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基于RNA-Seq对猪心组织新转录本解析及可变剪接和SNP分析
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作者 姚博元 杨志文 +3 位作者 孙亚朋 杨雅楠 张雅茹 王欣荣 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第4期1664-1675,共12页
为完善和优化猪基因组注释信息,本研究利用RNA-Seq测序技术,开展猪心肌组织的新转录本预测、可变剪接事件和SNP变异位点分析。本研究以藏猪(抗逆性强)和长白猪为研究对象,选取6月龄健康去势公猪各3头,采集其心肌组织样本,进行建库与测... 为完善和优化猪基因组注释信息,本研究利用RNA-Seq测序技术,开展猪心肌组织的新转录本预测、可变剪接事件和SNP变异位点分析。本研究以藏猪(抗逆性强)和长白猪为研究对象,选取6月龄健康去势公猪各3头,采集其心肌组织样本,进行建库与测序。通过数据分析,挖掘新转录本和新基因,进一步分析可变剪接事件和SNP变异,对新基因和差异可变剪接进行富集分析。结果显示,共发现930个新基因,5 993个新转录本,富集分析显示,病毒粒子组装和病毒生命周期等条目,NF-κB信号通路和Hedgehog信号等通路被显著富集。外显子跳跃(SE)占可变剪接类型的比例最高,筛选了159个显著的差异剪接基因,主要富集在收缩纤维、AMPK通路和昼夜节律等通路中。藏猪的变异位点均大于长白猪,同义突变数量共有311 117个位点;外显子和3′端非翻译区分别有418 136和356 478个变异位点。在极端环境下,藏猪心肌组织可能通过NF-κB和AMPK信号通路进行免疫调节,参与细胞的代谢及凋亡,改善心肌损伤,抑制高寒低氧应激。 展开更多
关键词 藏猪 长白猪 新转录本 可变剪接 SNP分析
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不同海拔藏绵羊(Ovis aries)睾丸组织新转录本注释及功能解析
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作者 尉斌艳 杨雅楠 +3 位作者 李伊健 高榕 马敏 王欣荣 《基因组学与应用生物学》 北大核心 2025年第1期30-43,共14页
藏绵羊(Ovis aries)是目前生活在高原环境中群体数量最大的绵羊品种,在转录水平层面上探究藏绵羊睾丸组织对不同海拔低氧环境适应的遗传机理,完善和优化绵羊基因组注释信息,可为探索其他动物低氧适应机制提供参考。研究选取高海拔藏绵... 藏绵羊(Ovis aries)是目前生活在高原环境中群体数量最大的绵羊品种,在转录水平层面上探究藏绵羊睾丸组织对不同海拔低氧环境适应的遗传机理,完善和优化绵羊基因组注释信息,可为探索其他动物低氧适应机制提供参考。研究选取高海拔藏绵羊和低海拔藏绵羊的睾丸组织为研究对象,提取RNA,构建cDNA文库,进行RNA-seq测序,对测序数据进行组装,并与绵羊参考基因组进行比对分析,优化已注释基因的结构,挖掘新转录本进行功能富集分析。采用实时荧光定量PCR(real time fluorogenic quantitative PCR)对随机选择的10个具有显著差异表达的新转录本进行验证。在高海拔和低海拔藏绵羊的睾丸组织中共挖掘了54755个新转录本,有2408个差异新转录本,其中1186个差异新转录本显著上调,而1222个则显著下调。通过GO富集分析,结果显示差异表达的新转录本主要富集在398条通路中,且富集数量较多的条目是细胞过程、绑定和细胞内解剖结构等。KEGG功能富集分析发现,差异表达新转录本在FoxO信号通路和RAS信号通路显著富集。睾丸组织新转录本可能通过调控生殖细胞的增殖、分化和凋亡,维持活性氧稳态,调节睾丸内部血管血液循环,进而调控藏绵羊睾丸对高海拔低氧环境的适应性。 展开更多
关键词 藏绵羊 新转录本 基因结构优化 低氧适应
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声音提示技术在电视新闻报道创新中的应用
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作者 阳青松 《电声技术》 2025年第1期71-73,共3页
探讨了声音提示技术在电视新闻报道中的应用创新,旨在提高报道的智能化水平。结合深度学习算法与语音识别技术,提出声音提示技术在实时语音转录、智能剪辑及个性化推荐中的应用方案。实验结果显示,该技术在提高语音转录准确性、剪辑效... 探讨了声音提示技术在电视新闻报道中的应用创新,旨在提高报道的智能化水平。结合深度学习算法与语音识别技术,提出声音提示技术在实时语音转录、智能剪辑及个性化推荐中的应用方案。实验结果显示,该技术在提高语音转录准确性、剪辑效果以及用户参与度方面表现优异,为电视新闻报道提供了新的技术路径与实践借鉴。 展开更多
关键词 声音提示技术 电视新闻 实时语音转录
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基于RNA-Seq技术的京海黄鸡卵巢组织转录本预测及新基因挖掘 被引量:9
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作者 董新龙 张向前 +4 位作者 韩昆鹏 凌姣姣 张跟喜 王金玉 王永娟 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第2期497-504,共8页
鸡及许多物种的全基因组测序及相关基因图谱都已宣告完成,但由于注释方法的局限性,还存在许多遗漏的新基因及对现有基因的误差注释。RNA-Seq技术是基于第2代测序技术的转录组学研究方法,该研究利用高通量测序技术对8只(高产组4只、低产... 鸡及许多物种的全基因组测序及相关基因图谱都已宣告完成,但由于注释方法的局限性,还存在许多遗漏的新基因及对现有基因的误差注释。RNA-Seq技术是基于第2代测序技术的转录组学研究方法,该研究利用高通量测序技术对8只(高产组4只、低产组4只)300日龄体重一致、饲养条件相同、产蛋数存在差异的京海黄鸡的卵巢组织所有RNA反转录而成的cDNA文库进行测序,通过分析RNA-Seq获得的京海黄鸡卵巢组织转录组数据,共发现4 431个新转录本,并将所有新转录本与GO、NR、Swiss-Prot、KEGG数据库进行比对和分析,发现了很多潜在的新基因并进行功能注释,为鸡基因组的进一步完善及功能基因的挖掘提供了数据基础。 展开更多
关键词 转录组测序 京海黄鸡 新转录本 新基因 功能注释
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基于RNA-Seq技术的葡萄不同花型新转录本预测和基因结构优化 被引量:3
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作者 纪薇 焦晓博 +5 位作者 罗尧幸 赵伟 郭雯岩 刘榕晨 赵旗峰 马小河 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期617-628,共12页
由于葡萄(Vitis spp.)基因组注释的不完善,本文以3个生长时期3种性状葡萄花器官(雌能花、雄花和两性花)为材料提取总RNA进行高通量测序,开展了葡萄新转录本发掘和已注释基因结构优化工作。获得173.41Gb高质量的过滤后的数据(clean data)... 由于葡萄(Vitis spp.)基因组注释的不完善,本文以3个生长时期3种性状葡萄花器官(雌能花、雄花和两性花)为材料提取总RNA进行高通量测序,开展了葡萄新转录本发掘和已注释基因结构优化工作。获得173.41Gb高质量的过滤后的数据(clean data),发掘出839个新转录本,其中697个新转录本得到了注释信息,同时对10 163个已注释基因的结构进行了优化。本研究旨在为后续葡萄基因组学、表型研究和其他生物基因组注释信息的完善提供参考。 展开更多
关键词 葡萄 RNA-SEQ 新转录本预测 基因结构优化
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广播电视新闻自动记录系统研究现状——语音识别的重要应用 被引量:3
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作者 张红 黄泰翼 徐波 《自动化学报》 EI CSCD 北大核心 2001年第3期338-345,共8页
广播电视新闻自动记录系统是近两年国际上出现的大词汇量连续语音识别系统研究的新热点 ,是语音识别技术进一步走向实用化的重要过渡形式 .文中介绍了目前国际上广播电视新闻自动记录系统出现的背景和发展历史 ,从系统性能与理论研究两... 广播电视新闻自动记录系统是近两年国际上出现的大词汇量连续语音识别系统研究的新热点 ,是语音识别技术进一步走向实用化的重要过渡形式 .文中介绍了目前国际上广播电视新闻自动记录系统出现的背景和发展历史 ,从系统性能与理论研究两方面介绍了这方面的研究现状并加以分析 。 展开更多
关键词 语音识别 广播电视新闻自动记录系统 声学模型 语言模型
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基于RNA-seq对复合益生菌作用于肉鸡回肠中新转录本预测及可变剪接、SNP分析 被引量:1
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作者 曹威荣 王燕飞 +3 位作者 张若男 贾浩 刘璇 张利环 《中国饲料》 北大核心 2024年第3期20-27,共8页
为分析复合益生菌饲喂肉鸡回肠转录组中的新转录本预测、可变剪接事件和SNP,选择200只1日龄黄麻肉鸡随机分为2组,每组5个重复,每个重复20只。对照组正常饮水,益生菌组饮用水中补充1%复合菌制剂,试验分为生长前期(1~21 d)、后期(22~42 d... 为分析复合益生菌饲喂肉鸡回肠转录组中的新转录本预测、可变剪接事件和SNP,选择200只1日龄黄麻肉鸡随机分为2组,每组5个重复,每个重复20只。对照组正常饮水,益生菌组饮用水中补充1%复合菌制剂,试验分为生长前期(1~21 d)、后期(22~42 d)两个阶段。42日龄时进行肉鸡屠宰试验,取对照组和益生菌组回肠各3个样本进行转录组测序。对测序数据进行分析,共发现1047个新基因,20176个新转录本,276个新基因在GO数据库中得到归类注释。对转录组数据进行可变剪接分析,外显子跳跃(SE)占可变剪接类型的比例最高,共筛选到1131个显著的差异剪接基因,在外显子跳跃(SE)、第一个外显子可变剪接(A5SS)、最后一个外显子可变剪接(A3SS)、外显子选择性跳跃(MXE)、内含子滞留(RI)事件中鉴定到的差异剪接基因数分别为588、139、176、136、92。对获得的差异剪接基因进行GO富集分析,主要富集在代谢和免疫GO term。KEGG富集到了胞吞作用、MAPK信号通路等。在各样品中大多数碱基取代均为转换大于颠换,其中转换单核苷酸多态性(SNP)所占百分比为73.53%~73.94%;颠换型SNP所占百分比为26.05%~26.47%。试验对对照组、益生菌组肉鸡的回肠进行了RNA-seq测序分析,为发掘复合益生菌作用于肉鸡回肠中的可变剪接事件提供基础,为进一步了解复合益生菌作用于肉鸡回肠中新转录本的发现和SNP位点提供了数据支撑。 展开更多
关键词 肉鸡 RNA-SEQ 新转录本 SNP 可变剪接
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基于转录组测序的白斑狗鱼性腺新转录本分析及基因结构优化 被引量:1
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作者 张俊杰 李万龙 +2 位作者 赵瑞阳 王顺哲 杨倩 《新疆农业大学学报》 CAS 2021年第6期417-423,共7页
为了完善和优化白斑狗鱼(Esox lucius)基因组信息,解析白斑狗鱼性腺组织在转录水平上的差异表达,本研究对5个不同阶段的白斑狗鱼性腺组织进行转录组测序,构建cDNA文库,将重新组装的测序数据与白斑狗鱼参考基因组进行比对分析。结果显示... 为了完善和优化白斑狗鱼(Esox lucius)基因组信息,解析白斑狗鱼性腺组织在转录水平上的差异表达,本研究对5个不同阶段的白斑狗鱼性腺组织进行转录组测序,构建cDNA文库,将重新组装的测序数据与白斑狗鱼参考基因组进行比对分析。结果显示,在本研究中挖掘了5240个白斑狗鱼性腺新转录本,同时不同程度的延伸了18715个基因的3'或5'端,在NR、NT、KO、SwissProt、Pfam、GO和COG/KOG等7个数据库分别成功注释了3179、4426、27、1412、2822、996和634个新转录本,其中GO富集分析显示,白斑狗鱼性腺差异新转录本在细胞过程和代谢过程等过程被显著富集。 展开更多
关键词 白斑狗鱼 转录组 新转录本 基因结构优化
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新布尼亚病毒核酸检测实时荧光RT-PCR方法的评价 被引量:3
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作者 吕惠荣 杨云惠 +1 位作者 杜燕华 黄学勇 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2013年第5期1186-1188,共3页
目的:对发热伴血小板减少综合征新布尼亚病毒核酸检测方法进行评价,为今后检测试剂的选择提供帮助与参考。方法:用实时荧光RT-PCR和RT-PCR方法对58例信阳市发热伴血小板减少综合征病例和河南省疾病预防控制中心发热待查门诊100例病例进... 目的:对发热伴血小板减少综合征新布尼亚病毒核酸检测方法进行评价,为今后检测试剂的选择提供帮助与参考。方法:用实时荧光RT-PCR和RT-PCR方法对58例信阳市发热伴血小板减少综合征病例和河南省疾病预防控制中心发热待查门诊100例病例进行检测,对比试验结果。结果:58例标本中,实时荧光RT-PCR方法检出阳性38例,阴性20例,阳性率65.52%;RT-PCR方法检出阳性37例,阴性21例,阳性率63.79%;100例非发热伴血小板减少综合征的发热待查病例荧光RT-PCR方法实验结果均为阴性,与临床检测结果一致。相对于RT-PCR方法,实时荧光RT-PCR检测方法的灵敏度为97.36%,特异度为100%。结论:实时荧光RT-PCR方法,具有较好的灵敏度和特异性,在发热伴血小板减少综合征早期检测和临床诊断治疗上具有重要意义。 展开更多
关键词 新布尼亚病毒 实时荧光RT-PCR RT-PCR
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Nrf2-ARE信号通路功能与临床疾病及相关药物的研究新进展 被引量:14
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作者 谭亲友 张靖 《中国医院药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第15期1331-1336,共6页
Nrf2(NF-E2-related factor 2)核因子E2相关因子是一种机体抵抗内界和外界氧化或化学等刺激的中枢调节者。Nrf2-ARE则是近年来新发现的细胞氧化应激反应的关键传导通路,当其在体内被有毒有害物质激活后转位进入细胞核能与抗氧化反应元件... Nrf2(NF-E2-related factor 2)核因子E2相关因子是一种机体抵抗内界和外界氧化或化学等刺激的中枢调节者。Nrf2-ARE则是近年来新发现的细胞氧化应激反应的关键传导通路,当其在体内被有毒有害物质激活后转位进入细胞核能与抗氧化反应元件(antioxidant response element,ARE)结合形成Nrf2-ARE信号通路,从而调控下游抗氧化蛋白、氧化酶和Ⅱ相解毒酶等。研究发现该通路在抗衰老、抗肿瘤、抗炎症、神经损伤、眼科等多方面均有重要作用。以Nrf2为靶点的药物有望用于肿瘤、糖尿病、神经退行性疾病等。本文综述了Nrf2-ARE信号通路功能及以其为靶点的药物研究的进展。 展开更多
关键词 Nrf2/ARE通路 转录因子 氧化应激 中草药 新靶点
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避免基因组DNA污染的半定量RT-PCR新方法
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作者 卢加举 崔百明 +2 位作者 廖文彬 于海川 彭明 《天津农业科学》 CAS 2011年第6期6-9,共4页
为了消除基因组DNA的污染,在逆转录引物oligo-dT5’端加上通用引物T7B结合序列,根据3’-RACE的原理,用T7B和目标基因特异性引物即可进行半定量RT-PCR分析。用该方法对转GhGAI基因的拟南芥进行表达分析,结果表明:此方法可有效避免基因组... 为了消除基因组DNA的污染,在逆转录引物oligo-dT5’端加上通用引物T7B结合序列,根据3’-RACE的原理,用T7B和目标基因特异性引物即可进行半定量RT-PCR分析。用该方法对转GhGAI基因的拟南芥进行表达分析,结果表明:此方法可有效避免基因组DNA污染导致的假阳性。 展开更多
关键词 半定量RT-PCR 新方法 转基因植株
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3个肉牛群体新转录本注释及功能解析 被引量:4
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作者 王正文 张凌云 +4 位作者 安雪姣 张小强 杨雅楠 蔡原 赵生国 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2022年第10期1-13,共13页
【目的】挖掘肉牛(Bos taurus)新转录本,探讨其潜在功能,为进一步探明牛肉品质差异的遗传机制提供思路。【方法】以平凉红牛、杂交和牛(和牛×平凉红牛)和西门塔尔牛为研究对象,采集其背最长肌,进行RNA-seq测序,构建cDNA文库,将重... 【目的】挖掘肉牛(Bos taurus)新转录本,探讨其潜在功能,为进一步探明牛肉品质差异的遗传机制提供思路。【方法】以平凉红牛、杂交和牛(和牛×平凉红牛)和西门塔尔牛为研究对象,采集其背最长肌,进行RNA-seq测序,构建cDNA文库,将重新组装的测序数据与牛参考基因组序列进行比对分析,优化已注释转录本的信息,挖掘新转录本并对其进行功能富集分析。随机挑选9个显著差异表达的新转录本进行RT-qPCR验证。【结果】对1081个转录本的5′非翻译区域(UTR)和1586个转录本的3′UTR分别实现了延伸,并对1038个转录本的5′和3′UTR都实现了延伸。挖掘新转录本442个,其中92个新转录本在不同群体间表达差异显著(P<0.05);GO分析显示,表达差异显著的新转录本在代谢过程、酶催化活性和细胞部分等显著富集;KEGG富集发现,显著差异表达的新转录本显著富集在味觉转导、过氧化物酶、河马(Hippo)和MAPK等信号通路中。RT-qPCR结果与RNA-seq结果在定量方面存在差异,但变化趋势一致,说明转录组测序结果可靠。【结论】新转录本通过各种代谢途径和通路广泛参与调控牛肌肉生长、脂肪沉积、疾病和免疫等各项生命活动。 展开更多
关键词 平凉红牛 杂交和牛 西门塔尔牛 新转录本 肉质性状
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日本岩崎文库藏《新编江湖风月集略注》天正旧钞本异文研究举隅
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作者 董璐 王明娟 《河北民族师范学院学报》 2022年第1期48-55,共8页
异文因文本变异而产生,是写抄本领域极为重要的基础研究内容。日本室町时代临济僧东阳英朝为南宋僧诗选本《江湖风月集》作注,是为《新编江湖风月集略注》。岩崎文库藏《新编江湖风月集略注》天正旧钞本完成于1586年,属室町末期较有代... 异文因文本变异而产生,是写抄本领域极为重要的基础研究内容。日本室町时代临济僧东阳英朝为南宋僧诗选本《江湖风月集》作注,是为《新编江湖风月集略注》。岩崎文库藏《新编江湖风月集略注》天正旧钞本完成于1586年,属室町末期较有代表性的钞本。岩崎本中存在不少异文,包含异体字形、一字多形、连字符误读、形近而讹、版本差异、俗字异文等。 展开更多
关键词 岩崎文库 《新编江湖风月集略注》 钞本 异文
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120日龄文昌鸡RNA-Seq基因结构及SNP分析 被引量:3
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作者 顾丽红 李金明 +3 位作者 张细权 邱峰芳 邢增杨 林哲敏 《中国家禽》 北大核心 2019年第12期5-11,共7页
为了深入挖掘文昌鸡RNA-Seq数据,进一步完善文昌鸡基因组的注释信息,试验采用生物信息学的方法对120日龄文昌鸡的高质量序列(Clean data)数据进行单核苷酸多态性(SNP)的查找、可变剪接(AS)筛查、基因结构优化和新转录本预测。结果共得到... 为了深入挖掘文昌鸡RNA-Seq数据,进一步完善文昌鸡基因组的注释信息,试验采用生物信息学的方法对120日龄文昌鸡的高质量序列(Clean data)数据进行单核苷酸多态性(SNP)的查找、可变剪接(AS)筛查、基因结构优化和新转录本预测。结果共得到78 564个可靠的SNP位点,22 227个可变剪接,优化基因9 546个,预测新转录本593个。研究结果为文昌鸡分子育种提供了新的靶点。 展开更多
关键词 文昌鸡 RNA测序 可变剪接 单核苷酸多态性 新转录本
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不同繁殖力绵羊睾丸组织新转录本注释及功能解析 被引量:3
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作者 伏晓玉 柳苗苗 +2 位作者 杨雅楠 闫尊强 王欣荣 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2023年第9期11-20,共10页
【目的】完善和优化绵羊(Ovis aries)基因组注释信息,解析绵羊睾丸组织在不同繁殖力水平的遗传机理。【方法】以高繁殖力绵羊品种湖羊和低繁殖力绵羊品种藏绵羊(各3只)为研究对象,采集其睾丸组织,提取RNA,构建cDNA文库,进行RNA-Seq测序... 【目的】完善和优化绵羊(Ovis aries)基因组注释信息,解析绵羊睾丸组织在不同繁殖力水平的遗传机理。【方法】以高繁殖力绵羊品种湖羊和低繁殖力绵羊品种藏绵羊(各3只)为研究对象,采集其睾丸组织,提取RNA,构建cDNA文库,进行RNA-Seq测序,对测序数据进行组装。利用Cuffcompare软件对重新组装的测序数据与绵羊参考基因组进行比对分析,优化已注释基因的结构,并挖掘新转录本,对新转录本进行GO和KEGG通路分析。使用DESeq软件挖掘差异表达新转录本,对其进行GO和KEGG通路分析。随机选取表达显著上调和下调的新转录本各5个,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对其表达水平进行验证。【结果】对6只供试羊构建了6个独立的cDNA文库,共获得266009566个原始读段,质量控制后得到133004783个过滤后读段;6个cDNA文库过滤后读段的GC含量在49.61%~51.14%,符合碱基组成规律,Q30比例≥92.96%。对4273个已注释基因的结构进行了优化,其中5′非翻译区域(UTR)延伸基因2027个,3′UTR延伸基因1907个,5′和3′UTR同时延伸基因339个。挖掘到12178个新转录本,GO功能分析显示,2416个新转录本注释到生物学过程、细胞组成和分子功能;KEGG富集发现新转录本显著富集在单纯疱疹病毒Ⅰ型感染、过氧物酶体、河马信号通路。与湖羊相比,藏绵羊睾丸组织中有155个新转录本表达差异显著,其中103个表达上调,52个表达下调;GO功能分析显示,差异新转录本富集在细胞过程、膜部分、绑定等条目;KEGG富集发现差异新转录本显著富集在钙信号通路和核因子-κB炎症信号通路等。10个差异表达新转录本的RT-qPCR验证试验结果与RNA-Seq结果趋势一致。【结论】从湖羊和藏绵羊睾丸组织中共挖掘出12178个新转录本,其中155个差异表达。这些新转录本主要通过参与细胞功能、生物调节和代谢途径,以及通过核因子-κB炎症信号和钙信号通路广泛参与调控生殖细胞的增殖与分化、睾酮的分泌、免疫应答、Ca2+跨膜转运等途径,进而调控绵羊睾丸的发育和精子的发生。 展开更多
关键词 湖羊 藏绵羊 睾丸 新转录本 家畜繁殖
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从基因水平对新型佐剂在旋毛虫疫苗中免疫调节作用的探讨
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作者 姜春燕 薛燕萍 黄敏君 《中国寄生虫病防治杂志》 CSCD 2005年第1期22-25,共4页
目的 从细胞因子的基因转录水平探讨两种新型佐剂霍乱毒素 B亚单位(CT B)和皂素(Saponin)在旋毛虫疫苗中的免疫调节作用。 方法 36只NIH小鼠随机分为CT B佐剂免疫组、Saponin佐剂免疫组和对照组。将CT B和Saponin分别与旋毛虫肌幼虫... 目的 从细胞因子的基因转录水平探讨两种新型佐剂霍乱毒素 B亚单位(CT B)和皂素(Saponin)在旋毛虫疫苗中的免疫调节作用。 方法 36只NIH小鼠随机分为CT B佐剂免疫组、Saponin佐剂免疫组和对照组。将CT B和Saponin分别与旋毛虫肌幼虫可溶性抗原混匀后,以口服或皮下注射途径免疫小鼠,隔周1次。第3次免疫后 1 周,经口感染旋毛虫感染期肌幼虫。感染后第8 d,采用RT PCR技术分析各组小鼠脾细胞在体外旋毛虫肌幼虫抗原刺激下,转录细胞因子 IFN γ、IL 2、IL 4及 IL 5 mRNA的水平。 结果 各组小鼠的脾细胞在体外抗原诱导下均未能转录 IL 2和 IFN γmRNA,但均有不同程度的 IL 4和 IL 5特异扩增,两免疫组的 IL 4 及 IL 5 mRNA转录水平明显高于对照组。结论  Th2细胞及其分泌的细胞因子在机体抗旋毛虫的保护性免疫中发挥着重要作用;从佐剂角度提高旋毛虫疫苗的保护性是可行的。 展开更多
关键词 新型佐剂 旋毛虫 疫苗 细胞因子 基因转录
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诱导性多能干细胞构建策略及其提高重编程效率的方法 被引量:1
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作者 李佳佳 马利兵 +1 位作者 陈秀莉 籍凤宇 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期41-48,共8页
以Oct4、Sox2、Klf4和c-Myc等转录因子于体细胞中异位表达,可获得具有胚胎干细胞特性的诱导性多能干细胞(iPSCs),但是iPSCs技术的重编程效率和应用于临床上的安全性却都很低。目前,iPSCs的研究集中于3个方面:一是增加iPSCs技术的重编程... 以Oct4、Sox2、Klf4和c-Myc等转录因子于体细胞中异位表达,可获得具有胚胎干细胞特性的诱导性多能干细胞(iPSCs),但是iPSCs技术的重编程效率和应用于临床上的安全性却都很低。目前,iPSCs的研究集中于3个方面:一是增加iPSCs技术的重编程效率;二是增加iPSCs应用于临床时的安全性;三是开创新的构建iPSCs的方法。第一个方面通过调整体细胞的表观遗传特性和细胞信号网络来达到;第二个方面可通过减少致癌性因子的使用及选择合适的载体系统来达到。而且,一些小分子化合物和调节细胞信号网络的方法也被用于诱导体细胞重编程为iPSCs。相对于仅仅使用转录因子重编程体细胞为iPSCs,使用小分子化合物或调节细胞信号网络的方法重编程体细胞为iPSCs的效率更高,而且通过这种方法获得的iPSCs的有更高的临床安全性。新构建iPSCs的方式与依赖含转录因子表达载体构建iPSCs的传统模式区别较大,它们的临床安全性或(和)重编程效率也得到了极大提高。使用4个转录因子的重组蛋白或体外合成并修饰的转录因子的mRNA已经能成功构建iPSCs;而使用miRNAs高效率重编程小鼠和人的体细胞为iPSCs的方法则开创了脱离转录因子重编程体细胞的全新策略。 展开更多
关键词 诱导性多能干细胞 转录因子 载体系统 重编程效率 安全性 全新策略
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超敏C反应蛋白/白蛋白、活化转录因子4对急性心肌梗死患者新发心房颤动预测价值研究 被引量:2
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作者 贾慧宇 刘昊鹏 +3 位作者 李凯 韩培天 李术伟 徐俊华 《创伤与急危重病医学》 2023年第2期104-109,共6页
目的分析超敏C反应蛋白(hs-CRP)/白蛋白(Alb)、活化转录因子4(ATF4)对急性心肌梗死(AMI)患者新发心房颤动的预测价值。方法选取2020年1月至2022年9月收治的398例AMI患者为观察组,并选取同期健康体检者398例为健康组。两组均采集外周血,... 目的分析超敏C反应蛋白(hs-CRP)/白蛋白(Alb)、活化转录因子4(ATF4)对急性心肌梗死(AMI)患者新发心房颤动的预测价值。方法选取2020年1月至2022年9月收治的398例AMI患者为观察组,并选取同期健康体检者398例为健康组。两组均采集外周血,检测血清hs-CRP、Alb、ATF4水平,计算hs-CRP/Alb。观察组根据住院期间是否新发心房颤动分为新发心房颤动患者和无新发心房颤动患者。通过电子病历系统收集入选患者资料,根据最邻近匹配法对新发心房颤动患者和无新发心房颤动患者进行1:1匹配,Logistic回归模型计算评分值。对纳入的因素进行单因素和多因素Logistic回归分析,筛选出新发心房颤动的预测因素,绘制受试者工作特征曲线(ROC)分析hs-CRP/Alb、ATF4对AMI患者新发心房颤动的预测价值。结果观察组hs-CRP/Alb、ATF4水平高于健康组,差异有统计学意义(P<0.05)。二元Logistic多因素回归分析结果显示,入院时心率、肌钙蛋白Ⅰ、左心房内径、hs-CRP/Alb、ATF4是AMI患者新发心房颤动的独立影响因素(P<0.05);hs-CRP/Alb、ATF4联合预测新发心房颤动的曲线下面积(AUC)值高于单独评估的AUC值(P<0.05)。结论AMI患者hs-CRP/Alb、ATF4可应用于预测新发心房颤动,二者联合对AMI患者新发心房颤动的预测效能更佳。 展开更多
关键词 超敏C反应蛋白/白蛋白 活化转录因子4 急性心肌梗死 新发心房颤动
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全自动中文新闻字幕生成系统的设计与实现
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作者 郑李磊 谢磊 +3 位作者 芦咪咪 王晓暄 杨玉莲 张艳宁 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第A03期69-74,共6页
本文设计与实现了一个全自动中文新闻字幕生成系统,输入为新闻视频,输出为视频对应的字幕文本.以《新闻联播》为语料,实现了音频提取、音频分类与切分、说话人识别、大词汇量连续语音识别、视频文件的播放和文本字幕的自动生成等多项功... 本文设计与实现了一个全自动中文新闻字幕生成系统,输入为新闻视频,输出为视频对应的字幕文本.以《新闻联播》为语料,实现了音频提取、音频分类与切分、说话人识别、大词汇量连续语音识别、视频文件的播放和文本字幕的自动生成等多项功能.新闻字幕的自动生成,避免了繁重费时的人工字幕添加过程.实验表明,该系统识别率高,能够满足听障等特殊人群和特殊场合的电视新闻收视需求. 展开更多
关键词 语音识别 广播新闻抄本 音频分类 说话人识别 字幕生成
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STAT1功能获得性突变3例临床特点及基因分析 被引量:2
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作者 方辉 张雷 +5 位作者 毛国顺 李桂涛 李利 赵晓峰 胡国生 朱影 《山西医科大学学报》 CAS 2021年第9期1237-1241,共5页
目的探讨3例慢性皮肤黏膜念珠菌病伴有自身免疫性疾病的信号传导与转录激活因子1(signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)功能获得性突变(gain-of-function,GOF)的临床特征及基因特点。方法选取就诊阜阳市人民医院... 目的探讨3例慢性皮肤黏膜念珠菌病伴有自身免疫性疾病的信号传导与转录激活因子1(signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)功能获得性突变(gain-of-function,GOF)的临床特征及基因特点。方法选取就诊阜阳市人民医院儿科的3例确诊为STAT1 GOF的患儿,对其临床特征进行分析总结,采集外周血样,运用高通量测序(high-throughput sequencing,NGS)进行基因检测,并同时进行父母的基因组DNA测序。结果3例患者均出现慢性皮肤黏膜念珠菌病、支气管扩张,并且伴有不同类型的自身免疫性疾病,基因检测证实均存在STAT1基因突变,有不同的突变位点,3个突变均属功能获得性突变,而父母基因均正常,为新发错义变异。结论STAT1 GOF新发突变易导致慢性皮肤黏膜念珠菌病合并自身免疫性疾病,并且在病程的不同时期STAT1基因突变可能伴随不同的自身免疫性疾病的表现,需定期观察,完善相关基因检测有助于早期诊断,避免漏诊及误诊。 展开更多
关键词 慢性皮肤黏膜念珠菌病 自身免疫性疾病 信号转导与转录激活因子1(STAT1)功能获得性突变 新发突变
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