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猪鞭虫和斯氏鞭虫线粒体pnad4和pcox1基因的扩增与序列分析 被引量：4
1
作者 张浩吉 梁祥解 +6 位作者 白挨泉 李高强 李金平 郭建超 张更利 蒲文珺 李国清 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期83-86,共4页
以采自广东不同地区的猪鞭虫(Trichuris suis)和斯氏鞭虫(Trichuris skrjabini)为研究对象,扩增线粒体基因组的pnad4和pcox1基因,将扩增产物纯化后克隆至pMD18-T载体,对阳性菌落进行测序和序列分析。结果表明,来源于不同地区的鞭虫上述... 以采自广东不同地区的猪鞭虫(Trichuris suis)和斯氏鞭虫(Trichuris skrjabini)为研究对象,扩增线粒体基因组的pnad4和pcox1基因,将扩增产物纯化后克隆至pMD18-T载体,对阳性菌落进行测序和序列分析。结果表明,来源于不同地区的鞭虫上述两个基因种内相对保守,差异性不大,但种间差异较大。猪鞭虫和斯氏鞭虫的pnad4长度均为468 bp,相互间有162个种间遗传标记位点;猪鞭虫和斯氏鞭虫的pcox1长度分别为600 bp与438 bp,相互间有156个种间遗传标记位点。两种鞭虫之间的pnad4基因差异率为45.1%-45.9%,pcox1基因差异率为44.1%-45.4%。上述线粒体两个基因均可作为区分两种线虫的种间遗传标记。 展开更多
关键词 猪鞭虫 斯氏鞭虫 pnad4基因 pcox1基因 序列分析
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猪克氏伪裸头绦虫线粒体pcox3、pcox4和pcytb基因的多态性 被引量：1
2
作者 王会宝 张君琦 +5 位作者 田格如 闫文朝 董瑞 胡雄峰 于三科 赵光辉 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期1336-1340,共5页
为阐明不同地区猪克氏伪裸头绦虫（Pseudanoplocephala crawfordi）分离株线粒体pcox3、pnad4、pcytb基因的部分序列的遗传变异情况，本研究首先扩增和测定了河南洛阳、济源和陕西杨凌地区猪的克氏伪裸头绦虫分离株pcox3、pnad4和pcytb... 为阐明不同地区猪克氏伪裸头绦虫（Pseudanoplocephala crawfordi）分离株线粒体pcox3、pnad4、pcytb基因的部分序列的遗传变异情况，本研究首先扩增和测定了河南洛阳、济源和陕西杨凌地区猪的克氏伪裸头绦虫分离株pcox3、pnad4和pcytb基因的序列，然后通过合并pcox3、pnad4和pcytb3段序列重建了克氏伪裸头绦虫与其他绦虫的种群遗传关系。结果显示，克氏伪裸头绦虫pcox3、pnad4和pcytb扩增片段的长度分别为503，604和690bp；克氏伪裸头绦虫线粒体3段基因pcox3、pnad4和pcytb的不同地域种内序列差异分别为0．00％～1．83％，0．00％～1．52％和0．00％～1．51％；基于合并pcox3、pnad4和pcytb3段基因重构种系发育树发现，不同地区克氏伪裸头绦虫分离株聚在一起，并形成姊妹支，而所有的克氏伪裸头绦虫分离株又形成2个小的分支；表明克氏伪裸头绦虫可能存在2个种群，并且与缩小膜壳绦虫亲缘关系最近。 展开更多
关键词 猪克氏伪裸头绦虫 pcox3 pnad4 pcytb 种系发育关系
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湖南省鸡蛔虫线粒体nad4基因序列的测定及分析 被引量：4
3
作者 李淼 蔡丝丝 +3 位作者 姚明锐 刘升 李许梅 侯强红 《现代农业科技》 2012年第4期321-321,325,共2页
为阐明鸡蛔虫湖南分离株线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)遗传变异情况,利用聚合酶链式反应(PCR)扩增鸡蛔虫的pnad4,并对序列进行比对。结果表明:所获得的pnad4序列长度均为408 bp。由于鸡蛔虫p... 为阐明鸡蛔虫湖南分离株线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)遗传变异情况,利用聚合酶链式反应(PCR)扩增鸡蛔虫的pnad4,并对序列进行比对。结果表明:所获得的pnad4序列长度均为408 bp。由于鸡蛔虫pnad4序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,从而为鸡蛔虫的分类鉴定及进一步的分子流行病学调查奠定基础。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 线粒体DNA pnad4基因 序列分析
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骆驼源片形吸虫的鉴定及遗传多样性研究 被引量：4
4
作者 邱启官 陈淞楠 +5 位作者 孟沁 谭笑若 李宁倩 刘晓恒 陈叔玉 刘伟 《中国预防兽医学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期1298-1302,共5页
为了鉴定骆驼源片形吸虫的种类,研究其遗传多样性,本实验对6条骆驼源片形吸虫分离株的线粒体pcox1和pnad4,以及核糖体ITS基因进行PCR扩增、测序以及遗传多样性分析,并利用pcox1、pnad4和ITS基因构建系统发育树分析其遗传进化关系。结果... 为了鉴定骆驼源片形吸虫的种类,研究其遗传多样性,本实验对6条骆驼源片形吸虫分离株的线粒体pcox1和pnad4,以及核糖体ITS基因进行PCR扩增、测序以及遗传多样性分析,并利用pcox1、pnad4和ITS基因构建系统发育树分析其遗传进化关系。结果显示,6条骆驼源片形吸虫pcox1、pnad4和ITS基因分别长342 bp、830 bp和748 bp,碱基差异率分别为0~0.6%、0~0.5%和0.1%~1.1%,种内高度保守;分别检测到2、4和5个单倍型,核苷酸多样性分别为0.003±0.003、0.002±0.003和0.005±0.005;与其他国家或地区的大片吸虫相应基因序列的同源性分别为99.7%~100.0%、95.9%~100.0%和98.9%~100.0%,与肝片吸虫相应基因序列的同源性分别为92.7%~93.3%、86.7%~87.3%和98.1%~99.2%,与其他片形吸虫相应基因序列的同源性分别为89.5%~89.8%、80.0%~80.2%和94.5%~95.6%。3个基因的系统进化分析结果显示,6条骆驼源片形吸虫均与已知大片吸虫分离株聚类形成同一分支,与肝片吸虫、杰氏片形吸虫处于不同分支。上述研究结果表明6条骆驼源片形吸虫分离株为大片吸虫,pcox1、pnad4和ITS基因均可作为大片吸虫的遗传分子标记。本研究为大片吸虫的分类鉴定以及骆驼源片形吸虫感染的防治提供参考依据。 展开更多
关键词 片形吸虫 骆驼 pcox1 pnad4 ITS 分子鉴定 遗传多样性
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鸡蛔虫COX2和NAD4rDNA的序列测定及分析 被引量：10
5
作者 李淼 侯强红 +3 位作者 蔡丝丝 李奔 李林波 侯利兰 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2013年第1期19-21,共3页
本试验旨在阐明湖南省鸡蛔虫分离株线粒体细胞色素C氧化酶第Ⅱ亚基(cox2)基因部分序列(pcox2)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位IV基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况。利用聚合酶链式反应(PCR)扩增鸡蛔虫的pcox2and pna... 本试验旨在阐明湖南省鸡蛔虫分离株线粒体细胞色素C氧化酶第Ⅱ亚基(cox2)基因部分序列(pcox2)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位IV基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况。利用聚合酶链式反应(PCR)扩增鸡蛔虫的pcox2and pnad4,应用clustalx1.81程序对序列进行比对,结果显示,所获得的cox2(pcox2)and nad4(pnad4)序列长度一致,为350bp(pcox2)and 400bp(pnad4)。由于鸡蛔虫pcox2and pnad4序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,从而为鸡蛔虫的分类鉴定及进一步的分子流行病学调查提供了基础。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 线粒体DNA cox2基因 nad4基因 种系发育关系
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