为探究麦田前茬作物玉米秸秆和水稻秸秆上中国小麦赤霉病菌的两个优势种Fusarium graminearum sensu stricto(F.graminearum)和F.asiaticum子囊壳形成和发育成熟过程的差异,分别选择3株F.graminearum菌株(SE81,3-ADON型;LcA-2,15-ADON型...为探究麦田前茬作物玉米秸秆和水稻秸秆上中国小麦赤霉病菌的两个优势种Fusarium graminearum sensu stricto(F.graminearum)和F.asiaticum子囊壳形成和发育成熟过程的差异,分别选择3株F.graminearum菌株(SE81,3-ADON型;LcA-2,15-ADON型;HX5-1,NIV型)和2株F.asiaticum菌株(M4A,3-ADON型;M31-2,NIV型),用其孢子悬浮液接种玉米秸秆和水稻秸秆,放置于花泥和地表两种环境条件下,比较接种不同菌株秸秆上子囊壳的形成和发育成熟情况及5个菌株对‘郑麦366’(高感小麦赤霉病品种)的致病力。结果表明:花泥环境下产生子囊壳的速度要快于地表,以玉米秸秆为载体子囊壳产生速度比水稻秸秆快且多数密度大,3个F.graminearum菌株(SE81、LcA-2和HX5-1)在同种秸秆相同环境下比2个F.asiaticum菌株(M4A和M31-2)产生子囊壳的速度快且子囊壳密度大。5个菌株在不同环境的不同秸秆上产生的子囊壳的成熟度均无规律,接种‘郑麦366’后其病情指数间有极显著差异(P<0.01),在花泥和地表的玉米秸秆和水稻秸秆上3次调查的子囊壳密度与‘郑麦366’的病情指数呈显著正相关,不同环境条件下的子囊壳产生速度(AUPGC)与‘郑麦366’的病情指数呈极显著正相关。本研究将为阐明F.graminearum和F.asiaticum在中国小麦赤霉病上表现区域性地理分布的原因提供参考依据。展开更多
Fusarium graminearum sensu stricto和F.asiaticum是中国主要的禾谷镰刀菌复合种(FGSC)成员,为了提高这2个种的鉴定效率,选取48个引起小麦赤霉病和玉米茎腐病的FGSC菌株,比较了系统发育谱系分析、PCR-RFLP(聚合酶链式反应-限制性片段...Fusarium graminearum sensu stricto和F.asiaticum是中国主要的禾谷镰刀菌复合种(FGSC)成员,为了提高这2个种的鉴定效率,选取48个引起小麦赤霉病和玉米茎腐病的FGSC菌株,比较了系统发育谱系分析、PCR-RFLP(聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性)和多重PCR 3种分子鉴定方法。系统发育谱系分析首先扩增菌株的EF-1α和Tri101两个基因的部分序列,测序之后利用MEGA 6.06软件构建系统发育树,结果表明,有11个菌株与F.asiaticum聚在一起,37个菌株与F.graminearum sensu stricto聚为一枝,此法繁琐、复杂、成本高,但鉴定结果准确。PCR-RFLP基于组蛋白H3基因特殊的酶切位点,设计引物H3d StyⅠ/H3R1,通过PCR和酶切反应进行鉴定,电泳检测发现,有11个菌株为F.asiaticum,37个菌株为F.graminearum sensu stricto,该法工作量大且对操作过程要求高。多重PCR基于CYP51A基因设计特异引物Fa F/FaR和Fg F/FgR进行鉴定,电泳检测结果表明,有11个菌株为F.asiaticum,37个菌株为F.graminearum sensu stricto,此法操作简单、效率高。以上3种分子鉴定方法结果一致,但多重PCR方法具有快速、准确、高效的特点。展开更多
A spiral bacterium (SH9), morphologically different from Helicobacter pylori (H. pylori), was found in a 62-year-old woman’s gastric mucosa. Gastroscopic examination revealed multiple gastric ulcers near t...A spiral bacterium (SH9), morphologically different from Helicobacter pylori (H. pylori), was found in a 62-year-old woman’s gastric mucosa. Gastroscopic examination revealed multiple gastric ulcers near the pyloric ring; mapping gastric biopsy showed mild mononuclear infiltration with large lymphoid follicles in the antrum, without corpus atrophy. Urea breath test and H. pylori culture were negative, but Giemsa staining of biopsies revealed tightly coiled bacteria that immunostained with anti-H. pylori antibody. Sequencing of SH9 16S rRNA and the partial urease A and B subunit genes showed that the former sequence had highest similarity (99%; 1302/1315 bp) to Helicobacter heilmannii (H. heilmannii) sensu stricto (H. heilmannii s.s.) BC1 obtained from a bobcat, while the latter sequence confirmed highest similarity (98.3%; 1467/1493 bp) to H. heilmannii s.s. HU2 obtained from a human. The patient was diagnosed with multiple gastric ulcers associated with H. heilmannii s.s. infection. After triple therapy (amoxicillin, clarithromycin, and lansoprazole) with regimen for eradicating H. pylori, gastroscopy showed ulcer improvement and no H. heilmannii s.s. upon biopsy.展开更多
水产动物肌肉中的脂肪酸组成可用于评价其种群遗传。本研究通过测定和比较辽河(LH)、黄河(HH)、长江(YZ)、瓯江(OJ)、闽江(MJ)和南流江(NLJ)水系野生绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto)肌肉中的脂肪酸组成,进一步分析了6群体间的遗传多样...水产动物肌肉中的脂肪酸组成可用于评价其种群遗传。本研究通过测定和比较辽河(LH)、黄河(HH)、长江(YZ)、瓯江(OJ)、闽江(MJ)和南流江(NLJ)水系野生绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto)肌肉中的脂肪酸组成,进一步分析了6群体间的遗传多样性和亲缘关系。结果显示:(1)在6水系群体中检测出26种脂肪酸,其中C20:5n3、C18:1n9、C22:6n3、C16:0、C20:4n6、C18:2n6和C18:0为主要种类,其总和占总脂肪酸的74%以上;(2)逐步判别分析法筛选出8种判别贡献较大的脂肪酸,分别是C17:0、C18:0、C20:0、C22:1n9、C18:3n3、C18:3n6、C20:2n6和C22:5n3,据此分别建立判别方程,综合判别准确率为98.33%;(3)聚类分析显示:OJ与MJ群体的欧氏距离最小, HH与YZ群体的欧氏距离比OJ与MJ群体的要大,NLJ群体与其他5个群体的欧氏距离相对最大;(4)6群体间脂肪酸含量的变异系数在2.99%—30.00%之间,遗传多样性指数变化幅度在3.2732—3.3204之间。综上,基于脂肪酸生物标记法表明6水系绒螯蟹群体遗传多样性指数均较高,脂肪酸可以有效鉴别6水系野生绒螯蟹种群,整体上南流江群体和其余5群体间相距最远;本研究结果可为绒螯蟹种质资源评价和开发利用等提供基础资料。展开更多
目的克隆新疆来源细粒棘球蚴的低密度脂蛋白受体相关蛋白(Low density lipoprotein receptor-related protein of Echinococcus granulosus sensu stricto-Xinjiang,EgLRP-Xinjiang)的基因序列,并分析其生物学信息。方法通过基因克隆技...目的克隆新疆来源细粒棘球蚴的低密度脂蛋白受体相关蛋白(Low density lipoprotein receptor-related protein of Echinococcus granulosus sensu stricto-Xinjiang,EgLRP-Xinjiang)的基因序列,并分析其生物学信息。方法通过基因克隆技术获得EgLRP基因的全长序列,并利用生物信息学方法预测EgLRP蛋白的生理生化特征、信号肽、跨膜区域、蛋白结构、进化树以及蛋白互作关系等生物学信息。结果基因克隆结果显示,EgLRP-Xinjiang与NCBI数据库中的EgLRP基因序列的相似性为99.84%。生物信息学分析结果显示,EgLRP的cDNA全长序列8205 bp,编码2734个氨基酸,存在1个信号肽和1个跨膜区域。EgLRP蛋白具有碳水化合物运输和代谢相关的超家族蛋白YvrE(YvrE super family)的特征结构域。进化树结果显示,EgLRP与多房棘球绦虫、微口膜绦虫的亲缘关系较近;与智人、小鼠等物种的亲缘关系较远。EgLRP蛋白与细粒棘球绦虫中的DVL-3、Intersectin-1和Wnt等蛋白存在相互作用,与mTOR、Wnt、Notch等信号通路密切相关。结论本研究成功克隆出EgLRP基因,其编码蛋白具有糖代谢相关特征结构域,且与代谢相关信号通路之间存在关联,可能参与细粒棘球绦虫的糖代谢等能量代谢过程,为研发新型抗包虫病药物靶点提供了研究基础。展开更多
绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto)是高盐碱耐受性水产动物,然而随着绒螯蟹种质退化等原因,北方地区养殖绒螯蟹面临规格小、抗逆性差和病害频发等问题,开发利用新的土著绒螯蟹种质保证绒螯蟹产业健康发展显得尤为必要。团队于2020和2021...绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto)是高盐碱耐受性水产动物,然而随着绒螯蟹种质退化等原因,北方地区养殖绒螯蟹面临规格小、抗逆性差和病害频发等问题,开发利用新的土著绒螯蟹种质保证绒螯蟹产业健康发展显得尤为必要。团队于2020和2021年9月,在黑龙江省绥芬河水系用地笼捕捉野生绒螯蟹共计299只(雌体156只,雄体143只),统计绒螯蟹性成熟情况并分别计算不同体重绒螯蟹所占百分比,测量性成熟个体的甲壳长、甲壳宽,解剖取出肝胰腺和性腺,精刮肌肉,测定可食率、色泽及常规营养成分。结果显示,绥芬河绒螯蟹雌体未性成熟比例显著低于性成熟比例(P<0.05),而雄体则相反。不论是雌体还是雄体,性成熟个体的平均体重均显著高于未性成熟个体(P<0.05)。雌性成熟个体平均体重为(110.51±2.42)g,雄性则为(147.79±5.94)g。雌性成熟个体(≥100.00 g/只)的百分比为55.94%,雄性成熟个体(≥125.00 g/只)的百分比为60.00%。9月29日,雌体肝胰腺指数(HSI)和性腺指数(GSI)均显著高于雄体,而出肉率(MY)和肥满度(CF)则显著低于雄体(P<0.05)。雌体甲壳亮度值(L*)和黄度值(b*)均显著低于雄体(P<0.05)。雌体性腺和肌肉中粗蛋白含量显著高于雄体,而性腺中水分含量则显著低于雄体(P<0.05)。综上所述,绥芬河绒螯蟹具有性成熟个体平均体重大且大规格个体百分比高等特点,卵巢和肌肉中粗蛋白与粗脂肪百分比较高,是一种重要的高蛋白低脂肪营养物质来源。本研究结果为绥芬河水系野生绒螯蟹种质资源开发以及利用提供了基础资料。展开更多
采取活体解剖和生化分析方法,研究闽江水系野生绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto,简称河蟹)成蟹的性腺指数(GSI)、肝胰腺指数(HSI)、出肉率(MY)、总可食率(TEY)和可食部位的常规生化成分、脂肪酸和氨基酸组成,并比较雌雄间的性别差异。...采取活体解剖和生化分析方法,研究闽江水系野生绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto,简称河蟹)成蟹的性腺指数(GSI)、肝胰腺指数(HSI)、出肉率(MY)、总可食率(TEY)和可食部位的常规生化成分、脂肪酸和氨基酸组成,并比较雌雄间的性别差异。结果显示:(1)雄蟹的平均体质量和MY均显著大于雌蟹,雌蟹的GSI显著高于雄蟹(P<0.05),两者的HSI和TEY均无显著性差异(P>0.05)。(2)雄蟹性腺中的水分含量显著高于雌蟹,雌蟹性腺中脂肪、蛋白质和碳水化合物含量均显著高于雄蟹(P<0.05);雄蟹肝胰腺的水分含量显著高于雌蟹(P<0.05),雌蟹肝胰腺的总脂含量显著高于雄蟹(P<0.05);雌雄蟹肌肉中的水分、脂肪、蛋白质和碳水化合物含量均无显著性差异(P>0.05)。(3)雌蟹和雄蟹肝胰腺中的脂肪酸组成差异较小;雌蟹性腺中的总单不饱和脂肪酸(∑MUFA)含量显著高于雄蟹,雄蟹性腺中的总多不饱和脂肪酸(∑PUFA)、总高度不饱和脂肪酸(∑HUFA)及∑n-6PUFA含量均显著高于雌蟹(P<0.05);雌蟹肌肉中的∑MUFA含量显著高于雄蟹,雄蟹肌肉中的∑PUFA、∑HUFA和∑n-6PUFA含量较高(P<0.05)。(4)雌蟹性腺中大部分氨基酸及总氨基酸(TAA)含量显著高于雄蟹,仅脯氨酸含量以雄蟹较高(P<0.01);雄蟹肌肉中的半胱氨酸含量显著高于雌蟹(P<0.05),其余氨基酸含量均无显著性差异(P>0.05)。雌蟹性腺和肌肉中大部分必需氨基酸评分(EAAS)高于雄蟹,雄蟹性腺苏氨酸、蛋氨酸+半胱氨酸和肌肉色氨酸、蛋氨酸+半胱氨酸的EAAS高于雌蟹。综上,闽江水系河蟹雌雄个体的总可食率无显著性差异,各可食部位的比例存在性别差异;雌雄成蟹均具有较高的氨基酸和脂肪酸营养价值,雄蟹性腺和肌肉中的脂肪酸组成优于雌蟹,雌蟹性腺和肌肉中的氨基酸组成相对较好。展开更多
目的克隆细粒棘球绦虫腺苷酸活化蛋白激酶β(AMP-activated protein kinaseβof Echinococcus granulosus sensu stricto,EgAMPKβ)基因全长序列,并进行生物信息学分析。方法提取细粒棘球绦虫原头蚴总RNA,利用PCR技术克隆EgAMPKβ基因...目的克隆细粒棘球绦虫腺苷酸活化蛋白激酶β(AMP-activated protein kinaseβof Echinococcus granulosus sensu stricto,EgAMPKβ)基因全长序列,并进行生物信息学分析。方法提取细粒棘球绦虫原头蚴总RNA,利用PCR技术克隆EgAMPKβ基因全长序列,并采用生物信息学技术对该基因编码蛋白的理化性质、磷酸化位点、抗原表位、结构域、二级结构、三级结构、多序列分析和亲缘性比较等进行生物信息学分析。结果EgAMPKβ的cDNA全长981 bp,编码326个氨基酸,相对分子质量为35.23585×10^(3),属于亲水性蛋白,无信号肽序列和跨膜区,具有22个丝氨酸磷酸化位点,15个苏氨酸磷酸化位点,含有5个酪氨酸磷酸化位点;4个B细胞抗原表位,具有碳水化合物结合模块(Carbohydrate-binding module,CBM)和αγ亚单位相互作用域(αγ-subunits interaction domain,αγ-SID)。EgAMPKβ基因与多房棘球绦虫和人AMPKβ基因序列相似性分别为98.47%和39.57%,与多房棘球绦虫、微口膜壳绦虫同属于绦虫纲,与人、猩猩和小鼠等哺乳纲动物的进化关系较远。结论成功克隆了EgAMPKβ基因,生物信息学分析其编码蛋白具有保守的功能结构域,对细粒棘球绦虫的能量代谢具有调控作用,为进一步了解细粒棘球绦虫能量代谢机制及其新型抗包虫病药物靶点开发提供了研究基础。展开更多
目的调查和鉴定新疆北疆石河子市、沙湾县、伊宁县和察布查尔县媒介蜱，并确定其携带的莱姆病螺旋体的基因型。方法选择4县市6个牧区为调查点，采集羊源寄生硬蜱，结合形态学与16SrRNA进行蜱种鉴定；采用BSK．H培养基对莱姆病螺旋体分...目的调查和鉴定新疆北疆石河子市、沙湾县、伊宁县和察布查尔县媒介蜱，并确定其携带的莱姆病螺旋体的基因型。方法选择4县市6个牧区为调查点，采集羊源寄生硬蜱，结合形态学与16SrRNA进行蜱种鉴定；采用BSK．H培养基对莱姆病螺旋体分离培养，并用硝酸银染色和巢式PCR法进行病原检测，阳性产物测序结果比对，并与11种GenBank参考序列比对，确定莱姆病螺旋体的基因型。结果6个调查点共采集寄生硬蜱900多只，经形态学与16SrRNA鉴定分别为网兰扇头蜱、刻点血蜱、亚洲璃眼蜱和边缘革蜱；从中分别选取样本硬蜱共102只，分24管，分离培养后结合巢式PCR和硝酸银染色共获得16管阳性培养物。5S～23SrRNA基因间隔区测序比对分析表明，所有菌株为伯氏疏螺旋体与国际报道的B．burgdoferi Sensu Stricto（B31）基因型具有高度同源性，同源性为98．6％～99．5％；OspC基因型分析与上述结果一致。结论4县市分离获得伯氏疏螺旋体，基因型为B．burgdorferi Sensu Stricto，且存在生物多样性。从图兰扇头蜱中分离到伯氏疏螺旋体为我国首次报道。展开更多
Diarrhea poses a significant threat to the health and well-being of weaned piglets,leading to substantial morbidity and mortality and economic loss in the pig industry.However,the structural characteristics of the gut...Diarrhea poses a significant threat to the health and well-being of weaned piglets,leading to substantial morbidity and mortality and economic loss in the pig industry.However,the structural characteristics of the gut microbiota and the key genera associated with early diarrhea in piglets within large-scale production systems are poorly understood.This study aimed to investigate the differences in the microbial community structure and the specific genera alteration between the healthy piglets and diarrhea piglets,and to identify the biomarkers of gut microbiota associated with diarrhea in piglets.A total of 250 fecal samples,including 130 healthy piglets(Duroc×Landrace×Large Yorkshire)in the Control group and 120 from diarrhea piglets in Diarrhea group,were collected from three large-scale farms as discovery cohorts and were used for 16S rRNA gene sequencing.Additionally,150 fecal samples from another largescale pig farm were collected for the validation trail.The Chao1 and ACE indices were obviously lower(P<0.01)in the diarrhea piglets compared to the healthy ones.Principal coordinate analysis showed significant differences in the distance matrix of gut microbiota between the healthy and diarrhea piglets(Bray-Curtis:P=0.001,Jaccard:P=0.001).Eighty-five genera were differentially enriched(P<0.001)between healthy and diarrhea piglets.Notably,Treponema,Sphaerochaeta,Escherichia-Shigella,Slackia,and Staphylococcus were identified as potential biomarkers of diarrhea susceptibility;Clostridium sensu stricto 1,Prevotella_9,Olsenella,Dorea,and Lachnospiraceae NK4A136 group were found to be beneficial for maintaining intestinal homeostasis.These differentially enriched genera of healthy and diarrhea piglets were further confirmed in the validation cohort.In conclusion,this study identified the diarrhea-associated and beneficial genera in the faces of piglet,providing a theoretical basis for the diagnosis and intervention of diarrhea in weaned piglets.展开更多
文摘为探究麦田前茬作物玉米秸秆和水稻秸秆上中国小麦赤霉病菌的两个优势种Fusarium graminearum sensu stricto(F.graminearum)和F.asiaticum子囊壳形成和发育成熟过程的差异,分别选择3株F.graminearum菌株(SE81,3-ADON型;LcA-2,15-ADON型;HX5-1,NIV型)和2株F.asiaticum菌株(M4A,3-ADON型;M31-2,NIV型),用其孢子悬浮液接种玉米秸秆和水稻秸秆,放置于花泥和地表两种环境条件下,比较接种不同菌株秸秆上子囊壳的形成和发育成熟情况及5个菌株对‘郑麦366’(高感小麦赤霉病品种)的致病力。结果表明:花泥环境下产生子囊壳的速度要快于地表,以玉米秸秆为载体子囊壳产生速度比水稻秸秆快且多数密度大,3个F.graminearum菌株(SE81、LcA-2和HX5-1)在同种秸秆相同环境下比2个F.asiaticum菌株(M4A和M31-2)产生子囊壳的速度快且子囊壳密度大。5个菌株在不同环境的不同秸秆上产生的子囊壳的成熟度均无规律,接种‘郑麦366’后其病情指数间有极显著差异(P<0.01),在花泥和地表的玉米秸秆和水稻秸秆上3次调查的子囊壳密度与‘郑麦366’的病情指数呈显著正相关,不同环境条件下的子囊壳产生速度(AUPGC)与‘郑麦366’的病情指数呈极显著正相关。本研究将为阐明F.graminearum和F.asiaticum在中国小麦赤霉病上表现区域性地理分布的原因提供参考依据。
文摘Fusarium graminearum sensu stricto和F.asiaticum是中国主要的禾谷镰刀菌复合种(FGSC)成员,为了提高这2个种的鉴定效率,选取48个引起小麦赤霉病和玉米茎腐病的FGSC菌株,比较了系统发育谱系分析、PCR-RFLP(聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性)和多重PCR 3种分子鉴定方法。系统发育谱系分析首先扩增菌株的EF-1α和Tri101两个基因的部分序列,测序之后利用MEGA 6.06软件构建系统发育树,结果表明,有11个菌株与F.asiaticum聚在一起,37个菌株与F.graminearum sensu stricto聚为一枝,此法繁琐、复杂、成本高,但鉴定结果准确。PCR-RFLP基于组蛋白H3基因特殊的酶切位点,设计引物H3d StyⅠ/H3R1,通过PCR和酶切反应进行鉴定,电泳检测发现,有11个菌株为F.asiaticum,37个菌株为F.graminearum sensu stricto,该法工作量大且对操作过程要求高。多重PCR基于CYP51A基因设计特异引物Fa F/FaR和Fg F/FgR进行鉴定,电泳检测结果表明,有11个菌株为F.asiaticum,37个菌株为F.graminearum sensu stricto,此法操作简单、效率高。以上3种分子鉴定方法结果一致,但多重PCR方法具有快速、准确、高效的特点。
基金Supported by A Grant-in-Aid for Scientific Research C-20590564 from the Ministry of Education,Culture,Sports,Science and Technology,Japan,to Ota H
文摘A spiral bacterium (SH9), morphologically different from Helicobacter pylori (H. pylori), was found in a 62-year-old woman’s gastric mucosa. Gastroscopic examination revealed multiple gastric ulcers near the pyloric ring; mapping gastric biopsy showed mild mononuclear infiltration with large lymphoid follicles in the antrum, without corpus atrophy. Urea breath test and H. pylori culture were negative, but Giemsa staining of biopsies revealed tightly coiled bacteria that immunostained with anti-H. pylori antibody. Sequencing of SH9 16S rRNA and the partial urease A and B subunit genes showed that the former sequence had highest similarity (99%; 1302/1315 bp) to Helicobacter heilmannii (H. heilmannii) sensu stricto (H. heilmannii s.s.) BC1 obtained from a bobcat, while the latter sequence confirmed highest similarity (98.3%; 1467/1493 bp) to H. heilmannii s.s. HU2 obtained from a human. The patient was diagnosed with multiple gastric ulcers associated with H. heilmannii s.s. infection. After triple therapy (amoxicillin, clarithromycin, and lansoprazole) with regimen for eradicating H. pylori, gastroscopy showed ulcer improvement and no H. heilmannii s.s. upon biopsy.
文摘水产动物肌肉中的脂肪酸组成可用于评价其种群遗传。本研究通过测定和比较辽河(LH)、黄河(HH)、长江(YZ)、瓯江(OJ)、闽江(MJ)和南流江(NLJ)水系野生绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto)肌肉中的脂肪酸组成,进一步分析了6群体间的遗传多样性和亲缘关系。结果显示:(1)在6水系群体中检测出26种脂肪酸,其中C20:5n3、C18:1n9、C22:6n3、C16:0、C20:4n6、C18:2n6和C18:0为主要种类,其总和占总脂肪酸的74%以上;(2)逐步判别分析法筛选出8种判别贡献较大的脂肪酸,分别是C17:0、C18:0、C20:0、C22:1n9、C18:3n3、C18:3n6、C20:2n6和C22:5n3,据此分别建立判别方程,综合判别准确率为98.33%;(3)聚类分析显示:OJ与MJ群体的欧氏距离最小, HH与YZ群体的欧氏距离比OJ与MJ群体的要大,NLJ群体与其他5个群体的欧氏距离相对最大;(4)6群体间脂肪酸含量的变异系数在2.99%—30.00%之间,遗传多样性指数变化幅度在3.2732—3.3204之间。综上,基于脂肪酸生物标记法表明6水系绒螯蟹群体遗传多样性指数均较高,脂肪酸可以有效鉴别6水系野生绒螯蟹种群,整体上南流江群体和其余5群体间相距最远;本研究结果可为绒螯蟹种质资源评价和开发利用等提供基础资料。
文摘目的克隆新疆来源细粒棘球蚴的低密度脂蛋白受体相关蛋白(Low density lipoprotein receptor-related protein of Echinococcus granulosus sensu stricto-Xinjiang,EgLRP-Xinjiang)的基因序列,并分析其生物学信息。方法通过基因克隆技术获得EgLRP基因的全长序列,并利用生物信息学方法预测EgLRP蛋白的生理生化特征、信号肽、跨膜区域、蛋白结构、进化树以及蛋白互作关系等生物学信息。结果基因克隆结果显示,EgLRP-Xinjiang与NCBI数据库中的EgLRP基因序列的相似性为99.84%。生物信息学分析结果显示,EgLRP的cDNA全长序列8205 bp,编码2734个氨基酸,存在1个信号肽和1个跨膜区域。EgLRP蛋白具有碳水化合物运输和代谢相关的超家族蛋白YvrE(YvrE super family)的特征结构域。进化树结果显示,EgLRP与多房棘球绦虫、微口膜绦虫的亲缘关系较近;与智人、小鼠等物种的亲缘关系较远。EgLRP蛋白与细粒棘球绦虫中的DVL-3、Intersectin-1和Wnt等蛋白存在相互作用,与mTOR、Wnt、Notch等信号通路密切相关。结论本研究成功克隆出EgLRP基因,其编码蛋白具有糖代谢相关特征结构域,且与代谢相关信号通路之间存在关联,可能参与细粒棘球绦虫的糖代谢等能量代谢过程,为研发新型抗包虫病药物靶点提供了研究基础。
文摘绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto)是高盐碱耐受性水产动物,然而随着绒螯蟹种质退化等原因,北方地区养殖绒螯蟹面临规格小、抗逆性差和病害频发等问题,开发利用新的土著绒螯蟹种质保证绒螯蟹产业健康发展显得尤为必要。团队于2020和2021年9月,在黑龙江省绥芬河水系用地笼捕捉野生绒螯蟹共计299只(雌体156只,雄体143只),统计绒螯蟹性成熟情况并分别计算不同体重绒螯蟹所占百分比,测量性成熟个体的甲壳长、甲壳宽,解剖取出肝胰腺和性腺,精刮肌肉,测定可食率、色泽及常规营养成分。结果显示,绥芬河绒螯蟹雌体未性成熟比例显著低于性成熟比例(P<0.05),而雄体则相反。不论是雌体还是雄体,性成熟个体的平均体重均显著高于未性成熟个体(P<0.05)。雌性成熟个体平均体重为(110.51±2.42)g,雄性则为(147.79±5.94)g。雌性成熟个体(≥100.00 g/只)的百分比为55.94%,雄性成熟个体(≥125.00 g/只)的百分比为60.00%。9月29日,雌体肝胰腺指数(HSI)和性腺指数(GSI)均显著高于雄体,而出肉率(MY)和肥满度(CF)则显著低于雄体(P<0.05)。雌体甲壳亮度值(L*)和黄度值(b*)均显著低于雄体(P<0.05)。雌体性腺和肌肉中粗蛋白含量显著高于雄体,而性腺中水分含量则显著低于雄体(P<0.05)。综上所述,绥芬河绒螯蟹具有性成熟个体平均体重大且大规格个体百分比高等特点,卵巢和肌肉中粗蛋白与粗脂肪百分比较高,是一种重要的高蛋白低脂肪营养物质来源。本研究结果为绥芬河水系野生绒螯蟹种质资源开发以及利用提供了基础资料。
文摘采取活体解剖和生化分析方法,研究闽江水系野生绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto,简称河蟹)成蟹的性腺指数(GSI)、肝胰腺指数(HSI)、出肉率(MY)、总可食率(TEY)和可食部位的常规生化成分、脂肪酸和氨基酸组成,并比较雌雄间的性别差异。结果显示:(1)雄蟹的平均体质量和MY均显著大于雌蟹,雌蟹的GSI显著高于雄蟹(P<0.05),两者的HSI和TEY均无显著性差异(P>0.05)。(2)雄蟹性腺中的水分含量显著高于雌蟹,雌蟹性腺中脂肪、蛋白质和碳水化合物含量均显著高于雄蟹(P<0.05);雄蟹肝胰腺的水分含量显著高于雌蟹(P<0.05),雌蟹肝胰腺的总脂含量显著高于雄蟹(P<0.05);雌雄蟹肌肉中的水分、脂肪、蛋白质和碳水化合物含量均无显著性差异(P>0.05)。(3)雌蟹和雄蟹肝胰腺中的脂肪酸组成差异较小;雌蟹性腺中的总单不饱和脂肪酸(∑MUFA)含量显著高于雄蟹,雄蟹性腺中的总多不饱和脂肪酸(∑PUFA)、总高度不饱和脂肪酸(∑HUFA)及∑n-6PUFA含量均显著高于雌蟹(P<0.05);雌蟹肌肉中的∑MUFA含量显著高于雄蟹,雄蟹肌肉中的∑PUFA、∑HUFA和∑n-6PUFA含量较高(P<0.05)。(4)雌蟹性腺中大部分氨基酸及总氨基酸(TAA)含量显著高于雄蟹,仅脯氨酸含量以雄蟹较高(P<0.01);雄蟹肌肉中的半胱氨酸含量显著高于雌蟹(P<0.05),其余氨基酸含量均无显著性差异(P>0.05)。雌蟹性腺和肌肉中大部分必需氨基酸评分(EAAS)高于雄蟹,雄蟹性腺苏氨酸、蛋氨酸+半胱氨酸和肌肉色氨酸、蛋氨酸+半胱氨酸的EAAS高于雌蟹。综上,闽江水系河蟹雌雄个体的总可食率无显著性差异,各可食部位的比例存在性别差异;雌雄成蟹均具有较高的氨基酸和脂肪酸营养价值,雄蟹性腺和肌肉中的脂肪酸组成优于雌蟹,雌蟹性腺和肌肉中的氨基酸组成相对较好。
文摘目的调查和鉴定新疆北疆石河子市、沙湾县、伊宁县和察布查尔县媒介蜱，并确定其携带的莱姆病螺旋体的基因型。方法选择4县市6个牧区为调查点，采集羊源寄生硬蜱，结合形态学与16SrRNA进行蜱种鉴定；采用BSK．H培养基对莱姆病螺旋体分离培养，并用硝酸银染色和巢式PCR法进行病原检测，阳性产物测序结果比对，并与11种GenBank参考序列比对，确定莱姆病螺旋体的基因型。结果6个调查点共采集寄生硬蜱900多只，经形态学与16SrRNA鉴定分别为网兰扇头蜱、刻点血蜱、亚洲璃眼蜱和边缘革蜱；从中分别选取样本硬蜱共102只，分24管，分离培养后结合巢式PCR和硝酸银染色共获得16管阳性培养物。5S～23SrRNA基因间隔区测序比对分析表明，所有菌株为伯氏疏螺旋体与国际报道的B．burgdoferi Sensu Stricto（B31）基因型具有高度同源性，同源性为98．6％～99．5％；OspC基因型分析与上述结果一致。结论4县市分离获得伯氏疏螺旋体，基因型为B．burgdorferi Sensu Stricto，且存在生物多样性。从图兰扇头蜱中分离到伯氏疏螺旋体为我国首次报道。
基金supported by the National Natural Science Foundation of China(32372907)the Basic Public Welfare Research Program of Zhejiang Province(LGN21C170004).
文摘Diarrhea poses a significant threat to the health and well-being of weaned piglets,leading to substantial morbidity and mortality and economic loss in the pig industry.However,the structural characteristics of the gut microbiota and the key genera associated with early diarrhea in piglets within large-scale production systems are poorly understood.This study aimed to investigate the differences in the microbial community structure and the specific genera alteration between the healthy piglets and diarrhea piglets,and to identify the biomarkers of gut microbiota associated with diarrhea in piglets.A total of 250 fecal samples,including 130 healthy piglets(Duroc×Landrace×Large Yorkshire)in the Control group and 120 from diarrhea piglets in Diarrhea group,were collected from three large-scale farms as discovery cohorts and were used for 16S rRNA gene sequencing.Additionally,150 fecal samples from another largescale pig farm were collected for the validation trail.The Chao1 and ACE indices were obviously lower(P<0.01)in the diarrhea piglets compared to the healthy ones.Principal coordinate analysis showed significant differences in the distance matrix of gut microbiota between the healthy and diarrhea piglets(Bray-Curtis:P=0.001,Jaccard:P=0.001).Eighty-five genera were differentially enriched(P<0.001)between healthy and diarrhea piglets.Notably,Treponema,Sphaerochaeta,Escherichia-Shigella,Slackia,and Staphylococcus were identified as potential biomarkers of diarrhea susceptibility;Clostridium sensu stricto 1,Prevotella_9,Olsenella,Dorea,and Lachnospiraceae NK4A136 group were found to be beneficial for maintaining intestinal homeostasis.These differentially enriched genera of healthy and diarrhea piglets were further confirmed in the validation cohort.In conclusion,this study identified the diarrhea-associated and beneficial genera in the faces of piglet,providing a theoretical basis for the diagnosis and intervention of diarrhea in weaned piglets.
