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禽流感病毒流行现状及qRT-PCR检测技术研究进展
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作者 刘雨晴 李安琪 +1 位作者 陈雯轩 吴华伟 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2026年第1期37-43,共7页
禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)因高变异性和跨物种传播能力,对全球公共卫生和家禽养殖业构成严重威胁。从病毒学特征来看,AIV主要通过血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因分型,其快速演化加剧了防控... 禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)因高变异性和跨物种传播能力,对全球公共卫生和家禽养殖业构成严重威胁。从病毒学特征来看,AIV主要通过血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因分型,其快速演化加剧了防控难度。流行病学研究表明,野生鸟类迁徙和活禽贸易活动是AIV传播的主要途径,不同亚型分布呈现显著的区域和时间差异。在检测技术方面,实时荧光定量反转录聚合酶链反应(quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,qRT-PCR)因灵敏度高和特异性强成为AIV检测的核心方法,但AIV亚型混合感染及变异株的出现对检测技术提出了更高的要求。本文系统总结了AIV的分型依据、分子特征、流行病学特性及检测技术的最新进展,以期为AIV的精准监测和防控提供理论参考。 展开更多
关键词 禽流感病毒 qrt-pcr 流行病学 高通量检测 防控策略
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沙生蜡菊qRT-PCR内参基因筛选与验证
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作者 刘欣欣 赖成霞 +1 位作者 谷玉风 葛风伟 《新疆师范大学学报(自然科学版)》 2026年第1期74-82,共9页
从沙生蜡菊转录组数据中选择5个管家基因(ACT1、ACT7、CYP、HIS、TUB)作为候选内参基因,使用qRT-PCR检测候选内参基因在沙生蜡菊不同组织和冻害胁迫下的表达水平,使用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder对其稳定性进行评估,筛... 从沙生蜡菊转录组数据中选择5个管家基因(ACT1、ACT7、CYP、HIS、TUB)作为候选内参基因,使用qRT-PCR检测候选内参基因在沙生蜡菊不同组织和冻害胁迫下的表达水平,使用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder对其稳定性进行评估,筛选合适内参基因。以沙生蜡菊HaWRKY基因作为靶标基因,验证内参基因稳定性。结果表明,HaCYP和HaHIS在沙生蜡菊组织中稳定表达;HaHIS在冻害胁迫后稳定表达;综上所述,HaHIS可作为沙生蜡菊内参基因。本研究获得沙生蜡菊合适内参基因,为沙生蜡菊基因表达分析提供了可靠的技术支持,同时为深入研究其响应冻害分子机制和次生代谢调控奠定了基础。 展开更多
关键词 沙生蜡菊 内参基因 qrt-pcr 基因表达分析
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沙芥qRT-PCR内参基因的筛选与验证 被引量:1
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作者 武兆昕 商凯凡 王萍 《植物生理学报》 北大核心 2025年第3期359-370,共12页
从沙芥全长转录组数据中选择10个内参基因(TIP41、UBQ10、UBC9、UP1、SAND、GAPDH、ACT、EF1α、PP2A、TUB)作为候选内参基因,使用qRT-PCR法检测候选内参基因在沙芥非生物和植物生长调节物质处理下的表达水平,并使用GeNorm、Normfinder... 从沙芥全长转录组数据中选择10个内参基因(TIP41、UBQ10、UBC9、UP1、SAND、GAPDH、ACT、EF1α、PP2A、TUB)作为候选内参基因,使用qRT-PCR法检测候选内参基因在沙芥非生物和植物生长调节物质处理下的表达水平,并使用GeNorm、Normfinder、BestKeeper和RefFinder分析其稳定性。结果表明:EF1α为沙芥所有处理样本混合组(Total组)最稳定内参基因;TIP41为干旱叶/根、NaCl处理叶根组合(LR组)/根、脱水LR组/叶片、ABA处理LR组/叶片、MeJA处理LR组/根中最稳定的内参基因;UBQ10为4℃处理LR组/叶片、42℃处理LR组、干旱LR组及SA处理LR组最稳定内参基因;ACT为4℃处理根、脱水处理根中最稳定内参基因;GADPH为42℃处理叶片中最稳定内参基因;PP2A为NaCl处理叶片、ABA处理根、SA处理根中最稳定的内参基因;UBC9为MeJA处理叶片中最稳定的内参基因。此外,选择3个胁迫相关基因(PcDREB2、PcCLCg和PcHSP17.8)验证了内参基因的准确性。本研究结果可用于沙芥非生物胁迫和植物生长调节物质处理下qPCR分析,为今后沙芥耐逆基因的表达分析提供了参考基因和理论依据。 展开更多
关键词 内参基因 沙芥 非生物胁迫 植物生长调节物质 qrt-pcr
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三种非生物胁迫下谷子qRT-PCR内参基因的筛选
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作者 雷翠云 马宁洁 +5 位作者 张晓霞 李瑞淼 冯萌萌 单萌 杨致荣 高建华 《植物生理学报》 北大核心 2025年第4期471-480,共10页
为了便于研究谷子(Setaria italica)这种新兴的C4禾谷类模式植物的基因表达模式,急需筛选鉴定谷子非生物胁迫下的内参基因。根据已有转录组数据和文献,筛选出8个基因作为候选内参基因。对名优谷子‘晋谷21号’的超早熟突变体xiaomi分别... 为了便于研究谷子(Setaria italica)这种新兴的C4禾谷类模式植物的基因表达模式,急需筛选鉴定谷子非生物胁迫下的内参基因。根据已有转录组数据和文献,筛选出8个基因作为候选内参基因。对名优谷子‘晋谷21号’的超早熟突变体xiaomi分别进行低氮、干旱和高盐胁迫处理,并在7个时间点(1、3、6、12、24、48、72 h)取样,分析8个候选基因在不同部位(叶、茎、根)的表达水平。通过在线工具RefFinder分析了所有样品中候选基因的表达稳定性。结果表明,Si4g07620基因(编码转录延伸因子)在所有样本中表现出较优的稳定性和可靠性,被确定为最佳内参基因;而鲜有作为内参基因的磷蛋白基因(Si5g32520)表现也相对稳定,仅次于Si4g07620。研究结果有助于深入探究谷子耐逆性的分子机理。 展开更多
关键词 谷子 基因表达分析 qrt-pcr 内参基因 非生物胁迫
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不同光质处理下糙皮侧耳qRT-PCR内参基因的优化
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作者 胡梦丹 祝梦柯 +3 位作者 张鹏 高玉千 邱立友 李亚楠 《中国瓜菜》 北大核心 2025年第6期35-43,共9页
为了筛选出适合分析糙皮侧耳在不同光质处理下基因特异性表达的内参基因,以糙皮侧耳菌丝为材料,在不同光质处理的菌丝转录组数据中筛选12个基因作为糙皮侧耳实时荧光定量PCR的候选内参基因,对其表达丰度和表达稳定性进行评价。设计的12... 为了筛选出适合分析糙皮侧耳在不同光质处理下基因特异性表达的内参基因,以糙皮侧耳菌丝为材料,在不同光质处理的菌丝转录组数据中筛选12个基因作为糙皮侧耳实时荧光定量PCR的候选内参基因,对其表达丰度和表达稳定性进行评价。设计的12个候选内参基因荧光定量引物具有良好的特异性,熔解曲线呈单一峰,各基因CT值在18~26之间。geNorm、NormFinder和BestKeeper表达稳定性分析显示,真核翻译起始因子编码基因(eIF1)、泛素结合酶编码基因(UBC)、40S核糖体蛋白编码基因(40SRP)和肌动蛋白编码基因(Actin1)在3种分析中的表达稳定性均位于前列。这4个基因在不同光质处理下的表达丰度从高到低依次为UBC、eIF1、Actin1和40SRP。eIF1和UBC可以作为靶标基因高丰度表达水平下的最佳内参基因组合;40SRP和Actin1可作为靶标基因中、低丰度表达水平下的最佳内参基因组合。 展开更多
关键词 糙皮侧耳 内参基因 光处理 qrt-pcr
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梨形环棱螺qRT-PCR内参基因的筛选
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作者 郭雪朋 文衍红 +3 位作者 罗福广 王志强 祝东梅 周小云 《华中农业大学学报》 北大核心 2025年第6期253-262,共10页
为筛选梨形环棱螺(Bellamya purificata)在不同发育阶段、不同组织以及性别间各组织中表达稳定的最佳qRT-PCR内参基因,分别用geNorm、NormFinder、BestKeeper软件和比较ΔCt法,以及综合分析软件RefFinder评估actβ、18S、gapdh、ef1α、... 为筛选梨形环棱螺(Bellamya purificata)在不同发育阶段、不同组织以及性别间各组织中表达稳定的最佳qRT-PCR内参基因,分别用geNorm、NormFinder、BestKeeper软件和比较ΔCt法,以及综合分析软件RefFinder评估actβ、18S、gapdh、ef1α、ef1β、rps3、rpl4、tubα、tubβ和sdha共10个候选基因在梨形环棱螺的胚胎阶段、幼螺阶段和雌雄成螺各组织中的表达稳定性。结果显示,候选内参基因在胚胎和幼螺阶段的表达稳定性依次为gapdh>tubα>18S>ef1α>ef1β>rps3>actβ>tubβ>sdha>rpl4,在雌螺各组织中的表达稳定性依次为ef1β>tubα>rps3>ef1α>18S>actβ>gapdh>sdha>tubβ>rpl4,在雄螺各组织中的稳定性依次为ef1α>rps3>ef1β>rpl4>tubα>actβ>18S>gapdh>tubβ>sdha,在性别间各组织中的稳定性依次为ef1β>ef1α>rps3>tubα>18S>actβ>gapdh>rpl4>sdha>tubβ。上述结果表明,gapdh和tubα为胚胎和幼螺阶段较适宜的qRT-PCR内参基因,ef1β和tubα为雌螺组织间较适宜的qRT-PCR内参基因,ef1α和rps3为雄螺组织间较适宜的qRT-PCR内参基因,ef1α和ef1β为性别间较适宜的qRT-PCR内参基因。 展开更多
关键词 梨形环棱螺 qrt-pcr 内参基因 表达稳定性
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基于ail基因的小肠结肠炎耶尔森菌qRT-PCR检测方法的建立
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作者 冯春辉 林静怡 +6 位作者 赵猛 方娅琼 马玉婷 陆文凯 许文豪 张红见 冈林环树 《青海大学学报》 2025年第4期59-64,共6页
为了建立一种操作简便、快速高效、特异性高的小肠结肠炎耶尔森菌检测方法,并将其应用于临床样品的快速筛选和流行病学调查,以小肠结肠炎耶尔森菌ail基因为靶基因,建立了针对小肠结肠炎耶尔森菌的qRT-PCR检测方法,并对临床样品进行检测... 为了建立一种操作简便、快速高效、特异性高的小肠结肠炎耶尔森菌检测方法,并将其应用于临床样品的快速筛选和流行病学调查,以小肠结肠炎耶尔森菌ail基因为靶基因,建立了针对小肠结肠炎耶尔森菌的qRT-PCR检测方法,并对临床样品进行检测。结果表明:灵敏性检测结果显示,qRT-PCR方法对目的DNA的检测限为10-2copies/μL;特异性检测结果显示,仅有小肠结肠炎耶尔森菌被检出。通过与普通PCR比较分析可知,基于小肠结肠炎耶尔森菌ail基因建立的qRT-PCR方法特异性强,灵敏性高,且操作简便快速,检测成本较低。研究结果可为青海地区小肠结肠炎耶尔森菌的传播与流行提供一种快速、灵敏的分子检测方法。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 ail基因 qrt-pcr PCR 灵敏性 特异性
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新布尼亚病毒编码milRNA qRT-PCR检测一步法的建立及其临床应用价值
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作者 吴寒英 方媛 +1 位作者 陈熹 杨平 《临床检验杂志》 2025年第7期534-540,共7页
目的构建新型布尼亚病毒(SFTSV)编码微小核糖核酸样小RNAs(microRNA-like small RNAs,milRNAs)的高效、稳定的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)一步法,并评估其临床应用价值。方法针对前期筛选的3种SFTSV milRNAs:sRNA S-1480、sRNA M-692、sRN... 目的构建新型布尼亚病毒(SFTSV)编码微小核糖核酸样小RNAs(microRNA-like small RNAs,milRNAs)的高效、稳定的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)一步法,并评估其临床应用价值。方法针对前期筛选的3种SFTSV milRNAs:sRNA S-1480、sRNA M-692、sRNA L-4706,设计并优化针对这3种milRNAs的qRT-PCR引物及反应体系。通过标准曲线绘制、引物浓度/序列优化、荧光染料优化、产物测序验证以及20例新布尼亚病毒感染者及20例健康人对照者血清标本检测,进一步评估方法的敏感性、特异性及临床适用性。结果成功构建一步qRT-PCR检测体系,以标准品构建的标准曲线在10 fmol/L~100 nmol/L范围内具有良好的线性关系(R 2>0.98),对3种milRNAs的检测下限均为10 fmol/L。ROC曲线分析结果显示,血清sRNA S-1480(AUC^(ROC)=0.9725)、sRNA M-692(AUC^(ROC)=0.7575)、sRNA L-4706(AUC^(ROC)=0.9575)以及3种milRNAs联合检测(AUC^(ROC)=0.9950)均可用于区分SFTSV感染者与健康人对照者。结论构建的一步qRT-PCR检测体系具有较高的敏感性,为SFTSV感染的临床诊断提供了高效、可靠的替代方案。 展开更多
关键词 微小核糖核酸样小RNAs 一步qrt-pcr方法 新布尼亚病毒
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毛叶芋兰不同组织qRT-PCR内参基因选择与验证 被引量:1
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作者 池珈仪 刘舒璇 +2 位作者 向思诗 詹若挺 何瑞 《热带作物学报》 北大核心 2025年第1期35-43,共9页
毛叶芋兰(Nervilia plicata)是一种珍稀南药,目前对其有效成分及其分子调控机理鲜有报道。实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)在植物基因表达分析中得到了广泛应用,但在毛叶芋兰中缺少研究,限制了相关工作的开展。在... 毛叶芋兰(Nervilia plicata)是一种珍稀南药,目前对其有效成分及其分子调控机理鲜有报道。实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)在植物基因表达分析中得到了广泛应用,但在毛叶芋兰中缺少研究,限制了相关工作的开展。在前期工作基础上,本研究从毛叶芋兰转录组数据库中筛选出Actin、GAPDH、TUA、UBC、UBQ、EF-1α、EF-1β、CYP、RPL共9个常见管家基因,以毛叶芋兰叶片、叶柄和球茎3个组织部位为材料,开展qRT-PCR内参基因的筛选工作。经过9个基因在不同组织的表达水平、稳定性和综合分析,筛选出最适合的内参基因,并选择毛叶芋兰花青素合成途径关键基因NpDFR、Np3GT进行验证。结果发现:EF-1α和CYP的表达稳定性相近,整体稳定性最好。2个内参基因单独或共同使用时,NpDFR、Np3GT在不同组织的表达情况与转录组测序结果基本一致,表明其均可用作qRT-PCR的内参基因。本研究结果为进一步开展毛叶芋兰药效相关基因的分子作用机理研究提供依据。 展开更多
关键词 毛叶芋兰 内参基因 实时荧光定量PCR 表达稳定性
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鸡传染性法氏囊病毒实时qRT-PCR检测方法的建立及初步应用 被引量:4
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作者 周欣 杨霞 +4 位作者 赵军 常洪涛 王新卫 陈陆 王川庆 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期424-430,共7页
根据高效培养鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)时对病毒滴度检测的需要,本文针对IBDV VP4基因的保守序列设计并合成了一对引物,以所构建的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测IBDV核酸载量的SYBR Green I荧光定量实时RT-PCR(qRT-PCR)方法,结果表... 根据高效培养鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)时对病毒滴度检测的需要,本文针对IBDV VP4基因的保守序列设计并合成了一对引物,以所构建的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测IBDV核酸载量的SYBR Green I荧光定量实时RT-PCR(qRT-PCR)方法,结果表明,其Ct值与标准品模板在4.03×101~109拷贝/μL范围内呈良好的线性关系,对IBDV核酸的最低检出量为40拷贝/μL,灵敏度是常规RT-PCR检测方法的1 000倍;该方法不与其它禽源病毒发生交叉反应,批内变异系数小于0.5%。应用本方法对DF-1细胞中IBDV的增殖滴度进行了测定,并与经典的TCID50测定方法进行了比较。结果显示两种方法测定的IBDV在微载体悬浮培养和方瓶静态培养条件下DF-1细胞上的增殖曲线都具有一定的平行关系,且qRT-PCR方法比TCID50方法更加快速和敏感,更适合于对IBDV增殖滴度的实时快速测定。 展开更多
关键词 鸡传染性法氏囊病毒 DF-1细胞 qrt-pcr TCID50 增殖滴度
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孟氏隐唇瓢虫qRT-PCR分析中内参基因的筛选 被引量:5
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作者 潘畅 张宇宏 庞虹 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2016年第2期261-270,共10页
选择合适的内参基因是qRT-PCR研究的关键。本文以孟氏隐唇瓢虫Cryptolaemus montrouzieri Mulsant为研究材料,利用qRT-PCR技术,对孟氏隐唇瓢虫4个候选内参基因Actin、RPS23、GAPDH和β-tubulin的mRNA的表达量进行了分析,并用Ge Norm、No... 选择合适的内参基因是qRT-PCR研究的关键。本文以孟氏隐唇瓢虫Cryptolaemus montrouzieri Mulsant为研究材料,利用qRT-PCR技术,对孟氏隐唇瓢虫4个候选内参基因Actin、RPS23、GAPDH和β-tubulin的mRNA的表达量进行了分析,并用Ge Norm、Norm Finder和Best Keeper软件分析它们在孟氏隐唇瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织中的表达稳定性。结果表明,以成虫不同组织为材料时,综合三种软件分析结果显示4个候选基因表达稳定性平均等级值排名为RPS23(rank=1)>β-tubulin(rank=2.3)>GAPDH(rank=3)>Actin(rank=3.7),以不同发育时期虫体为材料时,综合分析结果显示4个候选内参基因表达稳定性平均等级值排名为RPS23(rank=1.7)>Actin(rank=2)>GAPDH(rank=2.7)>β-tubulin(rank=3.7)。综合分析在瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织两种处理下,三种软件的评价效果,4个候选基因表达稳定性等级值的总平均排名为RPS23(rank=1.3)>Actin(rank=2.8)=GAPDH(rank=2.8)>β-tubulin(rank=3)。RPS23在瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织中均显示出较高的表达稳定性及与其它基因之间极大的相关性,可以确定为孟氏隐唇虫不同发育阶段及成虫不同组织基因表达分析中一个稳定表达的基因,可作为单个内参基因或者其它内参基因的协同基因,本实验为开展孟氏隐唇瓢虫功能基因表达分析奠定了方法学基础。 展开更多
关键词 孟氏隐唇瓢虫 qrt-pcr 内参基因 表达稳定性 GeNorm软件 NormFinder软件 BestKeeper软件
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利用qRT-PCR技术对PVY重组株系的鉴定 被引量:4
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作者 尚慧 韩树鑫 +6 位作者 高艳玲 张威 范国权 申宇 聂先舟 吕文河 白艳菊 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期238-244,共7页
【目的】马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)作为制约马铃薯生产的重要病毒之一,株系分化繁杂。近年被科学家研究分离的PVY^(N-Wi)和PVY^(NTN-NW)株系而言,其基因组结构极为相似但致病性差异较大。【方法】本研究利用qRT-PCR方法,方便快... 【目的】马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)作为制约马铃薯生产的重要病毒之一,株系分化繁杂。近年被科学家研究分离的PVY^(N-Wi)和PVY^(NTN-NW)株系而言,其基因组结构极为相似但致病性差异较大。【方法】本研究利用qRT-PCR方法,方便快捷的检测出马铃薯Y病毒的这2种不同株系,同时并使之可成功且稳定的应用于马铃薯生产中。通过查找Gen Bank已公布的PVY^(N-Wi)和PVY^(NTN-NW)株系的全基因组序列,设计用于qRT-PCR检测,扩增目的片段大小为150 bp左右的特异性引物,应用实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)进行检测。【结果】通过设计的引物对保存的试管苗毒源进行检测,可以成功的精准鉴别出PVY^(N-Wi)和PVY^(NTN-NW)株系;同时对100份田间采集的叶片样品进行检测,成功的检测出100份样品中32份样品,受到PVY^(N-Wi)株系侵染;27份样品,受到PVY^(NTN-NW)株系侵染;同时存在9份样品,可能同时受到PVY^(N-Wi)、PVY^(NTN-NW)株系的侵染。【结论】实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)可适用于马铃薯叶片样品的检测,为株系的快速鉴定提供了可靠的方法,可用于生产中大规模样品的检测,有利于及时采取防控措施,降低损失。 展开更多
关键词 马铃薯Y病毒(PVY) 株系分化 实时荧光定量PCR技术(qrt-pcr)
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黑龙江省某规模化奶牛场牛病毒性腹泻病毒qRT-PCR结合双抗夹心ELISA的检测 被引量:4
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作者 张世勋 赫鸣睿 +12 位作者 于洪江 何泊宁 赵尚琪 王丽 吴陈华 黄雯静 王天 刘宇 岳山 刘珊珊 翟军军 宋佰芬 朱战波 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第22期72-75,共4页
为了对黑龙江省规模化奶牛场牛病毒性腹泻/黏膜病进行检疫净化,试验应用qRT-PCR法检测了黑龙江省4个规模化奶牛场(A^D场)奶牛耳组织样品(共1286份,58组),qRT-PCR法检测得到的阳性组样品再用双抗夹心ELISA进行每份样品的检测。阳性牛间隔... 为了对黑龙江省规模化奶牛场牛病毒性腹泻/黏膜病进行检疫净化,试验应用qRT-PCR法检测了黑龙江省4个规模化奶牛场(A^D场)奶牛耳组织样品(共1286份,58组),qRT-PCR法检测得到的阳性组样品再用双抗夹心ELISA进行每份样品的检测。阳性牛间隔1个月用RT-PCR方法复检。结果表明:A场牛病毒性腹泻病毒阳性率为0.5%(1/193),B场为0.1%(2/875),C场为1.8%(1/55),D场未检测出牛病毒性腹泻/黏膜病抗原阳性牛(0/163)。间隔1个月,用RT-PCR方法复检,阳性符合率100%。说明qRT-PCR结合双抗夹心ELISA方法适合于规模化奶牛场牛病毒性腹泻/黏膜病的快速、特异性的检疫净化。 展开更多
关键词 奶牛 牛病毒性腹泻病毒 qrt-pcr 双抗夹心ELISA 检疫
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葡萄不同摘心处理下qRT-PCR内参基因的筛选与验证 被引量:4
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作者 赖呈纯 潘红 +4 位作者 张静 王琦 高慧颖 陈源 黄贤贵 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期890-900,共11页
摘心处理是保证葡萄产量和品质的关键栽培技术之一,选择稳定可靠的内参基因,有利于葡萄摘心响应分子机制相关基因表达的研究。本研究以不同摘心处理的葡萄叶片和茎杆为材料,利用qRT-PCR分析15个候选内参基因Actin、AP-2、Cyclophilin、E... 摘心处理是保证葡萄产量和品质的关键栽培技术之一,选择稳定可靠的内参基因,有利于葡萄摘心响应分子机制相关基因表达的研究。本研究以不同摘心处理的葡萄叶片和茎杆为材料,利用qRT-PCR分析15个候选内参基因Actin、AP-2、Cyclophilin、EF1-α、GAPDH、VAG、SAND、α-Tubulin、β-Tubulin、UBQ-L40、NAD5、ADH2、60SRP、18S rRNA、UBQ等在所供材料中的转录水平,并用RefFinder软件对候选内参基因稳定性进行综合评价。试验结果表明,葡萄叶片为材料的试验体系的最稳定内参基因为SAND和VAG,而葡萄茎杆为材料的试验体系以AP-2和Actin为最稳定的内参基因,且采用双内参基因组合,可以进一步提高试验结果的精确度;通过目的基因VvSS4转录水平数据标准化的验证,所获得的2组内参基因在各自的试验体系中可靠性高,可用于后续相关目的基因定量表达的研究。 展开更多
关键词 葡萄 摘心 实时荧光定量PCR(qrt-pcr) 内参基因 表达稳定性
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猪传染性胃肠炎病毒qRT-PCR检测方法的建立 被引量:9
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作者 原冬伟 颜子涵 +2 位作者 申贵男 王一 李明月 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1913-1917,共5页
猪传染性胃肠炎(TGE)是由猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)感染引起猪以腹泻、呕吐、脱水为主要特征的一种高度接触性肠道传染病,可造成极高的仔猪死亡率,且临床剖检很难与其他病毒性腹泻区别。本试验参考TGEV JS2012株N基因保守序列设计引物,... 猪传染性胃肠炎(TGE)是由猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)感染引起猪以腹泻、呕吐、脱水为主要特征的一种高度接触性肠道传染病,可造成极高的仔猪死亡率,且临床剖检很难与其他病毒性腹泻区别。本试验参考TGEV JS2012株N基因保守序列设计引物,构建阳性标准品,建立qRT-PCR检测方法。将阳性标准品10倍倍比稀释构建标准曲线,结果显示,在6.06×10^2~6.06×10^8拷贝/μL扩增具有良好的线性关系。同时对临床生产中常见的腹泻病毒:轮状病毒、猪德尔塔冠状病毒、猪流行性腹泻病毒核酸进行扩增,结果均为阴性,无交叉反应,表明该方法具有良好的特异性。通过与传统PCR检测方法对比,本试验建立的检测方法具有更高的灵敏性,为临床检测TGEV的早期感染和预防提供技术支持。 展开更多
关键词 qrt-pcr 猪传染性胃肠炎病毒 N基因
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梭梭qRT-PCR内参基因的筛选及稳定性分析 被引量:5
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作者 张玲玲 王淑冉 张胜 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期2005-2017,共13页
研究旨在探明梭梭(Haloxylon ammodendron)不同非生物胁迫下稳定表达的内参基因,为后续梭梭抗逆性相关基因功能研究奠定基础。采用实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术从梭梭转录组数据库中检测了GAPDH、EF1-α、UBC、RPL32、ALB、50S-... 研究旨在探明梭梭(Haloxylon ammodendron)不同非生物胁迫下稳定表达的内参基因,为后续梭梭抗逆性相关基因功能研究奠定基础。采用实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术从梭梭转录组数据库中检测了GAPDH、EF1-α、UBC、RPL32、ALB、50S-1721、50S-1063、RPⅡ、H3、PP2A、SOD、HSC70、TUA和TUB 14个候选内参基因在热胁迫、干旱、盐、ABA和昼夜节律条件下的表达变化,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder软件对梭梭候选内参基因的稳定性进行评价,最终筛选出合适的内参基因,并通过对梭梭磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC)基因表达分析,验证不同内参基因对试验结果的影响。4种软件分析得到的最优内参基因存在差异,在RefFinder网站上综合排序分析表明,在ABA处理和昼夜节律下,ALB是最优内参基因,RPⅡ基因在干旱胁迫下表达最稳定,TUB和RPⅡ基因在盐胁迫下最适用,H3基因在热胁迫下表达最为稳定。各种胁迫下最适宜的内参基因为ALB和RPL32。计算几何平均值得14个候选内参基因的综合稳定性排名,其中排名前2位的基因分别为SOD和RPL32。综上,SOD和RPL32可作为梭梭qRT-PCR标准化的内参基因。 展开更多
关键词 梭梭 非生物胁迫 内参基因 qrt-pcr
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QRT-PCR检测目的基因mRNA转录水平的应用 被引量:3
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作者 韩天龙 王敏 李志明 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第30期18432-18434,共3页
[目的]详细介绍One Step SYBR Green I实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time Quantitative Reverse Transcription PolymeraseChain Reaction,简称QRT-PCR)在定量检测靶基因mRNA转录水平上的应用。[方法]从样品准备、引物设计、核酸提... [目的]详细介绍One Step SYBR Green I实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time Quantitative Reverse Transcription PolymeraseChain Reaction,简称QRT-PCR)在定量检测靶基因mRNA转录水平上的应用。[方法]从样品准备、引物设计、核酸提取、反应体系构建、反应条件确定、标准曲线建立和目的基因定量等方面进行了分析。[结果]决定QRT-PCR反应成功与否的几个关键因素有模板的质量、底物的质量与浓度、引物的质量、酶和Mg2+、反应条件的优化。[结论]为畜牧兽医工作者利用分子生物学技术揭示疫病的发生机制和发病机理提供了技术参考,为基因表达的相对定量研究提供了方法支持。 展开更多
关键词 qrt-pcr 荧光定量 基因表达 转录水平
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黄独微型块茎诱导形成中SQS基因表达的qRT-PCR分析 被引量:1
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作者 尹明华 洪森荣 +2 位作者 林国卫 王爱斌 柯维忠 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1520-1524,共5页
目的对黄独微型块茎鲨烯合酶(SQS)基因的表达量进行分析,旨在为阐明黄独微型块茎不同诱导形成时期皂苷的合成机制提供理论依据。方法以Actin基因为内参基因,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析技术。通过对不同诱导形成时期的黄独... 目的对黄独微型块茎鲨烯合酶(SQS)基因的表达量进行分析,旨在为阐明黄独微型块茎不同诱导形成时期皂苷的合成机制提供理论依据。方法以Actin基因为内参基因,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析技术。通过对不同诱导形成时期的黄独微型块茎进行取样并提取RNA,反转录获得cDNA作模板,利用sybrGreen I成功构建了目的基因SQS和Actin的扩增曲线和熔解曲线。结果定量结果表明,SQS基因在黄独微型块茎诱导形成的初期(第18~36天)。表达量显著增加;在黄独微型块茎诱导形成的中期(第36-72天)SQS基因的表达量显著下降,并趋于稳定;在黄独微型块茎诱导形成的后期(第72-90天)SQS基因的表达量再次显著下降。结论在黄独微型块茎诱导形成的过程中,SQS基因的表达量呈现出“低-高-低-不变-低”的变化趋势,推测SQS是黄独微型块茎诱导形成中皂苷生物合成的关键酶。 展开更多
关键词 黄独 微型块茎诱导形成 鲨烯合酶SQS基因 ACTIN基因 qrt-pcr
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内参基因在昆虫qRT-PCR中的研究进展 被引量:3
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作者 史彩华 胡静荣 +1 位作者 李传仁 王文凯 《江苏农业科学》 北大核心 2017年第7期1-7,共7页
实时荧光定量PCR(qRT-PCR)具有灵敏度高、特异性强等优点,是昆虫目标基因表达和转录分析最常用的技术手段之一。然而,为了消除样本在RNA产量、质量及逆转录效率上存在的差异,在进行qRT-PCR分析目标基因表达量时必须选择合适的"管... 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)具有灵敏度高、特异性强等优点,是昆虫目标基因表达和转录分析最常用的技术手段之一。然而,为了消除样本在RNA产量、质量及逆转录效率上存在的差异,在进行qRT-PCR分析目标基因表达量时必须选择合适的"管家基因"作为内参基因。近年来,大量研究表明不同昆虫和不同试验条件选择的内参基因也不尽相同。因此,选择合适的内参基因是正确判断qRT-PCR结果分析的关键。从内参基因的选择、昆虫内参基因的研究和内参基因稳定性评价等几个方面进行综述,以期为研究者在将来的昆虫试验中选择合适的内参基因提供理论参考依据。 展开更多
关键词 内参基因 昆虫 qrt-pcr 进展
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新血清型流行性出血病病毒荧光定量qRT-PCR与RT-PCR检测方法的建立及应用 被引量:2
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作者 杨振兴 李占鸿 +5 位作者 宋子昂 李卓然 李华春 朱建波 廖德芳 杨恒 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期446-454,共9页
流行性出血病病毒(EHDV)是一种严重危害反刍动物的虫媒病毒。目前世界范围已发现9种血清型的EHDV,2018年笔者在云南芒市新分离到1株新血清型EHDV毒株(YNDH/V079/2018),但尚缺乏该血清型的特异性检测方法。本研究建立了新血清型EHDV核酸... 流行性出血病病毒(EHDV)是一种严重危害反刍动物的虫媒病毒。目前世界范围已发现9种血清型的EHDV,2018年笔者在云南芒市新分离到1株新血清型EHDV毒株(YNDH/V079/2018),但尚缺乏该血清型的特异性检测方法。本研究建立了新血清型EHDV核酸检测的实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)和RT-PCR方法。试验结果显示,建立的两种方法均具有良好的特异性与灵敏度,与另外7种血清型EHDV、蓝舌病病毒(BTV)、中山病病毒(CHUV)、阿卡斑病毒(AKAV)和阴性对照均无交叉反应。对病毒核酸的检测下限分别达到10 copies/μL(qRT-PCR)与102copies/μL(RT-PCR)。临床样品检测显示,qRT-PCR能在动物感染EHDV早期检测鉴定出病毒,更适合应用于检测病毒载量较低的血液样品。RT-PCR的扩增产物可以胶回收测序,进一步了解待测病毒的遗传信息,两种方法辅助使用,为新血清型EHDV的早期快速诊断、流行病学调查和试验研究等提供了有效的技术方法。 展开更多
关键词 流行性出血病病毒 新血清型 荧光定量qrt-pcr RT-PCR 血清型鉴定
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