[目的]探讨非小细胞肺癌脾虚湿滞证肠道菌群、代谢组学和蛋白质组学的基本特征。[方法]选择非小细胞肺癌脾虚湿滞证患者13例作为患者组,健康志愿者15例作为对照组。收集两组粪便标本,运用16S核糖体DNA(16S ribosomal DNA,16S r DNA)鉴...[目的]探讨非小细胞肺癌脾虚湿滞证肠道菌群、代谢组学和蛋白质组学的基本特征。[方法]选择非小细胞肺癌脾虚湿滞证患者13例作为患者组,健康志愿者15例作为对照组。收集两组粪便标本,运用16S核糖体DNA(16S ribosomal DNA,16S r DNA)鉴定技术检测肠道微生态,分析两组肠道菌群的多样性及差异性。采集两组血清标本,通过液相色谱-质谱联用技术对血清中的代谢物、蛋白进行检测,筛选差异明显的代谢物及蛋白,并进行富集分析通路预测。通过加权基因共表达网络分析(weighted correlation network analysis,WGCNA)软件对肠道菌群和代谢组学进行联合分析,阐明差异菌群-差异代谢物之间的关联性。通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行代谢组学和蛋白质组学数据联合分析,挖掘同一生物学进程中发生显著性变化的蛋白质和代谢物,探索肺癌关键基因和通路。[结果]两组间存在3种显著差异菌,分别是布鲁菌、鞘氨醇单胞菌、脱硫弧菌,14种差异蛋白(上调9个、下调5个),在补体和凝血信号通路(complement and coagulation cascades)、Pertussis、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositide 3-kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)等通路上富集明显。13种差异代谢物(负离子模式下2个、正离子模式下11个),主要涉及卟啉和叶绿素代谢、不饱和脂肪酸的生物合成、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成等代谢通路。进一步通过联合分析发现,差异物质与丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、PI3K-Akt、Ras信号通路、癌症信号通路、细胞因子受体相互作用(cytokine-cytokine receptor interaction)这5条信号通路相关。[结论]非小细胞肺癌脾虚湿滞证具有特异的肠道菌群、蛋白质和代谢物,通过联合分析发现PI3K-Akt、MAPK信号通路的失调可能与肺癌的发生发展相关。展开更多
文摘[目的]探讨非小细胞肺癌脾虚湿滞证肠道菌群、代谢组学和蛋白质组学的基本特征。[方法]选择非小细胞肺癌脾虚湿滞证患者13例作为患者组,健康志愿者15例作为对照组。收集两组粪便标本,运用16S核糖体DNA(16S ribosomal DNA,16S r DNA)鉴定技术检测肠道微生态,分析两组肠道菌群的多样性及差异性。采集两组血清标本,通过液相色谱-质谱联用技术对血清中的代谢物、蛋白进行检测,筛选差异明显的代谢物及蛋白,并进行富集分析通路预测。通过加权基因共表达网络分析(weighted correlation network analysis,WGCNA)软件对肠道菌群和代谢组学进行联合分析,阐明差异菌群-差异代谢物之间的关联性。通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行代谢组学和蛋白质组学数据联合分析,挖掘同一生物学进程中发生显著性变化的蛋白质和代谢物,探索肺癌关键基因和通路。[结果]两组间存在3种显著差异菌,分别是布鲁菌、鞘氨醇单胞菌、脱硫弧菌,14种差异蛋白(上调9个、下调5个),在补体和凝血信号通路(complement and coagulation cascades)、Pertussis、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositide 3-kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)等通路上富集明显。13种差异代谢物(负离子模式下2个、正离子模式下11个),主要涉及卟啉和叶绿素代谢、不饱和脂肪酸的生物合成、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成等代谢通路。进一步通过联合分析发现,差异物质与丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、PI3K-Akt、Ras信号通路、癌症信号通路、细胞因子受体相互作用(cytokine-cytokine receptor interaction)这5条信号通路相关。[结论]非小细胞肺癌脾虚湿滞证具有特异的肠道菌群、蛋白质和代谢物,通过联合分析发现PI3K-Akt、MAPK信号通路的失调可能与肺癌的发生发展相关。
