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Engineering circular RNA with Tetrahymena group Ⅰ intron ribozyme
1
作者 Huiping Shi Shaojun Peng +1 位作者 Minghui Yang Yuanyu Huang 《Chinese Chemical Letters》 2025年第9期8-11,共4页
Linear mRNA vaccines are constrained by exonuclease susceptibility and instability,leading to compromised antigen expression.Circular RNA(circRNA) lacking canonical 5' and 3' untranslated regions demonstrates ... Linear mRNA vaccines are constrained by exonuclease susceptibility and instability,leading to compromised antigen expression.Circular RNA(circRNA) lacking canonical 5' and 3' untranslated regions demonstrates intrinsic exonuclease resistance.Current circularization strategies face three principal limitations:chemical methods produce non-native 2',5'-phosphodiester bonds;ribozyme-mediated approaches are restricted to RNA fragments shorter than 500 nucleotides;the Anabaena Group I intron system retains immunogenic exon sequences.In contrast,the self-splicing Group I intron ribozyme from Tetrahymena enables precisely controlled circularization through autonomous structural rearrangement,yielding exonfree constructs.Through optimized purification protocols,historical scalability challenges are systematically addressed.This Perspective establishes the mechanistic rationale and therapeutic superiority of this engineered RNA circularization platform. 展开更多
关键词 Circular RNA Chemical methods Group I intron ribozyme TETRAHYMENA
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Ribozyme是唯一的非酶生物催化剂吗?
2
作者 邹国林 章俊军 李鹏 《大自然探索》 1998年第4期87-90,共4页
人们一直认为酶是唯一的生物催化剂,酶和生物催化剂概念具有等价性。Ribozyme的发现打破了这种等价性,生物催化剂上升为属概念,酶和ribozyme并列成为种概念。随着研究的深入,人们发现DNA也具有催化活性。本实验... 人们一直认为酶是唯一的生物催化剂,酶和生物催化剂概念具有等价性。Ribozyme的发现打破了这种等价性,生物催化剂上升为属概念,酶和ribozyme并列成为种概念。随着研究的深入,人们发现DNA也具有催化活性。本实验室对博莱霉素(BLM)的研究表明,BLM介导的DNA断链反应具有许多类似酶促反应的特性,并推测BLM和生物体内的许多辅酶可能是生物催化分子进化过程中保留下来的古老而简单的小分子生物催化剂。可以断言ribozyme并非唯一的非酶生物催化剂。 展开更多
关键词 生物催化剂 ribozyme deoxyribozyme chemzyme
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抗c-erbB-2 ribozyme的计算机设计 被引量:5
3
作者 毕锋 张学庸 +2 位作者 樊代明 惠宏襄 王成济 《第四军医大学学报》 1997年第1期6-6,共1页
目的:设计能特异性切割人癌基因c-erbB-2 mRNA的核酶(ribozyme).方法:根据Symons的“锤头结构”,以人癌基因c-erbB-2 mRNA为靶RNA,用计算机对其可能为核酶切割的位点进行分析以寻找最佳切点;对底物及核酶的二级结构进行预测.结果:c-erbB... 目的:设计能特异性切割人癌基因c-erbB-2 mRNA的核酶(ribozyme).方法:根据Symons的“锤头结构”,以人癌基因c-erbB-2 mRNA为靶RNA,用计算机对其可能为核酶切割的位点进行分析以寻找最佳切点;对底物及核酶的二级结构进行预测.结果:c-erbB-2mRNA第2428~2776位和第2820~3004位之间的二级结构相对稳定,是重要的生物学功能区,因而也是核酶理想的攻击区域.该区第2438,2477,2751位是核酶的最佳切割位点.针对这三个位点设计了三个核酶并分别命名为RZ1,RZ2,RZ3.计算机模拟显示,它们均能与底物切点两翼碱基结合而形成锤头状结构.通过计算机基因库检索,在已知人基因中,其它基因的mRNA均不含有上述三个核酶切点两翼碱基的同源序列.结论:并非所有的GUX或CUX均可作为核酶的理想切割位点,c-erbB-2mRNA上第2438,2477,2751位可能是核酶的最佳切割位点. 展开更多
关键词 C-ERBB-2 ribozyme 计算机设计 基因疗法 肿瘤
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Ribozyme和靶RNA的相互作用对于切割反应的影响 被引量:3
4
作者 陆长德 庄旻 祁国荣 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1994年第4期21-25,共5页
锤头结构Ribozyme(Rz)通过与靶RNA上切卢、二狈帕5核普酸序列的碱基配对识别和切割靶RNA。通过改变Ribozyme与靶RNA之间碱基配对的长度以及性质,研究了Ribozyme与靶RNA相互作用对于它的切割反应的影响。结果表明:(1)缩短碱基配对长度和... 锤头结构Ribozyme(Rz)通过与靶RNA上切卢、二狈帕5核普酸序列的碱基配对识别和切割靶RNA。通过改变Ribozyme与靶RNA之间碱基配对的长度以及性质,研究了Ribozyme与靶RNA相互作用对于它的切割反应的影响。结果表明:(1)缩短碱基配对长度和改变碱基配对的性质,使Ritiozyme与底物的熔卢、(Tm)降低,同时反应最适温度(Topt)也降低。(2)动力学分析表明,反应的Km值随温度升高而增加,当温度接近或高于Ribozyme与底物的熔点时,Km值增加大大加快。(3)反应的Kcat也随温度升高而增加,但Kcat增加的速度继而逐渐变慢,最后Kcat下降。 展开更多
关键词 ribozyme 切割 RNA 分子
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目的Ribozyme两侧长片段附加序列(LAS)的去除及其转录载体构建 被引量:6
5
作者 陈桦 陆长德 祁国荣 《生物化学杂志》 CSCD 1995年第1期44-49,共6页
选择小鼠腺苷脱氨酶mRNA特异Ribozyme做为目的Ribozyme(Rz),在目的Ribozyme两侧分别设计5'-顺式Rz和3'-顺式Rz,在目的Ribozyme上设计BamHI酶切位点,并构建了上述Riboz... 选择小鼠腺苷脱氨酶mRNA特异Ribozyme做为目的Ribozyme(Rz),在目的Ribozyme两侧分别设计5'-顺式Rz和3'-顺式Rz,在目的Ribozyme上设计BamHI酶切位点,并构建了上述Ribozyme转录载体pSCRz262,采用该质粒进行体外转录,并对转录靶RNA分子进行了切割反应。结果显示pSCRz262在转录过程中发生了自身切割,并释放出目的Ribozyme-Rz262,该目的Ribozyme不但去除了两侧长片段附加序列,而且保持了正确的生物学活性,通过BamHI切点的设计简化了该质粒的筛选。 展开更多
关键词 目的ribozyme 长片段附加序列 转录 RNA 载体
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抗HPV16 E7-ribozyme在CV-1细胞中的稳定表达 被引量:1
6
作者 黄扬中 孔玉英 +2 位作者 汪垣 祁国荣 陆长德 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第4期385-389,共5页
构建了由RSV-LTR启动子带动并能在细胞内稳定复制的Ribozyme的自身修剪表达质粒pRSV-Rz523、Ribozyme反义对照质粒pRSV-AE7及人增殖细胞核抗原基因(PCNA)启动子带动的HPV16 E7片段(+554~+686)的真核表达质粒pPCNA-E7。经G418抗性筛选... 构建了由RSV-LTR启动子带动并能在细胞内稳定复制的Ribozyme的自身修剪表达质粒pRSV-Rz523、Ribozyme反义对照质粒pRSV-AE7及人增殖细胞核抗原基因(PCNA)启动子带动的HPV16 E7片段(+554~+686)的真核表达质粒pPCNA-E7。经G418抗性筛选获得了稳定表达Ribozyme的CV-1细胞克隆,其表达水平约为9.0pmol/10~6个细胞,其中活性Ribozyme的量大于50fmol/10~6个细胞,分离得到的Ribozyme可在体外特异切割E7靶RNA片段。通过共转染Ribozyme(或反义对照)和底物表达质粒并筛选出细胞克隆,研究了Ribozyme在细胞中对底物表达水平的影响。初步结果显示,Ribozyme的导入可使细胞内底物E7的RNA表达水平降低了90%(反义对照使E7 RNA表达降低20%)。上述结果提示:在CV-1细胞中表达的Ribozyme不仅在体外,同时在细胞内具有一定的生物学活性,有可能应用于逆转宫颈癌细胞的恶性表型。 展开更多
关键词 ribozyme 乳头状瘤病毒 CV-1细胞 子宫颈癌
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抗猪瘟病毒Ribozyme基因表达载体的构建 被引量:1
7
作者 王敏华 段小波 +2 位作者 赵启祖 谢庆阁 范必勤 《江苏农业学报》 CSCD 1994年第3期34-41,共8页
根据猪瘟病毒(HCV)基因组RNA的序列和Ribozyme的结构特点,设计并合成了针对HCV基因组P(80)编码区长为56碱基对(bp)的榔头状HCVRibozyme(HR)基因。将此基因插入质粒pBluescrip... 根据猪瘟病毒(HCV)基因组RNA的序列和Ribozyme的结构特点,设计并合成了针对HCV基因组P(80)编码区长为56碱基对(bp)的榔头状HCVRibozyme(HR)基因。将此基因插入质粒pBluescriptSK中,转化XL1-blue细胞,经限制性内切酶鉴定,获得6个阳性克隆pBHR。可用于HCV抗性的体外表达研究。又将羊金属巯因启动子(oMT-promoter)插入pBHR,构建重组质粒poMHR,经序列分析插入的HR基因序列和方向与设计相符。再将oMTHR基因插入质粒pmMT中,最终构成pMHR表达载体,经酶切分析和聚合酶链式反应(PCR)鉴定表为此表达载体中确含oMT启动子和HCV-Ribozyme基因,可用于HCV抗性的体内表达研究。 展开更多
关键词 猪瘟 病毒 ribozyme 聚合 酶链反应
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pRNA导入型Ribozyme的设计和体外转录制备 被引量:1
8
作者 周颖 方静 +1 位作者 毛建平 祝延 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期99-105,共7页
目的:枯草杆菌的包装RNA分子pRNA是新型纳米分子载体,将其同锤头型核酶Ribozyme重组可以构建结构稳定、能进入细胞、主动识别结合和剪切基因RNA的pRNA-Ribozyme。由于目前100 nt以上的RNA分子采用化学合成制备较为困难,实验采用基因重... 目的:枯草杆菌的包装RNA分子pRNA是新型纳米分子载体,将其同锤头型核酶Ribozyme重组可以构建结构稳定、能进入细胞、主动识别结合和剪切基因RNA的pRNA-Ribozyme。由于目前100 nt以上的RNA分子采用化学合成制备较为困难,实验采用基因重组构建并体外转录制备170 nt的pRNA-Ribozyme。方法:依据pRNA序列和Ribozyme分子序列,采用PCR扩增和克隆重组,将pRNA-Ribozyme按照顺式连接开放式结构、和Ribozyme嵌入pRNA成自身环化闭合型结构,制备其DNA质粒;再在体外转录制备pRNA-Ribozyme分子。结果:体外生物合成制备pRNA-Ribozyme顺式连接开放式结构、和Ribozyme嵌入pRNA成自身环化闭合型结构pRNA-Ribozyme分子,它们能通过自身正确折叠形成聚合体结构。体外鉴定pRNA-Ribozyme对其靶mRNA均具有切割降解活性,为pRNA-Ribozyme分子的细胞内应用和在胞内表达应用打下基础。 展开更多
关键词 PRNA ribozyme
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RNA研究进展之一:Ribozyme 被引量:2
9
作者 金由辛 刘望夷 《生命的化学》 CAS CSCD 1990年第6期1-4,共4页
Cech和Altman因发现酶活性RNA(Ribozyme)而获得1989年诺贝尔化学奖。本文重点介绍Ribozyme的应用研究。现在已知的Ribozyme绝大部分参与RNA的加工和成熟。它们可以分为四类。(1).
关键词 RNA ribozyme
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Ribozyme研究现况与展望 被引量:3
10
作者 祁国荣 《生命的化学》 CAS CSCD 1994年第5期2-4,共3页
Ribozyme研究现况与展望祁国荣(中国科学院上海生物化学研究所,上海200031)关键词Ribozyme近年来,ribozyme研究进入一个平稳发展阶段,没有太大的突破。关于ribozyme在体内阻断基因表达和抗... Ribozyme研究现况与展望祁国荣(中国科学院上海生物化学研究所,上海200031)关键词Ribozyme近年来,ribozyme研究进入一个平稳发展阶段,没有太大的突破。关于ribozyme在体内阻断基因表达和抗病毒的前景,能否用作临床药物,还难... 展开更多
关键词 ribozyme 研究进展
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Ribozyme——分子病毒学的新领域 被引量:2
11
作者 赵小侠 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1991年第2期186-190,共5页
Ribozyme是具有催化RNA切割反应功能的RNA,它可以有效地序列特异性地切割RNA。最近,Ribozyme的一般结构已经被证实,因此能够设计并人工合成Ribozyme,通过切割破坏RNA,阻断其功能,并抑制基因表达,包括抑制病毒的基因表达,从而有效地阻止... Ribozyme是具有催化RNA切割反应功能的RNA,它可以有效地序列特异性地切割RNA。最近,Ribozyme的一般结构已经被证实,因此能够设计并人工合成Ribozyme,通过切割破坏RNA,阻断其功能,并抑制基因表达,包括抑制病毒的基因表达,从而有效地阻止病毒的复制和繁殖。这是近年来继反义RNA之后发现的又一个抑制基因表达的有力工具,它开辟了分子生物学的一个新领域,具有很大的潜在应用价值,因此它一出现即引起各国学者的极大兴趣。 展开更多
关键词 分子病毒学 ribozyme 核糖核酸
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细胞核内反义RNA和反义ribozyme-基因表达抑制新途径 被引量:1
12
作者 张德礼 高步先 +2 位作者 高显明 邓柏林 朱关福 《中国兽药杂志》 北大核心 1997年第1期52-53,共2页
细胞核内反义RNA和反义ribozyme-基因表达抑制新途径张德礼高步先高显明邓柏林朱关福1北京军区后勤部卫生防疫队、北京军区兽医防治中心北京100071;1中国军事医学科学院微生物流行病学研究所北京100850关键... 细胞核内反义RNA和反义ribozyme-基因表达抑制新途径张德礼高步先高显明邓柏林朱关福1北京军区后勤部卫生防疫队、北京军区兽医防治中心北京100071;1中国军事医学科学院微生物流行病学研究所北京100850关键词细胞核反义RNA反义ribozy... 展开更多
关键词 细胞核反义RNA 反义ribozyme 基因表达
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抗HPV16E7-ribozyme的体外制备与活性鉴定 被引量:1
13
作者 黄扬中 祁国荣 +1 位作者 王昌才 陆长德 《第一军医大学学报》 CSCD 1996年第4期285-288,共4页
通过体外转录结合乙醇沉淀,建立了体外大量制备抗HPV16E7-Rz的方法。切割实验表明,ribozyme可在体外准确和有效地切割E7靶RNA,形成85nt和86nt大小的切割产物。体外制备的ribozyme的切割活性... 通过体外转录结合乙醇沉淀,建立了体外大量制备抗HPV16E7-Rz的方法。切割实验表明,ribozyme可在体外准确和有效地切割E7靶RNA,形成85nt和86nt大小的切割产物。体外制备的ribozyme的切割活性、Km和kcat值与人工合成的相似。结果说明,体外制备的ri-bozyme具有特异的催化切割活性。 展开更多
关键词 ribozyme 人乳头瘤病毒16型 体外转录 活性鉴定
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Ribozyme与基因表达 被引量:1
14
作者 祁国荣 《生物工程进展》 CSCD 1991年第4期27-32,共6页
Ribozyme指一类具有生物催化功能的RNA,也称RNA催化剂、在化学本质上,它不同于具有生物催化功能的蛋白质——酶(enzyme),Ribozyme发现于80年代初,近十年来,ribozyme研究进展深化了生物催化理论,提出了生物大分子和生命起源的新概念。
关键词 ribozyme 核糖核酸 基因 表达
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核糖核酸和焦炭酸二乙酯修饰影响ribozyme切割活性的初步研究
15
作者 黄扬中 任秀容 +2 位作者 祁国荣 王昌才 陆长德 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1997年第6期1-4,共4页
以抗HPV16E7-ribozyme作为研究模型,对影响ribozrme切割活性的一些因素进行了初步探讨。结果发现,核糖核酸(RNA)可以明显影响ribozyme的体外切割活性,且其活性随着加入反应的RNA量和RNA种类的不同而异,细胞内的RNA可能会明显影响... 以抗HPV16E7-ribozyme作为研究模型,对影响ribozrme切割活性的一些因素进行了初步探讨。结果发现,核糖核酸(RNA)可以明显影响ribozyme的体外切割活性,且其活性随着加入反应的RNA量和RNA种类的不同而异,细胞内的RNA可能会明显影响ribozyme的体内切割活性。另外,ribozyme的焦炭酸二乙酯修饰也可明显影响ribozyme的切割活性,说明ribozyme保守序列中的腺苷酸(A)对其活性的维持是重要的。 展开更多
关键词 ribozyme 修饰 核糖酸酸 焦炭酸二乙酯 切割活性
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小鼠腺苷脱氨酶mRNA特异Ribozyme计算机设计
16
作者 陈桦 陈农安 +1 位作者 陆长德 祁国荣 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1994年第5期461-463,共3页
小鼠腺苷脱氨酶mRNA经计算机分析,包括:ribozyme切点位置选择,二级结构预测,基因生物学功能和基因同源性分析,筛选出四个锤头结构ribozyme.结果表明上述ribozyme底物切点两翼碱基形成发夹结构,切点... 小鼠腺苷脱氨酶mRNA经计算机分析,包括:ribozyme切点位置选择,二级结构预测,基因生物学功能和基因同源性分析,筛选出四个锤头结构ribozyme.结果表明上述ribozyme底物切点两翼碱基形成发夹结构,切点位于单链环区,切点所在基因片段位于该基因生物功能区内,并同已知小鼠其它基因不同源. 展开更多
关键词 腺苷脱氨酶mRNA ribozyme 计算机设计
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Ribozyme在疾病治疗中的应用 被引量:1
17
作者 侯丙凯 于惠敏 《国外医学(遗传学分册)》 1995年第4期202-203,共2页
Ribozyme具有催化切割其他RNA分子的能力,不少研究者针对这一特点,试图通过人工设计的Ribozyme破坏致病的RNA分子,在爱滋病、慢性肝炎和癌症等疾病的治疗上做了大量探索性的工作,对存在的许多问题提出了相应的解决方法。这方面的研究预... Ribozyme具有催化切割其他RNA分子的能力,不少研究者针对这一特点,试图通过人工设计的Ribozyme破坏致病的RNA分子,在爱滋病、慢性肝炎和癌症等疾病的治疗上做了大量探索性的工作,对存在的许多问题提出了相应的解决方法。这方面的研究预示着Ribozyme在临床治疗上的应用前景。 展开更多
关键词 基因治疗 RNA酶 ribozyme
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细胞核内反义RNA和反义ribozyme——基因表达抑制新途径
18
作者 张德礼 高步先 +2 位作者 高显明 邓柏林 朱关福 《医学研究杂志》 1997年第10期18-19,共2页
近年来,新采用的反义技术已有细胞核内反义RNA和Antizyme。前者是指将反义RNA限制于细胞核内抑制靶基因原始转录子,以避免在细胞浆需抑制极其巨大数量的靶RNA,而起到把问题解决在萌芽状态的独特作用,这种模拟真核生物天然存在反义RNA封... 近年来,新采用的反义技术已有细胞核内反义RNA和Antizyme。前者是指将反义RNA限制于细胞核内抑制靶基因原始转录子,以避免在细胞浆需抑制极其巨大数量的靶RNA,而起到把问题解决在萌芽状态的独特作用,这种模拟真核生物天然存在反义RNA封闭基因表达机制的高效方法,无疑开辟了一条抑制基因表达的新途径。后者是反义ribozyme,即ribozyme基因与反义RNA基因相连接,转录成具有ribozyme和反义RAN双重功能的一类RNA分子,实际上是基因剪刀和基因表达封条的联合体。目前,它在转基因植物研究方面,应用比较广泛。从研究进展、存在问题、发展对策和应用前景四方面评述细胞核内反义RNA和反义ribozyme是抑制基因表达的新途径。 展开更多
关键词 细胞核内反义RNA 反义ribozyme
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酶活性RNA(Ribozyme)的发现及其认识论
19
作者 朱和明 李彦辉 +1 位作者 周浩礼 朱长庚 《医学与社会》 1996年第4期36-37,40,共3页
酶活性RNA是一类具有携带遗传信息和催化作用双重功能的RNA分子,这一发现打破了“酶的本质是蛋白质”的传统观念。利用Ribozyme所进行的基因干预和基因治疗展现出重要的实用价值。这一事实告诉我们科学实验是科学发展的... 酶活性RNA是一类具有携带遗传信息和催化作用双重功能的RNA分子,这一发现打破了“酶的本质是蛋白质”的传统观念。利用Ribozyme所进行的基因干预和基因治疗展现出重要的实用价值。这一事实告诉我们科学实验是科学发展的动力,是检验真理的标准,科学的发展永无尽头,人类的认识没有止境。 展开更多
关键词 酶活性RNA ribozyme 认识论
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抗HPV16E7-ribozyme和靶RNA相互作用的计算机分析
20
作者 黄扬中 陈农安 +2 位作者 祁国荣 王昌才 陆长德 《第一军医大学学报》 CSCD 1996年第4期292-296,共5页
应用计算机分析了抗HPV16E7-ribozyme的体外切割反应结果,发现ribozyme和靶RNA的二级结构及其能量变化能影响ribozyme的切割活性。根据锤头结构ribozyme的能量变化模型,对抗HPV16E... 应用计算机分析了抗HPV16E7-ribozyme的体外切割反应结果,发现ribozyme和靶RNA的二级结构及其能量变化能影响ribozyme的切割活性。根据锤头结构ribozyme的能量变化模型,对抗HPV16E7-ribozyme和靶RNA在痘苗表达体系及稳定表达体系中的相互作用,进行计算机模拟分析。结果表明,计算机分析ribozyme和靶RNA在细胞内的相互作用,可以指导ribozyme的设计和在体内的应用研究。 展开更多
关键词 ribozyme 计算机 人乳头状瘤病毒 RNA 16型
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