条斑紫菜光系统Ⅱ反应中心蛋白编码psbA和psbD的表达分析 被引量：2

1

作者 陈张帆 王广策 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期52-56,共5页

从条斑紫菜(Porphyra yezoensisUeda)的3个不同的生长阶段:壳孢子、孢子体和配子体中提取总RNA,并用相应基因的引物扩增序列,用荧光定量PCR技术检测条斑紫菜3个生长阶段中psbA和psbD的转录水平变化。结果表明,psbA和psbD的变化趋势不一... 从条斑紫菜(Porphyra yezoensisUeda)的3个不同的生长阶段:壳孢子、孢子体和配子体中提取总RNA,并用相应基因的引物扩增序列,用荧光定量PCR技术检测条斑紫菜3个生长阶段中psbA和psbD的转录水平变化。结果表明,psbA和psbD的变化趋势不一致,并且,在壳孢子内基因表达量相对较高。这说明在细胞内,D1蛋白和D2蛋白并非同比例合成。壳孢子成熟发育成叶状体的过程要求光合作用提供更多的能量。 展开更多

关键词 爷斑紫菜(Porphyra YEZOENSIS Ueda) 不同发育阶段 PSBA psbd 基因表达

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花叶矢竹叶绿体psbD基因的克隆与功能分析 被引量：6

2

作者 许冰清 安苗苗 +3 位作者 姜可以 徐丽丽 杨海芸 周明兵 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期557-565,共9页

植物叶绿体光系统Ⅱ是植物进行光能转化、水的裂解和释放氧气的重要蛋白复合物,psb D基因编码光系统Ⅱ(PSⅡ)作用中心蛋白D2,D2和D1构成的异源二聚体上结合着与电子传递有关的大部分辅助因子和色素分子。以花叶矢竹Pseudosasa japonica ... 植物叶绿体光系统Ⅱ是植物进行光能转化、水的裂解和释放氧气的重要蛋白复合物,psb D基因编码光系统Ⅱ(PSⅡ)作用中心蛋白D2,D2和D1构成的异源二聚体上结合着与电子传递有关的大部分辅助因子和色素分子。以花叶矢竹Pseudosasa japonica f.akebonosuji为材料,提取总DNA,聚合酶链式反应(PCR)扩增psb D基因全长序列(Pj-psb D)。序列分析表明:其开放阅读框(ORF)为1 059 bp,编码352个氨基酸,相对分子质量为39.59 k D,等电点为5.34,有6个跨膜结构,有别于高等植物中psb D蛋白普遍存在的5个跨膜区。psb D还具备有多个与光合作用有关的结构域和功能位点。本实验用荧光定量PCR技术检测了花叶矢竹叶片3个不同生长阶段和3种叶色中psb D基因的表达量。分析表明:在花叶矢竹叶片生长发育时期,为了满足叶片生长发育和叶绿体的形成的需要,psb D基因表达量逐步提高。研究还发现:psb D在白叶中的表达量显著高于绿叶,这可能与植物的光保护机制有关,降低强光对白色和部分白叶的光合系统的损伤。 展开更多

关键词 分子生物学 花叶矢竹 psbd基因 克隆 叶色变异 荧光定量聚合酶链式反应(q RT-PCR)

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蕨类植物psbD基因的适应性进化和共进化分析 被引量：5

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作者 许可 王博 +2 位作者 苏应娟 高磊 王艇 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期429-438,共10页

D2蛋白是植物光系统Ⅱ复合体(PSⅡ)核心蛋白之一,由叶绿体psbD基因编码。为了深入理解核心薄囊蕨类植物在阴生环境下的"辐射"式演化,我们对12种蕨类植物的psbD基因进行了克隆和测序,然后联合已公布的其他8种蕨类植物的psbD序... D2蛋白是植物光系统Ⅱ复合体(PSⅡ)核心蛋白之一,由叶绿体psbD基因编码。为了深入理解核心薄囊蕨类植物在阴生环境下的"辐射"式演化,我们对12种蕨类植物的psbD基因进行了克隆和测序,然后联合已公布的其他8种蕨类植物的psbD序列,基于ω值(非同义替换率dN和同义替换率dS的比值)探讨了该基因经受的选择压力。发现D2蛋白在大多数分支和位点受到强烈的负选择,但是树蕨类分支的psbD进化速率低且ω值较高。借助多种模型进行的共进化分析显示,树蕨类D2蛋白的168R、245H和272M两两组成具有共进化关系的氨基酸位点对。 展开更多

关键词 核心薄囊蕨 psbd基因 选择压力 共进化

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脱水对条斑紫菜叶状体psbA和psbD基因表达量的影响 被引量：1

4

作者 杨芳 王广策 +2 位作者 张宝玉 陈张帆 潘光华 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期61-66,共6页

从处于不同脱水复水阶段的条斑紫菜(Porphyra yezoensis Ueda)叶状体中提取总RNA,用荧光定量PCR技术检测条斑紫菜不同脱水和复水过程中psbA和psbD基因的转录水平上的相对表达量的变化。实验结果表明,psbA和psbD基因转录水平上的相对表... 从处于不同脱水复水阶段的条斑紫菜(Porphyra yezoensis Ueda)叶状体中提取总RNA,用荧光定量PCR技术检测条斑紫菜不同脱水和复水过程中psbA和psbD基因的转录水平上的相对表达量的变化。实验结果表明,psbA和psbD基因转录水平上的相对表达量的变化趋势相似但变化幅度不一致。在相对含水量约为71%时两种基因转录水平上的相对表达量分别增加了6.18倍和2.13倍。说明在条斑紫菜叶状体脱水过程中两种基因的转录并非同比例完成;在轻度脱水状态下psbA和psbD基因转录水平上的相对表达量的快速增大可能是藻体暴露在空气中时适应陆地环境的初始响应。 展开更多

关键词 条斑紫菜(Porphyra YEZOENSIS Ueda) 脱水复水 PSBA psbd 转录水平上的相对表达量

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高粱叶绿体psbD基因在重组质粒pSD_2Ⅱ中的定位及psbD基因的亚克隆 被引量：1

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作者 许卫东 程振起 阎隆飞 《生物化学杂志》 CSCD 1992年第3期257-261,共5页

利用pUC19我们构建了高粱叶绿体基因文库,从库中我们筛选到4个含psbD基因的阳性克隆。Southern分析证明重组质粒由pUC19和高梁叶绿体DNA的Pst10片段组成。通过8种限制性内切酶酶切分析和Southern分析测出了重组质粒pSD_2Ⅱ的物理图谱,... 利用pUC19我们构建了高粱叶绿体基因文库,从库中我们筛选到4个含psbD基因的阳性克隆。Southern分析证明重组质粒由pUC19和高梁叶绿体DNA的Pst10片段组成。通过8种限制性内切酶酶切分析和Southern分析测出了重组质粒pSD_2Ⅱ的物理图谱,并确定了高梁psbD基因在重组质粒中的精确位置。通过构建pSAC_2质粒,可以将Pst10片段中非psbD部分去除,使psbD可以直接用EcoRⅠ从pSAC_2上切下,为研究高粱psbD基因的表达和序列分析奠定了基础。 展开更多

关键词 psbd基因 物理图谱 亚克隆 高粱

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羊草(Leymus chinensis)psbD基因开放读码框(ORF)的克隆及序列分析

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作者 徐晶 王傲雪 +1 位作者 李新玲 徐香玲 《哈尔滨师范大学自然科学学报》 CAS 2008年第6期65-69,共5页

从羊草中提取总RNA,采用简并PCR方法,扩增出编码353个氨基酸的psbD基因开放读码框(Open read ing frame,ORF)cDNA序列,GenBank登陆号为FJ176573,并对其序列进行了分析.同时次基因组DNA为模板对psbD基因开放读码框区域进行了扩增,证明该... 从羊草中提取总RNA,采用简并PCR方法,扩增出编码353个氨基酸的psbD基因开放读码框(Open read ing frame,ORF)cDNA序列,GenBank登陆号为FJ176573,并对其序列进行了分析.同时次基因组DNA为模板对psbD基因开放读码框区域进行了扩增,证明该基因无内含子,为其功能的进一步研究提供基因材料和理论依据. 展开更多

关键词 psbd基因 羊草 开放读码框

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带有调控序列的豌豆psbD基因的体外扩增

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作者 张燕珠 王广策 《南开大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 1993年第4期96-98,共3页

ｐｓｂＤ基因编码光系统Ⅱ反应中心Ｄ２蛋白。本文首次用多聚酶链式反应（ＰＣＲ）体外扩增了包括５＇上游调控序列和完整蛋白质编码序列的ｐｓｂＤ基因。

关键词 psbd基因 PCR 豌豆 蛋白

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高粱叶绿体psbD基因的克隆及其高效表达 被引量：2

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作者 许卫东 阎隆飞 程振起 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 1991年第22期1741-1744,共4页

近年来光合作用基因工程的研究进展十分迅速,许多重要的编码光合作用反应中心的蛋白质及酶的基因,已在多种植物叶绿体基因组及核基因组上定位并测定了其碱基序列,杉浦昌弘等先后完成了烟草、水稻等高等植物叶绿体基因组全序列分析,但是... 近年来光合作用基因工程的研究进展十分迅速,许多重要的编码光合作用反应中心的蛋白质及酶的基因,已在多种植物叶绿体基因组及核基因组上定位并测定了其碱基序列,杉浦昌弘等先后完成了烟草、水稻等高等植物叶绿体基因组全序列分析,但是C_4植物除玉米外,叶绿体基因的研究较少,高粱是主要的C_4植物。 展开更多

关键词 psbd基因 克隆 叶绿体 光合作用

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杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心蛋白D2基因的克隆及序列分析

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作者 刘红涛 宋建伟 +3 位作者 臧卫东 鲁照明 王鹏举 薛乐勋 《华中师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 2007年第3期431-436,共6页

根据莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、Oryza sativa、Chlorella vulgaris以及Me-sostigma viride等真核生物的psbD基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用TRIzol试剂提取杜氏盐藻(Dunaliella salina)细胞的总RNA,通过RT-... 根据莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、Oryza sativa、Chlorella vulgaris以及Me-sostigma viride等真核生物的psbD基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用TRIzol试剂提取杜氏盐藻(Dunaliella salina)细胞的总RNA,通过RT-PCR,得到杜氏盐藻cDNA片段的长度大约为1 000bp.该序列的PCR产物经T-A克隆并测序分析以及测序结果推导成氨基酸序列,Blast同源性分析表明所克隆的基因为杜氏盐藻psbD基因,编码杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心D2蛋白,该序列已递交GenBank(GenBank登录号为:DQ074450).编码的氨基酸序列,同源性依次为:Chlamydomonas reinhardtii92%,Nephroselmis olivacea88%,Pinus thunbergii88%,Am-borella trichopoda88%,Chlorella vulgaris88%.通过密码子偏爱性分析表明,psbD基因存在明显的密码子偏爱性,其(A+T)含量明显高于(G+C)含量. 展开更多

关键词 杜氏盐藻 D2蛋白 psbd 简并引物 密码子偏爱性

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互补问题中几类特殊矩阵之间的关系

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作者 孙艳波 《西南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2015年第2期1-4,共4页

线性互补问题中特殊矩阵M的性质是线性互补问题研究中的一个重要部分.研究了Cf0矩阵与半正定矩阵的关系,PSBD矩阵与半正定矩阵的关系,以及P矩阵与S矩阵的关系,得到了一些新的结论.

关键词 半正定矩阵 Cf0矩阵 psbd矩阵 P矩阵 S矩阵

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大肠杆菌二氢硫辛酸转乙酰基酶的外周亚基结合结构域的溶液构象 被引量：2

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作者 龚泽茂 邱水 +1 位作者 王媛媛 陶虎 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期624-629,共6页

丙酮酸脱氢酶复合体催化丙酮酸氧化脱羧,生成乙酰辅酶A.该复合体由丙酮酸脱羧酶(E1)、二氢硫辛酸乙酰转移酶(E2)和二氢硫辛酸脱氢酶(E3)三种酶组成.大肠杆菌E2的外周亚基结合结构域(peripheral subunit-binding domain,PSBD)结合E1和E3... 丙酮酸脱氢酶复合体催化丙酮酸氧化脱羧,生成乙酰辅酶A.该复合体由丙酮酸脱羧酶(E1)、二氢硫辛酸乙酰转移酶(E2)和二氢硫辛酸脱氢酶(E3)三种酶组成.大肠杆菌E2的外周亚基结合结构域(peripheral subunit-binding domain,PSBD)结合E1和E3,对丙酮酸脱氢酶复合物的结构和功能有重要作用.本研究采用PCR技术扩增了E2的PSBD的48个氨基酸残基区域编码序列(c DNA),构建p ET-32a-pp-Psbd表达载体,测序正确后转入BL21(DE3)中表达,目的蛋白质用镍柱和Hi Trap SP柱纯化后达到电泳纯,质谱鉴定纯化后蛋白质分子量与理论值符合.pull-down结果表明,PSBD可分别与E1和E3结合.圆二色谱表征PSBD的二级结构主要为a-螺旋,当在0.5mol/L Na Cl的离子强度下,55.7%的PSBD分子折叠为正确的构象.动态光散射实验发现,PSBD分子有3种不同的构象存在形式,因此,PSBD非常容易从折叠态转化为不和E1、E3结合的无规卷曲态,这种构象的相互转化为其功能性与E1、E3结合及解离提供了结构基础. 展开更多

关键词 二氢硫辛酸乙酰基转移酶 外周结合结构域 圆二色谱 构象 动态光散射

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