为探讨甘芪品系高抗麻口病特性在蛋白质水平上的抗病机制,利用iBAQ(intensity-basedabsolute-protein-quantification)非标记定量蛋白质组学技术分析鉴定具有高抗麻口病特性的甘芪纯系群体(HQ_(1)、HQ_(6)、HQ_(19))与高感麻口病黄芪(CK...为探讨甘芪品系高抗麻口病特性在蛋白质水平上的抗病机制,利用iBAQ(intensity-basedabsolute-protein-quantification)非标记定量蛋白质组学技术分析鉴定具有高抗麻口病特性的甘芪纯系群体(HQ_(1)、HQ_(6)、HQ_(19))与高感麻口病黄芪(CK)在蛋白质水平上的表达差异,收集HQ_(1)、HQ_(6)、HQ_(19)及CK中的总蛋白,通过SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳对总蛋白进行分离,胶内酶解,提出肽段,运用LC-MS/MS获得质谱图,于Uniport蛋白数据库中检索以及iBAQ非标定量分析,筛选出差异蛋白与特异性表达蛋白,对其进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果表明,通过LC-MS/MS分析共鉴定到蛋白质169个,其中8个蛋白质在甘芪品系与CK之间的差异具有统计学意义(P<0.05),有6个蛋白质特异性表达,NADH脱氢酶亚基7与蔗糖合酶在差异蛋白与特异性蛋白中均存在。生物学分析发现差异蛋白大多富集在分子功能方面的ATP合成上,特异性蛋白多富集在生物过程方面,包括参与肉桂酸、麦角甾醇等生物合成以及蔗糖、乙酰辅酶A、L-苯丙氨酸分解等代谢过程,对以上蛋白进行KEGG通路富集,发现50%的蛋白参与了新陈代谢通路,包括能量代谢、氨基酸代谢、脂质代谢等。该方法筛选出了与甘芪品系高抗麻口病特性相关的多种蛋白质,包括NADH脱氢酶亚基7、蔗糖合酶、查尔酮合酶及非特异性丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶等。展开更多
目的 探讨慢性阻塞性肺疾病急性加重期(AECOPD)并Ⅱ型呼吸衰竭病人无创通气(NIV)治疗结局的危险因素并构建预测模型加以评价。方法 回顾性选取2020年5月至2023年5月在资阳市精神病医院就诊的AECOPD并Ⅱ型呼吸衰竭病人142例,均接受NIV治...目的 探讨慢性阻塞性肺疾病急性加重期(AECOPD)并Ⅱ型呼吸衰竭病人无创通气(NIV)治疗结局的危险因素并构建预测模型加以评价。方法 回顾性选取2020年5月至2023年5月在资阳市精神病医院就诊的AECOPD并Ⅱ型呼吸衰竭病人142例,均接受NIV治疗。根据治疗24 h内NIV治疗结局将病人分为失败组(n=53)和成功组(n=89)。比较两组超敏C反应蛋白(hs-CRP)、白蛋白(Alb)和hs-CRP/Alb比值及临床资料。采用多因素logistic回归分析探索NIV治疗失败的独立危险因素,将独立危险因素引入R软件构建风险模型并进行模型评价。结果 失败组hs-CRP和hs-CRP/Alb值(2.14±0.50比0.53±0.12)高于成功组,Alb水平则低于成功组(均P<0.05);与成功组相比,失败组病人的呼吸频率值、舒张压、急性生理学和慢性健康状况评价Ⅱ(APACHEⅡ)评分[(22.48±4.17)分比(18.72±3.91)分]、序贯器官衰竭评估(SOFA)评分、白细胞计数及治疗前和治疗1 h后动脉血二氧化碳分压(PaCO_(2))水平[(76.11±12.22)mmHg比(58.83±9.92)mmHg]更高,失败组病人治疗前的动脉血氧分压(PaO2)水平、氧合指数及治疗前和治疗1 h后的pH值(7.29±0.18比7.40±0.21)更低(均P<0.05)。多因素logistic回归模型显示,hs-CRP/Alb值高(OR=2.75)、APACHEⅡ评分高(OR=1.61)、治疗1 h pH值低(OR=1.68)和PaCO_(2)高(OR=2.45)均为影响NIV治疗失败的独立危险因素(P<0.05);根据独立危险因素建立NIV治疗失败的预测模型方程:Logit(P)=-0.06+0.47×APACHEⅡ评分+0.52×治疗1 h pH值+0.90×治疗1 h PaCO_(2)+1.01×hs-CRP/Alb值,采用Bootstrap法内部验证显示,预测模型区分度良好;校准曲线显示模型拟合度好;构建的logistic预测模型进行回顾性验证,结果 显示其预测NIV治疗失败的受试者操作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC)为0.93,预测模型的预测效能优于hs-CRP/Alb值单独预测效能。结论 hs-CRP/Alb值高、APACHEⅡ评分高、治疗1 h pH值低和PaCO_(2)高是AECOPD并Ⅱ型呼吸衰竭病人NIV治疗失败的独立危险因素,引入独立危险因素构建的风险预测模型区分度、拟合度好,对NIV治疗结局具有较高的参考价值。展开更多
文摘为探讨甘芪品系高抗麻口病特性在蛋白质水平上的抗病机制,利用iBAQ(intensity-basedabsolute-protein-quantification)非标记定量蛋白质组学技术分析鉴定具有高抗麻口病特性的甘芪纯系群体(HQ_(1)、HQ_(6)、HQ_(19))与高感麻口病黄芪(CK)在蛋白质水平上的表达差异,收集HQ_(1)、HQ_(6)、HQ_(19)及CK中的总蛋白,通过SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳对总蛋白进行分离,胶内酶解,提出肽段,运用LC-MS/MS获得质谱图,于Uniport蛋白数据库中检索以及iBAQ非标定量分析,筛选出差异蛋白与特异性表达蛋白,对其进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果表明,通过LC-MS/MS分析共鉴定到蛋白质169个,其中8个蛋白质在甘芪品系与CK之间的差异具有统计学意义(P<0.05),有6个蛋白质特异性表达,NADH脱氢酶亚基7与蔗糖合酶在差异蛋白与特异性蛋白中均存在。生物学分析发现差异蛋白大多富集在分子功能方面的ATP合成上,特异性蛋白多富集在生物过程方面,包括参与肉桂酸、麦角甾醇等生物合成以及蔗糖、乙酰辅酶A、L-苯丙氨酸分解等代谢过程,对以上蛋白进行KEGG通路富集,发现50%的蛋白参与了新陈代谢通路,包括能量代谢、氨基酸代谢、脂质代谢等。该方法筛选出了与甘芪品系高抗麻口病特性相关的多种蛋白质,包括NADH脱氢酶亚基7、蔗糖合酶、查尔酮合酶及非特异性丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶等。
文摘目的 探讨慢性阻塞性肺疾病急性加重期(AECOPD)并Ⅱ型呼吸衰竭病人无创通气(NIV)治疗结局的危险因素并构建预测模型加以评价。方法 回顾性选取2020年5月至2023年5月在资阳市精神病医院就诊的AECOPD并Ⅱ型呼吸衰竭病人142例,均接受NIV治疗。根据治疗24 h内NIV治疗结局将病人分为失败组(n=53)和成功组(n=89)。比较两组超敏C反应蛋白(hs-CRP)、白蛋白(Alb)和hs-CRP/Alb比值及临床资料。采用多因素logistic回归分析探索NIV治疗失败的独立危险因素,将独立危险因素引入R软件构建风险模型并进行模型评价。结果 失败组hs-CRP和hs-CRP/Alb值(2.14±0.50比0.53±0.12)高于成功组,Alb水平则低于成功组(均P<0.05);与成功组相比,失败组病人的呼吸频率值、舒张压、急性生理学和慢性健康状况评价Ⅱ(APACHEⅡ)评分[(22.48±4.17)分比(18.72±3.91)分]、序贯器官衰竭评估(SOFA)评分、白细胞计数及治疗前和治疗1 h后动脉血二氧化碳分压(PaCO_(2))水平[(76.11±12.22)mmHg比(58.83±9.92)mmHg]更高,失败组病人治疗前的动脉血氧分压(PaO2)水平、氧合指数及治疗前和治疗1 h后的pH值(7.29±0.18比7.40±0.21)更低(均P<0.05)。多因素logistic回归模型显示,hs-CRP/Alb值高(OR=2.75)、APACHEⅡ评分高(OR=1.61)、治疗1 h pH值低(OR=1.68)和PaCO_(2)高(OR=2.45)均为影响NIV治疗失败的独立危险因素(P<0.05);根据独立危险因素建立NIV治疗失败的预测模型方程:Logit(P)=-0.06+0.47×APACHEⅡ评分+0.52×治疗1 h pH值+0.90×治疗1 h PaCO_(2)+1.01×hs-CRP/Alb值,采用Bootstrap法内部验证显示,预测模型区分度良好;校准曲线显示模型拟合度好;构建的logistic预测模型进行回顾性验证,结果 显示其预测NIV治疗失败的受试者操作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC)为0.93,预测模型的预测效能优于hs-CRP/Alb值单独预测效能。结论 hs-CRP/Alb值高、APACHEⅡ评分高、治疗1 h pH值低和PaCO_(2)高是AECOPD并Ⅱ型呼吸衰竭病人NIV治疗失败的独立危险因素,引入独立危险因素构建的风险预测模型区分度、拟合度好,对NIV治疗结局具有较高的参考价值。
