期刊文献+
共找到16篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
三磷酸腺苷结合盒转运体A1蛋白第二跨膜结构域缺失突变体的构建及其抗砷性研究 被引量:3
1
作者 罗燕 程建兵 +2 位作者 谭晓华 尹小菲 杨磊 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第23期1877-1882,共6页
目的检测三磷酸腺苷结合盒转运体A1(ABCA1)蛋白第2跨膜结构域(the second transmembrane domain,TMD2)中关键的抗砷结构域。方法采用重叠区扩增基因拼接法构建三磷酸腺苷结合盒转运体A1基因TMD2的一系列缺失突变体,分别转染至HeLa细胞,... 目的检测三磷酸腺苷结合盒转运体A1(ABCA1)蛋白第2跨膜结构域(the second transmembrane domain,TMD2)中关键的抗砷结构域。方法采用重叠区扩增基因拼接法构建三磷酸腺苷结合盒转运体A1基因TMD2的一系列缺失突变体,分别转染至HeLa细胞,激光共聚焦观察其定位,Cell Counting Kit-8检测48 h急性砷中毒后生存率的变化,原子荧光吸收光谱法检测细胞内的总砷含量。结果激光共聚焦证实各突变体的编码蛋白均定位在HeLa细胞的细胞膜上。CCK-8结果显示,转染胞外第4、5环,胞内第4、5环缺失突变体的HeLa细胞IC50分别为33.18、32.84、33.45、34.29μmol.L-1,与转染野生型三磷酸腺苷结合盒转运体A1质粒的HeLa细胞(IC50为33.96μmol.L-1)无显著差异,均高于空载体转染对照组(IC50为19.01μmol.L-1)。转染胞外第6环缺失突变体HeLa细胞的IC50为19.95μmol.L-1,与空载体对照组无显著差异,显著低于野生型三磷酸腺苷结合盒转运体A1质粒转染组。原子荧光分光光度法结果显示,转染胞外第6环缺失三磷酸腺苷结合盒转运体A1的HeLa细胞内砷含量与转染空载体接近,而转染其他突变体的结果与转染野生型三磷酸腺苷结合盒转运体A1的结果基本一致。结论成功构建了5个三磷酸腺苷结合盒转运体A1蛋白第2跨膜结构域的缺失突变体,且其表达的蛋白仍然正确定位于HeLa细胞的细胞膜上。突变体(除胞外第6环外)仍然具有一定的抗砷性,提示三磷酸腺苷结合盒转运体A1胞外第6环可能是关键抗砷结构域。 展开更多
关键词 三磷酸腺苷结合盒转运体A1 突变体 重叠区扩增基因拼接法 抗砷性 第2跨膜结构域
原文传递
肺癌细胞株中发现一种细胞周期素A2的异常剪接体 被引量:1
2
作者 王文兵 曾黎平 +1 位作者 朱伟 许文荣 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期196-197,共2页
目的检测细胞周期素(cyclinA1和cyclinA2)在4种肿瘤细胞中的表达,探讨其与肿瘤发生的关系。方法采用RT PCR和DNA测序技术观察cyclinA1和cyclinA2的基因表达并进行序列分析。结果cyclinA1在4种肿瘤细胞中均未检测到表达,而cyclinA2在4种... 目的检测细胞周期素(cyclinA1和cyclinA2)在4种肿瘤细胞中的表达,探讨其与肿瘤发生的关系。方法采用RT PCR和DNA测序技术观察cyclinA1和cyclinA2的基因表达并进行序列分析。结果cyclinA1在4种肿瘤细胞中均未检测到表达,而cyclinA2在4种肿瘤细胞中均有表达;在肺癌细胞株(LTEP a2)细胞中,发现一种cyclinA2异常的剪接体,其保留了第四内含子,而缺失了第五外显子,其序列编码蛋白质也发生了突变,只保留了5′端194氨基酸。结论细胞周期素表达与肿瘤发生有一定相关性,LTEP a2细胞中存在细胞周期素A2异常表达,其机制与作用有待进一步的研究。 展开更多
关键词 细胞周期素A1 细胞周期素A2 细胞周期 突变体 肺癌 异常剪接体
暂未订购
利用重叠PCR技术对OsAMT1.2进行定点突变 被引量:2
3
作者 李宝珍 李素梅 +1 位作者 施卫明 苏彦华 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期69-72,共4页
铵是植物吸收利用的主要氮源之一,而铵转运蛋白对铵的吸收、转运和代谢方面有重要的作用。为了深入研究水稻铵转运蛋白的结构功能特性,利用重叠PCR技术对OsAMT1.2蛋白质序列中保守的253 aa和257 aa的苯丙氨酸(F)和丝氨酸(S)分别突变为... 铵是植物吸收利用的主要氮源之一,而铵转运蛋白对铵的吸收、转运和代谢方面有重要的作用。为了深入研究水稻铵转运蛋白的结构功能特性,利用重叠PCR技术对OsAMT1.2蛋白质序列中保守的253 aa和257 aa的苯丙氨酸(F)和丝氨酸(S)分别突变为丙氨酸,成功获得了相应的2个点突变基因。因此,重叠PCR技术是一种简单有效的进行体外基因重组和突变的方法,对于研究高等植物功能基因的结构功能特性具有重要的意义。 展开更多
关键词 水稻 铵转运蛋白 OsAMT1.2 点突变 重叠PCR
在线阅读 下载PDF
利用改良SOE-PCR技术定点突变TuMVC4-VPg基因 被引量:3
4
作者 李国亮 钱伟 +7 位作者 张淑江 李菲 章时蕃 张慧 谢露露 武剑 王晓武 孙日飞 《中国蔬菜》 北大核心 2017年第10期39-44,共6页
芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,Tu MV)是白菜类蔬菜生产上的重要病害,其中Tu MV VPg基因在Tu MV侵染白菜类蔬菜的过程中起着至关重要的作用,且不同Tu MV株系的致病性不同。本试验采用改良的重叠延伸PCR(SOE-PCR)技术,以Tu MV C4-VP... 芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,Tu MV)是白菜类蔬菜生产上的重要病害,其中Tu MV VPg基因在Tu MV侵染白菜类蔬菜的过程中起着至关重要的作用,且不同Tu MV株系的致病性不同。本试验采用改良的重叠延伸PCR(SOE-PCR)技术,以Tu MV C4-VPg基因序列为模板,定点突变Tu MV C4-VPg与Tu MV CDN1-VPg基因间5个差异核苷酸位点(决定5个氨基酸差异)。结果表明:通过SOE-PCR技术获得了5个Tu MV C4-VPg基因的单点突变体,即Tu MV C4-VPg-Ⅰ、Tu MV C4-VPg-Ⅱ、Tu MV C4-VPg-Ⅲ、Tu MV C4-VPg-Ⅳ和Tu MV C4-VPg-Ⅴ。 展开更多
关键词 白菜类蔬菜 芜菁花叶病毒 VPg基因 重叠延伸PCR技术 单点突变
在线阅读 下载PDF
利用改进的MutMap方法克隆水稻雄性不育基因 被引量:16
5
作者 陈竹锋 严维 +6 位作者 王娜 张文辉 谢刚 卢嘉威 简智华 刘东风 唐晓艳 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期85-93,共9页
通过对籼稻黄华占EMS(甲磺酸乙酯)诱变,筛选得到一隐性核不育的水稻雄性不育突变体osms55,遗传分析表明该突变体为单基因控制的隐性核不育,采用高通量的Illumina Infinium iSelect SNP(50 K)芯片检测技术鉴定该突变体的遗传背景,确认该... 通过对籼稻黄华占EMS(甲磺酸乙酯)诱变,筛选得到一隐性核不育的水稻雄性不育突变体osms55,遗传分析表明该突变体为单基因控制的隐性核不育,采用高通量的Illumina Infinium iSelect SNP(50 K)芯片检测技术鉴定该突变体的遗传背景,确认该突变体的遗传背景与黄华占一致。文章利用改进的MutMap方法成功克隆该雄性不育基因,突变位点与突变表型的共分离分析表明LOC_Os02g40450(MER3)是控制osms55突变体雄性不育的基因,该基因的剪切识别位点发生变异后导致剪切异常,造成第5外显子缺失15个碱基,从而产生雄性不育。改进的MutMap方法无需精确组装的野生型基因组序列作对照,而是通过将定位群体中有突变表型植株的DNA pool和野生型植株DNA的重测序结果分别与日本晴参考基因组进行比对,然后再比较突变体和野生型的差异SNP来确定候选基因,该方法大大降低了野生型基因组测序和组装成本,进一步扩大了MutMap方法的应用范围。 展开更多
关键词 水稻(Oryza SATIVA L ) 突变体 雄性不育 MutMap 剪切识别位点
在线阅读 下载PDF
ABCA1胞外第四环缺失突变体的构建及其抗砷性初步研究 被引量:2
6
作者 程建兵 谭晓华 +1 位作者 罗燕 杨磊 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期27-32,共6页
目的:构建ABCA1细胞外第四环第1479~1597位氨基酸残基缺失的突变体。方法:采用重叠区扩增基因拼接法构建ABCA1第1479~1597位氨基酸残基缺失的突变体基因,并将其克隆至pcDNA3.1/V5-His/ABCA1重组载体上,脂质体法转染Hela细胞,激光共聚... 目的:构建ABCA1细胞外第四环第1479~1597位氨基酸残基缺失的突变体。方法:采用重叠区扩增基因拼接法构建ABCA1第1479~1597位氨基酸残基缺失的突变体基因,并将其克隆至pcDNA3.1/V5-His/ABCA1重组载体上,脂质体法转染Hela细胞,激光共聚焦观察突变体定位,Cell Counting Kit-8(CCK-8)试剂盒检测其48h急性砷中毒后生存率的变化。结果:该突变体基因经DNA序列分析表明其具有正确的序列和阅读框。激光共聚焦证实其表达的蛋白仍然能正确定位在Hela细胞的细胞膜上。CCK-8结果显示转染重组质粒和突变体质粒的细胞在各种砷浓度下生存率都较空载体组高。结论:成功构建了ABCA1胞外第四环第1479~1597位氨基酸残基缺失的突变体,且其表达的蛋白仍然定位于细胞膜上,突变体仍然具有一定的抗砷性,提示ABCA1胞外第四环可能不是关键抗砷结构域。 展开更多
关键词 ABCA1 突变体 重叠区扩增基因拼接法
原文传递
RSK4剪接变异体2对人乳腺癌细胞MDA-MB-231增殖和侵袭的影响(英文) 被引量:2
7
作者 梅燕 朱玲钰 +2 位作者 杨泓熇 钟国斌 杨华伟 《广西医科大学学报》 CAS 2019年第11期1705-1712,共8页
目的:探讨人核糖体S6蛋白激酶4变异体2(RSK4m2)对乳腺癌细胞MDA-MB-231增殖、迁移和侵袭的影响。方法:将RSK4m2慢病毒载体导入MDA-MB-231细胞中建立稳定过表达LV-RSK4m2细胞系,作为实验组(RSK4m2组);转染阴性病毒载体的MDA-MB-231细胞... 目的:探讨人核糖体S6蛋白激酶4变异体2(RSK4m2)对乳腺癌细胞MDA-MB-231增殖、迁移和侵袭的影响。方法:将RSK4m2慢病毒载体导入MDA-MB-231细胞中建立稳定过表达LV-RSK4m2细胞系,作为实验组(RSK4m2组);转染阴性病毒载体的MDA-MB-231细胞系为阴性对照组;未转染的MDA-MB-231细胞系为空白对照组。分别采用qPCR法和western blotting法检测各组细胞RSK4m2基因和蛋白的表达水平,CCK 8实验和克隆形成实验检测细胞的生长、增殖情况,细胞划痕实验检测细胞迁移能力,Transwell实验检测细胞的侵袭能力。结果:RSK4m2组RSK4m2 mRNA和蛋白表达水平显著高于阴性对照组和空白对照组(P<0.01),空白对照组和阴性对照组无明显差异(P>0.05)。RSK4m2组细胞生长、增殖、迁移和侵袭能力均明显低于阴性对照组和空白对照组(P<0.05),而阴性对照组和空白对照组无明显差异(P>0.05)。结论:RSK4m2在体外参与人乳腺癌MDA-MB-231细胞的生物行为调控,能抑制细胞的增殖、迁移和侵袭能力。 展开更多
关键词 剪接变异体 乳腺癌 RSK4m2 细胞增殖 迁移 侵袭
暂未订购
SPF大白猪和长白猪CIITA基因剪接突变体的鉴定分析及在不同组织中的表达模式
8
作者 马丽娜 刘英华 +2 位作者 王有祺 高彩霞 陈洪岩 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期2124-2137,共14页
为了鉴定分析SPF大白猪和长白猪CIITA剪接突变体,研究其在猪不同组织中的表达模式。本研究以5周龄的8头SPF大白猪和7头SPF长白猪为研究对象,设计特异性引物对CIITA基因进行扩增、克隆和测序,对获得的序列分析其剪接突变体特征,利用在线... 为了鉴定分析SPF大白猪和长白猪CIITA剪接突变体,研究其在猪不同组织中的表达模式。本研究以5周龄的8头SPF大白猪和7头SPF长白猪为研究对象,设计特异性引物对CIITA基因进行扩增、克隆和测序,对获得的序列分析其剪接突变体特征,利用在线软件对不同剪接突变体进行生物信息学分析,同时利用荧光定量PCR方法检测CIITA基因剪接突变体在2头SPF长白猪8种组织中的表达模式。结果显示,在SPF大白猪和长白猪CIITA基因CDS区存在3种不同的剪接突变体(CIITA-A、CIITA-B和CIITA-C),其CDS长分别为939、984和1698 bp。CIITA-A和CIITA-B突变体由于Exon 11部分核苷酸缺失(40和199 bp)使终止密码子提前,从而致使编码CIITA蛋白的结构域受到了剪接的影响,缺失了末端富含亮氨酸的4个重复结构域,蛋白结构发生了明显的改变。进化树结果表明,针对CIITA,猪与绵羊和牛具有较近的亲缘关系,在不同猪品种中具有较高的保守性。同时,CIITA不同剪接突变体在猪8种组织中均有表达,且表达量趋于一致,均在脾或肺中表达量较高,其次是肾、脊髓、甲状腺、肝、胸腺,在心脏中表达最低。本研究从SPF大白猪和长白猪上共获得了3个CIITA剪接突变体,其中两个蛋白结构缺失了4个富含亮氨酸的重复结构域,且不同剪接突变体在猪不同组织中均有表达,表达量稍有差异,为后续CIITA基因在机体内的免疫调控功能研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 SPF猪 CIITA基因 剪接突变体 表达
在线阅读 下载PDF
剪接因子SF2/ASF在胰腺癌中的表达及其临床意义
9
作者 孟琳 杨华宇 马秀梅 《癌变·畸变·突变》 CAS 2023年第3期209-214,共6页
目的:探讨胰腺癌组织中剪接因子2/选择性剪接因子(SF2/ASF)的表达,及其与抑癌基因P53(突变型)、增殖标志物Ki67和患者临床病理指标之间的相关性。方法:采用GEPIA数据库分析350例胰腺癌组织和癌旁正常组织中SRSF1基因(SF2/ASF的编码基因... 目的:探讨胰腺癌组织中剪接因子2/选择性剪接因子(SF2/ASF)的表达,及其与抑癌基因P53(突变型)、增殖标志物Ki67和患者临床病理指标之间的相关性。方法:采用GEPIA数据库分析350例胰腺癌组织和癌旁正常组织中SRSF1基因(SF2/ASF的编码基因)的表达差异,以及SRSF1与TP53和MKi67(Ki67的编码基因)的相关性;采用免疫组织化学法检测60例胰腺癌组织及对应的癌旁正常组织中SF2/ASF、突变型P53和Ki67蛋白的表达,采用Pearson相关性分析研究SF2/ASF与突变型P53和Ki67的相关性,以及SF2/AFS蛋白表达水平与胰腺癌患者临床病理学指标的关系;采用Cox比例风险回归模型进行预后分析。结果:GEPIA数据库分析结果表明,与癌旁正常组织相比,SRSF1基因在胰腺癌组织中的表达水平显著升高(P<0.01),SRSF1与TP53和MKi67的表达水平均相关(r分别为0.28和0.32,均为P<0.01);免疫组化检测结果显示,与癌旁正常组织相比,SF2/ASF蛋白、突变型P53和Ki67蛋白在胰腺癌组织中的表达水平显著升高(P<0.01)。Pearson相关性分析结果表明胰腺癌组织中,SF2/ASF蛋白表达水平与突变型P53蛋白及Ki67增殖指数有关(r分别为-0.386和0.275,均为P<0.05)。卡方检验结果表明SF2/ASF在胰腺癌中的表达水平与胰腺癌分化程度、淋巴结转移情况以及有无远端脏器转移有关(均为P<0.01),与胰腺癌发生部位和TNM分期无明显相关(P>0.05)。Cox风险回归分析表明,SF2/ASF高表达和患者年龄是影响患者总生存期的独立危险因素(均为P<0.01)。结论:SF2/ASF、突变型P53和Ki67蛋白在胰腺癌中高表达,且SF2/ASF的表达与突变型P53和Ki67具有相关性,提示SF2/ASF有望成为胰腺癌诊治的新靶点。 展开更多
关键词 胰腺癌 剪接因子2/选择性剪接因子 突变型P53 KI67 免疫组织化学
暂未订购
烟草PR3b转录后剪切元件NRSE1与GUS融合表达后的可变剪切
10
作者 赵雪 王锋 +7 位作者 王文静 刘晓峰 卞士权 刘艳华 刘新民 杜咏梅 张忠锋 张洪博 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1524-1531,共8页
【目的】烟草(Nicotiana tabacum L.)碱性几丁质酶基因PR3b在低烟碱突变体(nic1和nic2)中存在转录后mRNA可变剪切现象,但其可变剪切的发生机制仍不清楚。将PR3b的可变剪切元件NRSE1(nicotinesynthesis related splicing element 1)与GU... 【目的】烟草(Nicotiana tabacum L.)碱性几丁质酶基因PR3b在低烟碱突变体(nic1和nic2)中存在转录后mRNA可变剪切现象,但其可变剪切的发生机制仍不清楚。将PR3b的可变剪切元件NRSE1(nicotinesynthesis related splicing element 1)与GUS融合表达,分析NRSE1元件的独立可变剪切特性,以揭示其作用机制。【方法】利用PCR扩增方法获得PR3b cDNA序列中的NRSE1元件片段,并利用基因重组技术构建了烟草PR3b可变剪切元件NRSE1与GUS的融合表达载体。将融合表达载体导入农杆菌LBA4404后,通过农杆菌介导的叶盘转化法培育了表达NRSE1与GUS融合子的低烟碱突变体nic1和nic2及野生型烟草转基因植株;通过RT-PCR检测及GUS染色鉴定出阳性植株后,利用RT-PCR分析NRSE1与GUS融合表达后在低烟碱突变体和野生型烟草中的可变剪切特性;对转基因植株的幼苗进行乙烯(ET)和茉莉酸(JA)处理,通过GUS染色方法分析ET和JA处理对转基因植株中GUS活性的影响,并通过RT-PCR方法分析ET和JA处理对转基因植株中NRSE1与GUS融合子的可变剪切特性影响,以及对转基因植株中NRSE1与GUS融合子表达水平的影响。【结果】通过RT-PCR检测及GUS染色鉴定出表达NRSE1元件与GUS融合子的低烟碱突变体和野生型烟草转基因植株;RT-PCR检测及测序分析证明,NRSE1元件与GUS融合表达后仍能在低烟碱突变体发生高水平的可变剪切,剪切修饰区段的序列变化与烟草中PR3b的mRNA可变剪切修饰一致;利用ET和JA处理转基因植株进行的GUS染色表明,ET和JA处理对转基因植株的GUS活性有不同程度的影响;但利用ET和JA处理转基因植株进行的RT-PCR分析表明,ET和JA处理不改变NRSE1元件原有的诱导剪切特性,也不影响转基因植株中NRSE1元件与GUS融合子的表达水平。【结论】PR3b的可变剪切元件NRSE1与GUS在烟草中融合表达后,仍能在低烟碱突变体nic1和nic2中发生高水平的可变剪切;NRSE1在烟草中的可变剪切不依赖PR3b的其他mRNA区段,是烟草PR3b发生可变剪切的独立元件;ET和JA处理对NRSE1元件与GUS融合表达植株的GUS活性具有一定影响,可能存在翻译水平的调控作用。 展开更多
关键词 烟草 PR3b 低烟碱突变体 可变剪切 茉莉酸 乙烯
在线阅读 下载PDF
水稻白化转绿突变体wrg20的鉴定与基因克隆
11
作者 何梦星 李志雯 +5 位作者 易琴琴 沈兰 张光恒 任德勇 钱前 张强 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1213-1223,共11页
为探讨水稻叶绿体发育的分子机制,通过对粳稻日本晴进行甲基磺酸乙酯(EMS)诱变,获得一个稳定遗传的叶色白化突变体wrg20(white turn green 20),并对其进行表型鉴定、基因定位和功能分析。与野生型(WT)相比,该突变体于30℃培养时在三叶... 为探讨水稻叶绿体发育的分子机制,通过对粳稻日本晴进行甲基磺酸乙酯(EMS)诱变,获得一个稳定遗传的叶色白化突变体wrg20(white turn green 20),并对其进行表型鉴定、基因定位和功能分析。与野生型(WT)相比,该突变体于30℃培养时在三叶期之前完全白化,26℃时突变体白化叶片部分返绿。遗传分析结果表明,该突变性状受单隐性核基因控制。将该突变体与籼稻93-11杂交,构建F2分离群体并进行基因定位,将该基因定位于2号染色体198 kb区间内,通过测序发现LOC_Os02g33610存在由G至A单碱基替换,导致编码的天冬氨酸转化为天冬酰胺,表明该基因可能为OsWRG20的候选基因,与先前所报道的调控叶绿体发育的基因GRY79为等位基因。对该基因进行结构和功能分析,表明OsWRG20可能是调控水稻苗期幼叶生长发育的重要基因。与野生型相比,突变体的叶绿体基因内含子剪接效率降低,由此推断OsWRG20可能通过调控叶绿体RNA的剪接,参与调控水稻苗期叶绿体的发育。本研究结果为苗期水稻叶绿体发育研究提供了新的理论基础。 展开更多
关键词 水稻 白化突变体 OsWRG20 图位克隆 RNA剪接
在线阅读 下载PDF
Hepatitis B virus pre-S/S variants in liver diseases 被引量:17
12
作者 Bing-Fang Chen 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2018年第14期1507-1520,共14页
Chronic hepatitis B is a global health problem. The clinical outcomes of chronic hepatitis B infection include asymptomatic carrier state, chronic hepatitis(CH), liver cirrhosis(LC), and hepatocellular carcinoma(HCC).... Chronic hepatitis B is a global health problem. The clinical outcomes of chronic hepatitis B infection include asymptomatic carrier state, chronic hepatitis(CH), liver cirrhosis(LC), and hepatocellular carcinoma(HCC). Because of the spontaneous error rate inherent to viral reverse transcriptase, the hepatitis B virus(HBV) genome evolves during the course of infection under the antiviral pressure of host immunity. The clinical significance of pre-S/S variants has become increasingly recognized in patients with chronic HBV infection. Pre-S/S variants are often identified in hepatitis B carriers with CH, LC, and HCC, which suggests that these naturally occurring pre-S/S variants may contribute to the development of progressive liver damage and hepatocarcinogenesis. This paper reviews the function of the pre-S/S region along with recent findings related to the role of pre-S/S variants in liver diseases. According to the mutation type, five pre-S/S variants have been identified: pre-S deletion, pre-S point mutation, pre-S1 splice variant, C-terminus S point mutation, and pre-S/S nonsense mutation. Their associations with HBV genotype and the possible pathogenesis of pre-S/S variants are discussed. Different pre-S/S variants cause liver diseases through different mechanisms. Most cause the intracellular retention of HBV envelope proteins and induction of endoplasmic reticulum stress, which results in liver diseases. Pre-S/S variants should be routinely determined in HBV carriers to help identify individuals who may be at a high risk of less favorable liver disease progression. Additional investigations are required to explore the molecular mechanisms of the pre-S/S variants involved in the pathogenesis of each stage of liver disease. 展开更多
关键词 HEPATITIS B virus pre-S/S mutant pre-S DELETION splice variant spPS1 chronic HEPATITIS liver CIRRHOSIS hepatocellular carcinoma
暂未订购
采用RNA-seq比较甘蓝型油菜矮化突变体与其高秆亲本的可变剪切
13
作者 解艳芳 牛显飞 +2 位作者 蒋学飞 刘双双 王茂林 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期81-88,共8页
为了研究甘蓝型油菜的矮化机制以及植物激素与矮化的关系,用Illumina Hiseq 4000平台对苗期甘蓝型油菜矮化突变体NDF-1及其高秆亲本3529的根进行RNA-seq测序.测序数据以甘蓝型油菜基因组作为参考基因组进行比对,用TopHat软件鉴定可变剪... 为了研究甘蓝型油菜的矮化机制以及植物激素与矮化的关系,用Illumina Hiseq 4000平台对苗期甘蓝型油菜矮化突变体NDF-1及其高秆亲本3529的根进行RNA-seq测序.测序数据以甘蓝型油菜基因组作为参考基因组进行比对,用TopHat软件鉴定可变剪切,其中以3S和5S类型的可变剪切为主.对鉴定出的可变剪切基因做差异基因(DEGs)表达分析,共有913个DEGs,其中矮化突变体NDF-1相对于野生型3529上调的基因数有457个,显著下调的基因有456个.GO富集表明,发生可变剪切的差异基因主要功能是参与代谢过程和生物合成、细胞组分以及酶活性等过程.通过对代谢通路的富集,选取植物激素信号转导通路进行分析.该通路中的Bna Cnng57860D基因中存在两个仅发生在野生高秆3529油菜中的稳定性可变剪切,而基因BnaA05g32040D和BnaA03g50910D中发生的稳定性可变剪切仅在矮化突变体NDF-1中发现.本研究筛选出可能与油菜矮化相关的可变剪切,可为油菜矮化新品种培育研究奠定基础. 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 矮化突变体 RNA-SEQ 可变剪切 苗期根
原文传递
FAK突变体的亚细胞定位及生物学特性
14
作者 方旭前 刘湘帆 +5 位作者 姚玲 顾志冬 陈长强 倪培华 郑新民 樊绮诗 《中华临床实验室管理电子杂志》 2014年第1期32-36,共5页
目的探讨外显子33缺失型黏着斑激酶(focal adhesion kinase,FAK)突变体(FAK-Del33)的亚细胞定位及生物学特性。方法采用基础实验研究设计。将野生型FAK以及突变型FAK-Del33分别构建到pEGFP表达载体,并转染乳腺癌细胞株,以研究分析其细... 目的探讨外显子33缺失型黏着斑激酶(focal adhesion kinase,FAK)突变体(FAK-Del33)的亚细胞定位及生物学特性。方法采用基础实验研究设计。将野生型FAK以及突变型FAK-Del33分别构建到pEGFP表达载体,并转染乳腺癌细胞株,以研究分析其细胞表达和定位情况。另构建过表达FAK或FAK-Del33的MDA-MB-468乳腺癌稳转细胞株,研究评价其细胞表达和体外克隆形成能力。结果构建FAK-GFP融合蛋白表达载体转染MDA-MB-468后的细胞定位显示,野生型FAK在胞浆中弥散分布,而FAK突变体蛋白在胞浆中呈点状不均匀分布,并聚集成簇。经限制性内切酶酶切分析与测序分析,成功构建出过表达FAK的慢病毒载体,以293T细胞包装的重组慢病毒能够高效感染乳腺癌细胞;经抗生素puromycin筛选和荧光定量PCR鉴定,成功筛选到稳定表达FAK的细胞株。在软琼脂克隆形成实验中,FAK野生型的克隆形成数为(335±48)/1000个,FAK突变体为(735±91)/1000个,后者对MDA-MB-468乳腺癌稳转细胞株的增殖能力高于前者(t=9.437,P<0.01)。结论初步研究表明外显子33缺失可改变FAK的亚细胞定位;并能增强肿瘤细胞株的体外克隆形成能力,这种FAK突变体可能参与肿瘤的发生发展。 展开更多
关键词 剪接突变体 酪氨酸激酶 黏着斑激酶 肿瘤
原文传递
用改进的重叠区扩增基因拼接法构建中间缺失突变体 被引量:6
15
作者 李成华 房海燕 +3 位作者 邓小云 夏昆 郑多 夏家辉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2004年第1期52-55,共4页
目的 构建缺失第 32 5~ 373位氨基酸密码子的磷脂酸磷酸化激酶β(phosphatidylinositol 4 - kinase beta,PI4 K-β)基因 ,以探索一种简便的构建中间缺失突变体的方法。 方法 应用重叠区扩增基因拼接法的原理 ,在拼接延伸后 ,再进行... 目的 构建缺失第 32 5~ 373位氨基酸密码子的磷脂酸磷酸化激酶β(phosphatidylinositol 4 - kinase beta,PI4 K-β)基因 ,以探索一种简便的构建中间缺失突变体的方法。 方法 应用重叠区扩增基因拼接法的原理 ,在拼接延伸后 ,再进行一次 PCR扩增 ,得到缺失第 32 5~ 373位氨基酸密码子的 PI4 K- β基因 ,克隆至 p CMV- Tag4 A真核表达载体。 结果 成功地构建出缺失第 32 5~ 373位氨基酸密码子的 PI4 K- β突变体。 结论 这种改进的重叠区扩增基因拼接法可以有效而可靠地构建中间缺失突变体 ,具有推广价值。 展开更多
关键词 重叠区扩增基因拼接法 中间缺失突变体 克隆 磷脂酸磷酸化激酶β 氨基酸密码子
原文传递
The effect of a secretion-enhanced heavy chain on improving intein-based dual-vector co-delivery of a full-length factor Ⅷ gene 被引量:8
16
作者 ZHU FuXiang YANG ShuDe LIU ZeLong MIAO Jing QU HuiGe CHI XiaoYan 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2011年第2期158-163,共6页
Treatment of hemophilia A by gene therapy is adversely affected by inefficient FVIII secretion and the large FVIII gene,which is difficult to package in the promising adeno-associated virus (AAV) vectors.Inhibited sec... Treatment of hemophilia A by gene therapy is adversely affected by inefficient FVIII secretion and the large FVIII gene,which is difficult to package in the promising adeno-associated virus (AAV) vectors.Inhibited secretion of FVIII is caused mainly by inefficient secretion of its heavy chain.Previously,we have employed a protein splicing-based dual-vector to co-transfer a B-domain-deleted FVIII (BDD-FVIII) gene,suggesting that the light chain,covalently ligated to a co-expressed heavy chain can improve the secretion of spliced BDD-FVIII.However,its level of secretion was affected by inefficient secretion the heavy chain.Here,we studied the effect of a mutant heavy chain with L303E/F309S substitutions,which enhance FVIII secretion on the heavy chain itself and spliced FVIII when using a protein splicing-based split-delivery of a full-length FVIII gene.Eukaryotic vectors expressing Ssp DnaB intein-fused mutant heavy and light chains were transiently co-transfected into cultured COS-7 cells.A spliced FVIII protein was seen in co-transfected cells by Western blot analysis.The heavy chain was secreted by cells transfected with the mutant heavy chain gene alone at (39±11) ng/mL and this secretion increased to (123±13) ng/mL when cells were co-transfected with the light chain gene,which was greater than the secretion of wild-type heavy chain.The amount of spliced FVIII in the culture supernatant of co-transfected cells was (86±14) ng/mL,with an activity of (0.61±0.08) IU/mL,which was greater than that of wild-type FVIII co-transfected cells.Spliced FVIII and bioactivity were also detected in the combined culture supernatant of cells individually transfected with mutant heavy and light chain gene at a higher level than that of combined wild-type heavy and light chain transfections.This suggested that the heavy chain with improved secretion markedly increased the efficacy of protein splicing-based split delivery of the full-length FVIII gene using a dual-vector.These results encourage the transfer of this technology to an animal model using a dual-AAV vector. 展开更多
关键词 分泌作用 基因传递 因子和 内含肽 轻链 载体 基础 蛋白质剪接
在线阅读 下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部