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Genetic diversity and population structure of the Fujian oyster Crassostrea angulata revealed by mitochondrial COI gene and nuclear gene ITS2 sequences
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作者 Shiqi YU Ziqiang HAN Huayong QUE 《Journal of Oceanology and Limnology》 2026年第1期419-432,共14页
The Fujian oyster(Crassostrea angulata) is an economically significant shellfish species distributed mainly along the Fujian coast, Southeast China. However, its genetic diversity and structure remain unclear. The mai... The Fujian oyster(Crassostrea angulata) is an economically significant shellfish species distributed mainly along the Fujian coast, Southeast China. However, its genetic diversity and structure remain unclear. The main distribution area of the C. angulata is located in Fujian, South China. In total, 420 C. angulata were collected from 14 natural habitats(populations) along the Fujian coast, and their genetic diversity and structure were analyzed in the mitochondrial COI and nuclear gene ITS2 sequences. Results reveal that all the 14 populations of C. angulata exhibited high levels of genetic diversity, with a total of 57(haplotype diversity: 0.811±0.016) and 124(haplotype diversity: 0.912±0.007) haplotypes revealed by COI and ITS2, respectively. Notably, significant intermediate level of genetic differentiations between the Ningde Zhujiang(ZJ) population(FS T by COI: 0.035–0.142, P<0.05;FS T by ITS2: 0.078–0.123, P<0.05) with other populations were observed for the first time, which is also supported by the results of molecular variance analysis(FC T by COI: 0.105, P<0.05;FC T by ITS2: 0.086, P<0.05) and the clustering of the ZJ population into distinct branches in the interpopulation genetic differentiation tree. Furthermore, the evolutionary tree and haplotype network analyses do not support the formation of a clear geographical genealogical structure among these 14 populations. In addition, the population dynamics analysis suggests that the C. angulata may have undergone expansion during the third ice age of the Pleistocene. These results provide a reference for the preservation and further genetic improvement of C. angulata. 展开更多
关键词 Crassostrea angulata genetic diversity population structure mitochondrial COⅠgene nuclear gene ITS2 sequence
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The 2-adic complexity of sum sequences of Legendre sequences
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作者 JING Xiaoyan XU Zhefeng FENG Keqin 《纯粹数学与应用数学》 2025年第2期191-199,共9页
Binary sequences constructed by Legendre symbols are widely used in communication and cryptography since they have many good pseudo-random properties.In this paper,we determine the 2-adic complexity of the sum sequenc... Binary sequences constructed by Legendre symbols are widely used in communication and cryptography since they have many good pseudo-random properties.In this paper,we determine the 2-adic complexity of the sum sequence of any k many Legendre sequences and show that the 2-adic complexity of the sum sequences of any k many Legendre sequences reaches the maximum by proving the case of k=2 and 3,which implies that the sum sequences can resist the attack of rational approximation algorithm. 展开更多
关键词 2-adic complexity binary sequences Legendre symbol Legendre sequences
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Non-Abelian Extensions of Rota-Baxter Pre-Lie Algebras and Wells Exact Sequences
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作者 Shuangjian GUO Qun WANG 《Journal of Mathematical Research with Applications》 2025年第4期473-487,共15页
In this paper,we introduce non-abelian cohomology groups and classify the nonabelian extensions of Rota-Baxter pre-Lie algebras in terms of non-abelian cohomology groups.Next,we explore the inducibility of pairs of au... In this paper,we introduce non-abelian cohomology groups and classify the nonabelian extensions of Rota-Baxter pre-Lie algebras in terms of non-abelian cohomology groups.Next,we explore the inducibility of pairs of automorphisms and derive the analog Wells exact sequences under the circumstance of Rota-Baxter pre-Lie algebras.Finally,we discuss the inducibility problem of pairs of automorphisms about an abelian extensions of Rota-Baxter pre-Lie algebras. 展开更多
关键词 Rota-Baxter pre-Lie algebra non-abelian extension Wells exact sequences
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浙江省衢州市1例猴痘患者流行病学调查及基因特征分析
4
作者 杨瑞军 黄世腾 +3 位作者 吕磊 王双青 游佳玲 王晓光 《中国艾滋病性病》 北大核心 2026年第2期211-216,共6页
目的对衢州市1例猴痘患者开展流行病学处置及病原分子溯源,为衢州地区猴痘防控工作提供技术性支持。方法针对猴痘患者进行现场流行病学特征调查,并采集患者咽拭子、疱疹液、血清进行猴痘病毒核酸检测,确认阳性后进行全基因组测序,利用... 目的对衢州市1例猴痘患者开展流行病学处置及病原分子溯源,为衢州地区猴痘防控工作提供技术性支持。方法针对猴痘患者进行现场流行病学特征调查,并采集患者咽拭子、疱疹液、血清进行猴痘病毒核酸检测,确认阳性后进行全基因组测序,利用生物信息学软件进行多序列比对排列及构建进化树。结果经检测,该患者的咽拭子、疱疹液、血清标本猴痘病毒核酸检测结果均为阳性,基因序列比对及进化分析,病毒株型别属于IIb C.1.1,与广东病毒株(登录号EPI ISL 19909018、EPI ISL 19909011)亲缘关系最近,与参考基因组(NC_063383.1)相比,核苷酸同源性为99.89%,核苷酸平均遗传距离为0.001。基因编码区内发生16个氨基酸位点替换,其中OPG153编码区共发生1个氨基酸变异,2个氨基酸位点缺失;未发生氨基酸位点插入。结论衢州市猴痘患者感染的病毒与我国其他地区流行株的基因型一致,后续应持续关注病毒遗传进化情况,警惕新变异株出现。 展开更多
关键词 猴痘 猴痘病毒 全基因组测序 序列分析 生物信息学
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康复新液阴道灌洗对妇科肿瘤放疗后阴道菌群变化的影响
5
作者 王蕾娜 刘银辉 李龙婕 《中国微生态学杂志》 北大核心 2026年第1期83-88,共6页
目的研究康复新液阴道灌洗对妇科肿瘤患者放疗后阴道菌群失调的修复作用。方法选取20例妇科肿瘤放疗患者,排除10例后随机分为康复新液灌洗组(n=5)和生理盐水对照组(n=5)。采集放疗前后阴道拭子样本,通过16S rRNA基因测序和ITS测序分析... 目的研究康复新液阴道灌洗对妇科肿瘤患者放疗后阴道菌群失调的修复作用。方法选取20例妇科肿瘤放疗患者,排除10例后随机分为康复新液灌洗组(n=5)和生理盐水对照组(n=5)。采集放疗前后阴道拭子样本,通过16S rRNA基因测序和ITS测序分析细菌及真菌群落变化。结果康复新液灌洗组治疗后,阴道菌群中伯克霍尔德菌−卡巴洛菌−副伯克霍尔德菌属(Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia)丰度显著降低(t=3.219,P=0.016),乳杆菌属(Lactobacillus)丰度显著升高(t=3.291,P=0.013);对照组链球菌属(Streptococcus)丰度显著升高(t=7.999,P<0.001)。真菌群落中,假丝酵母菌属(Candida)丰度在康复新液灌洗组显著下降(t=3.984,P=0.020)。门水平上,康复新液灌洗组假单胞菌门(Pseudomonadota)丰度下降(t=3.186,P=0.018),而对照组拟杆菌门(Bacteroidota)丰度升高(t=3.429,P=0.011)。康复新液灌洗组pH值改善,阴道清洁度恢复。结论康复新液灌洗可抑制致病菌增殖、调节真菌群落及改善阴道微环境,可能有助于缓解与放射性阴道损伤相关的阴道菌群失调,显示出潜在的临床价值。 展开更多
关键词 康复新液 妇科肿瘤 放射性损伤 阴道菌群 16S rRNA基因测序 ITS测序
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2023—2024年大连市分离的布鲁氏菌基因组特征研究
6
作者 陈玉凤 周林 +2 位作者 侯君 岳雪瑶 于鹏 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2026年第1期21-26,共6页
目的研究大连市2023—2024年分离的18株布鲁氏菌基因组特征,为布鲁氏菌分子溯源、毒力基因分析以及耐药机制的研究提供数据支持。方法对大连市2023—2024年分离自患者的18株布鲁氏菌进行生化鉴定和全基因组测序,利用基因组分析软件对全... 目的研究大连市2023—2024年分离的18株布鲁氏菌基因组特征,为布鲁氏菌分子溯源、毒力基因分析以及耐药机制的研究提供数据支持。方法对大连市2023—2024年分离自患者的18株布鲁氏菌进行生化鉴定和全基因组测序,利用基因组分析软件对全基因组数据进行质控和基因组组装,同时从NCBI下载布鲁氏菌基因组序列,对组装基因组开展多位点序列分型(MLST)、全基因组单核苷酸多态性分析(whole-genome Single Nucleotide Polymorphism,wgSNP)、毒力基因和耐药基因分析。结果MLST分型结果:18株布鲁氏菌均为羊种布鲁氏菌ST8型。wgSNP结果:18株本地菌株和其他22株菌株被分为40个SNP型,所有菌株间均存在SNP差异,总SNP数为20590。通过系统发育分析,40株菌被分为3个主进化分支,2株本地菌株与呼和浩特、河北分离的菌株亲缘关系较近,位于主进化分支1上;4株本地菌株与通辽分离的菌株亲缘关系较近,位于主进化分支2上;其余12株本地菌株与其他19株菌株亲缘关系较近,均位于主进化分支3上,12株本地菌株与2株北京分离株、2株呼伦贝尔分离株位于主进化分支3的亚分支3b上,其他种的布鲁氏菌参考株均位于主进化分支3的亚分支3a上。DL230017BRU与DL231021BRU、DL240794BRU与DL240723BRU之间的SNP数均为2。18株菌株均有LPS、T4SS等13种毒力基因和adeF、Brucella suis mprF两种耐药基因。结论没有足够的流行病学信息支持这18株菌株为同一来源,且部分菌株与国内其他地区分离的菌株亲缘关系较近,但这些菌株具有潜在的致病性和耐药性,有必要开展连续监测,为布鲁氏菌病防控提供依据。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 全基因组测序 多位点序列分型 全基因组单核苷酸多态性分析 大连市
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测井沉积学研究起源、发展及时代传承 被引量:1
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作者 赖锦 杨薰 +6 位作者 宋翔羽 苏洋 王志始 黄若坤 郑欣 赵仪迪 王贵文 《地质论评》 北大核心 2026年第2期593-613,共21页
测井沉积学研究以沉积学、岩石物理学方法理论为指导,通过不同测井序列解决沉积学相关问题。为了更好地解读测井资料中蕴藏的沉积学信息,增添测井沉积学研究的活力并消除其典型研究误区,笔者等综合近几十年文献并结合作者自身工作实践,... 测井沉积学研究以沉积学、岩石物理学方法理论为指导,通过不同测井序列解决沉积学相关问题。为了更好地解读测井资料中蕴藏的沉积学信息,增添测井沉积学研究的活力并消除其典型研究误区,笔者等综合近几十年文献并结合作者自身工作实践,详细阐述了测井沉积学研究起源、发展及时代意义。首先简要回顾了测井沉积学概念的提出、发展与研究现状。通过梳理对沉积相标志响应较为灵敏的GR、SP和RT等常规测井序列,解析了常规测井相要素,地层倾角矢量模式和成像测井相模式及其与沉积相对应关系,并总结了测井沉积学研究内容及方法流程。在此基础上分析地球物理测井资料在岩性判别、沉积构造判别以及古水流系统恢复中的应用。通过常规、成像测井相结合可提取反映不同沉积微相的相标志,并指出沉积微相测井自动判别的流程与注意事项,归纳总结了测井与地质相结合的垂向沉积微相叠置序列的精细描述与评价流程。最后结合油气勘探开发历史使命指出测井沉积学研究的时代意义与发展方向。研究成果以期能够促进测井与沉积学科之间的进一步交叉融合应用,推动测井沉积学方法理论进步及其研究成果实践应用。 展开更多
关键词 测井沉积学 地球物理测井 沉积地质学 测井相 沉积微相 沉积序列
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云南及邻区M≥5.0地震序列类型特征
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作者 赵小艳 孟令媛 +1 位作者 彭关灵 王光明 《地震地质》 北大核心 2026年第1期162-180,共19页
本文根据云南及邻区1966年以来152组M≥5.0地震序列统计结果,对地震序列类型及其空间分布特征、最大余震震级和时空分布特征进行了分析,结果表明:1)研究区域地震序列以主余型为主,多震型次之,孤立型最少;同一序列类型中,随着地震震级增... 本文根据云南及邻区1966年以来152组M≥5.0地震序列统计结果,对地震序列类型及其空间分布特征、最大余震震级和时空分布特征进行了分析,结果表明:1)研究区域地震序列以主余型为主,多震型次之,孤立型最少;同一序列类型中,随着地震震级增大,主余型、多震型地震所占的比例增加,孤立型逐渐减少;对于不同破裂类型,正断型地震中,没有孤立型地震序列;逆冲型地震中,多震型的比例较高,且主要分布在滇东北地区。2)主震与最大余震震级线性回归结果显示,多震型线性相关性最好,其次是主余型,孤立型序列数据离散程度较高;最大余震的发生时间与序列类型和主震震级有一定关系;D_(1)值以红河断裂和小江断裂为界,具有明显的空间分布差异特征。3)地震序列空间分布具有较明显区域性特征,多震型比例最高的是小滇西,其次是滇东北;地震序列类型最单一的区域是滇中,相对复杂的区域为小滇西。4)多震型地震的孕震环境可能与复杂共轭的构造环境、新生断裂、上地壳低速区及历史大地震分布有一定的关系。 展开更多
关键词 地震序列类型 最大余震震级 多震型地震序列 序列空间分布特征
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融合对抗自编码器和U-net的非侵入式负荷分解方法
9
作者 王凌云 朱倍萱 +1 位作者 张涛 罗明天 《电力系统及其自动化学报》 北大核心 2026年第2期59-68,共10页
为了提高非侵入式负荷分解模型的分解效果和泛化性能,并针对现有生成式模型在非侵入式负荷分解任务中存在的一些局限性,提出一种引入变分推理思想和联合对抗机制的对抗自编码器非侵入式负荷分解方法。为保证负荷分解的实时性,采用序列... 为了提高非侵入式负荷分解模型的分解效果和泛化性能,并针对现有生成式模型在非侵入式负荷分解任务中存在的一些局限性,提出一种引入变分推理思想和联合对抗机制的对抗自编码器非侵入式负荷分解方法。为保证负荷分解的实时性,采用序列到序列映射模型。基于U-net框架构建对抗自编码器模型,在编码器与解码器之间添加跳跃连接,使模型可以同时捕获电器特征的局部细节和全局信息,实现多特征融合,避免特征丢失,同时引入实例-批归一化网络,提高模型的分解性能以及泛化性能。最后将所提模型与几种代表性模型在UK-DALE数据集上进行对比实验。结果表明:所提模型具有优秀的分解性能和泛化能力,并且更加轻量化。 展开更多
关键词 非侵入式负荷分解 对抗自编码器 深度学习 序列到序列 U-net 实例-批归一化
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动脉粥样硬化患者口腔菌群特征及炎症因子水平的关联分析
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作者 林瑜 董桐俊 +2 位作者 辛立栋 王凤云 赵明 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第1期6-12,共7页
目的探讨动脉粥样硬化(AS)患者口腔菌群多样性与炎症因子水平的特征及关联。方法纳入AS患者50例与健康对照50例,采集唾液和血样进行16S rRNA测序、IL-6、IL-1β、TNF-α、CRP检测;比较两组菌群结构与炎症指标差异,并进行Spearman相关和... 目的探讨动脉粥样硬化(AS)患者口腔菌群多样性与炎症因子水平的特征及关联。方法纳入AS患者50例与健康对照50例,采集唾液和血样进行16S rRNA测序、IL-6、IL-1β、TNF-α、CRP检测;比较两组菌群结构与炎症指标差异,并进行Spearman相关和多因素回归分析。结果AS组IL-6、IL-1β、TNF-α、CRP水平均显著高于对照组(IL-6:8.24±2.15 vs 6.15±1.76,P<0.01;CRP:7.42±2.41 vs 3.98±1.57,P<0.01);口腔菌群Shannon指数低于对照组(4.38±0.55 vs 4.61±0.52,P=0.040);Fusobacterium与CRP、IL-6正相关(r=0.41、0.36,均P<0.05)。多因素回归提示Fusobacterium丰度及IL-6、CRP水平均为AS潜在危险因素。结论AS患者口腔菌群多样性下降伴随炎症显著增高,二者或通过免疫和代谢途径相互作用,为AS的风险评估与干预策略提供新的思路。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 口腔菌群 炎症因子 16S rRNA测序
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基于全基因组测序的大肠埃希菌配对分离株分子特征分析
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作者 郑礼杰 钱费楠 +3 位作者 许金凤 姚淳 刘海冰 杜鸿 《临床检验杂志》 2026年第2期143-148,共6页
目的回顾性分析13对26株大肠埃希菌的分子特征改变。方法选取2021年6—12月期间江苏大学附属人民医院13例长期住院患者,将每例患者同一病程内前后分离的2株大肠埃希菌进行配对,采用全基因组二代测序及生物信息学方法对菌株的多位点序列... 目的回顾性分析13对26株大肠埃希菌的分子特征改变。方法选取2021年6—12月期间江苏大学附属人民医院13例长期住院患者,将每例患者同一病程内前后分离的2株大肠埃希菌进行配对,采用全基因组二代测序及生物信息学方法对菌株的多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、耐药基因及毒力基因等分子特征进行分析。结果4对(4/13,30.7%)大肠埃希菌发生了ST型的改变,且ST与cgMLST分型的改变符合率100%一致;7对(7/13,53.8%)大肠埃希菌的耐药基因发生改变,主要涉及氨基糖苷类、磺胺类、喹诺酮类、β-内酰胺类耐药基因;7对(7/13,53.8%)的毒力基因发生改变。结论短期内同一患者前后分离自相同或不同感染部位的大肠埃希菌的分子分型、耐药基因和毒力基因显示出动态变化,应加强监测,为精准诊疗提供依据。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 全基因组测序 序列分型 耐药基因 毒力基因
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鸭睾丸单细胞发育图谱构建与调控分析
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作者 陶志云 徐文娟 +7 位作者 卢立志 宋卫涛 章双杰 刘宏祥 王志成 顾昊天 朱春红 李慧芳 《中国农业科学》 北大核心 2026年第2期441-458,共18页
【目的】通过单细胞测序技术解析鸭睾丸发育成熟前后细胞异质性,构建鸭睾丸单细胞发育图谱,并进行比较分析,进一步揭示睾丸发育成熟过程和调控机制。【方法】分别收集10周龄(未成熟睾丸组,IMT)和23周龄(成熟睾丸组,MT)鸭睾丸3份,制备单... 【目的】通过单细胞测序技术解析鸭睾丸发育成熟前后细胞异质性,构建鸭睾丸单细胞发育图谱,并进行比较分析,进一步揭示睾丸发育成熟过程和调控机制。【方法】分别收集10周龄(未成熟睾丸组,IMT)和23周龄(成熟睾丸组,MT)鸭睾丸3份,制备单细胞悬液,进行单细胞测序。对获得的测序数据进行质控、标准化、降维和聚类分析,构建鸭不同发育时期睾丸图谱。对细胞亚群进行注释,并分析组间差异,筛选关键调控基因和信号通路。【结果】6个样本平均获得超过30000000高质量测序数据,经质控获得54702个有效细胞(IMT组27756个,MT组26946个)。通过细胞聚类和标记基因鉴定,成功鉴定21个细胞亚群,包含10个生殖细胞亚群和11个体细胞亚群。随着鸭睾丸发育成熟,精原干细胞、精原细胞、初级精母细胞、支持细胞1型和3型显著降低,中间型精母细胞、次级精母细胞、圆形精子细胞、长形精子细胞、支持细胞2型和4型显著增加。差异基因分析发现4495个差异基因(上调1737个,下调2758个),其中生殖细胞中Gm614、SPATC1、TSSK6、ZIC1、PHF7、Armc12和FAM166C等显著上调;在支持细胞中PKIA、SNX22、Wnt6、LAMA1、SCN4B、CDH6、FAM110C等显著下调。功能富集分析表明,TOP20 GO均属于细胞组分类别;KEGG分析提示内质网中的蛋白质加工和细胞衰老等信号通路具有关键调控作用;进一步对这两个信号通路中的差异基因进行蛋白互作网络分析显示,SEC63通过与ERLEC1、AMFR和RAD23B等相互作用调节内质网中的蛋白质加工过程,而CDK6通过CHEK2、CCNA2、CCNA1和CDC25等相互作用调节细胞衰老信号通路。【结论】首次构建了鸭睾丸发育成熟前后单细胞转录图谱,揭示睾丸发育成熟过程中细胞亚群动态变化规律,发现了大量差异表达基因,且提示SEC63和CDK6可能分别通过调控内质网中蛋白质加工和细胞周期进程在睾丸成熟机制中发挥重要作用。 展开更多
关键词 睾丸 单细胞测序 图谱构建 调控分析
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纳米孔测序技术辅助二代测序技术确认新等位基因HLADRB1^(*)12:101
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作者 陈男英 董丽娜 +3 位作者 何亿镇 陈晨 李奇 朱发明 《浙江医学》 2026年第1期49-53,共5页
目的鉴定人类白细胞抗原(HLA)新等位基因HLA-DRB1,并分析其核苷酸序列。方法基于Ion Torrent S5平台二代测序技术(NGS)检测HLA基因分型,并利用基于纳米孔测序技术平台的三代测序技术(TGS)进行确认。结果样本经NGS检测,结果为HLA-A^(*)02... 目的鉴定人类白细胞抗原(HLA)新等位基因HLA-DRB1,并分析其核苷酸序列。方法基于Ion Torrent S5平台二代测序技术(NGS)检测HLA基因分型,并利用基于纳米孔测序技术平台的三代测序技术(TGS)进行确认。结果样本经NGS检测,结果为HLA-A^(*)02:01,11:01;-B^(*)15:02,40:01;-C^(*)08:01,14:02;-DRB1^(*)12:XX,15:01;-DRB3^(*)03:01;-DRB5^(*)01:01;-DQA1^(*)01:02,06:01;-DQB1^(*)03:01,06:02;-DPA1^(*)01:03,02:02;-DPB1^(*)05:01:01G,21:01:01G。其中HLA-DRB1^(*)12:XX存在碱基突变,TGS检测确认结果一致;它与HLA-DRB1^(*)12:02:01:01比,第6外显子788位碱基G>A,导致234位编码氨基酸由甘氨酸变为谷氨酸。新等位基因序列已提交至GenBank数据库(编号为OP459299),并于2022年10月31日被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB1^(*)12:101。结论应用纳米孔测序技术辅助NGS成功确认了HLA-DRB1新等位基因,扩展了已知的HLA等位基因库,对HLA基因精准分型具有重要意义。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原-DRB1 新等位基因 二代测序技术 纳米孔测序技术 三代测序技术
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某教学医院分离的碳青霉烯类耐药肠杆菌的分子流行病学特征
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作者 郭辉 王启 +5 位作者 王宗岭 何宏 彭丽静 丛培珊 刘佶 潘华政 《中华医院感染学杂志》 北大核心 2026年第2期195-199,共5页
目的探讨某教学医院分离的碳青霉烯类耐药肠杆菌(CRE)的临床分布、耐药表型、基因型及其同源性,为耐药菌的防治提供指导。方法收集2019年12月-2024年1月青岛大学附属医院临床分离的216株CRE,对其进行菌种鉴定、药敏试验、碳青霉烯酶检... 目的探讨某教学医院分离的碳青霉烯类耐药肠杆菌(CRE)的临床分布、耐药表型、基因型及其同源性,为耐药菌的防治提供指导。方法收集2019年12月-2024年1月青岛大学附属医院临床分离的216株CRE,对其进行菌种鉴定、药敏试验、碳青霉烯酶检测及二代测序,统计分析其临床分布特点、耐药情况及其同源性。结果216株CRE菌株,以大肠埃希菌(90株)、肺炎克雷伯菌(66株)和霍氏肠杆菌(29株)为主。大肠埃希菌主要携带blaNDM-5基因,共有39种ST型,占前三位的为ST167、ST410和ST617。其中,检出1株大肠埃希菌同时携带blaIMP-8和blaNDM-5基因。肺炎克雷伯菌主要携带blaKPC-2基因,以ST11型为主。其中,1株肺炎克雷伯菌携带一种新的blaKPC基因,命名为blaKPC-223。本研究还获得了一株携带blaNDM-46基因的肺炎克雷伯菌。霍氏肠杆菌主要携带blaNDM-1基因,以ST171型为主。结论该医院分离的CRE菌株以大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和霍氏肠杆菌为主,菌株的多位点序列分型较多;本研究发现肺炎克雷伯菌携带一种新的blaKPC-223基因;经检索,携带blaNDM-46基因的肺炎克雷伯菌和同时携带blaIMP-8、blaNDM-5基因的大肠埃希菌均为首次报道。 展开更多
关键词 肠杆菌目细菌 碳青霉烯酶 耐药基因 多位点序列分型 同源性
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四川遂宁花叶、皱缩大豆病毒复合侵染分子鉴定及分析
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作者 陈诚 伏荣桃 +3 位作者 王剑 李星月 陈雪娟 卢代华 《大豆科学》 北大核心 2026年第1期124-131,共8页
为了研究四川遂宁表现出花叶、皱缩等症状的大豆是否受病毒侵染及其病毒种类,采用小RNA深度测序技术检测四川遂宁侵染大豆的病毒种类,并利用RT-PCR和序列测序分析对结果进行验证。结果显示:大豆样品受到大豆花叶病毒(Soybean Mosaic Vir... 为了研究四川遂宁表现出花叶、皱缩等症状的大豆是否受病毒侵染及其病毒种类,采用小RNA深度测序技术检测四川遂宁侵染大豆的病毒种类,并利用RT-PCR和序列测序分析对结果进行验证。结果显示:大豆样品受到大豆花叶病毒(Soybean Mosaic Virus, SMV)和菜豆普通花叶病毒(Bean Common Mosaic Virus, BCMV)的复合侵染。通过RT-PCR克隆和测序后证实上述2种病毒的存在,并以四川遂宁分离物分别命名(SMV-SCSN和BCMV-SCSN)。进一步扩增、克隆测序和组装后获得了SMV-SCSN的全基因组。系统发育分析表明,BCMV-SCSN分离物聚类在地域和寄主多样性最丰富的第V类群,且与BCMV-PStV株系具有较近的亲缘关系;SMV-SCSN与来自于韩国大豆的Anseong分离物亲缘关系最近,聚为系统发育地位独特的Clade 8类群。本研究首次报道SMV和BCMV在四川遂宁地区对大豆的复合侵染危害,为深入解析两种病毒的复合侵染机制,培育兼抗性大豆种质并开展病害防控提供参考。 展开更多
关键词 大豆 病毒 复合侵染 SMV BCMV 小RNA深度测序
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基于转录组技术挖掘高效解离难溶磷素候选基因
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作者 刘秀林 赵克臻 +8 位作者 王雪扬 宫天明 韩德志 苗丽丽 张丰屹 袁荣强 何雯瑾 王家军 张必弦 《分子植物育种》 北大核心 2026年第1期102-111,共10页
磷在土壤中多以难溶磷素形态存在,土壤有效磷素缺乏已成为制约大豆生产的关键环境因子之一。作物根系分泌物在活化难溶磷素中起重要作用,对改善土壤供磷水平、减低生产成本具有重要意义。本研究以大豆品种黑农48'为试验材料,利用转... 磷在土壤中多以难溶磷素形态存在,土壤有效磷素缺乏已成为制约大豆生产的关键环境因子之一。作物根系分泌物在活化难溶磷素中起重要作用,对改善土壤供磷水平、减低生产成本具有重要意义。本研究以大豆品种黑农48'为试验材料,利用转录组测序技术检测差异表达基因(different express genes,DEGs),共检测到2755个DEGs,其中,2506个上调表达,249个下调表达。通过差异表达基因KEGG途径分析,在3个代谢途径中共筛选出10个高效解离难溶磷素候选基因。利用RT-qPCR对候选基因进行表达验证,其中8个上调表达基因与测序结果一致,研究结果为后续开展大豆高效解离难溶磷素的分子机制研究提供重要的技术支撑。 展开更多
关键词 大豆 难溶磷素 转录组测序 差异表达基因
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甘肃玉米穗腐病病原菌种群结构及优势病原菌遗传多样性
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作者 王春明 郭成 +2 位作者 骆惠生 周天旺 洪流 《应用与环境生物学报》 北大核心 2026年第1期98-112,共15页
为明确甘肃玉米穗腐病病原菌的种群构成、数量、地域分布和优势病原菌遗传多样性,于2020至2021年在甘肃省11个市(州)收集36份玉米穗腐病样品,结合形态学特征、EF-1α基因序列分析、田间致病性测定和ISSR标记技术的方法对病原菌种类、分... 为明确甘肃玉米穗腐病病原菌的种群构成、数量、地域分布和优势病原菌遗传多样性,于2020至2021年在甘肃省11个市(州)收集36份玉米穗腐病样品,结合形态学特征、EF-1α基因序列分析、田间致病性测定和ISSR标记技术的方法对病原菌种类、分离频率和遗传结构等进行了鉴定和统计分析.结果表明,分离获得的8种镰孢菌均可引起玉米穗腐病,其分离频率分别为拟轮枝镰孢(Fusarium verticillioides)68.49%、层出镰孢(F.proliferatum)19.18%、胶孢镰孢(F.subglutinans)6.85%、布氏镰孢(F.boothii)2.40%、禾谷镰孢(F.graminearum)1.71%、温带镰孢(F.temperatum)0.69%、梨孢镰孢(F.poae)0.34%和新知镰孢(F.andiyazi)0.34%;拟轮枝镰孢和层出镰孢在甘肃四大生态区均有分布,其余种群仅在部分生态区分布,其中拟轮枝镰孢为甘肃玉米穗腐病优势病原菌;利用PopGen32软件分析发现甘肃省3个生态区拟轮枝镰孢菌间的亲缘关系相近,遗传距离在0.0086~0.0393之间;利用NTSYS-pcversion 2.10软件对供试的57个菌株进行聚类分析,结果显示在遗传相似系数为0.79时,将供试菌株划分为3个类群.通过进一步分析发现各生态区不同县区的菌株在聚类分析图的各个分支均有分布.本研究表明甘肃省玉米穗腐病优势镰孢菌拟轮枝镰孢遗传多样性与地理来源之间无明显相关性,研究结果可为该病害的病情测报和分区防治提供理论依据.(图6表6参40) 展开更多
关键词 玉米 穗腐病 致病性 ISSR 遗传多样性
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特定碳水化合物饮食对儿童炎症性肠病炎症标志物及肠道菌群影响分析
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作者 薛宁 魏绪霞 +3 位作者 唐运萍 杨露 符晓莉 张乐 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第2期169-175,共7页
目的通过对比分析特定碳水化合物饮食(SCD)干预前后炎症性肠病(IBD)患儿临床常用炎症标志物及肠道菌群变化,探讨SCD对IBD患儿炎症标志物及肠道菌群的影响。方法选取2021年6月-2024年9月在山东大学儿童医院收治的临床诊断为IBD患儿(轻度)... 目的通过对比分析特定碳水化合物饮食(SCD)干预前后炎症性肠病(IBD)患儿临床常用炎症标志物及肠道菌群变化,探讨SCD对IBD患儿炎症标志物及肠道菌群的影响。方法选取2021年6月-2024年9月在山东大学儿童医院收治的临床诊断为IBD患儿(轻度)作为研究对象,连续给予SCD干预治疗1个月,按治疗前后分为干预前组和干预后组,同期选取本院儿童保健科体检的同年龄段健康儿童为健康对照组,采用16SrDNA扩增子测序的方法检测各组肠道菌群的组成并分析其结果;同时,检测各组炎症标志物的水平并分析结果。结果IBD患儿SCD干预后较干预前血白细胞计数(Z=-1.979,P=0.048)、血小板计数(Z=-2.726,P=0.006)、CRP(Z=-3.68,P=0.000)、IL-6(t=-3.028,P=0.000)、IL-17(t=-7.025,P=0.000)、TNF-α(t=-4.003,P=0.001)、FC(Z=-3.92,P=0.000)均明显下降。肠道菌群结果分析显示,各组Alpha多样性差异无统计学意义(P>0.05);Beta多样性分析中,主坐标分析显示IBD患儿肠道菌群结构与健康组差异较大。在门水平中,厚壁菌门是健康对照组及干预后组最重要的菌门(42.1%,62.8%),变形菌门是干预前组最重要的菌门(42.7%);SCD干预后厚壁菌门丰度较健康对照组(Z=2.417,P=0.047)明显升高。在属水平中,健康对照组、干预前组、干预后组优势菌属依次为双歧杆菌属(26.34%)、埃希氏杆菌属(26.42%)、埃希氏杆菌属(11.7%)。在丰度排名前10的菌属中,干预后组瘤胃球菌属丰度较干预前组明显升高(Z=3.13,P=0.005)。LEfse分析结果显示健康儿童肠道菌群以双歧杆菌科、双歧杆菌属等为主要差异标志物种;而IBD患儿(干预前组)以肠杆菌科、链球菌属等为主要差异标志物种;瘤胃球菌属是干预后组重要的差异标志物种。结论儿童IBD存在肠道菌群紊乱的情况,SCD可以减轻患儿体内炎症反应,改善肠道菌群结构,对临床有辅助治疗作用。 展开更多
关键词 儿童 炎症性肠病 特定碳水化合物饮食 炎症标志物 肠道菌群
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不同覆盖对寒地苹果园土壤微生物群落结构和多样性的影响
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作者 胡颖慧 杨悦 +4 位作者 顾广军 卜海东 刘畅 于文全 陈雪 《中国农业科技导报(中英文)》 北大核心 2026年第1期223-231,共9页
为探究不同覆盖措施对寒地苹果园土壤微生物群落组成、相对丰度及多样性的影响,以寒地‘龙丰’苹果园为研究对象,采用高通量测序技术,以清耕为对照,研究4种覆盖(稻草、玉米秸秆、食用菌菌渣和园艺地布)下土壤细菌和真菌的群落结构、物... 为探究不同覆盖措施对寒地苹果园土壤微生物群落组成、相对丰度及多样性的影响,以寒地‘龙丰’苹果园为研究对象,采用高通量测序技术,以清耕为对照,研究4种覆盖(稻草、玉米秸秆、食用菌菌渣和园艺地布)下土壤细菌和真菌的群落结构、物种差异及多样性。结果表明,园艺地布覆盖显著提高了细菌放线菌门以及真菌担子菌门相对丰度;秸秆和菌渣覆盖提高了细菌变形菌门、拟杆菌门和粘菌门以及真菌子囊菌门的相对丰度,显著降低细菌芽单胞菌门以及真菌担子菌门和被孢霉门相对丰度。Beta多样性分析表明,秸秆和菌渣覆盖下土壤细菌和真菌群落结构更相似,与对照存在明显差异。Alpha多样性分析表明,菌渣覆盖下土壤细菌和真菌丰富度以及多样性指数较对照均显著提高,园艺地布覆盖显著提高了土壤细菌丰富度指数;土壤真菌多样性指数在不同覆盖处理下均显著提高,有机物覆盖显著提高土壤真菌丰富度指数。综上可知,覆盖措施显著影响了寒地苹果园土壤微生物群落结构,并不同程度提高了土壤微生物多样性,其中菌渣覆盖的效果最好。研究结果为寒地苹果园覆盖栽培技术的研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 覆盖 寒地 苹果园 高通量测序 土壤微生物
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基于DAT-MIGAN模型的化工过程数据填充方法
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作者 耿志强 李嘉骏 +3 位作者 魏微 韩永明 胡渲 王孟志 《化工学报》 北大核心 2026年第2期752-759,共8页
化工过程具有高温、强腐蚀等复杂工况,易导致传感器失效、信号异常等问题,从而引起长时间序列数据缺失。而传统统计填充和机器学习方法难以同时捕捉全局趋势与局部特征,无法有效应对该问题。为此,本论文提出了一种融合深度自适应Transfo... 化工过程具有高温、强腐蚀等复杂工况,易导致传感器失效、信号异常等问题,从而引起长时间序列数据缺失。而传统统计填充和机器学习方法难以同时捕捉全局趋势与局部特征,无法有效应对该问题。为此,本论文提出了一种融合深度自适应Transformer(deep adaptive transformer,DAT)与生成式对抗网络(MIGAN)的DAT-MIGAN数据填充方法。该方法利用DAT弥补MIGAN在学习短期和长期依赖上的不足,并在潜在空间融合多尺度注意力特征,构建全局-局部协同的缺失值估计网络,从而实现对长序列缺失数据的更精准填充。田纳西-伊斯曼(Tennessee Eastman,TE)数据集与化工装置生产数据实验表明,所提DAT-MIGAN算法能有效应对化工过程中长序列数据中的复杂缺失模式,显著提高了化工行业长序列缺失数据的填充准确度。 展开更多
关键词 算法 神经网络 数据填充 预测 长序列缺失
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