目的:通过整合空间代谢组学、单细胞转录组学及机器学习算法,系统解析黄芪赤风自拟方靶向“线粒体-代谢轴”改善肌少症的多层级调控机制。方法:在中医药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology ...目的:通过整合空间代谢组学、单细胞转录组学及机器学习算法,系统解析黄芪赤风自拟方靶向“线粒体-代谢轴”改善肌少症的多层级调控机制。方法:在中医药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)等数据库上筛选黄芪赤风自拟方活性成分和肌少症相关靶点,结合多组学数据(GSE1428等数据集)进行差异基因识别,通过12种机器学习算法筛选出5个核心基因。结果:功能富集分析表明,这些基因参与氧化磷酸化、嘌呤代谢及转化生长因子-β(Transforming Growth Factor-Beta,TGF-β)通路,并介导线粒体生物合成与能量代谢调控。免疫浸润分析揭示肌少症中T细胞亚群(CD4记忆T细胞)与巨噬细胞M2的异常浸润,且脂素1(Lipin 1,LPIN1)与免疫微环境显著相关。分子对接验证了维生素E与核心靶点的高亲和力,提示其潜在治疗价值。结论:研究构建了药物-成分-线粒体-代谢基因网络,阐明了黄芪赤风自拟方多靶点协同机制,为中医治疗肌少症提供了“数据-算法-机制”三位一体的新范式,为精准介入策略奠定了理论基础。展开更多
文摘目的:通过整合空间代谢组学、单细胞转录组学及机器学习算法,系统解析黄芪赤风自拟方靶向“线粒体-代谢轴”改善肌少症的多层级调控机制。方法:在中医药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)等数据库上筛选黄芪赤风自拟方活性成分和肌少症相关靶点,结合多组学数据(GSE1428等数据集)进行差异基因识别,通过12种机器学习算法筛选出5个核心基因。结果:功能富集分析表明,这些基因参与氧化磷酸化、嘌呤代谢及转化生长因子-β(Transforming Growth Factor-Beta,TGF-β)通路,并介导线粒体生物合成与能量代谢调控。免疫浸润分析揭示肌少症中T细胞亚群(CD4记忆T细胞)与巨噬细胞M2的异常浸润,且脂素1(Lipin 1,LPIN1)与免疫微环境显著相关。分子对接验证了维生素E与核心靶点的高亲和力,提示其潜在治疗价值。结论:研究构建了药物-成分-线粒体-代谢基因网络,阐明了黄芪赤风自拟方多靶点协同机制,为中医治疗肌少症提供了“数据-算法-机制”三位一体的新范式,为精准介入策略奠定了理论基础。
