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基于SYBR GreenⅡ的BVDV NS3基因实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用 被引量:2
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作者 李阳 张世勋 +4 位作者 赫鸣睿 刘珊珊 岳山 刘宇 朱战波 《黑龙江八一农垦大学学报》 2025年第2期23-31,共9页
为了建立基于SYBR GreenⅡ的牛病毒性腹泻病毒(BVDV)NS3基因实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测方法,设计并筛选了BVDV NS3基因的qRT-PCR引物,建立了BVDV NS3 qRT-PCR检测方法,并利用CFX96和猪警-2000 qRT-PCR仪检测了临床牛血清样本。结果显... 为了建立基于SYBR GreenⅡ的牛病毒性腹泻病毒(BVDV)NS3基因实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测方法,设计并筛选了BVDV NS3基因的qRT-PCR引物,建立了BVDV NS3 qRT-PCR检测方法,并利用CFX96和猪警-2000 qRT-PCR仪检测了临床牛血清样本。结果显示,筛选出1对特异性好的引物,CFX96和猪警-2000 qRT-PCR的标准品最小检出值分别为1×10^(1)copies·μL^(-1)和1×10^(2) copies·μL^(-1),特异性和重复性均良好,且临床血清样本的检测结果准确、一致。研究为BVDV检测提供了技术手段。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 ns3基因 实时荧光定量PCR SYBR GreenⅡ
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生物信息学和分子对接分析HuNoVs非结构蛋白NS3
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作者 王道 肖亚梅 刘丹 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第1期85-95,共11页
为了深入探究人类诺如病毒(Human noroviruses,HuNoVs)的NS3非结构蛋白的结构特征和小分子药物,运用多种生物信息学方法ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0、NCBI Conserved Domains、SOPMA、SWISS-MODEL、YinOYang 1.2、Net... 为了深入探究人类诺如病毒(Human noroviruses,HuNoVs)的NS3非结构蛋白的结构特征和小分子药物,运用多种生物信息学方法ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0、NCBI Conserved Domains、SOPMA、SWISS-MODEL、YinOYang 1.2、NetPhos 3.1、ABCpred、SYFPEITHI、Prankweb和Discovery Studio等预测NS3蛋白的同源性、理化性质、翻译后修饰位点、二级/三级结构、B/T细胞抗原表位、活性口袋位点及抑制化合物。HuNoVs的NS3蛋白是由363个氨基酸组成的稳定亲水性蛋白,相对分子量为39748.79 Da,理论等电点为6.37;NS3蛋白与其他病毒解旋酶序列相似性为32.52%,无信号肽和跨膜结构,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,具有2个功能结构域,38个O-糖基化位点和21个磷酸化位点,7个B-细胞抗原表位和19个T-细胞抗原表位;还存在6个活性口袋位置和5个潜在的小分子抑制化合物。本文为阐明人类诺如病毒非结构蛋白NS3的结构和在病毒性肠胃炎中的作用机制提供了理论依据,也为研发和筛选新疫苗和药物奠定了基础。 展开更多
关键词 人类诺如病毒 非结构蛋白ns3 生物信息学 分子对接
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稳定表达猪瘟病毒NS3-NS4A和NS3^(pro)-NS4A蛋白巨噬细胞系的构建及蛋白质组学分析
3
作者 郑晓茹 王一丹 +6 位作者 张丽红 杨莹莹 赵欣如 李敏 黄娟 张乔亚 曹志 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第11期5839-5851,共13页
本研究旨在通过构建稳定表达的猪瘟病毒(classical swine fever virus, CSFV)NS3-NS4A和NS3^(pro)-NS4A蛋白巨噬细胞系,以期更好地探索宿主天然免疫与CSFV的相互作用关系。利用琼脂糖凝胶电泳、连接与转化和提取质粒等方法对重组表达载... 本研究旨在通过构建稳定表达的猪瘟病毒(classical swine fever virus, CSFV)NS3-NS4A和NS3^(pro)-NS4A蛋白巨噬细胞系,以期更好地探索宿主天然免疫与CSFV的相互作用关系。利用琼脂糖凝胶电泳、连接与转化和提取质粒等方法对重组表达载体进行构建,将构建好的pCMV-CBH-GFP-2A-Puro-CSFV NS3^(pro)-NS4A、pCMV-CBH-GFP-2A-Puro-CSFV NS3-NS4A和pCMV-CBH-GFP-2A-Puro重组表达载体分别感染HEK-293T细胞包装出慢病毒。然后利用包装成功的慢病毒感染猪肺泡巨噬细胞(3D4/21),对感染细胞进行单克隆筛选得到稳定转染细胞系,最后用Western blot方法验证稳定细胞系蛋白表达。对其进行蛋白组学分析,筛选出MAPK、PI3K通路的相互作用蛋白,并进行功能分析,利用Western blot检测CDK4、CDC37、CASP3、IKBKG、NFκB1蛋白表达量。结果表明,经MegAlign分析构建的过表达CSFV非结构蛋白NS3-NS4A以及NS3^(pro)-NS4A慢病毒载体氨基酸序列全部正确,无移码;重组表达载体感染293T细胞24 h后,感染效率可达90%以上,慢病毒包装成功;Western blot分析成功获得稳定表达CSFV NS3-NS4A、NS3^(pro)-NS4A巨噬细胞系;通过蛋白组学分析,筛选出NS3-NS4A/mock组中MAPK与PI3K通路中上调蛋白11个,下调蛋白24个;经Western blot检测CSFV NS3-NS4A显著降低了MAPK通路中CASP3、NFκB1、IKBKG的表达,PI3K通路中CDK4、CDC37的表达。本研究成功构建了稳定表达NS3-NS4A、NS3^(pro)-NS4A蛋白的3D4/21细胞系,并对蛋白组学筛选的关键蛋白进行功能分析,为研究CSFV NS3-NS4A调控宿主天然免疫应答的机制提供物质基础。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 ns3-NS4A ns3^(pro)-NS4A 猪肺泡巨噬细胞 稳定表达
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牛病毒性腹泻病毒1c型NS3解旋酶结构域蛋白原核表达及间接ELISA的建立
4
作者 吴玉湖 王进千 +3 位作者 高明阳 安乐乐 张丽娟 刘俊林 《畜牧与兽医》 北大核心 2025年第11期89-97,共9页
旨在建立NS3解旋酶结构域蛋白间接ELISA检测方法,为牛病毒性腹泻病毒(BVDV)血清学检测提供简便高效的方法。PCR扩增获得编码NS3解旋酶结构域基因,构建原核表达载体pET28a-BVDV1c-NS3-H;1mmol/LIPTG25℃诱导表达目的蛋白后,采用Ni-NTA亲... 旨在建立NS3解旋酶结构域蛋白间接ELISA检测方法,为牛病毒性腹泻病毒(BVDV)血清学检测提供简便高效的方法。PCR扩增获得编码NS3解旋酶结构域基因,构建原核表达载体pET28a-BVDV1c-NS3-H;1mmol/LIPTG25℃诱导表达目的蛋白后,采用Ni-NTA亲和层析纯化目的蛋白并通过Westernblot验证其与阳性血清的特异性反应;之后采用纯化的NS3解旋酶结构域蛋白建立间接ELISA方法,进行了特异性、敏感性和重复性检验,并对不同地区的288份临床牛血清样品进行了检测,与IDEXX公司BVDV抗原试剂盒检测结果进行比较,确定符合率。结果:成功表达并纯化出NS3解旋结构域并证实其具有反应原性;ELISA优化结果表明,NS3解旋酶结构域蛋白最佳抗原包被浓度为125μg/mL,最佳包被液为1×TBST,最佳血清稀释浓度比为1∶10,最佳酶标二抗稀释浓度比为1∶10000;阴阳性结果判定值OD_(450nm)为008787;该抗原与小反刍兽疫病毒阳性血清、口蹄疫病毒阳性血清、牛传染性鼻气管炎阳性血清均不发生交叉性反应,敏感性高达1∶12800,批次内与批次间的变异系数均小于10%,并且对不同来源的牛血清样品进行检测,其符合率为8574%。结论:本研究建立的NS3解旋酶结构域蛋白的间接ELISA方法可用于BVDV抗体检测并为BVD诊断奠定了基础。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 ns3解旋结构域蛋白 抗原表位 原核表达 ELISA
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鸭坦布苏病毒非结构蛋白NS1和NS3诱导Neuro-2a细胞不完全自噬的研究
5
作者 陈星宇 姜雅倩 +2 位作者 宋春丽 宋臣阳 王晴 《病毒学报》 北大核心 2025年第3期845-855,共11页
本研究在鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus, DTMUV)诱导小鼠神经母细胞瘤细胞(Neuro-2a)不完全自噬促进病毒复制的基础上,鉴定诱导Neuro-2a细胞自噬的病毒蛋白,探究病毒非结构蛋白NS1、NS3在诱导Neuro-2a细胞不完全自噬中的作用。用载体... 本研究在鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus, DTMUV)诱导小鼠神经母细胞瘤细胞(Neuro-2a)不完全自噬促进病毒复制的基础上,鉴定诱导Neuro-2a细胞自噬的病毒蛋白,探究病毒非结构蛋白NS1、NS3在诱导Neuro-2a细胞不完全自噬中的作用。用载体pCMV14-Flag构建DTMUV十个编码蛋白基因的真核表达质粒,分别将其转染至Neuro-2a细胞,Western blot检测病毒蛋白和自噬标志性蛋白的表达,明确诱导Neuro-2a细胞自噬的病毒蛋白,并通过透射电镜、激光共聚焦、Western blot等方法进一步验证以上病毒蛋白在诱导Neuro-2a细胞不完全自噬中的作用。结果显示,本研究成功构建了DTMUV十个编码蛋白基因的真核表达质粒,且能够在Neuro-2a细胞中正常表达;非结构蛋白NS1和NS3能显著增加LC3-Ⅱ和P62蛋白水平,促进Neuro-2a细胞中自噬体形成,诱导Neuro-2a细胞发生不完全自噬,且NS1和NS3蛋白诱导的Neuro-2a细胞不完全自噬具有剂量和时间依赖性。综上所述,本研究证实DTMUV非结构蛋白NS1、NS3是诱导Neuro-2a细胞不完全自噬的关键蛋白,为进一步研究DTMUV的致病机制奠定基础。 展开更多
关键词 鸭坦布苏病毒 非结构蛋白NS1 非结构蛋白ns3 Neuro-2a细胞 不完全自噬
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环状病毒属非结构蛋白NS3/NS3a的研究进展
6
作者 齐瑛琳 周栋 +2 位作者 黄颖然 郗灿坤 尹鑫 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第8期875-884,共10页
环状病毒属(Orbivirus)属于呼肠孤病毒科(Reovir⁃idae),其成员包括蓝舌病病毒(Bluetongue virus,BTV)、非洲马瘟病毒(African horse sickness virus,AHSV)、流行性出血病病毒(Epizootic hemorrhagic disease virus,EHDV)等,主要通过库... 环状病毒属(Orbivirus)属于呼肠孤病毒科(Reovir⁃idae),其成员包括蓝舌病病毒(Bluetongue virus,BTV)、非洲马瘟病毒(African horse sickness virus,AHSV)、流行性出血病病毒(Epizootic hemorrhagic disease virus,EHDV)等,主要通过库蠓、伊蚊等媒介昆虫传播。BTV和EHDV主要感染反刍动物(牛、羊、鹿等),诱发严重疾病甚至死亡,并可致孕畜流产、死产、畸形胎^([1-2]);BTV已被鉴定出存在36个血清型(BTV-1~BTV-36)^([3]),EHDV包含9个血清型(EHDV-1、EHDV-2、EHDV-4~EHDV-10)^([4]);中国内地地区尚未暴发蓝舌病(BT)和流行性出血病疫情,但国内反刍动物群体及媒介昆虫体内BTV和EHDV感染率较高,并已陆续分离到多种不同血清型的病毒株^([5-9])。 展开更多
关键词 蓝舌病病毒 非结构蛋白ns3ns3a 环状病毒属 非洲马瘟病毒
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Eltrombopag,an FDA-approved drug,inhibits dengue virus type 2 by targeting NS2B-NS3 protease
7
作者 Xuerui Zhu Xiao Gao +8 位作者 Yan Wu Jia Lu Xinlan Chen Chenshu Zhao Haoyu Li Zhongfa Zhang Shuwen Liu Gengfu Xiao Xiaoyan Pan 《Virologica Sinica》 2025年第3期439-450,共12页
Dengue viruses(DENV)have spread throughout the world and pose a huge threat to human life.The most widespread serotype is type 2 DENV(DENV 2),which has no specific treatment.NS2B-NS3 protease plays a pivotal role in D... Dengue viruses(DENV)have spread throughout the world and pose a huge threat to human life.The most widespread serotype is type 2 DENV(DENV 2),which has no specific treatment.NS2B-NS3 protease plays a pivotal role in DENV replication because of its function in cleavage of the viral polyprotein;thus,it is considered a promising target for antiviral discovery.In this study,we developed a high-throughput screening system based on the NS2B-NS3 protease to identify candidates from an FDA-approved drug library.Eltrombopag was screened out of 3273 drugs,and demonstrated inhibition on DENV 2 at the micromolar level in vitro,significantly reducing viral loads in the targeted organs of challenged mice following intraperitoneal injection.Further mechanistic analysis showed that eltrombopag allosterically binds to the DENV 2 NS2B-NS3 protease in a reversible,noncompetitive manner,therefore inhibiting DENV 2 at the post-infection stage.In addition,eltrombopag inhibited the NS2B-NS3 proteases of DENV 4 and Zika virus,suggesting its potential as a broadspectrum antiviral agent.This study repurposed eltrombopag as a promising antiviral agent against DENV,providing an alternative for antiviral development against flaviviruses. 展开更多
关键词 Dengue virus type 2(DENV 2) Antiviral agent NS2B-ns3 protease ELTROMBOPAG Allosteric inhibitor
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鄂木斯克出血热病毒NS2B-NS3蛋白酶药物筛选体系的建立及抑制剂筛选
8
作者 陈雅丽 封守琴 +2 位作者 杨海涛 王泽方 肖云杰 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期986-995,共10页
鄂木斯克出血热病毒(Omsk hemorrhagic fever virus,OHFV)是一种蜱传黄病毒,主要分布在俄罗斯西伯利亚地区,通过蜱虫叮咬、接触感染物等途径感染人类。感染后症状包括头痛、咳嗽、发烧并伴有出血。目前尚无针对该病毒的特效药物。鄂木... 鄂木斯克出血热病毒(Omsk hemorrhagic fever virus,OHFV)是一种蜱传黄病毒,主要分布在俄罗斯西伯利亚地区,通过蜱虫叮咬、接触感染物等途径感染人类。感染后症状包括头痛、咳嗽、发烧并伴有出血。目前尚无针对该病毒的特效药物。鄂木斯克出血热病毒基因组经翻译后形成多聚蛋白,其中NS3蛋白酶可将多聚蛋白切割从而发挥其各自在病毒复制周期中的作用。NS2B的亲水区可以作为NS3蛋白酶的辅因子维持其水解活性,在该病毒的生命周期中发挥着不可或缺的作用。该文旨在以NS2B-NS3蛋白酶为靶点开发有效抑制鄂木斯克出血热的小分子抑制剂。选用大肠杆菌表达系统表达鄂木斯克出血热病毒NS2B-NS3蛋白酶,以获得纯度高且性质均一的蛋白。同时建立药物筛选体系,开展抑制剂筛选。最终建立的药物筛选体系为20 mmol/L Tris,20%甘油,pH 8.5,蛋白终浓度为2μmol/L,底物终浓度为100μmol/L。利用该体系进行抑制剂筛选,筛选出对OHFV NS2B-NS3蛋白酶抑制率高达99%的化合物吡啶硫酮锌,并对该抑制剂进行了IC50的测定和抑制剂类型的判定,其为可逆抑制剂。吡啶硫酮锌有望成为抗鄂木斯克出血热病毒的先导化合物,为针对该病毒今后的药物开发提供研究基础。 展开更多
关键词 鄂木斯克出血热 黄病毒 NS2B-ns3蛋白酶 蛋白酶抑制剂
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猪瘟病毒NS3丝氨酸蛋白酶功能区基因的克隆及其在大肠杆菌中的高效表达 被引量:1
9
作者 周鹏程 陈建国 丁明孝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期330-337,共8页
用RT PCR方法扩增分别获得了中国猪瘟病毒强毒石门株和兔化弱毒株非结构蛋白NS3丝氨酸蛋白酶功能区 [即NS3 (ΔC) ]基因cDNA ,将之克隆到 pGEMT载体测定其核苷酸序列 ,并推导出其对应氨基酸序列 ,结果表明这两个毒株间的NS3 (ΔC)区基... 用RT PCR方法扩增分别获得了中国猪瘟病毒强毒石门株和兔化弱毒株非结构蛋白NS3丝氨酸蛋白酶功能区 [即NS3 (ΔC) ]基因cDNA ,将之克隆到 pGEMT载体测定其核苷酸序列 ,并推导出其对应氨基酸序列 ,结果表明这两个毒株间的NS3 (ΔC)区基因核苷酸序列同源性为95 8% ,氨基酸序列同源性为 99% ,有 2个残基的差异 ;两毒株与一些猪瘟病毒以及同属的牛病毒性腹泻病病毒代表毒株的对应序列进行比较 ,所测核苷酸序列及推导的氨基酸序列均极为保守 ,而且氨基酸序列分析结果还表明 ,瘟病毒NS3 (ΔC)序列也含有与其它黄病毒同样保守的由His,Asp和Ser残基构成的胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶催化三分体 ,三分体中Ser为丝氨酸蛋白酶催化活性关键氨基酸残基 ;将上述NS3 (ΔC)基因亚克隆至原核表达载体pET 2 8a中 ,并在E .coli中获得高效表达 ,将表达产物纯化并免疫小鼠 ,间接免疫荧光和Westernblot结果表明制备了针对NS3(ΔC)蛋白的多克隆抗体。上述实验结果为继续深入研究非结构蛋白NS3在猪瘟病毒的复制及病毒与宿主细胞相互关系中的作用 。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 非结构蛋白ns3 ns3丝氨酸蛋白酶功能区 基因克隆 基因表达
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丙型肝炎病毒NS3蛋白生物学功能研究进展 被引量:1
10
作者 王志鹏 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期1006-1007,共2页
关键词 丙型肝炎病毒 功能研究进展 ns3蛋白 非结构蛋白ns3 慢性丙型肝炎 HCV复制 生物学功能 生命健康 持续感染 肝细胞癌 宿主细胞 研究热点 进展综述 微生物 肝硬化
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丙型肝炎病毒非结构蛋白 NS3反式激活研究进展
11
作者 荣义辉 纪冬 赵军 《传染病信息》 2005年第4期170-171,共2页
丙型肝炎病毒非结构区3(HCV NS3)基因位于HCV基因组非结构区3420-5312核苷酸区段.HCV NS3具有多种潜在生物学功能,如蛋白酶、解旋酶活性,介导细胞免疫反应、反式激活端粒酶、调节p53活性及参与蛋白激酶A和STAT信号转导等[1,2],从而影响... 丙型肝炎病毒非结构区3(HCV NS3)基因位于HCV基因组非结构区3420-5312核苷酸区段.HCV NS3具有多种潜在生物学功能,如蛋白酶、解旋酶活性,介导细胞免疫反应、反式激活端粒酶、调节p53活性及参与蛋白激酶A和STAT信号转导等[1,2],从而影响宿主细胞功能,导致细胞增生、凋亡,甚至癌变.对于NS3蛋白反式激活作用研究,可为进一步研究HCV致病(癌)的分子生物学机制和探索新的丙型肝炎治疗技术提供帮助. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 反式激活作用 非结构蛋白ns3 HCV基因组 分子生物学机制 细胞免疫反应 非结构区 生物学功能 蛋白激酶A ns3蛋白
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丙型肝炎病毒非结构蛋白NS3与乙型肝炎病毒X蛋白协同反式激活作用的研究 被引量:15
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作者 刘妍 成军 +5 位作者 牟劲松 陆荫英 王建军 杨倩 王琳 张玲霞 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期47-49,共3页
构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白 3(NS3)的重组表达质粒pcDNA3 1(- ) NS3和表达乙型肝炎病毒 (HBV)X蛋白的重组质粒pcDNA3 1(- ) X ,分别瞬时转染肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞 ,用免疫印记 (Westernblotting)方法鉴定病毒基因的表达。... 构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白 3(NS3)的重组表达质粒pcDNA3 1(- ) NS3和表达乙型肝炎病毒 (HBV)X蛋白的重组质粒pcDNA3 1(- ) X ,分别瞬时转染肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞 ,用免疫印记 (Westernblotting)方法鉴定病毒基因的表达。两个表达质粒分别及同时与报告质粒pCAT3 promoter共转染HepG2细胞 ,检测报告基因氯霉素乙酰转移酶 (CAT)的表达水平 ,酶的活性反映了表达的肝炎病毒蛋白对SV4 0病毒早期启动子功能的影响。结果显示 ,两个重组表达载体pcDNA3 1(- ) NS3及pcDNA3 1(- ) X在HepG2细胞均能瞬时表达相应的肝炎病毒蛋白 ;单独共转染实验中 pcDNA3 1(- ) NS3、pcDNA3 1(- ) X组的CAT的表达分别是对照的 3 5倍和 4 4倍 ,两种质粒共同转染时酶的表达是对照的 8 5倍 ;表达质粒对CAT酶表达的激活作用呈剂量依赖性。研究表明 ,HepG2细胞中表达的HCVNS3蛋白和HBVX蛋白均具有反式激活SV4 0早期启动子的功能 ,并且两种蛋白的反式激活功能具有协同特性。本实验有助于解释HCV、HBV感染 ,尤其是共同感染的致病 (癌 ) 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构蛋白 ns3 乙型肝炎病毒 X蛋白 协同反式激活 研究
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酵母双杂交技术筛选克隆丙型肝炎病毒NS3结合蛋白基因 被引量:15
13
作者 李克 王琳 +4 位作者 成军 陆荫英 洪源 刘妍 张玲霞 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期31-33,共3页
为克隆与丙型肝炎病毒 (HCV)NS3蛋白结合的肝细胞中的蛋白基因 ,采用酵母双杂交系统Ⅲ技术进行筛选。构建HCVNS3蛋白诱饵酵母质粒 ,转化酵母AH10 9后与含文库质粒的酵母Y187进行配合 ,在营养缺陷培养基上进行双杂交筛选。选择既能在 4... 为克隆与丙型肝炎病毒 (HCV)NS3蛋白结合的肝细胞中的蛋白基因 ,采用酵母双杂交系统Ⅲ技术进行筛选。构建HCVNS3蛋白诱饵酵母质粒 ,转化酵母AH10 9后与含文库质粒的酵母Y187进行配合 ,在营养缺陷培养基上进行双杂交筛选。选择既能在 4重营养缺陷培养基(SD/ Trp Leu Ade His)上生长 ,又能在涂有X α 半乳糖(X α gal)的四缺培养平皿上生长的蓝色菌落 ,提取此酵母克隆的质粒 ,转化大肠杆菌后进行测序 ,并进行生物信息学分析。分析的结果显示 ,筛选出 19个阳性克隆 ,包括已知功能基因 17个 ,还有 1个克隆的测序结果与GenBank中的 1个未知功能序列有 4 4 %的同源性 ,初步证明了此基因与HCVNS3有结合活性。说明成功克隆了HCVNS3蛋白结合蛋白基因 ,为以后研究此基因在HCV致病机制以及在肝细胞中的生理功能提供了线索。 展开更多
关键词 酵母双杂交技术 筛选 克隆 丙型肝炎病毒 ns3结合蛋白基因
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猪瘟病毒NS3基因克隆、原核表达及间接ELISA方法初步建立 被引量:11
14
作者 蒋大良 余兴龙 +6 位作者 李润成 葛猛 罗维 颜爱 李杰 刘春红 涂长春 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期78-84,共7页
采用PCR方法从携带猪瘟病毒兔化弱毒(Hog cholera lapinized virus,HCLV)全长基因组cDNA的质粒pPOHCLV中扩增到长度为2000bp左右NS3基因序列,并将其克隆至原核表达载体pET-32a(+),构建成重组原核表达载体pETNS3。将pETNS3在大肠杆菌Rose... 采用PCR方法从携带猪瘟病毒兔化弱毒(Hog cholera lapinized virus,HCLV)全长基因组cDNA的质粒pPOHCLV中扩增到长度为2000bp左右NS3基因序列,并将其克隆至原核表达载体pET-32a(+),构建成重组原核表达载体pETNS3。将pETNS3在大肠杆菌Rosetta(DE3)中进行优化表达,SDS-PAGE分析重组蛋白NS3主要以包涵体形式表达,分子大小约95kD。Western Blotting分析表明重组蛋白NS3具有免疫原性。采用Ni+亲和层析方法纯化得到重组蛋白NS3(90%)。以纯化的重组蛋白NS3为抗原初步建立了检测CSFVNS3抗体的间接ELISA方法,检测221份不同猪群和年龄猪的血清样品。检测结果与IDEXX公司CSFV-Ab检测试剂盒检测结果进行对比,阳性符合率为83.33%,阴性符合率为89.38%,总符合率为86.43%。30份存在差异的血清样品用间接免疫荧光法(Indirect immunofluorescence assay,IFA)进行检测,结果显示IFA检测结果与NS3间接ELISA和IDEXX公司CSFV-Ab检测试剂盒符合率分别为56.67%和43.33%。 展开更多
关键词 CSF V ns3 基因克隆 原核表达 蛋白纯化 免疫印迹 间接ELISA IFA
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丙型肝炎病毒非结构蛋白NS3反式激活SV40病毒早期启动子的研究 被引量:15
15
作者 刘妍 成军 +5 位作者 牟劲松 陆荫英 王建军 李克 王琳 张玲霞 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期44-46,共3页
聚合酶链反应(PCR)扩增丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白NS3基因 ,克隆至真核表达载体pcDNA3 1(- )中 ,构建HCV NS3基因真核表达载体 pcDNA3 1(- ) NS3;以该质粒转染肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞 ,免疫印迹方法 (Westernblotting)检测转染... 聚合酶链反应(PCR)扩增丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白NS3基因 ,克隆至真核表达载体pcDNA3 1(- )中 ,构建HCV NS3基因真核表达载体 pcDNA3 1(- ) NS3;以该质粒转染肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞 ,免疫印迹方法 (Westernblotting)检测转染细胞中HCVNS3蛋白的瞬时表达 ;与报告质粒pCAT3 promoter共转染HepG2细胞 ,用酶联免疫吸附方法 (ELISA)检测细胞中氯霉素乙酰转移酶 (CAT)的表达活性。结果显示 ,质粒pcDNA3 1(- ) NS3在HepG2细胞瞬时表达HCVNS3蛋白 ,共转染实验中pcDNA3 1(- ) NS3组的CAT表达活性是空质粒对照组的 4 6倍。表明构建的表达载体能在哺乳动物细胞中表达出相应蛋白 ,并能够反式激活SV4 0病毒早期启动子。本研究为进一步克隆HCVNS3蛋白反式激活的靶基因 。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构蛋白ns3 反式激活 SV40病毒 早期启动子
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丙型肝炎病毒NS3螺旋酶寡核苷酸适配子的筛选与鉴定 被引量:12
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作者 詹林盛 卓海龙 +2 位作者 王会中 彭剑淳 王全立 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第3期245-250,共6页
为筛选和鉴定抗丙型肝炎病毒(HCV) NS3螺旋酶(NS3h) 的寡核苷酸适配子(aptamers). 利用SELEX技术,以HCV NS3h为靶分子,从体外合成的81 bp随机单链DNA文库中筛选与HCV NS3h特异结合的寡核苷酸适配子. 克隆测序后,进行了解离常数(Kd) 测定... 为筛选和鉴定抗丙型肝炎病毒(HCV) NS3螺旋酶(NS3h) 的寡核苷酸适配子(aptamers). 利用SELEX技术,以HCV NS3h为靶分子,从体外合成的81 bp随机单链DNA文库中筛选与HCV NS3h特异结合的寡核苷酸适配子. 克隆测序后,进行了解离常数(Kd) 测定和Clustal W软件包分析适配子一级结构. 经过8轮循环筛选,随机ssDNA库与HCV NS3h的结合率从0.45%上升到29.5%. 所有的一级结构没有共同的同源序列,但可分5个家族,其中4个家族具有共同的保守序列. 解离常数测定表明,寡核苷酸适配子H2与HCV NS3h特异结合的亲和力最高,Kd值为140 nmol/L. 适配子H2 (10 μmol/L)在体外对HCV NS3h的活性具有一定的抑制作用,抑制率达44%. 利用随机寡核苷酸文库获得了抗HCV NS3h的寡核苷酸适配子. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 ns3螺旋酶 SELEX 寡核苷酸适配子
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抗猪瘟病毒NS3(p80)蛋白单克隆抗体的制备及其特性鉴定 被引量:15
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作者 鲁絮 张彦明 +5 位作者 郑增忍 穆杨 龚振华 李葳 徐浩 余欣 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期464-468,共5页
在大肠杆菌Rosetta(DE3)中表达猪瘟病毒石门株NS3基因部分功能片段,以纯化的重组NS3(p80)蛋白免疫BALB/c小鼠,取其脾细胞与骨髓瘤细胞SP2/0进行融合,经间接ELISA筛选及3次连续克隆化获得了4株可分泌抗NS3单抗的杂交瘤细胞(2G7,2F11,5D2... 在大肠杆菌Rosetta(DE3)中表达猪瘟病毒石门株NS3基因部分功能片段,以纯化的重组NS3(p80)蛋白免疫BALB/c小鼠,取其脾细胞与骨髓瘤细胞SP2/0进行融合,经间接ELISA筛选及3次连续克隆化获得了4株可分泌抗NS3单抗的杂交瘤细胞(2G7,2F11,5D2和6F11),通过小鼠体内诱生法制备腹水,并对杂交瘤细胞和单克隆抗体的特性进行鉴定。结果表明,杂交瘤细胞染色体正常,抗体分泌稳定,单抗效价高,亲和力各不相同,Ig亚类鉴定均为IgG1。Westernblot分析证明4株单抗均能与原核表达的NS3蛋白特异性结合,6F11株与真核表达的NS3蛋白有较强的特异性反应。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 ns3基因 表达 蛋白纯化 单克隆抗体
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牛病毒性腹泻病病毒NS3表位串联蛋白表达及抗体间接ELISA方法的建立 被引量:12
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作者 贾莹 李岩 +4 位作者 尹鑫 温凯 刘华 张文龙 王君伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1120-1125,共6页
为建立一种有效的牛病毒性腹泻病病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)抗体检测方法,作者将BVDVNS3蛋白2个抗原表位的编码核酸序列进行串联,构建重组表达载体pET-30a-EXnN,并在原核表达系统中表达了重组蛋白。选取包含12个表位肽的... 为建立一种有效的牛病毒性腹泻病病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)抗体检测方法,作者将BVDVNS3蛋白2个抗原表位的编码核酸序列进行串联,构建重组表达载体pET-30a-EXnN,并在原核表达系统中表达了重组蛋白。选取包含12个表位肽的重组蛋白(r-BVDV-EX6N)作为包被抗原建立NS3蛋白抗体间接ELISA方法。该方法的特异性和稳定性良好,与2种商品化试剂盒的符合率分别为96.05%和78.95%。试验结果表明建立的ELISA方法可用于BVDV NS3蛋白抗体的检测。 展开更多
关键词 BVDV ns3蛋白 表位串联 间接ELISA
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牛病毒性腹泻病毒NS3基因的序列分析、表达与抗原性鉴定 被引量:7
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作者 李岩 聂明非 +4 位作者 魏伟 温凯 贾莹 霍慧 王君伟 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期311-316,共6页
本研究应用套式RT-PCR方法扩增出牛病毒性腹泻病毒VEDEVAC株编码NS3蛋白的基因,克隆至表达载体pET-30a(+),并进行测序。对瘟病毒属病毒NS3基因进行氨基酸差异性分析,显示平均P-distance为0.07,系统进化树分析表明VEDEVAC株隶属于BVDV1... 本研究应用套式RT-PCR方法扩增出牛病毒性腹泻病毒VEDEVAC株编码NS3蛋白的基因,克隆至表达载体pET-30a(+),并进行测序。对瘟病毒属病毒NS3基因进行氨基酸差异性分析,显示平均P-distance为0.07,系统进化树分析表明VEDEVAC株隶属于BVDV1型。将构建成功的重组质粒转化大肠埃希氏菌Rosetta(DE3),在IPTG诱导下表达NS3重组蛋白,经Ni-NTA亲和层析纯化和尿素梯度透析后进行反应原性鉴定。Western blotting结果显示表达的重组蛋白可以与牛病毒性腹泻病毒阳性血清反应,并与猪瘟阳性血清有交叉反应,ELISA结果显示该重组蛋白具有良好的反应原性。所获得的蛋白为建立针对NS3抗体的ELISA检测方法奠定了基础。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 ns3蛋白 差异性分析 进化树 抗原性
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丙型肝炎病毒NS3蛋白促进人源肝细胞的增殖及其相关机制研究 被引量:6
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作者 李波 冯德云 +5 位作者 程瑞雪 孙树艳 何琼琼 胡忠良 郑晖 文继舫 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第10期991-997,共7页
丙型肝炎病毒(HCV)NS3蛋白与肝癌细胞(HCC)的发生密切相关,但其机制尚不清楚.既往体外研究极少采用HCV的自然宿主细胞——人肝细胞作为研究体系,故所获研究结果有待进一步探讨和证实.构建了表达HCVNS3蛋白的真核质粒,通过稳定转染人源... 丙型肝炎病毒(HCV)NS3蛋白与肝癌细胞(HCC)的发生密切相关,但其机制尚不清楚.既往体外研究极少采用HCV的自然宿主细胞——人肝细胞作为研究体系,故所获研究结果有待进一步探讨和证实.构建了表达HCVNS3蛋白的真核质粒,通过稳定转染人源永生化肝细胞系QSG7701,建立了稳定表达HCVNS3蛋白的人源永生化肝细胞系QSG7701/NS3,以此为实验平台,检测了细胞增殖的变化,丝裂原蛋白激酶(MAPK)通路激酶磷酸化水平的改变及转录因子AP-1、NF-κB和STAT3的活性变化.结果表明:HCVNS3蛋白可促进人源永生化肝细胞QSG7701的增殖,HCVNS3蛋白激活ERKs/AP-1可能是其促进细胞增殖的重要机制,并通过上调转录因子NF-κB和STAT3的活性,诱导宿主细胞急性炎症损伤. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒ns3蛋白 肝细胞 丝裂原蛋白激酶(MAPK) 增殖
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