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基于mt-nuDNA的西宁市北川河高原鳅系统发育关系
1
作者 杨增平 王正莉 +2 位作者 郭欣乐 李国珍 李国刚 《绿色科技》 2025年第24期13-18,共6页
本研究旨在通过分子标记技术,探讨西宁市北川河高原鳅的系统发育关系,以期为后续生态保护提供遗传学依据。高原鳅属鱼类是青藏高原水域的特有类群,由于地理隔离与生态适应,在不同区域可能已形成独特的遗传分化。以线粒体DNA(mtDNA,Cyt b... 本研究旨在通过分子标记技术,探讨西宁市北川河高原鳅的系统发育关系,以期为后续生态保护提供遗传学依据。高原鳅属鱼类是青藏高原水域的特有类群,由于地理隔离与生态适应,在不同区域可能已形成独特的遗传分化。以线粒体DNA(mtDNA,Cyt b、16S rRNA)和核基因(nuDNA,EGRZB、IRBP、myh6、RAG1、RH1)为分子标记展开分析,对mtDNA的两个片段进行BLAST在线同源性比对,随后构建系统发育树。结果显示,内类群中物种分成两大支:拟硬刺高原鳅(T.pseudoscleroptera)所在的一支和斯氏高原鳅(T.stoliczkai)聚为一支,两者又与东方高原鳅(T.orientalis)聚为一大支;另一支由粗壮高原鳅(T.robusta)与黄河高原鳅(T.pappenheimi)构成。nuDNA构建的系统发育树得到了与线粒体高度相似的结果:拟硬刺高原鳅与东方高原鳅聚为一支,二者再与斯氏高原鳅聚为一大支。单倍型网络连接图、ABGD划分及遗传距离分析均支持系统发育树。 展开更多
关键词 高原鳅属 北川河 MTDNA nudna
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人工繁育环境中长江鲟繁殖活动的环境DNA动态研究
2
作者 申晓雪 满李君 +3 位作者 刘青娟 李莎 刘焕章 俞丹 《水生生物学报》 北大核心 2026年第4期19-28,共10页
本研究基于线粒体DNA(mtDNA)和核基因DNA(nuDNA)的数字PCR技术,揭示了国家一级重点保护鱼类长江鲟(Acipenser dabryanus)在人工繁殖过程中的环境DNA动态变化规律。通过设计长江鲟特异性引物与TaqMan探针,采集不同繁殖阶段的环境DNA样品,... 本研究基于线粒体DNA(mtDNA)和核基因DNA(nuDNA)的数字PCR技术,揭示了国家一级重点保护鱼类长江鲟(Acipenser dabryanus)在人工繁殖过程中的环境DNA动态变化规律。通过设计长江鲟特异性引物与TaqMan探针,采集不同繁殖阶段的环境DNA样品,对mtDNA、nuDNA的数字PCR产物浓度及核质比(nuDNA/mtDNA)的变化进行了定量分析。结果表明,mtDNA和nuDNA浓度均在繁殖发生后快速达到峰值,其中雄鱼挤精后mtDNA浓度升至繁殖前水平的27倍,nuDNA浓度升至130倍;在雌鱼挤卵后,mtDNA和nuDNA浓度分别达到繁殖前水平的8和13倍。同样,雄、雌鱼池的核质比在挤精和挤卵后迅速升至峰值(0.14和0.09)。整体来说,雄、雌鱼池峰值时的mtDNA浓度分别为nuDNA的12与11倍,且可在繁殖结束后持续检出24—36h,稳定性与持久性更强;nuDNA则在繁殖行为发生后迅速达到峰值并于12h内快速衰减,对瞬时繁殖行为的敏感性更强。因此,环境DNA监测能够精准捕捉长江鲟繁殖活动的分子信号及变化过程,为揭示长江鲟等珍稀濒危鱼类的繁殖生态特征及非侵入式监测提供了重要技术支撑。 展开更多
关键词 环境DNA 繁殖 数字PCR MTDNA nudna 长江鲟
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