-
题名水稻穗长基因qPL9的精细定位及其候选基因分析
被引量：2
- 1
-
-
作者
连光倩
翟雪
尚菲
王建飞
-
机构
南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室
-
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期398-405,共8页
-
基金
江苏省自然科学基金项目(BK2015142)
-
文摘
[目的]本研究旨在发掘水稻产量相关基因,为水稻产量性状改良提供新的种质资源,为水稻穗发育遗传研究提供分子证据。[方法]利用表型差异明显的粳稻‘茭白稻’和籼稻‘Saber’构建F_2群体,对其株高及穗部性状进行QTL检测。根据F_2结果,构建F_(2∶3)分离群体,对效应值较高的穗长QTL qPL9进行验证、精细定位和候选基因预测,并对候选基因进行克隆、测序和序列比对分析。[结果]在F_2群体中检测到株高、穗长、每穗颖花数、二次枝梗数、粒长和粒宽共6个性状的16个QTL。其中效应最高的qPL9解释了32.8%的穗长变异,位于SSR标记RM1189和L171之间,LOD值为8.27。对qPL9所在位点进行验证后进行精细定位,最终将其定位在InDel标记L174与L171之间,物理距离为90.47 kb,含有9个开放阅读框(ORF)。分析候选基因序列,发现LOC_Os09g28300、LOC_Os09g28310和LOC_Os09g28320的编码序列在‘茭白稻’和‘Saber’间有差异,且导致氨基酸序列差异。[结论]qPL9是新位点,其候选基因可能为LOC_Os09g28300、LOC_Os09g28310和LOC_Os09g28320。
-
关键词
水稻
QTL
精细定位
qpl9
候选基因
-
Keywords
rice(Oryza sativa L.)
QTL
fine mapping
qPL 9
candidate gene
-
分类号
S511.032
[农业科学—作物学]
-
