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From a mononuclear FeL_(2)complex to a Fe_(4)L_(4)molecular square:Designed assembly and spin-crossover property 被引量:2
1
作者 Zhuo Wang Li-Peng Zhou +2 位作者 Li-Xuan Cai Chong-Bin Tian Qing-Fu Sun 《Nano Research》 SCIE EI CAS CSCD 2021年第2期398-403,共6页
By introduction of a new Fe(L^(1))_(2)spin-crossover(SCO)unit into the polynuclear system,a nano-scale Fe4(L^(2))_(4)molecular square architecture is designed through coordination-directed self-assembly strategy.Both ... By introduction of a new Fe(L^(1))_(2)spin-crossover(SCO)unit into the polynuclear system,a nano-scale Fe4(L^(2))_(4)molecular square architecture is designed through coordination-directed self-assembly strategy.Both the mononuclear Fe(L^(1))_(2)and tetranuclear Fe4(L^(2))_(4)complexes have bee门structurally confirmed by 1H nuclear magnetic resonance(NMR),electrospray ionization time-of-flight mass spectrometry(ESI-TOF-MS),and temperature-dependent single crystal X-ray diffraction studies.Variable-temperature magnetic susceptibility measurements reveal the presence of an abrupt SCO behavior with a thermal hysteresis width of 4K for Fe(L^(1))_(2).By clear contrast,Fe4(L^(2))_(4)undergoes a gradual spin transition behavior with enlarged thermal hysteresis width and higher spin transition temperature. 展开更多
关键词 spin-crossover compound molecular square iron coordination-directed self-assembly supram olecular chem istry
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安徽省2008-2010年宋内氏志贺菌分子流行病学分析 被引量:8
2
作者 胡守奎 胡万富 +1 位作者 王敏 陈道利 《中华疾病控制杂志》 CAS 北大核心 2013年第11期959-962,共4页
目的对安徽省2008-2010年宋内氏志贺氏菌进行分子流行病学分析,为安徽省的菌痢检测和监测搭建分子平台。方法应用纸片扩散(kirby-bauer,K-B)法进行药物敏感试验;应用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)方法对20株宋内氏志... 目的对安徽省2008-2010年宋内氏志贺氏菌进行分子流行病学分析,为安徽省的菌痢检测和监测搭建分子平台。方法应用纸片扩散(kirby-bauer,K-B)法进行药物敏感试验;应用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)方法对20株宋内氏志贺氏菌进行基因分析;运用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)技术进行亲缘性分析。结果 20株宋内氏志贺菌对氟哌酸(ciprofloxacin,CIP)和先锋必(cefoperazone,CPZ)最为敏感,敏感率达100%;多重PCR结果显示除志贺毒素1(shiga toxin 1,SET1)为阴性外,其余三种基因:侵袭性质粒H抗原(invasion plasmid antigen H,ipaH)、志贺肠毒素2(shiga toxin 2,SET2)、志贺菌增殖和侵袭相关的毒力基因(invasion associated locus,ial)皆为阳性;20株菌用XbaⅠ酶切后经PFGE电泳后可分为6个主要型别。结论安徽省受试20株宋内氏志贺菌多重耐药现象严重且基因型高度一致;菌型呈多种型别并存的趋势,说明安徽省宋内氏菌的来源属于多克隆系。 展开更多
关键词 志贺菌 宋氏 流行病学 分子 电泳 凝胶 脉冲场
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绿色荧光蛋白分子标记在环境微生物学研究中的应用 被引量:4
3
作者 叶海仁 钟卫鸿 陈建孟 《环境污染与防治》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期353-355,共3页
绿色荧光蛋白 ( g reen fluorescent protein,GF P)分子标记是现有遗传标记中最简单方便的一种方法 ,GF P及 GF P突变体在微生物降解污染物、生物膜菌群构架、环境生态学和环境检测生物传感器等研究领域取得了很好的应用效果。
关键词 绿色荧光蛋白 环境微生物 分子标记 遗传标记 降解 污染物 生物膜 环境生态学 环境检测
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针刺对肥胖大鼠褐色脂肪组织产热作用的影响 被引量:18
4
作者 刘志诚 孙凤岷 +7 位作者 赵东红 张中成 孙志 徐斌 吴海涛 徐炳国 闫润虎 李朝军 《中国临床康复》 CAS CSCD 2003年第27期3665-3667,共3页
目的:探讨针刺对肥胖机体褐色脂肪组织(brownadiposetissue,BAT)解偶联蛋白1(uncouplingprotein1,UCP1)和肾上腺素能受体(β-adrenergicreceptor,β-AR)基因表达的作用。方法:采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)和RNA印迹试验(NorthernBlot... 目的:探讨针刺对肥胖机体褐色脂肪组织(brownadiposetissue,BAT)解偶联蛋白1(uncouplingprotein1,UCP1)和肾上腺素能受体(β-adrenergicreceptor,β-AR)基因表达的作用。方法:采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)和RNA印迹试验(NorthernBlot)测定UCP1和β-AR的基因表达水平,观察针刺治疗前后肥胖大鼠(SD大鼠,n=18)体质量、Lee's指数、体脂,BATUCP1和β-AR的基因表达变化。结果:肥胖大鼠体质量、Lee's指数、体脂均显著高于正常大鼠(t=7.51,9.15,8.20;P<0.01),而BATUCP1和β-AR的基因表达水平明显低于正常大鼠(RT-PCR分析:t=-5.66,-4.66;NorthernBlot分析:t=-4.25,-4.925;P均<0.01)。相关分析显示,肥胖指标与BATUCP1和β-AR的基因表达水平呈负相关(RT-PCR或NorthernBlot分析P<0.05~0.01)。针刺治疗取得良好减肥疗效同时,肥胖大鼠BATUCP1和β-AR的基因表达水平明显回升(RT-PCR分析:t=2.20,6.72;NorthernBlot分析:t=2.33,2.35;P均<0.05)。结论:BATUCP1和β-AR的基因表达异常低下可能是产生肥胖的重要因素之一。针刺促进肥胖机体BATUCP1和β-AR的基因表达可能是针刺减肥的细胞分子机制之一。 展开更多
关键词 针刺 肥胖 褐色脂肪组织 解偶联蛋白1 肾上腺素能受体 基因表达
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苯甲基化木材溶液相对分子质量及其分布 被引量:2
5
作者 程发 魏玉萍 +2 位作者 王东华 赵雪峰 张镜吾 《天津大学学报(自然科学与工程技术版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第5期635-638,共4页
以四氢呋喃为溶剂将苯甲基化木粉溶液化,并利用凝胶渗透色谱考察了不同溶液化条件对液化产品的分子量及分子量分布的影响.实验结果表明,木材经苯甲基化改性后,其溶解性能得到很大的提高.在该实验条件下,苯甲基化木材的增重率是影响液化... 以四氢呋喃为溶剂将苯甲基化木粉溶液化,并利用凝胶渗透色谱考察了不同溶液化条件对液化产品的分子量及分子量分布的影响.实验结果表明,木材经苯甲基化改性后,其溶解性能得到很大的提高.在该实验条件下,苯甲基化木材的增重率是影响液化产品分子量及分子量分布的主要因素,且增重为142.500的木粉,其液化产品分子量分布较窄;在此增重条件下,溶剂用量增大会导致液化产品分子量增大,分布变窄;催化剂的选择直接影响了苯甲基化木材的溶液化历程,相同用量时,盐酸作催化剂液化产品的分子量较低且分布较窄;溶液化时间对液化产品的分子量及其分布影响较小. 展开更多
关键词 苯甲基化木材 溶液化 相对分子质量 相对分子质量分布 溶解性能 四氢呋喃
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槲皮素在分子印迹聚合物修饰碳糊电极上的电化学行为及测定 被引量:3
6
作者 张旭红 周清 +1 位作者 翟海云 潘育方 《中国测试》 CAS 北大核心 2015年第11期50-54,共5页
建立分子印迹聚合物修饰碳糊电极测定药物中槲皮素含量的新方法。以槲皮素为模板分子,甲基丙烯酸为功能单体,偶氮二异丁腈为引发剂,乙二醇二甲基丙烯酸酯为交联剂,通过沉淀聚合法制得槲皮素分子印迹聚合物,以m(石墨+聚合物):m(石蜡)=4∶... 建立分子印迹聚合物修饰碳糊电极测定药物中槲皮素含量的新方法。以槲皮素为模板分子,甲基丙烯酸为功能单体,偶氮二异丁腈为引发剂,乙二醇二甲基丙烯酸酯为交联剂,通过沉淀聚合法制得槲皮素分子印迹聚合物,以m(石墨+聚合物):m(石蜡)=4∶1比例混合制成的印迹聚合物修饰碳糊电极作为工作电极。在0 V富集150 s,然后从0~0.6 V以100 m V/s扫速线性扫描,记录其在0.338 V的峰电流。槲皮素物质量浓度在1.25×10-6~4.0×10-5 mol/L与峰电流呈良好的线性关系(r=0.995 0),检出限为4.72×10-8mol/L,应用该方法测定胶囊中槲皮素的含量,测得回收率为96.7%~105.6%。该修饰电极具有较高的选择性和灵敏度,可用于槲皮素的测定。 展开更多
关键词 分子印迹聚合物 沉淀聚合 修饰电极 槲皮素 碳糊电极
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超高分子量聚乙烯的滑动磨损性能与机理研究 被引量:10
7
作者 王乙潜 樊瑞新 +1 位作者 黄立萍 郦剑 《材料科学与工程》 CSCD 1999年第3期35-39,共5页
用MM200型磨损试验机测试了超高分子量聚乙烯(ultrahighmolecularweightpolyethylene)的滑动磨损性能,考察了滑动速度与载荷对其磨损的影响,通过扫描电子显微镜对UHMWPE磨损表面... 用MM200型磨损试验机测试了超高分子量聚乙烯(ultrahighmolecularweightpolyethylene)的滑动磨损性能,考察了滑动速度与载荷对其磨损的影响,通过扫描电子显微镜对UHMWPE磨损表面形貌的观察,指出:在跑合期阶段,UHMWPE表面形成了一系列的脊;在严重磨损阶段,表面层发生了大范围的撕裂与断裂。 展开更多
关键词 超高分子量 聚乙烯 滑动磨损 磨损机理
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中国脑型疟患者恶性疟原虫分离株裂殖子表面蛋白MSP1第16—17区基因的分子克隆及序列分析 被引量:1
8
作者 边中启 管惟滨 +2 位作者 宋关鸿 王功焯 李方银 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1997年第2期69-75,共7页
目的 :为设计研制安全有效的人脑型疟疫苗提供进一步科学依据。方法 :应用多聚酶链反应 ( PCR)技术对中国 5例脑型疟患者恶性疟原虫云南省勐腊县勐罕 CMH/YN分离株和云南省盈江县农场 CYJ/YN分离株基因组 DNA裂殖子表面蛋白 1( MSP1)第... 目的 :为设计研制安全有效的人脑型疟疫苗提供进一步科学依据。方法 :应用多聚酶链反应 ( PCR)技术对中国 5例脑型疟患者恶性疟原虫云南省勐腊县勐罕 CMH/YN分离株和云南省盈江县农场 CYJ/YN分离株基因组 DNA裂殖子表面蛋白 1( MSP1)第 13— 17区基因进行扩增 ,将扩增产物分别经 Eco RI和 Kpn I双酶切后 ,回收的 MSP1第 16— 17区基因分子定向克隆M13mp18和 M13mp19载体 ,按 Sanger双脱氧链终止法进行 DNA序列测定 ,并与 MAD2 0、K1和Wellcome株原型基因进行同源性分析比较。结果 :发现脑型疟患者恶性疟原虫 CMH/YN和 CYJ/YN分离株 MSP1第 16— 17区基因之间的序列完全相同 ,全长为 918bp,编码 30 6个氨基酸 ,含 12个半胱氨酸组成的 2个表皮生长因子 ( EGF)单体结构域 ;除了在核苷酸第 4 869位缺失 1个碱基和散在分布 5个碱基点突变之外 ,与 MAD2 0、K1和 Wellcome株相应基因之间的核苷酸同源性分别为 98.6%、2 3.3%和 2 2 .8%。结论 :本研究在世界上首次报道脑型疟患者恶性疟原虫分离株MSP1第 16— 17区 DNA序列测定分析结果 ,确证该基因与 MAD2 0株高度同源性 ,并发现在1691— 170 1位氨基酸存在 TCTEEDSGSSR表位。 展开更多
关键词 疟疾 脑型疟患者 恶性 疟原虫 分子克卫生 疫苗
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分子遗传标记及其在动物育种中的应用(下) 被引量:11
9
作者 杜立新 《黄牛杂志》 1995年第3期50-52,共3页
分子遗传标记及其在动物育种中的应用(下)杜立新(山东农业大学动物科技学院泰安271018)3分子遗传标记在动物育种中的应用3.1遗传标记辅助选择近年来的研究结果表明,基因作为遗传功能单位不是完全随机地分布在染色体上,... 分子遗传标记及其在动物育种中的应用(下)杜立新(山东农业大学动物科技学院泰安271018)3分子遗传标记在动物育种中的应用3.1遗传标记辅助选择近年来的研究结果表明,基因作为遗传功能单位不是完全随机地分布在染色体上,而是具有相同或相关功能的基因往往组... 展开更多
关键词 动物 育种 分子遗传标记 应用 染色体
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人Vigilin基因5'端EcoRI片段的克隆及限制性酶切图谱分析 被引量:1
10
作者 曾星 Pl.,G 《同济医科大学学报》 CSCD 北大核心 1996年第1期1-4,共4页
为了解人基因组Vigilin基因结构和探讨Vigilin蛋白的功能,在人基因组Vigilin基因全长克隆的基础上,在5'端EcoRI片段亚克隆(Vig-CG5-7E),并从13个限制性核酸内切酶中选出6种对亚克隆DN... 为了解人基因组Vigilin基因结构和探讨Vigilin蛋白的功能,在人基因组Vigilin基因全长克隆的基础上,在5'端EcoRI片段亚克隆(Vig-CG5-7E),并从13个限制性核酸内切酶中选出6种对亚克隆DNA进行部分酶切和分子杂交,组建了克隆Vig-CG5-7EDNA的详细限制性酶切图谱,从而为克隆Vigilin基因的转录调控序列提供合适的酶切位点。 展开更多
关键词 Vigilin基因 基因结构 核酸限制内切酶 克隆
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含Teflon-AF层的NLO聚合物驻极体双层膜系统的电荷衰减动态特性
11
作者 陈钢进 夏钟福 +1 位作者 张冶文 张红焰 《应用科学学报》 CAS CSCD 1999年第4期379-383,共5页
采用开路热刺激放电法研究了恒压电晕充电极化的含Teflon-AF层的非线性光学聚合物驻极体双层膜系统的电荷动态特性,结合电光效应和表面电位衰减测量结果分析表明:双层膜系统中偶极分子有序取向稳定性明显优于单层非线性光学... 采用开路热刺激放电法研究了恒压电晕充电极化的含Teflon-AF层的非线性光学聚合物驻极体双层膜系统的电荷动态特性,结合电光效应和表面电位衰减测量结果分析表明:双层膜系统中偶极分子有序取向稳定性明显优于单层非线性光学聚合物驻极体,其原因在于Teflon-AF层中高储存稳定性的空间电荷有效地抑制了分子偶极驻极体层中偶极分子有序取向的松驰. 展开更多
关键词 非线性光学 分子偶极聚合物 驻极体 双层膜
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Construction of the Antisense Eukaryotic Vector for Proliferating Cell Nuclear Antigen Gene and Its Expression in Bladder Cancer EJ Cell Line
12
作者 童强松 曾甫清 +2 位作者 齐义鹏 朱朝晖 鲁功成 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2002年第4期327-330,共4页
To explore a novel strategy for antisense gene therapy of cancer,the coding sequence of hum an proliferating cell nuclear antigen(PCNA) c DNA was reversely inserted into the eukaryotic vector p L XSN by molecular cl... To explore a novel strategy for antisense gene therapy of cancer,the coding sequence of hum an proliferating cell nuclear antigen(PCNA) c DNA was reversely inserted into the eukaryotic vector p L XSN by molecular cloning techniques and transferred into bladder cancer EJcells with li- posome. The PCNA expression in transferred cells was dynamically detected by immunofluo- rescence and RT- PCR techniques. Changes of proliferation activities of cancer cells were assayed by MTT colorim etric and cloning formation m ethods.In the experiment,the antisense eukaryotic vector was successfully constructed and nam ed as p L APSN.After transfection with it for1- 7 days,PCNA protein and m RNA levels in cancer cells were blocked by16 .74 % - 84 .2 1% (P< 0 .0 5 ) and2 3.2 7% - 86 .15 % (P<0 .0 5 ) respectively.The proliferation activities of transferred cells were inhibited by 2 7.91% - 6 2 .0 7% (P<0 .0 1) ,with cloning formation abilities being de- creased by 5 0 .81% (P<0 .0 1) . Itwas concluded that the in vitro proliferation activities of cancer cells could be effectively inhibited by blocking PCNA expression with antisense technique,which could serve as an ideal strategy for gene therapy of bladder cancer. 展开更多
关键词 proliferating cell nuclear antigen antisense RNA m olecular cloning gene expression
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低分子肝素在经皮冠状动脉成形术中应用的临床观察
13
作者 赵晓峰 《中国现代药物应用》 2008年第4期13-14,共2页
目的探讨低分子肝素在经皮冠状动脉成形术(PCI)中应用的有效性和安全性。方法将2002年4月至2007年7月收治的共224例行PCI术的患者分为普通肝素组和低分子肝素组。普通肝素组103例,其中男78例,平均年龄65.6±10岁。低分子肝素组121例... 目的探讨低分子肝素在经皮冠状动脉成形术(PCI)中应用的有效性和安全性。方法将2002年4月至2007年7月收治的共224例行PCI术的患者分为普通肝素组和低分子肝素组。普通肝素组103例,其中男78例,平均年龄65.6±10岁。低分子肝素组121例,其中男92例,平均年龄(64±10)岁。结果两组的一般临床资料比较差异无显著性。两组手术成功率为98.4%和98%。7d内主要心血管事件各2例,急性血栓形成均0例,周围血管并发症8例与4例,两组比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论低分子肝素在PCI中的应用是有效的、安全的。 展开更多
关键词 肝素 低分子 血管成行术 经腔 经皮冠状动脉
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低分子肝素治疗不稳定型心绞痛41例临床观察
14
作者 颜程光 《实用临床医学(江西)》 CAS 2006年第9期38-39,共2页
目的:探讨低分子肝素治疗不稳定型心绞痛(UA)的临床疗效。方法:对41例不稳定型心绞痛病例,治疗前均常规治疗。在此基础上低分子肝索(体重≤60kg为5000U,体重〉60kg为7500U),12h1次皮下注射,连用7~14d,分别于用药前30min,... 目的:探讨低分子肝素治疗不稳定型心绞痛(UA)的临床疗效。方法:对41例不稳定型心绞痛病例,治疗前均常规治疗。在此基础上低分子肝索(体重≤60kg为5000U,体重〉60kg为7500U),12h1次皮下注射,连用7~14d,分别于用药前30min,用药后48h采血测定活化部分凝血活酶时间(APTT),凝血酶原时间(PT)。结果:显效9例,有效24例,总有效率80.5%。结论:低分子肝素具有高比例的抗因子Xa和抗因子Ⅱa活性,由于其分子量小,与血浆蛋白和内皮细胞结合减少。所以生物利用度高,血浆半衰期长。疗效可取得与肝素同样甚至更高抗凝血酶效果,并且有发生严重出血事件低的优点。 展开更多
关键词 低分子肝素 不稳定型心绞痛
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分子生物学创新实验教学模式的实践
15
作者 刘忠渊 李轶杰 《科技视界》 2015年第29期47-47,82,共2页
分子生物学是一门实践性很强的学科。分子生物学实验是理论和实践相结合的典型课程。本文通过基础性实验、综合性实验、创新设计性实验教学模式的改革与探索,提高了分子生物学实验教学质量,增强了学生学习的主动性与创新能力。
关键词 分子生物学实验 基础性实验 综合性实验 创新设计性实验
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驱油用高相对分子质量聚丙烯酰胺的制备 被引量:7
16
作者 张清林 张宝军 《化学工业与工程》 CAS 1999年第5期300-304,共5页
以丙烯酰胺和丙烯酸钠为原料,利用一种氧化还原引发体系,采用水溶液共聚法合成了高相对分子质量的聚丙烯酰胺。研究了反应温度、引发剂的添加量、单体总百分含量、单体配比及体系的p H值等因素对聚合物相对分子质量的影响,确定了... 以丙烯酰胺和丙烯酸钠为原料,利用一种氧化还原引发体系,采用水溶液共聚法合成了高相对分子质量的聚丙烯酰胺。研究了反应温度、引发剂的添加量、单体总百分含量、单体配比及体系的p H值等因素对聚合物相对分子质量的影响,确定了最佳的反应条件。 展开更多
关键词 驱油剂 化学驱油 相对分子质量 聚丙烯酰胺 制备 采油工艺
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线粒体抗病毒蛋白对先天免疫的影响 被引量:2
17
作者 倪才飞 黄蓓 钟辉 《生物技术通讯》 CAS 2008年第5期734-736,共3页
病毒感染启动宿主先天免疫反应是通过激活转录因子NF-κB和干扰素调节因子3(IRF-3),它们协同调控Ⅰ型干扰素的表达。病毒在复制过程中产生的复制中间体双链RNA作为一个病原相关分子模式,被细胞内具有RNA解旋酶活性的维甲酸诱导基因Ⅰ(RI... 病毒感染启动宿主先天免疫反应是通过激活转录因子NF-κB和干扰素调节因子3(IRF-3),它们协同调控Ⅰ型干扰素的表达。病毒在复制过程中产生的复制中间体双链RNA作为一个病原相关分子模式,被细胞内具有RNA解旋酶活性的维甲酸诱导基因Ⅰ(RIG-1)编码蛋白检测到。线粒体抗病毒蛋白(MAVS)作为一个接头蛋白,在RIG-1信号通路的下游和NF-κB、IRF-3信号通路的上游扮演着重要的角色。MAVS通过其疏水跨膜结构域定位在线粒体外膜上,是线粒体中发现的第一个与先天免疫相关的蛋白质,将线粒体和先天免疫联系在一起。 展开更多
关键词 线粒体抗病毒蛋白 先天免疫 维甲酸诱导基因Ⅰ 病原相关分子模武
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聚酰亚胺/聚N-乙烯吡咯烷酮分子复合物的合成和表征 被引量:1
18
作者 袁于民 吴美琰 《高分子学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1996年第4期480-485,共6页
由原位缩聚制备了刚性高分子聚酰亚胺(PI)和柔性基体聚N-乙烯吡咯烷附(PVP)的分子复合物,并由实验证明了中间体聚酰胺酸(PA)和聚乙烯吡咯烷酮大分子之间存在的酸一碱相互作用.这种相互作用促进了混容性,使聚酰亚胺能... 由原位缩聚制备了刚性高分子聚酰亚胺(PI)和柔性基体聚N-乙烯吡咯烷附(PVP)的分子复合物,并由实验证明了中间体聚酰胺酸(PA)和聚乙烯吡咯烷酮大分子之间存在的酸一碱相互作用.这种相互作用促进了混容性,使聚酰亚胺能以分子水平或接近分子水平分散在聚毗咯烷酮的基体之中.聚酰亚胺/聚N-乙烯吡咯烷团分子复合物的薄膜呈透明性,在整个组成范围内只有一个Tg,显示单相行为。当PI含量<20%时,SEM相片呈现均相形貌,看不到PI微晶.广角X-ray衍射图表明PI特征结晶峰消失,和无定形的PVP完全混容.当PI含量>40%,SEM显示有均匀分布的、棒状PI微晶存在.通过分子复合,即使PI含量为10%,聚N-乙烯吡咯烷酮不再溶于乙醇,耐热性也有提高. 展开更多
关键词 分子复合物 聚酰亚胺 混溶性 PVP
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分形理论及其在状态方程中的应用
19
作者 索小芳 马沛生 《化学工业与工程》 CAS 1999年第5期292-296,F003,共6页
本文介绍了基于分形结构的配位数、分子的平均势及由此推导出的基于硬球模型的状态方程( H S F T),同时介绍了 H S F
关键词 分形理论 状态方程 应用 配位数 平均势 纯物质 分子结构
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新隐式溶剂模型下的B型RNA模拟
20
作者 刘裕峰 龚海鹏 《生命科学仪器》 2014年第5期30-33,共4页
分子动力学模拟是研究包括RNA在内的生物大分子结构和功能的重要方法,但常规的显式溶剂模拟耗时较长,影响了其进一步应用。隐式溶剂模型通过用连续模型代替溶剂分子,能大大加速模拟速度,因此提高模拟效率。然而,现有的隐式溶剂模型都不... 分子动力学模拟是研究包括RNA在内的生物大分子结构和功能的重要方法,但常规的显式溶剂模拟耗时较长,影响了其进一步应用。隐式溶剂模型通过用连续模型代替溶剂分子,能大大加速模拟速度,因此提高模拟效率。然而,现有的隐式溶剂模型都不能很好地描述核酸分子,尤其是RNA。在之前的研究中(已接收),我们提出了一个新的隐式溶剂模型,并分别测试了A型RNA双螺旋、28S r RNA和t RNA等多个系统,验证了该模型可以更好地计算隐式溶剂下的静电相互作用。由于上述系统均以稳定的结构作为起始,因此没有采集到大的构象变化。在本文中,我们将采用B型RNA双螺旋(B-RNA)作为测试系统来验证该模型是否能正确地采集到大尺度的构象转变过程。初步结果表明,在我们的模型下,B-RNA不仅能够正确地采集A型RNA双链构象,而且其搜索速度也比相应的显式模型快。 展开更多
关键词 分子动力学模拟 B型RNA 隐式溶剂模型
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