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tRF Prospect:基于神经网络学习的tRNA衍生片段靶标预测算法
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作者 任黛西 易健勇 +4 位作者 莫勇真 杨梅 熊炜 曾朝阳 石磊 《生物化学与生物物理进展》 北大核心 2025年第9期2428-2438,共11页
目的转运核糖核酸衍生片段(transfer RNA derived fragment,tRF)是一种新型的长度介于13~50 nt的非编码RNA,最近被发现可能通过靶向结合mRNA,促进mRNA降解,抑制蛋白质翻译,从而在细胞中发挥特定的生物学功能,但预测其靶基因的生物信息... 目的转运核糖核酸衍生片段(transfer RNA derived fragment,tRF)是一种新型的长度介于13~50 nt的非编码RNA,最近被发现可能通过靶向结合mRNA,促进mRNA降解,抑制蛋白质翻译,从而在细胞中发挥特定的生物学功能,但预测其靶基因的生物信息学方法尚且有限。为了研究这一种新型分子在基因网络调控中发挥的作用,开发一种更全面地预测tRF靶标的算法具有重要意义。方法使用多层感知机神经网络深度学习算法,以确认结合的38687对tRF∶mRNA为训练数据,将已知的tRF和靶标结合的特征用于模型学习,并扩大收录的tRF和靶标的范围。结果将该基于神经网络学习的tRF靶标预测算法命名为tRF Prospect,算法AUC达93.4%,经与过表达tRF后的转录组高通量测序数据进行比对,具有良好的预测性能,证实该算法具有较高准确度。结论tRF Prospect主要预测tRF发挥生物学功能可能作用的靶向mRNA,对现有的tRF靶标预测平台在收录tRF种类、靶标范围和预测模型上进行了补充,为研究tRF在生物中的新作用提供了基础。 展开更多
关键词 转运核糖核酸衍生片段 数据库 神经网络学习
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基于反时限混沌郊狼优化算法的BP神经网络参数优化 被引量:19
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作者 刘威 付杰 +5 位作者 周定宁 王薪予 成秘 黄敏 靳宝 牛英杰 《控制与决策》 EI CSCD 北大核心 2021年第10期2339-2349,共11页
针对郊狼优化算法优化性能弱及多样性低等问题,提出一种基于反时限衰减算子的混沌郊狼优化算法(ICCOA).首先,在个体迭代更新过程加入反时限衰减权重因子,使得全局搜索与局部开发能力保持平衡的同时提高算法的搜索速度;其次,加入基于Ten... 针对郊狼优化算法优化性能弱及多样性低等问题,提出一种基于反时限衰减算子的混沌郊狼优化算法(ICCOA).首先,在个体迭代更新过程加入反时限衰减权重因子,使得全局搜索与局部开发能力保持平衡的同时提高算法的搜索速度;其次,加入基于Tent混沌映射的混沌干扰机制,将种群中部分较差个体经过映射产生新个体,进而增大种群多样性;接着,为了验证ICCOA算法的优化能力,分别在10、30和100维度下进行函数优化测试,并与5种优化算法进行比较,其实验结果表明ICCOA算法具有良好的优化性能;最后,将ICCOA算法应用于BP神经网络参数优化,提出新的神经网络模型(ICCOABP),并与标准神经网络、基于遗传算法的BP神经网络参数优化方法一同应用于机器学习的分类任务进行性能比较,实验结果表明ICCOABP算法具有高效性. 展开更多
关键词 郊狼优化 反时限 Tent混沌映射 神经网络 机器学习
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基于CS-ANN的软件缺陷预测模型研究 被引量:6
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作者 王海林 于倩 +3 位作者 李彤 郁湧 明利 孙金文 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2017年第2期467-472,476,共7页
为了提高软件缺陷预测的准确率,利用布谷鸟搜索(cuckoo search,CS)算法的寻优能力和人工神经网络(artificial neural network,ANN)算法的非线性计算能力,提出了基于CS-ANN的软件缺陷预测方法。此方法首先使用基于关联规则的特征选择算... 为了提高软件缺陷预测的准确率,利用布谷鸟搜索(cuckoo search,CS)算法的寻优能力和人工神经网络(artificial neural network,ANN)算法的非线性计算能力,提出了基于CS-ANN的软件缺陷预测方法。此方法首先使用基于关联规则的特征选择算法降低数据的维度,去除了噪声属性;然后利用布谷鸟搜索算法寻找神经网络算法的权值,使用权值和神经网络算法构建出预测模型;最后使用此模型完成缺陷预测。使用公开的NASA数据集进行仿真实验,结果表明该模型降低了误报率,并提高了预测的准确率,综合评价指标AUC(area under the ROC curve)、F1值和G-mean都优于现有模型。 展开更多
关键词 软件缺陷预测 人工神经网络 布谷鸟搜索算法 软件质量 机器学习
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改进卷积神经网络算法在水面漂浮垃圾检测中的应用 被引量:5
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作者 汤伟 高涵 《中国科技论文》 CAS 北大核心 2019年第11期1210-1216,共7页
针对传统目标检测算法在检测水面漂浮垃圾时易受外界复杂环境影响而难以实现的问题,提出了一种基于改进卷积神经网络的水面漂浮垃圾检测算法。运用数据增强技术改善训练过程中因样本不足而导致的过拟合问题,并利用迁移学习的方法训练出... 针对传统目标检测算法在检测水面漂浮垃圾时易受外界复杂环境影响而难以实现的问题,提出了一种基于改进卷积神经网络的水面漂浮垃圾检测算法。运用数据增强技术改善训练过程中因样本不足而导致的过拟合问题,并利用迁移学习的方法训练出水面漂浮垃圾目标检测模型。结果表明,与传统的ViBe背景建模算法相比,所提算法能对水面漂浮垃圾进行分类,并标记出垃圾位置,对垃圾的检测准确率高达93%,能完全克服水波、波光等外界干扰。 展开更多
关键词 卷积神经网络 数据增强 迁移学习 漂浮垃圾检测
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