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龙眼胚性愈伤组织维生素C过氧化物酶基因(apx)及NADH脱氢酶基因(nad2)部分序列的克隆 被引量：8
1
作者 王凤华 赖钟雄 +1 位作者 郑金贵 吕柳新 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期45-48,共4页
　采用PCR技术从龙眼胚性愈伤组织中扩增出维生素C过氧化物酶基因 (apx)的部分cDNA序列longan1及NADH脱氢酶基因(nad2)的部分cDNA序列longan31,其中longan31是首次从体胚中克隆到的NADH脱氢酶基因(nad2).杂交结果显示,longan1与胚性愈... 　采用PCR技术从龙眼胚性愈伤组织中扩增出维生素C过氧化物酶基因 (apx)的部分cDNA序列longan1及NADH脱氢酶基因(nad2)的部分cDNA序列longan31,其中longan31是首次从体胚中克隆到的NADH脱氢酶基因(nad2).杂交结果显示,longan1与胚性愈伤组织和球形胚的RNA具有明显杂交信号,说明longan1在胚性愈伤组织和球形胚阶段特异表达. 图 3参 展开更多
关键词 龙眼 体细胞胚胎发生 APX nad2
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皱纹盘鲍和九孔鲍遗传差异nad2-cox1分析及鲍属系统发育 被引量：1
2
作者 陈丽 申欣 +2 位作者 孟学平 王兴强 杨玉钗 《广东海洋大学学报》 CAS 2015年第1期28-34,共7页
基于nad2-cox1核苷酸序列分析了皱纹盘鲍和九孔鲍3个养殖群体的遗传差异,基于cox1分析了鲍属19种鲍的系统发育关系。共获得625 bp的DNA片段,33个片段共检测到17种单倍型,其中皱纹盘鲍2个群体26个个体15种单倍型,九孔鲍7个个体2种单倍型... 基于nad2-cox1核苷酸序列分析了皱纹盘鲍和九孔鲍3个养殖群体的遗传差异,基于cox1分析了鲍属19种鲍的系统发育关系。共获得625 bp的DNA片段,33个片段共检测到17种单倍型,其中皱纹盘鲍2个群体26个个体15种单倍型,九孔鲍7个个体2种单倍型。皱纹盘鲍大连群体与厦门群体有6种交叉共享单倍型,皱纹盘鲍与九孔鲍之间无共享单倍型。皱纹盘鲍群体内个体间的遗传距离（D）为0.002~0.015,九孔鲍个体间D值为0.003,两种鲍间的遗传距离为0.300~0.320。鲍属系统发育分析显示,皱纹盘鲍与日本鲍、盘鲍聚为一支（D值为0.000~0.004）,而后与大鲍聚在一起（支持率为100﹪）（D值为0.018）,九孔鲍、细纹九孔鲍、杂色鲍聚为一支（D值为0）。九孔鲍与马蹄螺科的Diloma bicanaliculata聚为一支,白鲍、黑鲍、红鲍、北国鲍、堪察加鲍聚为一支（支持率87﹪）。 展开更多
关键词 皱纹盘鲍 九孔鲍 nad2-cox1
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鸡蛔虫凤阳株线粒体ATP 6、NAD 1和NAD 2基因遗传变异分析
3
作者 缪欣怡 陈玉晴 +6 位作者 石家鑫 潘言迪 方林克 黄阳 李文超 顾有方 刘欣超 《动物医学进展》 北大核心 2025年第11期87-94,共8页
为了探究鸡蛔虫的遗传变异情况,对分离自安徽省凤阳县的2株鸡蛔虫线粒体ATP合成酶F0亚单位6(ATP 6)基因、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅰ(NAD 1)基因和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅱ(NAD 2)基因序列进行PCR扩增和测序,用DNAS... 为了探究鸡蛔虫的遗传变异情况,对分离自安徽省凤阳县的2株鸡蛔虫线粒体ATP合成酶F0亚单位6(ATP 6)基因、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅰ(NAD 1)基因和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅱ(NAD 2)基因序列进行PCR扩增和测序,用DNAStar和Dnasp6.0等软件分析3个基因的核酸序列,并用MEGA11.0构建系统进化树。结果显示,鸡蛔虫凤阳分离株ATP 6、NAD 1和NAD 2基因的开放阅读框片段大小分别为597 bp、876 bp和843 bp,2株鸡蛔虫3个基因的核苷酸同源性分别为99.0%、98.1%和97.8%。遗传距离分析显示,鸡蛔虫凤阳分离株的ATP 6、NAD 1和NAD 2基因与其他鸡蛔虫同源基因的遗传距离均小于或者等于0.024,3个基因分别检测到13、7和4个单倍型,总的单倍型多样性分别为0.971、0.819和0.900,核苷酸多样性分别为0.01141、0.00665和0.01096。以ATP 6、NAD 1和NAD 23个基因序列构建的种系进化树均显示,鸡蛔虫凤阳分离株与其他已知鸡蛔虫分离株聚类在一个分支,其次与鸽蛔虫聚类成禽蛔科支系,与其他蛔虫所属的分支均相距较远,能够鉴别不同种的蛔虫。研究表明,鸡蛔虫凤阳分离株存在遗传变异,但程度较低,且NAD 2基因比ATP 6、NAD 1基因更适合作为鸡蛔虫遗传变异研究的分子标记。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 ATP 6基因 NAD 1基因 NAD 2基因 遗传变异
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甘肃省甘南州家畜细粒棘球蚴病例特征及其病原遗传多样性分析 被引量：1
4
作者 严斌昌 米荣升 +3 位作者 邵云全 黄玉富 石玉桂 赵宏 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第9期1014-1019,共6页
目的分析甘肃省甘南州细粒棘球蚴(Echinococcus granulosus)基因型、遗传多样性及群体间遗传差异,为甘南州细粒棘球溯源及制定预防控制策略提供参考。方法收集2016-2022年甘南州玛曲县及碌曲县屠宰场家畜肝脏或肺脏感染的囊型棘球蚴病(c... 目的分析甘肃省甘南州细粒棘球蚴(Echinococcus granulosus)基因型、遗传多样性及群体间遗传差异,为甘南州细粒棘球溯源及制定预防控制策略提供参考。方法收集2016-2022年甘南州玛曲县及碌曲县屠宰场家畜肝脏或肺脏感染的囊型棘球蚴病(cystic echinococcosis,CE)包囊,提取包囊基因组DNA,PCR扩增线粒体NADH脱氢酶2(nad2)基因,测序剪接后进行Blast比对,DnaSPv5软件分析nad2序列的基因型,利用Mega11软件采用邻接法构建系统进化树,再使用PopArt 1.7软件建立细粒棘球蚴nad2基因网络图,最后使用Arlequin 3.5.2.2分析nad2不同群体间的遗传差异。结果PCR结果显示,家畜CE感染率为9.97%(64/642),绵羊(9.14%,48/525)和牛(13.68%,16/117)感染率差异极显著(χ^(2)=175.6,P<0.01)。nad2基因条带大小为882 bp,将测序结果与GenBank中发表的细粒棘球蚴的序列进行比对,相似度均达到99%以上。序列分析结果显示,分为G1(占90.63%,58/64)和G3(占9.37%,6/64)两个基因型,序列相似度可达100%;共有12个单倍型,其中Hap1(占50.00%,32/64)是最主要的单倍型,Hap2(占14.06%,9/64)次之,其中Hap3是和Hap4属于G3基因型(占9.37%,6/64)。系统发生树结果显示,G1和G3基因型处在两个小的分支上,在基因网络图中以Hap1单倍型为中心,其他11个单倍型呈散射状分布;序列单倍型多样性范围为0.7086~0.7706,核苷酸多样性范围为0.00321~0.00452。甘南州两个县细粒棘球蚴种群田岛检验(Tajima's D)均为负值,表明甘南州的细粒棘球蚴种群处于扩张或净化选择的趋势,中性检验(Fu's F)推测两个县的细粒棘球蚴种群也处于扩张趋势,且存在一些特有的基因型,FST结果表明,甘南州细粒棘球蚴不同种群间遗传分化差异不显著(P>0.05)。结论本研究发现甘南州家畜表现出较高的遗传多样性,并处于扩张趋势,存在地区特有的单倍型。共有G1和G3两个基因型,12个单倍型,其中Hap1占50%,其近缘单倍型在全世界均有分布,是甘南州乃至其他主要流行区的主要致病单倍型。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 囊型棘球蚴病 甘肃省甘南州 nad2基因 基因型 遗传多样性
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辣椒线粒体基因转录本编辑位点研究 被引量：4
5
作者 吴智明 程蛟文 +2 位作者 唐鑫 崔俊杰 胡开林 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期49-53,共5页
以辣椒细胞质雄性不育系北A及其相应保持系北B为材料,比较分析了nad2、atpA和cob 3个线粒体基因转录本的编辑位点。结果表明,atpA基因转录本在不育系与保持系中都未发生编辑。nad2基因在不育系中的编辑位点共有10处,与保持系相比增加了... 以辣椒细胞质雄性不育系北A及其相应保持系北B为材料,比较分析了nad2、atpA和cob 3个线粒体基因转录本的编辑位点。结果表明,atpA基因转录本在不育系与保持系中都未发生编辑。nad2基因在不育系中的编辑位点共有10处,与保持系相比增加了3处非C-U的特异编辑位点。cob基因在不育系与保持系中的编辑位点都有6处,除5处共同的C-U编辑外,不育系和保持系各有1处U-C和G-U的特异编辑位点。保持系比不育系相应位点的编辑频率偏高。编辑大多改变了编码氨基酸的种类,增加了编码蛋白质的疏水性。推测不育胞质特异的线粒体基因转录本编辑可能与辣椒细胞质雄性不育有关。 展开更多
关键词 辣椒 细胞质雄性不育 nad2 COB RNA编辑
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新疆新源县多房棘球蚴病病例特征及其病原基因多态性分析 被引量：1
6
作者 才仁 任远 +4 位作者 米荣升 郭刚 齐文静 张壮志 郭宝平 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CSCD 北大核心 2022年第2期181-186,共6页
目的了解新疆新源县人群多房棘球蚴病(AE)病例特征及其病原基因多态性情况,为制定AE预防控制策略提供参考。方法收集2016—2020年新疆医科大学第一附属医院生物样品库中新源县AE患者的病例信息及其手术切除的肝脏病灶样品,提取肝脏病灶... 目的了解新疆新源县人群多房棘球蚴病(AE)病例特征及其病原基因多态性情况,为制定AE预防控制策略提供参考。方法收集2016—2020年新疆医科大学第一附属医院生物样品库中新源县AE患者的病例信息及其手术切除的肝脏病灶样品,提取肝脏病灶样品基因组DNA,PCR扩增线粒体NADH脱氢酶2(nad2)基因并测序,PCR产物经测序剪接后进行BLAST比对,用MEGA10.0软件采用邻接法构建系统进化树,DnaSPv5软件分析扩增序列的基因型,Network10.0软件制作nad2基因型网络图。结果共收集AE病例28例,其中农区7例,巩乃斯河两岸流域21例;男性17例,女性11例,二者差异无统计学意义(χ^(2)=0.704,P>0.05);民族分布中,汉族12例、哈萨克族11例、维吾尔族3例、蒙古族1例、其他民族1例;职业分布中以农牧民为主,占92.86%(26/28),其他职业仅占7.14%(2/28),不同职业间病例数差异有统计学意义(χ^(2)=3.89,P<0.05);年龄分布中以20~49岁年龄组为主,占78.57%(22/28),其他年龄组占21.43%(6/28),不同年龄组间病例数差异无统计学意义(χ^(2)=0.418,P>0.05)。25份多房棘球蚴肝组织病灶样品PCR扩增出大小约1031 bp的片段,与预期大小一致,另3份未扩增出条带。序列比对结果显示,25条序列分属H1、H2、H3和H4等4个基因型,其中H1为主要基因型(占72.0%,18/25),与哈萨克斯坦(GenBank登录号AB461406)分离株序列一致性为100%。系统进化树结果显示,新源县病例分离株的4个基因型与波兰(GenBank登录号KY205700)和哈萨克斯坦(GenBank登录号AB461406)分离株在同一条分支上,但与法国(GenBank登录号AB461404)、奥地利(GenBank登录号AB461403)、加拿大(GenBank登录号JF751036)、美国阿拉斯加(GenBank登录号MT429275)、美国印第安纳(GenBank登录号AB461409)及中国内蒙古(GenBank登录号AB461411)分离株亲缘关系较远。基因型网络图结果显示,以H1为中心,H2、H3、H4、中国四川,波兰、加拿大及日本分离株呈散射状分布,表明这些分离株均与H1亲缘关系较近,但与法国、奥地利、加拿大,美国阿拉斯加等序列不在同一分支,亲缘关系较远。结论本研究分析的28例AE患者主要为汉族和哈萨克族,农牧民占比较高,AE患者样品共有4个基因型,其中H1属新源县主要基因型。 展开更多
关键词 多房棘球蚴病 新源县 nad2基因 基因型
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新疆乌恰县人体泡球蚴线粒体DNA分析 被引量：3
7
作者 郑雪婷 吴川川 +5 位作者 冉博 邵英梅 温浩 况玲 李军 张文宝 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第2期151-154,168,共5页
目的通过线粒体DNA测序初步确定新疆乌恰县多房棘球蚴的来源。方法新疆维吾尔自治区南疆乌恰县泡球蚴病患者5例,采集其病灶组织,提取DNA,PCR扩增多房棘球绦虫线粒体DNA Nad2序列,并与已发表的泡球蚴线粒体DNA Nad2序列进行序列比对和系... 目的通过线粒体DNA测序初步确定新疆乌恰县多房棘球蚴的来源。方法新疆维吾尔自治区南疆乌恰县泡球蚴病患者5例,采集其病灶组织,提取DNA,PCR扩增多房棘球绦虫线粒体DNA Nad2序列,并与已发表的泡球蚴线粒体DNA Nad2序列进行序列比对和系统进化分析。结果新疆南疆乌恰县是一个新的泡型包虫病流行区。Nad2基因序列比对分析及遗传距离矩阵显示,5例AE患者病灶扩增的Em Nad2基因存在差异,人体感染的虫株之间存在低的遗传变异。Nad2基因系统进化树分析表明,这些虫株是亚洲多房棘球绦虫亚型,包含3个单倍体型。结论新疆乌恰县多房棘球绦虫流行株属于亚洲基因型,至少有3种单倍体型。关于乌恰县多房棘球绦虫终末宿主和中间宿主的种群以及其在疾病的传播中的作用需要进一步证实。 展开更多
关键词 多房棘球绦虫 泡球蚴病 线粒体DNA 基因型
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姬松茸多肽提取物对D-半乳糖致衰老模型小鼠的保护作用 被引量：8
8
作者 冯晴霞 闫宇宁 +4 位作者 杨峄 周嘉宁 李乐斌 卢学春 安丽萍 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第7期164-170,共7页
目的:建立姬松茸多肽提取方法,并研究姬松茸多肽提取物对D-半乳糖(D-galactose,D-gal)致衰老模型小鼠的保护作用。方法:硫酸铵沉淀法从姬松茸蛋白酶解物分离多肽,用Sephadex G-50凝胶层析纯化得到姬松茸多肽;将ICR小鼠随机分为4组,即空... 目的:建立姬松茸多肽提取方法,并研究姬松茸多肽提取物对D-半乳糖(D-galactose,D-gal)致衰老模型小鼠的保护作用。方法:硫酸铵沉淀法从姬松茸蛋白酶解物分离多肽,用Sephadex G-50凝胶层析纯化得到姬松茸多肽;将ICR小鼠随机分为4组,即空白组、模型组、阳性药物(吡拉西坦)组和姬松茸多肽组,除空白组外,其余各组小鼠皮下注射300 mg/(kg mb·d)D-gal,建立衰老模型,通过Morris水迷宫和避暗仪测试小鼠学习记忆能力,检测小鼠血清总抗氧化能力(total antioxidant capacity,T-AOC)、丙二醛(malondialdehyde,MDA)浓度、过氧化氢酶(catalase,CAT)活力和活性氧(reactive oxygen species,ROS)水平;苏木精-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色观察小鼠脑组织海马区神经元结构变化;逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)检测脑组织中核因子E2相关因子2(nuclear factor erythroid 2-related factor 2,Nrf2)、NAD(P)H∶醌氧化还原酶(NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1,NQO1)、谷氨酸半胱氨酸连接酶(glutamate-cysteine ligase,GCLM)m RNA相对表达量。结果:Sephadex G-50分离得一个明显色谱峰即为姬松茸多肽提取物;与模型组比较,姬松茸多肽组小鼠水迷宫及避暗潜伏期缩短,错误次数显著减少(P<0.05或P<0.01),血清CAT活力、T-AOC明显提高,ROS水平、MDA浓度显著下降(P<0.05或P<0.01);HE染色结果显示,与模型组相比,姬松茸多肽组小鼠神经元排列紧密,核固缩细胞数量减少;RT-PCR结果显示姬松茸多肽组小鼠脑组织中Nrf2、NQO1、GCLM mRNA相对表达量显著增高(P<0.05)。结论:姬松茸多肽提取物可以对D-gal致衰老模型小鼠产生保护作用,可能与其抗氧化作用相关。 展开更多
关键词 姬松茸多肽提取物 D-半乳糖 衰老 抗氧化 核因子E2相关因子2/NAD(P)H:醌氧化还原酶
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基于线粒体nad1 intron2序列的金钗石斛和混淆品亲缘关系及DNA条形码研究 被引量：1
9
作者 丁鸽 张代臻 +2 位作者 丁小余 蔡照胜 商士斌 《江苏农业科学》 2018年第21期38-41,共4页
为了建立简便、重复性高的金钗石斛的分子鉴别方法,对金钗石斛及其混淆品的亲缘关系进行分析并构建稳定的序列条形码分析,根据金钗石斛及其混淆品的nad1 intron 2序列,寻找其中存在的特异性位点并设计特异性鉴别引物,运用Mega 5. 0等软... 为了建立简便、重复性高的金钗石斛的分子鉴别方法,对金钗石斛及其混淆品的亲缘关系进行分析并构建稳定的序列条形码分析,根据金钗石斛及其混淆品的nad1 intron 2序列,寻找其中存在的特异性位点并设计特异性鉴别引物,运用Mega 5. 0等软件进行遗传关系分析并构建系统进化树。根据序列中存在的单核苷酸多态性(SNP)位点及特异性鉴别引物,可在53℃的复性条件下扩增得到约400 bp的条带,将金钗石斛与其混淆品成功分开;构建的UPGMA树可以将金钗石斛及其混淆品鉴别开。SNP位点及位点特异性PCR具有高效、准确、省时的特点,有广泛的应用前景。同时,通过nad1基因第2内含子可以分析正品与混淆品之间的亲缘关系并成功构建物种分析的条形码序列,为石斛药材的鉴别提供了可靠的科学依据,也为构建更完整的DNA barcoding(DNA条形码)数据库奠定基础。 展开更多
关键词 金钗石斛 nad1基因第2内含子 单核苷酸多态性 亲缘关系 DNA条形码
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