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应用单细胞RNA测序分析椎间盘退变中纤维环细胞-巨噬细胞的相互作用及其关键通路
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作者 李国望 宋秀云 +7 位作者 徐宝山 赵雅洁 赵嘉国 杜立龙 许海委 宁尚龙 刘钢 王雪 《中国脊柱脊髓杂志》 北大核心 2026年第1期107-116,共10页
目的:通过单细胞RNA测序阐明免疫细胞与纤维环细胞相互作用的时空动态特征。方法:实验采用12只8周龄雄性Sprague Dawley大鼠,并随机分为3组:正常对照组(NT)、针刺退变7d组(IDD7)及针刺退变14d组(IDD14),每组三只大鼠的椎间盘组织合并作... 目的:通过单细胞RNA测序阐明免疫细胞与纤维环细胞相互作用的时空动态特征。方法:实验采用12只8周龄雄性Sprague Dawley大鼠,并随机分为3组:正常对照组(NT)、针刺退变7d组(IDD7)及针刺退变14d组(IDD14),每组三只大鼠的椎间盘组织合并作为一个scRNA-seq样本(即NT/IDD7/IDD14各1个样本,n=3大鼠/组)。椎间盘组织经过混合的多种胶原酶消化后,并未进行流式分选,直接利用BD Rhapsody平台,对3个样本开展了单细胞RNA测序(scRNA-seq)。通过以下流程解析细胞动态变化:采用Seurat对原始计数矩阵进行质量控制、标准化及批次校正(Harmony算法整合),保留基因表达均值用于后续分析。通过FindVariableFeatures筛选2000个高变基因,经主成分分析(principal component analysis,PCA)降维后,采用Louvain聚类算法(分辨率0.2)对细胞进行分群,并结合SingleR工具进行细胞类型注释,获取各亚群的标志基因。对比正常对照组(NT)、针刺退变7d组(IDD7)及针刺退变14d组(IDD14)间的差异表达基因(筛选阈值:|logFC|>0.5,P<0.05)。使用基于R语言开发的生物信息学软件包ClusterProfiler与enrichR软件分别对差异基因进行GO(gene ontology)生物学过程与KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析(P<0.05,基因数≥2),筛选显著相关通路。基于Monocle3构建伪时间轨迹,将整合数据转换为cell_data_set对象,经UMAP(uniform manifold approximation and projection)降维与Louvain聚类后,利用learn_graph与order_cells函数揭示细胞状态演化路径。运用CellChat与CellPhoneDB分析配体-受体相互作用,计算细胞间通讯概率,可视化关键信号通路(如细胞因子、生长因子)在NT与IDD组间的动态变化。采用免疫荧光技术对CD68(巨噬细胞标记物)、SPP1、CD44等蛋白的共定位表达进行定量分析。结果:单细胞数据鉴定出9个主要细胞群:纤维环细胞(NP)、纤维环细胞(AF)、巨噬细胞(Mφ)、单核细胞、中性粒细胞、T细胞、成纤维细胞、内皮细胞及平滑肌细胞。74个基因持续差异表达,主要与免疫细胞趋化相关。并系统解析了纤维环细胞的时序性分子变化。纤维环细胞存在修复型(Fibro-1/3)与耗竭型(Fibro-2)两极分化,为精准干预提供靶群依据。拟时序T1期可能(对应IDD7d)是应激保护向纤维化转化的关键节点,为阻断不可逆损伤提供治疗窗口期。细胞互作动态演变:纤维环亚群中耗竭型Fibro-2与巨噬细胞的互作数最多,SPP1信号轴由Fibro-2主导发送,Mφ-3为主要接收者,该通路可能驱动纤维环细胞向促纤维化表型转化,提示其可能参与基质破坏和纤维化重塑进程。结论:纤维环细胞可能通过SPP1-CD44信号轴增强与巨噬细胞的相互作用,进而激活炎症反应并加速基质降解。这一发现揭示了椎间盘退变过程中的关键细胞受体-配体对,为IDD的精准干预提供了新的潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 椎间盘退变 巨噬细胞 纤维环细胞 单细胞测序 SPP1-CD44通路
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分泌性磷酸化蛋白1在前列腺癌免疫治疗中的机制及研究进展
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作者 李莹莹 桑珊珊 +1 位作者 管晓辉 杨佩颖 《临床医学进展》 2026年第1期2628-2635,共8页
前列腺癌是男性最常见的恶性肿瘤之一,传统治疗方法包括手术、化疗、放疗及雄激素剥夺治疗等,患者初始可获益,但绝大多数终将进展为去势抵抗性前列腺癌,面临耐药难题。由于前列腺癌特殊的免疫逃逸机制及肿瘤微环境显著的免疫抑制特征,... 前列腺癌是男性最常见的恶性肿瘤之一,传统治疗方法包括手术、化疗、放疗及雄激素剥夺治疗等,患者初始可获益,但绝大多数终将进展为去势抵抗性前列腺癌,面临耐药难题。由于前列腺癌特殊的免疫逃逸机制及肿瘤微环境显著的免疫抑制特征,免疫治疗收效甚微,如何破解“冷肿瘤”困境成为关键。分泌性磷酸化蛋白1 (SPP1)作为一种多功能磷酸化糖蛋白,被认为是极具前景的治疗靶点,其通过调节先天性和适应性免疫系统,促进肿瘤血管生成、侵袭、转移和免疫抑制。本文针对SPP1的生物学特性、SPP1在前列腺癌中的作用、SPP1在前列腺癌免疫治疗中的新策略与生物标志物潜能等3个方面进行论述,旨在揭示SPP1影响前列腺癌免疫治疗的科学内涵,为临床转化提供理论支撑与参考。 展开更多
关键词 前列腺癌 SPP1 肿瘤微环境 免疫治疗耐药 作用机制
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The Application Value of Chest CT Combined with Serum Vanin-1 and SPP1 in Diagnosing the Severity of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
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作者 Yufei Wei Yijie Cui +1 位作者 Wei Zhang Xueyao Wang 《Journal of Clinical and Nursing Research》 2026年第1期354-359,共6页
Objective:To investigate the quantitative assessment efficacy of chest CT combined with serum Vanin-1 and SPP1 in determining the progression stage of chronic obstructive pulmonary disease(COPD).Methods:A total of 100... Objective:To investigate the quantitative assessment efficacy of chest CT combined with serum Vanin-1 and SPP1 in determining the progression stage of chronic obstructive pulmonary disease(COPD).Methods:A total of 100 COPD subjects from our hospital from January 2020 to December 2023 were included and randomly divided into a healthy control group and an experimental group(50 cases each).The healthy control group underwent slow vital capacity measurement using a spirometer,while the experimental group underwent high-resolution thin-slice CT scans and serum Vanin-1 and SPP1 concentration measurements.Pulmonary function parameters,symptom burden,biomarker concentrations,and imaging characteristics were compared between the two groups.Results:The FEV1/FVC ratio in the experimental group(58.3±7.2)was lower than that in the healthy control group(92.1±4.8);the total CAT score(22.4±3.5)was higher than that in the healthy control group(3.1±1.2);both Vanin-1(18.7±2.3μg/L)and SPP1(25.6±4.1μg/L)levels were higher than those in the healthy control group;LAA%-950(38.7±6.2%)and WA%(68.5±5.3%)were significantly higher than those in the healthy control group(all p<0.001).Conclusion:Chest CT combined with serum Vanin-1 and SPP1 can accurately quantify the pathological progression of COPD,providing a dual basis for clinical staging and individualized intervention. 展开更多
关键词 Chronic obstructive pulmonary disease Chest CT Vanin-1 SPP1 Disease assessment
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SMARCA4缺失型非小细胞肺癌的SPP1表达及其与PD-L1的关系 被引量:3
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作者 吴娟 黄曦 +5 位作者 李佳嘉 魏雨晴 张丽琴 俞咏梅 陆志伟 张鹤 《中国临床药理学与治疗学》 北大核心 2025年第4期477-486,共10页
目的:分析SMARCA4缺失型非小细胞肺癌中分泌性磷蛋白1(SPP1)及细胞程序性死亡-配体1(PD-L1)的表达,为罕见病理类型肺癌后续治疗研究提供科学依据。方法:回顾性分析12例SMARCA4缺失型非小细胞肺癌患者的临床与病理特征,根据其形态学分为... 目的:分析SMARCA4缺失型非小细胞肺癌中分泌性磷蛋白1(SPP1)及细胞程序性死亡-配体1(PD-L1)的表达,为罕见病理类型肺癌后续治疗研究提供科学依据。方法:回顾性分析12例SMARCA4缺失型非小细胞肺癌患者的临床与病理特征,根据其形态学分为腺癌与低分化癌两组,分析SPP1与PD-L1在两组的表达与关系。结果:所有患者均检出SPP1表达且其在低分化癌组表达水平较腺癌组显著升高(P=0.015);PD-L1表达者占6/7(5例未测),较之腺癌组,PD-L1亦在低分化癌组高表达(P=0.048),两组的PD-L1表达差异与SPP1表达差异一致。结论:SMARCA4缺失型非小细胞肺癌具有较高的SPP1及PD-L1阳性表达,病理形态为低分化癌者更甚,SPP1与PD-L1在SMARCA4缺失型非小细胞肺癌中的表达情况可能具有正相关性,其关联机制及免疫治疗中作用有待后续研究进一步探讨。 展开更多
关键词 NSCLC SMARCA4缺失 SPP1 PD-L1 免疫治疗
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心肌梗死进程中巨噬细胞时间特异性分子表达模式的动态变化 被引量:1
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作者 吴懋 孙佳 +1 位作者 周挺 牛超 《温州医科大学学报》 2025年第4期259-266,共8页
目的:探究小鼠心肌梗死(MI)后巨噬细胞随疾病进展的时间特异性分子表达模式。方法:构建MI动物模型,设5组:假手术组、MI组(3、7、14 d)、MI+anti-OPN组。HE染色评估心脏组织的炎症水平;马松染色评估心脏纤维化程度;心脏超声检测心功能变... 目的:探究小鼠心肌梗死(MI)后巨噬细胞随疾病进展的时间特异性分子表达模式。方法:构建MI动物模型,设5组:假手术组、MI组(3、7、14 d)、MI+anti-OPN组。HE染色评估心脏组织的炎症水平;马松染色评估心脏纤维化程度;心脏超声检测心功能变化。在单细胞水平上,采用CN(Cluster Network)单细胞差异基因分析探究巨噬亚群的差异表达特征,并通过免疫荧光染色(IF)验证巨噬亚群的时空特异性。结果:HE染色结果表明,与假手术组比,MI早期(MI 3 d)以炎症反应为主,而晚期(MI 7 d和14 d)则逐渐转向纤维化修复过程。单细胞RNA测序(scRNA-seq)鉴定出13个异质性巨噬亚群,这些亚群在MI进程中表现出显著的动态演变。其中,Spp1^(hi)Mac和Fn1^(hi)Mac分别作为MI 3 d(炎症期)和14 d(纤维化期)的关键浸润亚群,其时空特异性分布特征通过IF染色得到验证。给予OPN中和抗体(Spp1)干预后,Spp1^(hi)Mac数量减少,心脏超声结果显示,与MI组(3 d)相比,MI+anti-OPN组左心室射血分数和左心室短轴缩短率升高(P<0.05)。结论:巨噬亚群在MI进程中表现出显著的动态演变,其中Spp1^(hi)Mac和Fn1^(hi)Mac分别作为MI 3 d和14 d的关键浸润亚群,在调控白细胞外渗过程和心脏重构机制中发挥重要作用。通过OPN中和抗体干预可特异性减少Spp1^(hi)Mac的数量,从而显著改善心功能。 展开更多
关键词 心肌梗死 巨噬细胞 Spp1^(hi)Mac 单细胞RNA测序
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SPP1在代谢相关性脂肪性肝炎中的诊断价值及调控机制
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作者 李沙 李锦忠 +3 位作者 谌宁 李敏然 戴二黑 齐亚娟 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 北大核心 2025年第4期505-517,共13页
目的:代谢相关性脂肪性肝炎(metabolic dysfunction-associated steatohepatitis,MASH)是代谢相关性脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated fatty liver disease,MAFLD)的进展阶段,目前主要依赖肝活检进行确诊,存在创伤性强、依... 目的:代谢相关性脂肪性肝炎(metabolic dysfunction-associated steatohepatitis,MASH)是代谢相关性脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated fatty liver disease,MAFLD)的进展阶段,目前主要依赖肝活检进行确诊,存在创伤性强、依从性差等问题。因此,亟需开发非侵入性生物标志物以辅助诊断。本研究旨在通过整合机器学习算法与肝脏转录组数据,筛选MASH关键诊断基因,并探讨分泌型磷蛋白1(secreted phosphoprotein 1,SPP1)在MASH中的调控机制及诊断价值。方法:从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)获取MAFLD患者肝脏转录组数据集,通过差异表达分析筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。结合随机森林、人工神经网络、Lasso回归和支持向量机递归特征消除算法筛选关键基因,构建Neural-MASH诊断模型,并通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估性能。进一步分析候选关键基因与免疫细胞浸润及临床指标的相关性,并进行功能富集分析。结果:共筛选出85个DEGs,功能富集显示其与p53信号通路和细胞外基质(extra cellular matrix,ECM)-受体相互作用密切相关。通过多算法交叉验证,确定SPP1、含Fc受体样及黏蛋白结构域蛋白(fc alpha and mu receptor,FCAMR)、含黄素单加氧酶1(flavin-containing monooxygenase 1,FMO1)为关键基因,其中SPP1在MASH中表达上调,且与B细胞、巨噬细胞M0浸润及临床指标呈正相关(均P<0.05)。Neural-MASH模型在训练集和验证集中的曲线下面积(area under curve,AUC)分别为1.000和0.811。功能分析揭示SPP1主要参与ECM、细胞迁移调控、脂质定位及IL-18信号通路等生物学过程。结论:SPP1可作为MASH的潜在诊断标志物,其与免疫微环境的交互作用可能在疾病进展中发挥关键调控作用。基于机器学习所构建的Neural-MASH模型具有较高的诊断效能,可为MASH的无创诊断提供参考依据。 展开更多
关键词 代谢相关性脂肪性肝炎 分泌型磷蛋白1(SPP1) 人工神经网络 生物标志物
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SPP1^(+)巨噬细胞及其表达产物CCL18在CTD-ILD中的水平及临床意义
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作者 张琳 庞春艳 +1 位作者 王永福 鲁芙爱 《包头医学院学报》 2025年第6期49-55,共7页
目的:分析结缔组织病合并间质性肺病(CTD-ILD)患者外周血中SPP1^(+)巨噬细胞的比例和其表达产物趋化因子18(CCL18)在CTD-ILD患者血清中表达水平及临床意义。方法:选取20例结缔组织病(CTD)患者和20例健康人群作为对照组,35例初诊CTD-ILD... 目的:分析结缔组织病合并间质性肺病(CTD-ILD)患者外周血中SPP1^(+)巨噬细胞的比例和其表达产物趋化因子18(CCL18)在CTD-ILD患者血清中表达水平及临床意义。方法:选取20例结缔组织病(CTD)患者和20例健康人群作为对照组,35例初诊CTD-ILD患者作为实验组,比较实验组与对照组中SPP1^(+)巨噬细胞、CCL18表达水平的差异,并与Ⅰ型胶原蛋白(COL1A1)、红细胞沉降率(ESR)、C-反应蛋白(CRP)等指标进行相关性分析。结果:与对照组相比,CTD-ILD患者外周血单核细胞中SPP1^(+)巨噬细胞比例显著增加(P<0.05),血清中CCL18的含量也明显升高(P<0.05);同时SPP1^(+)巨噬细胞、CCL18与ESR、CRP、COL1A1、肺部影像学评分(HRCT评分)呈正相关关系(P<0.05),与用力肺活量占预计值的百分比(FVC%)、一氧化碳弥散量占预计值的百分比(DLCO%)呈负相关关系(P<0.05);SPP1^(+)巨噬细胞和CCL18的曲线下面积(AUC)分别为0.732、0.939,二者联合检测的AUC为0.939,灵敏度为93.5%,特异度为83.3%,约登指数为0.768。结论:SPP1^(+)巨噬细胞及CCL18是CTD-ILD患者预后不良的因素,二者联合检测对疾病的预后具有重要的意义。 展开更多
关键词 结缔组织病合并间质性肺病 SPP1^(+)巨噬细胞 趋化因子18 Ⅰ型胶原
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龙胆苦苷通过调节肝星状细胞中MIF-SPP1信号通路预防巨噬细胞介导的肝纤维化机制研究 被引量:1
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作者 王继绪 朱英斌 +1 位作者 陈茂丽 韩永峰 《细胞与分子免疫学杂志》 北大核心 2025年第7期593-602,共10页
目的探究龙胆苦苷(GPS)通过调节肝星状细胞中巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)-分泌型磷蛋白1(SPP1)信号通路预防巨噬细胞介导的肝纤维化机制。方法将LX-2细胞分为对照组、转化生长因子β(TGF-β)组、TGF-β联合GPS(25、50、100、150)μmol/mL... 目的探究龙胆苦苷(GPS)通过调节肝星状细胞中巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)-分泌型磷蛋白1(SPP1)信号通路预防巨噬细胞介导的肝纤维化机制。方法将LX-2细胞分为对照组、转化生长因子β(TGF-β)组、TGF-β联合GPS(25、50、100、150)μmol/mL组,EDU检测细胞增殖、Transwell TM检测细胞侵袭、Western blot法检测平滑肌激动蛋白(α-SMA)与一型胶原蛋白(COL1A1)蛋白表达。分离M1型巨噬细胞条件培养基(M1-CM)用于处理TGF-β组、TGF-β联合GPS组LX-2细胞,同时检测细胞上清液中诱导型一氧化氮合酶(iNOS)、精氨酸酶1(Arg1)浓度,细胞增殖与侵袭能力,以及α-SMA与COL1A1蛋白表达。生物信息学分析GPS、肝纤维化与巨噬细胞相关基因的靶点交集,药物亲和反应的靶点稳定性(DARTS)实验和Western blot法验证GPS对MIF的调控作用。进一步将LX-2细胞分为对照组、TGF-β组、TGF-β联合M2-CM组、TGF-β和oe-NC联合M2-CM组、TGF-β和oe-MIF联合M2-CM组,分析细胞上清液iNOS、Arg1浓度及细胞增殖、侵袭、α-SMA与COL1A1蛋白表达变化。将LX-2细胞分为对照组、TGF-β组、TGF-β联合oe-NC组、TGF-β联合oe-MIF组、TGF-β和oe-MIF联合GPS组,Western blot法测定MIF与SPP1蛋白表达。构建大鼠肝纤维化模型,探究GPS对体内肝纤维化的潜在治疗作用。结果与对照组相比,TGF-β组LX-2细胞增殖与侵袭能力增加,α-SMA与COL1A1蛋白表达增强,而GPS干预能够抑制TGF-β条件LX-2细胞增殖与侵袭,并降低α-SMA与COL1A1蛋白表达。与对照组相比,TGF-β组细胞上清液中iNOS浓度上调、Arg1浓度下降,并且M1-CM处理在TGF-β干预的基础上,进一步增加了iNOS浓度、降低了Arg1浓度,同时促进了细胞增殖与侵袭,上调了α-SMA与COL1A1蛋白表达,而GPS能够逆转M1-CM干预的结果。生物信息学分析发现MIF为GPS、肝纤维化与巨噬细胞相关基因的靶点交集之一,且GPS能够靶向并抑制其表达。相比于TGF-β组,M2-CM干预后细胞上清液中iNOS浓度下降、Arg1浓度增加,LX-2细胞增殖与侵袭能力降低,α-SMA与COL1A1蛋白表达减弱,然而过表达MIF后,逆转了M2-CM的干预效果。Western blot结果显示,相比于对照组,TGF-β组MIF与SPP1蛋白表达增强,过表达MIF后MIF与SPP1蛋白表达进一步增强,而GPS干预则抑制了MIF与SPP1蛋白表达。动物实验中,GPS干预治疗能够减轻肝纤维化大鼠肝损伤,并抑制肝组织中MIF与SPP1、α-SMA与COL1A1蛋白表达。结论GPS可能通过抑制肝星状细胞中MIF-SPP1信号通路预防巨噬细胞介导的肝纤维化。 展开更多
关键词 巨噬细胞 龙胆苦苷(GPS) 肝星状细胞 肝纤维化 巨噬细胞迁移抑制因子(MIF) 分泌型磷蛋白1(SPP1)
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结直肠癌中SPP1+巨噬细胞的分布和功能及临床意义研究进展
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作者 龙雨欣 杨岳 +1 位作者 金硕(综述) 张红梅(审校) 《中国肿瘤临床》 北大核心 2025年第12期633-637,共5页
结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是中国常见的消化道恶性肿瘤之一,其恶性进展与肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)的调控密切相关。肿瘤相关巨噬细胞作为TME中关键的免疫调节细胞,具有显著的异质性特征。分泌型磷蛋白1阳性肿瘤... 结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是中国常见的消化道恶性肿瘤之一,其恶性进展与肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)的调控密切相关。肿瘤相关巨噬细胞作为TME中关键的免疫调节细胞,具有显著的异质性特征。分泌型磷蛋白1阳性肿瘤相关巨噬细胞(secreted phosphoprotein 1 tumor-associated macrophages,SPP1+TAM)是一类具有明确促瘤作用的亚群。SPP1+TAM在CRC组织中呈现特异性分布特征,尤其在肿瘤侵袭前沿和转移灶中显著富集。该亚群通过分泌SPP1等效应分子,参与结肠癌细胞黏附、迁移、血管生成和转移等多种活动。本文就SPP1+TAM在CRC中的分布特征、分子调控机制及其临床意义进行综述,旨在为开发新型诊断标志物和靶向治疗策略提供理论依据。 展开更多
关键词 结直肠癌 肿瘤微环境 SPP1+巨噬细胞 骨桥蛋白
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The Predictive Value of SPP1 Gene Expression for the Survival of Advanced Liver Cancer Treated with Transarterial Chemoembolization
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作者 Yu Cai Pu Yan +3 位作者 Chang Tian Yuqing Li Yuanyuan Jia Siqi Wang 《Proceedings of Anticancer Research》 2025年第1期97-107,共11页
Objective:To evaluate the predictive value of secreted phosphoprotein 1(SPP1)gene expression for postoperative survival in patients with advanced liver cancer undergoing hepatic artery interventional chemoembolization... Objective:To evaluate the predictive value of secreted phosphoprotein 1(SPP1)gene expression for postoperative survival in patients with advanced liver cancer undergoing hepatic artery interventional chemoembolization treatment.Method:Bioinformatics methods,including gene ontology(GO)and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)pathway analysis,were used to identify genes related to survival prognosis in hepatocellular carcinoma(HCC)patients.A retrospective analysis of 115 advanced liver cancer patients treated between January 2016 and October 2017 was conducted.Patients were categorized into SPP1 high-expression(n=89)and low-expression groups(n=26).Additionally,115 healthy individuals served as the control group.The relationship between SPP1 expression and clinical pathological features was analyzed.A 60-month follow-up and logistic regression analysis identified risk factors affecting survival.Results:SPP1 mRNA expression was significantly higher in liver cancer patients compared to healthy controls(P<0.05).SPP1 expression levels were significantly associated with tumor size,Child-Pugh grading,lymph node metastasis,and BCLC staging(P<0.05).High SPP1 expression,along with tumor size,Child-Pugh grading,lymph node metastasis,and BCLC staging,were independent risk factors for survival(P<0.05).The 60-month survival rate was 17.39%,with a median survival of 40 months in the low-expression group versus 18 months in the high-expression group(P<0.05).Conclusion:SPP1 expression is significantly upregulated in advanced liver cancer patients and has predictive value for postoperative survival following hepatic artery chemoembolization treatment.SPP1,combined with clinical indicators such as tumor size,Child-Pugh grading,lymph node metastasis,and BCLC staging,may serve as a prognostic biomarker for interventional treatment outcomes. 展开更多
关键词 SPP1 Transarterial chemoembolization Advanced liver cancer Survival period Predictive value
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焦点黏连信号通路相关基因在鸡肌肉发育中的表达研究 被引量:4
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作者 刘龙洲 梁忠 +4 位作者 黄华云 吴姝 梁鼎震 薛菠 杨烨 《中国家禽》 北大核心 2018年第17期8-12,共5页
试验以矮小品系S2鸡为试验素材,采用q-PCR技术以及SPSS分析软件,研究焦点黏连(Focal adhesion)信号通路中调控:小凹蛋白-3(CAV-3)、血小板衍生生长因子受体α多肽(PDGFRA)、分泌型焦磷酸蛋白(SPP1)在生长期骨骼肌发育中的表达模式及在... 试验以矮小品系S2鸡为试验素材,采用q-PCR技术以及SPSS分析软件,研究焦点黏连(Focal adhesion)信号通路中调控:小凹蛋白-3(CAV-3)、血小板衍生生长因子受体α多肽(PDGFRA)、分泌型焦磷酸蛋白(SPP1)在生长期骨骼肌发育中的表达模式及在成肌细胞增殖和分化期的表达特征。结果显示:在肌肉组织中,CAV-3在胸肌和腿肌中的表达模式相同,从4周龄开始随着发育时间的增加,CAV-3表达量逐渐降低,在16周龄时显著低于其他发育时期(P<0.05);在0日龄、8周龄时PDGRFA在胸肌中相对表达量显著高于腿肌(P<0.05),但在16周龄时胸肌中PDGRFA相对表达量显著低于腿肌(P<0.05);SPP1在胸肌和腿肌中的表达模式存在显著差异,从4周龄开始,在胸肌中随着发育时间增加,SPP1相对表达量逐渐减少,在腿肌中随着发育时间的增加,SPP1相对表达量逐渐减少。在成肌细胞中,CAV-3相对表达量在增殖期100%时显著高于其他发育时期(P<0.05),并随分化时间的增加,CAV-3相对表达量逐渐减少;PDGFRA表达量在分化期的表达显著高于增殖期(P<0.05),并随诱导分化时间的延长表达量逐渐升高;SPP1相对表达量在增殖期100%时显著高于其他发育时期(P<0.05)。结果表明:CAV-3、PDGFRA和SPP1 mRNA表达量在鸡成肌细胞增殖分化期和鸡肌肉组织生长期分别呈现明显的差异性,3种基因可能分别以不同的方式参与调控胸肌、腿肌发育过程,为进一步研究该3种基因分别调控肌肉发育的分子机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 肌肉 CAV-3 PDGFRA SPP1
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基于基因芯片的前列腺癌转移高表达基因SPP1的生物信息学分析 被引量:3
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作者 李铁求 滕伊漓 +3 位作者 邹亚光 杨宇 李琦 毛向明 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2014年第11期984-990,共7页
目的:利用生物信息学方法分析前列腺癌转移高表达基因SPP1以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据。方法:在公共基因芯片数据库(GEO)中下载前列腺癌转移相关基因芯片数据,利用BRB-Array Tools软件、protp... 目的:利用生物信息学方法分析前列腺癌转移高表达基因SPP1以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据。方法:在公共基因芯片数据库(GEO)中下载前列腺癌转移相关基因芯片数据,利用BRB-Array Tools软件、protparam、Motif Scan、Signal P4.0、TMHMM、Net Phos2.0、Predict Protein、GO、KEGG、STRING等生物信息学工具进行数据挖掘及生物信息学分析。结果:共筛选出前列腺癌转移共同差异基因73个,表达上调21个,表达下调52个(P<0.01),其中对前列腺癌转移高表达基因SPP1进行生物信息学分析发现,SPP1蛋白由314个氨基酸组成,该蛋白含有2个N-连接糖基化位点、8个酪蛋白激酶II磷酸化位点、3个PKC磷酸化位点,主要参与细胞外基质结合、骨化、成骨细胞分化、细胞黏附、PI3K-Akt信号通路、黏着斑、ECM受体相互作用、Toll样受体信号通路等分子功能和信号通路。结论:利用生物信息学的方法能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息,SPP1可能在前列腺癌转移中发挥重要作用,有望成为前列腺癌转移的早期诊断标志物和治疗的新靶点。 展开更多
关键词 SPP1基因 生物信息学 前列腺癌 转移相关基因 基因芯片
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spp1基因在肺癌组织中表达的定量检测及其意义 被引量:2
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作者 曹惠芳 满晓波 +6 位作者 蒋虹 徐志飞 唐亮 邱秀华 谈冶雄 吴孟超 王红阳 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 2003年第2期119-121,共3页
目的 :探讨定量检测骨桥蛋白编码基因在原发性肺癌中的表达及其意义。方法 :制备 2 4例肺癌患者癌及癌周正常肺组织中总RNA ,采用RT PCR及实时荧光定量PCR技术分析spp1基因的mRNA表达水平。 结果 :在所有 2 4例肺癌中肺癌组织的骨桥蛋... 目的 :探讨定量检测骨桥蛋白编码基因在原发性肺癌中的表达及其意义。方法 :制备 2 4例肺癌患者癌及癌周正常肺组织中总RNA ,采用RT PCR及实时荧光定量PCR技术分析spp1基因的mRNA表达水平。 结果 :在所有 2 4例肺癌中肺癌组织的骨桥蛋白表达高于相邻的癌周正常肺组织 ,并且全部在 6倍以上 ,其中 7例在 10 0倍以上。结论 :肺癌组织中骨桥蛋白的表达明显升高 ,是肺癌诊断的重要标志物。 展开更多
关键词 spp1基因 肺癌组织 表达 定量检测
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SPP1基因在肺腺癌中的表达及与预后的相关性研究 被引量:4
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作者 栾艳超 梁超 +3 位作者 韩青松 刘佳坤 杨立伟 李志峰 《临床肺科杂志》 2022年第6期884-891,共8页
目的SPP1基因与多种肿瘤的发生、侵袭和转移有关,但SPP1与肺腺癌(Lung adenocarcinoma LUAD)的关系尚未研究。本研究拟探讨SPP1在肺腺癌中的表达与患者临床特征及预后的关系。方法挖掘UALCAN数据库分析SPP1表达与临床关系;运用GEPIA、K-... 目的SPP1基因与多种肿瘤的发生、侵袭和转移有关,但SPP1与肺腺癌(Lung adenocarcinoma LUAD)的关系尚未研究。本研究拟探讨SPP1在肺腺癌中的表达与患者临床特征及预后的关系。方法挖掘UALCAN数据库分析SPP1表达与临床关系;运用GEPIA、K-M数据库分析SPP1表达与预后关系。采用qPCR、western blot和免疫组织化(IHC)法检测肺腺癌中SPP1的表达情况,并分析SPP1表达与临床参数及预后的关系。结果SPP1在肺腺癌中高表达,与肿瘤临床分期、淋巴结转移、和生存状况显著相关。SPP1表达与患者OS负相关。Cox分析提示SPP1蛋白表达、肿瘤临床分期、远处转移为影响LUAD患者预后的独立危险因素。结论SPP1表达水平与肺腺癌的预后显著相关,有可能成为LUAD诊治、评估预后的重要分子标志物。 展开更多
关键词 SPP1 肺腺癌 预后 生物信息学
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生物信息学分析SPP1基因在肝细胞癌中的表达及机制 被引量:3
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作者 成镀 谢鹏 操寄望 《武汉大学学报(医学版)》 CAS 2019年第6期886-890,共5页
目的:生物信息学分析SPP1在肝细胞癌(HCC)中的表达及与临床预后的关系,并预测SPP1表达异常的分子机制。方法:GEPIA数据库分析SPP1 mRNA在肝细胞癌中的表达及与患者预后的关系;cBioPortal、MethHC、GCBI和StarBase和NetPhos 3.1 Server... 目的:生物信息学分析SPP1在肝细胞癌(HCC)中的表达及与临床预后的关系,并预测SPP1表达异常的分子机制。方法:GEPIA数据库分析SPP1 mRNA在肝细胞癌中的表达及与患者预后的关系;cBioPortal、MethHC、GCBI和StarBase和NetPhos 3.1 Server等数据库预测SPP1基因突变、启动子区甲基化水平、与SPP1结合的miRNAs转录后调控、蛋白翻译后修饰。结果:SPP1 mRNA在HCC中表达升高,其中SPP1高表达患者的总体预后差(log-rank P=0.00011)。HCC中SPP1存在基因扩增和深度缺失。启动子区甲基化水平降低(P<0.005),并与SPP1表达负相关(R=0.650,P<0.0001)。HCC中miR-146a表达降低,miR-146a能与SPP1的3’-UTR结合,miR-146a与SPP1的共表达有统计学意义(P<0.0001);4个激酶unsp、PKC、PKA、CKⅡ能在39个位点将其底物SPP1蛋白磷酸化。结论:生物信息学分析SPP1可作为早期肝细胞癌的潜在诊断指标。其升高可能与SPP1基因组扩增、启动子区去甲基化、转录后miR-146a对其3’-UTR调控、蛋白翻译后磷酸化修饰相关。 展开更多
关键词 SPP1 肝细胞癌 预后 甲基化 磷酸化
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Hepatitis B virus pre-S/S variants in liver diseases 被引量:17
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作者 Bing-Fang Chen 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2018年第14期1507-1520,共14页
Chronic hepatitis B is a global health problem. The clinical outcomes of chronic hepatitis B infection include asymptomatic carrier state, chronic hepatitis(CH), liver cirrhosis(LC), and hepatocellular carcinoma(HCC).... Chronic hepatitis B is a global health problem. The clinical outcomes of chronic hepatitis B infection include asymptomatic carrier state, chronic hepatitis(CH), liver cirrhosis(LC), and hepatocellular carcinoma(HCC). Because of the spontaneous error rate inherent to viral reverse transcriptase, the hepatitis B virus(HBV) genome evolves during the course of infection under the antiviral pressure of host immunity. The clinical significance of pre-S/S variants has become increasingly recognized in patients with chronic HBV infection. Pre-S/S variants are often identified in hepatitis B carriers with CH, LC, and HCC, which suggests that these naturally occurring pre-S/S variants may contribute to the development of progressive liver damage and hepatocarcinogenesis. This paper reviews the function of the pre-S/S region along with recent findings related to the role of pre-S/S variants in liver diseases. According to the mutation type, five pre-S/S variants have been identified: pre-S deletion, pre-S point mutation, pre-S1 splice variant, C-terminus S point mutation, and pre-S/S nonsense mutation. Their associations with HBV genotype and the possible pathogenesis of pre-S/S variants are discussed. Different pre-S/S variants cause liver diseases through different mechanisms. Most cause the intracellular retention of HBV envelope proteins and induction of endoplasmic reticulum stress, which results in liver diseases. Pre-S/S variants should be routinely determined in HBV carriers to help identify individuals who may be at a high risk of less favorable liver disease progression. Additional investigations are required to explore the molecular mechanisms of the pre-S/S variants involved in the pathogenesis of each stage of liver disease. 展开更多
关键词 HEPATITIS B virus pre-S/S mutant pre-S DELETION SPLICE variant spps1 chronic HEPATITIS liver CIRRHOSIS hepatocellular carcinoma
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胆管癌全基因组表达差异的初步观察 被引量:2
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作者 田志刚 徐智 +10 位作者 张亮 李晓红 凌晓锋 任永红 侯纯升 王姝杰 王立新 修典荣 宋士兵 张同琳 周孝思 《中国微创外科杂志》 CSCD 2007年第5期480-485,共6页
目的通过比较肝门部胆管癌与胆总管中下段癌的全基因组表达差异,进一步揭示胆管癌发生、发展的内在分子机制。方法采用含21329条Oligo DNA的人类全基因组寡核苷酸芯片,对3例肝门部胆管癌与正常胆管配对检测差异表达基因,另取4例胆总管... 目的通过比较肝门部胆管癌与胆总管中下段癌的全基因组表达差异,进一步揭示胆管癌发生、发展的内在分子机制。方法采用含21329条Oligo DNA的人类全基因组寡核苷酸芯片,对3例肝门部胆管癌与正常胆管配对检测差异表达基因,另取4例胆总管中下段癌标本与正常胆管配对检测差异表达基因,通过SAM分析,得到两者间差异表达基因,并采用实时定量RT-PCR验证芯片结果。结果肝门部胆管癌与胆总管中下段癌之间基因表达既存在共性,又存在差异。与正常胆管组织相比,两者共同上调基因244条,共同下调基因399条;而两者差异表达基因共82条(ratio≥2.0或≤0.5)。通过SAM分析(q=0),两者显著差异表达基因共40条,其中上调基因29条,下调基因11条,包括AREG、EPHA2、SPP1、PACE4等。结论高通量的基因芯片技术能够筛选出大量的胆管癌差异表达基因,肝门部胆管癌与胆总管中下段癌的基因表达亦存在着明显的聚类性质差别。 展开更多
关键词 肝门部胆管癌 胆总管中下段癌 全基因组寡核苷酸芯片 AREG SPP1
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芽孢杆菌B_1、B_2对豌豆尖镰孢菌抗菌机理的研究 被引量:8
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作者 刘晓妹 陈秀蓉 蒲金基 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期1-5,共5页
同、异步培养结果表明:芽孢杆菌B1、B2对豌豆尖孢镰孢菌(Fusarium oxysporumSchl f.sp.pisi)有很强的抑菌作用。经B1、B2无菌液处理后的病原菌由灰白色变为白色,气生菌丝增多且纠结成团。抗菌显微特征是:导致病菌孢子和菌丝体膨大、畸... 同、异步培养结果表明:芽孢杆菌B1、B2对豌豆尖孢镰孢菌(Fusarium oxysporumSchl f.sp.pisi)有很强的抑菌作用。经B1、B2无菌液处理后的病原菌由灰白色变为白色,气生菌丝增多且纠结成团。抗菌显微特征是:导致病菌孢子和菌丝体膨大、畸形、原生质凝聚、孢子不萌发或萌发异常、菌丝生长点产生大量泡囊、生长受阻,后期菌丝体断裂、泡囊破裂、原生质外泄。B1、B2无菌液中蛋白含量分别为1795.53μg/mL和1345.93μg/mL,各含一种抗菌蛋白,其分子量分别为103.5kD(B1)和127.6kD(B2)。 展开更多
关键词 芽孢杆菌(Bacillus spp.)B1、B2 豌豆尖镰孢菌 抗菌机理
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Mdx小鼠骨骼肌纤维化及Spp1基因表达 被引量:1
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作者 陈雪晓 王雪 +6 位作者 宋学琴 吴红然 崔红颖 要萌萌 陈秀晓 张亚 侯志刚 《脑与神经疾病杂志》 2016年第9期578-582,共5页
目的通过观察Duchenne型肌营养不良的模型鼠mdx小鼠骨骼肌中纤维化情况,研究Spp1基因在mdx小鼠及其对照鼠中不同时期的表达,探讨在mdx小鼠中Spp1与肌纤维化的关系。方法选取雄性C57BL/10Sc Sn-Dmdmdx/JNju鼠为实验组,雄性C57BL/6Sc Sn... 目的通过观察Duchenne型肌营养不良的模型鼠mdx小鼠骨骼肌中纤维化情况,研究Spp1基因在mdx小鼠及其对照鼠中不同时期的表达,探讨在mdx小鼠中Spp1与肌纤维化的关系。方法选取雄性C57BL/10Sc Sn-Dmdmdx/JNju鼠为实验组,雄性C57BL/6Sc Sn小鼠为对照组,根据年龄分为2w组、4w组、8w组、12w组。每组选取6只,3只用于冰冻切片的苏木精-伊红染色及马松(masson)染色,3只用于基因芯片及q RT-PCR。结果 2w及4w时mdx小鼠无明显结缔组织增生,8w时,mdx小鼠可见轻度结缔组织增生;12w时,mdx小鼠结缔组织增生程度较8w稍加重,仍为小片状区域的纤维化,对照组小鼠不同时期均未见纤维化;mdx小鼠2w与12w股四头肌基因芯片表达谱对比,其中Spp1基因在mdx小鼠2w与12w相比fold-change值为-15.1354,变化明显;Spp1在mdx小鼠股四头肌不同时期表达量比较:8w组较4w组明显升高,12w组较8w组表达量下降,但仍高于4w组,8w组与12w组Spp1表达量较同期对照组明显升高,差异具有统计学意义。结论 mdx小鼠早期(2w^4w)肌纤维化表现不明显,8w时骨骼肌内可见少量结缔组织增生,随后缓慢进展。2 Spp1基因在mdx小鼠成熟期(8w^12w)表达量明显增加,推测其在mdx小鼠肌纤维化中发挥一定作用。 展开更多
关键词 DUCHENNE型肌营养不良 骨骼肌纤维化 Spp1基因 mdx小鼠 基因芯片
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基于数据库分析SPP1在肺鳞癌中的表达及意义 被引量:3
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作者 秦春明 《临床医学研究与实践》 2019年第7期7-8,共2页
目的基于数据库分析分泌性磷蛋白1(SPP1)在肺鳞癌中的表达及意义。方法通过检索Oncomine和cBioPortal数据库中关于SPP1的信息,并对目前数据库中资料进行二次分析,分析其在肺鳞癌中的作用。结果 Oncomine数据库中共有4个研究涉及SPP1在... 目的基于数据库分析分泌性磷蛋白1(SPP1)在肺鳞癌中的表达及意义。方法通过检索Oncomine和cBioPortal数据库中关于SPP1的信息,并对目前数据库中资料进行二次分析,分析其在肺鳞癌中的作用。结果 Oncomine数据库中共有4个研究涉及SPP1在肺鳞癌组织和正常组织中的表达,共包括184个样本,荟萃4个结果发现,SPP1在肺鳞癌中较正常组织高表达,差异具有统计学意义(P=2.84×10^(-7))。通过cBioPortal数据库分析,在oncoprint选项中发现501例中晚期肺鳞癌的样本中有39例SPP1高表达(7.8%)。SPP1表达量与肺鳞癌总体生存率存在相关性,SPP1高表达5年生存率为29.1%,而SPP1低表达5年生存率为49.3%,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论通过对Oncomine和cBioPortal数据库中肿瘤相关基因信息的深入检索,提出SPP1在肺鳞癌组织中高表达,且与肺鳞癌预后有关,其将为肿瘤药物的开发提供重要理论依据。 展开更多
关键词 SPP1 肺鳞癌 Oncomine cBioPortal 预后
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