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克氏原螯虾微小杆菌Exiguobacterium profundum的分离鉴定与药敏试验 被引量：2
1
作者 石瑞雪 李艳和 《中国农学通报》 2023年第2期123-129,共7页
为了判断克氏原螯虾(Procambarus clarkii)发病致死的原因,从发病濒死虾肝胰脏中分离出一株优势菌,通过对该菌进行菌落形态观察、革兰氏染色、生理生化鉴定、16srRNA测序分析及进化树构建确认其为微小杆菌Exiguobacterium profundum。... 为了判断克氏原螯虾(Procambarus clarkii)发病致死的原因,从发病濒死虾肝胰脏中分离出一株优势菌,通过对该菌进行菌落形态观察、革兰氏染色、生理生化鉴定、16srRNA测序分析及进化树构建确认其为微小杆菌Exiguobacterium profundum。通过纸片扩散法测定了该菌株对青霉素G、氨苄西林、头孢氨苄、阿米卡星、庆大霉素、卡那霉素、诺氟沙星、复方新诺明等30种抗菌药物的敏感性,结果显示该菌对30种药物均敏感。通过回归感染实验推测其可能参与克氏原螯虾的致病过程。本实验结果为克氏原螯虾E.profundum的病原鉴定和药物诊治提供了一定的参考和理论基础。 展开更多
关键词 克氏原螯虾 微小杆菌Exiguobacterium profundum 病原鉴定 16SRRNA基因 药敏试验 回归感染
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深海微小杆菌的分离鉴定及其对长牡蛎的致病性
2
作者 姜军 孙洁洁 +4 位作者 杨文文 高磊 冷金源 王玲玲 宋林生 《水产学报》 北大核心 2025年第1期207-220,共14页
【目的】从患有脓包病的长牡蛎中分离并鉴定致病菌,系统分析其形态特征、生理生化特征及致病机制,为长牡蛎脓包病的防治提供科学依据。【方法】从辽宁省大连市庄河某养殖区采集了患有脓包病的长牡蛎,利用16S rDNA测序及生物信息学技术... 【目的】从患有脓包病的长牡蛎中分离并鉴定致病菌,系统分析其形态特征、生理生化特征及致病机制,为长牡蛎脓包病的防治提供科学依据。【方法】从辽宁省大连市庄河某养殖区采集了患有脓包病的长牡蛎,利用16S rDNA测序及生物信息学技术鉴定出一株深海微小杆菌,并对其进行药敏实验和溶血实验,进一步结合人工感染实验、高通量测序和实时荧光定量PCR技术分析感染后长牡蛎鳃组织中炎症相关基因表达及细菌群落结构变化情况。【结果】分离菌株在2216 E琼脂培养基中形成直径为1.0~1.5 mm的乳黄色菌落,形态均一稳定;对头孢哌酮、青霉素和阿莫西林等抗生素高度敏感;在28℃条件下表现出显著的β溶血活性。人工感染实验显示,深海微小杆菌感染导致长牡蛎外套膜出现脓包,鳃表面出现白色斑点,同时伴有肿胀,感染后长牡蛎鳃组织中Cgtlr3、Cgap-1、Cgcaspase-3、Cgil-17-5和Cgil-17-6基因的mRNA表达水平显著升高。高通量测序分析显示,感染后长牡蛎鳃组织中变形菌门和弯曲杆菌门的相对丰度增加,弧菌科的相对丰度升高。【结论】深海微小杆菌促进鳃组织炎症相关基因的表达,同时提高了鳃组织中弧菌的丰度导致长牡蛎发病,是诱发长牡蛎脓包病的潜在病原之一。研究结果为贝类病害的预防和控制提供了一定的数据支撑。 展开更多
关键词 长牡蛎 脓包病 深海微小杆菌 16S rDNA测序 转录组测序
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深海嗜压菌水通道蛋白AqpSS9在Bac-to-Bac家蚕杆状病毒系统中表达 被引量：2
3
作者 陈旭 陈健 +4 位作者 黄磊 蔡谨 吕正兵 张耀洲 徐志南 《药物生物技术》 CAS CSCD 2011年第4期283-287,共5页
利用家蚕杆状病毒表达系统合成深海嗜压菌Photobacterium profundum SS9的新型水通道蛋白AqpSS9。首先通过家蚕核型多角体病毒BmNPV的Bac-to-Bac系统构建重组转移载体pFasBac HTB-AqpSS9,将其转化到含穿梭载体Bm-Bacmid的大肠杆菌Bm-DH1... 利用家蚕杆状病毒表达系统合成深海嗜压菌Photobacterium profundum SS9的新型水通道蛋白AqpSS9。首先通过家蚕核型多角体病毒BmNPV的Bac-to-Bac系统构建重组转移载体pFasBac HTB-AqpSS9,将其转化到含穿梭载体Bm-Bacmid的大肠杆菌Bm-DH10Bac中进行转座作用,白斑筛选得到重组穿梭载体Bacmid-AqpSS9。用脂质体介导将Bacmid-AqpSS9转染家蚕BmN细胞,在细胞内包装形成重组的BmNPV病毒rBm AqpSS9。利用SDS-PAGE及Western blot检测重组蛋白AqpSS9在家蚕培养细胞中的表达,结果显示目标蛋白被成功表达。该实验为新型水通道蛋白AqpSS9的进一步应用研究奠定了基础。 展开更多
关键词 水通道蛋白AqpSS9 Bac-to—Bac/BMNPV系统 表达 Photobacterium profundum SS9
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微小杆菌NOS基因密码子偏好性分析
4
作者 罗希帆 王宇 +3 位作者 杜锦 陈帅君 杨红澎 吴疆 《天津农学院学报》 CAS 2024年第4期23-29,共7页
对微小杆菌NOS基因密码子偏好性进行分析,为后续NOS基因的功能验证及遗传转化等研究提供理论依据。研究表明:微小杆菌NOS基因的密码子偏好性较弱,偏好使用G/C结尾的密码子;比较分析不同细菌NOS基因的密码子偏好性参数,发现不同细菌NOS... 对微小杆菌NOS基因密码子偏好性进行分析,为后续NOS基因的功能验证及遗传转化等研究提供理论依据。研究表明:微小杆菌NOS基因的密码子偏好性较弱,偏好使用G/C结尾的密码子;比较分析不同细菌NOS基因的密码子偏好性参数,发现不同细菌NOS基因密码子偏好性存在一定差异,整体看,放线菌NOS基因密码子偏好性比蓝藻,厚壁菌门强;与其他细菌NOS基因的CDS序列及RSCU值聚类分析表明,微小杆菌NOS基因与放线菌NOS基因表现出相近的密码子使用偏好性;中性绘图、PR2-plot和ENc-plot分析均表明,自然选择是影响NOS基因密码子偏好性形成的主要因素;与7种模式生物的基因组密码子使用频率比较发现,在异源转化受体选择中,大肠杆菌原核表达系统较酵母菌真核表达系统更适合微小杆菌NOS异源表达,常见5种作物均可作为微小杆菌NOS基因的遗传转化受体,其中水稻更理想。本研究初步揭示了微小杆菌NOS基因密码子使用规律,对后续开展基因功能验证有重要的指导作用,同时也可为生物一氧化氮合成酶进化提供一定科学依据。 展开更多
关键词 微小杆菌 NOS基因 密码子 偏好性
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微小杆菌冷激蛋白(CSP)基因密码子偏好性分析
5
作者 钟迎兰 罗希帆 +3 位作者 杜锦 陈帅君 黄海东 吴疆 《天津农学院学报》 CAS 2024年第5期1-10,共10页
对微小杆菌(Exobacterium profundaum)冷激蛋白(CSP)基因(EpCSP)密码子偏好性进行分析,为后续EpCSP基因的功能验证及遗传转化等研究提供理论依据。结果表明:EpCSP基因的密码子偏好性较弱,偏好使用A/T结尾的密码子;比较分析不同物种CSP... 对微小杆菌(Exobacterium profundaum)冷激蛋白(CSP)基因(EpCSP)密码子偏好性进行分析,为后续EpCSP基因的功能验证及遗传转化等研究提供理论依据。结果表明:EpCSP基因的密码子偏好性较弱,偏好使用A/T结尾的密码子;比较分析不同物种CSP基因的密码子偏好性参数发现,大多数物种CSP基因密码子偏好使用G/C结尾的密码子;21个物种CSP基因的CDS序列及RSCU值聚类分析表明,微小杆菌与另外20个不同物种CSP基因密码子使用偏好性存在一定差异;中性分析、PR2-plot分析、ENc-plot等都证实了自然选择是影响CSP基因密码子偏好性形成的最主要原因;与7种模式生物的基因组密码子使用频率对比研究表明,在筛选异源转化受体时,作为真核表达系统的酿酒酵母比作为原核表达系统的大肠杆菌更利于EpCSP基因异源表达,而在选择植物遗传转化受体时,拟南芥和小麦比烟草和水稻更适合作为EpCSP基因的遗传转化受体。本研究初步探索了EpCSP基因密码子使用偏好性,对以后开展基因功能验证有重要的指导作用,同时也可为研究微小杆菌分子进化提供一定的理论基础。 展开更多
关键词 微小杆菌 CSP基因 密码子偏好性 异源表达 外源宿主
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