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Ultra-Fast Next Generation Human Genome Sequencing Data Processing Using DRAGEN<sup>TM</sup>Bio-IT Processor for Precision Medicine 被引量:3
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作者 Amit Goyal Hyuk Jung Kwon +5 位作者 Kichan Lee Reena Garg Seon Young Yun Yoon Hee Kim Sunghoon Lee Min Seob Lee 《Open Journal of Genetics》 2017年第1期9-19,共11页
Slow speed of the Next-Generation sequencing data analysis, compared to the latest high throughput sequencers such as HiSeq X system, using the current industry standard genome analysis pipeline, has been the major fa... Slow speed of the Next-Generation sequencing data analysis, compared to the latest high throughput sequencers such as HiSeq X system, using the current industry standard genome analysis pipeline, has been the major factor of data backlog which limits the real-time use of genomic data for precision medicine. This study demonstrates the DRAGEN Bio-IT Processor as a potential candidate to remove the “Big Data Bottleneck”. DRAGENTM accomplished the variant calling, for ~40× coverage WGS data in as low as ~30 minutes using a single command, achieving the over 50-fold data analysis speed while maintaining the similar or better variant calling accuracy than the standard GATK Best Practices workflow. This systematic comparison provides the faster and efficient NGS data analysis alternative to NGS-based healthcare industries and research institutes to meet the requirement for precision medicine based healthcare. 展开更多
关键词 NGS Data Analysis BWA-GATK DRAGEN Bio-IT processor Genomics INDEL Mapping
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大连市MSM对HIV PrEP用药知晓和使用意愿相关因素分析 被引量:1
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作者 张敏 孙明玉 +9 位作者 曹雪 赵志杰 熊帮洁 张群 王雅琪 洪晟杰 马兆煜 张宇 崔佳 李程 《中国艾滋病性病》 北大核心 2025年第9期997-1002,共6页
目的分析大连市MSM对HIV PrEP用药的知晓、使用意愿及相关因素,为制定该人群HIV PrEP服务策略提供科学依据。方法采用“滚雪球”的方法,通过MSM社会组织和疾控中心自愿咨询检测门诊招募MSM,进行面对面问卷调查,收集其一般人口学特征、... 目的分析大连市MSM对HIV PrEP用药的知晓、使用意愿及相关因素,为制定该人群HIV PrEP服务策略提供科学依据。方法采用“滚雪球”的方法,通过MSM社会组织和疾控中心自愿咨询检测门诊招募MSM,进行面对面问卷调查,收集其一般人口学特征、行为学信息、对PrEP的知晓和使用意愿情况,并以PrEP知晓和PrEP使用意愿为因变量,进行χ^(2)检验和多因素Logistic回归分析。结果共调查500名MSM,年龄18~77岁,PrEP知晓率46.0%,63.0%的调查对象知晓并愿意使用PrEP。多因素Logistic回归分析结果显示,最近3个月从未使用安全套(OR=3.839,95%CI:1.549~9.516),使用过rush popper(OR=2.546,95%CI:1.454~4.458),接受过HIV检测(OR=1.951,95%CI:1.039~3.662),知晓PEP(OR=23.678,95%CI:13.284~42.205)是PrEP知晓的促进因素,性行为方式为同性/异性均可(OR=0.568,95%CI:0.343~0.941)是PrEP知晓的阻碍因素。月收入≥5000元(OR=2.816,95%CI:1.190~6.664),性伴数量>10个(OR=2.338,95%CI:1.129~4.842),近3个月有时使用安全套(OR=2.667,95%CI:1.257~5.661),透露过性向(OR=2.728,95%CI:1.425~5.224),知晓PEP(OR=7.057,95%CI:1.661~29.977)是PrEP使用意愿的促进因素。结论大连市MSM的PrEP知晓和使用意愿比例较低,应进一步开展针对性PrEP宣传教育,尤其是提高不使用安全套、使用过rush、多性伴MSM对PrEP正确认识和引导有需求的MSM正确使用PrEP,从而提升PrEP知晓和使用。 展开更多
关键词 艾滋病病毒 男男性行为者 暴露前预防 影响因素
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一类4维3-李代数上的O-算子及导出的3-Pre-李代数
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作者 程紫莹 吕家凤 亢闯闯 《浙江师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2025年第1期21-29,共9页
李代数的Operad理论应用于3-李代数,可自然地构造出3-Pre-李代数,其与Pre-李代数有很多相似的性质.利用4维复3-李代数的分类以及3-李代数和O-算子的结构常数的关系,使用Maple软件求解三次非线性方程组,对一类4维复3-李代数上与伴随表示... 李代数的Operad理论应用于3-李代数,可自然地构造出3-Pre-李代数,其与Pre-李代数有很多相似的性质.利用4维复3-李代数的分类以及3-李代数和O-算子的结构常数的关系,使用Maple软件求解三次非线性方程组,对一类4维复3-李代数上与伴随表示相结合的O-算子进行了刻画.此外,利用所得结果,给出了这些O-算子导出的26个3-Pre-李代数的例子. 展开更多
关键词 3-pre-李代数 O-算子 3-李代数 pre-李代数
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天津市部分新诊断HIV阳性男男性行为者PrEP和nPEP知晓及使用情况分析 被引量:1
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作者 费丽萍 赵鹤鹤 +6 位作者 王实 郭燕 龚卉 于茂河 杨杰 汤后林 吕繁 《中国艾滋病性病》 北大核心 2025年第3期283-287,共5页
目的了解新诊断HIV阳性MSM对PrEP和nPEP的知晓和使用情况。方法以2023年12月至2024年8月天津市部分新诊断HIV阳性MSM为研究对象,通过问卷调查收集研究对象的基本人口学信息、性行为特征及PrEP、nPEP的知晓和使用情况。使用Logistic回归... 目的了解新诊断HIV阳性MSM对PrEP和nPEP的知晓和使用情况。方法以2023年12月至2024年8月天津市部分新诊断HIV阳性MSM为研究对象,通过问卷调查收集研究对象的基本人口学信息、性行为特征及PrEP、nPEP的知晓和使用情况。使用Logistic回归分析新诊断HIV阳性MSM中PrEP和nPEP知晓的影响因素。结果共计纳入研究对象251人,其中83人(33.1%)知晓PrEP,111人(55.8%)知晓nPEP。12人(4.8%)曾使用过PrEP,9人(3.6%)曾使用过nPEP。多因素Logistic回归分析显示,大专及以上文化程度者(PrEP:aOR=3.31,95%CI:1.66~6.83;nPEP:aOR=2.33,95%CI:1.28~4.28)、性伴数≥2(PrEP:aOR=2.29,95%CI:1.14~4.69;nPEP:aOR=2.02,95%CI:1.12~3.68)、既往有HIV检测史(PrEP:aOR=12.26,95%CI:5.62~30.00;nPEP:aOR=3.99,95%CI:2.21~7.36)是PrEP和nPEP知晓的促进因素。此外,同性性向(aOR=2.52,95%CI:1.08~6.31)也是nPEP知晓的促进因素。结论天津市部分新诊断HIV阳性MSM的PrEP和nPEP的知晓和使用情况均较低。可以通过网络平台、社会组织及同伴教育者在动员MSM进行HIV检测的同时普及PrEP和nPEP知识。 展开更多
关键词 艾滋病病毒感染者 暴露前预防 非职业暴露后预防 知晓 男男性行为者
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RPC-Chain:基于信誉机制与受控PRE的众包模型链
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作者 董文浩 朱晓军 +1 位作者 王龙 杨倩倩 《计算机应用研究》 北大核心 2025年第1期36-41,共6页
为解决众包面临的信任问题、不对称贡献与收益关系以及数据安全性共享等挑战,提出一种基于信誉模型与受控代理重加密(PRE)的众包模型链,即RPC-Chain。RPC-Chain基于超级账本Fabric,将众包模型的交易流程抽象化。首先,完善信誉机制提高... 为解决众包面临的信任问题、不对称贡献与收益关系以及数据安全性共享等挑战,提出一种基于信誉模型与受控代理重加密(PRE)的众包模型链,即RPC-Chain。RPC-Chain基于超级账本Fabric,将众包模型的交易流程抽象化。首先,完善信誉机制提高系统整体的效率与公平;其次,引入受控代理重加密以确保数据安全共享服务;最后,使用Fabric搭建众包区块链仿真平台并进行了相关测试。实验表明,该方案在模型设计、数据安全加密共享和信誉模型的激励效果等方面显示出一定优势。 展开更多
关键词 区块链 代理重加密 信誉机制 智能合约 众包
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Pseudoephedrine: A Review and Benefit-Risk Assessment with Reference to the Risk of Posterior Reversible Encephalopathy Syndrome (PRES) and Reversible Cerebral Vasoconstriction Syndrome (RCVS)
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作者 Ronald Eccles 《Open Journal of Respiratory Diseases》 2025年第1期19-34,共16页
Pseudoephedrine (PSE) is a widely used nasal decongestant. A review by the European Medicines Agency has reported that PSE may be associated with risks of posterior reversible encephalopathy syndrome (PRES) and revers... Pseudoephedrine (PSE) is a widely used nasal decongestant. A review by the European Medicines Agency has reported that PSE may be associated with risks of posterior reversible encephalopathy syndrome (PRES) and reversible cerebral vasoconstriction syndrome (RCVS). PRES and RCVS are rare but serious conditions that affect cerebral blood flow. This review discusses the pharmacology of PSE and potential risks for PRES and RCVS and concludes that considering the common use of PSE, with over 70 million packs of PSE taken each year in the European Union and the United Kingdom, and the rare occurrence of PRES and RCVS, that the risks of developing PRES/RCVS on exposure to PSE are likely to be very low. 展开更多
关键词 Posterior Reversible Encephalopathy Syndrome (preS) Reversible Cerebral Vasoconstriction Syndrome (RCVS) PSEUDOEPHEDRINE European Medicines Agency
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新疆MSM基于事件驱动型PrEP用药方案的成本效用分析
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作者 王骋昊 杨恒 +1 位作者 边举元 张国珍 《中国艾滋病性病》 北大核心 2025年第7期737-743,共7页
目的 评估在新疆高危MSM中基于事件驱动型PrEP用药方案,实施暴露前预防用药策略的成本效用。方法 基于事件驱动型PrEP用药方案,依据高危MSM的不同占比、PrEP覆盖率和依从性设立8种干预策略,利用Markov模型,计算无PrEP干预和不同PrEP干... 目的 评估在新疆高危MSM中基于事件驱动型PrEP用药方案,实施暴露前预防用药策略的成本效用。方法 基于事件驱动型PrEP用药方案,依据高危MSM的不同占比、PrEP覆盖率和依从性设立8种干预策略,利用Markov模型,计算无PrEP干预和不同PrEP干预策略的成本和质量调整寿命年,以2022年新疆全年人均国内生产总值为标准评价PrEP策略的经济价值。结果 在中依从性且高危MSM占比为20%或40%,覆盖率分别为50%、80%时,成本效用比分别比为19 687元/QALY、19 676元/QALY、19 671元/QALY、19 672元/QALY;在高依从性高危MSM占比为20%或40%、覆盖率分别为50%、80%时,成本效用比分别为18 848元/QALY、18 857元/QALY,18 858元/QALY、18 855元/QALY,均小于2022年新疆人均GDP。结论 在高危MSM中基于事件驱动型PrEP用药方案实施PrEP策略有较好经济效益。未来应多渠道,针对性宣传PrEP;探索低成本PrEP方案;通过同伴监督等方式强化PrEP的依从性。 展开更多
关键词 艾滋病 暴露前预防用药 男男性行为者 MARKOV模型 成本效用分析
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Wheat TaPKL genes regulate pre-harvest sprouting and yield-related traits
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作者 Wanqing Bai Ziyi Yang +5 位作者 Xuchang Yu Shuxian Huang Yufan Wang Yexing Jing Yunwei Zhang Jiaqiang Sun 《Journal of Genetics and Genomics》 2025年第9期1148-1150,共3页
Wheat(Triticum aestivum L.)is an important staple food crop in the world and supplies about 20%of human caloric and protein consumption(Giraldo et al.,2019;Xiao et al.,2022).Wheat production accounts for~30%of global ... Wheat(Triticum aestivum L.)is an important staple food crop in the world and supplies about 20%of human caloric and protein consumption(Giraldo et al.,2019;Xiao et al.,2022).Wheat production accounts for~30%of global cereal crops(Li et al.,2019).With the global population increasing and the frequency of natural disasters rising,enhancing wheat yield is crucial to meet food demand.Spike traits such as increased grain number per spike are key determinants of wheat yield.Pre-harvest sprouting(PHS)is a significant natural disaster that severely impacts grain yield and end-use quality of wheat(Tai et al.,2021,2024). 展开更多
关键词 spike traits pre harvest sprouting yield GENES natural disasters WHEAT
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Zuchongzhi-3 Sets New Benchmark with 105-Qubit Superconducting Quantum Processor
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作者 LIU Danxu GE Shuyun WU Yuyang 《Bulletin of the Chinese Academy of Sciences》 2025年第1期55-56,共2页
A team of researchers from the University of Science and Technology of China(USTC)of the Chinese Academy of Sciences(CAS)and its partners have made significant advancements in random quantum circuit sampling with Zuch... A team of researchers from the University of Science and Technology of China(USTC)of the Chinese Academy of Sciences(CAS)and its partners have made significant advancements in random quantum circuit sampling with Zuchongzhi-3,a superconducting quantum computing prototype featuring 105 qubits and 182 couplers. 展开更多
关键词 quantum circuit sampling superconducting quantum computing prototype zuchongzhi superconducting quantum processor QUBITS COUPLERS
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Reassessing the Origin of Fossils in pre-Enlightenment Europe:1300–1700
10
作者 Ivano Del Prete 《Episodes》 2025年第3期373-383,共11页
This article aims to correct some common misconceptions on the nature and origin of fossils in Europe between the fourteenth and the early eighteenth century.Building upon recent scholarship,I argue that the possibili... This article aims to correct some common misconceptions on the nature and origin of fossils in Europe between the fourteenth and the early eighteenth century.Building upon recent scholarship,I argue that the possibility of a world older than a few thousand years was largely acceptable throughout this period,and that explanations for the formation of fossils(notably,marine fossils)that required long timescales were mainstream.Until c.1300,fossils of marine creatures were normally seen as the remains of actual fish and shells brought inland by a succession of partial or global inundations,or by local telluric upheavals.Alongside,aborted spontaneous generations caused by astrological forces or slow geological revolutions gained ground in the following centuries.It was only in the late 1600s that fossils began to be widely regarded as physical evidence of a global inundation in historical times,in support of a young Earth and of the literal truth of the Bible. 展开更多
关键词 world age telluric upheavals inundations FOSSILS misconceptions spontaneous generation geological revolutions pre enlightenment europe
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Empowering Sentiment Analysis in Resource-Constrained Environments:Leveraging Lightweight Pre-trained Models for Optimal Performance
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作者 V.Prema V.Elavazhahan 《Journal of Harbin Institute of Technology(New Series)》 2025年第1期76-84,共9页
Sentiment analysis,a cornerstone of natural language processing,has witnessed remarkable advancements driven by deep learning models which demonstrated impressive accuracy in discerning sentiment from text across vari... Sentiment analysis,a cornerstone of natural language processing,has witnessed remarkable advancements driven by deep learning models which demonstrated impressive accuracy in discerning sentiment from text across various domains.However,the deployment of such models in resource-constrained environments presents a unique set of challenges that require innovative solutions.Resource-constrained environments encompass scenarios where computing resources,memory,and energy availability are restricted.To empower sentiment analysis in resource-constrained environments,we address the crucial need by leveraging lightweight pre-trained models.These models,derived from popular architectures such as DistilBERT,MobileBERT,ALBERT,TinyBERT,ELECTRA,and SqueezeBERT,offer a promising solution to the resource limitations imposed by these environments.By distilling the knowledge from larger models into smaller ones and employing various optimization techniques,these lightweight models aim to strike a balance between performance and resource efficiency.This paper endeavors to explore the performance of multiple lightweight pre-trained models in sentiment analysis tasks specific to such environments and provide insights into their viability for practical deployment. 展开更多
关键词 sentiment analysis light weight models resource⁃constrained environment pre⁃trained models
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Amaurosis fugax in primigravida woman precursor of posterior reverse encephalopathy syndrome concurrent with macular edema
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作者 Panayiotis Christodoulou Ioannis Katsimpris 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 2025年第11期2213-2216,共4页
Dear Editor,Posterior reverse encephalopathy syndrome(PRES),manifests as a confusional state/delirium,convulsion,or acute blindness which illustrates in magnetic resonance imaging(MRI)typical bilateral white matter le... Dear Editor,Posterior reverse encephalopathy syndrome(PRES),manifests as a confusional state/delirium,convulsion,or acute blindness which illustrates in magnetic resonance imaging(MRI)typical bilateral white matter lesions.These clinical and radiological changes are reversible in two to three weeks,usually generated by acute hypertension,preeclampsia,eclampsia,immunosuppression,septicemia,and end-stage renal disease.PRES is commonly diagnosed in patients in their thirties. 展开更多
关键词 posterior reversible encephalopathy syndrome amaurosis fugax PRIMIGRAVIDA macular edema reverse encephalopathy syndrome pres manifests clinical radiological changes
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Perceptions of pre-university students in Malaysia on geoscience discipline
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作者 Dony Adryansyah Nazaruddin Nurul Syahida Abu Bakar Nur Hidayah Md Noh 《Episodes》 2025年第4期421-432,共12页
As Malaysia seeks to enhance its educational development,understanding student attitudes toward various scientific disciplines—particularly STEM fields—becomes crucial.This study investigates the perceptions of pre-... As Malaysia seeks to enhance its educational development,understanding student attitudes toward various scientific disciplines—particularly STEM fields—becomes crucial.This study investigates the perceptions of pre-university students in Malaysia regarding the geoscience discipline.Data were collected through a questionnaire designed to explore students’experiences with geoscience-related subjects and their perceptions of this essential field,focusing on their understanding and interest in geoscience. 展开更多
关键词 MALAYSIA pre university students enhance its educational developmentunderstanding student attitudes geoscience discipline student attitudes educational development STEM fields
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乙型肝炎病毒preS基因突变对乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的诊断价值
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作者 陈秋宇 程倬 +2 位作者 邬亚鑫 邓立功 庞红全 《传染病信息》 2025年第4期313-319,共7页
目的分析乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者的乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)前表面抗原(preS)基因突变特点,描述HBV preS基因突变对HBV相关HCC的诊断价值。方法回顾性分析2019年9月至2023年9月就诊于... 目的分析乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者的乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)前表面抗原(preS)基因突变特点,描述HBV preS基因突变对HBV相关HCC的诊断价值。方法回顾性分析2019年9月至2023年9月就诊于达州市中心医院消化内科的慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者(CHB组)和HBV相关HCC患者(HCC组)。采用sanger测序法分析preS区突变。结果HCC组的患者年龄更大、基因型为C型的患者更多、HBV DNA水平更低、甲胎蛋白(alpha fetoprotein,AFP)水平更高(P<0.05)。在HCC组及CHB组中,共有24.41%(31/127)的患者发生preS1缺失,preS1区共发现47.90%(57/119)的点突变;共有16.54%(21/127)的患者发生preS2缺失,preS2区共发现65.45%(36/55)的点突变。preS1区W4P/R/Y、D27G/S、N51Y/T/S/Q/P、I/N56H/W、K57Q/K、A60V、D/A62S/T、G73S/N、A90T/S/G、V95A和L108V/I,以及preS2区T125S/N/P、F141V/L/I、V158A点突变在HCC组中的发生率高于CHB组(P<0.05)。基因型为C型、HBV DNA以及W4P/R/Y(preS1)、A90T/S/G(preS1)、L108V/I(preS1)、F141V/L/I(preS2)点突变可独立诊断CHB患者中HCC的发生。结论preS区W4P/R/Y(preS1)、A90T/S/G(preS1)、L108V/I(preS1)、F141V/L/I(preS2)与HCC发生相关,使用这些点突变检测将有助于HBV相关HCC的临床诊断。 展开更多
关键词 肝细胞癌 乙型肝炎病毒 乙型肝炎病毒前表面抗原 基因突变 诊断
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Commentary on the dose-response effect of pre-exercise carbohydrates in McArdle disease:Methodological considerations and practical implications
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作者 Jiawei Du Jinghua Hou 《Journal of Sport and Health Science》 2025年第2期77-78,共2页
We read with great interest the recent article by Valenzuela et al.1titled“Dose-response effect of pre-exercise carbohydrates under muscle glycogen unavailability:Insights from McArdle disease”published in the Journ... We read with great interest the recent article by Valenzuela et al.1titled“Dose-response effect of pre-exercise carbohydrates under muscle glycogen unavailability:Insights from McArdle disease”published in the Journal of Sport and Health Science The study's exploration of the effects of varying carbohydrate(CHO)doses on exercise capacity in Mc Ardle disease,a condition characterized by complete muscle glycogen unavailability,is a significant contribution to the field of sports science and metabolic disorders. 展开更多
关键词 dose response exercise capacity mcardle disease published muscle glycogen sports science metabolic disorders McArdle disease pre exercise carbohydrates
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男男性行为者PrEP污名化体验的Meta整合
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作者 彭雨馨 钟涛 +1 位作者 徐璇 付光蕾 《中国艾滋病性病》 北大核心 2025年第1期106-111,共6页
目的系统评价和整合MSM暴露前预防污名化体验的质性研究,为MSM实施针对性干预提供循证依据。方法检索Cochrane Library、PubMed、Embase、Web of Science、CINAHL、SinoMed、万方数据库、中国知网和维普数据库中关于MSM暴露前预防污名... 目的系统评价和整合MSM暴露前预防污名化体验的质性研究,为MSM实施针对性干预提供循证依据。方法检索Cochrane Library、PubMed、Embase、Web of Science、CINAHL、SinoMed、万方数据库、中国知网和维普数据库中关于MSM暴露前预防污名化体验的质性研究,检索时限为建库至2024年9月。结果共纳入16篇基于国外研究的文献,提炼出57个研究结果,形成14个新类别,进一步归纳得到4个整合结果:污名化影响因素复杂、污名化存在多重表现、污名化影响日常生活、污名化应对策略多样。结论MSM暴露前预防污名化体验复杂,未来可借鉴国外研究,结合我国国情及文化背景,加强医护人员专业化培训,运用数字化工具积极实施综合性干预措施,联合家庭、社区构建整体化社会支持模式,帮助MSM减轻污名化体验。 展开更多
关键词 HIV 男男性行为者 暴露前预防 污名化 质性研究 Meta整合
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基于PowerMILL PostProcessor的海德汉iTNC530系统PLANE指令后置处理研究
17
作者 康晓崇 《机械研究与应用》 2025年第5期102-107,共6页
后置处理在计算机辅助制造(CAM)与数控加工之间起到关键的桥梁作用,其性能直接影响加工精度和效率。该文基于PowerMILL后处理编辑器开发了一个针对海德汉iTNC530系统的后处理器,旨在实现PLANE指令的自动生成,以适应复杂的多轴加工任务... 后置处理在计算机辅助制造(CAM)与数控加工之间起到关键的桥梁作用,其性能直接影响加工精度和效率。该文基于PowerMILL后处理编辑器开发了一个针对海德汉iTNC530系统的后处理器,旨在实现PLANE指令的自动生成,以适应复杂的多轴加工任务。文章详细描述了开发流程,包括刀具方向向量的提取、旋转角度的计算以及PLANE指令的生成,并结合具体案例展示了如何应用数学模型与旋转矩阵进行刀具路径的优化控制。仿真验证结果表明,所开发的后置处理器能够生成高精度的数控程序,提高了加工的自动化程度和稳定性,可以为多轴加工中的后置处理开发提供实践指导和技术参考。 展开更多
关键词 后置处理开发 海德汉iTNC530 PLANE指令 数学模型
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原核生物pre-tRNA 5'末端剪切酶的结构和功能研究
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作者 邵齐源 李洋洋 +1 位作者 张威振 甘建华 《复旦学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期113-120,共8页
5'末端的剪切是pre-tRNA加工和成熟过程中非常重要的一个环节,由RNase P负责催化。不同于常规的RNase P,原核生物中存在一类protein-only RNase P(也称HARP),不需要依赖核酶就能对pre-tRNA的5'末端进行剪切。为了阐明HARP结合... 5'末端的剪切是pre-tRNA加工和成熟过程中非常重要的一个环节,由RNase P负责催化。不同于常规的RNase P,原核生物中存在一类protein-only RNase P(也称HARP),不需要依赖核酶就能对pre-tRNA的5'末端进行剪切。为了阐明HARP结合和剪切pre-tRNA的分子机制,我们表达和纯化了Thermocrinis ruber来源的HARP蛋白(TrHARP)。定点突变、分子筛和体外活性实验证实TrHARP具有pre-tRNA剪切活性,而且该活性受到蛋白聚合状态的影响。此外,我们还筛选获得了TrHARP蛋白质的晶体,采集了衍射数据并建立了初始的结构模型。尽管TrHARP与Aquifex aeolicus来源的HARP Aq_880的折叠方式类似,但TrHARP与Aq_880在结构中的聚合方式和相对方位存在显著的差异。分子筛以及负染电镜实验结果均显示pre-tRNA的引入会导致HARP结构的解聚,这为进一步阐明HARP结合和催化pre-tRNA的5'末端成熟的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 protein-only RNase P pre-tRNA HARP 晶体结构 功能 蛋白表达
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HIV/梅毒双重检测在MSM PrEP使用者中的成本效果分析
19
作者 张忻恒 高天帅 +1 位作者 赖锦 陈丹镝 《中国艾滋病性病》 北大核心 2025年第9期980-986,共7页
目的评估在使用PrEP的MSM中进行单独和双重HIV/梅毒检测的成本效果,为推动双重检测在MSM中的扩大应用提供决策依据。方法本研究采用马尔可夫模型,模拟2020年至2024年中国MSM中HIV和梅毒的流行情况,并假设了一个由10万名年龄≥18岁的MSM... 目的评估在使用PrEP的MSM中进行单独和双重HIV/梅毒检测的成本效果,为推动双重检测在MSM中的扩大应用提供决策依据。方法本研究采用马尔可夫模型,模拟2020年至2024年中国MSM中HIV和梅毒的流行情况,并假设了一个由10万名年龄≥18岁的MSM组成的静态队列,效果指标采用质量调整寿命年(QALYs)。结果实施背景频率的单独梅毒检测(年检测率60.4%)、每3个月进行一次单独梅毒检测和每3个月进行一次HIV/梅毒双重检测将分别额外花费1400万美元、2160万美元和1600万美元,其增量成本效果比(ICER)分别为5457美元/QALY、3826美元/QALY和5174美元/QALY。结论在使用PrEP的MSM中每3个月进行一次HIV/梅毒双重检测比单独检测更具成本效果。双重检测不仅降低了检测成本,还减少了个人需要接受检测的次数,有望提高检测依从性。 展开更多
关键词 艾滋病病毒 梅毒 双重检测 暴露前预防 男男性行为者 成本效果分析
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云南省处方前置审核系统应用现状分析
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作者 徐帆 尹文洁 +7 位作者 李珂佳 李正富 陈洁 邬梅仙 陈瑞祥 李松梅 张国文 李特 《中国药房》 北大核心 2026年第1期6-10,共5页
目的调研云南省医疗机构处方前置审核系统的应用现状,评估其系统功能及管理能力,为推动合理用药提供实践依据。方法对云南省二级及以上公立医疗机构进行系统应用情况调研;构建包含处方即时审查、处方关联审查、审核规则设定、循证信息... 目的调研云南省医疗机构处方前置审核系统的应用现状,评估其系统功能及管理能力,为推动合理用药提供实践依据。方法对云南省二级及以上公立医疗机构进行系统应用情况调研;构建包含处方即时审查、处方关联审查、审核规则设定、循证信息支持、处方权限管理及系统应用管理6个方面共39项指标的能力成熟度评价体系,对其中已应用系统的医疗机构进行能力评估。结果共回收有效问卷100份,其中37家医疗机构已启用处方前置审核系统,主要集中于三级医院。系统多采用模块化架构,通过应用程序接口及中间件嵌入医院信息系统,具备一定的实时处方风险识别能力。处方前置审核能力成熟度评价结果显示,系统在适应证、禁忌证、配伍禁忌等基础审核功能上表现良好,但在肠外营养处方和特定疾病药物用量审查、患者个体化特征识别及审核规则设定等方面仍存在不足,审方中心建设与制度管理亦不完善。结论云南省处方前置审核系统总体应用率不高,系统功能与管理机制尚需进一步完善。建议加强低等级医疗机构的信息化建设投入,探索区域化统一审核机制,推动审方工作规范化、智能化发展。 展开更多
关键词 前置审核 处方审核 医疗机构 合理用药 能力成熟度
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