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Development of Multiplex-PCR for Identification of Pasteurella multocida,Haemophilus parasuis and Actinbacillus pleuropneumoniae 被引量:2
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作者 HE Ying ZHAO Ping +2 位作者 CHU Yue-feng GAO Peng-cheng LU Zhong-xin 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2010年第8期25-27,共3页
[Objective]To develop multiplex-PCR for diagnosis of mixed infection caused by Pasteurella multocida(PM),Haomophilus parasuis(HPS)and Actinbaci/lus pleuropneumoniae(App).[Method]PCR method was developed to detect sing... [Objective]To develop multiplex-PCR for diagnosis of mixed infection caused by Pasteurella multocida(PM),Haomophilus parasuis(HPS)and Actinbaci/lus pleuropneumoniae(App).[Method]PCR method was developed to detect single infection caused by PM,HPS or App.The conditions of amplification and primers were optimized,and the multiple-PCR was developed to detect mixed infection of PM,HPS and App.[Result]A 457-bp band,a 821-bp band and a 342-bp band were simultaneously amplified in the one PCR reaction system.The method had high sensitivity and specificity.[Conduslon]The multiple-PCR is successfully developed and can be used for differential diagnosis of PM,HPS and App. 展开更多
关键词 Haemophilus parasuis Pasteurella multocida Actinbacillus pleuropneumoniae multiplex-pcr
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Evaluation of an internal control in a multiplex-PCR assay for sex determination of <i>in vitro</i>-produced bovine embryos
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作者 Fabiana de Almeida Rufino Marcelo Marcondes Seneda +3 位作者 Alice Fernandes Alfieri Katia Cristina Silva-Santos Karina Cristina Puggesi Rubin Amauri Alcindo Alfieri 《Advances in Bioscience and Biotechnology》 2011年第6期456-462,共7页
The use of an internal control in a multiplex-PCR assay for sex determination of In Vitro-produced bovine embryos was evaluated in biopsies of groups of 54 fresh and 44 frozen embryos. The internal controls used were ... The use of an internal control in a multiplex-PCR assay for sex determination of In Vitro-produced bovine embryos was evaluated in biopsies of groups of 54 fresh and 44 frozen embryos. The internal controls used were the primers BOV 1 and BOV 2, which amplify a product with 626 base pairs (bp) of bovine mitochondrial DNA ND5 gene. The primers BRY.4aF and BRY.4aR were used for bovine Y chromosome sequence amplification. The specificity of multiplex- PCR reactions realized in biopsies corresponding to about 20% of each fresh embryo (10 male and 10 female) by means of confirming the sexing in the remaining embryo content (~80%) presented 100% specificity. Amplicons of the internal control and Y chromosome were both amplified until dilution corresponding to 6.25% of total extracted DNA from a male embryo. Sex determination was possible in 53 (98.1%) fresh embryos and 40 (90.9%) frozen embryos. The products related to the Y chromosome and mitochondrial DNA were simultaneously amplified in 34 (63%) fresh embryos and 27 (61.4%) frozen embryos, showing a male embryo. The female sex, distinguished by internal control amplification only, was detected in 19 (35.2%) and 13 (29.5%) biopsies, respectively, of fresh and frozen embryos. In one (1.8%) and four (9.1%) biopsies of fresh and frozen embryos, respectively, neither product was amplified, most likely due to the absence of embryonic cells or the presence of embryonic cells going through apoptosis. The multiplex-PCR assay developed in this work showed avoided the limitation of a lack of an internal standard, and was also sensitive, specific, and efficient in reaction failure identification. This technique shows great potential for use on a commercial scale in routine sex determination of In Vitro-produced embryos. 展开更多
关键词 BOVINE Embryos In VITRO Production SEXING multiplex-pcr
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基于多重PCR的SNP基因分型及其在辣椒种质遗传多样性及关联分析中的应用
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作者 黄月琴 陈学军 +5 位作者 方荣 周坤华 雷刚 李歌歌 方钰 袁欣捷 《植物遗传资源学报》 北大核心 2026年第1期132-151,I0047-I0054,共28页
利用简化基因组测序数据,开发了一套基于多重PCR的SNP基因分型panel,包含170个核心SNP标记。利用该SNP panel及30个表型性状对202份辣椒种质进行分析,解析其遗传多样性,发掘辣椒优良表型性状的关联位点。结果表明,170个核心SNP标记分布... 利用简化基因组测序数据,开发了一套基于多重PCR的SNP基因分型panel,包含170个核心SNP标记。利用该SNP panel及30个表型性状对202份辣椒种质进行分析,解析其遗传多样性,发掘辣椒优良表型性状的关联位点。结果表明,170个核心SNP标记分布于12条染色体上,香农指数平均为0.616,多态性信息含量平均为0.334,基因多样性平均值0.428,说明供试材料遗传多样性较好。基于SNP标记的聚类分析、群体结构分析和主成分分析结果较为一致,均将供试材料划分为5个类群,各类群与地理来源和果实形态有一定相关性。30个表型性状变异系数在7.00%~87.88%之间、平均为34.85%,ShannonWiener多样性指数在0.03~2.07之间、平均为1.19,其中单果重的变异系数最大,商品果纵径的Shannon-Wiener多样性指数最大,花冠颜色变异系数和Shannon-Wiener多样性指数均最小;表型性状间大部分存在显著或极显著相关性。进一步对表型性状、SNP标记进行关联分析,结果表明,GLM和MLM两种方法共检测到53个SNP关联位点,与12个表型性状显著关联;GLM和MLM分别可以解释4.83%~48.41%和10.86%~19.19%的表型变异,其中位于4号染色体的980-003标记对花冠颜色的表型变异解释率最高;53个关联位点里有4个位点被两种方法同时检测到。本研究所开发的SNP基因分型panel是一种通量高、准确性好且成本低的基因型鉴定方法,可应用于辣椒遗传结构分析、分子标记辅助育种、品种鉴定等研究。此外,本研究还构建了202份辣椒种质表型性状和基因型数据库,有效地建立了表型与基因型的对应关系,为辣椒优异基因发掘、种质创新和品种遗传改良提供理论指导和材料基础。 展开更多
关键词 辣椒 SNP基因分型 多重PCR 遗传多样性 关联分析
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细胞种属鉴别多重PCR法的优化及验证
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作者 吴雪伶 张琪梦 +5 位作者 纳涛 魏山山 范珊珊 宗伟英 孟淑芳 杨志行 《中国生物制品学杂志》 2026年第2期180-188,共9页
目的对原有细胞种属鉴别多重PCR法进行再优化以及再验证,使其可适用于不同检测机构及实验室的检测。方法对猪、中国仓鼠、非洲绿猴和大鼠的引物序列及核酸提取方式、引物配比、参比细胞混合基因组DNA的配比、PCR扩增程序及DNA模板用量... 目的对原有细胞种属鉴别多重PCR法进行再优化以及再验证,使其可适用于不同检测机构及实验室的检测。方法对猪、中国仓鼠、非洲绿猴和大鼠的引物序列及核酸提取方式、引物配比、参比细胞混合基因组DNA的配比、PCR扩增程序及DNA模板用量进行优化,对优化后的方法进行灵敏度、交叉污染检测限度及不同实验室间的复核验证。结果优化后的方法可成功用于10个种属的细胞鉴别检测,方法灵敏度可达50~5000个细胞,交叉污染的检测水平可达1∶100~1∶10000,4家不同实验室均能利用该方法成功对细胞进行检测。结论优化后的细胞种属鉴别多重PCR法具有较好的专属性及检测细胞交叉污染的能力,可用于不同实验室的细胞种属鉴别检测,耐用性好,将为生产及检定用细胞的质量控制提供有效的技术手段。 展开更多
关键词 细胞种属 鉴别 多重PCR法 线粒体
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侵染山药的五种病毒多重PCR检测方法的建立与应用
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作者 李想 鲁书豪 +9 位作者 徐国豪 高素霞 文艺 李绍建 杨瑾 李雪梦 王飞 鲁传涛 秦艳红 陈招荣 《植物病理学报》 北大核心 2026年第1期142-149,共8页
山药种植过程中普遍受到多种病毒的复合侵染,严重影响其产量和品质。为了实现对多种山药病毒的高效、快速检测,本研究建立了一种可以同时检测油菜花叶病毒(youcai mosaic virus, YoMV)、日本山药花叶病毒(Japanese yam mosaic virus, JY... 山药种植过程中普遍受到多种病毒的复合侵染,严重影响其产量和品质。为了实现对多种山药病毒的高效、快速检测,本研究建立了一种可以同时检测油菜花叶病毒(youcai mosaic virus, YoMV)、日本山药花叶病毒(Japanese yam mosaic virus, JYMV)、蚕豆萎蔫病毒-2(broad bean wilt virus-2,BBWV-2)、山药潜隐病毒(yam latent virus, YLV)和山药黄斑花叶病毒(yam yellow spot mosaic virus, YYSMV)的多重RT-PCR检测方法,5种病毒扩增目的条带大小分别为:504、614、750、1 030和1 207 bp,最佳的退火温度为55℃,各病毒多重PCR添加特引物浓度分别为YoMV F/R 0.08μmol·L^(-1)、JYMV F/R 0.04μmol·L^(-1)、BBWV-2 F/R 0.16μmol·L^(-1)、YLV F/R 0.32μmol·L^(-1)、YYSMV F/R 0.24μmol·L^(-1),检测灵敏度为8.11×10^(5)个拷贝·μL^(-1)。本检测方法可以高效、准确地检测山药上的5种病毒,极大的提高了检测效率,为山药病毒病的检测提供了技术支撑。 展开更多
关键词 山药病毒 多重PT-PCR 引物浓度 退火温度 复合侵染
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基于多重巢式聚合酶链式反应和毛细管电泳检测三种食源性致病菌
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作者 李俊杰 王惺雅 +5 位作者 杨浩楠 魏娜 赵丽颖 朱淑云 朱建华 何文森 《食品与发酵工业》 北大核心 2026年第4期242-250,共9页
该研究旨在利用多重巢式聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)与毛细管电泳技术建立快速检测大肠埃希氏菌、鼠伤寒沙门氏菌和金黄色葡萄球菌的方法。该文以大肠埃希氏菌β-葡萄糖苷酶基因(uidA基因)、鼠伤寒沙门氏菌毒力基因(... 该研究旨在利用多重巢式聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)与毛细管电泳技术建立快速检测大肠埃希氏菌、鼠伤寒沙门氏菌和金黄色葡萄球菌的方法。该文以大肠埃希氏菌β-葡萄糖苷酶基因(uidA基因)、鼠伤寒沙门氏菌毒力基因(hilA基因)和金黄色葡萄球菌耐热核酸酶基因(nuc基因)为靶标,设计3对嵌套式引物进行2轮扩增,利用毛细管电泳分析产物,通过对2轮巢式PCR退火温度的优化,建立3种食源性致病菌的多重巢式PCR-毛细管电泳检测方法。3对嵌套式引物特异性良好,2轮巢式PCR最佳退火温度分别为54℃和56℃,对大肠埃希氏菌和金黄色葡萄球菌检测灵敏度可达10^(1)copies,对鼠伤寒沙门氏菌检测灵敏度可达10^(3)copies。该方法快速、准确和高灵敏,适用于能提取DNA的食品样本中3种食源性致病菌的检测,为食源性致病菌的检测提供新方案。 展开更多
关键词 多重巢式PCR 毛细管电泳 食源性致病菌 特异性 灵敏度
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DHAV-1、DAstV-1、DHAV-3和APMV-1四重PCR检测方法的建立及应用
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作者 李海名 吴晓燕 +3 位作者 康华裕 王旭 王一涵 张彦龙 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2026年第2期94-99,共6页
为了建立一种能同时检测鸭甲肝病毒1型(DHAV-1)、鸭星状病毒1型(DAstV-1)、鸭甲肝病毒3型(DHAV-3)和禽副黏病毒1型(APMV-1)的方法,试验根据GenBank中公布的DHAV-13A基因、DAstV-11a基因、DHAV-33a3b基因和APMV-1 F基因序列分别设计4对... 为了建立一种能同时检测鸭甲肝病毒1型(DHAV-1)、鸭星状病毒1型(DAstV-1)、鸭甲肝病毒3型(DHAV-3)和禽副黏病毒1型(APMV-1)的方法,试验根据GenBank中公布的DHAV-13A基因、DAstV-11a基因、DHAV-33a3b基因和APMV-1 F基因序列分别设计4对特异性引物,通过优化反应条件及特异性、敏感性和重复性试验建立了四重PCR检测方法,并采用该方法对96份疑似病毒感染的鸭病料样本进行检测。结果表明:DHAV-1、DHAV-3、DAstV-1和APMV-1四重RT-PCR检测方法的最优退火温度和引物浓度分别为56℃、0.8μmol/L。该方法能同时扩增出大小为195 bp(DHAV-13A基因)、289 bp(DAstV-11a基因)、462 bp(DHAV-33a3b基因)、726 bp(APMV-1基因)的特异性片段,而与鸭瘟病毒(DPV)、鸭坦布苏病毒(DTMUV)、鸭圆环病毒(DuCV)和鸭甲肝病毒2型(DHAV-2)无交叉反应;对DHAV-1、DAstV-1、DHAV-3和APMV-1的最低检测限分别为1.111×10~4 copies/μL、3.078×10~2 copies/μL、4.938×10~3 copies/μL、3.456×10~2 copies/μL;批间重复试验和批内重复试验的3个平行样本的结果均一致。采用该方法对96份临床样本的检测结果与参考方法的符合率为100%。说明本研究建立的针对DHAV-1、DHAV-3、DAstV-1和APMV-1四重PCR检测方法特异性强、敏感性较高、重复性好,在临床样本检测中展现出良好的应用效果。 展开更多
关键词 鸭甲肝病毒 鸭星状病毒 禽副黏病毒1型 混合感染 多重PCR检测方法 检测方法建立
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多重PCR在血流感染细菌及其耐药基因检测中的临床应用价值
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作者 曾桂胜 陈丹虹 +3 位作者 吴见欢 陈志芬 邹惠英 廖建军 《齐齐哈尔医学院学报》 2026年第3期264-269,共6页
目的评价多重PCR法在检测血流感染细菌及其耐药基因中的临床应用价值。方法使用血流感染细菌及其耐药基因15项联合检测试剂盒,采用多重PCR法于体外同时检测50例报阳血液培养中的12种临床常见血流感染病原菌及KPC、mecA、NDM 3种耐药基因... 目的评价多重PCR法在检测血流感染细菌及其耐药基因中的临床应用价值。方法使用血流感染细菌及其耐药基因15项联合检测试剂盒,采用多重PCR法于体外同时检测50例报阳血液培养中的12种临床常见血流感染病原菌及KPC、mecA、NDM 3种耐药基因,与传统血培养方法比较其检出时效性,准确性。结果共检测出表皮葡萄球菌、铜绿假单胞菌、人葡萄球菌、金黄色葡萄球菌、粪肠球菌、大肠埃希菌、嗜麦芽单胞菌、肺炎链球菌、鲍曼不动杆菌的,未检出溶血葡萄球菌、屎肠球菌、肺炎克雷伯菌和KPC、mecA、NDM等耐药基因。相较传统血培养方法,多重PCR法对血培养阳性患者的TAT时间可缩短1~2 d,及早提示感染病原菌。结论与传统血培养细菌鉴定相比,联合检测试剂盒体现出多重PCR的敏感性、特异性、阳性预测值较高,可提高血流感染细菌检测速度,对多重感染的鉴定及指导临床早期合理用药具有意义。 展开更多
关键词 血流感染 细菌培养 多重PCR 耐药基因
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌核酸快速检测方法的建立与评价 被引量:1
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作者 何丽 陈丽丹 +3 位作者 杨欢 郭莹坚 李亚婷 张海燕 《生物工程学报》 北大核心 2026年第2期890-899,共10页
为建立一种快速、准确的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)核酸即时检测方法,本研究首先针对16S rRNA、nuc和mecA基因设计特异性引物与荧光探针;以MRSA标准菌株制备梯度核酸标准品,优化qPCR... 为建立一种快速、准确的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)核酸即时检测方法,本研究首先针对16S rRNA、nuc和mecA基因设计特异性引物与荧光探针;以MRSA标准菌株制备梯度核酸标准品,优化qPCR体系并测序验证,完成方法构建。随后系统评估该体系的灵敏度、线性范围、重复性、特异性及抗干扰性能。最后,将优化后的方法应用于临床样本,并以临床实验室常用的鉴定方法(质谱法)为参比方法,验证其实用价值。本研究建立的MRSA核酸快速检测体系,可在30 min内完成对MRSA核酸的检测,对16S rRNA、nuc和mecA基因的灵敏度分别为1.0×10^(2)、1.0×10^(2)、1.0×10^(3)CFU/mL;线性范围分别为1.0×10^(2)-1.0×10^(9)、1.0×10^(2)-1.0×10^(9)、1.0×10^(3)-1.0×10^(9)CFU/mL;批内和批间的变异系数均小于5%;与多种病原体之间无交叉反应;2 g/L的血红蛋白和100μg/mL头孢曲松钠对检测无干扰;与质谱法相比,具有较好的一致性,灵敏度和特异性较高。结果表明,本研究构建的MRSA核酸快速检测方法兼具高灵敏度与操作简便性,为病原微生物核酸即时检测提供了新策略,可作为临床微生物快速筛查的可靠技术选项。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 核酸检测 快速检测 多重检测 聚合酶链反应 耐药菌筛查
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基于SNP构建芋种质资源的分子身份证
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作者 王直新 孙亚林 +7 位作者 王海宁 王莹 黄新芳 李峰 刘玉平 匡晶 柯卫东 朱红莲 《植物遗传资源学报》 北大核心 2026年第2期398-406,I0108-I0142,共44页
芋[Colocasia esculenta(L.)Schott]是世界第五大根茎类作物,其种质资源以地方品种为主。由于不同地区间引种频繁,以及长期依赖球茎进行无性繁殖,芋品种类型多且存在大量表型相似的材料,仅依赖表型性状鉴定已难以满足准确鉴别和高效管... 芋[Colocasia esculenta(L.)Schott]是世界第五大根茎类作物,其种质资源以地方品种为主。由于不同地区间引种频繁,以及长期依赖球茎进行无性繁殖,芋品种类型多且存在大量表型相似的材料,仅依赖表型性状鉴定已难以满足准确鉴别和高效管理的需求。为提升芋种质资源管理的精准度与数字化水平,基于前期重测序数据开发了覆盖全基因组的695对特异性引物。利用该引物体系对193份芋种质资源进行靶向测序,共检测到2317个高可信度SNP位点。基于遗传聚类分析,193份种质被清晰地划分为6个类群。计算样品间SNP差异位点所反映的遗传相似度,结果显示79.57%的样品对的遗传相似度集中在0.45~0.65区间;同时发现8对样品的遗传相似度高达0.98以上,可能为同物异名或遗传背景高度相近的材料。此外,还进一步筛选出17个核心SNP位点,构建了芋种质资源的分子指纹图谱,并结合其地理来源和品种类型信息,建立了每份材料唯一的分子身份证。本研究建立的方法体系为芋种质资源的精准区分、鉴定及基因型数据的数字化管理提供了有力的技术支撑,对种质资源的保护和高效利用具有重要的理论意义和应用价值。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 多重PCR 靶向测序 指纹图谱
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茶梅花叶病病毒种类鉴定及多重PCR检测技术建立
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作者 朱宏佩 黄温柔 +1 位作者 刘欢 刘斐 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第4期143-151,共9页
【目的】明确引起茶梅(Camellia sasanqua)花叶病的病毒种类和主要病毒的全基因组序列,建立可靠的病毒分子检测技术,为茶梅病毒病的早期诊断和抗病毒育种提供参考。【方法】以2022年7月至2024年3月,采自陕西、浙江、福建和江苏地区具有... 【目的】明确引起茶梅(Camellia sasanqua)花叶病的病毒种类和主要病毒的全基因组序列,建立可靠的病毒分子检测技术,为茶梅病毒病的早期诊断和抗病毒育种提供参考。【方法】以2022年7月至2024年3月,采自陕西、浙江、福建和江苏地区具有黄化、褪绿、植株矮小等症状的茶梅叶片为材料,通过小RNA(sRNA)测序技术鉴定茶梅花叶病的病毒种类,并克隆病毒的全基因组序列,研究其分子变异情况。建立茶梅3种病毒一步法多重RT-PCR(mRT-PCR)快速诊断技术并进行优化。【结果】在表现花叶症状的茶梅叶片中检测到山茶环斑相关病毒3(camellia ringspot-associated virus 3,CRSaV-3)、山茶黄化环斑病毒(camellia yellow ringspot virus,CaYRSV)和山茶乙型线形相关病毒3(camellia japonica associated metaflexid virus 3,CjBV-3)3种病毒。系统发育结果显示,茶梅3种病毒分子变异较小,但与来源于山茶花(C.japonica)的分离物相比,仍然存在较大的分子变异。建立了3种茶梅病毒一步法mRTPCR检测技术,该检测技术具有快速、高效、操作简便等优点。【结论】首次鉴定了茶梅花叶病的病毒种类,克隆获得3种茶梅病毒的11条全基因组序列,建立了茶梅病毒mRT-PCR检测技术,该技术具有快速、高效、操作简便等特点,可用于CRSaV-3、CaYRSV和CjBV-3的快速检测。 展开更多
关键词 茶梅花叶病 病毒鉴定 多重RT-PCR(mRT-PCR)
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海南地区2020—2024年0~14岁儿童呼吸道合胞病毒感染流行病学特征
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作者 钟凌霄 王康冬 陈金妮 《中国热带医学》 北大核心 2026年第2期241-245,252,共6页
目的探讨海南地区0~14岁儿童呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)感染的流行病学特征,为临床RSV感染预防、早期评估、及时采取干预措施提供参考依据。方法收集2020—2024年海南省妇女儿童医学中心门/急诊和住院部就诊进行... 目的探讨海南地区0~14岁儿童呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)感染的流行病学特征,为临床RSV感染预防、早期评估、及时采取干预措施提供参考依据。方法收集2020—2024年海南省妇女儿童医学中心门/急诊和住院部就诊进行RSV相关检测的急性下呼吸道感染患儿的鼻/咽拭子标本,通过核酸检测法、多重PCR-毛细管电泳法和多重靶向扩增-高通量测序法(tNGS)进行检测确诊RSV感染,收集相关临床数据建立数据库,利用统计学分析方法进行分析。结果2020—2024年共收集呼吸道感染病例32309例样本,其中4683例RSV阳性病例,总阳性检出率为14.49%(4683/32309)。男性患儿检出率为15.06%,高于女性患儿的13.61%(χ^(2)=12.904,P<0.01)。婴儿组(1月~1岁)儿童RSV检出率最高(24.97%),RSV检出率随年龄增长总体呈下降趋势(χ^(2)=1811.606,P<0.01)。RSV感染在2020年秋季、2021年夏秋季、2022年冬季、2023年和2024年春夏季显示流行高峰。RSV阳性标本中,RSV单一检出1255例,混合检出3428例。在混合检出中占比例前三位的非细菌性呼吸道病原体依次为人鼻病毒、肺炎支原体和副流感病毒。RSV的A、B两种基因亚型在海南地区呈时空交替流行。重症患儿中RSV阳性检出率为12.49%(209/1673),其中新生儿组的阳性率最高(33.33%),其次为婴儿组(22.19%)。结论海南地区0~14岁儿童RSV感染流行时期与当地雨季基本重合;RSV感染总阳性检出率及重症病例阳性检出率与年龄均呈负相关;RSV两种基因亚型在海南地区呈时空交替流行模式,且RSV感染存在一定比例的混合感染情况。 展开更多
关键词 呼吸道合胞病毒 急性下呼吸道感染 多重PCR-毛细管电泳法 多重靶向扩增-高通量测序法 儿童
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耐药基因blaNDM、mcr-1和cfr三重TaqMan qPCR检测方法的建立及应用 被引量:1
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作者 杨威 于海航 +7 位作者 王芸萌 王珏 韩昱 胡晓悦 谌志伟 卢军霞 高英 张宁 《中国兽医学报》 北大核心 2025年第2期243-248,273,共7页
为实现同时检测blaNDM、mcr-1和cfr 3种耐药基因的方法。通过构建质粒标准品、对引物及探针设计和优化反应体系及条件,成功建立blaNDM、mcr-1和cfr三重荧光定量PCR检测方法。该方法能特异性地检出blaNDM、mcr-1和cfr,而对其他耐药基因... 为实现同时检测blaNDM、mcr-1和cfr 3种耐药基因的方法。通过构建质粒标准品、对引物及探针设计和优化反应体系及条件,成功建立blaNDM、mcr-1和cfr三重荧光定量PCR检测方法。该方法能特异性地检出blaNDM、mcr-1和cfr,而对其他耐药基因均不能检出;3个耐药基因标准曲线的相关系数(R2)均大于0.999,变异系数(Cv)均低于1%;质粒标准品最低检出限值均为10^(2) copies/μL。使用建立的方法对800份细菌样本进行检测,结果显示,含耐药基因mcr-1样本32份、只含耐药基因blaNDM样本40份、只含耐药基因cfr样本2份;同时含有耐药基因mcr-1和blaNDM的样本8份,未检出同时携带3种耐药基因的细菌样本。以上结果证实,本研究建立的三重荧光定量PCR方法具有灵敏性高、特异性强及稳定性好的优点,适用于临床上快速检测blaNDM、mcr-1和cfr 3种耐药基因,为细菌多重耐药基因的检测和控制提供技术支持。 展开更多
关键词 blaNDM mcr-1 CFR 耐药基因 多重荧光定量PCR
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多重PCR结合毛细管电泳筛查20种转基因玉米转化体
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作者 邢珍娟 董立明 +5 位作者 闫伟 龙丽坤 马月 何禹璇 赵宁 李飞武 《玉米科学》 北大核心 2025年第12期27-35,共9页
为规范转基因玉米及其产品的种植和贸易,相关行业与监管部门迫切需要研发多靶标高通量的高效检测方法。研究开发一种多重PCR体系,能够特异性检测20种转基因(GM)玉米转化体。通过荧光毛细管电泳(CE)对所有扩增产物进行分离与分析,利用其... 为规范转基因玉米及其产品的种植和贸易,相关行业与监管部门迫切需要研发多靶标高通量的高效检测方法。研究开发一种多重PCR体系,能够特异性检测20种转基因(GM)玉米转化体。通过荧光毛细管电泳(CE)对所有扩增产物进行分离与分析,利用其高分辨率、多重荧光检测及高灵敏度,实现对所有转化体的同时识别,检出限达到0.1%。研究表明,所开发的多重PCR结合毛细管电泳的方法能够高效、准确且灵敏地检测常见转基因玉米转化事件,可为生物育种产业化推广及转基因产品监管提供技术支撑。 展开更多
关键词 玉米 多重PCR 毛细管电泳 高通量检测
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啮齿类实验动物4种常见病原菌多重巢式PCR检测方法的建立与初步应用 被引量:1
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作者 席晓霞 孙婧 +3 位作者 郭家熙 张丽娟 刘晓玲 段天林 《中兽医医药杂志》 2025年第4期18-25,共8页
建立一种检测啮齿类实验动物鼠伤寒沙门菌、鼠棒状杆菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌等4种常见致病菌的多重巢式PCR检测方法,在此基础上,采用咽拭子和肛拭子等采样方法优化检测流程。试验针对病原菌16S rDNA序列保守区和可变区,通过... 建立一种检测啮齿类实验动物鼠伤寒沙门菌、鼠棒状杆菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌等4种常见致病菌的多重巢式PCR检测方法,在此基础上,采用咽拭子和肛拭子等采样方法优化检测流程。试验针对病原菌16S rDNA序列保守区和可变区,通过引物长短差异分别设计通用引物和特异性引物,通过巢式PCR检测各种样本中的病原菌。结果显示,优化后的四重巢式PCR方法可对同一样品中的4种致病菌模板进行特异性扩增,无交叉反应;多重巢式PCR方法可从标准菌株DNA模板中扩增出待检病原菌DNA片段,而阴性对照组均未能检出;多重巢式PCR方法的检测灵敏度明显高于普通多重PCR方法(≤10-2pg/μL vs≤1 pg/μL);多重巢式PCR方法可从混合感染的样本中特异性地检测出4种致病菌;在实际应用中,多重巢式PCR可检测出病原菌感染的阳性样本,且检出率高于普通多重PCR方法。本试验建立的4种病原菌多重巢式PCR检测方法可同时检测动物咽拭子或肛拭子等临床样本中的多种病原菌,与普通多重PCR方法相比,该方法具有省时省力、灵敏性高、特异性强等优点。 展开更多
关键词 多重巢式PCR 鼠伤寒沙门菌 鼠棒状杆菌 铜绿假单胞菌 金黄色葡萄球菌
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淡水鱼中5种人兽共患吸虫囊蚴多重PCR检测方法的建立
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作者 王雪 李犇 +8 位作者 李晶 兰卓 侯美如 杨彦 王佳文 刘雪薇 邱鸿宇 高俊峰 王春仁 《中国农业大学学报》 北大核心 2025年第7期161-173,共13页
为快速鉴别淡水鱼感染吸虫囊蚴的种类,基于GenBank中华支睾吸虫、东方次睾吸虫、横川后殖吸虫、日本棘隙吸虫和圆圃棘口吸虫参考序列的保守区域分别设计5对特异性引物,通过优化反应条件,建立同时检测5种吸虫囊蚴的多重PCR方法。结果显示... 为快速鉴别淡水鱼感染吸虫囊蚴的种类,基于GenBank中华支睾吸虫、东方次睾吸虫、横川后殖吸虫、日本棘隙吸虫和圆圃棘口吸虫参考序列的保守区域分别设计5对特异性引物,通过优化反应条件,建立同时检测5种吸虫囊蚴的多重PCR方法。结果显示:1)PCR反应体系中最佳引物组合浓度为10μmol/L,最适退火温度为59℃,可同时扩增的各吸虫特异性片段,扁弯口吸虫、全冠吸虫、卷棘口吸虫、肝片吸虫和土耳其斯坦裂体吸虫的检测结果均为阴性;5种吸虫囊蚴重组质粒DNA最低检出浓度均为1 ng/μL;批间与批内试验均一致。2)通过单重PCR方法验证多重PCR检测结果,符合率为100%。3)采用多重PCR方法检测的100尾麦穗鱼中,21尾(21/100,21%)阳性,8尾(8/100,8%)为单病原感染,13尾(13/100,13%)为多病原混合感染,华支睾吸虫、东方次睾吸虫、横川后殖吸虫、日本棘隙吸虫和圆圃棘口吸虫的阳性数分别为11(11%)、9(9%)、4(4%)、8(8%)和8(8%),与分别使用形态学方法及单重PCR验证结果相同。综上,本研究成功建立了同时检测淡水鱼华支睾吸虫、东方次睾吸虫、横川后殖吸虫、日本棘隙吸虫和圆圃棘口吸虫囊蚴的多重PCR方法,该方法具有特异性强、敏感性高、重复性好等优点,有望在鱼病检测、突发鱼源性公共卫生事件及出入境检验检疫中应用。 展开更多
关键词 华支睾吸虫 东方次睾吸虫 横川后殖吸虫 日本棘隙吸虫 圆圃棘口吸虫 多重PCR
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鸡呼吸道常见病毒多重PCR检测方法的建立及初步应用
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作者 董亚青 王永娟 +5 位作者 赵长菁 陈文峰 洪佳屹 夏爱鸿 袁橙 徐淑颖 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第4期357-362,共6页
H9N2禽流感病毒(AIV)、新城疫病毒(NDV)、传染性支气管炎病毒(IBV)、传染性喉气管炎病毒(ILTV)、鸡痘病毒(FPV)是引起鸡呼吸系统疾病的常见病毒。为建立能快速鉴别检测以上5种病毒的方法,本研究根据H9N2 AIV的HA基因、NDV的L基因、IBV的... H9N2禽流感病毒(AIV)、新城疫病毒(NDV)、传染性支气管炎病毒(IBV)、传染性喉气管炎病毒(ILTV)、鸡痘病毒(FPV)是引起鸡呼吸系统疾病的常见病毒。为建立能快速鉴别检测以上5种病毒的方法,本研究根据H9N2 AIV的HA基因、NDV的L基因、IBV的N基因、ILTV的TK基因、FPV的4b基因设计了5对特异性引物,并分别由公司合成5种重组质粒标准品,采用方阵法优化反应体系和扩增条件,建立了能同时检测上述病毒的多重PCR方法。分别以IBV、ILTV、H9N2 AIV、FPV、NDV、传染性法氏囊病毒、鸡毒支原体基因组为模板,利用该方法检测并分析其特异性;利用10倍倍比稀释后的5种重组质粒标准品为模板,采用本研究建立的多重PCR扩增,评估该方法的敏感性。结果显示,建立的多重PCR方法可特异性检测IBV、ILTV、H9N2 AIV、FPV、NDV,对其他病原扩增结果均为阴性,特异性较强;该方法对5种重组质粒标准品混合物的检测限至少为10~2拷贝/μL。利用建立的方法检测82份临床样品,评估其临床应用的可行性,结果显示,H9N2 AIV的阳性率为3.7%(3/82),未检出NDV,IBV的阳性率为12.2%(10/82),ILTV的阳性率为8.5%(7/82),FPV的阳性率为2.4%(2/82),IBV+H9N2 AIV混合感染率为1.2%(1/82),ILTV+H9N2 AIV混合感染率为1.2%(1/82),其他病毒的混合感染未检出,结果与单一PCR的检测结果一致,两种方法的符合率达100%。本研究建立的多重PCR方法特异性强、灵敏性高,可同时实现鸡呼吸系统5种常见病毒的高效快速检测,为鸡呼吸系统疾病的早期发现及流行病学调查提供了技术支撑。 展开更多
关键词 呼吸道 病毒 多重PCR
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疑似中枢神经系统感染患者脑脊液PCR结果及临床特征分析
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作者 王洋 赵辉 李辉 《国际检验医学杂志》 2025年第6期704-708,共5页
目的探讨疑似中枢神经系统(CNS)感染患者脑脊液PCR病原体检测结果与临床特征的关系。方法选取2022年8月至2023年12月新疆医科大学第二附属医院收治的疑似CNS感染患者140例为研究对象,收集所有患者临床资料,并对其进行脑脊液常规检查,采... 目的探讨疑似中枢神经系统(CNS)感染患者脑脊液PCR病原体检测结果与临床特征的关系。方法选取2022年8月至2023年12月新疆医科大学第二附属医院收治的疑似CNS感染患者140例为研究对象,收集所有患者临床资料,并对其进行脑脊液常规检查,采用多重PCR检测技术检测患者脑脊液中病原体。最终确诊CNS感染的患者根据PCR检测结果分为PCR阳性组和PCR阴性组,将非CNS感染患者设为对照组,比较3组患者临床实验室资料。采用Upset图归纳PCR阴性CNS感染患者临床特征,Logistic回归分析临床特征与PCR阴性CNS感染的关系。结果140例患者最终96例确诊CNS感染,96例CNS感染患者中有56例PCR阳性,据此分为PCR阳性组(56例)、PCR阴性组(40例)和对照组(44例)。3组发热时间、脑膜刺激征、脑电图重度改变、意识障碍比例、脑脊液白细胞数、脑脊液蛋白量及颅脑CT异常征象比较,差异有统计学意义(P<0.05);PCR阳性组脑膜刺激征比例、脑脊液白细胞数、脑脊液蛋白量、脑电图重度改变比例高于PCR阴性组,差异有统计学意义(P<0.05);Upset图显示,PCR阴性CNS感染患者最常见的临床特征主要集中在脑脊液白细胞数>50×10^(6)/L、脑电图重度改变、脑脊液蛋白量>0.2 g/L、脑膜刺激征及发热时间>4 d;Logistic回归分析显示,脑膜刺激征(OR=7.040)、脑脊液白细胞数(OR=1.323)、脑脊液蛋白量(OR=8.989)、脑电图重度改变(OR=16.667)与PCR阴性CNS感染有关(P<0.05)。结论早期PCR阴性的患者可通过判断其临床特征来预测CNS感染,对于提高临床诊断和治疗具有重要意义。 展开更多
关键词 中枢神经系统感染 多重PCR检测 脑脊液 临床特征
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乌梢蛇与7种混伪品的基因膜芯片鉴别方法的建立
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作者 刘艳 熊金龙 +3 位作者 王萍 陈广云 马金惠 杭婧 《实用药物与临床》 2025年第7期493-497,共5页
目的建立一种快速、高通量的鉴别乌梢蛇及其常见7种混伪品的基因膜芯片方法。方法设计乌梢蛇及7种混伪品蛇的特异性探针,固定在尼龙膜上,与多重PCR扩增产物杂交,通过酶-底物显色产生肉眼可见的斑点。结果建立的方法特异性强,重复性好,... 目的建立一种快速、高通量的鉴别乌梢蛇及其常见7种混伪品的基因膜芯片方法。方法设计乌梢蛇及7种混伪品蛇的特异性探针,固定在尼龙膜上,与多重PCR扩增产物杂交,通过酶-底物显色产生肉眼可见的斑点。结果建立的方法特异性强,重复性好,准确度高,检出限为0.1ng,满足检测要求。结论本研究建立了乌梢蛇与7种混伪品的基因膜芯片鉴别方法,提高了掺假样品检测效率,为乌梢蛇中药材分子鉴别提供参考。 展开更多
关键词 乌梢蛇 基因膜芯片 多重PCR 混伪品
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慢性肺曲霉病抗真菌药停药依据研究
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作者 李天义 肖海浩 +3 位作者 汤春梅 李宇 苏雯婕 陈家华 《广东医学》 2025年第2期284-288,共5页
目的探讨支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)曲霉多重荧光定量PCR联合血清曲霉IgG抗体、BALF-半乳甘露聚糖(galactomannan,GM)检测作为慢性肺曲霉病(chronic pulmonary aspergillosis,CPA)抗真菌药停药依据。方法研... 目的探讨支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)曲霉多重荧光定量PCR联合血清曲霉IgG抗体、BALF-半乳甘露聚糖(galactomannan,GM)检测作为慢性肺曲霉病(chronic pulmonary aspergillosis,CPA)抗真菌药停药依据。方法研究对象为2020年7月1日至2024年6月30日在广州市胸科医院肺结核科住院并诊断为CPA的120例患者,按照随机数字表法分为试验组和对照组,每组60例。两组患者均给予伏立康唑治疗,并定期行支气管镜下真菌清除术。对照组参考2015年《慢性肺曲霉病的诊断与治疗临床指南》推荐的至少6个月抗真菌治疗时间,停药依据参考临床症状改善+影像学表现+真菌学检查结果+支气管镜检查。在对照组的基础上,试验组的停药依据参考BALF曲霉多重荧光定量PCR+血清曲霉IgG抗体+BALF-GM检测结果。比较两组患者服药时长,并随访观察两组患者停药后3、6、12个月时间,记录两组CPA复发情况。结果试验组患者的服药时长为14(4,24)个月,对照组患者的服药时长为12(6,20)个月,两组数据经秩和检验分析显示差异无统计学意义(Z=-0.025,P>0.05)。停药后3个月(0.00%vs.7.55%)、停药后6个月(9.09%vs.20.75%),两组的复发率比较差异无统计学意义(P>0.05)。停药后12个月,试验组的复发率为16.36%,显著低于对照组的33.96%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论采用BALF曲霉多重荧光定量PCR联合血清曲霉IgG抗体、BALF-GM检测作为临床指导CPA患者抗真菌停药的依据能有效降低停药12个月后的复发率。 展开更多
关键词 多重荧光定量PCR 曲霉IgG抗体 半乳甘露聚糖 慢性肺曲霉病 停药
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