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缺血性糖尿病足溃疡中ncRNAs作用机制的研究进展
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作者 张维扬 明明 +1 位作者 杜伟鹏 郭小勇 《内蒙古医学杂志》 2025年第3期329-332,共4页
随着糖尿病(DM)患病人数不断增加,糖尿病足溃疡(diabetic foot ulcer,DFU)患者数也呈逐渐增加的趋势,而下肢动脉病变对DFU有很大影响。大量研究表明,ncRNAs与糖尿病足合并下肢动脉病变的发生发展关系密切,本文就ncRNAs在糖尿病足合并下... 随着糖尿病(DM)患病人数不断增加,糖尿病足溃疡(diabetic foot ulcer,DFU)患者数也呈逐渐增加的趋势,而下肢动脉病变对DFU有很大影响。大量研究表明,ncRNAs与糖尿病足合并下肢动脉病变的发生发展关系密切,本文就ncRNAs在糖尿病足合并下肢动脉疾病中作用机制的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 糖尿病足溃疡 下肢动脉硬化闭塞 ncrnas
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lncRNA NCRNA00173在骨肉瘤组织中的表达及其临床意义 被引量:5
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作者 潘海霞 杨兰 +1 位作者 胡洪林 白义凤 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期884-888,共5页
目的:探讨lncRNA NCRNA00173在骨肉瘤组织中表达及其临床意义。方法:通过实时荧光定量PCR法检测lncRNA NCRNA00173在54例骨肉瘤组织及癌旁组织标本(收集自四川省人民医院骨科2012年10月至2016年12月手术患者)中的表达,分析其表达的临床... 目的:探讨lncRNA NCRNA00173在骨肉瘤组织中表达及其临床意义。方法:通过实时荧光定量PCR法检测lncRNA NCRNA00173在54例骨肉瘤组织及癌旁组织标本(收集自四川省人民医院骨科2012年10月至2016年12月手术患者)中的表达,分析其表达的临床意义。结果:与癌旁组织比较,lncRNA NCRNA00173在骨肉瘤组织标本中的表达明显降低(1.793±0.158 vs 5.368±0.285,t=10.96,P<0.01)。lncRNA NCRNA00173的表达与疾病分期、淋巴结转移、远处转移、肿瘤分化及生存状态明显相关(均P<0.05),而与患者的性别、年龄无关(均P>0.05);此外,高表达lncRNA NCRNA00173患者的OS及PFS均较低表达者明显延长(P<0.01)。Cox多因素回归模型分析提示,lncRNA NCRNA00173的表达、远处转移及临床分期是骨肉瘤独立的预后因素(P<0.05)。结论:lncRNA NCRNA00173参与调节骨肉瘤的发生发展,可作为潜在的骨肉瘤诊断和预后评估的分子标志物。 展开更多
关键词 lncrna ncrna00173 骨肉瘤 临床意义
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单核细胞增生李斯特菌ncRNA rli60基因缺失株的构建研究 被引量:3
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作者 彭叶龙 乔军 +4 位作者 孟庆玲 谢堃 赵海龙 宋雪梅 陈创夫 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2014年第2期148-152,共5页
为了构建单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)ncRNA rli60基因缺失株,采用基因重叠延伸PCR(SOE-PCR)的方法成功构建具有氯霉素抗性的pKSV7-Δrli60穿梭质粒,然后电转化至LM-SB5感受态细胞中,在温度和氯霉素的双重选择压力... 为了构建单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)ncRNA rli60基因缺失株,采用基因重叠延伸PCR(SOE-PCR)的方法成功构建具有氯霉素抗性的pKSV7-Δrli60穿梭质粒,然后电转化至LM-SB5感受态细胞中,在温度和氯霉素的双重选择压力下进行同源重组,通过PCR进行重组菌鉴定。结果表明:成功筛选得到遗传性稳定的LM ncRNA rli60基因缺失株,为揭示LM ncRNA rli60基因功能提供了研究材料;同时,为进一步研究其在LM致病性及环境应激中的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 ncrna rli60基因 同源重组 重叠延伸PCR
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lncRNA RAB11B-AS1上调miR-628-3p抑制人胃癌细胞系增殖和迁移 被引量:3
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作者 杨宁波 贾晓东 寇耀 《基础医学与临床》 2021年第12期1762-1766,共5页
目的探讨lncRNA RAB11B-AS1对胃癌细胞增殖、迁移、侵袭和顺铂敏感性的影响及分子机制。方法建立顺铂耐药胃癌细胞系(HGC-27/DDP),将其分为对照组、si-NC组和si-RAB11B-AS1组;四甲基偶氮唑盐比色法(MTT)检测细胞存活率;实时荧光定量PCR(... 目的探讨lncRNA RAB11B-AS1对胃癌细胞增殖、迁移、侵袭和顺铂敏感性的影响及分子机制。方法建立顺铂耐药胃癌细胞系(HGC-27/DDP),将其分为对照组、si-NC组和si-RAB11B-AS1组;四甲基偶氮唑盐比色法(MTT)检测细胞存活率;实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测RAB11B-AS1和miR-628-3p的表达;流式细胞仪检测细胞周期;Transwell小室法检测细胞迁移和侵袭;双荧光素酶报告实验检测RAB11B-AS1和miR-628-3p的靶向关系。结果0.2、0.4 mg/L顺铂处理后HGC-27细胞存活率显著降低(P<0.05),而0~0.4 mg/L的顺铂处理后HGC-27/DDP细胞存活率无统计学意义。HGC-27和HGC-27/DDP细胞中RAB11B-AS1表达水平显著升高(P<0.05),且HGC-27/DDP细胞中RAB11B-AS1表达水平显著高于HGC-27细胞(P<0.05)。lncRNA RAB11B-AS1干扰表达,G0-G1期细胞所占比例显著升高,S期细胞所占比例显著降低(P<0.05);细胞存活率显著降低,迁移、侵袭细胞数显著降低(P<0.05)。RAB11B-AS1靶向调控miR-628-3p。结论LncRNA RAB11B-AS1可通过上调miR-628-3p表达抑制胃癌细胞增殖、迁移、侵袭,并提高癌细胞对顺铂的敏感性。 展开更多
关键词 ncrna RAB11B-AS1 miR-628-3p 胃癌 增殖 顺铂 敏感性
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Research progress of lncRNA and miRNA in hepatic ischemia-reperfusion injury 被引量:7
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作者 Shan-Fei Zhu Wei Yuan +1 位作者 Yong-Liang Du Bai-Lin Wang 《Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International》 SCIE CAS CSCD 2023年第1期45-53,共9页
Background:Hepatic ischemia-reperfusion injury(HIRI)is a common complication of liver surgeries,such as hepatectomy and liver transplantation.In recent years,several non-coding RNAs(nc RNAs)including long non-coding R... Background:Hepatic ischemia-reperfusion injury(HIRI)is a common complication of liver surgeries,such as hepatectomy and liver transplantation.In recent years,several non-coding RNAs(nc RNAs)including long non-coding RNAs(lnc RNAs)and micro RNAs(mi RNAs)have been identified as factors involved in the pathological progression of HIRI.In this review,we summarized the latest research on lnc RNAs,mi RNAs and the lnc RNA-mi RNA regulatory networks in HIRI.Data sources:The Pub Med and Web of Science databases were searched for articles published up to December 2021 using the following keywords:“hepatic ischemia-reperfusion injury”,“lnc RNA”,“long noncoding RNA”,“mi RNA”and“micro RNA”.The bibliography of the selected articles was manually screened to identify additional studies.Results:The mechanism of HIRI is complex,and involves multiple lnc RNAs and mi RNAs.The roles of lnc RNAs such as AK139328,CCAT1,MALAT1,TUG1 and NEAT1 have been established in HIRI.In addition,numerous mi RNAs are associated with apoptosis,autophagy,oxidative stress and cellular inflammation that accompany HIRI pathogenesis.Based on the literature,we conclude that four lnc RNA-mi RNA regulatory networks mediate the pathological progression of HIRI.Furthermore,the expression levels of some lnc RNAs and mi RNAs undergo significant changes during the progression of HIRI,and thus are potential prognostic markers and therapeutic targets.Conclusions:Complex lnc RNA-mi RNA-m RNA networks regulate HIRI progression through mutual activation and antagonism.It is necessary to screen for more HIRI-associated lnc RNAs and mi RNAs in order to identify novel therapeutic targets. 展开更多
关键词 ncrna lncrna MIRNA Hepatic ischemia-reperfusion injury Research progress
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ncRNA层面病毒入侵宿主机制的研究
6
作者 王红 张纯瑞 +3 位作者 王利强 胡振宇 黄俞玮 李孔宁 《哈尔滨医科大学学报》 CAS 2016年第6期501-503,共3页
目的从非编码RNA(ncRNA)的层面解析病毒入侵、病毒与宿主之间相互作用的机制。方法基于病毒相关蛋白质/ncRNA互作网络,计算网络中节点的度和介数,并采用威尔森秩和检验来比较与背景网络度和介数的显著差异情况。结果病毒相关的人类蛋白... 目的从非编码RNA(ncRNA)的层面解析病毒入侵、病毒与宿主之间相互作用的机制。方法基于病毒相关蛋白质/ncRNA互作网络,计算网络中节点的度和介数,并采用威尔森秩和检验来比较与背景网络度和介数的显著差异情况。结果病毒相关的人类蛋白质和ncRNA在各自相应的网络和细胞死亡网络中为hub节点和bottleneck节点。那些既被病毒蛋白质又被病毒ncRNA靶向作用的人类蛋白质有着更高的度和介数,并且显著地富集在细胞死亡进程上。结论人类蛋白质和ncRNA都对病毒入侵起着重要的作用,病毒入侵宿主会影响人类宿主细胞中重要的蛋白质和ncRNA。 展开更多
关键词 病毒 ncrna 细胞死亡
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一种基于模糊神经网络的ncRNA基因预测方法
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作者 宋丹丹 邓志东 《东南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第S1期139-145,共7页
提出了一种基于模糊神经网络的ncRNA基因预测方法.该方法由预处理、具有结构学习的模糊神经网络预测器、后处理3个部分组成.预处理模块将比对后的输入序列进行滑动窗处理,并顺序提取有效的特征信息.模糊神经网络预测器采用了基于Takagi-... 提出了一种基于模糊神经网络的ncRNA基因预测方法.该方法由预处理、具有结构学习的模糊神经网络预测器、后处理3个部分组成.预处理模块将比对后的输入序列进行滑动窗处理,并顺序提取有效的特征信息.模糊神经网络预测器采用了基于Takagi-Sugeno模型的5层模糊神经网络结构,通过输入层、模糊化层、点火强度层、归一化点火强度层、输出层的计算,得到预测结果;并进一步给出了一种模糊神经网络的结构学习算法,可有效地降低参数空间的维度,提高计算效率,并避免过学习情况的产生.后处理过程可对有交叠的预测结果进行拼接.实验结果表明,较之其他预测工具,本方法的ncRNA基因预测精度有所提高. 展开更多
关键词 ncrna基因预测 模糊神经网络 结构学习
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ncRNA的功能和机制研究策略
8
作者 范双莉 王晓静 任亚丽 《科技资讯》 2017年第35期220-220,222,共2页
在哺乳动物的基因组中发现有大量的非编码RNA(ncRNAs),这些ncRNAs中有很多是RNA加工的副产物,它们中很多在细胞中发挥各种调控功能。ncRNAs的原序列和二级结构中信息量巨大,使得它们非常适合作为分子间相互作用的支架。此外,在不进行特... 在哺乳动物的基因组中发现有大量的非编码RNA(ncRNAs),这些ncRNAs中有很多是RNA加工的副产物,它们中很多在细胞中发挥各种调控功能。ncRNAs的原序列和二级结构中信息量巨大,使得它们非常适合作为分子间相互作用的支架。此外,在不进行特定的相互作用时,它们的功能可被丰富的核酸酶严格控制。现对未来ncRNA功能和机制的研究策略进行讨论和综述。 展开更多
关键词 RNA ncrna 生物功能 调控机制 功能基因组学
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RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP)与非编码RNA(ncRNA)调控的研究进展 被引量:6
9
作者 丁超 张兰 +1 位作者 曹洁 于文强 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期256-261,共6页
RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRP)是一类以单链RNA为模板合成互补RNA链的聚合酶。根据其来源可分为病毒RdRP和细胞RdRP,病毒RdRP对病毒基因组复制及病毒引起的宿主免疫反应有重要作用,宿主细胞RdRP主要参与RNA干... RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRP)是一类以单链RNA为模板合成互补RNA链的聚合酶。根据其来源可分为病毒RdRP和细胞RdRP,病毒RdRP对病毒基因组复制及病毒引起的宿主免疫反应有重要作用,宿主细胞RdRP主要参与RNA干扰(RNA interference,RNAi)现象。越来越多研究证明RdRP的功能与非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)密不可分,本文对病毒RdRP、细胞RdRP与ncRNA调控之间的关系作了较详细的阐述,同时对丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)诱发的肝癌机制提出新的观点。 展开更多
关键词 RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP) 非编码RNA(ncrna) RNA干扰(RNAI) 丙型肝炎病毒(HCV)
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lncRNAs功能注释和预测 被引量:8
10
作者 余铖亮 骆亮 廖奇 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期239-243,共5页
随着测序技术的发展,在各种哺乳动物中发现越来越多的长非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs),但是大部分lncRNAs的功能却未知.鉴于lncRNAs在众多生物过程如免疫反应、发育和基因印迹中表现出对蛋白编码基因和其它非编码RNAs的重... 随着测序技术的发展,在各种哺乳动物中发现越来越多的长非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs),但是大部分lncRNAs的功能却未知.鉴于lncRNAs在众多生物过程如免疫反应、发育和基因印迹中表现出对蛋白编码基因和其它非编码RNAs的重要调节作用,对lncRNAs的功能研究也成为生物学家和生物信息学家研究的热点.其中,功能注释和预测是目前研究lncRNAs功能的主要方法之一.本文主要对lncRNAs功能注释和预测方法的研究进展作一综述,包括以下几个方面:基于共表达网络的方法、基于miRNAs的方法、基于蛋白质结合的方法、基于表观遗传修饰的方法以及基于ceRNA网络的方法.为进一步研究lncRNAs的功能提供参考,同时为开发更加有效的注释或预测方法提供线索. 展开更多
关键词 长非编码RNAs(1ncrnas) 功能注释 生物信息学
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与哺乳动物配子发生相关的ncRNA研究进展 被引量:1
11
作者 陈薪全 甘麦邻 +5 位作者 沈林園 赵叶 陈蕾 张顺华 牛丽莉 朱砺 《家畜生态学报》 北大核心 2022年第12期1-7,14,共8页
哺乳动物的配子包括精子和卵子,配子发生过程包括原始生殖细胞的形成、增殖、迁移到生殖嵴以及分化为成熟的配子,这一系列复杂的生物学过程受到相关基因和转录因子的精细调控。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类不具有蛋白编码能力... 哺乳动物的配子包括精子和卵子,配子发生过程包括原始生殖细胞的形成、增殖、迁移到生殖嵴以及分化为成熟的配子,这一系列复杂的生物学过程受到相关基因和转录因子的精细调控。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类不具有蛋白编码能力的RNA分子,可在表观遗传方面调控基因表达,进而发挥生物学功能。作为近年来的研究热点,已有大量研究表明ncRNA参与配子发生过程,并可能会进一步影响受精卵的形成和早期胚胎发育过程。该文结合近年来的研究,综述了ncRNA在配子发生过程中的作用,以及相关ncRNA对早期胚胎发育、不育症相关疾病的影响。 展开更多
关键词 配子 ncrna 精子发生 卵子发生 早期胚胎发育
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利用不同G+C含量细菌基因组评估细菌ncRNA基因预测工具 被引量:1
12
作者 刘林梦 温权 欧竑宇 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2583-2592,共10页
【目的】为识别已完成全测序细菌基因组中的ncRNA基因,对3个常用ncRNA预测工具s RNAPredict、PORTRAIT和s RNAscanner进行评估。【方法】选择了细菌ncRNA数据库BSRD收录的含有已知ncRNA基因数目大于30的9个细菌基因组,并按基因组G+C含... 【目的】为识别已完成全测序细菌基因组中的ncRNA基因,对3个常用ncRNA预测工具s RNAPredict、PORTRAIT和s RNAscanner进行评估。【方法】选择了细菌ncRNA数据库BSRD收录的含有已知ncRNA基因数目大于30的9个细菌基因组,并按基因组G+C含量进行分类,比较s RNAPredict和PORTRAIT工具的预测准确性。提取不同G+C含量基因组中ncRNA基因转录起始和终止区的序列特征,对s RNAscanner预测结果进行评估。【结果】s RNAPredict对细菌ncRNA基因的预测特异性和阳性检出率均高于PORTRAIT,而敏感性则较差;两种工具预测效果均随基因组G+C含量不同而产生明显变化。在不同G+C含量的细菌基因组中,ncRNA基因启动子和终止子区域的序列特征有明显差异。利用这些序列特征能提高s RNAscanner预测ncRNA基因的平均水平。【结论】3种ncRNA基因工具预测效果随基因组G+C含量变化而不同。不同G+C含量基因组中ncRNA基因的转录起始和终止区特征可作为ncRNA基因预测的重要参数之一。 展开更多
关键词 细菌ncrna基因 基因组G+C含量 转录起始区域 转录终止区域 预测
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ncRNA调控细胞程序性死亡影响动脉粥样硬化的研究进展 被引量:1
13
作者 苏红彤 邓芷琳 +1 位作者 李靖 曲鹏 《中国动脉硬化杂志》 CAS 2024年第2期93-101,共9页
动脉粥样硬化(As)是许多心血管疾病(CVD)的发病基础,巨噬细胞、平滑肌细胞和内皮细胞是参与As病变的主要细胞,诸多研究证实上述细胞程序性死亡(PCD)可影响As的发生发展,调控上述PCD可能成为防治As的关键。近年来许多研究发现非编码RNA(n... 动脉粥样硬化(As)是许多心血管疾病(CVD)的发病基础,巨噬细胞、平滑肌细胞和内皮细胞是参与As病变的主要细胞,诸多研究证实上述细胞程序性死亡(PCD)可影响As的发生发展,调控上述PCD可能成为防治As的关键。近年来许多研究发现非编码RNA(ncRNA)通过调控相关因子参与PCD,如凋亡、自噬、焦亡、坏死性凋亡、铁死亡和铜死亡等。该文对ncRNA通过调控PCD影响As的机制展开讨论,为As的治疗提供新思路。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 ncrna 细胞程序性死亡
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肝癌组织LncRNA TINCR和ANRIL表达水平及其与患者预后的关系 被引量:11
14
作者 张帅 朱佳 +4 位作者 吴相柏 陈巧 魏亚元 张晓平 许海 《热带医学杂志》 CAS 2019年第1期55-59,共5页
目的探讨肝癌组织长链非编码RNA(LncRNA)组织分化诱导非蛋白质编码RNA(TINCR)和细胞周期激酶抑制因子4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)表达水平及其与患者预后的关系。方法选取2010年7月至2012年11月本院进行手术切除的68例肝癌患者的肿... 目的探讨肝癌组织长链非编码RNA(LncRNA)组织分化诱导非蛋白质编码RNA(TINCR)和细胞周期激酶抑制因子4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)表达水平及其与患者预后的关系。方法选取2010年7月至2012年11月本院进行手术切除的68例肝癌患者的肿瘤组织及癌旁组织,采用RT-PCR方法检测肝癌组织和癌旁组组中LncRNA TINCR和ANRIL相对表达量,分析LncRNA TINCR和ANRIL表达与患者临床病理特征及生存率的关系。结果肝癌组织中TINCR和ANRIL相对表达量均显著高于癌旁组织(P<0.05);TINCR表达量与患者肿瘤大小、肿瘤分化程度及TNM分期有关,ANRIL表达量与患者肿瘤大小和TNM分期有关;TINCR高表达患者无瘤生存率及5年总生存率均显著低于TINCR低表达患者(P<0.05);ANRIL高表达患者无瘤生存率及5年总生存率均显著低于ANRIL低表达患者(P<0.05);肿瘤大小、TINCR高表达和ANRIL高表达是影响肝癌患者预后的危险因素。结论肝癌组织中TINCR和ANRIL表达显著上调,可能参与肿瘤进展过程,与患者预后密切相关。 展开更多
关键词 肝癌 长链非编码RNA 组织分化诱导非蛋白质编码RNA 细胞周期激酶抑制因子4基因座中反义非编码RNA
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喉鳞癌中CircRNA、LncRNA、miRNA调控网络构建及功能研究 被引量:3
15
作者 王微 孙亚男 《现代肿瘤医学》 CAS 2020年第5期698-701,共4页
目的:探讨喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中CircRNA、LncRNA、miRNA之间的共表达调控网络。方法:选取哈尔滨医科大学附属第二医院耳鼻咽喉头颈外科喉鳞状细胞癌患者标本,使用微阵列芯片技术对9对喉癌组织及其对... 目的:探讨喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中CircRNA、LncRNA、miRNA之间的共表达调控网络。方法:选取哈尔滨医科大学附属第二医院耳鼻咽喉头颈外科喉鳞状细胞癌患者标本,使用微阵列芯片技术对9对喉癌组织及其对应的癌旁非癌组织进行测序。筛选出差异表达的LncRNA、CircRNA、mRNA,通过TargetScan和miRanda算法对差异表达的RNA进行分析,构建出喉鳞状细胞癌的竞争内源性RNA(endogenous competitive RNA,ceRNA)网络。结果:发现8个LncRNA、6个CircRNA和13个mRNA以miR-107为中心形成共表达调控网络。6个LncRNA、3个CircRNA和20个mRNA以miR-19a-3p为中心形成共表达调控网络。结论:构建CircRNA/LncRNA、miRNA、mRNA之间的调控网络,为喉癌的后续治疗提供参考依据。 展开更多
关键词 喉鳞状细胞癌 非编码RNA 内源竞争性RNA 调控网络
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NORHA,a novel follicular atresia-related lncRNA,promotes porcine granulosa cell apoptosis via the miR-183-96-182 cluster and FoxO1 axis 被引量:2
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作者 Wang Yao Zengxiang Pan +3 位作者 Xing Du Jinbi Zhang Honglin Liu Qifa Li 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2022年第2期441-457,共17页
Background:Follicular atresia has been shown to be strongly associated with a low follicle utilization rate and female infertility,which are regulated by many factors such as microRNAs(miRNAs),which constitute a class... Background:Follicular atresia has been shown to be strongly associated with a low follicle utilization rate and female infertility,which are regulated by many factors such as microRNAs(miRNAs),which constitute a class of noncoding RNAs(ncRNAs).However,little is known about long noncoding RNAs(lncRNAs),which constitute another ncRNA family that regulate follicular atresia.Results:A total of 77 differentially expressed lncRNAs,including 67 upregulated and 10 downregulated lncRNAs,were identified in early atretic follicles compared to healthy follicles by RNA-Sequencing.We characterized a noncoding RNA that was highly expressed in atretic follicles(NORHA).As an intergenic lncRNA,NORHA was one of the upregulated lncRNAs identified in the atretic follicles.To determine NORHA function,RT-PCR,flow cytometry and western blotting were performed,and the results showed that NORHA was involved in follicular atresia by influencing GC apoptosis with or without oxidative stress.To determine the mechanism of action,bioinformatics analysis,luciferase reporter assay and RNA immunoprecipitation assay were performed,and the results showed that NORHA acted as a‘sponge’,that directly bound to the miR-183-96-182 cluster,and thus prevented its targeted inhibition of FoxO1,a major sensor and effector of oxidative stress.Conclusions:We provide a comprehensive perspective of lncRNA regulation of follicular atresia,and demonstrate that NORHA,a novel lncRNA related to follicular atresia,induces GC apoptosis by influencing the activities of the miR-183-96-182 cluster and FoxO1 axis. 展开更多
关键词 Follicular atresia Granulosa cell apoptosis ncrna NORHA Oxidative stress
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细菌ncRNA基因预测工具的评估
17
作者 金城 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2582-2582,共1页
细菌非编码RNA(ncRNA)在RNA的转录调节、染色体复制、RNA加工与修饰、m RNA翻译与稳定性、蛋白质降解与转运以及细菌感染等许多过程中都发挥着重要作用[1]。目前,基于实验鉴定的细菌ncRNA,已开发出不同的生物信息学预测方法[3-6],其中... 细菌非编码RNA(ncRNA)在RNA的转录调节、染色体复制、RNA加工与修饰、m RNA翻译与稳定性、蛋白质降解与转运以及细菌感染等许多过程中都发挥着重要作用[1]。目前,基于实验鉴定的细菌ncRNA,已开发出不同的生物信息学预测方法[3-6],其中比较基因组学和转录单元预测方法是目前最常用的方法。比较基因组学和转录单元预测方法的结合使用,具有较高的特异性,但大多数方法的普适性较低。 展开更多
关键词 细菌ncrna基因 G+C含量 预测
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外泌体ncRNAs在脂肪细胞成脂及相关代谢疾病中作用的研究进展
18
作者 陈永芳 徐兴昱 +3 位作者 刘壮 张琳 邢华 潘士锋 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2022年第9期126-133,共8页
外泌体是一种几乎所有细胞均可分泌的、直径在30~200 nm的微小囊泡,具有脂质双层膜结构,内含多种生物活性分子(蛋白质、脂质和RNAs等),可对生理和病理状态下多种生物学过程发挥重要调控作用。外泌体非编码RNA(ncRNAs)在脂肪组织与机体... 外泌体是一种几乎所有细胞均可分泌的、直径在30~200 nm的微小囊泡,具有脂质双层膜结构,内含多种生物活性分子(蛋白质、脂质和RNAs等),可对生理和病理状态下多种生物学过程发挥重要调控作用。外泌体非编码RNA(ncRNAs)在脂肪组织与机体其他组织信息交流过程中发挥关键作用。本文针对外泌体的生物合成与功能、脂肪相关组织外泌体携带的ncRNAs(miRNA、lncRNA和circRNA等)在脂肪细胞成脂分化中的调控作用以及脂肪源性外泌体携带的ncRNAs与胰岛素抵抗间的关系等几个方面进行了阐述,为揭示外泌体携带的ncRNAs在脂肪组织与机体相关组织互作中的作用,进而为阐明肥胖及相关代谢性疾病的病因以及筛选新的治疗靶点提供参考依据。 展开更多
关键词 外泌体 ncrnas 脂肪组织 脂肪相关组织 细胞间通讯
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lncRNA NCRNA00173靶向miR-765对骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响的实验研究 被引量:1
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作者 吴昌强 韦敏 +1 位作者 郑一鸣 林正坚 《广西医科大学学报》 CAS 2021年第9期1748-1754,共7页
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)NCRNA00173是否通过靶向调控miR-765影响骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭。方法:采用实时荧光定量PCR(q PCR)检测骨肉瘤细胞U2-OS、Saos-2、SJSA-1和SOSP-9607以及人成骨细胞hFOB1.19中NCRNA00173和miR-765... 目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)NCRNA00173是否通过靶向调控miR-765影响骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭。方法:采用实时荧光定量PCR(q PCR)检测骨肉瘤细胞U2-OS、Saos-2、SJSA-1和SOSP-9607以及人成骨细胞hFOB1.19中NCRNA00173和miR-765的表达情况。选择骨肉瘤U2-OS细胞为研究对象,将细胞随机分为Con组(正常培养的U2-OS细胞)、pcDNA组(转染空载体质粒)和NCRNA00173组(转染pcDNA-NCRNA00173过表达载体质粒)。qPCR检测NCRNA00173和miR-765的表达变化;双荧光素酶报告基因实验检测NCRNA00173是否靶向miR-765;分别采用噻唑蓝(MTT)法、克隆形成实验、划痕实验和Transwell实验检测过表达NCRNA00173对U2-OS细胞增殖、克隆形成、迁移和侵袭能力的影响,蛋白质印迹(Western blotting)检测增殖细胞核抗原(PCNA)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)和基质金属蛋白酶-9(MMP-9)的表达。结果:与人成骨细胞h FOB1.19相比,骨肉瘤细胞U2-OS、Saos-2、SJSA-1和SOSP-9607中NCRNA00173的表达明显下调(P<0.05),而miR-765的表达明显上调(P<0.05);与Con组和pcDNA组相比,NCRNA00173组细胞中NCRNA00173的表达显著升高(P<0.05),而miR-765、PCNA、MMP-2和MMP-9的表达显著降低(P<0.05),细胞增殖和克隆形成能力降低(P<0.05),划痕愈合率明显降低(P<0.05),迁移和侵袭细胞数明显减少(P<0.05);双荧光素酶报告基因实验证实NCRNA00173可靶向结合miR-765。结论:NCRNA00173可通过靶向miR-765影响骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 lncrna ncrna00173 miR-765 骨肉瘤细胞 增殖 迁移
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一种新的基于两序列比对的ncRNA基因识别模型
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作者 管乃洋 骆志刚 +1 位作者 严繁妹 王金华 《生物信息学》 2007年第3期121-124,共4页
利用上下文相关隐Markov模型建立ncRNA基因基本二级结构模型,从两序列比对结果中提取序列相似性信息,并把该信息引入基本的上下文相关Markov模型中,从而构建出新的ncRNA基因识别模型。
关键词 生物信息学 非编码RNA 隐Mdcov模型 基因识别
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