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保存最古老矿物结合多肽的中新世鸵鸟蛋壳化石首次组织化学研究
1
作者 吴倩 泮艳红 +2 位作者 李志恒 周忠和 艾莉达 《古脊椎动物学报（中英文）》 CSCD 北大核心 2024年第2期120-134,共15页
古蛋白质比古DNA具有更高的保存潜力,因此蛋白质组学研究可以帮助阐明一些超出古DNA研究领域的灭绝生物群体的生物学特征。迄今为止最古老的多肽发现于中国西北地区晚中新世临夏盆地的鸵鸟蛋壳化石中,是与蛋壳矿化相关的蛋白质struthioc... 古蛋白质比古DNA具有更高的保存潜力,因此蛋白质组学研究可以帮助阐明一些超出古DNA研究领域的灭绝生物群体的生物学特征。迄今为止最古老的多肽发现于中国西北地区晚中新世临夏盆地的鸵鸟蛋壳化石中,是与蛋壳矿化相关的蛋白质struthiocalcin(SCA-1)的一部分。前人认为SCA-1在蛋壳中均匀分布,并因其与方解石晶体结合的特性而得以在地质历史中长时间保存。本次对同一鸵鸟蛋壳化石进行了组织学、扫描电子显微镜和拉曼光谱分析,发现蛋壳内侧锥体层的晶核含有部分磷灰石,其他部位则完全由方解石构成;这些晶核部分应当是在成岩作用过程中经历了磷酸盐化。在对该化石蛋壳样品脱钙处理后,其锥体层晶核部分存在残留物,呈现网络状纤维结构,其位置和形态与现生鸵鸟蛋壳中脱钙后残留的有机质相似。结果表明,该化石蛋壳中的古多肽可能集中保存在锥体层晶核处,而非在整个蛋壳中均匀分布。磷酸盐化可能是另一个有利于有机物长期保存的埋藏过程。临夏盆地的古气候和埋藏环境可能为该古蛋白分子的保存提供了有利的条件。建议在未来研究中进行更深入的组织化学和矿物学分析,以进一步了解该盆地有机质和古蛋白的保存机制。 展开更多
关键词 化石有机质 生物矿化蛋白 磷灰石 磷酸盐化 鸵鸟蛋壳 古蛋白
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山麻鸭SCA-2基因克隆、生物信息学及组织表达谱分析
2
作者 张迎燕 刘亚楠 +6 位作者 江林 梅慧灵 郑定黔 田若宁 徐丽 李昂 吴旭 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第6期47-52,135,共7页
为了探究Struthiocalcin-2(SCA-2)基因在山麻鸭蛋壳形成过程中的作用,试验选择9只产蛋高峰期(30周龄)的健康山麻鸭,采用SMART-RACE方法对山麻鸭SCA-2基因cDNA序列进行克隆,运用生物信息学软件对SCA-2基因编码蛋白质的理化性质、二级和... 为了探究Struthiocalcin-2(SCA-2)基因在山麻鸭蛋壳形成过程中的作用,试验选择9只产蛋高峰期(30周龄)的健康山麻鸭,采用SMART-RACE方法对山麻鸭SCA-2基因cDNA序列进行克隆,运用生物信息学软件对SCA-2基因编码蛋白质的理化性质、二级和三级结构进行预测及分析,构建SCA-2基因系统进化树;采集试验山麻鸭心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌、肌胃、下丘脑、垂体、卵巢,以及输卵管的漏斗部、膨大部、峡部和子宫部共14个组织,每3只做一次混样处理,每个组织共3个重复,提取组织RNA,通过实时荧光定量PCR分析SCA-2基因mRNA在上述组织中的相对表达量。结果表明:SCA-2基因的cDNA全长为726 bp,该基因编码蛋白的分子式为C_(836)H_(1247)N_(229)O_(247)S_(8),属于不稳定蛋白,其中丝氨酸(12.6%)、亮氨酸(12.0%)、丙氨酸(10.2%)含量较高;蛋白质的二级结构中,α螺旋占23.35%、β折叠占13.77%、无规卷曲占62.87%,且包含信号肽序列,不含跨膜结构;山麻鸭与绿头鸭、凤头潜鸭和棕硬尾鸭的亲缘关系最近;SCA-2基因在山麻鸭14种组织中均有不同程度的表达,其中在输卵管子宫部和峡部组织中的表达量极显著高于卵巢(P<0.01),明显高于其他组织。说明本试验成功克隆到了SCA-2基因,该基因可能在山麻鸭蛋壳的形成过程中扮演着重要角色。 展开更多
关键词 山麻鸭 SCA-2基因 基因克隆 生物信息学 组织表达谱
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