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Differential Expression of MicroRNAs in Response to Drought Stress in Maize 被引量:3
1
作者 LI Jing-sheng FU Feng-ling +3 位作者 AN Ming ZHOU Shu-feng SHE Yue-hui LI Wan-chen 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2013年第8期1414-1422,共9页
Drought is one of the major abiotic stresses that limit maize productivity. Apart from the principal transcriptional regulation, post-transcriptional regulation mediated by microRNAs appears to be the prevalent respon... Drought is one of the major abiotic stresses that limit maize productivity. Apart from the principal transcriptional regulation, post-transcriptional regulation mediated by microRNAs appears to be the prevalent response of plants to abiotic stress. In this study, the differential expression of microRNAs in the previously evaluated drought-tolerant inbred lines R09 under drought stress was detected by microarray hybridization. The target genes of the differentially-expressed microRNAs were predicted by bioinformatics software WMD3 for plant target gene prediction. The possible regulation of the differentially-expressed microRNAs as well as their target genes in maize response to drought stress was analysed according to Gene Ontology. Sixty-eight microRNAs in 29 microRNA families were detected to be differentially expressed in the seedling of the drought-tolerant inbred line R09, accounting for 5.97% of the total number of the probes. The expression profiles were different between the two time points of the drought stress. The functions of the genes targeted by the differentially-expressed microRNAs involve multiple physiological and biochemical pathways of response to abiotic stress, such as transcription regulation, metabolism, signal transduction, hormone stimulation, and transmembrane transport. Under drought stress, the differential expression of microRNAs regulates the expression of their target genes, resulting in multiple responses of physiological and biochemical pathways relative to drought tolerance of maize, miR156, miR159 and miR319 families may play more important roles. The different members of the same family may play similar regulation effects in most cases. 展开更多
关键词 differential expression DROUGHT MAIZE microarray microrna target gene
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microRNAs参与韧带成纤维细胞成骨分化相关分子表达的调节 被引量:6
2
作者 张秀梅 崔亚洲 +2 位作者 周小艳 于芳沧 韩金祥 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期540-547,共8页
韧带成纤维细胞成骨分化与强直性脊柱炎等多种异位骨化相关性疾病有关,但其机制尚不清楚.本研究目的在于观察韧带成纤维细胞在成骨分化过程中microRNA和mRNA的表达谱变化,以期为揭示成纤维细胞成骨分化机制提供研究基础.原代培养韧带成... 韧带成纤维细胞成骨分化与强直性脊柱炎等多种异位骨化相关性疾病有关,但其机制尚不清楚.本研究目的在于观察韧带成纤维细胞在成骨分化过程中microRNA和mRNA的表达谱变化,以期为揭示成纤维细胞成骨分化机制提供研究基础.原代培养韧带成纤维细胞、地塞米松、抗坏血酸和β-磷酸甘油体外诱导其成骨分化,RT-PCR检测成骨标志物骨钙素和Runx2的表达.采用表达谱基因芯片分析诱导0、7、14 d后韧带成纤维细胞的microRNAs和mRNAs表达,并用实时定量PCR(RT-qPCR)和Western印迹方法验证生物信息学分析结果.结果显示,与未诱导前相比,成骨分化第7 d有66个microRNAs和640个mRNA表达上调,94个microRNAs和744个mRNA表达下调;成骨分化第14 d有58个microRNAs和781个mRNA表达上调,96个microRNAs和603个mRNA表达下调.实时定量PCR和Western印迹验证结果显示,miR-29b在成骨分化过程中表达上调,TGFβ3表达水平降低,与芯片结果一致,miR-29b通过抑制TGFβ3蛋白的翻译来促进Runx2的表达,从而促进韧带成纤维细胞向成骨细胞分化.韧带成纤维细胞成骨分化过程中,microRNA调控基因及mRNA差异表达基因除涉及BMPs、Wnt和Ihh等信号通路外,在成纤维细胞成骨分化过程中可能还存在其它的新机制. 展开更多
关键词 成纤维细胞 成骨分化 microrna MRNA 芯片
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子宫内膜癌干细胞分化过程中microRNA表达谱的鉴定及分析 被引量:7
3
作者 王伟 王臻 +3 位作者 黄康榕 王月玲 柏海燕 杨新园 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期221-226,共6页
目的筛选子宫内膜癌干细胞分化过程中差异表达的microRNAs(miRNAs)并进行初步鉴定。方法无血清悬浮培养法富集子宫内膜癌干细胞,贴壁培养获得其分化细胞。利用microRNA芯片比较肿瘤干细胞及其分化细胞之间miRNAs的表达差异,挑选出有显... 目的筛选子宫内膜癌干细胞分化过程中差异表达的microRNAs(miRNAs)并进行初步鉴定。方法无血清悬浮培养法富集子宫内膜癌干细胞,贴壁培养获得其分化细胞。利用microRNA芯片比较肿瘤干细胞及其分化细胞之间miRNAs的表达差异,挑选出有显著差异的miRNAs,通过RT-qPCR进行验证,应用TargetScan等数据库预测其靶基因;同时,芯片检测肿瘤干细胞及其分化细胞之间基因表达的差异,结合预测的miRNAs靶基因进行综合分析。结果 microRNA芯片筛选得到子宫内膜癌干细胞及其分化细胞之间差异表达(相差倍数2倍以上)的miRNAs有11个,其中在肿瘤干细胞中表达上调的miRNAs 10个,分别为miR-522、miR-139-3p、miR-520c-5p、miR-518d-5p、miR-146b-5p、miR-34a、miR-526a、miR-193a-3p、miR-221、miR-4674;在肿瘤干细胞中低表达的miRNA 1个,为miR-760。RT-qPCR检测结果显示,除miR-526a、miR-4674以外,其余9个miRNAs在肿瘤干细胞及分化细胞间的相对表达量均存在显著差异,与芯片检测结果一致。TargetScan、miRanda及miRTarBase在线数据库的交集中,筛选的miRNAs均可预测到靶基因。基因芯片检测肿瘤干细胞及其分化细胞,表达有显著性差异的基因共445个,其中207个在肿瘤干细胞中高表达,238个在肿瘤干细胞中低表达,与预测的miRNAs靶基因进行综合分析后发现,除miR-139-3p外,两者均有交集。结论子宫内膜癌干细胞分化过程中部分miRNAs的表达具有显著性变化,对此进行深入探索将为肿瘤干细胞的分化机制研究提供新的线索。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 肿瘤干细胞 分化 micrornaS microrna芯片
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MicroRNA 34a-5p对成骨细胞炎症反应及分化的影响 被引量:6
4
作者 王贵玲 杨谛 +2 位作者 郭佳杰 于雅琼 仇丽鸿 《口腔医学研究》 CAS 北大核心 2017年第11期1139-1142,共4页
目的:探究microRNA 34a-5p(miR-34a-5p)对成骨细胞炎症反应及分化的调节作用,并初步探究其相关机制。方法:脂质体法瞬时转染人成骨样细胞系MG63使细胞中miR-34a-5p表达增强,同时设通用阴性对照(NC)组。牙髓卟啉单胞菌(Porphyromonas end... 目的:探究microRNA 34a-5p(miR-34a-5p)对成骨细胞炎症反应及分化的调节作用,并初步探究其相关机制。方法:脂质体法瞬时转染人成骨样细胞系MG63使细胞中miR-34a-5p表达增强,同时设通用阴性对照(NC)组。牙髓卟啉单胞菌(Porphyromonas endodontalis,P.e)来源的不同浓度脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)作用于MG63后,检测细胞内miR-34a-5p表达;取20mg/L P.e-LPS作用24h后,检测细胞内IL-6表达。成骨诱导48h后,检测细胞中成骨分化标志物以及Notch1受体的表达。结果:P.e-LPS作用于MG63细胞后,miR-34a-5p表达被抑制(P<0.05)。MiR-34a-5p转染细胞后,与NC组相比,细胞内IL-6表达减少(P<0.01);20mg/L P.e-LPS作用下,miR-34a-5p组IL-6表达较NC组下降更为明显(P<0.01)。成骨细胞诱导分化48h后,miR-34a-5p组中分化标志物表达较NC对照组均显著增加(P<0.05),而Notch1受体表达被抑制(P<0.05)。结论:MiR-34a-5p可能通过Notch1信号通路,发挥抑制成骨细胞炎症和促进成骨分化的作用。 展开更多
关键词 microrna 34a-5p 成骨细胞 炎症 分化
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无功能垂体腺瘤与正常垂体中microRNAs的差异表达 被引量:6
5
作者 肖伟伟 毛志钢 +3 位作者 周静 罗斌 王海军 朱永红 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期26-30,共5页
【目的】检测微小分子RNA(microRNA,miRNA)在无功能垂体腺瘤(NFA)和正常垂体(NP)组织中的差异表达,探讨微小分子RNA在垂体腺瘤发生发展过程中的作用。【方法】收集6例NFA和6例NP,应用miRCURYTM LNA基因芯片技术分析差异表达的miRNA,并... 【目的】检测微小分子RNA(microRNA,miRNA)在无功能垂体腺瘤(NFA)和正常垂体(NP)组织中的差异表达,探讨微小分子RNA在垂体腺瘤发生发展过程中的作用。【方法】收集6例NFA和6例NP,应用miRCURYTM LNA基因芯片技术分析差异表达的miRNA,并应用荧光定量PCR对部分差异表达的miRNA进行验证。【结果】与正常标本相比,肿瘤标本中miR-124、-141、-200c、-223、-297、-299-5p、-32、-340、-378、-491-3p、-519d、-525-5p、-550、-551a、-574-5p、-583、-662、-768-3p、-885-5p、-890等20个miRNAs显著上调(上调到>2.0倍),miR-125b-1、-132、-17、-192、-193a-3p、-193a-5p、-21、-302c、-30b、-31、-376b、-490-5p、-542-3p、-567、-622、-637、-654-3p、-658等18个miRNAs明显下调(下调到0.5倍以下)。一些差异表达的miRNA参与细胞的增殖和凋亡过程,提示它们的变化可能与垂体腺瘤的发生发展有关。【结论】miRNAs表达的变化可能参与无功能垂体腺瘤的发生,而miRNAs靶基因的确立可以为无功能垂体腺瘤的发生机制提供新的理论依据。 展开更多
关键词 microrna 无功能垂体腺瘤 垂体 基因芯片 差异表达 BCL-2
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microRNA在两种不同来源的肝卵圆细胞中的差异表达 被引量:2
6
作者 许荣华 何冬雷 +2 位作者 孟津 夏立平 王健 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第17期4879-4882,共4页
目的分离纯化两种不同模型来源的卵圆细胞(HOCs)并初步筛选差异表达的microRNA。方法采用2-乙酰氨基芴(2-AAF)和2/3肝切除(PH)建立SD大鼠HOCs增殖模型,用化学致癌剂3'-甲基-4-二甲基偶氮苯(3'-Me-DAB)诱发SD大鼠肝卵圆细胞增生... 目的分离纯化两种不同模型来源的卵圆细胞(HOCs)并初步筛选差异表达的microRNA。方法采用2-乙酰氨基芴(2-AAF)和2/3肝切除(PH)建立SD大鼠HOCs增殖模型,用化学致癌剂3'-甲基-4-二甲基偶氮苯(3'-Me-DAB)诱发SD大鼠肝卵圆细胞增生模型;分离纯化并鉴定两种不同模型来源的大鼠肝卵圆细胞;用microRNA芯片技术检测HOCs/AAF与HOCs/DAB中microRNA的表达谱,筛选差异表达的microRNA;用实时荧光定量PCR方法对筛选出的部分差异microRNA进行验证。结果 1激光扫描共聚焦显微镜显示,两种肝卵圆细胞胞质和胞膜均表达干细胞标志Thy-1及C-kit。2microRNA芯片的结果显示,HOCs/DAB与HOCs/AAF比较,有10个microRNA表达上调,8个microRNA表达下调。3实时荧光定量PCR结果进一步证实mir-210、mir92b、mir-1281在HOCs/DAB中显著上调,而mir-181、mir-1228显著下调。结论两种不同模型来源的肝卵圆细胞存在着显著差异表达的microRNA,为研究肝癌细胞可能来源于肝卵圆细胞HOCs/DAB提供线索。 展开更多
关键词 肝卵圆细胞 分化 microrna 微小RNA芯片
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大鼠肝卵圆细胞向肝癌细胞分化过程中microRNA的变化 被引量:1
7
作者 许荣华 何冬雷 +2 位作者 孟津 夏立平 王健 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期1-6,共6页
目的利用生物芯片技术分析大鼠肝卵圆细胞分化为肝癌细胞过程中微小RNA(microRNA,miRNA)的表达变化,筛选调控分化的microRNAs,探讨肝癌发生的起源机制。方法用化学致癌剂3’-Me-DAB诱发SD大鼠肝卵圆细胞增生,采用密度梯度离心法分离、... 目的利用生物芯片技术分析大鼠肝卵圆细胞分化为肝癌细胞过程中微小RNA(microRNA,miRNA)的表达变化,筛选调控分化的microRNAs,探讨肝癌发生的起源机制。方法用化学致癌剂3’-Me-DAB诱发SD大鼠肝卵圆细胞增生,采用密度梯度离心法分离、纯化肝卵圆细胞,行体外培养使其恶性分化并进行鉴定。提取分化过程中的microRNA进行microRNA基因芯片杂交,获得卵原细胞恶性分化过程中microRNA表达谱。同时利用种植模型及大鼠Y染色体特异性PCR技术,验证卵圆细胞可恶性分化为肝癌细胞。结果①激光扫描共聚焦显微镜显示,肝卵圆细胞胞浆和胞膜表达干细胞标志Thy-1及C-kit;②通过基因微阵列分析,卵原细胞恶性分化过程中有22个miRNA的改变显著,其中19个表达上调,3个表达下调;③卵原细胞种植模型的大鼠肝癌组织具有SRY基因的电泳条带。结论特定microRNA可能对大鼠肝卵圆细胞分化为肝癌细胞过程起到关键作用。 展开更多
关键词 肝卵圆细胞 分化 microrna 微小RNA芯片
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MicroRNA对成骨细胞分化的调控 被引量:2
8
作者 税巍 胡侦明 王大武 《中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志》 2012年第2期145-150,共6页
微小RNA(micro RNA,miRNA)是一类非蛋白质编码调控小RNA,长度约为22nt。由于miRNA不编码蛋白质,限制了其生物学功能的应用。目前的研究主要是关于miRNA调控单一组织的限制性转录,即一类编码一种转录因子,控制影响细胞增殖、分化、凋亡... 微小RNA(micro RNA,miRNA)是一类非蛋白质编码调控小RNA,长度约为22nt。由于miRNA不编码蛋白质,限制了其生物学功能的应用。目前的研究主要是关于miRNA调控单一组织的限制性转录,即一类编码一种转录因子,控制影响细胞增殖、分化、凋亡及个体生长发育,miRNA能对成骨分化过程产生正向、负向调控作用。本文就miRNA对成骨细胞分化的调控研究进展进行综述。 展开更多
关键词 微小RNA 转录因子 成骨分化 调控
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淮安食管鳞癌与癌旁组织中差异表达microRNAs的初步分析 被引量:7
9
作者 刘辉 刘冉 +7 位作者 苏耀耀 杨淼 浦跃朴 尹立红 王仪 潘恩春 郭伟 尤振兵 《癌变·畸变·突变》 CAS CSCD 2010年第6期418-422,共5页
目的:初步筛选淮安食管鳞癌与癌旁组织中差异表达的microRNAs,为进一步研究与肿瘤相关的microRNA在食管鳞癌发病机制中的作用奠定基础。方法:选取3例食管鳞癌病人癌组织及其癌旁组织为样本,采用AgilentTM高通量的microRNA微阵列芯片检测... 目的:初步筛选淮安食管鳞癌与癌旁组织中差异表达的microRNAs,为进一步研究与肿瘤相关的microRNA在食管鳞癌发病机制中的作用奠定基础。方法:选取3例食管鳞癌病人癌组织及其癌旁组织为样本,采用AgilentTM高通量的microRNA微阵列芯片检测miRNAs的表达水平,应用配对t检验分析芯片数据,筛选食管鳞癌组织和癌旁组织中差异表达的内源性microRNAs。结果:MicroRNA微阵列芯片检测的866个人类相关microRNA探针中,食管鳞癌组织与配对癌旁组织样本表达差异有统计学意义的microRNAs有15个(P<0.05):其中表达上调的有7个,分别为hsa-miR-20a,hsa-miR-155,hsa-miR-574-5p,hsa-miR-21*,hsa-miR-183,hsa-miR-60 1,hsa-miR-623;表达下调的有8个,分别为hsa-miR-186,hsa-miR-10a,hsa-miR-144,hsa-miR-338-3p,hsa-miR-192,hsa-miR-218,hsa-miR-45 1,hsa-miR-139-5p。结论:在食管鳞癌组织和癌旁组织中初步筛选了15个差异表达的microRNAs,它们可能与食管鳞癌的发生和发展相关。 展开更多
关键词 食管鳞癌 microrna 差异表达 微阵列
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microRNA调控间充质干细胞成骨分化的研究进展 被引量:5
10
作者 沈君颜 王浩(综述) 刘海亮(审校) 《同济大学学报(医学版)》 CAS 2020年第1期123-129,135,共8页
间充质干细胞是一类体内广泛存在的多能干细胞,具有多向分化潜能,为多种组织器官提供保护及损伤修复。近年来,间充质干细胞向成骨细胞诱导分化用于治疗骨代谢等相关性疾病已成为热点。microRNA(miRNA)作为生物体内重要的小分子非编码RNA... 间充质干细胞是一类体内广泛存在的多能干细胞,具有多向分化潜能,为多种组织器官提供保护及损伤修复。近年来,间充质干细胞向成骨细胞诱导分化用于治疗骨代谢等相关性疾病已成为热点。microRNA(miRNA)作为生物体内重要的小分子非编码RNA,通过转录后调控影响基因表达,参与各种生命过程。研究显示,多种不同的miRNA在间充质干细胞向成骨分化过程中起着核心调节作用。本文结合相关文献,对miRNA调控间充质干细胞成骨分化的作用及机制归纳总结,以帮助全面了解靶向miRNA治疗骨代谢性相关疾病的潜能。 展开更多
关键词 间充质干细胞 成骨分化 microrna 成骨细胞 骨疾病
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心血管衰老时序变化相关miRNA调控基因的差异表达及其功能分析
11
作者 周靖雅 李鹏 范济瑞 《新疆医科大学学报》 2025年第4期464-470,共7页
目的探讨不同年龄段间心血管衰老相关微小RNA(miRNA)调控基因的差异表达及功能分析。方法筛选2020年1月-2021年1月符合入选标准的临床健康受检者12例,按年龄平均分为3组:≤44岁组、45~59岁组、≥60岁组,利用基因芯片技术筛选组间差异基... 目的探讨不同年龄段间心血管衰老相关微小RNA(miRNA)调控基因的差异表达及功能分析。方法筛选2020年1月-2021年1月符合入选标准的临床健康受检者12例,按年龄平均分为3组:≤44岁组、45~59岁组、≥60岁组,利用基因芯片技术筛选组间差异基因,对差异miRNA进行靶基因预测、基因本体论(GO)分析、KEGG信号通路分析。结果(1)与≤44岁组相比,45~59岁组有5个差异miRNA,其中3个miRNA表达上调,2个miRNA表达下调;与≤44岁组相比,≥60岁组有40个差异miRNA,其中20个miRNA表达上调,20个miRNA表达下调。与45~59岁组相比,≥60岁组有38个差异miRNA,其中36个miRNA表达上调,2个miRNA表达下调。(2)45~59岁组与≤44岁组差异miRNA的靶基因有45个,≥60岁组与≤44岁组差异miRNA的靶基因有985个,≥60岁组与45~59岁组差异miRNA的靶基因有1296个。(3)GO和KEGG富集分析结果显示,45~59岁组与≤44岁组差异miRNA的靶基因主要参与调控干细胞增殖以及DNA损伤信号,富集在p53信号通路、脂肪细胞因子信号通路、长寿调节途径等;≥60岁组与≤44岁组差异miRNA的靶基因主要参与细胞黏附,富集在cAMP信号通路等;≥60岁组与45~59岁组差异miRNA的靶基因主要参与葡萄糖转运过程,富集在T细胞受体信号通路、调节干细胞多能性信号通路以及调节昼夜节律途径等。(4)扩大样本量验证结果显示,miR-21-3p在≥60岁组中具有表达上调趋势,miR-338-5p在≥60岁组中具有表达下调趋势,且初步呈现年龄依赖性下降。与≤44岁组比较,≥60岁组磷酸酶和张力蛋白同源基因(PTEN)和沉默信息调节因子1(SIRT1)基因的表达显著下降(P<0.05)。结论miR-21-3p、miR-212-3p、miR-338-5p是心血管衰老时序变化相关的差异miRNA,可能通过调控靶基因PTEN和SIRT1的表达,参与调控血管内皮及心肌细胞周期、细胞衰老与修复及能量代谢等过程,从而影响心血管衰老。 展开更多
关键词 心血管衰老 微小RNA 基因芯片 差异表达
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miRNA在血管钙化中的作用研究进展
12
作者 贾会翠 梁秋华 《临床医学研究与实践》 2025年第15期195-198,共4页
血管钙化是一种在脂质代谢紊乱、高血糖、高血磷等因素作用下钙、磷异常沉积于动脉壁导致血管壁硬化,从而引起功能障碍的病理现象,是导致高血压病、慢性肾脏病、心血管病等疾病的危险因素。近年来,微小RNA(miRNA)在血管钙化中的重要作... 血管钙化是一种在脂质代谢紊乱、高血糖、高血磷等因素作用下钙、磷异常沉积于动脉壁导致血管壁硬化,从而引起功能障碍的病理现象,是导致高血压病、慢性肾脏病、心血管病等疾病的危险因素。近年来,微小RNA(miRNA)在血管钙化中的重要作用被发现,但其在血管钙化发生发展中的病理生理机制尚不清楚。本综述主要介绍miRNA通过调控成骨细胞分化、Klotho蛋白、细胞凋亡、炎症反应、自噬、核心岩藻糖基化修饰等参与血管钙化的发生与发展过程,探索miRNA作为治疗靶点的潜力,为血管钙化的预防、诊断和治疗提供新的策略。 展开更多
关键词 血管钙化 微小RNA 成骨细胞分化 KLOTHO蛋白 细胞凋亡
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早期糖尿病肾病相关微小RNA在小鼠肾脏的表达变化 被引量:7
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作者 张政 罗勇军 +1 位作者 彭惠民 何晓燕 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第13期1383-1386,共4页
目的建立db/db小鼠早期糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达谱。方法采用12只9周龄高血糖且24h尿白蛋白显著增高的db/db小鼠作为早期糖尿病肾病组,12只9周龄db/m小鼠作为正常对照组,用于miRNA芯片和... 目的建立db/db小鼠早期糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达谱。方法采用12只9周龄高血糖且24h尿白蛋白显著增高的db/db小鼠作为早期糖尿病肾病组,12只9周龄db/m小鼠作为正常对照组,用于miRNA芯片和实时荧光定量RT-PCR检测。Trizol法抽提肾脏总RNA,YM-100微离心滤器富集小RNA,芯片技术检测DN组和对照组miRNAs的差异表达谱。应用实时荧光定量RT-PCR验证部分差异miRNAs,运用生物信息学技术预测部分相关miRNAs的靶基因。结果芯片结果显示,66个miRNA在DN组和对照组存在差异表达(P<0.01),其中35个miRNAs在DN组呈高表达,31个miRNAs在DN组呈低表达,差异倍数从1.08~10.20。实时荧光定量RT-PCR进一步验证部分miRNA的表达,结果显示3个miRNAs在DN组表达上调,分别为:miR-196a、miR-98和miR-29c;4个表达在DN组下调,分别为miR-21、miR-451、miR-709和miR-187,差异显著(P<0.01)。结论部分miRNAs在DN和正常对照肾脏组织中存在差异表达,可能参与了DN发生的分子机制。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 microrna microrna芯片 差异表达
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持续张应力大鼠骨髓基质干细胞骨向分化影响的基因芯片分析 被引量:5
14
作者 张鹏 房兵 +5 位作者 俞创奇 代庆刚 欧阳宁娟 吴玉琼 杨筱 江凌勇 《医用生物力学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第1期14-19,共6页
目的通过基因芯片技术研究持续张应力作用下大鼠骨髓基质干细胞(bone marrow stromal cells,BMSCs)成骨分化中基因表达差异。方法体外分离及培养大鼠BMSCs,使用Flexercell应力加载系统进行频率1 Hz、幅度10%持续张应力加载6 h。检测持... 目的通过基因芯片技术研究持续张应力作用下大鼠骨髓基质干细胞(bone marrow stromal cells,BMSCs)成骨分化中基因表达差异。方法体外分离及培养大鼠BMSCs,使用Flexercell应力加载系统进行频率1 Hz、幅度10%持续张应力加载6 h。检测持续张应力下大鼠BMSCs差异表达基因谱,并通过qRT-PCR对部分芯片结果进行验证。结果加力组与对照组相比差异表达基因共有1 244条,其中上调基因793条,下调基因451条。基因本体论(gene ontology,GO)分类发现差异表达基因主要涉及多器官发育、细胞分化、细胞趋化、黏附等功能。Notch、Wnt、FGF及IGF 4条通路可能参与力学诱导下BMSCs成骨分化过程。差异表达基因的PCR验证结果与芯片结果保持一致。结论张应力可诱导BMSCs骨向分化,而基因芯片筛选出的差异表达基因可能是力学刺激诱导骨向分化的作用靶点。 展开更多
关键词 基因芯片 骨髓基质干细胞 张应力 骨向分化
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小鼠间充质干细胞脂向分化过程中miRNA-143的表达 被引量:5
15
作者 凌宏艳 胡小波 +4 位作者 奉水东 杨丝丝 何剑琴 张恺芳 廖端芳 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2012年第1期12-15,共4页
目的探讨小鼠间充质干细胞(MSCs)脂向分化过程中miRNA-143(miR-143)的表达,为阐明MSCs脂向分化的调控机制提供新线索。方法采用全骨髓体外分离结合差速贴壁法纯化扩增C57BL/6小鼠MSCs,将第5代MSCs采用脂肪细胞分化诱导剂进行成脂诱导。... 目的探讨小鼠间充质干细胞(MSCs)脂向分化过程中miRNA-143(miR-143)的表达,为阐明MSCs脂向分化的调控机制提供新线索。方法采用全骨髓体外分离结合差速贴壁法纯化扩增C57BL/6小鼠MSCs,将第5代MSCs采用脂肪细胞分化诱导剂进行成脂诱导。运用miRNA芯片技术比较MSCs组和脂肪细胞组中miR-143的表达,并通过实时定量PCR技术验证。结果成功分离、纯化和培养MSCs;MSCs经脂肪诱导剂诱导后,胞内大量脂滴形成,油红O染色阳性。MiRNA芯片及实时定量PCR结果均表明miR-143在MSCs脂向分化过程中显著上调(3.73±0.42 vs 1.00±0.14,P<0.01)。结论 miR-143可能参与调控MSCs的脂向分化。 展开更多
关键词 miRNA-143 间充质干细胞 脂向分化 MIRNA芯片 实时定量PCR
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补肾方含药血清处理的大鼠成骨细胞miRNA差异表达 被引量:3
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作者 梁兴伦 潘欣 +11 位作者 曾思良 嵇承栋 周文锐 李琛 朱敏洁 刘传颂 周文博 许诚 钱淑雯 于德华 张韶伟 朱卫红 《安徽中医药大学学报》 2017年第4期71-75,共5页
目的筛选补肾方含药血清干预的大鼠成骨细胞中差异表达的miRNA,为补肾方治疗骨质疏松症提供可供选择的目标miRNA,以探讨其通过调控靶基因表达发挥治疗效应的机制。方法经细胞性状鉴定的原代大鼠成骨细胞用含药血清干预,采用miRNA芯片检... 目的筛选补肾方含药血清干预的大鼠成骨细胞中差异表达的miRNA,为补肾方治疗骨质疏松症提供可供选择的目标miRNA,以探讨其通过调控靶基因表达发挥治疗效应的机制。方法经细胞性状鉴定的原代大鼠成骨细胞用含药血清干预,采用miRNA芯片检测补肾方含药血清干预3d与干预1d的成骨细胞miRNA表达水平,并挑选差异表达2倍以上的miRNA进行定量PCR验证。结果培养的原代细胞具有典型的成骨细胞性状特征。与对照血清相比,补肾方含药血清干预3d的成骨细胞共有24个2倍以上表达差异的miRNA,其中上调的16个,下调的8个。差异表达2倍以上的miRNA定量PCR结果与芯片数据一致。结论补肾方通过成骨细胞中差异表达的miRNA调控靶基因改善骨质疏松症。 展开更多
关键词 MIRNA芯片 补肾方 成骨细胞 MIRNA 差异表达
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结直肠腺瘤复发患者外周血miRNAs表达差异研究 被引量:2
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作者 李清华 杨志文 +1 位作者 吴梅 徐萍 《胃肠病学》 2015年第11期672-675,共4页
背景:miRNAs是一类非编码小分子RNA,可在转录后水平调控基因表达,在肿瘤发生、发展中发挥重要作用。目的:以miRNA芯片筛选在结直肠腺瘤复发患者外周血中特异性表达的miRNAs,以期为复发预测提供敏感而特异的指标。方法:选取50例曾行结肠... 背景:miRNAs是一类非编码小分子RNA,可在转录后水平调控基因表达,在肿瘤发生、发展中发挥重要作用。目的:以miRNA芯片筛选在结直肠腺瘤复发患者外周血中特异性表达的miRNAs,以期为复发预测提供敏感而特异的指标。方法:选取50例曾行结肠镜下结直肠腺瘤摘除术的患者,于2012年8月—2013年9月复查结肠镜,从中选取结直肠腺瘤复发者和未复发者各4例,采集外周血标本,以miRNA芯片检测miRNAs表达谱并筛选复发组与未复发组间的差异表达miRNAs。以real-time PCR对部分差异表达miRNAs进行验证。结果:与未复发组相比,复发组共筛选出11个差异表达miRNAs,其中7个表达上调,分别为hp_hsa-miR-548ai、hsa-miR-4446-3p、hsa-miR-139-3p、hsa-miR-27a-5p、hsa-miR-10a、hsa-miR-23a、hsa-miR-486-3p,4个表达下调,分别为hsa-miR-124、hsa-miR-3613-5p、hsa-miR-495、hsa-miR-485-5p。其中7个miRNAs经real-time PCR验证,表达变化趋势与芯片检测结果相一致。结论:部分差异表达miRNAs可能参与了结直肠腺瘤的复发机制,为进一步探索复发预测指标提供了线索。 展开更多
关键词 结直肠腺瘤 复发 微RNAS 差异表达 微阵列分析
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大鼠成骨细胞微小RNAs的筛选研究 被引量:2
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作者 潘欣 曾思良 +6 位作者 梁兴伦 嵇承栋 周文博 周文锐 李琛 朱敏洁 沈琪 《转化医学杂志》 2017年第2期68-73,共6页
目的应用微小RNAs(microRNAs,miRNAs)芯片技术筛选补肾方含药血清干预大鼠成骨细胞后差异表达的miRNAs,与前期获得的软骨细胞差异miRNAs比较,筛选出共有差异miRNAs,以探讨补肾方通过共有miRNAs调控靶基因表达发挥治疗效应的机制。方法... 目的应用微小RNAs(microRNAs,miRNAs)芯片技术筛选补肾方含药血清干预大鼠成骨细胞后差异表达的miRNAs,与前期获得的软骨细胞差异miRNAs比较,筛选出共有差异miRNAs,以探讨补肾方通过共有miRNAs调控靶基因表达发挥治疗效应的机制。方法原代培养的大鼠成骨细胞经碱性磷酸酶染色、Ⅰ型胶原免疫荧光染色和矿化结节染色鉴定后,用补肾方含药血清干预成骨细胞,在给定时间点收获细胞,抽提纯化总RNAs行miRNAs芯片检测,并挑选差异表达4倍以上的miRNAs行实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应验证。结果所培养的原代细胞具有典型的成骨细胞形态和功能,碱性磷酸酶染色、Ⅰ型胶原免疫荧光染色和矿化结节染色均为阳性。与补肾方含药血清干预成骨细胞1 d相比,干预6 d的共有229个2倍以上表达差异的miRNAs,其中上调的52个、下调的177个。差异表达4倍以上的miRNAs实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应结果与芯片数据一致。与前期软骨细胞差异miRNAs芯片数据比较,miRNAs均上调2倍以上的有8个、下调4倍以上的2个。结论补肾方含药血清干预成骨细胞获得了一套较为特异的miRNAs,初步预测上调的miRNAs可能通过靶向Runx2、Wnt、Notch、Axin2等基因在骨发育、骨形态发生、骨吸收以及软骨内成骨形成等相关的信号通路中发挥作用。 展开更多
关键词 补肾方 成骨细胞 微小RNAs芯片 差异表达 大鼠
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miR-98-5p促进成骨细胞增殖和分化的可能及机制 被引量:4
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作者 郑峰 张富财 许喆 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2021年第26期4112-4117,共6页
背景:miRNA-98-5p可抑制高迁移率族AT HOOK蛋白2(high mobility group AT-HOOK 2,HMGA2)。磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B/糖原合成酶激酶3β(phosphatidylinositol 3-kinase/alkaline phosphatase/glycogen synthase kinase-3β,PI3K/AKT/... 背景:miRNA-98-5p可抑制高迁移率族AT HOOK蛋白2(high mobility group AT-HOOK 2,HMGA2)。磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B/糖原合成酶激酶3β(phosphatidylinositol 3-kinase/alkaline phosphatase/glycogen synthase kinase-3β,PI3K/AKT/GSK-3β)信号通路参与细胞增殖过程。骨折愈合过程中,miR-98-5p是否通过激活HMGA2作用于PI3K/Akt/GSK-3β通路来促进成骨细胞的增殖仍不清楚。目的:探讨miR-98-5p调控HMGA2和PI3K/AKT/GSK-3β通路促进成骨细胞增殖和分化的机制。方法:取MC3T3-E1细胞,通过Lipofectamine 2000分别转染miR-98-5p模拟物和HMGA2质粒到MC3T3-E1细胞,分别为miR-98-5p转染组和HMGA2过表达组;用二甲基亚砜处理的MC3T3-E1细胞及Scramblez乱序质粒转染至MC3T3-E1,分别为转染对照组和空白质粒组;采用脂质体瞬时转染miR-98-5p抑制剂,作为miR-98-5p抑制剂组;不做任何处理的MC3T3-E1细胞作为空白对照组。结果与结论:①空白对照组和转染对照组的HMGA2、PI3K/Akt/GSK-3β、碱性磷酸酶活性及mRNA水平差异无显著性意义,与转染对照组比,miR-98-5p转染组HMGA2和PI3K/Akt/GSK-3β蛋白表达、细胞分化、细胞增殖,碱性磷酸酶活性及mRNA均显著降低;②Targetscan7.1预测miR-98-5p与HMGA2相互作用结果显示,与转染对照组比,miR-98-5p转染组的HMGA2蛋白和mRNA均降低;与miR-98-5p转染组比,miR-98-5p抑制剂组的HMGA2蛋白和mRNA均增加;③空白对照组和空白质粒组的成骨细胞增殖、碱性磷酸酶活性及mRNA水平差异无显著性意义,与空白质粒组比,HMGA2过表达组的PI3K/Akt/GSK-3β表达、细胞分化程度、MC3T3-E1细胞增殖、碱性磷酸酶活性及mRNA水平均显著增加;④结果显示miR-98-5p可抑制MC3T3-E1细胞的HMGA2和PI3K/Akt/GSK-3β表达,同时抑制细胞的增殖和分化,HMGA2可能是miR-98-5p的直接作用靶点。 展开更多
关键词 成骨细胞 小微RNA98-5p HMGA2 磷脂酰肌醇3-激酶 蛋白激酶B 糖原合成酶激酶3Β 转染 MC3T3-E1细胞 增殖 分化
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应用基因芯片分析牙周膜干细胞向成骨细胞分化过程中miRNA表达谱的差异 被引量:3
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作者 吕红兵 《中国医学工程》 2014年第5期3-4,共2页
在人牙周膜干细胞(PDLSCs)成骨分化过程中,可以利用基因芯片技术,观察miRNA表达谱的变化,从而为人牙周膜干细胞成骨分化机制提供研究基础。本研究应用基因芯片来分析牙周膜干细胞向成骨细胞分化过程中miRNA表达谱的差异,对治疗牙周炎提... 在人牙周膜干细胞(PDLSCs)成骨分化过程中,可以利用基因芯片技术,观察miRNA表达谱的变化,从而为人牙周膜干细胞成骨分化机制提供研究基础。本研究应用基因芯片来分析牙周膜干细胞向成骨细胞分化过程中miRNA表达谱的差异,对治疗牙周炎提供了新的研究思路和方案。 展开更多
关键词 基因芯片 miRNA表达谱 牙周膜 干细胞 成骨 细胞分化
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