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The role of the transcription factor NAC17 in enhancing plant resistance and stress tolerance in Vitis quinquangularis
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作者 Xiaolin Liu Jie Zhu +3 位作者 Ruixiang Li Yang Feng Qian Yao Dong Duan 《Journal of Integrative Agriculture》 2025年第9期3435-3450,共16页
Stilbenes,a natural plant phytoalexin,are involved in the plant's response to various biotic and abiotic stresses in its environment.STILBENE SYNTHASE(STS)is the key enzyme regulating resveratrol synthesis in grap... Stilbenes,a natural plant phytoalexin,are involved in the plant's response to various biotic and abiotic stresses in its environment.STILBENE SYNTHASE(STS)is the key enzyme regulating resveratrol synthesis in grapevine.However,the regulatory mechanism of STS gene expression remains unclear.In this study,we reported a NAC transcription factor,VqNAC17,in Vitis quinquangularis,which can improve plant resistance to salt stress,drought stress,and Pseudomonas syringae pv.Tomato DC3000(Pst DC3000)in transgenic Arabidopsis thaliana.Additionally,the interaction between the transcription factors VqNAC17 and VqMYB15 was confrmed using yeast two-hybrid and BiFC.In transgenic A.thaliana,VqNAC17 participates in plant immunity through interaction with VqMYB15 to affect the stilbene synthesis.Furthermore,the experimental results of the yeast one-hybrid assay and LUC transient expression assay found that VqNAC17 can also bind to the promoter of VqMYB15.These results indicate that VqNAC17 is a key regulator that can promote the expression of STS by interacting with VqMYB15. 展开更多
关键词 Vitis quinquangularis VqNAC17 VqMYB15 protein interaction STS
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适用于转录组测序的毛葡萄叶片总RNA提取方法筛选 被引量:5
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作者 张树伟 丁峰 +2 位作者 黄羽 彭宏祥 卢江 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期3593-3597,共5页
毛葡萄叶片中含有大量多糖、多酚等多种次生代谢物,严重影响RNA提取质量,筛选从毛葡萄叶片中提取高质量RNA的方法是开展相关分子研究的基础。本研究采用改良CTAB法、改良SDS/酚法和三种试剂盒法,筛选适合转录组测序的提取毛葡萄叶片总RN... 毛葡萄叶片中含有大量多糖、多酚等多种次生代谢物,严重影响RNA提取质量,筛选从毛葡萄叶片中提取高质量RNA的方法是开展相关分子研究的基础。本研究采用改良CTAB法、改良SDS/酚法和三种试剂盒法,筛选适合转录组测序的提取毛葡萄叶片总RNA的方法。结果显示,五种方法均可以获得毛葡萄叶片总RNA,但在纯度和完整性上差别较大。改良CTAB和改良SDS/酚法提取的总RNA OD260/OD230比值小于1.8,试剂盒A法提取的总RNA在纯度和完整性上均可以满足转录组测序要求,试剂盒B法和试剂盒C法提取的总RNA降解严重。相比其他四种方法,试剂盒A法提取的毛葡萄叶总RNA质量更好,在纯度和完整性上均能满足转录组测序及其他分子生物学实验的要求。 展开更多
关键词 毛葡萄(Vitis quinquangularis) 叶片 RNA提取方法 转录组测序
原文传递
基于高通量测序的野生毛葡萄转录组数据分析 被引量:1
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作者 方辉 蒋胜理 +2 位作者 曲俊杰 周思泓 潘凤英 《湖北农业科学》 2016年第18期4827-4831,共5页
利用RNA-seq技术对所构建的野生毛葡萄(Vitis quinquangularis Rehd)叶片的转录组进行测定,对原始reads进行过滤和组装,得到了35 238条质量较高的unigene,平均长度为1 081 nt,N50为1 735 nt。基于NCBI蛋白质数据库(Nr)、蛋白质序列数据... 利用RNA-seq技术对所构建的野生毛葡萄(Vitis quinquangularis Rehd)叶片的转录组进行测定,对原始reads进行过滤和组装,得到了35 238条质量较高的unigene,平均长度为1 081 nt,N50为1 735 nt。基于NCBI蛋白质数据库(Nr)、蛋白质序列数据库(Swiss-Prot)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库和直系同源基因簇(COG)进行相似性比对,共注释了26 751条unigene,另有8 487条unigene未被注释。物种同源性显示与葡萄的同源性最高为74.48%。利用COG数据库将unigene分成25类,通过GO分类和KEGG富集性分析,将unigene分别归类于44个GO类别和122个代谢途径。此外,在35 238条unigene中共搜索到4 428个SSR位点,二核苷酸的SSR数目最多(1 906条),其次为三核苷酸(1 762条)。这些信息为毛葡萄功能基因、相关候选基因的发掘以及分子标记辅助育种提供了重要依据。 展开更多
关键词 毛葡萄(Vitis quinquangularis Rehd) 转录组 高通量测序
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