰-tRNA合成酶与神经退行性疾病 被引量:7
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作者 朱斌 王恩多 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第6期562-566,共5页
氨基酰-tRNA合成酶催化tRNA的氨基酰化反应为生物体内的蛋白质合成提供原料.这类古老且保守的蛋白质分子在高等生物复杂的细胞分子网络中分化出的新功能是目前人们关注的焦点.近期在对一些患有神经退行性疾病的病人和小鼠模型的研究中发... 氨基酰-tRNA合成酶催化tRNA的氨基酰化反应为生物体内的蛋白质合成提供原料.这类古老且保守的蛋白质分子在高等生物复杂的细胞分子网络中分化出的新功能是目前人们关注的焦点.近期在对一些患有神经退行性疾病的病人和小鼠模型的研究中发现,位于酪氨酰-tRNA合成酶、甘氨酰-tRNA合成酶和丙氨酰-tRNA合成酶上的突变,可分别导致DI腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Toothdisease,CMT)C型,腓骨肌萎缩症2D型及小脑浦肯雅(Purkinje)细胞丢失.初步的致病机理研究表明,致病突变对这3种酶的影响各不相同:酪氨酰-tRNA合成酶的氨基酰化催化能力受到影响,甘氨酰-tRNA合成酶受影响的可能是一种未知的新功能,而丙氨酰-tRNA合成酶受影响的则是它的编校功能.这些研究结果揭示了氨基酰-tRNA合成酶涉及神经退行性疾病的广泛性和其机制的复杂性,并将促进对神经退行性疾病这一类常见疾病的病理和治疗方法的研究. 展开更多
关键词 氨基酰-trna合成酶 酪氨酰-trna合成酶 甘氨酰-trna合成酶 丙氨酰-trna合成酶 神经退行性疾病 腓骨肌萎缩症 浦肯雅(Purkinje)细胞
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The research team of Prof. Qing Xia has developed a novel translation enhancement strategy called “tRNA-plus”
5
作者 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 2025年第10期977-978,共2页
在生命体的蛋白质合成过程中,转运RNA(tRNA)扮演着不可或缺的“翻译官”角色。它能够精准识别信使RNA(mRNA)序列上的特定密码子,并将对应的氨基酸运送至核糖体进行蛋白质组装。t RNA的丰度及其化学修饰状态不仅决定了翻译过程的效率和... 在生命体的蛋白质合成过程中,转运RNA(tRNA)扮演着不可或缺的“翻译官”角色。它能够精准识别信使RNA(mRNA)序列上的特定密码子,并将对应的氨基酸运送至核糖体进行蛋白质组装。t RNA的丰度及其化学修饰状态不仅决定了翻译过程的效率和准确性,还深刻影响着mRNA分子的稳定性,是蛋白质合成质量控制的核心环节。近年来发现, tRNA丰度和修饰的改变会以密码子依赖的方式影响mRNA稳定性和蛋白质输出,这表明tRNA可能成为一种潜在的翻译增强剂。 展开更多
关键词 氨基酸 转运RNA trna-plus trna丰度 核糖体
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tRNA的应用前景 被引量:1
6
作者 陈莉 金由辛 王德宝 《生命的化学》 CAS CSCD 2000年第3期103-105,共3页
关键词 trna介导蛋白质工程 trna 类似物 校正trna
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转移核糖核酸发现五十年——tRNA发现者Zamecnik辞世 被引量:3
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作者 刘望夷 《生命的化学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期656-666,共11页
Crick(1955)预见到细胞内存在一种小分子RNA称为"衔接子",并假定它是一种沟通DNA与蛋白质序列之间的中介体。Zamecnik(1955)发现sRNA(tRNA),Hoagland(1954)发现氨基酸激活酶(氨基酰-tRNA合成酶)。镁离子稳定tRNA的二级结构(19... Crick(1955)预见到细胞内存在一种小分子RNA称为"衔接子",并假定它是一种沟通DNA与蛋白质序列之间的中介体。Zamecnik(1955)发现sRNA(tRNA),Hoagland(1954)发现氨基酸激活酶(氨基酰-tRNA合成酶)。镁离子稳定tRNA的二级结构(1963),由此,可以得到大的寡核苷酸片断,甚至tRNA的半分子。这项技术大大推动了tRNA及其他RNA序列分析工作的迅速进展。Holley(1965)首次测定出酵母tRNAAla全部核苷酸序列,并设计出一种"三叶草"二级结构。Crick(1966)较早地提出"摆动假说",即反密码子5’端的碱基并不与密码子3’端碱基严格配对,允许有一定的摆动。Rich(1974)等用X射线晶体衍射法,阐明了酵母tRNAPhe的高级结构(呈L型)。2000年,英国剑桥科学家,使用在冰箱保存了15年的酵母tRNAPhe晶体,重新测定它的L型结构是正确的,并严格确定其中10个镁离子和一个精胺分子的精确部位。 展开更多
关键词 衔接子 trna 氨基酰-trna合成酶 镁离子 trna一级结构 三叶草二级结构 L型高级结构 摆动假说
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基于tRNA介导的双串联sgRNA技术定点编辑猪MSTN成熟肽的研究
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作者 吴桐 刘雯雯 +5 位作者 任红艳 徐康 于济世 杨烨 印遇龙 毕延震 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第11期138-143,共6页
多位点基因编辑是通往复合性状协同改良的有效路径,它可以通过并联表达多个单顺反子单导向RNA(Single-guide RNA,sgRNA)和串联表达一个多顺反子sgRNA 2种方法实现。前者元件构成复杂,牺牲了编辑效率;后者结构单一,效率优势明显。本研究... 多位点基因编辑是通往复合性状协同改良的有效路径,它可以通过并联表达多个单顺反子单导向RNA(Single-guide RNA,sgRNA)和串联表达一个多顺反子sgRNA 2种方法实现。前者元件构成复杂,牺牲了编辑效率;后者结构单一,效率优势明显。本研究利用转运RNA(tRNA)精确自剪切的优点,通过表达双顺反子sgRNA,定点编辑了猪肌抑素基因成熟肽编码区,获得了纯合敲除MSTN的猪原代肾成纤维细胞系,成功构建了基于tRNA串联双sgRNA的载体PX459-tRNA-MSTN,相较于单sgRNA介导及双sgRNA分别介导的方式,串联双sgRNA介导的敲除效率显著提高,并成功实现了MSTN基因的敲除,证实了tRNA自剪切机制在大型动物多基因编辑中的有效性和实用性,为地方猪种的经济性状遗传改良提供了简便、高效的技术方案,展现出在畜牧育种中推广应用的潜力。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 trna 桃源黑猪 MSTN
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tRNA衍生的小RNA在呼吸系统疾病中的作用研究进展
9
作者 渠怡彤 徐炎 +3 位作者 管志伟 孟璐 李银丽 邱建利 《解放军医学杂志》 北大核心 2025年第11期1461-1468,共8页
tRNA衍生的小RNA(tsRNA)是一种新型非编码小RNA,具有调控基因表达、蛋白质翻译、表观遗传、细胞增殖和凋亡及通讯等多种生物学功能。tsRNA在呼吸系统癌症、肺损伤、肺动脉高压、儿童阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征及呼吸道病毒感染中... tRNA衍生的小RNA(tsRNA)是一种新型非编码小RNA,具有调控基因表达、蛋白质翻译、表观遗传、细胞增殖和凋亡及通讯等多种生物学功能。tsRNA在呼吸系统癌症、肺损伤、肺动脉高压、儿童阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征及呼吸道病毒感染中异常表达,影响疾病的发生发展。但目前关于tsRNA在呼吸系统疾病中的调控机制尚未完全阐明。因此,本文介绍tsRNA的来源、分类与检测方法,总结tsRNA在呼吸系统疾病中的生物学功能、相关调控机制及其作为生物标志物在临床诊断和预后评估中的应用前景,以期为呼吸系统疾病的诊治提供新的思路,并为tsRNA调控呼吸系统疾病的深入研究提供借鉴。 展开更多
关键词 呼吸系统疾病 trna衍生的小RNA(tsRNA) 调控机制 临床价值
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7个水稻线粒体tRNA^(Trp)突变体的克隆和活力测定
10
作者 金晓玲 巩菊芳 乌云塔娜 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期256-260,共5页
为了研究tRNAs被相应的氨酰酶识别的种属特异性,构建了7个水稻线粒体tRNATrp3个碱基(G73,U72,A68)的单点或多点突变的突变体.突变基因,经体外转录后分别用枯草杆菌(B.subtilis)和人色氨酰tRNA合成酶(TrpRS)进行氨酰化反应,并测定动力学... 为了研究tRNAs被相应的氨酰酶识别的种属特异性,构建了7个水稻线粒体tRNATrp3个碱基(G73,U72,A68)的单点或多点突变的突变体.突变基因,经体外转录后分别用枯草杆菌(B.subtilis)和人色氨酰tRNA合成酶(TrpRS)进行氨酰化反应,并测定动力学常数.结果表明:与野生型水稻线粒体tRNATrp相比,7个突变体的转录产物被B.subtilisTrpRS氨酰化的活力分别下降了53.33%~99.79%;被人TrpRS氨酰化的活力则提高了4~330倍,其中以pMPH7的氨酰化活力改变最大.识别位碱基G73,G1/U72,U5/A68对水稻线粒体tRNATrp的种属特异性识别起重要作用. 展开更多
关键词 水稻线粒体色氨酸trna 枯草杆菌色氨酰trna合成酶 人色氨酰trna合成酶 突变体
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蛋白质合成中四个tRNA相关问题的拓展
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作者 滕远王 冯国庆 吕涛 《生物学教学》 北大核心 2025年第8期80-83,共4页
蛋白质合成与tRNA密切关联,本文挑选蛋白质合成中四个与tRNA密切相关的问题进行拓展分析,以帮助教师和学生更深入了解蛋白质合成的细节。
关键词 trna 第二套遗传密码 CCA末端 起始密码子
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十字花科黑腐病菌的tRNA基因是适应性表达而不是组成型表达
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作者 龚智宇 胡姗姗 +4 位作者 黎宗洋 苏贝宁 杨玉环 杨卓奇 唐东阶 《基因组学与应用生物学》 北大核心 2025年第6期578-591,共14页
传统观点认为,一个基因组中所有转运RNA(transfer RNA,tRNA)基因的表达都是恒定且高水平的,而且不同tRNA基因的表达水平都是相似的,属于组成型表达。而今,随着挑战这个观点的实验证据不断涌现,人们越来越意识到tRNA基因的表达可能是适... 传统观点认为,一个基因组中所有转运RNA(transfer RNA,tRNA)基因的表达都是恒定且高水平的,而且不同tRNA基因的表达水平都是相似的,属于组成型表达。而今,随着挑战这个观点的实验证据不断涌现,人们越来越意识到tRNA基因的表达可能是适应性表达而不是组成型表达。本研究采用Northern杂交方法,对十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathovar campestris,Xcc)8004菌株(Xcc8004菌株)基因组中所有55个注释的tRNA基因在对数生长期的表达水平进行了检测和比较。结果发现,不同tRNA基因的表达水平存在巨大差异:有些高表达、有些中表达、有些低表达、有些则几乎不表达。此外,本研究还发现,tRNA基因XC4365的表达受到果糖的强烈抑制。启动子β-葡萄糖苷酸酶(β-glucuronidase,GUS)报告系统构建和GUS活性检测结果证明,果糖对XC4365表达的抑制作用在XC4365启动子上。这些结果充分证明,在Xcc8004菌株中,tRNA基因的表达是适应性表达而不是组成型表达。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌 转运RNA(trna)基因 表达 果糖
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氨基酰-tRNA合成酶及其与相关tRNA的相互作用研究 被引量:4
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作者 王恩多 《中国科学院院刊》 2001年第5期349-352,共4页
氨基酰tRNA合成酶是生物体蛋白质合成过程中的一类关键酶 ,对它的研究具有重要的生物学意义和应用前景。该项目系统研究了大肠杆菌亮氨酰 和精氨酰 tRNA合成酶及其与相关tR NA的相互作用。用酶和tRNA的基因克隆和高表达 ,tRNA体外转... 氨基酰tRNA合成酶是生物体蛋白质合成过程中的一类关键酶 ,对它的研究具有重要的生物学意义和应用前景。该项目系统研究了大肠杆菌亮氨酰 和精氨酰 tRNA合成酶及其与相关tR NA的相互作用。用酶和tRNA的基因克隆和高表达 ,tRNA体外转录 ,基因定点突变 ,酶片段的体外重组等手段研究了酶与tRNA的相互作用的结构基础 ,得到一系列重要结果。 展开更多
关键词 大肠杆菌 亮氨酰-trna合成酶 精氨酰-trna 合成酶 trna 相互作用 氨基酰-trna合成酶
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甘氨酰tRNA合成酶1在肿瘤中的研究进展
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作者 公凯 沈大庆 《癌症进展》 2025年第2期133-137,共5页
甘氨酰tRNA合成酶1(GARS1)是一种氨酰基tRNA合成酶,属于Ⅱ类t RNA合成酶家族成员,在蛋白质合成过程中参与将氨基酸装载到各自的tRNA分子上,可使tRNA与其同源氨基酸结合,从而为蛋白质的编码提供氨基酸。GARS1已被证明是人类自身免疫疾病... 甘氨酰tRNA合成酶1(GARS1)是一种氨酰基tRNA合成酶,属于Ⅱ类t RNA合成酶家族成员,在蛋白质合成过程中参与将氨基酸装载到各自的tRNA分子上,可使tRNA与其同源氨基酸结合,从而为蛋白质的编码提供氨基酸。GARS1已被证明是人类自身免疫疾病、多发性肌炎和皮肌炎中自身抗体的靶标。研究表明,GARS1可能是多种肿瘤的致癌基因,并可能作为潜在的生物标志物和治疗靶点。本文对GARS1在肿瘤中的研究进展进行综述,为肿瘤的诊断、治疗及预后评估提供新策略和科学依据。 展开更多
关键词 甘氨酰trna合成酶1 肿瘤 治疗靶点
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Unveiling mitochondrial mysteries:Exploring novel tRNA variants in type 2 diabetes mellitus
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作者 Chun-Han Cheng Wen-Rui Hao Tzu-Hurng Cheng 《World Journal of Diabetes》 SCIE 2025年第1期1-6,共6页
The recent study of Ding et al provides valuable insights into the functional implications of novel mitochondrial tRNATrp and tRNASer(AGY)variants in type 2 diabetes mellitus(T2DM).This editorial explores their findin... The recent study of Ding et al provides valuable insights into the functional implications of novel mitochondrial tRNATrp and tRNASer(AGY)variants in type 2 diabetes mellitus(T2DM).This editorial explores their findings,highlighting the role of mitochondrial dysfunction in the pathogenesis of T2DM.By examining the molecular mechanisms through which these tRNA variants contribute to disease progression,the study introduces new targets for therapeutic strategies.We discuss the broader implications of these results,emphasizing the importance of understanding mitochondrial genetics in addressing T2DM. 展开更多
关键词 Mitochondrial trna variants Type 2 diabetes mellitus Mitochondrial dysfunction Genetic markers Therapeutic strategies
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原核生物pre-tRNA 5'末端剪切酶的结构和功能研究
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作者 邵齐源 李洋洋 +1 位作者 张威振 甘建华 《复旦学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期113-120,共8页
5'末端的剪切是pre-tRNA加工和成熟过程中非常重要的一个环节,由RNase P负责催化。不同于常规的RNase P,原核生物中存在一类protein-only RNase P(也称HARP),不需要依赖核酶就能对pre-tRNA的5'末端进行剪切。为了阐明HARP结合... 5'末端的剪切是pre-tRNA加工和成熟过程中非常重要的一个环节,由RNase P负责催化。不同于常规的RNase P,原核生物中存在一类protein-only RNase P(也称HARP),不需要依赖核酶就能对pre-tRNA的5'末端进行剪切。为了阐明HARP结合和剪切pre-tRNA的分子机制,我们表达和纯化了Thermocrinis ruber来源的HARP蛋白(TrHARP)。定点突变、分子筛和体外活性实验证实TrHARP具有pre-tRNA剪切活性,而且该活性受到蛋白聚合状态的影响。此外,我们还筛选获得了TrHARP蛋白质的晶体,采集了衍射数据并建立了初始的结构模型。尽管TrHARP与Aquifex aeolicus来源的HARP Aq_880的折叠方式类似,但TrHARP与Aq_880在结构中的聚合方式和相对方位存在显著的差异。分子筛以及负染电镜实验结果均显示pre-tRNA的引入会导致HARP结构的解聚,这为进一步阐明HARP结合和催化pre-tRNA的5'末端成熟的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 protein-only RNase P pre-trna HARP 晶体结构 功能 蛋白表达
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人类线粒体tRNA生物合成与线粒体疾病 被引量:8
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作者 阳娅玲 肖红利 管敏鑫 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期916-925,共10页
线粒体是普遍存在于真核细胞中的一类细胞器.每个线粒体含有多个拷贝的闭合环状双链DNA.人类线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)共编码22种线粒体tRNA(mitochondrial tRNA,mt tRNA),2种rRNA及13种多肽.mt tRNA独特的结构特点决定了它... 线粒体是普遍存在于真核细胞中的一类细胞器.每个线粒体含有多个拷贝的闭合环状双链DNA.人类线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)共编码22种线粒体tRNA(mitochondrial tRNA,mt tRNA),2种rRNA及13种多肽.mt tRNA独特的结构特点决定了它们与具有典型三叶草结构的细胞质tRNA不同.编码mt tRNA的基因突变频率较高,这可能是引起线粒体功能障碍的主要原因之一.同时,这与很多病理现象相关.目前发现,大量与mt tRNA生物代谢和功能相关的核因子包括加工内切酶、tRNA修饰酶和氨酰-tRNA合成酶.这些核因子的异常导致了疾病相关的tRNA致病突变.由此可见mt tRNA功能对于线粒体活性的重要性. 展开更多
关键词 线粒体 线粒体trna 突变 氨酰-trna合成酶 线粒体疾病
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草菇基因组中的tRNA分析 被引量:2
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作者 陈炳智 谢宝贵 +4 位作者 胡良韬 邓优锦 江玉姬 刘新锐 贵甫 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期594-599,共6页
草菇(Volvariella volvacea),又名中国蘑菇,是一种生长于中国和东南亚的重要经济食用菌。本文基于本实验室的草菇基因组测序结果,分析了草菇基因组中的tRNA情况。草菇基因组的302个框架中,共发现了177个tRNA基因,其中有7个可能的假基因,... 草菇(Volvariella volvacea),又名中国蘑菇,是一种生长于中国和东南亚的重要经济食用菌。本文基于本实验室的草菇基因组测序结果,分析了草菇基因组中的tRNA情况。草菇基因组的302个框架中,共发现了177个tRNA基因,其中有7个可能的假基因,有2个携带硒代半胱氨酸,一个抑制性tRNA基因和一个未知的异型结构tRNA。除了上述11个特殊的tRNA基因外,166个tRNA可按反密码子类型分成47类。与其它5种担子菌的基因组tRNA比较,草菇的tRNA数量处于第4位,少于鬼伞、裂褶菌、灵芝,多于双孢蘑菇和平菇。通过比较分析草菇及这5种大型真菌的基因组tRNA编码情况,首次报道了几种食用菌tRNA遵守修正的摆动假说的情况。另外,草菇的同功受体tRNA非编码子序列也具有差异性,对tRNA的分析将有助于进一步研究草菇的进化。 展开更多
关键词 草菇基因组 trna基因 修正的摆动假设 同功受体trna
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剑尾鱼线粒体DNA D-环及侧翼tRNA^(thr)和tRNA^(pro)序列与结构分析 被引量:4
19
作者 白俊杰 劳海华 +2 位作者 叶星 简清 吴淑勤 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期89-92,共4页
采用PCR方法从剑尾鱼(Xiphophorushelleri)线粒体基因组中扩增到1段约15.5kb的片段,测定了其中627个碱基的序列。经测序分析表明,该扩增片段包括486bp的D 环的部分序列以及D 环5'端的tRNAthr和tRNApro基因的完整序列。其中486bpD环... 采用PCR方法从剑尾鱼(Xiphophorushelleri)线粒体基因组中扩增到1段约15.5kb的片段,测定了其中627个碱基的序列。经测序分析表明,该扩增片段包括486bp的D 环的部分序列以及D 环5'端的tRNAthr和tRNApro基因的完整序列。其中486bpD环序列包含3段保守的终止相关序列TAS、与TAS互补的序列以及类似其他鱼类线粒体CSB序列。tRNAthr由线粒体DNA的H链编码,长度为72bp。tRNApro由线粒体DNA的L链编码,长度为69bp。并绘制了这2种tRNA的二级结构图。本研究所测定的基因序列已登录国际GenBank数据库,序号为AF489918。 展开更多
关键词 剑尾鱼 线粒体DNA D—环 侧翼 trna^trh trnapro 基因序列 二级结构图
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Modulation of tRNA^(Cln)decoding efficacy by metal ion binding and glutamine supply
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作者 Yuxuan Shen Tianchang Wang +3 位作者 Hua Qiao Qing Liang Jingru Lv Qing Xia 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 2025年第1期28-40,共13页
Transfer RNAs(tRNAs)adopt a stable L-shaped tertiary structure crucial for their involvement in protein translation.Among various divalent metal ions,magnesium ions play a pivotal role in preserving the tertiary struc... Transfer RNAs(tRNAs)adopt a stable L-shaped tertiary structure crucial for their involvement in protein translation.Among various divalent metal ions,magnesium ions play a pivotal role in preserving the tertiary structure of tRNA.However,the precise location of the Mg^(2+)binding pocket in human tRNA remains elusive.In this investigation,we identified the Mg^(2+)binding site within human tRNAGln using suppressor tRNA^(Gln).This variant of tRNA recognizes premature stop codons(specificlly UAG)and facilitates the expression of fll-length proteis.By mutating sites 8 and C72 in supprssr tRNAcl,we assessed the decoding efficiency of the resulting mutant suppressor tRNAs,which serves as a measure of tRNA's ability to decode genetic information.Our analysis revealed that the U8C mutant suppressor tRNA exhibited a significantly lower Mg^(2+)content compared to the C72U mutant.Furthermore,we observed a notable reduction in decoding efficiency in the U8-mutated suppressor tRNA,as evidenced by GFP fluorescence and Western blotting analysis.Conversely,mutations at the C72 site had a comparatively minor impact on decoding efficiency.These findings underscored the tight binding of Mg^(2+)to the U8 site of human tRNAGln,crucial for maintaining the stability of tRNA tertiary structure and translation efficacy.Additionally,our investigation delved into the influence of glutamine availability on tRNA decoding efficiency at the cellular level.The results indicated that both the concentration of amino acids and the codon context of TAG could modulate tRNA decoding efficiency.This study provided valuable insights into the structure and function of tRNA,laying the groundwork for further exploration in this field. 展开更多
关键词 Metal ions trna tertiary structure Glutamine supply Decoding efficacy
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