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SAGES巡天观测规划策略及程序
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作者 郑捷 王炜 +2 位作者 范舟 李春 赵刚 《天文学进展》 CSCD 北大核心 2024年第4期698-708,共11页
SAGES是基于不同站点不同能力的多台望远镜进行的北天多波段测光巡天,目前正在持续推进中。全球各类测光巡天很多,大部分都有相应的巡天观测策略。为高效完成巡天任务、实现巡天观测科学目标,制定了SAGES巡天观测总体策略,编写了巡天观... SAGES是基于不同站点不同能力的多台望远镜进行的北天多波段测光巡天,目前正在持续推进中。全球各类测光巡天很多,大部分都有相应的巡天观测策略。为高效完成巡天任务、实现巡天观测科学目标,制定了SAGES巡天观测总体策略,编写了巡天观测规划软件。该软件在实践中运行效果良好,有力支持了SAGES巡天观测。简要介绍SAGES巡天的观测策略、规划程序的结构以及主要功能、使用方法和输出结果等内容。目前该程序仍在为SAGES巡天后续的观测提供支持。 展开更多
关键词 巡天 sages 观测规划 规划程序
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Construction of the Genealogy of Eccentric Monks Based on the Historical Materials of Chan Buddhism in the Song Dynasty--From Enlightened Masters in Chan Buddhism,Sages,to Saints
2
作者 Jing-Jia Huang 《Cultural and Religious Studies》 2024年第8期501-511,共11页
Regarding the Chan Buddhism lamp records from the Song Dynasty and starting from Jing De Zhuan Deng Lu,the category of“enlightened masters in Chan Buddhism”禪門達者was listed separately,meaning a separate category w... Regarding the Chan Buddhism lamp records from the Song Dynasty and starting from Jing De Zhuan Deng Lu,the category of“enlightened masters in Chan Buddhism”禪門達者was listed separately,meaning a separate category was established for eccentric monks who pretended to be crazy,had unknown inheritance and miraculous deeds,and were difficult to classify.The following lamp records named this category of eccentric monks as“sages”散聖,or“saints”應化聖賢,which constructed another historical genealogy for the special Chan Buddhism eccentric monks.Moreover,the early lamp records included mostly idiosyncratic mad monks from previous dynasties.Since the Southern Song Dynasty,Chan Buddhism historical materials included many sages from the current dynasty.Therefore,this study mainly examines how the genealogy of Chan Buddhism eccentric monks was constructed in Song Dynasty Chan Buddhism lamp records,including quotations,and organizes the images of eccentric monks in the Song Dynasty,as written in Chan Buddhism historical materials,in order that the meaning of existence of these enlightened masters,sages,saints,etc.,included in the genealogy of Song Dynasty eccentric monks in the history of Chan Buddhism can be reflected. 展开更多
关键词 genealogy of eccentric monks enlightened masters in Chan Buddhism sages in Chan Buddhism saints in Chan Buddhism Song Dynasty
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A Summary of the Research on the Rural Sages Culture
3
作者 LI Xiao-rong 《Journal of Literature and Art Studies》 2018年第11期1581-1587,共7页
As a cultural phenomenon rooted in the traditional rural society China,rural sages culture has played an important role in the inheritance of civilization and social stability.The new period,rural sages culture helps ... As a cultural phenomenon rooted in the traditional rural society China,rural sages culture has played an important role in the inheritance of civilization and social stability.The new period,rural sages culture helps to cultivate rural civilization and promote the development of rural economy and rural social stability.In the process of innovation and development of rural sages culture,across the rural have all made great achievements,which initiatives in Zhejiang and Guangdong province is typical.On this basis,the mechanism to play rural sages’role mainly includes:researching rural sages culture,strengthening the construction of the scholarly society,attracting rural sages regression and remodeling of the rural elite etc. 展开更多
关键词 SUMMARY RESEARCH RURAL SAGE CULTURE
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Creating the Role of Rural Teachers as New Rural Sages under the Background of Rural Revitalization Based on Organizational Change and Planned Happenstance Theories
4
作者 LIN Jiangfeng YANG Shuai SHAN Yingyu 《Journal of Landscape Research》 2023年第6期65-68,72,共5页
In the context of rural revitalization,people are re-examining the issue of creating the role of teachers as“new rural sages”.However,most of previous studies ignored the school organizational change in the process ... In the context of rural revitalization,people are re-examining the issue of creating the role of teachers as“new rural sages”.However,most of previous studies ignored the school organizational change in the process of reform.The planned happenstance suggests that teachers should maintain a positive mindset about the eventualities in their careers.Based on the organizational change theory,this paper gave some advice to help teachers in playing a role of new rural sages:①rooting in local culture and enhancing teachers’sense of belonging,②providing compensation for teachers in a targeted way,and③providing a comprehensive and objective evaluation mechanism for ensuring teachers’participation in social governance. 展开更多
关键词 Rural teacher School organizational reform Planned happenstance theory New rural sage
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PySAGES:flexible,advanced sampling methods accelerated with GPUs
5
作者 Pablo F.Zubieta Rico Ludwig Schneider +12 位作者 Gustavo R.Pérez-Lemus Riccardo Alessandri Siva Dasetty Trung D.Nguyen Cintia A.Menéndez Yiheng Wu Yezhi Jin Yinan Xu Samuel Varner John A.Parker Andrew L.Ferguson Jonathan K.Whitmer Juan Jde Pablo 《npj Computational Materials》 CSCD 2024年第1期2877-2888,共12页
Molecular simulations are an important tool for research in physics,chemistry,and biology.The capabilities of simulations can be greatly expanded by providing access to advanced sampling methods and techniques that pe... Molecular simulations are an important tool for research in physics,chemistry,and biology.The capabilities of simulations can be greatly expanded by providing access to advanced sampling methods and techniques that permit calculation of the relevant underlying free energy landscapes.In this sense,software that can be seamlessly adapted to a broad range of complex systems is essential.Building on past efforts to provide open-source community-supported software for advanced sampling,we introduce PySAGES,a Python implementation of the Software Suite for Advanced General Ensemble Simulations(SSAGES)that provides full GPU support for massively parallel applications of enhanced sampling methods such as adaptive biasing forces,harmonic bias,or forward flux sampling in the context of molecular dynamics simulations.By providing an intuitive interface that facilitates the management of a system’s configuration,the inclusion of new collective variables,and the implementation of sophisticated free energy-based sampling methods,the PySAGES library serves as a general platform for the development and implementation of emerging simulation techniques.The capabilities,core features,and computational performance of this tool are demonstrated with clear and concise examples pertaining to different classes of molecular systems.We anticipate that PySAGES will provide the scientific community with a robust and easily accessible platform to accelerate simulations,improve sampling,and enable facile estimation of free energies for a wide range of materials and processes. 展开更多
关键词 PYTHON SAGE COLLECTIVE
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Large Language Model (LLM-ChatGPT) and Learner Autonomy: Teaching Present Simple Tense as a Model
6
作者 Hasan Mohammed Saleh Jaashan 《Open Journal of Applied Sciences》 2025年第2期450-462,共13页
Learner autonomy stands on the top priorities of scholars due to its pivotal role in fostering student-centered learning methods. It empowers the learners to be in charge of their learning process and be the center of... Learner autonomy stands on the top priorities of scholars due to its pivotal role in fostering student-centered learning methods. It empowers the learners to be in charge of their learning process and be the center of attention in language learning education. For this purpose, different AI tools were used and implemented in pedagogy to narrow the divide in promoting learning/teaching approaches. This study aims to gauge the impact of using LLM-ChatGPT to teach EFL learners the present simple tense autonomously via providing automated feedback, and chances for regular drillings without over reliance on teacher. It also aims to investigate the EFL learners’ perception of using LLM-ChatGPT as a reinforcement approach to learner autonomy. A cohort comprising 50 EFL learners would participate in the study and a between subject design method using control and experimental groups would be implemented. The findings of the study indicated that learners who were taught present simple tense’s rule through using LLM-ChatGPT application, with less teacher’s dominance, scored grades similar to those who were taught the same tense’s rule by the teacher (sage on the stage approach). This substantiates the idea that LLM-Chat GPT acts a role akin to teachers in teaching grammatical rules. Moreover, the learners felt that LLM-ChatGPT application had a positive impact on fostering autonomous learning. 展开更多
关键词 Learner Autonomy LLM-ChatGPT Sage on the Stage Approach EFL Learners E-Learning Student-Centered Approach
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Predicting survival in atrial fibrillation: results from SAGE-AF
7
作者 David C Parish Catarina I Kiefe +3 位作者 Jordy Mehawej Edith Mensah Otabil Carly N Beniek Francis C Dane 《Journal of Geriatric Cardiology》 2025年第3期344-350,共7页
Background Using Systematic Assessment of Geriatric Elements in Atrial Fibrillation(SAGE-AF) data, determine how well the rich mix of demographic, clinical history, geriatric assessments, and clinically adjudicated ev... Background Using Systematic Assessment of Geriatric Elements in Atrial Fibrillation(SAGE-AF) data, determine how well the rich mix of demographic, clinical history, geriatric assessments, and clinically adjudicated events can predict two-year survival.Methods Subjects were recruited from participating outpatient practices if they had non-valvular AF, were 65 or over with CHA_(2)DS_(2)-VASc scores of at least 2, and were candidates for anticoagulation. Demographics, clinical history, and geriatric qualities of life were assessed by interview and medical records review using standardized protocols and repeated at one and two years. Events identified were abstracted and submitted for adjudication using standard definitions of events and categories. Nonmortality event categories included hospitalizations(cardiovascular, bleeding, other), bleeding(major, clinically relevant non-major, minor), and seven major adverse cardiovascular events.Results The 1245 subjects experienced 1960 events, primarily hospitalizations(935) and/or bleeding(817);114 subjects(9.2%)died during two years of follow-up. Events initially abstracted to more than one category(172) were combined, resulting in 1788unique incidents. Most subjects had zero or one event(69%) and fewer than 7% had more than 3 types. Most variables were significant in bivariate analysis. Using multiple logistic regression with two-year survival as the outcome variable, the best-fit model included event number and type, number of unique incidents, and number of bleeding events(R^(2) = 0.511, C = 93.1) with sensitivity = 97.9% and specificity = 44.7%.Conclusions Two-year survival was high. This model, if validated, could have major implications for treatment of patients with AF. Patients in the large group with no or one event are at very low risk of death(under 2%). The small group with high risk for further complications, including death, deserve reassessment to determine if this trajectory can be altered. 展开更多
关键词 geriatric qualities systematic assessment geriatric elements clinical history predictive factors atrial fibrillation sage af geriatric assessments SURVIVAL atrial fibrillation
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液氦温区大冷量GM制冷机仿真及参数分布研究 被引量:4
8
作者 巢伟 赵钦宇 +2 位作者 李睿泽 王博 甘智华 《低温工程》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期57-63,共7页
为提高液氦温区GM制冷机制冷效率,加快产品迭代速度,采用Sage仿真软件对鹏力超低温生产的一台KDE420两级GM制冷机进行了整机建模,该制冷机由两台KDC6000V压缩机并联驱动,模拟结果显示该制冷机一、二级分别可获得71.6 W@50 K、2.6 W@4.2 ... 为提高液氦温区GM制冷机制冷效率,加快产品迭代速度,采用Sage仿真软件对鹏力超低温生产的一台KDE420两级GM制冷机进行了整机建模,该制冷机由两台KDC6000V压缩机并联驱动,模拟结果显示该制冷机一、二级分别可获得71.6 W@50 K、2.6 W@4.2 K制冷量,与实验测试结果基本一致。同时对模型中整机(火用)损失情况、膨胀机内温度和(火用)流分布等进行了系统分析。分析表明:进入二级回热器的(火用)占一级膨胀腔(火用)的69.5%,二级回热器铅丸段温度梯度过高,通过优化二级回热填料可进一步提高制冷性能。 展开更多
关键词 液氦温区 GM制冷机 SAGE (火用)损失
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Variation in the Composition of the Essential Oil of Commercial Salvia officinalis L.Leaves Samples from Different Countries 被引量:1
9
作者 Ain Raal Anne Orav +4 位作者 Tetiana Ilina Alla Kovalyova Taras Koliadzhyn Yuliia Avidzba Oleh Koshovyi 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2024年第8期2051-2062,共12页
Salvia officinalis L.(Lamiaceae)leaves and its essential oil is used for mouth and throat disorders,skin disorders,minor wounds,and gastrointestinal disorders,and is widely used worldwide.The research aimed to conduct... Salvia officinalis L.(Lamiaceae)leaves and its essential oil is used for mouth and throat disorders,skin disorders,minor wounds,and gastrointestinal disorders,and is widely used worldwide.The research aimed to conduct a comparative study of the composition of S.officinalis essential oils from commercial samples,and their main chemotypes.The volatile constituents from S.officinalis leaves were investigated using gas chromatography(GC).The commercial samples of sage leaves were obtained from retail pharmacies in nine mainly European countries.The yield of essential oil in S.officinalis commercial leaves was between 10.0 and 24.8 mL/kg.The principal components(>5%)among the main identified 25 compounds were 1,8-cineole(8.3%–45.3%),α-thujone(3.0%–34.0%),сamphor(11.3%–29.3%),β-thujone(1.5%–12.9%),viridiflorol(1.1%–10.4%),camphene(2.6%–7.1%),andα-pinene(1.3%–5.8%).In seven(Estonia,England,France,Hungary,Belgium,Ukraine,Georgia)samplesα-thujone dominated.Four samples(Estonia,Georgia,England,Hungary)belong to the most common chemotypeα-thujone>camphor>1,8-cineole.Eight chemotypes of S.officinalis essential oils have been found.Toxic thujones are widespread compounds among them. 展开更多
关键词 SAGE TERPENOIDS CHEMOTYPES thujone TOXICITY
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论动态自适应滤波 被引量:190
10
作者 杨元喜 何海波 徐天河 《测绘学报》 EI CSCD 北大核心 2001年第4期293-298,共6页
动态导航与定位的质量取决于对动态载体扰动和观测异常扰动的认知和控制。本文首先介绍了目前广泛使用的 Sage自适应滤波 ,讨论了自适应滤波的残差向量、新息向量及状态参数预报值残差向量的解析关系 ,以及它们之间的协方差矩阵之间的关... 动态导航与定位的质量取决于对动态载体扰动和观测异常扰动的认知和控制。本文首先介绍了目前广泛使用的 Sage自适应滤波 ,讨论了自适应滤波的残差向量、新息向量及状态参数预报值残差向量的解析关系 ,以及它们之间的协方差矩阵之间的关系 ;分析了基于新息向量、残差向量和状态参数预报值残差向量的自适应协方差估计存在的问题。对新近发展起来的抗差滤波、Sage自适应滤波及抗差自适应滤波进行了综合比较与分析 ,结果表明抗差自适应滤波解算理论与方法除自适应地估计载体状态预报向量的协方差矩阵外 ,还能自适应地估计任意历元观测量的权。计算结果证实 ,抗差自适应滤波不仅计算简单 ,而且能有效地控制观测异常和载体状态扰动异常对动态系统参数估值的影响。 展开更多
关键词 Sage滤波 自适应估计 抗差估计 动态系统 动态导航 动态定位 GPS 残差 噪声
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磁共振频谱数据定量后处理技术比较 被引量:13
11
作者 郭绣琴 肖叶玉 +4 位作者 沈智威 徐志锋 庞丽 宁立波 吴仁华 《磁共振成像》 CAS 2010年第2期126-129,共4页
目的比较磁共振频谱定量的三种常用后处理软件(LCModel、SAGE、Functool)对代谢物含量估计的准确性。方法14例健康成年人,平均年龄为26.1岁。使用STEAM序列进行定量检测,实验参数为TE=30ms,TR=3000ms。结果三种软件处理结果中除NAA/Cr外... 目的比较磁共振频谱定量的三种常用后处理软件(LCModel、SAGE、Functool)对代谢物含量估计的准确性。方法14例健康成年人,平均年龄为26.1岁。使用STEAM序列进行定量检测,实验参数为TE=30ms,TR=3000ms。结果三种软件处理结果中除NAA/Cr外,Cho/Cr、mI/Cr的比值相互间存在差异。LCModel软件分析得到Cho/Cr比值与文献偏差明显。使用Functool软件进行分析发现,NAA/Cr、mI/Cr比值与文献结果间存在偏差。使用SAGE软件对频谱的波峰下面积分析并计算出比值,得出Cho/Cr、mI/Cr与文献结果存在差异。结论使用LCModel软件对于磁共振频谱进行定量处理,在基线的拟合及系统误差处理方面较SAGE软件及Functool软件有优势,但LCModel对代谢物浓度估算仍存在误差。 展开更多
关键词 磁共振频谱学 STEAM LCMODEL Functool SAGE 定量
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一种数值稳定的次优并行Sage自适应滤波器 被引量:18
12
作者 刘广军 吴晓平 郭晶 《测绘学报》 EI CSCD 北大核心 2002年第4期283-288,共6页
提出了一种新的次优Sage自适应Kalman滤波算法。该算法通过对滤波器发散的综合抑制 ,有效提高了滤波器的数值稳定性。针对经典次优Sage滤波器经常存在结果偏移现象 ,设计了一种附加伴随滤波器的并行滤波结构 ,消除了结果偏移 。
关键词 卡尔曼滤波 自适应 Sage滤波 动态数据处理 数学模型 噪声
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转录组平台技术及其在代谢工程中的应用 被引量:23
13
作者 史硕博 陈涛 赵学明 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期1187-1198,共12页
组学技术在系统水平上对细胞代谢进行全面的分析,极大地促进了代谢工程的发展和应用。全基因组水平的转录分析可以使研究者更加精确地评估细胞表型,加深对细胞代谢的理解。而且转录组分析也有助于研究者鉴定菌种改良的目标基因,加速对... 组学技术在系统水平上对细胞代谢进行全面的分析,极大地促进了代谢工程的发展和应用。全基因组水平的转录分析可以使研究者更加精确地评估细胞表型,加深对细胞代谢的理解。而且转录组分析也有助于研究者鉴定菌种改良的目标基因,加速对微生物细胞工厂的合理设计及构建。文中介绍了3种主要转录组平台技术的原理,并总结了转录组学在代谢工程领域中应用的最新进展和未来发展趋势。 展开更多
关键词 转录组 代谢工程 基因芯片 SERIAL analysis of gene expression(SAGE) massively parallel signature sequencing(MPSS) RNA-seq
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肝癌相关cDNA片段的快速克隆和表达 被引量:8
14
作者 赵弘智 梁平 +2 位作者 李靖 李洪艳 黄小兵 《世界华人消化杂志》 CAS 2004年第8期1785-1788,共4页
目的:克隆原发性肝癌相关新基因. 方法:利用抑制消减杂交法(suppression subtractive hybridi- zation,SSH)已经发现了1条新的肝癌相关基因片断表达序列标签(EST),长447 bp,经Genebank检索,90%无同源性.在其保守序列区设计了2条用于3’R... 目的:克隆原发性肝癌相关新基因. 方法:利用抑制消减杂交法(suppression subtractive hybridi- zation,SSH)已经发现了1条新的肝癌相关基因片断表达序列标签(EST),长447 bp,经Genebank检索,90%无同源性.在其保守序列区设计了2条用于3’Race扩增的寡聚核苷酸引物(3’GSP2:5’-CGCATAGTACCAGTATCGAC AAAGG-3’,3’NGSP2:5’-TCCACATTACGGACC CGACGGATT-3’),利用cDNA末端快速扩增法(RACE) 进一步克隆该基因的全长cDNA序列.人原发性肝癌细胞株HepG2,体外传代培养,培养基为RPMI1640培养基.提取HepG2总RNA,方法参照SV Total RNA Isolation System 的说明进行.RACE法扩增采用Clontech公司的Smart TM Race cDNA Amplification Kit.将3’RACE-PCR扩增的目的片段以Race自带的产物纯化试剂盒进行纯化、回收,然后将其克隆到PMD 18-T Vector中,提纯质粒后进行酶切鉴定,确认质粒内有插入片段,由宝生物工程(大连)有限公司协助完成测序.将克隆所得cDNA片段用NCBI 提供的BLASTN与GeneBank的dbEST、nr数据库进行同源性比较,确认代表新基因的EST并且登录GeneBank (http://www.ncbi.nlm.nih.Gov/submission).3例病理标本取自西南医院肝胆科,病理证实均为原发性肝细胞肝癌, 分别提取肝癌及远端正常肝组织总RNA.将酶切回收的克隆插入片段分别进行同位素标记获得cDNA探针,利用Clontech公司的ExpressHybTM杂交液通过RNA印记法检测克隆片段在肝癌及正常肝组织中的表达,方法参照ExpressHybTM Hybridization Solution user manual说明进行. 同时,利用互联网的基因表达分析序列数据库(http://www. ncbi.nlm.nih.gov/SAGE)(series analysis of gene expression, SAGE)对基因的表达及其表达水平进行分析,从而确定其组织的分布. 结果:得到5条3’EST(694 447-3,724 447-3,697 447-3,711 447-3,692 447-3;大小500-550 bp),5 条3’EST均已登录GeneBank(登录号:CK730344, CK730345,CK730346,CK730347,CK730348).对其中2条带有poly-A尾的3’EST(694 447-3,724 447-3),进行序列分析后,发现他们是代表新基因或不同剪接体的EST,且具有共同的保守序列.RNA印记分析显示694 447- 3,724 447-3在3例肝癌组织中的表达强度明显高于对应的正常肝组织.通过SAGE文库分析基因的表达谱,发现694447-3和724 447-3在神经系统肿瘤、结肠癌、胃癌、乳腺癌肿瘤文库的表达高于对应的正常组织文库. 结论:克隆所得的2条带有poly-A尾的3’EST可能是新的肝癌多基因家族成员.利用RACE技术可以快速、高效的克隆疾病相关基因. 展开更多
关键词 肝癌 CK EST 正常肝组织 克隆 表达 HepG2 新基因 SAGE 剪接体
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水稻乙酰乳酸合成酶基因的克隆和功能分析 被引量:14
15
作者 宋贵生 冯德江 +2 位作者 魏晓丽 唐家斌 朱祯 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2007年第3期66-72,共7页
乙酰乳酸合成酶(ALS)是植物和微生物中亮氨酸、异亮氨酸和缬氨酸合成途径的一个关键酶,该基因在植物抗除草剂基因工程中具有重要的应用价值。利用生物信息学分析,自水稻中分离了ALS基因的cDNA和基因组DNA序列。序列分析表明,ALS基因没... 乙酰乳酸合成酶(ALS)是植物和微生物中亮氨酸、异亮氨酸和缬氨酸合成途径的一个关键酶,该基因在植物抗除草剂基因工程中具有重要的应用价值。利用生物信息学分析,自水稻中分离了ALS基因的cDNA和基因组DNA序列。序列分析表明,ALS基因没有内含子,GC碱基含量高并不对称分布。软件预测ALS基因是单拷贝基因位于第4号染色体上,Southern杂交验证了此结果。构建ALS基因的植物表达载体并转化烟草,转基因烟草通过PCR-Southern验证。EXACT-RT-PCR结果表明,水稻ALS基因在转基因烟草的叶片和根部均有转录发生。利用甲嘧磺隆进行除草剂抗性测试,和对照烟草相比转基因烟草除草剂抗性高达50mg.L-1。 展开更多
关键词 乙酰乳酸合成酶(ALS) EXACT-RT-PCR 抗除草剂 SAGE(基因表达系列分析)
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临床指南知识表达模型研究现状分析 被引量:8
16
作者 刘鸿燕 万艳丽 +1 位作者 于凡 胡红濮 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2017年第5期1-7,共7页
临床指南伴随循证医学的发展而产生,在减少医疗失误、规范医疗行为等方面有十分重大的意义,但目前医疗实践过程中存在临床指南使用率低、医生依从性差等问题,推动临床指南的发展与应用需要更有效、更智能的手段。阐述了临床指南的产生... 临床指南伴随循证医学的发展而产生,在减少医疗失误、规范医疗行为等方面有十分重大的意义,但目前医疗实践过程中存在临床指南使用率低、医生依从性差等问题,推动临床指南的发展与应用需要更有效、更智能的手段。阐述了临床指南的产生及其知识结构,总结了存在的问题,分析了数字化临床指南常用的知识表达模型及模型对比,指出了当前临床指南知识表达面临的挑战。 展开更多
关键词 知识表达 临床指南 表达模型 GLIF SAGE EON
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SAGE方法分析永生化BEP2D细胞及α粒子诱发恶性转化BEP2D细胞的基因表达 被引量:5
17
作者 葛世丽 李刚 +2 位作者 陈伟 楼铁柱 吴德昌 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第1期12-17,共6页
目的:采用基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)方法,分析永生化BEP2D细胞及α粒子诱发恶性转化BEP2D细胞的基因表达。方法:细胞培养,收获永生化BEP... 目的:采用基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)方法,分析永生化BEP2D细胞及α粒子诱发恶性转化BEP2D细胞的基因表达。方法:细胞培养,收获永生化BEP2D细胞及α粒子诱发恶性转化BEP2D细胞;提取细胞总RNA,分离mRNA,合成生物素标记的双链cDNA;采用SAGE方法获取标签序列,结合UniGene文库分析标签代表的转录本,最终通过SAGE软件分析标签丰度,比较两组细胞基因表达差异。选取SAGE实验得到的在两组细胞中表达的已知基因Smad7和 CCR11,以 RT-PCR方法制备探针,用两组细胞等量总RNA为样本,做 Northern blot杂交。结果:建立了2个独立的 SAGE文库。一个是1.5 Gyα粒子照射诱发恶性转化BEP2D细胞的SAGE文库,一个是永生化BEP2D细胞SAGE文库。从2个文库中分别挑取克隆53个、50个,进行测序,测序一共得到总标签2331个,代表单一转录本 252个,有 70%的 SAGE标签可找到与之一一对应的基因,有84个核糖体蛋白基因,约占33%;有12个转录本(4.8%)找不到与之理想匹配的已知基因; 展开更多
关键词 基因表达系列分析 BEP2D细胞 SAGE 肺肿瘤 Α粒子
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改进的Sage自适应滤波方法 被引量:50
18
作者 徐天河 杨元喜 《测绘科学》 CSCD 2000年第3期22-24,共3页
本文首先介绍了 Sage自适应滤波方法 ,分析了基于新息向量、残差向量和状态参数预报值改正向量的协方差自适应估计所存在的问题 ,提出了改进 Sage自适应滤波的新方法。结果表明 。
关键词 Sage滤波 自适应估计 动态系统 GPS
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LRP16基因的SAGE谱及其在正常血细胞、白血病细胞中的表达状况 被引量:33
19
作者 韩为东 楼方定 +3 位作者 于力 王全顺 韩小平 李续建 《军医进修学院学报》 CAS 2002年第3期161-163,共3页
目的 :通过信息学和实验学的方法检测LRP1 6基因在肿瘤细胞以及在造血发育不同阶段的表达状况 ,探讨其在肿瘤发生、发展以及在血细胞成熟过程中可能的作用。方法 :以NCBI提供的高通量CGAP SAGEmap数据库为实验对象 ,“VirtualNorthern... 目的 :通过信息学和实验学的方法检测LRP1 6基因在肿瘤细胞以及在造血发育不同阶段的表达状况 ,探讨其在肿瘤发生、发展以及在血细胞成熟过程中可能的作用。方法 :以NCBI提供的高通量CGAP SAGEmap数据库为实验对象 ,“VirtualNorthern”程序为实验工具 ,分析比较了LRP1 6基因在多种肿瘤组织、细胞系和相应正常组织中的表达谱 ;采用半定量RT PCR方法检测了该基因在多种正常血细胞及白血病细胞中的表达量。结果 :SAGE结果显示LRP1 6在人类多种肿瘤细胞中的表达量明显高于其正常对应组织。脐血中未检测到LRP1 6表达 ,正常骨髓及经G CSF动员的PBSC(peripheralbloodstemcells)中的表达量明显低于正常人外周血、原代白血病细胞及白血病细胞系 (P <0 0 0 1 )。结论 :LRP1 6在不同的血细胞中表达量不同。同时表明LRP1 6与急性白血病等多种肿瘤的发生、发展存在相关性 ;在初诊与复发白血病中 ,LRP1 展开更多
关键词 LRP16基因 SAGE谱 血细胞 白血病 基因表达 基因文库
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应用生物信息学方法分析人HCA56基因 被引量:9
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作者 杨美香 曲迅 +2 位作者 韩克军 冯进波 陈慰峰 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2005年第2期169-172,共4页
目的利用生物信息学对新克隆的人ligatin样基因HCA 5 6的基因和蛋白序列进行分析,探讨生物信息学在新基因研究中的作用。方法以人类基因组数据库为基础,利用电子PCR和SAGE数据库对HCA 5 6进行染色体定位和组织表达分布分析;BLAST程序进... 目的利用生物信息学对新克隆的人ligatin样基因HCA 5 6的基因和蛋白序列进行分析,探讨生物信息学在新基因研究中的作用。方法以人类基因组数据库为基础,利用电子PCR和SAGE数据库对HCA 5 6进行染色体定位和组织表达分布分析;BLAST程序进行HCA 5 6的基因结构分析和相似序列搜索;ORFfinder和GeneRunner3 0 5程序对HCA 5 6编码蛋白进行序列预测和功能分析。结果得出HCA 5 6的全长cDNA为2 0 2 1bp ,定位于染色体1q31 q32 ,其最长的开放读码框架为175 5bp ,编码5 84个氨基酸,编码氨基酸含有一个亮氨酸拉链和一假定的RNA结合保守序列。相似性搜索发现HCA 5 6基因片段与人ligatin基因片段具有很高的相似性(99% )。SAGE结果显示HCA 5 6在多种组织中都有表达。结论生物信息学是进行新基因研究的有效方法;HCA 5 6很可能是ligatin的全长编码基因。 展开更多
关键词 生物信息学 新基因 蛋白序列 读码框架 编码基因 表达 方法分析 SAGE 人类基因组 序列预测
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