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2023年中国A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原和基因特性分析 被引量:1
1
作者 成艳辉 隗合江 +7 位作者 李希妍 曾晓旭 肖宁 唐静 谢怡然 杨磊 王大燕 黄维娟 《疾病监测》 北大核心 2025年第4期492-498,共7页
目的分析2023年中国分离的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原和基因特性。方法对2148株A(H1N1)pdm09亚型流感毒株用红细胞凝集抑制试验进行抗原分析,对其中505株毒株进行序列测定和分析。结果2023年检测的2148株毒株中,95.00%以上的毒株... 目的分析2023年中国分离的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原和基因特性。方法对2148株A(H1N1)pdm09亚型流感毒株用红细胞凝集抑制试验进行抗原分析,对其中505株毒株进行序列测定和分析。结果2023年检测的2148株毒株中,95.00%以上的毒株抗原性与疫苗株A/Victoria/4897/2022和A/West Virginia/30/2022类似;98.42%(497/505)测序毒株的血凝素(HA)基因属于C.1分支,在此分支中存在多个有共同氨基酸位点变异的小分支;在测序毒株中,11株毒株有已知对神经氨酸酶抑制剂耐药的E119A、Q136K和H275Y氨基酸位点变异。结论2023年中国流行的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与同期的疫苗株抗原性匹配,但HA基因存在多样性的特点。 展开更多
关键词 A(H1N1)pdm09亚型流感病毒 抗原性 基因特性
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重连口服液体外抗甲型H1N1 pdm09病毒活性和抗炎机制研究
2
作者 卫宇航 张琳煜 +4 位作者 俞峻岭 孙永 王新汝 李泽庚 童佳兵 《现代中西医结合杂志》 2025年第22期3094-3101,共8页
目的探讨重连口服液的体外抗甲型H1N1 pdm09病毒活性和抗炎机制。方法(1)用CCK-8试剂盒检测不同浓度重连口服液和奥司他韦对MDCK细胞(狗肾上皮细胞)、A549细胞(人非小细胞肺癌细胞)的毒性,计算细胞半数中毒浓度(CC_(50)),确定重连口服... 目的探讨重连口服液的体外抗甲型H1N1 pdm09病毒活性和抗炎机制。方法(1)用CCK-8试剂盒检测不同浓度重连口服液和奥司他韦对MDCK细胞(狗肾上皮细胞)、A549细胞(人非小细胞肺癌细胞)的毒性,计算细胞半数中毒浓度(CC_(50)),确定重连口服液和奥司他韦的有效安全浓度范围。(2)实验设病毒组、重连口服液组、奥司他韦组。将MDCK细胞接种于96孔板中,培养24 h后,加入稀释好的病毒液50μL吸附1 h,然后病毒组加入病毒维持液,重连口服液组和奥司他韦组分别加入20000μg/mL重连口服液、12.5μg/mL磷酸奥司他韦溶液,培养72 h后检测,计算病毒半数组织感染量(TCID_(50))。(3)实验设正常组、病毒组、奥司他韦组、重连口服液2μg/mL组、重连口服液20μg/mL组、重连口服液200μg/mL组、重连口服液2000μg/mL组、重连口服液20000μg/mL组。选取季节性甲型流感病毒代表株A/TJA/swl1962株,按照直接作用和预防作用2种方式,先后将病毒接种到12孔板上,奥司他韦组加入终浓度为12.5μg/mL的磷酸奥司他韦溶液,重连口服液各组加入相应浓度的重连口服液,培养24 h后检测病毒载量,计算药物对病毒的半数抑制浓度(IC_(50))及各组病毒抑制率。(4)实验设病毒组、重连口服液组。将MDCK细胞接种于12孔板中,培养24 h后加入100 TCID_(50)的甲型H1N1 pdm09病毒液,培养1 h后,弃液清洗后加入病毒维持液继续培养;在病毒接种后2,4,6 h,病毒组加入病毒维持液,重连口服液组加入含20000μg/mL重连口服液的病毒维持液,病毒接种8 h后,免疫荧光染色观察流感病毒核蛋白(NP)表达情况。(5)实验设空白组、模型组、重连低剂量组、重连中剂量组、重连高剂量组、奥司他韦组。将对数生长期的A549细胞接种于12孔板,培养48 h,除空白组外的其他组均加100 TCID_(50)的H1N1 pdm09病毒稀释液200μL。培养1 h后,重连低、中、高剂量组分别滴加5 mg/mL、10 mg/mL、15 mg/mL重连口服液,奥司他韦组滴加50μg/mL磷酸奥司他韦。培养24 h后,实时荧光定量PCR法检测细胞中单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)、流感病毒基质蛋白2(M2)mRNA表达情况,Western blot法检测细胞中M2蛋白和细胞炎症因子维甲酸诱导基因I(RIG-I)、NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、半胱氨酸蛋白酶1(Caspase-1)、白细胞介素-1β(IL-1β)蛋白表达情况。结果(1)重连口服液对MDCK、A549细胞的CC_(50)分别为28.56 mg/mL、14.59 mg/mL。(2)重连口服液对病毒的IC_(50)为9.10 mg/mL,抑制作用呈剂量依赖性。(3)病毒感染MDCK细胞2 h和4 h后给予重连口服液,可明显抑制NP表达。(4)模型组A549细胞中M2、MCP-1 mRNA相对表达量和M2、RIG-I、NLRP3、ASC、Caspase-1、IL-1β蛋白相对表达量均明显高于空白组(P均<0.05);各药物组A549细胞中M2、MCP-1 mRNA相对表达量和M2、RIG-I、NLRP3、ASC、Caspase-1、IL-1β蛋白相对表达量均明显低于模型组(P均<0.05),且重连各组上述各指标均呈剂量依赖性降低(P均<0.05)。结论重连口服液可有效抑制甲型H1N1 pdm09病毒复制,并可通过降低A549细胞中RIG-I的表达来减少炎症小体的产生,从而发挥抗炎作用。 展开更多
关键词 重连口服液 磷酸奥司他韦 H1N1pdm09病毒 NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3 凋亡相关斑点样蛋白 半胱氨酸蛋白酶1 白细胞介素-1β
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2009-2017年烟台地区甲型(H1N1)pdm09流感病毒神经氨酸酶基因进化分析 被引量:7
3
作者 刘娟 高巧 +4 位作者 徐迎春 孙振璐 董兆静 徐小雯 宫连凤 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期1032-1036,共5页
目的分析2009-2017年烟台地区甲型(H1N1) pdm09流感病毒流行情况及神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进化特征。方法收集2009年8月~2017年8月烟台地区两家哨点医院流感样病例咽试子标本10 236份,狗肾细胞(Madin-Darby canine kidney cel... 目的分析2009-2017年烟台地区甲型(H1N1) pdm09流感病毒流行情况及神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进化特征。方法收集2009年8月~2017年8月烟台地区两家哨点医院流感样病例咽试子标本10 236份,狗肾细胞(Madin-Darby canine kidney cell,MDCK)分离流感病毒,血凝抑制实验进行病毒分型。选取甲型(H1N1) pdm09流感毒株43株,扩增NA基因全序列并测序,应用分子生物学软件分析其遗传变异特征。结果系统发生分析表明大部分烟台分离株属于2、7、6C、6B. 1和6B. 2基因型; NA蛋白分子多个氨基酸位点发生变异,与疫苗株相比,6、7基因型增加了44位糖基化位点; 6B. 1和6B. 2基因亚型,减少了386位糖基化位点;运用固定效应似然比模型和内部固定效应似然比模型发现34和386两个正向选择压力位点,NA蛋白酶活性中心位点及周围辅助位点均未发生变异。结论 2009-2017年烟台地区甲型(H1N1) pdm09流感病毒NA基因持续发生变异,仍对神经氨酸酶抑制剂敏感,未来仍应加强流感流行状况和病原基因特征监测。 展开更多
关键词 甲型(HlNl)pdm09 神经氨酸酶 耐药 基因进化
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2019-2020年山东省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性及血凝素基因特征分析 被引量:3
4
作者 吴巨龙 寇增强 +4 位作者 孙林 宋绍霞 何玉洁 张玉薇 刘倜 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2021年第8期884-887,892,共5页
目的了解山东省2019-2020年分离株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性及血凝素(hemagglutinin, HA)基因变异情况。方法采用单向红细胞凝集抑制试验对2019-2020监测年分离的15株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行抗原性分析;PCR扩增病毒的HA... 目的了解山东省2019-2020年分离株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性及血凝素(hemagglutinin, HA)基因变异情况。方法采用单向红细胞凝集抑制试验对2019-2020监测年分离的15株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行抗原性分析;PCR扩增病毒的HA基因并测序,进行进化分析,以及糖基化位点、抗原变异位点、受体结合位点的变异分析。结果 2019-2020年流行株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒均为疫苗株A/Brisbane/02/2018的类似株。HA基因均属于6B.1分支,毒株HA基因核苷酸序列与当季疫苗株A/Brisbane/02/2018的同源性为98.5%~99.0%,与最新疫苗株A/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019的核苷酸同源性为99.3%~99.8%。所有毒株与当季疫苗株相比均出现了T185I位点变异。结论 2019-2020监测年度山东省流行的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与WHO推荐的疫苗组分匹配性良好,疫苗株推荐存在滞后性。HA基因与其编码的氨基酸持续变异,因此应加强对病毒变异的监测,为疫苗筛选及流感防控措施的制定提供参考。 展开更多
关键词 A(H1N1)pdm09流感 血凝素 HA基因 抗原性
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长沙市2016-2023年A(H1N1)pdm09流感病毒血凝素基因进化特征 被引量:4
5
作者 刘晓蕾 叶文 +3 位作者 袁洁 裴瑞青 黄政 徐明忠 《中国热带医学》 CAS 2023年第11期1151-1156,共6页
目的 分析2016-2023年度长沙市A(H1N1)pdm09流感病毒的血凝素(hemagglutinin, HA)基因特征,了解HA基因遗传进化趋势和氨基酸突变情况,为新形势下流感疫情的防控、流感疫苗筛选提供科学依据。方法 无特定病原(specific pathogen free, S... 目的 分析2016-2023年度长沙市A(H1N1)pdm09流感病毒的血凝素(hemagglutinin, HA)基因特征,了解HA基因遗传进化趋势和氨基酸突变情况,为新形势下流感疫情的防控、流感疫苗筛选提供科学依据。方法 无特定病原(specific pathogen free, SPF)鸡胚分离法获得2016-2023年长沙市的A(H1N1)pdm09流感病毒毒株,使用Illumina公司的MiSeq对其进行二代测序测定。借助DNAStar中MegAlign软件分析HA基因的同源性,构建进化树使用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 11(MEGA11)软件中的Neighbor Joining(NJ)法进行。结果 2016-2023年长沙市的A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因同源性为94.8%~99.9%,HA基因同源性逐年降低。2016-2023年度长沙市A(H1N1)pdm09分离株与WHO疫苗推荐株同源性为96.8%~99.0%,流感分离株与疫苗推荐株匹配性相对较好。长沙市的A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因进化树显示其在6B分支中进化出多个不同分支,目前已进化到6B.1A.5a.2a分支。HA 4个抗原决定簇氨基酸位点不断发生变异,目前4个抗原决定簇中的15个抗原位点氨基酸发生突变,分离株在2023年新出现的A186T抗原变异位点近期值得关注。受体结合位点在130环相对保守,220环零星发生氨基酸变异,190环氨基酸变异位点是否日趋稳定还需加强监测。以A/California/07/2009(CY121680)为参考株,近年来长沙市大部分A(HlNl)pdm09分离株增加了162 NQTY糖基化位点,减少了276 NTTC糖基化位点,目前这2个位点的糖基化变异日趋稳定。结论 长沙市A(H1N1)pdm09病毒HA基因不断进化变异,提示病毒有逃逸免疫反应可能,我们应持续加强流感监测。 展开更多
关键词 A(H1N1)pdm09 HA基因 进化特征
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2022-2023年山东省A(H1N1)pdm09流感病毒HA、NA基因变异特征分析 被引量:1
6
作者 吴巨龙 张淑 +4 位作者 何玉洁 孙林 宋绍霞 孙文魁 刘倜 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期471-477,共7页
目的 了解山东省2022-2023流感监测年度分离的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因的变异特征,为流感的防控提供科学依据。方法 从流感监测网络实验室分离的流感毒株中按地市随机选取1... 目的 了解山东省2022-2023流感监测年度分离的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因的变异特征,为流感的防控提供科学依据。方法 从流感监测网络实验室分离的流感毒株中按地市随机选取14株A(H1N1)pdm09亚型流感毒株,以WHO推荐的当季疫苗株为参考进行全基因组测序,并采用荧光法开展神经氨酸酶抑制(neuraminidase inhibition,NI)实验以评估药物敏感性。结果 山东省2022-2023年度分离的A(H1N1)pdm09流感病毒属于6B.1A分支中的5a.2a进化簇,核苷酸序列比对分析显示,HA和NA基因与2021-2023年度北半球疫苗株A/Victoria/2570/2019的亲缘关系较为接近,同源性分别为98.5%~98.7%和98.8%~99.1%。氨基酸序列分析显示,HA蛋白有20个位点发生了氨基酸序列变异,并发现1株病毒可能发生抗原漂移,有3株病毒发生了HA蛋白糖基化位点的缺失。NA酶相关重要位点未发生变异。NI实验显示,所测流感毒株均对抗流感病毒药物敏感。结论 所监测毒株与疫苗株整体同源性很高,但氨基酸存在一定程度变异,今后有必要持续开展流感病毒基因变异特征监测以了解流感流行的风险,以及评价基因变异对流感疫苗和治疗药物效果的影响。 展开更多
关键词 甲型H1N1pdm09流感 HA基因 NA基因 基因变异
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2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因特征分析 被引量:1
7
作者 陈宏彬 鄢育青 +3 位作者 张炎华 林琦 吴晶晶 修文琼 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期988-995,共8页
目的分析2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的血凝素(Hemagglutinin,HA)基因特征,了解与其他省份和全球范围内时间和空间上的分布差异。方法选取2016-2020年福建省流感监测网络实验室分离A(H1N1)pdm09流感毒株基因序列测定。... 目的分析2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的血凝素(Hemagglutinin,HA)基因特征,了解与其他省份和全球范围内时间和空间上的分布差异。方法选取2016-2020年福建省流感监测网络实验室分离A(H1N1)pdm09流感毒株基因序列测定。基因序列用MEGA、Net NGlyc 1.0 Server分析基因特征。结果2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒HA基因进化树分析与其他省份及国外大部分一致,但仍有少部分不同。HA分支由6B转化为6B.1并演化至6B.1A5A。HA基因变异主要在抗原性决定簇Sa、Ca、Sb。对于不同地区疫苗株匹配度也会有差异。结论福建省A(H_(1)N_(1))pdm09病毒流行株具有遗传多样性。 展开更多
关键词 A(H1N1)pdm09亚型流感病毒 血凝素 序列分析
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2015—2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒分子流行病学特征分析 被引量:1
8
作者 李艳宇 李姗姗 +1 位作者 杜嘉鑫 韩营营 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1076-1081,1089,共7页
目的分析2015—2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒的分子流行病学特征。方法收集2015年1月1日—2018年12月31日期间北京市东城区流感样病例的咽拭子样本,RT-PCR法检测核酸,阳性样本接种至MDCK细胞进行病毒分离,血凝抑制试验... 目的分析2015—2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒的分子流行病学特征。方法收集2015年1月1日—2018年12月31日期间北京市东城区流感样病例的咽拭子样本,RT-PCR法检测核酸,阳性样本接种至MDCK细胞进行病毒分离,血凝抑制试验鉴定流感亚型。选取30株甲型H1N1pdm09亚型分离株,RT-PCR法扩增血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因序列,并测序。应用DNASTAR 5.0软件将HA、NA序列进行拼接,MEGA 6.0软件建立系统进化树,并进行遗传特征分析。结果共检测样本7533份,甲型H1N1pdm09亚型231份,阳性率为23.24%。30株甲型H1N1pdm09亚型分离株与WHO推荐的北半球疫苗株A-Brisbane-02-2018的HA基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.42%~99.53%和97.40%~99.32%;NA基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为98.11%~99.74%和97.72%~99.80%。HA基因共有16个氨基酸位点发生改变,NA基因共有10个位点发生改变;抗原受体结合位点、糖基化位点和耐药位点均未发生改变。结论2015—2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒HA和NA基因位点发生了一些变异,但抗原性和耐药性未发生改变,与疫苗株匹配性较高。本研究为北京市东城区评价疫苗保护效果及制定流感防治措施提供了实验依据。 展开更多
关键词 流感病毒 甲型H1N1pdm09亚型 血凝素 神经氨酸酶 流行病学特征
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2018-2019监测年度吉林省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性和基因特性分析
9
作者 柳鸿敏 李静 +3 位作者 侯程程 武月婷 李响 杨显达 《中国实验诊断学》 2020年第8期1297-1300,共4页
目的了解吉林省2018-2019监测年度A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性变异情况。方法用血凝抑制的方法对2018-2019监测年度分离的92株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行抗原分析,用深度测序的方法对17株病毒进行序列测定,然后进行... 目的了解吉林省2018-2019监测年度A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性变异情况。方法用血凝抑制的方法对2018-2019监测年度分离的92株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行抗原分析,用深度测序的方法对17株病毒进行序列测定,然后进行基因特性分析。结果抗原分析结果显示,检测的92株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与参考株A/Michigan/45/2015(H1pdm)比较,效价均无>8倍差异,抗原性相似。序列分析的结果显示,与WHO推荐北半球疫苗株比较,HA具有高度的同源性。结论2018-2019监测年度吉林省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和HA基因特性没有发生明显变异。 展开更多
关键词 A(H1N1)pdm09亚型流感病毒 抗原性 基因特性
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1例A(H1N1)pdm09流感重症病例感染株病毒基因组学变异特征分析
10
作者 曹蓝 陈艺韵 +6 位作者 马蒙蒙 周腾飞 夏丹 刘艳慧 李魁彪 狄飚 秦鹏哲 《华南预防医学》 2024年第4期375-379,共5页
目的通过比较1株重症A(H1N1)pdm09流感病毒株与轻型感染株及疫苗株的病毒遗传进化和基因变异差异,探讨重症流感病毒基因组学特点。方法收集流感监测哨点医院重症流感病例和轻型流感样病例的呼吸道样本,全基因组序列测序后,通过生物信息... 目的通过比较1株重症A(H1N1)pdm09流感病毒株与轻型感染株及疫苗株的病毒遗传进化和基因变异差异,探讨重症流感病毒基因组学特点。方法收集流感监测哨点医院重症流感病例和轻型流感样病例的呼吸道样本,全基因组序列测序后,通过生物信息学软件对流感病毒的遗传进化和基因变异特征进行分析。结果1株重症A(H1N1)pdm09流感病毒株与同期流行的8株轻型毒株病毒核苷酸同源性差异最大的为HA基因(97.0%~99.9%),差异最小的为PB2基因(98.9%~100.0%)。病毒株各基因片段与A/Brisbane/02/2018疫苗株同源性普遍高于与A/Michigan/45/2015疫苗株的同源性。氨基酸位点分析上,重症毒株携带有特异的氨基酸变异位点,分别位于HA蛋白K521R、NP蛋白A129S和NS蛋白L52I/S87P/M104I。在遗传进化特征上,重症毒株HA和NA基因均位于6B.1A.5a进化分支,不同于大部分轻型病毒株。重症毒株与轻型病毒株NA蛋白神经氨酸酶催化位均未发生变异。结论重症流感病毒株位于6B.1A.5a进化分支,与轻型流感病毒株进化分支不同。重症毒株在HA蛋白、NP蛋白和NS蛋白发生特异性氨基酸突变,建议应持续密切关注重症流感病毒基因变异特点。 展开更多
关键词 A(H1N1)pdm09流感病毒 重症流感 基因组变异 遗传进化
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2023年湖州市区pdm09 H1N1流感病毒NA基因特征分析
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作者 沈樟 徐德顺 《现代实用医学》 2024年第7期904-906,共3页
pdm09 H1N1流感病毒自2009年爆发引起全球大流行,目前已成为流感流行常见亚型之一[1]。该病毒包含由8个基因片段,其中神经氨酸酶(neuraminidase,NA)是嵌入流感病毒包膜表面的一种重要的功能糖蛋白[2]。主要负责成熟病毒从宿主细胞中释放... pdm09 H1N1流感病毒自2009年爆发引起全球大流行,目前已成为流感流行常见亚型之一[1]。该病毒包含由8个基因片段,其中神经氨酸酶(neuraminidase,NA)是嵌入流感病毒包膜表面的一种重要的功能糖蛋白[2]。主要负责成熟病毒从宿主细胞中释放,在感染下一个宿主细胞进行复制转录,最终使机体出现临床症状和体征[3]。 展开更多
关键词 流感病毒 pdm09H1N1 基因变异 神经氨酸酶
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2017-2019年呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒基因特征分析 被引量:4
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作者 刘东洋 杨月清 +6 位作者 樊红霞 罗云 杨海荣 郝建峰 李海玲 刘艳超 高玉敏 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期376-382,共7页
目的了解呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒遗传进化特征及抗原位点、糖基化位点和耐药位点的变异情况,为流感防控提供科学依据。方法采集2017-2019年呼和浩特市3家哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本进行核酸检测,阳性样本通过MDC... 目的了解呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒遗传进化特征及抗原位点、糖基化位点和耐药位点的变异情况,为流感防控提供科学依据。方法采集2017-2019年呼和浩特市3家哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本进行核酸检测,阳性样本通过MDCK细胞和鸡胚进行病毒分离。随机抽取15株甲型A(H1N1)pdm09流感毒株进行基因测序分析。采用MEGA7.0.14软件、DNASTAR7.0.1软件和NetNGlyc1.0软件进行基因进化树分析、核苷酸同源性分析和糖基化位点分析。结果呼和浩特市2017-2019年15株甲型A(H1N1)pdm09分离株与疫苗株A/Brisbane/02/2018和A/Michigan/45/2015共同属于6B.1分支。各年度分离株与疫苗株A/Brisbane/02/2018的组间遗传距离分别为0.004、0.011和0.013。相较于疫苗株A/California/07/2009和A/Michigan/45/2015,2017年起甲型A(H1N1)pdm09病毒抗原位点变异较大,但与疫苗株A/Brisbane/02/2018相比并未发生抗原漂移现象,与疫苗株匹配效果较好。分离株与疫苗株A/California/07/2009相比多了糖基化位点162NQS/T。分离株与神经氨酸酶抑制剂耐药相关的9个关键氨基酸位点没有发生变异。结论随着时间推移,呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒与疫苗株的基因相似性逐渐降低,提示呼和浩特市病毒在不断进化中,应持续监测。本次研究中的分离株与WHO推荐的2019-2020年北半球疫苗株A/Brisbane/02/2018相比未发生抗原漂移现象,WHO推荐的疫苗株对目前流行的甲型A(H1N1)pdm09流感仍有较好的保护效果。所有分离株NA基因均未发生H275Y耐药突变,提示呼和浩特市流行的甲型A(H1N1)pdm09流感仍然对奥司他韦等NA抑制剂药物敏感。 展开更多
关键词 甲型A(H1N1)pdm09 流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 基因特征
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2017-2019年度上海市松江区A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因特征分析 被引量:9
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作者 吴佳瑾 刘玲 +2 位作者 赵雪 盛峰松 乔雪飞 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期423-430,共8页
目的分析上海市松江区2017-2019监测年度A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因特征。方法对松江区分离的毒株随机挑选46株A(H1N1)pdm09流感病毒毒株进行HA和NA基因序列进化分析和氨基酸位点变异分析,采用神经氨酸酶抑制实验开展奥司他韦和扎... 目的分析上海市松江区2017-2019监测年度A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因特征。方法对松江区分离的毒株随机挑选46株A(H1N1)pdm09流感病毒毒株进行HA和NA基因序列进化分析和氨基酸位点变异分析,采用神经氨酸酶抑制实验开展奥司他韦和扎那米韦敏感性监测。结果A(H1N1)pdm09流感病毒属于6B.1A分支且进化出了6B.1A2、6B.1A5A和6B.1A6进化簇。核苷酸序列分析显示,HA和NA基因与WHO推荐的2019-2020年度的疫苗株A/Brisbane/02/2018的亲缘关系较为接近,同源性分别为98.6%~99.4%和99.1%~99.7%。氨基酸序列分析显示,HA1蛋白共有23个位点发生氨基酸序列变异,43.48%病毒发生位于抗原决定簇Cb、Sa和Sb区的S74R、S164T、T185I共同突变,提示病毒发生抗原漂移。鸡胚适应性分析发现HA蛋白D187V、Q223R和E224K位点的适应性突变。NA蛋白共有25个位点发生变异,存在酶活性中心E119K(2/46)突变。神经氨酸酶抑制实验显示,所测流感病毒对奥司他韦和扎那米韦均敏感。结论A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因及其编码的氨基酸持续变异,因此应持续监测流感病毒,为科学防控提供依据。 展开更多
关键词 A(H1N1)pdm09流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 基因特征 鸡胚适应性分析
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2019-2020年海南省A(H1N1)pdm09流感病毒基因特性分析 被引量:2
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作者 孙初阳 崔磊 +3 位作者 潘家兴 王如敏 马焱 李丹丹 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期532-537,共6页
目的分析海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性,了解病毒的变异情况,为海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的防控提供依据。方法选取14株2019-2020年海南省流感监测网络实验室分离到的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行基因序列测... 目的分析海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性,了解病毒的变异情况,为海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的防控提供依据。方法选取14株2019-2020年海南省流感监测网络实验室分离到的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行基因序列测定,测序结果用MEGA 10.1.8和DNASTAR7.0.1软件进行基因特性分析。结果2019-2020年海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与国际疫苗株A/Brisbane/02/2018的血凝素基因(Hemagglutinin HA)和神经氨酸酶基因(Neuraminidase NA)均在核苷酸进化树6B.1分支上。海南分离株与疫苗株A/Brisbane/02/2018 HA基因核苷酸和氨基酸同源性范围分别为98.5%~99.1%和97.7%~99.1%,对神经氨酸酶抑制剂敏感,HA基因在Sa抗原决定簇NQT162-164有共同变异位点,N162位点的变异增加了1个潜在糖基化位点。Sb抗原决定簇K156位点发生变异的分离株为参考血清A/Brisbane/02/2018的低反应株,其余分离株均为疫苗株A/Brisbane/02/2018的类似株。结论2019-2020年海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与WHO推荐的北半球疫苗组分匹配。 展开更多
关键词 A(H1N1)pdm09亚型流感病毒 抗原性 基因特性 血凝素 神经氨酸酶
暂未订购
携带H1N1 pdm09基因的重配猪流感病毒分子流行特征研究进展 被引量:1
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作者 余良政 丁仰保 +9 位作者 何剑桥 刘林林 崔柏杨 郭嘉宁 曾昊 郭金凡 韦祖樟 欧阳康 黄伟坚 陈樱 《动物医学进展》 北大核心 2021年第3期87-91,共5页
在2009年甲型H1N1流感(H1N1 pdm09)大流行暴发初期,该病毒就已经成功地潜入到了猪群当中,继而参与到了猪流感病毒(SIV)的进化过程,通过不断地重配和适应,促进了新型SIV变异毒株的产生。目前,世界各地的猪群中普遍流行着携带有H1N1 pdm0... 在2009年甲型H1N1流感(H1N1 pdm09)大流行暴发初期,该病毒就已经成功地潜入到了猪群当中,继而参与到了猪流感病毒(SIV)的进化过程,通过不断地重配和适应,促进了新型SIV变异毒株的产生。目前,世界各地的猪群中普遍流行着携带有H1N1 pdm09基因片段的新型SIV,其重配形式呈现多样化。值得一提的是,由于H1N1 pdm09毒株的内部基因具有广泛的基因相容性,不同亚型、不同谱系的人源流感病毒、禽源流感病毒和本地猪流感病毒更倾向与它们优先发生重组。重配后的子代病毒较亲本毒株容易获得选择优势,能够在猪群中建立稳定的遗传谱系。研究发现H1N1 pdm09部分独特的内部基因片段在其高效的人际间传播过程中发挥着决定性的作用。一旦这类新型SIV成功突破种间屏障,获得适应新的哺乳动物的能力,将会对人类健康造成潜在的威胁。论文综述了携带有H1N1 pdm09基因的新型重配SIV的分子流行情况,特别就H1N1 pdm09内部基因与重组病毒致病性、传播能力等相关的分子基础进行了系统地综述,为防控新型SIV的暴发和保障公共卫生安全提供依据。 展开更多
关键词 H1N1 pdm09 基因 重配猪流感病毒 分子流行特征
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海南省2019-2020监测年度A(H1N1)pdm09流感病毒基质蛋白基因特性分析 被引量:1
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作者 孙初阳 潘家兴 +2 位作者 崔蕾 王如敏 李丹丹 《中国热带医学》 CAS 2021年第11期1085-1088,共4页
目的分析2019—2020监测年度(2019年4月1日—2020年3月29日)海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒基质蛋白基因(Matrix,M)进化规律和M2蛋白氨基酸位点变异情况。方法选取14株2019—2020年海南省分离的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行基因序列测... 目的分析2019—2020监测年度(2019年4月1日—2020年3月29日)海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒基质蛋白基因(Matrix,M)进化规律和M2蛋白氨基酸位点变异情况。方法选取14株2019—2020年海南省分离的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行基因序列测定,采用Neighbor-Joining方法进行种系进化分析,通过系统进化树比较海南流行株与疫苗株的差异。测序结果用MEGA 10.1.8和DNASTAR7.0.1软件进行基因特性分析及基因同源性分析。结果2019—2020监测年度,海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒分离株占分离株的4.9%。序列分析显示,海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与国际疫苗株A/Brisbane/02/2018的M基因在核苷酸系统进化树6B.1分支上,核苷酸与氨基酸同源性范围为98.7%~100.0%、98.8%~100.0%。12株分离株胞外区编码区S23N氨基酸发生变异;跨膜区14株分离株均发生S31N位点突变,突变率为100.0%;1株I39V位点氨基酸变异;9株分离株在胞浆区E70D位氨基酸位点发生变异。结论2019—2020监测年度海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒活动水平较低,与疫苗株相匹配,对金刚烷胺类药物耐药,应特别关注M2蛋白氨基酸变异情况,为临床抗流感病毒药物的使用提供科学依据。 展开更多
关键词 A(H1N1)pdm09亚型流感病毒 基质蛋白 基因变异
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Antigenic Drift of the Hemagglutinin from an Influenza A(H1N1) pdm09 Clinical Isolate Increases its Pathogenicity In Vitro 被引量:2
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作者 Lei Xing Yunbo Chen +11 位作者 Boqian Chen Ling Bu Ying Liu Zhiqi Zeng Wenda Guan Qigao Chen Yongping Lin Kun Qin Honglin Chen Xilong Deng Xinhua Wang Wenjun Song 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2021年第5期1220-1227,共8页
The influenza A(H1 N1)pdm09 virus emerged in 2009 and has been continuously circulating in humans for over ten years.Here,we analyzed a clinical influenza A(H1 N1)pdm09-infected patient case hospitalized for two month... The influenza A(H1 N1)pdm09 virus emerged in 2009 and has been continuously circulating in humans for over ten years.Here,we analyzed a clinical influenza A(H1 N1)pdm09-infected patient case hospitalized for two months in Guangdong(from December 14,2019 to February 15,2020).This isolate,named A/Guangdong/LCF/2019(LCF/19),was genetically sequenced,rescued by reverse genetics,and phylogenetically analyzed in the context of other relevant pdm09 isolates.Compared with earlier isolates,this pdm09 virus’s genetic sequence contains four substitutions,S186 P,T188 I,D190 A,and Q192 E,of the hemagglutinin(HA)segment at position 186–192(H3 numbering)in the epitope Sb,and two of which are located at the 190-helix.Phylogenetic analysis indicated that the epitope Sb started undergoing a rapid antigenic change in2018.To characterize the pathogenicity of this novel substitution motif,a panel of reassortant viruses containing the LCF/2019 HA segment or the chimeric HA segment with the four substitutions were rescued.Kinetic growth data revealed that the reassortant viruses,including the LCF/2019 with the PTIAAQE substitution,propagated faster than those rescued ones having the STTADQQ motif in the epitope Sb in Madin-Darby Canine Kidney(MDCK)cells.The HI test showed that the binding activity of escape mutant to 2018 pdm09 sera was weaker than GLW/2018,suggesting that old vaccines might not effectively protect people from infection.Due to the difference in the selection of vaccine strains,people vaccinated in the southern hemisphere could still suffer a severe infection if infected with this antigenic drift pdm09 virus. 展开更多
关键词 HA antigenic drift Influenza A(H1N1)pdm09 virus HA epitope Sb
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Immunogenic and Protective Properties of the First Kazakhstan Vaccine against Pandemic Influenza А(Н1N1) pdm09 in Ferrets
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作者 Kaissar Tabynov Zhailaubai Kydyrbayev +5 位作者 Abylai Sansyzbay Berik Khairullin Sholpan Ryskeldinova Nurika Assanzhanova Yerken Kozhamkulov Dulat Inkarbekov 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2012年第6期345-352,共8页
This paper presents the results of a pre-clinical study of the immunogenicity and efficacy of an egg-derived, inactivated, whole-virion adjuvanted vaccine (Refluvac) on ferret models. For this purpose, groups of eig... This paper presents the results of a pre-clinical study of the immunogenicity and efficacy of an egg-derived, inactivated, whole-virion adjuvanted vaccine (Refluvac) on ferret models. For this purpose, groups of eight ferrets (6 to 7 months old) were injected with 0.5 mL of vaccine specimens containing 3.75, 7.5 or 15.0 μg of virus hemagglutinin. Administration was intramuscular and given either as a single dose or as two doses 14 days apart. All vaccine specimens manifested immunogenicity in ferrets for single (HI titer, from 51 ± 7 to 160 ± 23) and double (HI titer, from 697± 120 to 829 ± 117) administrations. To assess the protective effects of the vaccine, ferrets from the vaccinated and control groups were infected intranasally with pandemic virus A/California/7/09 (H1N1) pdm09 at a dose of 106 106/0.5 mL. Fourteen days post-infection, the ferrets inoculated with single or double vaccines containing 3.75, 7.5 or 15.0 ~g of hemagglutinin per dose showed no signs of influenza infection, weight loss, or body temperature rise, and no premature deaths occurred. The number of vaccinated ferrets shedding the virus via the upper airway, as well as the amount of virus shed after infection, was significantly reduced in comparison with animals from the control group. Based on our results, we suggest that a single vaccination at a dose of 3.75 or 7.5 μg hemagglutinin be used for Phase I clinical trials. 展开更多
关键词 VACCINE Pandemic Influenza A (H1N1) pdm09 Immunogenic and Protective Properties FERRETS
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