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广西南宁猪繁殖与呼吸综合征病毒流行毒株ORF5和NSP2基因的遗传变异分析 被引量：2
1
作者 李瑞雪 李承辉 +6 位作者 陈俭 李健 南世发 王瑛春 卢德章 肖书奇 殷玉鹏 《病毒学报》 北大核心 2025年第1期173-183,共11页
本文旨在监测广西南宁猪场猪繁殖与呼吸综合征病病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行情况。采集2022年广西壮族自治区南宁市4个不同规模化猪场的9322份血清样品、1348份睾丸液、402份精液样品、308... 本文旨在监测广西南宁猪场猪繁殖与呼吸综合征病病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行情况。采集2022年广西壮族自治区南宁市4个不同规模化猪场的9322份血清样品、1348份睾丸液、402份精液样品、3083份唾液样品和787份环境样品,使用qRT-PCR方法对样品中的病原进行检测,同时扩增PRRSV阳性样品的ORF5和NSP2基因;测序后利用DNAStar软件进行遗传进化分析、氨基酸序列比对分析,并对ORF5基因的N-糖基化位点进行预测。从PRRSV阳性样品中成功获得23条ORF5基因序列和18条NSP2基因序列,基于ORF5基因遗传进化分析属于PRRSV美洲型,其中NADC30-like毒株13株,NADC34-like毒株9株,VR2332-Like毒株1株。对ORF5氨基酸进行多序列比对显示,23株毒株无插入或缺失,但都存在位点突变。基于NSP2基因遗传进化分析显示为PRRSV美洲型,对NSP2氨基酸进行多序列比对显示,18株PRRSV存在1+19个氨基酸的缺失,与NADC30毒株NSP2氨基酸对应位置缺失模式一致。结果表明,该地区猪场主要流行NADC30-Like和NADC34-Like毒株,PRRSV不同流行毒株存在一定的遗传差异,本研究为广西PRRS防控和疫苗选用提供了科学依据。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸障碍综合征 ORF5 nsp2 遗传进化分析
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2022—2023年广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5和Nsp2基因的遗传变异分析 被引量：1
2
作者 彭家为 李康 +5 位作者 张歆明 吴寿堂 王爽云 刘燕玲 张乐宜 宋长绪 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2025年第4期86-94,102,共10页
为了初步了解我国广东省猪场中猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行特点和遗传变异情况,试验于2022年2月份——2023年10月份采集广东省11个地区(广州市、肇庆市、河源市、江门市... 为了初步了解我国广东省猪场中猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行特点和遗传变异情况,试验于2022年2月份——2023年10月份采集广东省11个地区(广州市、肇庆市、河源市、江门市、茂名市、云浮市、韶关市、清远市、珠海市、湛江市、汕头市)27家猪场共241份疑似患猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)病猪的肺脏组织和血液样本并采用RT-PCR方法进行PRRSV检测,根据检测结果选取不同地区猪场的10份阳性样本病毒核酸对ORF5和Nsp2基因进行测序及序列遗传变异分析。结果表明:241份肺脏组织和血液样本的总阳性率为21.99%;不同地区阳性率在9.90%~42.86%之间,其中阳性率最高的地区为广州市,最低的地区为云浮市;肺脏组织样本阳性率为14.28%,血液样本阳性率为24.32%。从基于PRRSV ORF5基因构建的遗传进化树中可见,选取的10株PRRSV毒株中有1株(GDZH)位于以JXA1和CH-1a为代表的Lineage8.7亚群分支上,有5株(GDJM、GDKP、GDHY、GDMM、GDST)位于以NADC30为代表的Lineage1亚群分支上,有4株(GDGZ、GDGZ-2、GDZJ、GDGY)位于Lineage3亚群分支上。选取的10株PRRSV毒株ORF5基因之间的核苷酸序列相似性为80.1%~99.3%,其中GDGZ、GDZJ、GDGY和GDGZ-2的ORF5基因与Lineage3亚群毒株QYYZ(登录号为JQ308798.1)的核苷酸序列相似性最高,分别为90.2%、89.4%、93.7%、90.0%;GDJM、GDKP、GDHY、GDST和GDMM的ORF5基因与Lineage1亚群毒株NADC30(登录号为MH500776.1)的核苷酸序列相似性最高,分别为91.0%、92.2%、90.8%、85.7%、91.7%,GDZH的ORF5基因与Lineage8.7亚群高致病性毒株JXA1(登录号为EF11244.5)的核苷酸序列相似性最高,为96.2%。从基于PRRSV Nsp2基因构建的遗传进化树中可见,选取的10株PRRSV毒株中有5株(GDZH、GDGZ、GDGZ-2、GDZJ、GDGY)位于以JXA1和CH-1a为代表的Lineage8.7亚群分支上,有5株(GDJM、GDHY、GDST、GDMM、GDKP)位于以NADC30为代表的Lineage1亚群分支上。选取的10株PRRSV毒株Nsp2基因之间的核苷酸序列相似性为31.6%~96.6%。其中GDZH、GDGZ、GDGZ-2、GDZJ和GDGY的Nsp2基因与Lineage8.7亚群高致病性毒株JXA1(登录号为EF11244.5)的核苷酸序列相似性最高,分别为97.1%、98.1%、96.8%、91.3%、94.2%,GDJM、GDKP、GDST、GDMM、GDHY的Nsp2基因与Lineage1亚群毒株NADC30(登录号为MH500776.1)的核苷酸序列相似性最高,分别为67.6%、83.6%、82.2%、82.8%、80.3%。说明广东省猪场中流行的PRRSV毒株呈现多样性,Lineage3、Lineage1和Lineage8.7为主要流行的亚群。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5基因 nsp2基因 遗传变异 广东省
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2021-2024年我国猪繁殖与呼吸综合征病毒NSP2基因的遗传变异分析
3
作者 翁成桢 黄欣欣 +6 位作者 李鸿喜 章蓓雯 唐歆 曹翀 谢旭 陈洪博 李晓冰 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2025年第8期68-75,共8页
为了解我国流行的猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)基因型谱系及遗传变异情况,试验对NCBI数据库中2021—2024年来自我国的224条PRRSV NSP2基因序列进行比对和修剪,通过构建系统发育... 为了解我国流行的猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)基因型谱系及遗传变异情况,试验对NCBI数据库中2021—2024年来自我国的224条PRRSV NSP2基因序列进行比对和修剪,通过构建系统发育树分析我国流行的PRRSV毒株基因型谱系,并进行遗传距离、遗传进化、基因选择压力及基因重组分析。结果表明:我国流行的PRRSV毒株基因型主要为美洲型(基因Ⅱ型),占比为96.9%;其他为欧洲型(基因Ⅰ型),占比为3.1%。其中基因Ⅰ型毒株均属于谱系subtypeⅠ;基因Ⅱ型毒株属于4个谱系(L1、L3、L5和L8),占比由高到低依次为L1(66.1%)、L8(25.4%)、L5(4.9%)和L3(0.4%)。PRRSV基因Ⅰ型谱系subtypeⅠNSP2基因的核苷酸和氨基酸遗传距离分别为0.278和0.359;基因Ⅱ型谱系L1 NSP2基因的核苷酸和氨基酸遗传距离分别为0.200和0.293,谱系L5 NSP2基因的核苷酸和氨基酸遗传距离分别为0.003和0.004,谱系L8 NSP2基因的核苷酸和氨基酸遗传距离分别为0.082和0.124。PRRSV基因Ⅰ型谱系subtypeⅠ与基因Ⅱ型谱系L1、L5和L8 NSP2基因的核苷酸遗传距离分别为0.629,0.642和0.655;基因Ⅱ型谱系L1与L5、L8 NSP2基因的核苷酸遗传距离分别为0.324和0.372,谱系L5与L8 NSP2基因的核苷酸遗传距离为0.240。PRRSV基因Ⅰ型谱系subtypeⅠ与基因Ⅱ型谱系L1、L5和L8 NSP2基因的氨基酸遗传距离分别为0.804,0.810,0.839;基因Ⅱ型谱系L1与L5、L8 NSP2基因的氨基酸遗传距离分别为0.446和0.490,谱系L5与L8 NSP2基因的氨基酸遗传距离为0.316。PRRSV基因Ⅰ型谱系subtypeⅠ与基因Ⅱ型谱系L1、L5和L8 NSP2基因的分离位点数量分别为170,210,3和166,单体型多样性分别为0.998,0.691,0.979和0.952,平均差异位点数分别为76.286,45.015,0.945和20.869,核苷酸多态性分别为0.326,0.192,0.004和0.089。4个谱系间的同义替换率和基因流量化指标分别为3.365和0.171,且不同谱系间均差异显著(P<0.05);群体间遗传分化系数为0.688;基因流为0.110。PRRSV基因Ⅰ型谱系subtypeⅠ与基因Ⅱ型谱系L1、L5和L8 NSP2基因的非同义突变与同义突变比值(dN/dS)分别为0.362,0.540,0.387,0.426,均受负向选择压力。224条PRRSV NSP2基因序列共发生12次重组事件,均为基因Ⅱ型NSP2基因内重组,其中基因Ⅱ型谱系L1内重组事件6件,谱系L8内重组事件2件,谱系L1、L8间重组事件4件。说明我国流行的PRRSV毒株以基因Ⅱ型谱系L1和L8为主,基因Ⅰ型谱系subtypeⅠ和基因Ⅱ型谱系L1较基因Ⅱ型谱系L3、L5和L8遗传变异程度更高,基因Ⅱ型谱系L1更易发生基因重组。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 nsp2基因 遗传变异 核苷酸多样性 基因重组
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羊轮状病毒GS2023株NSP2基因克隆及序列分析
4
作者 于頔浠 赵登率 +7 位作者 张远航 李平 王天宇 张克山 高寒 覃丽梅 赵孟孟 李家奎 《畜牧与兽医》 北大核心 2025年第4期121-129,共9页
为研究羊轮状病毒NSP2蛋白的结构和功能,以羊轮状病毒GS2023株cDNA为模板对NSP2基因进行PCR扩增与克隆,并利用多种生物信息学分析预测软件分析NSP2的生物信息学特征。结果:NSP2基因的开放阅读框长度为954 bp,编码317个氨基酸;NSP2属于... 为研究羊轮状病毒NSP2蛋白的结构和功能,以羊轮状病毒GS2023株cDNA为模板对NSP2基因进行PCR扩增与克隆,并利用多种生物信息学分析预测软件分析NSP2的生物信息学特征。结果:NSP2基因的开放阅读框长度为954 bp,编码317个氨基酸;NSP2属于亲水性、稳定蛋白,不存在信号肽;亚细胞定位预测表明其主要定位于细胞质和细胞核中,属于非跨膜蛋白;该蛋白含有36个糖基化位点以及49个磷酸化位点;二级结构由α螺旋结构、延伸链和无规则卷曲构成,三级结构则呈自身首尾相连结构;NSP2蛋白与国内外轮状病毒株的氨基酸相似性为90.2%~98.7%;GS2023株与国内牛源轮状病毒株SCMY1和SCMY2氨基酸对比发现在第38位由赖氨酸突变为精氨酸,与国内多种羊源毒株和牛源毒株氨基酸对比发现在第100、202位分别由丝氨酸突变为天冬酰胺、由缬氨酸突变为异亮氨酸;系统发育进化树分析结果显示,GS2023株与国内牛源轮状病毒株遗传距离最近,与其他羊源轮状病毒遗传距离较远。本研究成功克隆羊轮状病毒NSP2基因并分析NSP2蛋白的生物学特征,为进一步研究NSP2蛋白的结构和功能提供理论参考。 展开更多
关键词 羊 轮状病毒 nsp2 序列分析 系统发育进化分析
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猪繁殖与呼吸综合征病毒NSP2基因研究进展 被引量：2
5
作者 张航 沙惠阳 +1 位作者 黄良宗 赵孟孟 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第1期214-221,共8页
猪繁殖与呼吸综合征是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)引起的一种烈性传染病。PRRSV的非结构蛋白2(NSP2)编码一个多功能蛋白,具有广泛生物学作用。本文对NSP2遗传变异分析,与自身病毒蛋白互作,与宿主蛋白互作,影响PRRSV复制、毒力、细... 猪繁殖与呼吸综合征是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)引起的一种烈性传染病。PRRSV的非结构蛋白2(NSP2)编码一个多功能蛋白,具有广泛生物学作用。本文对NSP2遗传变异分析,与自身病毒蛋白互作,与宿主蛋白互作,影响PRRSV复制、毒力、细胞噬性,调节宿主免疫以及在疫苗应用等相关研究进行综述,为深入研究PRRSV致病机理和疫苗设计提供重要理论基础。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 nsp2基因 致病机理 疫苗研究
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猪繁殖与呼吸综合征病毒Nsp2基因及其编码蛋白的研究进展 被引量：2
6
作者 李莲 陈希文 周杰珑 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第8期59-62,共4页
猪繁殖与呼吸综合征病毒（ Porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV）主要引起母猪繁殖障碍和仔猪呼吸道障碍，给世界养猪业造成了重大的经济损失。PRRSV的变异性极大，而整个基因组中变异最大的部分就是Nsp2区域... 猪繁殖与呼吸综合征病毒（ Porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV）主要引起母猪繁殖障碍和仔猪呼吸道障碍，给世界养猪业造成了重大的经济损失。PRRSV的变异性极大，而整个基因组中变异最大的部分就是Nsp2区域，即使是在同一亚型的毒株中其核苷酸同源性也仅为78％～88％。其编码的Nsp2蛋白是一个多功青甚蛋白，不仅能促进病毒的复制，而且还可以降低I型干扰素产生及抑制信号转导通路。另外，Nsp2蛋白还可以作为发展标记疫苗和弱毒疫苗的潜在靶基因。现将Nsp2的这些特性作一简要综述，以期为进一步阐明PRRSV的致病机理和免疫特性等提供重要的理论基础。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) 变异 nsp2基因 nsp2蛋白 病毒复制 疫苗
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高致病性PRRSV的分离及其Nsp2和ORF5基因的序列分析 被引量：29
7
作者 马静云 李浩波 +4 位作者 王玲玲 何晓明 王连想 谢青梅 毕英佐 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期650-657,共8页
从广东省不同地区疑似高致病性猪生殖与呼吸综合征病料中分离出能引起Marc-145细胞病变的病毒，经RT-PCR检测，确定分离物中存在美洲型猪生殖与呼吸综合征病毒（PRRSV），将此细胞病毒液命名为GDBl，用其感染回归5头40日龄健康仔猪，采... 从广东省不同地区疑似高致病性猪生殖与呼吸综合征病料中分离出能引起Marc-145细胞病变的病毒，经RT-PCR检测，确定分离物中存在美洲型猪生殖与呼吸综合征病毒（PRRSV），将此细胞病毒液命名为GDBl，用其感染回归5头40日龄健康仔猪，采集发病及死亡猪组织，重新用Marc-145细胞进行病毒分离，将再次分离到的病毒命名为GDB1F。对GDB1、GDBIF的Nsp2、ORF5基因序列进行测定分析。结果表明，单独感染猪2／2发病死亡，同居感染的3头猪全部发病，2头死亡；感染后2～4d所有感染猪均出现体温升高。死亡猪表现为严重的出血性、间质性肺炎，肢体远端皮表出血。序列分析结果表明，GDB1和GDB1F株的Nsp2基因与国内高致病性PRRSV分离株JXA1、HN2Nsp2、HNXT1、HNyz、HUB2、HUN1的同源性很高，达98．4％～99．0％。GDB1和GDB1F株的ORF5基因存在部分突变，没有缺失，与国内高致病性PRRSV分离株JXA1、HUB2、JX0612、GDZC1的同源性高达97．5％～99．8％。 展开更多
关键词 高致病性猪生殖与呼吸综合征病毒 分离 nsp2基因 ORF5基因 序列分析
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高致病性猪蓝耳病病毒GS/LZh/07株的分离、鉴定及其非结构蛋白Nsp2基因特性分析 被引量：19
8
作者 吴锦艳 田宏 +9 位作者 尚佑军 刘湘涛 郑海学 靳野 尹双辉 满自萍 赵娜 蔡承茹 蔺芳 谢庆阁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期438-443,共6页
将高致病性猪蓝耳病疑似病料接种Marc145细胞,发现该病料可使Marc145细胞产生CPE,应用猪蓝耳病病原检测试剂盒从细胞培养物中检测到PRRSV,命名为Gs/Lzh/07株。同时应用RT-PCR方法扩增该分离毒株的非结构蛋白Nsp2基因,并进行了序列测定,... 将高致病性猪蓝耳病疑似病料接种Marc145细胞,发现该病料可使Marc145细胞产生CPE,应用猪蓝耳病病原检测试剂盒从细胞培养物中检测到PRRSV,命名为Gs/Lzh/07株。同时应用RT-PCR方法扩增该分离毒株的非结构蛋白Nsp2基因,并进行了序列测定,发现所扩增到的Nsp2基因有90个核苷酸的缺失。序列比对结果表明:该分离病毒Nsp2基因与经典毒株PRRSV-ch-1a核苷酸同源性为83.0%,氨基酸同源性为72.7%;与高致病性变异毒株NX和SD核苷酸同源性为95.5%,氨基酸同源性为90.9%,可见该毒来源于2006-2007年流行毒株,说明高致病性猪蓝耳病变异病毒已经在甘肃省存在。该毒株的成功分离为高致病性猪蓝耳病流行病学调查分析提供数据,也为预防控制该病积累了资料。Nsp2的特性分析为揭示高致病性猪蓝耳病PRRSV在甘肃省的流行特点提供参考。 展开更多
关键词 高致病性猪蓝耳病病毒 分离 鉴定 nsp2 特性分析
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中国部分地区2005-2007年猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株ORF5基因和Nsp2基因遗传变异分析 被引量：15
9
作者 薛青红 张彦明 +4 位作者 刘湘涛 郎洪武 邹敏 高金源 邓永 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期1805-1812,共8页
【目的】为分析2005-2007年间中国部分省区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特征,了解其遗传演化规律,查明中国目前PRRSV流行毒株现状。【方法】应用病毒分离方法从中国4个省份在2005-2007年间采集的81份疑似蓝耳病... 【目的】为分析2005-2007年间中国部分省区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特征,了解其遗传演化规律,查明中国目前PRRSV流行毒株现状。【方法】应用病毒分离方法从中国4个省份在2005-2007年间采集的81份疑似蓝耳病病料中分离到36株猪繁殖与呼吸综合征病毒,应用RT-PCR方法对36株PRRSV现地分离株的ORF5基因和Nsp2基因进行扩增和序列分析。【结果】36株现地分离株均属于美洲型PRRSV,ORF5基因全长均为603bp,未发现有基因缺失或插入,编码约200个氨基酸,分离株推导氨基酸序列变异主要发生在9～39位;36个分离株中有15株PRRSVNsp2基因全长为2940bp,21株PRRSVNsp2基因全长为2850bp;发生Nsp2缺失的PRRSV在Nsp2基因第481位、532～560位发生了不连续缺失,共缺失30个氨基酸。与GeneBank中收录的14个PRRSVORF5、Nsp2基因进行核苷酸及氨基酸序列比较和分析,系统进化关系显示,除B02-2005株可能与疫苗株有关外,多数现地分离株与Ch-1a株遗传距离较近,不同年份分离到的毒株与早期PRRSV分离株的同源性逐年降低。【结论】根据氨基酸变异情况对PRRSV现地分离株进行亚群聚类分析,发现36株现地分离株分别归属于以VR-2332为代表的4亚群,以BJ-4为代表的1亚群和以Ch-1a为代表的2亚群。进化关系表明PRRSVORF5、Nsp2基因及其推导的氨基酸序列均发生了较大变异,不同地区PRRSV分离株的遗传关系存在交叉现象,地域特征不明显。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 病毒分离 ORF5基因 nsp2基因 遗传变异
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猪生殖与呼吸综合征病毒HN／XT／07株的分离鉴定及其Nsp2基因的特性分析 被引量：11
10
作者 吴锦艳 田宏 +7 位作者 尚佑军 郑海学 靳野 尹双辉 赵娜 满自萍 刘湘涛 谢庆阁 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1033-1037,共5页
从湖南湘潭某发病猪场分离到1株病毒,该病毒可使Marc-145细胞产生CPE,应用猪生殖与呼吸综合征病毒检测试剂盒从感染细胞培养物中检测到猪生殖与呼吸综合征病毒,并将该分离毒株命名为HN/XT/07。采用RT-PCR方法扩增该分离毒株的Nsp2基因,... 从湖南湘潭某发病猪场分离到1株病毒,该病毒可使Marc-145细胞产生CPE,应用猪生殖与呼吸综合征病毒检测试剂盒从感染细胞培养物中检测到猪生殖与呼吸综合征病毒,并将该分离毒株命名为HN/XT/07。采用RT-PCR方法扩增该分离毒株的Nsp2基因,并进行序列测定,发现在2932～3031 bp之间不连续缺失了87个核苷酸。序列比对结果显示,该分离毒Nsp2基因与PRRSV经典毒株Ch-1a的核苷酸同源性为85.5%,氨基酸同源性为80.1%;与2006～2007年流行的PRRSV高致病性变异毒株NX和SD的核苷酸同源性为95.3%～96.4%,氨基酸同源性为90.9%～95.6%。 展开更多
关键词 猪生殖与呼吸综合征病毒 分离 鉴定 nsp2基因 特性分析
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PRRSV SC-GY变异株Nsp2、ORF5、ORF3基因遗传变异分析 被引量：9
11
作者 陈希文 李莲 +6 位作者 尹苗 赖守勋 汪谦 罗文涛 叶兆美 王雄清 周杰珑 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1433-1441,共9页
为了监测PRRSV流行毒株的基因变异情况,采用RT-PCR方法对四川省广元市某疑似猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)发病猪场病料进行分子鉴定,获得1株PRRSV命名为SC-GY株,并对SC-GY株的Nsp2、ORF5及ORF3基因进行测序比对和系统进化树构建。结... 为了监测PRRSV流行毒株的基因变异情况,采用RT-PCR方法对四川省广元市某疑似猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)发病猪场病料进行分子鉴定,获得1株PRRSV命名为SC-GY株,并对SC-GY株的Nsp2、ORF5及ORF3基因进行测序比对和系统进化树构建。结果表明,SC-GY株为Nsp2基因发生30个氨基酸不连续缺失、ORF3基因第17位插入1个丝氨酸(S)的美洲型高致病性PRRSV变异毒株,其Nsp2、ORF5、ORF3基因与VR2332、SC2012、CH-1a、JXA1、HUN4、NADC30、HENAN-XINX等国内外代表毒株的核苷酸同源性分别为70.3%~97.9%,82.4%~97.6%,83.1%~98.2%,编码氨基酸同源性分别为62.3%~96.3%,78.0%~95.7%,81.6%~96.5%;而与LV等欧洲型毒株的核苷酸同源性分别为18.9%,60.8%,63.7%,编码氨基酸同源性分别为14.0%,54.9%,57.2%。基因遗传进化树分析表明,SC-GY株与JXA1、TJ、HUN4等前期分离的毒株以及近期在四川周边分离的SC2012、SCwhn09CD、SCwhn14DY等毒株都相距较远。由此表明,该地区PRRSV在当前高频度活疫苗免疫下,流行毒株基因仍在不断变异,猪场应减少PRRSV活疫苗的免疫并加强对临床PRRSV流行毒株的监测。 展开更多
关键词 PRRSV nsp2 ORF5 ORF3 遗传变异
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PRRSV山西株ORF5和Nsp2基因序列分析 被引量：8
12
作者 姚敬明 刘文俊 +7 位作者 罗甜甜 吴忻 王娟萍 孟帆 韩一超 樊振华 米瑞娟 詹海杰 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期1-5,共5页
采用RT-PCR方法对2009—2011年山西省分离的5株猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV）的ORF5和Nsp2（2503～3269nt）基因进行克隆和测序，并对其基因序列和推导的氨基酸序列与国内外毒... 采用RT-PCR方法对2009—2011年山西省分离的5株猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV）的ORF5和Nsp2（2503～3269nt）基因进行克隆和测序，并对其基因序列和推导的氨基酸序列与国内外毒株进行了同源性分析。序列分析结果显示，5株分离株Nsp2基因与国内分离的PRRSV变异株（JXA1、HuN、HUN4、HUB1）的序列同源性最高，为96．8％～98．2％，且缺失位置一致，均存在2个位点30个氨基酸缺失；ORF5基因大小为603bp，编码200个氨基酸，第13、151位均为具有强毒特性的精氨酸（R），137位为丝氨酸（S），表明这5株均为野毒株，与国内分离的PRRSV变异株（JXA1、HuN、HUN4、HUB1）毒株的序列同源性最高，为96．5％～98．0％。结果表明，山西省内目前流行的PRRSV为Nsp2缺失30个氨基酸的变异毒株。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5基因 nsp2基因 变异分析
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猪繁殖与呼吸综合征病毒nsp2基因缺失株RT-PCR检测方法的建立 被引量：6
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作者 李玉峰 王先炜 +2 位作者 陈闻 姜平 许家荣 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期169-171,共3页
为了快速检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)nsp2基因缺失流行株,在对不同PRRSV分离株nsp2基因核苷酸序列分析的基础上,设计了针对nsp2基因的1对兼并PCR引物和1条基因特异性反转录引物。RT-PCR试验结果表明,经典PRRSVS1毒株和高致病性n... 为了快速检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)nsp2基因缺失流行株,在对不同PRRSV分离株nsp2基因核苷酸序列分析的基础上,设计了针对nsp2基因的1对兼并PCR引物和1条基因特异性反转录引物。RT-PCR试验结果表明,经典PRRSVS1毒株和高致病性nsp2缺失株SY0608毒株的PCR扩增片段的大小分别为768 bp和678 bp。特异性试验和敏感性试验证明,该检测方法特异性较好,但敏感性相对较低,可用于快速鉴别诊断PRRSVnsp2基因缺失毒株和经典PRRSV毒株。 展开更多
关键词 PRRSV nsp2基因 RT—PCR 基因缺失
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福建地区PRRSV分离株Nsp2基因新变异序列鉴定 被引量：5
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作者 刘建奎 魏春华 +4 位作者 杨小燕 戴爱玲 李晓华 潘秀珍 危美康 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期271-275,共5页
为了解福建省2009年以来猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行株的现状、分子生物学特征和遗传演化规律,本研究收集了福建省不同地区的14株PRRSV分离株,并对其Nsp2基因进行遗传变异分析。结果表明与参考病毒株VR-2332相比共有4种类型氨基... 为了解福建省2009年以来猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行株的现状、分子生物学特征和遗传演化规律,本研究收集了福建省不同地区的14株PRRSV分离株,并对其Nsp2基因进行遗传变异分析。结果表明与参考病毒株VR-2332相比共有4种类型氨基酸的缺失和1种类型的氨基酸插入,3株分离株在472位～520位和533位～561位发生了不连续的78个氨基酸缺失;2株分离株472位～520位、533位～561位和593位～595位发生了不连续的81个氨基酸缺失;1株分离株在593位～595位发生了3个氨基酸的缺失;其余8个分离株的Nsp2蛋白存在第481位和533位～561位共30个氨基酸的不连续缺失,其中有1个分离株在599位～603位插入了5个氨基酸,同时又在481位和533位～561位发生了不连续的30个氨基酸的缺失,这是国内首次发现有氨基酸插入的病毒株。这些新的缺失和插入与PRRSV致病性及其与生物学特性的关系有待于进一步研究。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 nsp2基因 遗传变异 缺失 插入
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高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒Nsp2缺失变异株与经典美洲型毒株基因芯片鉴别方法的建立 被引量：8
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作者 郭焕成 席进 +1 位作者 李江南 涂长春 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2010年第11期1254-1259,共6页
目的建立高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)Nsp2缺失变异株与经典美洲型毒株基因芯片鉴别方法。方法根据高致病性PRRSV Nsp2缺失变异株与经典美洲型毒株(非缺失株)的核苷酸序... 目的建立高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)Nsp2缺失变异株与经典美洲型毒株基因芯片鉴别方法。方法根据高致病性PRRSV Nsp2缺失变异株与经典美洲型毒株(非缺失株)的核苷酸序列,设计扩增美洲型PRRSV保守序列和包含基因缺失区域的Nsp2基因片段的二重PCR引物,并设计长度为31～35nt的美洲型毒株通用寡核苷酸探针和非缺失株相对于变异株Nsp2基因缺失区域的探针,建立寡核苷酸芯片方法。检测该方法的特异性和灵敏度,并进行初步应用。结果通过杂交模式可清楚地区分经典毒株与缺失毒株;芯片探针与猪瘟病毒(Clas-sical swine fever virus,CSFV)、猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type2,PCV2)、猪伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)样品无非特异性杂交;芯片法与常规PCR法的灵敏度相近;对12份疑似高致病性PRRS猪病料的检测结果与常规PCR法一致。结论建立的芯片方法能够准确鉴别高致病性PRRSV Nsp2缺失变异株,可用于高致病性PRRSV的临床诊断和流行病学调查。 展开更多
关键词 高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒 经典美洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒 nsp2缺失变异株 寡核苷酸芯片 诊断 鉴别
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A组人轮状病毒NSP2基因的克隆、表达及免疫学性质研究(英文) 被引量：5
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作者 范耀春 文喻玲 +2 位作者 尹兴晓 李传印 陈元鼎 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期17-23,共7页
轮状病毒非结构蛋白NSP2在病毒基因组复制过程中起重要作用。在原核系统中重组表达了来自中国的第一株全基因组被克隆和研究了的轮状病毒NSP2,并进一步对其免疫学性质进行了研究。结果显示,在大肠杆菌中能够高效表达重组NSP2蛋白,而且... 轮状病毒非结构蛋白NSP2在病毒基因组复制过程中起重要作用。在原核系统中重组表达了来自中国的第一株全基因组被克隆和研究了的轮状病毒NSP2,并进一步对其免疫学性质进行了研究。结果显示,在大肠杆菌中能够高效表达重组NSP2蛋白,而且该蛋白能够诱发豚鼠产生特异性抗体。Western blot和免疫荧光检测表明所得抗体不仅能与该重组NSP2蛋白发生特异性反应,而且可以与轮状病毒SA11株或Wa株感染的MA104细胞中表达的NSP2发生反应。以上这些结果为进一步研究该重组NSP2蛋白的结构。 展开更多
关键词 轮状病毒 nsp2 重组表达 免疫学性质
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猪生殖与呼吸综合征病毒NM1株的分离鉴定及其Nsp2基因的序列分析 被引量：4
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作者 李真光 冷雪 +2 位作者 齐巧玲 温永俊 武华 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期293-297,共5页
从内蒙古某猪场患高热症病猪病料中分离到1株病毒,该病毒能在Marc-145细胞上增殖,产生细胞病变。经RT-PCR法鉴定证明,该病毒为美洲型PRRSV,将其命名为NM1。应用设计的特异性引物扩增NM1株的Nsp2基因,并与国内外PRRSV分离株的Nsp2基因序... 从内蒙古某猪场患高热症病猪病料中分离到1株病毒,该病毒能在Marc-145细胞上增殖,产生细胞病变。经RT-PCR法鉴定证明,该病毒为美洲型PRRSV,将其命名为NM1。应用设计的特异性引物扩增NM1株的Nsp2基因,并与国内外PRRSV分离株的Nsp2基因序列进行了比较。结果表明,NM1株Nsp2基因推导的氨基酸序列出现30个不连续的缺失,与PRRSV高致病性毒株HuN4、HuB2、JXA1的核苷酸序列同源性分别为99.1%、99.0%和98.9%。动物回归试验结果显示,人工感染的5头仔猪全部发病,其中3头死亡,说明NM1株为发生变异的PRRSV,其致病力有所增强。 展开更多
关键词 猪生殖与呼吸综合征病毒 分离与鉴定 nsp2基因 序列分析 致病性
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2006—2012年鲁豫冀地区15株猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及ORF5/Nsp2基因的遗传变异分析 被引量：6
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作者 唐娜 管宇 +10 位作者 魏凤 王金良 曲光刚 肖跃强 李峰 谢金文 张松林 张倩 于新友 沈志强 柳增善 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第10期26-32,共7页
为研究鲁豫冀地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的遗传变异情况,对2006—2012年来自3省区发病猪场的42份样品进行PRRSV分离鉴定,并进行了生物学特性研究和PCR鉴定,结果显示先后... 为研究鲁豫冀地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的遗传变异情况,对2006—2012年来自3省区发病猪场的42份样品进行PRRSV分离鉴定,并进行了生物学特性研究和PCR鉴定,结果显示先后分离到15株PRRSV。分别采用RT-PCR扩增其ORF5基因和部分Nsp2基因并测序,与GenBank中68个ORF5序列和40个Nsp2序列的推导氨基酸序列进行比对,遗传变异分析结果表明,15株分离株均属于美洲型毒株,其中13个毒株Nsp2基因推导的氨基酸序列均存在氨基酸的不连续缺失,其ORF5基因推导的氨基酸序列与JXA1株有较高的同源性(95.5%～97.5%);SDDY2007株与疫苗株RespPRRS MLV和VR2332株亲缘关系相近,处于同一个亚群中;而HN25-2009分离株Nsp2基因推导的氨基酸序列有30个氨基酸的特征性缺失,其ORF5基因推导的氨基酸序列的遗传进化分析结果显示该分离株处于VR2332所在亚群(氨基酸同源性97.5%),具有一定特殊性。本试验结果表明,2006—2012年高致病性PRRSV是鲁豫冀地区的优势流行毒株,且存在疫苗毒株,3省区流行毒株间有一定遗传差异,但无明显地域特征。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 分离 遗传变异 ORF5基因 nsp2基因
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高致病性PRRSV Nsp2变异株Power SYBR Green real time RT-PCR检测方法的建立 被引量：4
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作者 郭杨 陈世界 +3 位作者 林华 郭万柱 徐志文 颜其贵 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期410-415,共6页
根据高致病性猪生殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）Nsp2变异株Nsp2基因保守区的核苷酸序列设计合成了1对引物,建立了Power SYBR Green模式的实时荧光定量RT-PCR方法,用于检测高致病性PRRSV Nsp2变异株。以pMD-Nsp2质粒为阳性对照制作标准曲... 根据高致病性猪生殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）Nsp2变异株Nsp2基因保守区的核苷酸序列设计合成了1对引物,建立了Power SYBR Green模式的实时荧光定量RT-PCR方法,用于检测高致病性PRRSV Nsp2变异株。以pMD-Nsp2质粒为阳性对照制作标准曲线,并对该方法的特异性、敏感性、重复性进行评价。结果显示,该方法只能检测到高致病性PRRSV Nsp2变异株的特异性扩增信号;检测线性范围广,在模板浓度为3.15×10^9-3.15×10^0copies/μL具有良好的线性关系,相关系数（r^2）为0.998;最低检测限为3.15copies/μL。对25份疑似高致病性PRRS猪病料的检测结果显示,该方法与病毒分离的符合率为100%。表明,建立的Nsp2-Power SYBR Green RT-PCR方法具有良好的特异性、敏感性和重复性。 展开更多
关键词 高致病性PRRSV nsp2变异株 POWER SYBR Green实时荧光反转录聚合酶链式反应
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新疆猪繁殖与呼吸综合征病毒分离鉴定及其Nsp2和ORF5基因遗传变异分析 被引量：5
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作者 张美玲 陆桂丽 +3 位作者 薛晶 刘丽雅 简子健 夏俊 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第17期106-110,2,共5页
为探索新疆猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的变异特征,利用RT-PCR、ORF5和部分NSP2基因序列进行分析,鉴定从新疆某猪场疑似猪高热病死亡猪肺脏分离出的一株病毒.分离的病毒株被鉴定为PRRSV美洲型,命名为XJ-Q株.该株病毒与香港分离株H... 为探索新疆猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的变异特征,利用RT-PCR、ORF5和部分NSP2基因序列进行分析,鉴定从新疆某猪场疑似猪高热病死亡猪肺脏分离出的一株病毒.分离的病毒株被鉴定为PRRSV美洲型,命名为XJ-Q株.该株病毒与香港分离株HK13亲缘关系最近,与国内变异株（HUB1和JXA1）同源性较为亲近.与美洲型标准毒株VR-2332相比,该分离株在481位和532～560位共有30个氨基酸缺失;与国内分离的PRRSV变异株相比,在487～489位有3个氨基酸的独特缺失.结果表明,新疆分离株为PRRSV美洲型,属于新缺失的PRRSV毒株. 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸道综合征病毒(PRRS) ORF5基因 nsp2基因 序列分析
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