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利用eDNA技术分析马鞍列岛海藻场表层沉积物中大型海藻的组成
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作者 邹俏 王凯 王玉清 《应用生态学报》 北大核心 2025年第1期303-310,共8页
大型海藻死亡或脱落后通过碎屑的形式最终沉积进入海底,追踪它们的分布对于了解海藻对沉积物的贡献至关重要。为确定沉积物中大型海藻的种类组成和分布,本研究采用环境DNA技术分析了马鞍列岛海洋特别保护区4个典型岛礁海域东绿华(DLH)... 大型海藻死亡或脱落后通过碎屑的形式最终沉积进入海底,追踪它们的分布对于了解海藻对沉积物的贡献至关重要。为确定沉积物中大型海藻的种类组成和分布,本研究采用环境DNA技术分析了马鞍列岛海洋特别保护区4个典型岛礁海域东绿华(DLH)、西绿华(XLH)、鳗头山(MTS)和鳗对山(MDS)的表层沉积物。在沉积物样品中共检测出大型藻类18目,其中红藻门13目21科23属,褐藻门5目5科5属,在科分类水平上,以珊瑚藻科、混石藻科、网地藻科和马尾藻科占优势,大型藻类操作分类单元(OTU)序列数占沉积物样本OTU序列数的37.2%。非度量多维尺度排序(NMDS)和相似性分析(ANOSIM)表明,不同站位沉积物中大型藻类的组成相似。研究表明,红藻是该海域沉积物中的优势藻类,沉积物中的大型藻类组成符合海藻场海藻分布特征,eDNA技术在分析沉积物中大型海藻的组成上具有一定的可行性,可以为大型海藻的多样性监测和藻场生态保护管理提供数据支持。 展开更多
关键词 马鞍列岛 海藻场 沉积物 大型海藻 edna技术
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海草床生态系统环境DNA研究进展
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作者 沈捷 赖文婷 +4 位作者 蔡泽富 贾舒雯 张剑 黎夏敏 陈石泉 《广西科学》 北大核心 2026年第1期1-13,共13页
海草床是海洋典型的高生产力生态系统之一,具有维持生物多样性、净化水体环境、固碳储碳等核心生态功能,其生态状况对海洋生态系统稳定与功能发挥具有关键意义。环境DNA(environmental DNA,eDNA)技术作为一种非侵入性生物监测手段,突破... 海草床是海洋典型的高生产力生态系统之一,具有维持生物多样性、净化水体环境、固碳储碳等核心生态功能,其生态状况对海洋生态系统稳定与功能发挥具有关键意义。环境DNA(environmental DNA,eDNA)技术作为一种非侵入性生物监测手段,突破了传统海草床监测方法的技术局限,为海草床生态系统的精准研究与综合评估提供了全新技术路径。本文系统梳理了海草床生态系统研究中eDNA技术的基础理论与方法体系,涵盖海草及共生生物eDNA的生物学特性、样本采集与预处理、提取与检测技术及数据分析验证方法;全面阐述了该技术在物种多样性监测、生态健康与环境胁迫评估、生物量与分布动态监测、生态扰动与入侵物种监测等核心领域的研究进展,同时总结了其在海草床碳汇潜力评估、沉积物eDNA历史演变解析等前沿方向的应用成果;深入剖析了当前海草床生态系统eDNA研究面临的生境基质干扰、方法标准化缺失、本土参考序列数据库不足等关键挑战,并针对性提出技术优化、流程规范、数据库建设等解决策略;最后展望了eDNA技术与遥感、人工智能(AI)等技术集成融合,在海草床生态保护修复、监测网络构建、跨学科研究等领域的应用前景,旨在为海草床生态系统的科学保护、可持续管理及相关研究的深入开展提供理论参考与技术支撑。 展开更多
关键词 海草床生态系统 环境DNA(edna) 生物监测 碳汇评估 沉积物edna 生态保护
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对虾养殖池塘沉积物中IHHNV DNA检测方法的评估与应用
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作者 吕若萱 王秀华 +6 位作者 王美凤 连新宇 李晨 许华 尹伟力 贾鹏 杨冰 《渔业科学进展》 北大核心 2025年第3期160-169,共10页
对虾传染性皮下和造血组织坏死病毒(IHHNV)是虾类疫病重要病原之一,对对虾养殖业造成危害,其主要检测方法通常通过捕获个体进行分子生物学检测。环境DNA(eDNA)技术可直接从环境样本中快速、经济地监测到目标病原,在水生动物病原检测方... 对虾传染性皮下和造血组织坏死病毒(IHHNV)是虾类疫病重要病原之一,对对虾养殖业造成危害,其主要检测方法通常通过捕获个体进行分子生物学检测。环境DNA(eDNA)技术可直接从环境样本中快速、经济地监测到目标病原,在水生动物病原检测方面的应用得到快速发展。为了评估eDNA技术检测虾类疾病病原IHHNV的有效性和可行性,本研究以不同粒径底质池塘沉积物作为研究对象,结合3种试剂盒进行提取条件优化,评估不同底质下eDNA的提取效果,利用荧光定量PCR检测方法检测IHHNV最低核酸检出量。结果显示,优化的方法对于沙底沉积物中IHHNV的检测灵敏度可达1.52×10^(2)copies/μL,泥底沉积物中IHHNV的检测灵敏度为1.32×10^(2)copies/μL,该方法灵敏度较高,方便可行,不同的池塘沉积物成分最低检测限浓度相差不到一个数量级,对提取效果差异不明显,可用于沉积物中IHHNV的检测。应用优化的eDNA技术和养殖对虾组织样品qPCR方法对养殖环境中IHHNV的存在情况进行调查。结果显示,调查点养殖池塘沉积物和养殖对虾样品中均有IHHNV检出,且存在一定对应关系。该研究对对虾养殖池塘沉积物中IHHNV DNA检测方法的评估与应用提供了可靠的技术手段,为监测养殖动物健康状态提供了科学依据,同时丰富并完善了eDNA方法在虾类病原监测中的应用。 展开更多
关键词 IHHNV 环境DNA 沉积物
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沉积物和流速对环境DNA持久性的影响 被引量：1
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作者 王玉蓉 王媛媛 文茄汀 《中国农村水利水电》 北大核心 2024年第8期1-7,共7页
环境DNA(Environmental DNA,eDNA)技术作为河流健康评价的关键工具,在水生生态系统生物分析中表现出极大的应用潜力。然而,eDNA与广泛存在于水体中的沉积物的关系非常复杂,同时也受到水流的影响,这严重限制了eDNA技术的推广和应用。研... 环境DNA(Environmental DNA,eDNA)技术作为河流健康评价的关键工具,在水生生态系统生物分析中表现出极大的应用潜力。然而,eDNA与广泛存在于水体中的沉积物的关系非常复杂,同时也受到水流的影响,这严重限制了eDNA技术的推广和应用。研究以中国重要淡水养殖鱼类草鱼为对象,探讨水流和沉积物对草鱼eDNA持久性的影响。结果显示:①在流动水体中,eDNA降解速度随流速增加而加快;②沉积物的存在则加速了eDNA的降解过程,与沉积物铺设厚度相比,沉积物粒径对eDNA持久性的影响更为显著;③在静水中,eDNA降解速度随沉积物粒径增大而减缓,但在流动水中,水流干扰导致了相反的eDNA降解模式,即eDNA的降解速度随着沉积物粒径的增大而加快。研究突显了在eDNA实验设计及解释中考虑沉积物特性的重要性,对于eDNA技术在水生生态系统应用提供了宝贵参考。 展开更多
关键词 edna 沉积物 持久性 降解率 流速
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