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回顾Rep与Cap的结构及其对研究CRESS DNA 病毒的启发
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作者 王栓群 刘献辉 +2 位作者 王琳 张衡 谢相科 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第2期120-129,共10页
编码复制相关蛋白(Replication-associated protein,Rep)的单链环状DNA病毒(Circular Rep Encoding Single-Stranded DNA (CRESS DNA) Viruses)感染真核生物,具有病毒基因组小、宿主范围多样化、流行率高、滚环复制以及亲和性强等特点。... 编码复制相关蛋白(Replication-associated protein,Rep)的单链环状DNA病毒(Circular Rep Encoding Single-Stranded DNA (CRESS DNA) Viruses)感染真核生物,具有病毒基因组小、宿主范围多样化、流行率高、滚环复制以及亲和性强等特点。CRESS DNA病毒广泛感染且潜伏于多种真核生物,包括植物、动物、人类和真菌等,在病毒学领域影响深远且具有重要意义。CRESS DNA病毒是一种小型非囊膜DNA病毒,直径15~25 nm。病毒具有单链环状的基因组,主要编码两种蛋白质包括衣壳相关蛋白(Capsid protein,Cap)以及复制相关蛋白。Cap是组成病毒衣壳的唯一蛋白质组分,且在整个病毒复制周期中起着至关重要的作用,其参与病毒附着、细胞进入、基因组脱壳和成熟病毒粒子的组装。Rep则介导病毒基因组复制起始位点的识别,并利用其核酸内切酶活性使环状DNA断裂以进行滚环复制(Rolling cycle replication,RCR)。CRESS DNA病毒能够利用碱基长度有限的基因组在多种真核生物中进行复制并引起许多重要疾病,是病毒自然进化过程中产生的一种优秀的研究模型,该病毒进行复制的分子机制以及感染宿主的免疫机制值得深入探究。本文回顾了目前对CRESS DNA病毒编码蛋白的结构研究,通过了解蛋白在复制周期中的作用及其相互关系,为进一步阐明CRESS DNA病毒相关疾病的发病机制提供参考。 展开更多
关键词 CRESS DNA病毒 衣壳蛋白 复制酶相关蛋白 蛋白质结构 致病机制
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Automatic Pancreas Segmentation in CT Images Using EfficientNetV2 and Multi-Branch Structure
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作者 Panru Liang Guojiang Xin +2 位作者 Xiaolei Yi Hao Liang Changsong Ding 《Computers, Materials & Continua》 2025年第5期2481-2504,共24页
Automatic pancreas segmentation plays a pivotal role in assisting physicians with diagnosing pancreatic diseases,facilitating treatment evaluations,and designing surgical plans.Due to the pancreas’s tiny size,signifi... Automatic pancreas segmentation plays a pivotal role in assisting physicians with diagnosing pancreatic diseases,facilitating treatment evaluations,and designing surgical plans.Due to the pancreas’s tiny size,significant variability in shape and location,and low contrast with surrounding tissues,achieving high segmentation accuracy remains challenging.To improve segmentation precision,we propose a novel network utilizing EfficientNetV2 and multi-branch structures for automatically segmenting the pancreas fromCT images.Firstly,an EfficientNetV2 encoder is employed to extract complex and multi-level features,enhancing the model’s ability to capture the pancreas’s intricate morphology.Then,a residual multi-branch dilated attention(RMDA)module is designed to suppress irrelevant background noise and highlight useful pancreatic features.And re-parameterization Visual Geometry Group(RepVGG)blocks with amulti-branch structure are introduced in the decoder to effectively integrate deep features and low-level details,improving segmentation accuracy.Furthermore,we apply re-parameterization to the model,reducing computations and parameters while accelerating inference and reducing memory usage.Our approach achieves average dice similarity coefficient(DSC)of 85.59%,intersection over union(IoU)of 75.03%,precision of 85.09%,and recall of 86.57%on the NIH pancreas dataset.Compared with other methods,our model has fewer parameters and faster inference speed,demonstrating its enormous potential in practical applications of pancreatic segmentation. 展开更多
关键词 Pancreas segmentation efficientNetV2 multi-branch structure re-parameterization
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融合多尺度特征与可变形注意力的机车圆弹簧缺陷检测方法
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作者 彭珍瑞 裴志彪 《中国图象图形学报》 北大核心 2026年第2期499-511,共13页
目的 机车圆弹簧缺陷检测对机车的安全运行至关重要,受限于检测车间复杂环境的影响,机车圆弹簧缺陷检测存在漏检、误检及检测效率低下的问题,为此,提出一种基于改进RT-DETR(real-time detection Transformer)的机车圆弹簧缺陷检测方法... 目的 机车圆弹簧缺陷检测对机车的安全运行至关重要,受限于检测车间复杂环境的影响,机车圆弹簧缺陷检测存在漏检、误检及检测效率低下的问题,为此,提出一种基于改进RT-DETR(real-time detection Transformer)的机车圆弹簧缺陷检测方法。方法 首先,应用结构重参数化(structural re-parameterization,Rep)方法来改进部分卷积(partial convolution, Pconv),构建重参数化的部分卷积(Rep-Pconv)替换原始主干中的Basic block;其次,在基于注意力的尺度内特征交互(attention-based intra-scale feature interaction,AIFI)模块中引入可变形注意力(deformable attention,DA)机制修正原有结构中的多头自注意力机制(multi-head self-attention),提高模型对局部区域的关注度;最后,在颈部网络添加P2检测层,结合尺度序列特征融合(scale-sequence feature fusion,SSFF)思想与三重特征编码器(triple feature encoder,TFE)结构,构建轻量的跨尺度特征信息融合模块。结果 利用自建机车圆弹簧缺陷数据集对所提方法进行验证,相较于原始的RT-DETR算法,改进后RT-DETR算法在参数量减少54%的同时,将mAP50提升至97.2%,提高2.8%,精度以及召回率分别提升0.8%和1.2%;与YOLOv5s、YOLOv8s、YOLO11s和YOLO12s相比,所提算法在多项指标上表现出显著优势。结论 本文所改进的RT-DETR机车圆弹簧缺陷检测算法,能够有效应对机车圆弹簧在车间复杂环境检测的要求,通过实验验证并与当前主流目标检测算法进行对比分析,结果表明所提算法在实验数据集上表现优异。 展开更多
关键词 机车圆弹簧 缺陷检测 RT-DETR 部分卷积(Pconv) 结构重参数化(rep) 可变形注意力机制 特征融合
原文传递
基于加工特征的B-rep模型几何变换算法 被引量:2
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作者 马善坤 刘长安 方文涛 《组合机床与自动化加工技术》 北大核心 2012年第4期20-24,共5页
为了真实反映加工过程中零件的几何变换情况,对边界表示法模型的特征尺寸的改变和特征的删除方法进行了研究。基于拓扑结构保持不变的前提下,提出了通过延长特征邻接边实现面特征在法向方向上尺寸改变的几何更新算法和几何形状规则的特... 为了真实反映加工过程中零件的几何变换情况,对边界表示法模型的特征尺寸的改变和特征的删除方法进行了研究。基于拓扑结构保持不变的前提下,提出了通过延长特征邻接边实现面特征在法向方向上尺寸改变的几何更新算法和几何形状规则的特征的删除算法,针对几何形状不规则的非独立特征,提出了通过面对齐和合并面处理来实现特征删除的算法。经过几何变换后,确保零件模型面壳封闭,保证模型的合理性和完整性,能够通过模型重构映射零件的实际加工情况。最后通过软件实例验证了方法的可行性。 展开更多
关键词 边界表示法 拓扑结构 特征删除 模型重构
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宁夏稻瘟病菌群体遗传结构研究 被引量:7
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作者 李文强 王源超 郑小波 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期66-72,共7页
采用Pot2-rep-PCR指纹识别技术对宁夏稻瘟病菌的群体结构进行分析。根据每个菌株的指纹型将2002至2005年在9个地区采集的406个稻瘟病菌单孢菌株鉴定为65个单元型,其中,单元型NXH7包含176个菌株,占总菌株数的43.3%,在所有年份、地区和大... 采用Pot2-rep-PCR指纹识别技术对宁夏稻瘟病菌的群体结构进行分析。根据每个菌株的指纹型将2002至2005年在9个地区采集的406个稻瘟病菌单孢菌株鉴定为65个单元型,其中,单元型NXH7包含176个菌株,占总菌株数的43.3%,在所有年份、地区和大多数水稻品种上出现,是宁夏稻瘟病菌中最广泛适应的单元型。对稻瘟病菌群体的时空变化分析发现,不同年份、不同地区的稻瘟病菌亚群体间遗传分化不明显(地区间Gst=0.0832,年份间Gst=0.0509),遗传结构相似;不同水稻品种上的亚群体遗传分化明显(Gst=0.2823)。提示寄主的选择作用是宁夏稻瘟病菌群体演化的主要力量。宁夏稻瘟病菌菌株间有较高的相似性,总体相似性大于62%,DNA指纹没有任何清晰的系谱结构,没有任何聚类组被大于60%的bootstrap值支持。提示宁夏稻瘟病菌群体可能是单一的无性系谱占绝对优势。总体而言,宁夏稻瘟病菌群体遗传多样性水平较低(H=0.0963,I=0.1806)。 展开更多
关键词 稻瘟病菌 宁夏 遗传结构 遗传多样性 rep-PCR DNA指纹
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实体造型中的几何模型与数据结构研究 被引量:3
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作者 蒋玉明 薛晓滨 傅涓 《中国机械工程》 CAS CSCD 北大核心 1996年第6期27-30,共4页
对于三维实体造型,以边界表示和CSG树表示法相结合为基础,采用5级拓扑层次和改进的翼边数据结构——“半”边数据结构,并基于欧拉扩展公式,介绍用于布尔集合运算的一系列欧拉算子。
关键词 实体造型 几何模型 CSG树 数据结构 机械设计
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视黄醇结合蛋白的结构与功能 被引量:10
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作者 金宏 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1996年第2期126-129,共4页
视黄醇结合蛋白(RBP)是视黄醇转运的载体蛋白,作为结合小分子流水物质的载体蛋白家族(lipocalin)的一个重要成员,其结构与功能的研究正受到国外学者的重视,文章介绍了视黄醇结合蛋白的性质、结构研究进展,讨论了视... 视黄醇结合蛋白(RBP)是视黄醇转运的载体蛋白,作为结合小分子流水物质的载体蛋白家族(lipocalin)的一个重要成员,其结构与功能的研究正受到国外学者的重视,文章介绍了视黄醇结合蛋白的性质、结构研究进展,讨论了视黄醇结合蛋白与前蛋白和受体相互作用的位点和结构特点. 展开更多
关键词 视黄醇结合蛋白 结构 功能
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中国水稻白叶枯病原菌群体的遗传结构(英文) 被引量:11
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作者 章琦 J.E.Leach +1 位作者 R.J.Nelson T.W.Mew 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第2期150-158,共9页
用Rep-PCR和RFLP两种方法分析了143个水稻白叶枯病Xanthomonas oryzae pv.oryzae菌系。这些菌系采集于长江流域,华南,华北和东北的20个省市的96个点。Rap-PCR是利用一些基于细菌的短的重复单位引物(ERIC,BOX和REP)及来自稻白叶枯病原菌... 用Rep-PCR和RFLP两种方法分析了143个水稻白叶枯病Xanthomonas oryzae pv.oryzae菌系。这些菌系采集于长江流域,华南,华北和东北的20个省市的96个点。Rap-PCR是利用一些基于细菌的短的重复单位引物(ERIC,BOX和REP)及来自稻白叶枯病原菌的可动重复单位(IS1112和IS1113)引物的DNA扩增特性。在RFLP分析中,以无毒基因家族中的一个成员avrXa10为探针。Rep-PCR分析呈显较高的单元型多样性(H=0.75)。在4个水稻生长地区中,Rep-PCR分析的结果是:华南稻区的遗传多样性最高(H=0.96),随后为长江流域(H=0.93),东北(H=0.77),华北(H=0.69)。根据3个分簇生物统计的共有指纹型,143个菌系被构成3簇。在各簇中都有来自不同水稻产区的菌系,表明菌系的分簇不受地理区域的影响。 展开更多
关键词 水稻 白叶枯病 遗传结构
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基于特征的三维建模技术的研究 被引量:2
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作者 杜来红 陈桦 房亚东 《中国制造业信息化(学术版)》 2004年第5期108-110,共3页
首先介绍了特征设计的相关概念,然后论述了特征的定义及分类。着重讨论了特征的描述方法及其模型的数据结构,并对形状特征中局部特征的B-rep方法做了改进,同时对Pro/Engineer系统建立的零件特征进行了分析。
关键词 特征设计 数据结构 局部特征 三维建模 B-rep方法 PRO/E 机械设计
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ASE文件的解析与数据格式转换 被引量:1
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作者 沈润泉 何本阳 《毕节学院学报(综合版)》 2008年第4期92-94,共3页
对ASE文件的信息进行解析,并定义导入ASE文件的数据结构。由于ASE文件相对比较散乱,所以提出一种基于翼边结构的ASE文件存储,从而得到适合用户的数据结构。
关键词 ASE文件 解析 边界表示法 翼边结构 功能区
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3D GIS支持下的盐腔三维表面拓扑重建技术研究 被引量:1
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作者 王文 陈建忠 王永志 《国土资源信息化》 2012年第2期62-67,共6页
在分析了盐岩特性和盐腔作为地下能源储备库等应用可行性和重要性的基础上,详细阐述了利用声纳探测技术进行盐腔测量的原理及测腔数据的组织方式。利用HalfEdge数据结构和边界表示模型,对声纳测腔数据进行了盐腔三维表面拓扑重建技术的... 在分析了盐岩特性和盐腔作为地下能源储备库等应用可行性和重要性的基础上,详细阐述了利用声纳探测技术进行盐腔测量的原理及测腔数据的组织方式。利用HalfEdge数据结构和边界表示模型,对声纳测腔数据进行了盐腔三维表面拓扑重建技术的研究。并对构建的表面模型进行了有效性检查和可能存在的缺陷进行了修复,得到了正确、有效的盐腔三维表面模型,为盐腔的稳定性分析、蠕变特性分析等数值模拟过程,提供了有效的数据基础。该方法具有重要的经济意义和社会意义,可以为盐腔的建造,尤其是安全合理地利用盐腔提供科学依据和技术支持。 展开更多
关键词 3D GIS 盐腔 三维表面拓扑重建 半边数据结构 边界表示模型
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江苏沭阳主城区地下水含水层结构三维可视化建模初探 被引量:2
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作者 杨俊松 汪名鹏 薛玖红 《地下水》 2022年第2期29-31,共3页
通过对沭阳主城区水文地质条件以及水文地质钻孔资料的分析,利用GeoDatabase空间数据库与OpenGL图形库,使用B-Rep模型构造水文地质含水层结构的三维模型,实现了包括旋转、平移、缩放、属性查询等三维模型浏览功能,展示了沭阳主城区三维... 通过对沭阳主城区水文地质条件以及水文地质钻孔资料的分析,利用GeoDatabase空间数据库与OpenGL图形库,使用B-Rep模型构造水文地质含水层结构的三维模型,实现了包括旋转、平移、缩放、属性查询等三维模型浏览功能,展示了沭阳主城区三维水文地质结构整体形态和单个含水层的三维结构以及对含水层的任意切割剖面与三维可视化栅栏图,从而更加直观的反应沭阳主城区地下水的赋存条件与赋存空间的三维可视化效果和可认知程度,为沭阳主城区地下水资源管理和利用提供依据。 展开更多
关键词 含水层结构 三维可视化 B-rep模型 沭阳主城区
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An approach for converting orthographic projection drawings into 3D-CAD models
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作者 Gao Sande Huang Loulin 《Computer Aided Drafting,Design and Manufacturing》 2016年第3期39-43,共5页
Abstract: Hand drawings and two dimensional (2D) CAD drawings have been replaced by three dimensional (3D) CAD models in mechanical design, but some 2D drawings produced before are needed in the new design. Howev... Abstract: Hand drawings and two dimensional (2D) CAD drawings have been replaced by three dimensional (3D) CAD models in mechanical design, but some 2D drawings produced before are needed in the new design. However, the techniques and software packages for automatically converting 2D drawings into 3D-CAD models with high precision have not yet been developed due to the difficulties to verify the validity of the drawings, to decide the hidden lines and eoncavo-convex faces, and to represent free-form surfaces. In addition, it is very time consuming to manually convert a large number of 2D drawings into 3D CAD models. To address these problems, we propose an approach for converting 2D drawings into 3D-CAD models automatically. 展开更多
关键词 2D drawing DXF image recognition 3D-CAD model B-rep data structure
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